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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过转录组分析鉴定了集胞藻PCC 7942中响应酸性胁迫的关键基因,并通过基因工程成功提高了其耐酸性 | 首次系统鉴定集胞藻PCC 7942中参与酸性胁迫响应的六个关键基因,并通过过表达chlL和chlN基因成功增强菌株耐酸性 | NA | 探究集胞藻PCC 7942的酸性胁迫响应机制并开展耐酸工程改造 | 集胞藻Synechococcus elongatus PCC 7942 | 合成生物学 | NA | RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 表型分析, 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除, 基因过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | NA | 工业生物技术 |
| 22 | 2025-10-05 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了青霉菌中植物多糖降解酶(PPDEs)的分布、功能、生物合成调控机制及高产菌株选育研究进展 | 系统总结了青霉菌PPDE生物合成调控机制的最新研究进展,并提出了通过合成生物学和代谢工程提高PPDE产量的新策略 | 作为小型综述,未包含所有相关研究,且主要关注青霉菌属 | 提高青霉菌植物多糖降解酶(PPDEs)的产量和效率,促进其工业化应用 | 青霉菌属真菌,特别是草酸青霉菌(Penicillium oxalicum) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 青霉菌 | NA | 工业生物技术, 能源 |
| 23 | 2025-10-05 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文总结了利用合成生物学方法改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇效率的策略 | 系统综述了近年来通过基因工程技术改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的合成生物学策略 | NA | 提高从可再生资源微生物发酵生产异丁醇的效率 | 天然和非天然微生物宿主 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 微生物宿主 | 异丁醇生物合成途径 | 能源, 环境 |
| 24 | 2025-10-05 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中构建了(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 设计了包含来自不同生物界源六种酶的工程化生物合成途径,结合合成生物学、生物催化和合成化学方法 | NA | 开发复杂吲哚生物碱的高效生物合成方法 | (+)-brevianamides A和B等含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程、生物催化 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 包含环二肽合成酶(NascA)、环二肽氧化酶(DmtD2/DmtE2)、异戊二烯基转移酶(NotF)、黄素依赖单加氧酶(BvnB)和激酶(PhoN和IPK)的五步生物合成途径 | 医药 |
| 25 | 2025-10-05 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择压力下的稳定性 | 采用开源硬件微流控技术,通过凝胶微滴培养单细胞并利用荧光显微镜定量分析微菌落,实现了对质粒稳定性的高通量并行分析 | 目前研究主要使用大肠杆菌作为实验模型,在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发一种无需抗生素选择即可分析质粒稳定性的高通量方法 | 质粒在大肠杆菌中的稳定性 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、荧光蛋白表达 | NA | 荧光图像数据 | 大量微滴和微菌落的并行分析 | NA | 大肠杆菌 | 质粒表达的荧光蛋白生物传感器 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-05 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究从甜槠转录组中筛选并鉴定了两个查尔酮合酶基因,通过生物信息学分析和功能验证揭示了其在查尔酮生物合成中的作用 | 首次从甜槠中鉴定出两个CHS基因,并证明其在大肠杆菌中与外来基因共表达可催化合成根皮素 | 仅验证了两个CHS基因在体外系统中的功能,未在植物体内进行功能验证 | 探究甜槠查尔酮合酶基因家族在查尔酮合成中的功能 | 甜槠(Lithocarpus litseifolius)的查尔酮合酶基因LlCHS1和LlCHS2 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、生物信息学分析、系统发育分析、异源表达 | NA | 转录组数据、蛋白质序列数据 | 两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢通路工程,将LlCHS1/LlCHS2与Aa4CL共表达构建根皮素合成途径 | 工业生物技术 |
| 27 | 2025-10-05 |
Refining minimal engineered receptors for specific activation of on-target signaling molecules
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81259-4
PMID:39738202
|
研究论文 | 本研究通过优化最小工程受体(MERs)的设计,实现了对目标信号分子的特异性激活并减少STAT5的非靶向激活 | 发现了Box1突变能够最小化STAT5的非靶向激活,同时保持目标信号分子的激活能力 | 优化后的MERs对目标信号分子的激活效率略有降低 | 开发能够特异性激活目标信号分子的合成受体 | 最小工程受体(MERs)和七种酪氨酸基序 | 合成生物学 | NA | 酪氨酸-苯丙氨酸突变、丙氨酸突变 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成受体设计,包含JAK结合域和酪氨酸基序 | 医学, 合成生物学 |
