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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-12-20 |
Post-genomic illumination of paclitaxel biosynthesis
2024-12, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01869-8
PMID:39604636
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综述 | 本文总结了紫杉醇生物合成研究的关键里程碑,并强调了通过基因组水平分析潜在关键基因所取得的最新进展 | 通过基因组测序和组装揭示了紫杉醇生物合成所需的最小基因集,为合成生物学方法促进紫杉醇的工业化生产铺平了道路 | 紫杉醇生物合成途径的完整阐明仍面临重大挑战,许多中间产物尚未通过实验确定 | 总结紫杉醇生物合成研究进展,探讨通过合成生物学方法实现紫杉醇工业化生产的可能性 | 紫杉醇的生物合成途径及其关键基因 | NA | NA | 基因组测序和组装 | NA | 基因组数据 | 三种红豆杉(Taxus)基因组 |
22 | 2024-12-19 |
Next-Generation Probiotics and Chronic Diseases: A Review of Current Research and Future Directions
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08702
PMID:39588716
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综述 | 本文综述了下一代益生菌(NGPs)在慢性疾病中的应用现状及未来发展方向 | 本文介绍了通过合成生物学和生物信息学工程化的下一代益生菌,旨在针对特定疾病状态,具有增强的稳定性和生存能力 | 本文讨论了NGPs在稳定性和递送方面的挑战,并强调了进一步研究以优化其疗效和确保安全性的必要性 | 探讨下一代益生菌在预防和治疗慢性疾病中的应用及其未来发展方向 | 下一代益生菌的稳定性、递送挑战及其在糖尿病、肥胖和心血管疾病等慢性疾病中的应用 | NA | 慢性疾病 | 高通量测序 | NA | NA | NA |
23 | 2024-12-19 |
Evolution of Vitamin E Production: From Chemical Synthesis and Plant Extraction to Microbial Cell Factories
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08813
PMID:39644244
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综述 | 本文回顾了维生素E生产从传统的化学合成和植物提取到前沿的微生物细胞工厂的演变过程 | 本文介绍了通过代谢工程和合成生物学在微生物细胞工厂中生产维生素E的最新进展 | 本文讨论了当前面临的挑战,包括技术难题和未来发展方向 | 探讨维生素E生产技术的演变及其未来发展 | 维生素E的生产方法及其在植物和微生物中的生物合成 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
24 | 2024-12-19 |
Discovery and Functional Identification of 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Cytochrome P450s in Triterpenoid Metabolic Pathways of Actinidia eriantha
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06937
PMID:39648448
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研究论文 | 本研究通过转录组测序分析结合合成生物学方法,在酵母中异源表达,鉴定了参与猕猴桃三萜代谢途径的关键酶基因 | 首次鉴定了两个2,3-氧化角鲨烯环化酶(AeOSC2和AeOSC3)和两个细胞色素P450(AeCYP716A8和AeCYP716A9),并成功重建了猕猴桃中乌索烷型和齐墩果烷型三萜的生物合成途径 | NA | 探索猕猴桃中三萜代谢途径的关键酶基因及其功能 | 猕猴桃中的三萜化合物及其生物合成途径 | 代谢组学 | NA | 转录组测序分析,合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
25 | 2024-12-19 |
All Roads Lead to Rome: Pathways to Engineering Disease Resistance in Plants
2024-Dec-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412223
PMID:39691979
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综述 | 本文综述了植物病害抗性的基本机制和不同策略,并探讨了未来培育持久和广谱抗病植物的前景 | 本文结合了基因工程、基因编辑和合成生物学等最新进展,提供了开发植物病害抗性的全面策略 | 本文讨论了现有策略的局限性及其可能的解决方案 | 探讨开发植物病害抗性的新策略,以减少全球作物因病害而损失的风险 | 植物病害抗性的机制和策略,以及用于抗病育种的关键基因 | NA | NA | 基因工程、基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA |
26 | 2024-12-19 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2024-Dec-18, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
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研究论文 | 本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)生成的人工细胞囊泡的形成和特性,包括尺寸分布和后组装加载 | 首次展示了通过bioPISA方法生成具有均匀尺寸和可控内部结构的囊泡,并成功演示了将大分子加载到预形成的囊泡中的可行性 | 研究主要集中在实验室规模,尚未在大规模应用中验证 | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡,用于合成生物学等应用 | 通过bioPISA生成的囊泡的尺寸分布、形态和内部结构,以及后组装加载大分子的可行性 | 合成生物学 | NA | 生物催化聚合诱导自组装(bioPISA),荧光相关光谱(FCS),电穿孔 | NA | 囊泡 | 未明确提及具体样本数量 |
27 | 2024-12-19 |
Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders
2024-Dec-17, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2024.2444364
PMID:39688950
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综述 | 本文综述了基于细菌及其衍生物的药物递送系统在治疗中枢神经系统疾病中的最新研究进展 | 提出了利用细菌及其衍生物作为药物递送系统的创新方法,能够跨越血脑屏障,实现精确药物递送 | 需要解决生物安全性、免疫排斥和规模化生产等挑战 | 探讨细菌载体在治疗中枢神经系统疾病中的应用潜力 | 细菌载体在治疗缺血性脑损伤、神经退行性疾病和胶质瘤中的应用 | NA | 神经退行性疾病 | 基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA |
28 | 2024-12-19 |
Multi-enzyme assemblies both in the cell membrane and cytoplasm boost intracellular lycopene production
2024-Dec-15, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138654
PMID:39689805
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研究论文 | 本研究利用新型二十面体蛋白笼Mi3作为蛋白质支架,结合基于酯键的肽标签系统ReverseTag/ReverseCatcher,在体外和体内提高酶催化效率,特别是在番茄红素生物合成中的应用 | 首次将ReverseTag/ReverseCatcher/Mi3系统应用于细胞膜和细胞质中的多酶组装,显著提高了番茄红素的产量 | NA | 提高酶催化效率,特别是在番茄红素生物合成中的应用 | 多酶组装系统在细胞膜和细胞质中的应用 | 合成生物学 | NA | 多酶组装系统 | NA | 蛋白质 | NA |
29 | 2024-12-19 |
Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy
2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02578-0
PMID:39666238
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综述 | 本文综述了基于沙门氏菌的癌症免疫治疗策略,重点探讨了其对肿瘤微环境的调控作用及优化工程策略 | 本文介绍了沙门氏菌在癌症免疫治疗中的多重优势,包括广谱抗肿瘤活性、肿瘤靶向能力、免疫调节作用、溶瘤特性、遗传可编程性和工程灵活性 | 本文讨论了开发更安全有效的基于沙门氏菌的癌症免疫治疗所面临的挑战 | 探讨如何通过沙门氏菌调控肿瘤微环境,提升癌症免疫治疗效果 | 沙门氏菌在癌症免疫治疗中的应用及其对肿瘤微环境的调控作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
30 | 2024-12-19 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本文利用微流控平台结合数学模型,在单细胞水平上精确表征了与真菌次级代谢相关的基因调控回路 | 首次将微流控平台与数学模型结合,用于单细胞水平上精确表征真菌基因调控回路,并成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 研究仅限于两种代表性真菌基因调控回路,样本量较小 | 探索真菌基因调控回路在次级代谢中的作用,发现新的天然产物 | 真菌基因调控回路及其在次级代谢中的表达强度和时序 | 合成生物学 | NA | 微流控平台 | 数学模型 | 基因表达数据 | 30个转录因子-启动子组合,来自两种代表性真菌基因调控回路,使用模式真菌Aspergillus nidulans |
31 | 2024-12-19 |
Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02487-0
PMID:39572716
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研究论文 | 本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+,用于准确预测RNA的三维结构 | RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题,提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道,并在多个评估中表现优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法,以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发 | 单链RNA的三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 语言模型 | 序列 | 约2370万条RNA序列 |
32 | 2024-12-18 |
All-in-One CO2 Capture and Transformation: Lessons from Formylmethanofuran Dehydrogenases
2024-Dec-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00623
PMID:39584476
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研究论文 | 本文讨论了formylmethanofuran脱氢酶(FMD)在CO2捕获和转化中的潜力,并探讨了其在生物系统和人工系统中的应用 | FMD酶通过不同的操作模式节省细胞能量,并且可以在生物系统和人工系统中进行CO的电还原,生成有机化合物合成中的中间体 | NA | 探讨FMD酶在CO2捕获和转化中的应用,并研究其在生物系统和人工系统中的潜力 | formylmethanofuran脱氢酶(FMD)及其在CO2转化中的作用 | 生物化学 | NA | 酶催化 | NA | NA | NA |
