合成生物学相关文章
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当前共找到 95 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-12-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 利用合成生物学方法，工程化细菌自组装生物玻璃聚硅酸盐包壳，并展示增强的光聚焦能力 | 首次利用合成生物学将海绵硅酸酶表达于细菌表面，实现微生物自组装聚硅酸盐“生物玻璃”外壳，并将细菌转化为可产生强纳米射流的活体微透镜，显著提升光聚焦性能 | 未明确讨论聚硅酸盐包壳的长期稳定性和大规模生产成本，且仅基于单一酶（硅酸酶）表达，可能限制光学性能调控的灵活性 | 开发廉价、耐用、可调控环境响应性的生物光子组件 | 表达硅酸酶的大肠杆菌 | 合成生物学、光子学 | NA | 合成生物学、生物矿化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 硅酸酶表达回路 | 光子学、材料科学、环境传感 |
| 2 | 2026-07-22 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-12-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 通过基因工程改造细菌，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应，增强肿瘤免疫治疗 | 工程化高色氨酸表达细菌菌株L-Trp CB，通过丁酸抑制IDO活性并释放色氨酸激活CD8+ T细胞，实现肿瘤靶向免疫治疗 | 研究仅在小鼠和兔模型中进行，需进一步验证临床安全性和有效性 | 开发合成生物学策略用于肿瘤免疫治疗 | 工程化细菌菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞的影响 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达回路 | 医学 |
| 3 | 2026-07-14 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 通过结合培养优化和合成生物学，提高黄色粘球菌中次生代谢物（如myxoprincomide）的产量与检测能力 | 提出名为2PRIM-BOOST的新策略，结合底盘菌株工程与两步生长培养基优化，增强非核糖体肽合成酶（NRPS）/聚酮合酶（PKS）次生代谢物的生产，并促进医学相关生物活性筛选 | 该方法目前仅针对myxoprincomide进行验证，尚需应用于更多隐性代谢物以全面验证其有效性 | 提高粘细菌次生代谢物的实验室产量，以发现新药物前体 | 黄色粘球菌DZ2菌株及其产生的次生代谢物myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 合成生物学、启动子工程、培养基优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9或相关基因组工程工具（未明确指定） | 黄色粘球菌（Myxococcus xanthus） | 组成型强启动子插入至生物合成基因簇上游 | 医学 |
| 4 | 2026-07-13 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究Methanosarcina acetivorans在抑制能量保守性甲烷苯并蒽醌：CoM-CoB异二硫化物还原酶HdrED时的转录响应 | 揭示细胞通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性将甲烷生成与基因调控耦合的未知机制，并发现甲基营养型甲烷生成调节因子MsrC参与异二硫化物感应 | NA | 了解产甲烷古菌如何感知和响应末端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans | 机器学习 | NA | 转录组分析 | NA | 转录本丰度数据 | NA | NA | Methanosarcina acetivorans | NA | 可再生能源生产, 可持续化学品生产, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-07-03 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-12-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
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综述 | 系统回顾21世纪中国在植物病毒抗病毒剂方面的化学与生物学研究进展 | 整合化学、化学生物学、合成生物学等多学科方法，深入分析植物病毒靶标生物学特征及药物-靶标互作机制 | 未明确指出具体研究局限，可能缺乏对现有药剂抗性问题的讨论 | 综述植物病毒抗病毒剂研发的生物学基础、靶标特性及未来药物开发方向 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 植物病毒学 | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 6 | 2026-07-01 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-12-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本综述总结了天然产物生物合成中异戊二烯侧链的修饰机制及其对结构和功能多样性的贡献 | 揭示了环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、非常规C-C键断裂和氧化环化等新型生物合成机制 | 未具体说明局限性 | 指导异戊二烯侧链修饰的发现、表征和应用 | 天然产物生物合成中的异戊二烯侧链修饰 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 7 | 2026-05-22 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出使用线性混合效应模型评估合成基因电路性能，并验证固定效应β作为布尔逻辑门行为的统计描述符 | 首次将线性混合效应模型系统应用于合成基因电路的统计分析，引入固定效应β作为量化布尔逻辑门性能的通用指标，并结合蒙特卡洛模拟推荐实验样本量 | 未提及 | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法，建立可预测的布尔逻辑门性能指标 | 已发表的144个布尔逻辑门及设计的嵌套抑制子OR门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型，无监督机器学习（k-means聚类），蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | 144个布尔逻辑门数据及模拟样本量 | NA | NA | 合成基因电路，布尔逻辑门（OR门等） | 计算、生物传感、人类健康 |
| 8 | 2026-04-18 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 本研究从两栖动物蟾蜍中鉴定出七种具有不同催化特性的吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶，并解析了其底物混杂性和特异性的分子机制 | 首次在蟾蜍中系统鉴定INMT家族酶，揭示了其底物混杂性与特异性的多样性，并通过分子对接和突变实验阐明了相关机制 | 研究主要基于体外酶学实验，未在活体系统中验证酶的功能；样本来源仅限于一种蟾蜍物种，可能缺乏普适性 | 探究INMT家族酶的底物混杂性和特异性机制，为天然产物生物合成和合成生物学应用提供基础 | 从Bufo gargarizan蟾蜍中鉴定的七种INMT家族酶（BNMT 1, 3, 4, 5, 6, 7, 11） | 合成生物学 | NA | 分子对接、定点突变、酶学活性测定 | NA | 酶学数据、分子模拟数据 | 七种酶蛋白 | NA | Bufo gargarizan（蟾蜍） | NA | 医药、工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-13 |
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-Dec-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264
PMID:39658019
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综述 | 本文综述了细菌金属稳态的机制，包括金属感应、金属蛋白质组重塑和金属运输过程 | 提供了金属感应蛋白和金属感应核糖开关多样性的综合视角，并探讨了其在合成生物学和生物技术应用中的选择性利用 | 作者指出在金属稳态理解方面仍存在知识空白，需要更多研究来填补 | 探讨细菌如何维持金属稳态以确保金属蛋白质组的功能完整性和适应性 | 细菌的金属感应机制、金属蛋白质组和金属运输系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 10 | 2026-04-09 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-12-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流控工作流程，用于分析质粒保留，通过培养单细胞于凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落 | 采用开源硬件微流控技术，结合荧光蛋白表达和非特异性DNA染色，实现高通量质粒稳定性分析，相比传统平板计数具有更高统计能力 | 研究主要聚焦于大肠杆菌作为实验模型，方法虽具通用性但需进一步验证于其他生物体 | 开发一种开源微流控工作流程，用于分析质粒在无抗生素选择下的保留情况 | 质粒在单细胞中的表达和保留，以及微菌落的量化 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、DNA染色 | NA | 图像数据 | NA | 开源硬件 | 大肠杆菌 | 质粒表达荧光蛋白，用于构建生物传感器或标记系统 | 工业生物技术、环境、医学 |
| 11 | 2026-03-05 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微流体平台与数学模型的系统，用于在单细胞水平上定量表征真菌基因调控回路，并利用该平台成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 首次将先进微流体平台与数学模型结合，实现了对多细胞真菌基因调控回路在单细胞水平的精确表征与定量分析 | 研究主要基于模式真菌构巢曲霉，尚未广泛验证于其他真菌物种 | 定量表征真菌次级代谢相关基因调控回路，以发现新型天然产物 | 真菌基因调控回路（GRCs）及其调控的次级代谢生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 微流体平台、数学模型、基因回路重构 | 数学模型 | 单细胞表达数据 | 30个转录因子-启动子组合（源自两个代表性真菌GRCs） | 基因回路重构 | 构巢曲霉（Aspergillus nidulans） | 基因调控回路（GRCs）、生物合成基因簇（BGCs）重构 | 医药、工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-10 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Dec-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102320
PMID:39398225
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研究论文 | 本研究评估了利用CRISPR-Cas9和HITI技术在骨骼肌高表达位点进行RNA引导DNA整合的精确性和有效性，旨在实现长期治疗基因表达 | 通过劫持肌肉肌酸激酶和肌红蛋白启动子，在骨骼肌中实现高效治疗基因整合，为基于靶向整合的医学提供概念验证技术 | 研究基于小鼠模型，人类应用需进一步验证；长期安全性和免疫反应未全面评估 | 开发一种在骨骼肌中实现高水平治疗基因表达的靶向整合方法，用于基因替代疗法 | 小鼠成肌细胞和骨骼肌组织，使用GFP或人因子IX作为报告或治疗基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, HITI, 基因组和转录组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中明确） | CRISPR-Cas9 | 小鼠 | 利用内源启动子（肌肉肌酸激酶和肌红蛋白）驱动治疗基因表达的合成生物电路 | 医学 |
| 13 | 2026-01-17 |
Harnessing microbes to pioneer environmental biophotoelectrochemistry
2024-12, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.005
PMID:39095256
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综述 | 本文综述了微生物生物光电化学系统在环境可持续性策略中的应用，强调其从传统生物能源系统向高级应用的转变 | 强调了从传统生物能源系统向复杂BPEC应用的转变，利用太阳能进行生化转化，并整合系统设计与合成生物学以扩展环境清洁和能源生成潜力 | NA | 探索微生物生物光电化学系统在环境可持续策略中的应用，包括碳氮固定、污染物降解和废水能源回收 | 微生物生物光电化学系统及其在环境修复和能源生成中的应用 | NA | NA | 微生物生物光电化学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 环境, 能源 |
| 14 | 2025-12-05 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
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研究论文 | 本文通过数学建模研究了诱导型双稳态系统中基因调控网络对细胞命运决定的动态过程的影响 | 揭示了基因调控步骤的延迟和外部诱导时间尺度对命运决定动态轨迹的偏差作用，并提出了稳态参数决定命运决定景观而动态过程形成新的瞬态分布的观点 | NA | 研究诱导型双稳态系统中细胞命运决定的动态过程 | 基因调控网络和细胞命运决定过程 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 常微分方程 | NA | NA | NA | NA | 诱导型双稳态系统 | 合成生物学 |
| 15 | 2025-12-03 |
Perspectives on Synthetic Protein Circuits in Mammalian Cells
2024-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100555
PMID:39372446
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综述 | 本文综述了哺乳动物细胞中合成蛋白质电路的设计原理、工具及其在生物医学领域的应用前景 | 系统梳理了基于蛋白质翻译后修饰（如蛋白水解和磷酸化）的合成生物学工具包，并提出了从工具开发到临床前应用的转化框架 | NA | 探讨合成蛋白质电路在哺乳动物细胞工程化中的应用潜力与设计策略 | 哺乳动物细胞中的合成蛋白质电路 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质工程、翻译后修饰调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | 基于蛋白水解、磷酸化或可编程结合的合成蛋白质电路，用于重编程细胞行为 | 医学 |
| 16 | 2025-11-24 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
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研究论文 | 本研究揭示了SKIK肽标签能有效缓解由连续脯氨酸残基组成的核糖体停滞肽引起的翻译停滞现象 | 首次发现SKIK肽标签与翻译延伸因子EF-P在缓解连续脯氨酸富集蛋白的核糖体停滞中具有协同促进作用 | 研究主要关注特定类型的停滞肽（WPPP和SecM AP），对其他类型停滞肽的适用性尚需验证 | 探究SKIK肽标签对核糖体翻译停滞的缓解机制及其在蛋白质生产优化中的应用 | 含有连续脯氨酸残基的核糖体停滞肽（WPPP和SecM AP）及其对翻译过程的影响 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成系统、体外翻译反应、动力学分析 | NA | 蛋白质产量数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
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研究论文 | 通过启动子捕获方法从南极微生物群落中鉴定出在多种假单胞菌门细菌中具有功能的广宿主范围启动子序列 | 首次从南极微生物群落中发现能在多种假单胞菌门细菌中工作的广宿主范围启动子序列 | 仅构建了约2000个克隆的文库，样本规模相对有限 | 扩展合成生物学可用生物元件的目录 | 南极微生物群落中的启动子序列 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆，从中鉴定出13个功能启动子序列 | 启动子捕获 | Pseudomonas putida KT2440, Escherichia coli DH5α, Cupriavidus taiwanensis R1, Paraburkholderia phymatum STM 815, Ensifer meliloti 1021, Pseudomonas sp. UYIF39 | 启动子元件 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 开发了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的方案，制造出无法分裂但能抵抗环境压力的细胞-材料混合体 | 首次实现了细菌细胞内合成聚合物网络的组装，创造了兼具合成材料工程简易性和天然细胞功能性的新型细胞底盘 | 需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术等专业知识，功能化扩展需要合成基因电路工程和水凝胶聚合化学技能 | 开发结合合成材料工程简易性和天然细胞功能性的新型细胞底盘 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA | 细胞内水凝胶化 | 细菌 | 合成聚合物网络 | 生物技术、生物医学工程、活体治疗 |
| 19 | 2025-10-05 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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观点文章 | 介绍诺华公司在天然产物药物发现领域的工具、挑战和成功经验 | 整合基因组工程和数据科学等新技术，探索抗体药物偶联物、放射性配体疗法和xRNA药物等新治疗模式 | NA | 推动天然产物从早期研究向开发和临床应用转化 | 微生物菌株和分离的天然产物 | 药物发现 | NA | 基因组工程、数据科学、计算生物学、合成生物学 | NA | NA | 90,000个微生物菌株和20,000个分离的天然产物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 20 | 2025-10-05 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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综述 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法研究玫瑰孢链霉菌中达托霉素生物合成的调控机制 | 发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域存在两个突变，并鉴定出十个可用于代谢工程调控的正负调控基因 | NA | 通过基因组分析和合成生物学方法加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 玫瑰孢链霉菌及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 革兰氏阳性菌感染 | 基因组测序、代谢工程、合成生物学、诱变育种 | NA | 基因组序列数据 | 两种菌株（野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株） | 代谢工程,合成生物学,定向诱变 | 玫瑰孢链霉菌 | 达托霉素生物合成基因簇，包含九个翻译偶联基因 | 医药 |