| 28 | 2025-10-05 |
All-in-One CO2 Capture and Transformation: Lessons from Formylmethanofuran Dehydrogenases
2024-12-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00623
PMID:39584476
|
综述 | 本文探讨了甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)在二氧化碳捕获和转化中的潜力及其对合成生物学的启示 | 揭示了FMD酶无需ATP水解即可实现CO₂固定与转化的独特机制,为生物启发式合成化学提供了新范式 | 主要基于实验室研究,实际工业应用仍需进一步验证 | 探索生物酶系统在温室气体CO₂转化和碳化学回收中的应用 | 古菌中的甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)多酶复合体 | 合成生物学 | NA | 酶催化机制分析、电还原技术 | NA | 生物化学数据、结构生物学数据 | NA | NA | 古菌 | 氧化还原活性转化与氧化还原中性转化耦合的天然酶系统 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 29 | 2025-10-05 |
Towards the first synthetic eukaryotic cell
2024-Dec, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.11.001
PMID:40078978
|
综述 | 本文全面探讨了合成真核细胞的设计原理、构建策略及技术突破,重点关注首个合成真核细胞的实现路径 | 系统整合多个人工设计合成的真核生物染色体,推动首个合成真核细胞的实现 | NA | 实现首个重新设计的合成真核细胞 | 真核生物染色体与合成细胞 | 合成生物学 | NA | DNA合成技术 | NA | NA | NA | Sc2.0项目提供的工程化细胞平台 | 酵母 | 真核染色体重新设计 | 医学,工业,农业,科研 |
| 30 | 2025-10-05 |
CRISPR-Mediated rDNA Integration and Fluorescence Screening for Pathway Optimization in Pichia pastoris
2024-Dec-26, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00104
PMID:39975573
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR的rDNA整合和荧光筛选方法(CRISPO),用于在毕赤酵母中进行多拷贝途径优化 | 建立了单步、无抗生素的多拷贝途径整合方法,利用荧光蛋白作为筛选标记可视化限速步骤 | NA | 优化异源基因和途径在毕赤酵母中的表达性能 | 香叶醇生物合成途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 荧光信号,代谢产物浓度 | NA | CRISPR-Cas9 | 毕赤酵母 | 甘油诱导/葡萄糖抑制启动子(CRISPOi)和强组成型启动子(CRISPOc)驱动的荧光报告系统,甲羟戊酸途径优化 | 工业生物技术 |
| 31 | 2024-12-17 |
Hypoxia as challenge and opportunity: From cells to crops, to synthetic biology
2024-Dec-24, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae640
PMID:39657271
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy
2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02578-0
PMID:39666238
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综述 | 本文系统阐述了沙门氏菌通过调控肿瘤微环境增强癌症免疫治疗效果的最新策略与进展 | 聚焦沙门氏菌重塑免疫抑制性肿瘤微环境的多重机制及其合成生物学改造策略 | NA | 探讨基于沙门氏菌的癌症免疫治疗新策略 | 沙门氏菌及其工程化改造株 | 合成生物学与免疫治疗 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 遗传编程 | 沙门氏菌 | 肿瘤靶向系统、免疫调节回路 | 医药 |
| 33 | 2025-10-06 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-Dec-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
|
综述 | 概述中国在21世纪针对植物病毒的抗病毒剂研究进展,包括作用靶点生物学特性、药物与靶点互作模式及未来研发方向 | 系统整合化学生物学、化学信息学与合成生物学等多学科方法,提出植物病毒药物研发与人类病毒药物开发的交叉借鉴视角 | NA | 促进作物抗病毒剂的深度研发,并为人类及兽用抗病毒药物开发提供参考 | 植物病毒及其抗病毒剂 | NA | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 医药 |
| 34 | 2025-10-06 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
|
综述 | 系统总结用于生物膜研究的实验室模型设计及其优缺点 | 整合传统与现代生物膜模型,并提出通过增材制造、合成生物学和生物工程技术改进模型的新思路 | 现有实验室模型存在多种局限性,无法完全模拟真实场景 | 开发更适合研究生物膜特性和耐药机制的实验室模型 | 生物膜微生物群落 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 35 | 2025-10-06 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