33 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法,通过工程化细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein,使其自组装形成多硅酸盐“生物玻璃”涂层,从而增强光聚焦能力 | 本文首次利用工程化细菌自组装形成多硅酸盐涂层,并展示了其显著的光聚焦能力,亮度比未修饰的细菌高出近一个数量级 | 本文未详细讨论该技术的实际应用场景和大规模生产的可能性 | 探索合成生物学在生产具有独特光学特性的光子组件中的应用 | 工程化细菌及其自组装形成的多硅酸盐涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
34 | 2024-12-18 |
CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration
2024-Dec-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00632
PMID:39680738
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综述 | 本文综述了过去五年中用于整合大DNA片段的方法,特别是新兴的CRISPR相关技术 | 本文重点介绍了基于CRISPR的转座酶和重组酶策略,这些策略有望革新复杂疾病的基因治疗 | 当前技术面临效率低、脱靶效应和高成本等挑战 | 开发能够精确插入千碱基大小DNA片段的工具,以支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用 | 大DNA片段的整合,特别是千碱基大小DNA片段的插入 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA |
35 | 2024-12-18 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2024-Dec-16, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
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综述 | 本文综述了通过工程化噬菌体对抗多重耐药细菌的研究进展 | 工程化噬菌体可以扩展宿主范围、提高噬菌体效能,并赋予新功能 | 天然噬菌体的宿主范围狭窄、特性未完全表征,以及潜在的指数复制和进化风险限制了其应用 | 探讨工程化噬菌体在病原体检测和消除中的应用 | 多重耐药细菌 | NA | NA | 噬菌体工程技术 | NA | NA | NA |
36 | 2024-12-18 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2024-Dec-16, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(T细胞)的生物学特性及其在治疗多种疾病中的应用前景 | 本文讨论了纳米医学和合成生物学领域的最新进展,这些进展推动了新一代T细胞临床试验的发展,旨在更精确地调控T细胞功能 | 本文提到了当前T细胞疗法在临床试验中存在的重要局限性和未解答的问题 | 探讨调节性T细胞的生物学机制及其在治疗多种疾病中的应用策略 | 调节性T细胞及其在过敏、移植、自身免疫和癌症等疾病中的作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
37 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
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研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络(GAN)和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库,并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法,推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络(GAN),多模型融合 | 生成对抗网络(GAN),双向长短期记忆网络(BiLSTM),卷积神经网络(CNN) | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 |
38 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
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综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述,未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力,并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
39 | 2024-12-17 |
Molecular Insights into the Elevator-type Mechanism of the Cyanobacterial Bicarbonate Transporter BicA
2024-Dec-13, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 研究揭示了蓝藻中碳酸氢盐转运蛋白BicA的电梯式机制 | 通过收集超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据,揭示了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排,并研究了可能降低构象转变自由能垒的突变 | 尽管进行了详细的分子动力学模拟,但对BicA转运机制的动态理解仍不完整 | 深入理解蓝藻中碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制,并为增强光合作用生产提供原子级别的见解 | 蓝藻中的碳酸氢盐转运蛋白BicA | NA | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 结构数据 | NA |
40 | 2024-12-17 |
Hypoxia as challenge and opportunity: from cells to crops, to synthetic biology
2024-Dec-06, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae640
PMID:39657271
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |