合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-01-05	A single-plasmid-based, easily curable CRISPR/Cas9 system for rapid, iterative genome editing in Pseudomonas putida KT2440 2024-Dec-30, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02634-4 PMID:39734219	研究论文	本文开发了一种基于单质粒的CRISPR/Cas9系统，用于在Pseudomonas putida KT2440中进行快速迭代基因组编辑	开发了一种易于消除的CRISPR/Cas9系统，能够在不到1.5天内完成一次编辑，是目前最快的P. putida迭代基因组编辑系统	NA	开发一种快速、高效的基因组编辑系统，用于P. putida的基因工程	Pseudomonas putida KT2440	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	9次删除、3次替换和2次插入的实验验证
22	2025-01-05	Genetically encoded biosensors for the circular plastics bioeconomy 2024-Dec, Metabolic engineering communications IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.mec.2024.e00255 PMID:39737114	综述	本文综述了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用，包括其开发和应用	提出了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的双重作用，即促进塑料的生产和回收/升级	文章主要集中于已有生物传感器的总结，缺乏对新技术的深入探讨	探讨基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用	塑料前体/单体的生物传感器	合成生物学	NA	基因编码生物传感器	NA	NA	NA
23	2025-01-04	Next-Generation Probiotics and Chronic Diseases: A Review of Current Research and Future Directions 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c08702 PMID:39588716	review	本文综述了下一代益生菌（NGPs）在预防和治疗慢性疾病中的当前研究和未来方向	探讨了通过合成生物学和生物信息学设计的NGPs，具有增强的稳定性和生存能力，针对特定疾病状态	传统益生菌的疗效和机制仍不明确，FMT的长期效果仍在研究中	研究NGPs在预防和治疗慢性疾病中的应用	下一代益生菌（NGPs）	微生物组研究	糖尿病、肥胖、心血管疾病	高通量测序、合成生物学、生物信息学	NA	NA	NA
24	2025-01-04	Evolution of Vitamin E Production: From Chemical Synthesis and Plant Extraction to Microbial Cell Factories 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c08813 PMID:39644244	综述	本文回顾了维生素E生产的演变过程，从传统的化学合成和植物提取方法到尖端的微生物细胞工厂	本文强调了代谢工程和合成生物学在维生素E生物生产中的革命性进展，特别是通过工程微生物细胞工厂的应用	化学合成无法生产特定的立体异构体，且由于化学残留和生物活性有限，其应用仅限于动物饲料；植物提取受限于资源可用性和高种植成本	探讨维生素E生产的演变及其未来发展方向	维生素E的生产方法，包括化学合成、植物提取和微生物细胞工厂	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	NA	NA
25	2025-01-04	The Role of SF1 and SF2 Helicases in Biotechnological Applications 2024-Dec, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-024-05027-w PMID:39093351	review	本文综述了SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制，并探讨了它们在生物技术应用中的潜力	强调了SF1解旋酶中独特的1B和2B结构域及其对酶活性的影响，并讨论了UvrD解旋酶的活性形式及解旋后解离的争议	NA	总结SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制，并探讨其在生物技术中的应用	SF1和SF2解旋酶	生物技术	NA	纳米孔测序、蛋白质测序、等温扩增	NA	NA	NA
26	2025-01-01	Machine Learning-Driven Innovations in Microfluidics 2024-Dec-13, Biosensors DOI:10.3390/bios14120613 PMID:39727877	综述	本文探讨了机器学习在微流体生物传感器设计、制造和应用中的整合，强调了机器学习算法如何通过提高设计准确性、操作效率和管理复杂诊断数据集来增强性能	将机器学习与微流体技术结合，开发出能够自动化实验流程、实时数据分析和支持决策的智能系统	未具体提及研究的局限性	研究机器学习在微流体生物传感器中的应用，以提升其性能和效率	微流体生物传感器	机器学习	NA	机器学习	NA	复杂诊断数据集	NA
27	2024-12-30	Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-024-13379-w PMID:39731599	研究论文	本文通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938的组成型和光调控启动子，并创建了该生物的模块化合成生物学部件集合	结合系统生物学和合成生物学，开发了一种从组学到部件的流程，为非传统微生物提供了有用的生物学见解和遗传工具	部分假定的调控启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性，可能影响其调控效果	研究红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938的光生物学和代谢途径调控，并开发其遗传工具	红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938	合成生物学	NA	转录组学	NA	基因表达数据	不同波长光（红、绿、蓝、紫外）和氧化应激条件下的Xanthophyllomyces dendrorhous样本
28	2024-12-29	Advanced metabolic Engineering strategies for the sustainable production of free fatty acids and their derivatives using yeast 2024-Dec-27, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00473-w PMID:39731138	综述	本文综述了利用酵母进行代谢工程策略以可持续生产游离脂肪酸及其衍生物的研究进展	探讨了酵母利用替代碳源（如CO、甲醇和乙酸）的工程策略，超越了传统的糖类	未提及具体实验数据或案例研究	推动可持续工业脂质生产技术的发展	酵母	代谢工程	NA	合成生物学和代谢工程工具	NA	NA	NA
29	2024-12-29	Enhanced Eicosapentaenoic Acid Production via Synthetic Biological Strategy in Nannochloropsis oceanica 2024-Dec-19, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md22120570 PMID:39728144	研究论文	本研究通过合成生物学策略提高海洋微藻Nannochloropsis oceanica中EPA的产量	首次在Nannochloropsis oceanica中应用合成生物学策略，通过基因过表达和敲除技术显著提高EPA产量	研究仅限于实验室环境，未进行大规模生产验证	提高Nannochloropsis oceanica中EPA的产量	海洋微藻Nannochloropsis oceanica	合成生物学	NA	基因过表达、基因敲除、转录组分析	NA	基因表达数据	NA
30	2024-12-28	Construction and Optimization of Engineered Saccharomyces cerevisiae for De Novo Synthesis of Phloretin and Its Derivatives 2024-Dec-26, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c09893 PMID:39723863	研究论文	本研究通过合理设计和合成生物学方法，构建并优化了用于从头合成根皮素及其衍生物的工程化酿酒酵母	首次在同一宿主中系统比较了三种根皮素生物合成途径，并通过优化酶筛选、菌株工程和协调异源途径与内源代谢，实现了根皮素及其衍生物的最高产量	NA	解决对二氢查耳酮日益增长的需求，并为更复杂衍生物的生物合成奠定基础	根皮素及其衍生物	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
31	2024-12-26	Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking 2024-Dec-25, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264 PMID:39658019	综述	本文综述了细菌金属稳态的机制，包括金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输	提供了金属调节蛋白和金属感应核糖开关的多样性视角，并讨论了其在合成生物学和生物技术中的应用	文章指出在金属稳态理解方面仍存在一些空白，需要进一步研究	探讨细菌如何通过金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输来维持金属稳态	细菌	生物学	NA	NA	NA	NA	NA
32	2024-12-26	Intron RPS25Ai, a Novel DNA Element, Has Global Effects on Synthetic Pathway Engineering by Empowering Protein Synthesis 2024-Dec-25, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c11278 PMID:39660479	研究论文	本研究探讨了内含子作为多功能新型生物DNA元件在合成生物学中的潜力，展示了其在转录和翻译层面的时空调控模式，并应用于工程酵母中的异源代谢途径，显著提高了β-胡萝卜素的产量	首次将内含子RPS25Ai作为多级调控遗传元件应用于合成生物学，展示了其在转录前和成熟RNA水平的表达增强效果，并实现了基因组规模的调控	研究主要局限于酵母细胞，未在其他生物系统中验证其广泛适用性	探索内含子作为新型生物DNA元件在合成生物学中的应用潜力	内含子RPS25Ai及其在工程酵母中的应用	合成生物学	NA	基因工程、代谢途径工程	NA	基因表达数据	工程酵母细胞
33	2024-12-25	Designed to breathe: synthetic biology applications in plant hypoxia 2024-Dec-23, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiae623 PMID:39673416	综述	本文综述了近年来在植物低氧响应监测工具方面的进展，特别是通过合成生物学方法设计的新型遗传电路	本文介绍了从细菌和动物研究中改编或专为植物设计的氧气响应报告器、染料和纳米探针，并强调了合成生物学视角在设计植物氧气依赖响应遗传电路中的应用	本文讨论了在植物低氧生物学领域实施合成生物学解决方案的当前限制和挑战	总结植物低氧响应监测工具的最新进展，并探讨合成生物学在植物低氧生物学中的应用	植物低氧响应监测工具和合成生物学方法	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
34	2024-12-25	Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering 2024-Dec-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00574 PMID:39509282	综述	本文综述了细菌无细胞系统中天然和工程化调控组件及其应用	本文系统性地总结了在无细胞系统中实现复杂调控网络的进展，并探讨了其在合成生物学中的应用	NA	探讨无细胞系统中调控组件的发展及其在合成生物学中的应用	细菌无细胞系统中的调控组件	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
35	2024-12-25	Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology 2024-Dec-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00615 PMID:39509658	研究论文	本文探讨了合成生物学如何推动细菌纤维素（BC）基生物材料的发展，并强调了其在工程化活性材料（ELMs）中的潜力	本文创新性地将合成生物学与材料科学结合，探索了细菌纤维素在工程化活性材料中的应用，并讨论了3D生物打印在这一领域的潜力	本文主要讨论了合成生物学在细菌纤维素中的应用前景，但未详细探讨具体的技术挑战和实施细节	研究合成生物学如何推动细菌纤维素基材料的发展，并探索其在工程化活性材料中的应用	细菌纤维素基生物材料及其在工程化活性材料中的应用	材料科学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
36	2024-12-25	Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli 2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.10.627567 PMID:39713314	研究论文	本文设计并实现了一种在Escherichia coli中合成(+)-Brevianamides A和B的生物合成途径	通过结合合成生物学、生物催化与合成化学方法，设计了一条五步的生物合成途径，简化了复杂吲哚生物碱的合成	NA	开发一种高效合成(+)-Brevianamides A和B的生物合成途径	(+)-Brevianamides A和B的生物合成	NA	NA	生物合成	NA	NA	NA
37	2024-12-21	Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors 2024-Dec-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00149 PMID:39555579	研究论文	本文开发了一种新型αCD206-synNotch受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞之间的相互作用	本文首次开发了针对CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch受体，为研究癌细胞与巨噬细胞的相互作用提供了新的工具	本文讨论了该受体在应用中的一些意外问题，表明其在实际应用中可能存在局限性	开发一种新型合成受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用	CD206巨噬细胞和癌细胞	NA	NA	合成生物学	synNotch受体	NA	小鼠转移模型
38	2024-12-21	Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics 2024-Dec-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00388 PMID:39558834	研究论文	本文介绍了一种红光响应的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP，用于细菌的光遗传学研究	该系统利用植物光受体PhyA和FHY1以及Cre重组酶的分裂版本，实现了对基因表达和DNA切除的精确控制，并展示了红光在多色控制和穿透性方面的优势	NA	开发一种红光响应的Cre重组酶系统，以实现细菌中基因表达和DNA切除的精确控制	红光响应的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP及其在细菌中的应用	合成生物学	NA	光遗传学	NA	NA	NA
39	2024-12-21	Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline 2024-Dec-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00221 PMID:39573840	研究论文	本文研究了SKIK肽标签对含有连续脯氨酸的终止肽的翻译抑制效应的缓解作用	首次展示了SKIK肽标签能够有效缓解WPPP引起的翻译停滞，并揭示了SKIK肽标签与翻译延伸因子P（EF-P）协同促进富含连续脯氨酸蛋白的翻译	NA	研究SKIK肽标签对终止肽翻译抑制效应的缓解作用及其机制	含有连续脯氨酸的终止肽（如SecM AP和WPPP）	NA	NA	体外翻译反应	NA	蛋白质	NA
40	2024-12-21	Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties 2024-Dec-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00336 PMID:39601053	研究论文	研究通过改变弹性蛋白样多肽（ELP）长度来调控宏观活体材料的蛋白质基质结构和流变学特性	揭示了序列-结构-性质关系，并展示了通过微调基因序列显著改变流变学特性的新设计原则	尚未完全阐明序列、结构和流变学特性之间的复杂关系	探索如何通过改变弹性蛋白样多肽（ELP）长度来影响活体材料的微结构和粘弹性行为	宏观活体材料及其蛋白质基质中的弹性蛋白样多肽（ELP）	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA