合成生物学相关文章
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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
|
研究论文 | 通过启动子捕获方法从南极微生物群落中鉴定出在多种假单胞菌门细菌中具有功能的广宿主范围启动子序列 | 首次从南极微生物群落中发现能在多种假单胞菌门细菌中工作的广宿主范围启动子序列 | 仅构建了约2000个克隆的文库，样本规模相对有限 | 扩展合成生物学可用生物元件的目录 | 南极微生物群落中的启动子序列 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆，从中鉴定出13个功能启动子序列 | 启动子捕获 | Pseudomonas putida KT2440, Escherichia coli DH5α, Cupriavidus taiwanensis R1, Paraburkholderia phymatum STM 815, Ensifer meliloti 1021, Pseudomonas sp. UYIF39 | 启动子元件 | 工业生物技术 |
| 2 | 2025-10-05 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
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研究论文 | 本研究探讨诱导双稳态系统中基因调控网络动态过程对细胞命运决定的影响 | 揭示了基因调控步骤延迟和外部诱导时间尺度对命运决定动态过程的影响，提出稳态参数决定命运决策景观但动态演化过程会产生新的瞬态分布 | NA | 理解生物命运决定过程中的动态机制 | 诱导双稳态系统中的基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 常微分方程 | 理论模型 | NA | NA | NA | 双稳态系统 | 合成生物学 |
| 3 | 2025-10-05 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 开发了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的方案，制造出无法分裂但能抵抗环境压力的细胞-材料混合体 | 首次实现了细菌细胞内合成聚合物网络的组装，创造了兼具合成材料工程简易性和天然细胞功能性的新型细胞底盘 | 需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术等专业知识，功能化扩展需要合成基因电路工程和水凝胶聚合化学技能 | 开发结合合成材料工程简易性和天然细胞功能性的新型细胞底盘 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA | 细胞内水凝胶化 | 细菌 | 合成聚合物网络 | 生物技术、生物医学工程、活体治疗 |
| 4 | 2025-10-05 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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观点文章 | 介绍诺华公司在天然产物药物发现领域的工具、挑战和成功经验 | 整合基因组工程和数据科学等新技术，探索抗体药物偶联物、放射性配体疗法和xRNA药物等新治疗模式 | NA | 推动天然产物从早期研究向开发和临床应用转化 | 微生物菌株和分离的天然产物 | 药物发现 | NA | 基因组工程、数据科学、计算生物学、合成生物学 | NA | NA | 90,000个微生物菌株和20,000个分离的天然产物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 5 | 2025-10-05 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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综述 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法研究玫瑰孢链霉菌中达托霉素生物合成的调控机制 | 发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域存在两个突变，并鉴定出十个可用于代谢工程调控的正负调控基因 | NA | 通过基因组分析和合成生物学方法加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 玫瑰孢链霉菌及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 革兰氏阳性菌感染 | 基因组测序、代谢工程、合成生物学、诱变育种 | NA | 基因组序列数据 | 两种菌株（野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株） | 代谢工程,合成生物学,定向诱变 | 玫瑰孢链霉菌 | 达托霉素生物合成基因簇，包含九个翻译偶联基因 | 医药 |
| 6 | 2025-10-05 |
Systematic review on marine carbon source-mannitol: Applications in synthetic biology
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127881
PMID:39241502
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综述 | 系统综述海洋碳源甘露醇在合成生物学中的应用现状与前景 | 首次系统总结甘露醇作为海洋碳源在合成生物学中的双重应用：既作为遗传回路诱导剂又作为高价值化学品生物制造的碳源 | NA | 提升甘露醇在合成生物学中应用的竞争力，改善生物合成过程的效率 | 甘露醇作为海洋碳源及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 多种微生物宿主 | 遗传回路控制、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01454-3
PMID:38985434
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研究论文 | 从印度阿萨姆森林根际土壤中分离的链霉菌PBR19具有抗菌活性和生物合成潜力 | 发现可能为新分类单元的链霉菌PBR19，其含有与抗生素合成相关的II型聚酮合酶基因，对ESKAPE病原体表现出显著抗菌活性 | NA | 探索森林根际土壤来源的链霉菌的抗菌活性和生物合成潜力 | 链霉菌PBR19及其代谢产物 | 微生物学 | 细菌感染 | 扫描电子显微镜(SEM)、基因测序、最小抑菌浓度(MIC)测定 | NA | 基因序列数据、显微镜图像、化学分析数据 | 1个链霉菌分离株(PBR19) | NA | 链霉菌(Streptomyces sp.) | NA | 医药 |
| 8 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
|
研究论文 | 本文描述了一种名为THETA循环的改良三羧酸循环系统在大肠杆菌中用于碳固定和氨基酸合成 | 开发了名为THETA循环的新型代谢循环系统，将传统单向TCA循环改造为可用于碳固定的双向循环 | NA | 开发合成生物学代谢循环系统以增强二氧化碳捕获和封存能力 | 大肠杆菌代谢系统和THETA循环模块 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重新设计、异源表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | THETA代谢循环，包含三个模块：丙酮酸到琥珀酸转化、琥珀酸到巴豆酰辅酶A转化、巴豆酰辅酶A到乙酰辅酶A和丙酮酸转化 | 环境, 能源 |
| 9 | 2025-10-05 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 通过基因工程改造高色氨酸表达菌株用于肿瘤免疫治疗，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应 | 开发了能严格定植肿瘤的高色氨酸表达工程菌株，通过产生丁酸盐抑制IDO活性，同时提供色氨酸支持CD8+ T细胞活化 | NA | 开发基于合成生物学的肿瘤免疫治疗新策略 | 基因工程菌株L-Trp CB及其在肿瘤微环境中的作用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔子多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达工程菌株 | 医学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程菌，展示了增强的光聚焦能力 | 首次利用工程细菌自组装形成聚硅酸盐外壳，创造出具有可调结构特性的活体微透镜 | NA | 开发环境友好型活体微透镜，用于光子器件的光聚焦和操控 | 工程改造的细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、硅酸盐生物矿化技术 | NA | 光学性能数据 | NA | 基因工程 | 细菌 | 硅酸盐酶表达系统，使细菌能够自组装聚硅酸盐外壳 | 光子器件、光学材料 |
| 11 | 2025-10-05 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
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综述 | 本文全面概述了细菌无细胞系统中使用的天然和工程化调控组件及其应用 | 系统总结了无细胞系统中调控组件的功能复杂性增长需求，涵盖天然和工程化两类调控组件 | NA | 为细菌无细胞系统工程提供调控组件的全面概述 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 调控网络、基因电路 | 诊断工具开发、代谢工程 |
| 12 | 2025-10-05 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
|
综述 | 探讨合成生物学如何推动细菌纤维素基生物材料的发展及其在工程活性材料中的应用 | 将合成生物学与细菌纤维素材料相结合，开发具有编程生物功能的新型工程活性材料 | NA | 研究合成生物学在细菌纤维素材料工程化中的应用潜力 | 细菌纤维素及其衍生的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 生物传感器、响应系统 | 生物医学, 材料科学, 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch合成受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | 首次开发了专门靶向CD206巨噬细胞的synNotch合成受体，为研究肿瘤转移过程中的细胞间相互作用提供了新工具 | 研究中发现了该受体应用中的意外限制和注意事项 | 开发新型合成受体以研究巨噬细胞与癌细胞在肿瘤转移过程中的相互作用机制 | CD206巨噬细胞、癌细胞、小鼠转移模型 | 合成生物学 | 肿瘤转移 | synNotch受体工程、哺乳动物合成生物学 | NA | NA | NA | synNotch | 哺乳动物细胞 | 合成受体、生物传感器 | 医学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
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研究论文 | 开发了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP，用于细菌光遗传学应用 | 首次将植物光感受器PhyA和FHY1与分裂Cre重组酶结合，创建红光响应系统，实现与蓝光系统的正交控制 | NA | 开发红光响应的光遗传学工具，改善光控基因表达的波长选择性和组织穿透性 | 细菌基因表达控制系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学，基因工程 | NA | NA | NA | Cre重组酶，分裂蛋白系统 | 细菌 | 红光诱导基因表达系统，DNA切除控制 | 工业生物技术 |
| 15 | 2025-10-05 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
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研究论文 | 本研究揭示了翻译增强型SKIK肽标签能够有效缓解由连续脯氨酸残基组成的核糖体阻滞肽引起的翻译停滞现象 | 首次发现SKIK肽标签与翻译延伸因子P在缓解连续脯氨酸富集蛋白的核糖体停滞中具有协同促进作用，并证明其位置邻近性对缓解效果的关键影响 | 研究主要关注特定类型的阻滞肽（WPPP和SecM AP），对其他类型阻滞肽的效果尚未验证 | 探究SKIK肽标签对核糖体阻滞肽引起的翻译停滞的缓解机制及其在蛋白质生产优化中的应用 | 含有连续脯氨酸残基的核糖体阻滞肽（SecM AP和WPPP）及其对翻译过程的影响 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成系统、体外翻译反应、动力学分析 | NA | 蛋白质产量数据、荧光蛋白表达数据、动力学数据 | 使用超折叠绿色荧光蛋白作为报告基因进行体外翻译反应分析 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
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研究论文 | 本研究通过改变工程活材料中弹性蛋白样多肽的长度，探索其对材料微观结构和粘弹性行为的影响 | 首次系统研究弹性蛋白样多肽长度变化对工程活材料序列-结构-性能关系的影响，揭示了基因序列微调可显著改变材料流变特性的新设计原理 | 研究结果与其他生物复合材料模型缺乏可比性，序列-结构-性能关系较为复杂 | 阐明工程活材料的序列-结构-性能关系，探索基因序列调控对材料性能的影响 | 基于工程菌的厘米级工程活材料及其蛋白基质 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 材料性能数据、显微结构数据 | 三种不同ELP长度的工程活材料变体 | 合成生物学方法 | 工程菌 | 弹性蛋白样多肽(ELP)蛋白基质工程 | 材料 |
| 17 | 2025-10-05 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
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研究论文 | 本研究开发了可通过吲哚调控的T7 RNA聚合酶变体，实现精确的转录控制 | 首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过内源性代谢物吲哚的严格调控，创建了新型化学诱导'停走'平台 | NA | 开发受内源性代谢物调控的精确酶活性控制系统 | T7 RNA聚合酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 细菌 | 配体激活核酸聚合酶(LARPs)，化学诱导停走平台 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究在大肠杆菌中构建组合生物合成途径，成功生产含鸟氨酸的乳酸素481类似物并评估其抗菌活性 | 利用具有宽松底物特异性的SyncM修饰酶和新型肽精氨酸酶OspR，首次在乳酸素481中同时引入鸟氨酸和(甲基)羊毛硫氨酸修饰 | 特定位点的羊毛硫氨酸和甲基羊毛硫氨酸形成可能会阻碍鸟氨酸的掺入 | 开发合成生物学策略以增强抗菌肽的化学和功能多样性 | 乳酸素481及其含鸟氨酸的类似物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 组合生物合成、酶催化修饰 | NA | 生物活性数据 | 使用单指示菌株进行抗菌活性评估 | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 组合生物合成途径，包含杂交前导肽设计、酶催化修饰系统 | 医药 |
| 19 | 2025-10-05 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究利用膜结合异戊烯基转移酶在Komagataella phaffii中实现了生物活性苯丙素类化合物Artepillin C的从头合成 | 首次在Komagataella phaffii中实现Artepillin C的从头合成，通过增强异戊二烯底物途径和优化对香豆酸供应，产量达到目前报道的最高水平 | 对香豆酸供应在工程菌株中仍构成生产瓶颈 | 通过合成生物学方法实现Artepillin C的稳定供应 | Artepillin C生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、分批培养、补料分批培养 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 代谢工程 | Komagataella phaffii | Artepillin C生物合成途径，包含对香豆酸特异性双异戊烯基转移酶AcPT1、异戊烯基二磷酸异构酶和截短型HMG-CoA还原酶 | 医药 |
| 20 | 2025-10-05 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学元件库 | 首次将系统生物学与合成生物学结合，创建了从组学到元件的流程，为非常规微生物快速开发遗传工具 | 许多推定的调控型启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 差异基因表达分析, 基因本体分析, 荧光素酶检测 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 在不同波长光照和氧化应激条件下的X. dendrorhous样本 | 模块化克隆系统 | Xanthophyllomyces dendrorhous | 组成型和光调控启动子, 整合位点, 终止子, 选择标记, 报告基因 | 工业生物技术 |