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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-02 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从石栎属植物中克隆了查尔酮合成酶基因,并进行了生物信息学分析和功能表征 | 首次从石栎属植物中鉴定出两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2),并验证了其催化合成根皮素的功能 | 仅在大肠杆菌中验证了基因功能,未在植物体内进行验证 | 探索石栎属植物中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能 | 石栎属植物的CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析、生物信息学分析、大肠杆菌异源表达 | NA | 基因序列数据 | 2个CHS基因 |
22 | 2025-04-25 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
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研究论文 | 通过启动子捕获方法在Pseudomonadota多样菌种中鉴定新型广宿主范围启动子序列 | 利用南极微生物群落发现新型广宿主范围启动子序列,扩展了合成生物学的遗传工具包 | 研究中仅使用了约2000个克隆,可能未覆盖所有潜在的启动子序列 | 扩展合成生物学中可用的生物部件目录,特别是广宿主范围启动子序列 | 南极微生物群落中的Pseudomonadota多样菌种 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆,鉴定出13个功能性启动子序列 |
23 | 2025-03-26 |
Refining minimal engineered receptors for specific activation of on-target signaling molecules
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81259-4
PMID:39738202
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研究论文 | 本研究改进了最小工程受体(MERs)的设计,以减少STAT5的非靶向激活,同时保持对特定信号分子的靶向激活 | 通过酪氨酸突变和Box1区域的丙氨酸突变,发现了一种能最小化STAT5非靶向激活的MERs变体 | 虽然减少了STAT5的非靶向激活,但略微降低了靶向信号分子的激活效率 | 开发能够精确激活特定信号分子的合成受体,用于基因和细胞治疗 | 最小工程受体(MERs)及其对信号分子的激活特性 | 合成生物学 | NA | 酪氨酸突变、丙氨酸突变 | NA | NA | NA |
24 | 2025-03-26 |
All-in-One CO2 Capture and Transformation: Lessons from Formylmethanofuran Dehydrogenases
2024-12-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00623
PMID:39584476
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研究论文 | 本文探讨了甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)在CO2捕获和转化中的潜力及其在可持续化学合成中的应用 | 揭示了FMD作为一种高效的生物CO转化系统,其独特的反应机制和能量节约模式为CO2的化学回收提供了新思路 | NA | 探索生物CO激活系统在可持续化学合成中的应用,特别是FMD在CO2捕获和转化中的潜力 | 甲酰甲烷呋喃脱氢酶(FMD)及其在CO2捕获和转化中的作用 | 合成生物学 | NA | 电还原CO | NA | NA | NA |
25 | 2025-03-15 |
Towards the first synthetic eukaryotic cell
2024-Dec, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.11.001
PMID:40078978
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综述 | 本文全面回顾了合成生物学和合成基因组学领域在实现首个合成真核细胞方面的进展 | 强调了Sc2.0项目在提供关键工具和工程细胞平台方面的贡献,这些工具和平台显著加速了研究和工业进展 | 讨论了合成真核生命带来的伦理和法律问题,但未提出具体解决方案 | 探讨合成真核细胞的设计原则和构建策略,以及其在医学、工业、农业和研究中的潜在应用 | 真核细胞 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
26 | 2025-03-10 |
Prospects for synthetic biology in 21st Century agriculture
2024-Dec-30, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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研究论文 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景,强调了其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 通过整合先进的遗传工具、计算建模和系统生物学,研究人员能够精确修改植物基因组,以增强产量、抗逆性和养分利用效率等特性 | 尽管植物合成生物学在农业中具有巨大潜力,但仍面临监管批准和公众接受度方面的挑战 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用,以应对全球粮食安全挑战并实现环境可持续性 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA |
27 | 2025-02-23 |
CRISPR-Mediated rDNA Integration and Fluorescence Screening for Pathway Optimization in Pichia pastoris
2024-Dec-26, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00104
PMID:39975573
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CRISPO的CRISPR介导的rDNA整合和荧光筛选技术,用于在毕赤酵母中进行多拷贝途径优化 | CRISPO技术实现了单步、无抗生素的多拷贝途径整合,显著提高了香叶醇的产量,并确定了甲羟戊酸途径的限速步骤 | NA | 优化毕赤酵母中的异源基因和途径表达,提高香叶醇的产量 | 毕赤酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 荧光筛选 | NA | NA | NA |
28 | 2024-12-17 |
Hypoxia as challenge and opportunity: From cells to crops, to synthetic biology
2024-Dec-24, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae640
PMID:39657271
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
29 | 2025-01-23 |
Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy
2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02578-0
PMID:39666238
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综述 | 本文综述了沙门氏菌在癌症免疫治疗中的应用,特别是其在改善肿瘤微环境(TME)方面的潜力 | 沙门氏菌因其广谱抗肿瘤活性、肿瘤靶向能力、免疫调节作用、溶瘤特性、遗传可编程性和工程灵活性,成为癌症免疫治疗中的领先候选者 | 开发更安全、更有效的基于沙门氏菌的癌症免疫疗法仍面临挑战 | 探讨沙门氏菌在调节肿瘤微环境(TME)中的应用,以增强癌症免疫治疗的疗效 | 沙门氏菌及其在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA |
30 | 2025-01-16 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-Dec-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
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综述 | 本文详细综述了21世纪中国在植物病毒抗病毒剂的研究进展,包括抗病毒剂的生物特性、作用模式及未来药物开发的见解 | 本文综合了化学生物学、化学信息学、生物信息学和合成生物学的最新进展,为抗病毒药物的设计、合成、活性评估及作用机制研究提供了新的方法和工具 | 本文主要关注植物病毒抗病毒剂的研究,未涉及人类或动物病毒疾病的抗病毒剂开发 | 深入研究植物病毒抗病毒剂的研发,以应对复杂爆发的植物病毒疾病 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 生物信息学 | 植物病毒疾病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA |
31 | 2025-01-16 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
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综述 | 本文全面回顾了用于生物膜研究的经典和现代模型,总结了实验室生物膜模型的各种设计及其优缺点 | 提供了改进生物膜模型的见解,以更接近真实场景,利用增材制造、合成生物学和生物工程中的新技术 | 当前实验室模型存在各种局限性 | 研究生物膜的物理特性、抗微生物剂的抗性机制及其基因和蛋白质表达谱 | 生物膜 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA |
32 | 2025-01-15 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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评论 | 本文回顾了诺华公司在天然产物药物发现方面的历史,并介绍了从早期研究到开发及以后的过程中所使用的工具和面临的挑战 | 利用90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物,结合微生物学、计算生物学、合成生物学、化学和工艺开发等多学科方法,寻找新药物 | 未明确提及具体的研究局限性 | 通过天然产物发现新药物,并利用新技术加速药物发现和可持续化合物供应 | 天然产物及其衍生的药物 | 药物发现 | NA | 基因组工程、数据科学、抗体药物偶联物、放射性配体疗法、xRNA药物 | NA | NA | 90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物 |
33 | 2025-01-15 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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研究论文 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法,探讨了达托霉素在Streptomyces roseosporus中的生物合成调控,旨在加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 通过比较野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株的基因组序列,发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域有两个突变,这些突变影响了多顺反子mRNA的转录 | 研究主要基于两种菌株的基因组分析,可能无法全面反映所有可能的调控机制 | 提高达托霉素的发酵产量,并促进新型脂肽类抗生素的发现和商业化 | Streptomyces roseosporus菌株及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因组分析、代谢工程、合成生物学、诱变 | NA | 基因组序列 | 两种Streptomyces roseosporus菌株(野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株) |
34 | 2025-01-15 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
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综述 | 本文综述了人工细胞的发展及仿生策略,重点讨论了基于仿生材料的人工细胞构建的底层策略 | 从仿生材料出发构建人工细胞,从简单的细胞支架到多室系统,从功能模块的构建到关键代谢行为的模拟,甚至到通信网络的仿生 | 对该领域的瓶颈进行了粗略分析 | 探讨人工细胞的构建及其在材料工程与生命科学之间的桥梁作用 | 人工细胞 | 合成生物学 | NA | 仿生技术 | NA | NA | NA |
35 | 2025-01-14 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 本文提出了一种线性混合效应模型,用于评估合成基因电路的性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路的统计分析,提出固定效应β作为电路性能的描述符 | 未提及具体局限性 | 标准化用于评估合成基因电路性能的统计方法 | 合成基因电路的布尔逻辑门性能 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型、k-means聚类、蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 实验数据 | 144个已发布的布尔逻辑门 |
36 | 2025-01-05 |
A single-plasmid-based, easily curable CRISPR/Cas9 system for rapid, iterative genome editing in Pseudomonas putida KT2440
2024-Dec-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02634-4
PMID:39734219
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研究论文 | 本文开发了一种基于单质粒的CRISPR/Cas9系统,用于在Pseudomonas putida KT2440中进行快速迭代基因组编辑 | 开发了一种易于消除的CRISPR/Cas9系统,能够在不到1.5天内完成一次编辑,是目前最快的P. putida迭代基因组编辑系统 | NA | 开发一种快速、高效的基因组编辑系统,用于P. putida的基因工程 | Pseudomonas putida KT2440 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 9次删除、3次替换和2次插入的实验验证 |
37 | 2025-01-05 |
Genetically encoded biosensors for the circular plastics bioeconomy
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00255
PMID:39737114
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综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用,包括其开发和应用 | 提出了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的双重作用,即促进塑料的生产和回收/升级 | 文章主要集中于已有生物传感器的总结,缺乏对新技术的深入探讨 | 探讨基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用 | 塑料前体/单体的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因编码生物传感器 | NA | NA | NA |
38 | 2025-01-04 |
Next-Generation Probiotics and Chronic Diseases: A Review of Current Research and Future Directions
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08702
PMID:39588716
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review | 本文综述了下一代益生菌(NGPs)在预防和治疗慢性疾病中的当前研究和未来方向 | 探讨了通过合成生物学和生物信息学设计的NGPs,具有增强的稳定性和生存能力,针对特定疾病状态 | 传统益生菌的疗效和机制仍不明确,FMT的长期效果仍在研究中 | 研究NGPs在预防和治疗慢性疾病中的应用 | 下一代益生菌(NGPs) | 微生物组研究 | 糖尿病、肥胖、心血管疾病 | 高通量测序、合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA |
39 | 2025-01-04 |
Evolution of Vitamin E Production: From Chemical Synthesis and Plant Extraction to Microbial Cell Factories
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08813
PMID:39644244
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综述 | 本文回顾了维生素E生产的演变过程,从传统的化学合成和植物提取方法到尖端的微生物细胞工厂 | 本文强调了代谢工程和合成生物学在维生素E生物生产中的革命性进展,特别是通过工程微生物细胞工厂的应用 | 化学合成无法生产特定的立体异构体,且由于化学残留和生物活性有限,其应用仅限于动物饲料;植物提取受限于资源可用性和高种植成本 | 探讨维生素E生产的演变及其未来发展方向 | 维生素E的生产方法,包括化学合成、植物提取和微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
40 | 2025-01-04 |
The Role of SF1 and SF2 Helicases in Biotechnological Applications
2024-Dec, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05027-w
PMID:39093351
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review | 本文综述了SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制,并探讨了它们在生物技术应用中的潜力 | 强调了SF1解旋酶中独特的1B和2B结构域及其对酶活性的影响,并讨论了UvrD解旋酶的活性形式及解旋后解离的争议 | NA | 总结SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制,并探讨其在生物技术中的应用 | SF1和SF2解旋酶 | 生物技术 | NA | 纳米孔测序、蛋白质测序、等温扩增 | NA | NA | NA |