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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-07-11 |
Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01454-3
PMID:38985434
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研究论文 | 本文研究了从印度阿萨姆邦Pobitora野生动物保护区森林根际土壤中分离出的Streptomyces sp. PBR19的抗菌活性及其生物合成潜力 | 发现PBR19可能是一个新的分类单元,并显示出对ESKAPE病原体的显著抗菌活性,同时含有与抗生素合成相关的PKS II型基因 | 研究仅针对有限的病原体进行了测试,且未进行体内实验验证 | 探索PBR19的抗菌活性及其在药物开发和合成生物学中的潜在应用 | Streptomyces sp. PBR19及其抗菌活性 | 微生物学 | 细菌感染 | 扫描电子显微镜(SEM)、基因测序 | NA | 微生物样本、基因数据 | 单一分离菌株PBR19及其提取物 |
2 | 2025-07-10 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
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研究论文 | 本文描述了在大肠杆菌中使用改良的三羧酸循环(THETA循环)进行碳固定和氨基酸合成的研究 | 提出了THETA循环这一改良的三羧酸循环,用于合成生物学和碳固定,并展示了其在体内各模块的可行性及与大肠杆菌代谢网络的整合 | NA | 研究改良的三羧酸循环在合成生物学和碳固定中的应用 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重新设计、异源表达 | NA | NA | NA |
3 | 2025-06-20 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本文通过基因工程改造高色氨酸表达的细菌株,抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应,以增强肿瘤免疫治疗效果 | 开发了一种能严格定植于肿瘤的高色氨酸表达细菌株,其产生的丁酸盐能抑制IDO活性,同时释放大量色氨酸支持CD8+ T细胞激活和能量代谢 | 目前仅在鼠和兔的多肿瘤模型中验证效果,临床应用的可行性和安全性尚需进一步研究 | 开发一种增强肿瘤免疫治疗的合成生物学策略 | 基因工程改造的细菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞反应的影响 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | 鼠和兔的多肿瘤模型 |
4 | 2025-06-12 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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research paper | 该研究利用合成生物学方法开发了一种能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程细菌,这种细菌能够增强光的聚焦 | 通过工程化细菌表达硅酸盐生物矿化酶,使其能够自组装聚硅酸盐外壳,形成具有可调结构特性的活体微透镜,其光聚焦能力比未修饰细菌强近一个数量级 | NA | 开发一种环境友好、具有可调结构特性的活体微透镜,用于光聚焦和操纵 | 工程化细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
5 | 2025-06-03 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
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review | 本文综述了细菌无细胞系统中的天然和工程调控组件及其应用 | 全面概述了无细胞系统中调控组件的使用,包括天然和工程化的组件 | NA | 探讨无细胞系统中调控组件的应用及其在合成生物学中的重要性 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-03 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
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research paper | 探讨合成生物学如何影响细菌纤维素(BC)基生物材料的现状及其在工程活性材料(ELMs)中的应用 | 结合合成生物学与材料科学,开发具有编程生物功能的可持续材料,并探索3D生物打印在BC基ELMs中的潜在应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 研究合成生物学如何推动细菌纤维素基材料的创新及其在生物医学等领域的应用 | 细菌纤维素(BC)及其衍生的工程活性材料(ELMs) | 合成生物学与材料科学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA |
7 | 2025-06-03 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
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研究论文 | 本文开发了一种新型的αCD206-synNotch受体,用于研究肿瘤微环境中巨噬细胞与癌细胞之间的瞬时相互作用 | 开发了针对CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch受体,这是一种新型的合成受体,可用于监测和理解巨噬细胞与癌细胞之间的相互作用对转移建立的影响 | 研究中发现了关于其应用的一些意外注意事项,具体细节未明确说明 | 开发新型合成受体以研究肿瘤微环境中巨噬细胞与癌细胞的相互作用 | CD206巨噬细胞和癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | synNotch受体工程 | 小鼠转移模型 | NA | NA |
8 | 2025-06-03 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
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research paper | 本研究介绍了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP,用于细菌光遗传学应用 | 开发了首个红光诱导的Cre重组酶系统,解决了现有光遗传工具主要响应蓝光的限制,并展示了红光在密集培养穿透性和低毒性方面的优势 | NA | 开发适用于细菌的多色光遗传控制系统 | 细菌基因表达和DNA切除的光控系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学技术 | OptoCre-REDMAP系统(基于PhyA和FHY1植物光感受器与分裂Cre重组酶) | NA | NA |
9 | 2025-06-03 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
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research paper | 研究SKIK肽标签如何缓解由连续脯氨酸残基引起的翻译停滞,并揭示其与EF-P协同促进翻译的机制 | 发现SKIK肽标签能有效缓解WPPP引起的翻译停滞,并揭示其与EF-P的协同作用 | 研究主要基于体外翻译反应和体内蛋白质生产系统,未涉及更复杂的生物环境 | 优化蛋白质生产过程以推动合成生物学应用 | 核糖体停滞肽(RAPs)如SecM AP和WPPP | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成和体内蛋白质生产系统 | NA | 蛋白质序列和翻译效率数据 | 未明确提及具体样本数量 |
10 | 2025-06-03 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
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研究论文 | 本文探讨了通过基因修饰宏观活体材料的蛋白质基质来控制其结构和流变学特性的方法 | 研究了弹性蛋白样多肽(ELP)长度变化对活体材料微观结构和粘弹性行为的影响,揭示了序列-结构-特性之间的关系 | 研究结果与其它生物复合材料模型的相似性较少,复杂性较高 | 探索活体工程材料(ELMs)的序列、结构和流变学特性之间的关系 | 弹性蛋白样多肽(ELP)修饰的宏观活体材料 | 生物材料工程 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
11 | 2025-06-03 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
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研究论文 | 该研究开发了一种由吲哚激活的T7 RNA聚合酶变体,用于合成生物学中的精确基因表达调控 | 首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过生理浓度吲哚的化学诱导激活,创建了新型配体激活核酸聚合酶(LARPs)平台 | EC50值为344 μM的激活效率可能在某些应用中需要优化 | 开发化学诱导的基因表达调控系统用于合成生物学应用 | T7 RNA聚合酶变体及其在细菌中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化 | NA | NA | NA |
12 | 2025-06-03 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究通过在大肠杆菌中使用组合生物合成途径,合成了含有鸟氨酸的抗菌乳酸素481类似物 | 利用具有宽松底物特异性的SyncM酶催化活性乳酸素481的产生,并成功将鸟氨酸和(甲基)羊毛硫氨酸整合到肽中 | 在乳酸素481特定位点,先前的羊毛硫氨酸和甲基羊毛硫氨酸形成可能阻碍鸟氨酸的掺入 | 探索抗菌肽的生物合成途径及其功能多样性 | 乳酸素481及其含有鸟氨酸的类似物 | 合成生物学 | NA | 组合生物合成途径 | NA | NA | NA |
13 | 2025-06-03 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究利用膜结合异戊二烯基转移酶在Komagataella phaffii中实现了生物活性苯丙素类化合物Artepillin C的从头合成 | 通过增强异戊二烯二磷酸供应途径,显著提高了Artepillin C的产量,并实现了最高报道水平的从头合成量 | 研究中发现对香豆酸(-CA)的供应成为工程菌株中Artepillin C生产的瓶颈 | 开发稳定的Artepillin C生物合成方法 | Artepillin C生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因工程、分批培养 | NA | NA | NA |
14 | 2025-06-03 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议,使其无法进行细胞分裂并抵抗环境压力 | 提出了一种将细菌转化为单寿命设备的新方法,结合了合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性 | 协议的实施需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识,进一步功能化需要从合成遗传电路工程到水凝胶聚合化学的技能 | 开发一种新的细胞底盘,结合合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性,用于生物技术、生物医学工程和活体治疗 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 水凝胶化学、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-01 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究利用转录组学数据从红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938中发现了组成型和光调控启动子,并开发了该生物的模块化合成生物学部件集合 | 结合系统生物学和合成生物学,开发了一种从组学到部件的流程,为非传统微生物提供了快速“入门”方法 | 许多假定的调控启动子在合成遗传背景下表现为组成型,仅有一个启动子在UV照射下显示出九倍激活 | 研究Xanthophyllomyces dendrorhous在不同光波长和氧化应激条件下的转录组学,开发其遗传工具 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学、差异基因表达分析(DGE)、基因本体(GO)分析 | NA | 转录组数据 | 在不同光波长(红、绿、蓝、紫外)和氧化应激条件下的Xanthophyllomyces dendrorhous样本 |
16 | 2025-05-29 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过RNA测序比较转录组分析,在模型蓝藻Synechococcus elongatus PCC 7942中鉴定了酸性应激响应基因,并通过基因敲除和过表达实验验证了这些基因在酸耐受性中的作用 | 鉴定了六个参与酸性应激响应的基因,并通过过表达chlL和chlN基因成功提高了S. elongatus PCC 7942的酸耐受性 | 研究仅针对S. elongatus PCC 7942,未在其他蓝藻中进行验证 | 探究蓝藻的酸应激响应机制并提高其酸耐受性 | Synechococcus elongatus PCC 7942蓝藻 | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
17 | 2025-05-29 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了青霉菌中多糖降解酶(PPDE)的分布、功能、生物合成调控机制及高产PPDE菌株的分子育种研究进展 | 总结了青霉菌PPDE的最新研究进展,包括其分布、功能、调控机制及分子育种策略 | 作为小型综述,可能未涵盖该领域所有相关研究 | 促进通过代谢工程和合成生物学开发真菌PPDE生产,推动PPDE工业生物精炼应用 | 青霉菌(特别是草酸青霉)及其产生的植物多糖降解酶(PPDE) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程 | NA | NA | NA |
18 | 2025-05-29 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文综述了利用基因工程技术改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇的策略和合成生物学方法 | 总结了近年来通过基因工程改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的策略 | 讨论了工程化微生物宿主面临的挑战,如底物范围有限、溶剂耐受性低等问题 | 提高可再生资源生产生物燃料异丁醇的效率 | 微生物宿主 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA |
19 | 2025-05-28 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 该研究设计了一种在大肠杆菌中生产(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 结合合成生物学、生物催化和合成化学方法,设计了一个五步工程生物合成途径,用于生产复杂的吲哚生物碱 | NA | 简化对含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物的获取途径 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
20 | 2025-05-02 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 介绍了一种基于开放硬件的微流体工作流程,用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留 | 采用开源硬件微流体工作流程,提供精确的流量控制和温度管理,增强易用性、稳健性和可访问性 | 研究以大肠杆菌为实验模型,方法的普适性有待进一步验证 | 分析质粒保留,为合成生物学提供技术支持 | 质粒和单细胞微菌落 | 合成生物学 | NA | 微流体技术、荧光显微镜 | NA | 图像数据 | 大量微滴和微菌落 |