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综述 | 本文综述了基于仿生材料构建人工细胞的研究进展,重点关注自下而上的构建策略 | 系统探讨了从简单细胞支架到多室系统、从功能模块构建到关键代谢行为模拟的人工细胞仿生策略 | 对该领域的瓶颈进行了初步分析 | 开发人工细胞构建技术并弥合材料工程与生命科学之间的鸿沟 | 人工细胞及其构建材料 | 合成生物学 | NA | 仿生技术、自下而上构建策略 | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞支架、多室系统、功能模块、代谢行为模拟、通信网络仿生 | 医学, 工业生物技术 |
| 36 | 2025-10-06 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
|
研究论文 | 提出使用线性混合效应模型来分析和量化合成基因布尔逻辑门性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路分析,提出固定效应β作为布尔逻辑门性能的统一描述符 | NA | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法 | 合成基因布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, k-means聚类, 蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因电路性能数据 | 144个已发表的布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等), 嵌套阻遏蛋白OR门 | 计算, 生物传感, 人类健康 |
| 37 | 2025-01-05 |
A single-plasmid-based, easily curable CRISPR/Cas9 system for rapid, iterative genome editing in Pseudomonas putida KT2440
2024-Dec-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02634-4
PMID:39734219
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研究论文 | 本文开发了一种基于单质粒的CRISPR/Cas9系统,用于在Pseudomonas putida KT2440中进行快速迭代基因组编辑 | 开发了一种易于消除的CRISPR/Cas9系统,能够在不到1.5天内完成一次编辑,是目前最快的P. putida迭代基因组编辑系统 | NA | 开发一种快速、高效的基因组编辑系统,用于P. putida的基因工程 | Pseudomonas putida KT2440 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 9次删除、3次替换和2次插入的实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2025-01-05 |
Genetically encoded biosensors for the circular plastics bioeconomy
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00255
PMID:39737114
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综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用,包括其开发和应用 | 提出了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的双重作用,即促进塑料的生产和回收/升级 | 文章主要集中于已有生物传感器的总结,缺乏对新技术的深入探讨 | 探讨基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用 | 塑料前体/单体的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因编码生物传感器 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-01-04 |
Next-Generation Probiotics and Chronic Diseases: A Review of Current Research and Future Directions
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08702
PMID:39588716
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review | 本文综述了下一代益生菌(NGPs)在预防和治疗慢性疾病中的当前研究和未来方向 | 探讨了通过合成生物学和生物信息学设计的NGPs,具有增强的稳定性和生存能力,针对特定疾病状态 | 传统益生菌的疗效和机制仍不明确,FMT的长期效果仍在研究中 | 研究NGPs在预防和治疗慢性疾病中的应用 | 下一代益生菌(NGPs) | 微生物组研究 | 糖尿病、肥胖、心血管疾病 | 高通量测序、合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-01-04 |
Evolution of Vitamin E Production: From Chemical Synthesis and Plant Extraction to Microbial Cell Factories
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08813
PMID:39644244
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综述 | 本文回顾了维生素E生产的演变过程,从传统的化学合成和植物提取方法到尖端的微生物细胞工厂 | 本文强调了代谢工程和合成生物学在维生素E生物生产中的革命性进展,特别是通过工程微生物细胞工厂的应用 | 化学合成无法生产特定的立体异构体,且由于化学残留和生物活性有限,其应用仅限于动物饲料;植物提取受限于资源可用性和高种植成本 | 探讨维生素E生产的演变及其未来发展方向 | 维生素E的生产方法,包括化学合成、植物提取和微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |