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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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综述 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法研究玫瑰孢链霉菌中达托霉素生物合成的调控机制 | 发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域存在两个突变,并鉴定出十个可用于代谢工程调控的正负调控基因 | NA | 通过基因组分析和合成生物学方法加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 玫瑰孢链霉菌及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 革兰氏阳性菌感染 | 基因组测序、代谢工程、合成生物学、诱变育种 | NA | 基因组序列数据 | 两种菌株(野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株) | 代谢工程,合成生物学,定向诱变 | 玫瑰孢链霉菌 | 达托霉素生物合成基因簇,包含九个翻译偶联基因 | 医药 |
| 22 | 2025-10-05 |
Systematic review on marine carbon source-mannitol: Applications in synthetic biology
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127881
PMID:39241502
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综述 | 系统综述海洋碳源甘露醇在合成生物学中的应用现状与前景 | 首次系统总结甘露醇作为海洋碳源在合成生物学中的双重应用:既作为遗传回路诱导剂又作为高价值化学品生物制造的碳源 | NA | 提升甘露醇在合成生物学中应用的竞争力,改善生物合成过程的效率 | 甘露醇作为海洋碳源及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 多种微生物宿主 | 遗传回路控制、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 23 | 2025-10-05 |
Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01454-3
PMID:38985434
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研究论文 | 从印度阿萨姆森林根际土壤中分离的链霉菌PBR19具有抗菌活性和生物合成潜力 | 发现可能为新分类单元的链霉菌PBR19,其含有与抗生素合成相关的II型聚酮合酶基因,对ESKAPE病原体表现出显著抗菌活性 | NA | 探索森林根际土壤来源的链霉菌的抗菌活性和生物合成潜力 | 链霉菌PBR19及其代谢产物 | 微生物学 | 细菌感染 | 扫描电子显微镜(SEM)、基因测序、最小抑菌浓度(MIC)测定 | NA | 基因序列数据、显微镜图像、化学分析数据 | 1个链霉菌分离株(PBR19) | NA | 链霉菌(Streptomyces sp.) | NA | 医药 |
| 24 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
|
研究论文 | 本文描述了一种名为THETA循环的改良三羧酸循环系统在大肠杆菌中用于碳固定和氨基酸合成 | 开发了名为THETA循环的新型代谢循环系统,将传统单向TCA循环改造为可用于碳固定的双向循环 | NA | 开发合成生物学代谢循环系统以增强二氧化碳捕获和封存能力 | 大肠杆菌代谢系统和THETA循环模块 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重新设计、异源表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | THETA代谢循环,包含三个模块:丙酮酸到琥珀酸转化、琥珀酸到巴豆酰辅酶A转化、巴豆酰辅酶A到乙酰辅酶A和丙酮酸转化 | 环境, 能源 |
| 25 | 2025-10-05 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
|
综述 | 本文全面概述了细菌无细胞系统中使用的天然和工程化调控组件及其应用 | 系统总结了无细胞系统中调控组件的功能复杂性增长需求,涵盖天然和工程化两类调控组件 | NA | 为细菌无细胞系统工程提供调控组件的全面概述 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 调控网络、基因电路 | 诊断工具开发、代谢工程 |
| 26 | 2025-10-05 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
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综述 | 探讨合成生物学如何推动细菌纤维素基生物材料的发展及其在工程活性材料中的应用 | 将合成生物学与细菌纤维素材料相结合,开发具有编程生物功能的新型工程活性材料 | NA | 研究合成生物学在细菌纤维素材料工程化中的应用潜力 | 细菌纤维素及其衍生的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 生物传感器、响应系统 | 生物医学, 材料科学, 工业生物技术 |
| 27 | 2025-10-05 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch合成受体,用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | 首次开发了专门靶向CD206巨噬细胞的synNotch合成受体,为研究肿瘤转移过程中的细胞间相互作用提供了新工具 | 研究中发现了该受体应用中的意外限制和注意事项 | 开发新型合成受体以研究巨噬细胞与癌细胞在肿瘤转移过程中的相互作用机制 | CD206巨噬细胞、癌细胞、小鼠转移模型 | 合成生物学 | 肿瘤转移 | synNotch受体工程、哺乳动物合成生物学 | NA | NA | NA | synNotch | 哺乳动物细胞 | 合成受体、生物传感器 | 医学 |
| 28 | 2025-10-05 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
|
研究论文 | 开发了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP,用于细菌光遗传学应用 | 首次将植物光感受器PhyA和FHY1与分裂Cre重组酶结合,创建红光响应系统,实现与蓝光系统的正交控制 | NA | 开发红光响应的光遗传学工具,改善光控基因表达的波长选择性和组织穿透性 | 细菌基因表达控制系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学,基因工程 | NA | NA | NA | Cre重组酶,分裂蛋白系统 | 细菌 | 红光诱导基因表达系统,DNA切除控制 | 工业生物技术 |
| 29 | 2025-10-05 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
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研究论文 | 本研究通过改变工程活材料中弹性蛋白样多肽的长度,探索其对材料微观结构和粘弹性行为的影响 | 首次系统研究弹性蛋白样多肽长度变化对工程活材料序列-结构-性能关系的影响,揭示了基因序列微调可显著改变材料流变特性的新设计原理 | 研究结果与其他生物复合材料模型缺乏可比性,序列-结构-性能关系较为复杂 | 阐明工程活材料的序列-结构-性能关系,探索基因序列调控对材料性能的影响 | 基于工程菌的厘米级工程活材料及其蛋白基质 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 材料性能数据、显微结构数据 | 三种不同ELP长度的工程活材料变体 | 合成生物学方法 | 工程菌 | 弹性蛋白样多肽(ELP)蛋白基质工程 | 材料 |
| 30 | 2025-10-05 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
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研究论文 | 本研究开发了可通过吲哚调控的T7 RNA聚合酶变体,实现精确的转录控制 | 首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过内源性代谢物吲哚的严格调控,创建了新型化学诱导'停走'平台 | NA | 开发受内源性代谢物调控的精确酶活性控制系统 | T7 RNA聚合酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 细菌 | 配体激活核酸聚合酶(LARPs),化学诱导停走平台 | 工业生物技术 |
| 31 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
|
研究论文 | 本研究在大肠杆菌中构建组合生物合成途径,成功生产含鸟氨酸的乳酸素481类似物并评估其抗菌活性 | 利用具有宽松底物特异性的SyncM修饰酶和新型肽精氨酸酶OspR,首次在乳酸素481中同时引入鸟氨酸和(甲基)羊毛硫氨酸修饰 | 特定位点的羊毛硫氨酸和甲基羊毛硫氨酸形成可能会阻碍鸟氨酸的掺入 | 开发合成生物学策略以增强抗菌肽的化学和功能多样性 | 乳酸素481及其含鸟氨酸的类似物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 组合生物合成、酶催化修饰 | NA | 生物活性数据 | 使用单指示菌株进行抗菌活性评估 | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 组合生物合成途径,包含杂交前导肽设计、酶催化修饰系统 | 医药 |
| 32 | 2025-10-05 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究利用膜结合异戊烯基转移酶在Komagataella phaffii中实现了生物活性苯丙素类化合物Artepillin C的从头合成 | 首次在Komagataella phaffii中实现Artepillin C的从头合成,通过增强异戊二烯底物途径和优化对香豆酸供应,产量达到目前报道的最高水平 | 对香豆酸供应在工程菌株中仍构成生产瓶颈 | 通过合成生物学方法实现Artepillin C的稳定供应 | Artepillin C生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、分批培养、补料分批培养 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 代谢工程 | Komagataella phaffii | Artepillin C生物合成途径,包含对香豆酸特异性双异戊烯基转移酶AcPT1、异戊烯基二磷酸异构酶和截短型HMG-CoA还原酶 | 医药 |
| 33 | 2025-10-05 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学元件库 | 首次将系统生物学与合成生物学结合,创建了从组学到元件的流程,为非常规微生物快速开发遗传工具 | 许多推定的调控型启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 差异基因表达分析, 基因本体分析, 荧光素酶检测 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 在不同波长光照和氧化应激条件下的X. dendrorhous样本 | 模块化克隆系统 | Xanthophyllomyces dendrorhous | 组成型和光调控启动子, 整合位点, 终止子, 选择标记, 报告基因 | 工业生物技术 |
| 34 | 2025-10-05 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定了集胞藻PCC 7942中响应酸性胁迫的关键基因,并通过基因工程成功提高了其耐酸性 | 首次系统鉴定集胞藻PCC 7942中参与酸性胁迫响应的六个关键基因,并通过过表达chlL和chlN基因成功增强菌株耐酸性 | NA | 探究集胞藻PCC 7942的酸性胁迫响应机制并开展耐酸工程改造 | 集胞藻Synechococcus elongatus PCC 7942 | 合成生物学 | NA | RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 表型分析, 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除, 基因过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | NA | 工业生物技术 |
| 35 | 2025-10-05 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了青霉菌中植物多糖降解酶(PPDEs)的分布、功能、生物合成调控机制及高产菌株选育研究进展 | 系统总结了青霉菌PPDE生物合成调控机制的最新研究进展,并提出了通过合成生物学和代谢工程提高PPDE产量的新策略 | 作为小型综述,未包含所有相关研究,且主要关注青霉菌属 | 提高青霉菌植物多糖降解酶(PPDEs)的产量和效率,促进其工业化应用 | 青霉菌属真菌,特别是草酸青霉菌(Penicillium oxalicum) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 青霉菌 | NA | 工业生物技术, 能源 |
| 36 | 2025-10-05 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文总结了利用合成生物学方法改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇效率的策略 | 系统综述了近年来通过基因工程技术改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的合成生物学策略 | NA | 提高从可再生资源微生物发酵生产异丁醇的效率 | 天然和非天然微生物宿主 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 微生物宿主 | 异丁醇生物合成途径 | 能源, 环境 |
| 37 | 2025-10-05 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中构建了(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 设计了包含来自不同生物界源六种酶的工程化生物合成途径,结合合成生物学、生物催化和合成化学方法 | NA | 开发复杂吲哚生物碱的高效生物合成方法 | (+)-brevianamides A和B等含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程、生物催化 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 包含环二肽合成酶(NascA)、环二肽氧化酶(DmtD2/DmtE2)、异戊二烯基转移酶(NotF)、黄素依赖单加氧酶(BvnB)和激酶(PhoN和IPK)的五步生物合成途径 | 医药 |
| 38 | 2025-10-05 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从甜槠转录组中筛选并鉴定了两个查尔酮合酶基因,通过生物信息学分析和功能验证揭示了其在查尔酮生物合成中的作用 | 首次从甜槠中鉴定出两个CHS基因,并证明其在大肠杆菌中与外来基因共表达可催化合成根皮素 | 仅验证了两个CHS基因在体外系统中的功能,未在植物体内进行功能验证 | 探究甜槠查尔酮合酶基因家族在查尔酮合成中的功能 | 甜槠(Lithocarpus litseifolius)的查尔酮合酶基因LlCHS1和LlCHS2 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、生物信息学分析、系统发育分析、异源表达 | NA | 转录组数据、蛋白质序列数据 | 两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢通路工程,将LlCHS1/LlCHS2与Aa4CL共表达构建根皮素合成途径 | 工业生物技术 |
| 39 | 2025-10-05 |
Refining minimal engineered receptors for specific activation of on-target signaling molecules
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81259-4
PMID:39738202
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研究论文 | 本研究通过优化最小工程受体(MERs)的设计,实现了对目标信号分子的特异性激活并减少STAT5的非靶向激活 | 发现了Box1突变能够最小化STAT5的非靶向激活,同时保持目标信号分子的激活能力 | 优化后的MERs对目标信号分子的激活效率略有降低 | 开发能够特异性激活目标信号分子的合成受体 | 最小工程受体(MERs)和七种酪氨酸基序 | 合成生物学 | NA | 酪氨酸-苯丙氨酸突变、丙氨酸突变 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成受体设计,包含JAK结合域和酪氨酸基序 | 医学, 合成生物学 |
| 40 | 2025-10-05 |
All-in-One CO2 Capture and Transformation: Lessons from Formylmethanofuran Dehydrogenases
2024-12-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00623
PMID:39584476
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综述 | 本文探讨了甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)在二氧化碳捕获和转化中的潜力及其对合成生物学的启示 | 揭示了FMD酶无需ATP水解即可实现CO₂固定与转化的独特机制,为生物启发式合成化学提供了新范式 | 主要基于实验室研究,实际工业应用仍需进一步验证 | 探索生物酶系统在温室气体CO₂转化和碳化学回收中的应用 | 古菌中的甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)多酶复合体 | 合成生物学 | NA | 酶催化机制分析、电还原技术 | NA | 生物化学数据、结构生物学数据 | NA | NA | 古菌 | 氧化还原活性转化与氧化还原中性转化耦合的天然酶系统 | 环境,能源,工业生物技术 |