合成生物学相关文章
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当前共找到 104 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-12-21 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
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研究论文 | 本文展示了通过理性设计和定向进化改造的T7 RNA聚合酶，能够在吲哚的生理相关浓度下被激活 | 开发了一种新的化学诱导“停止和启动”平台，称为LARPs，可立即用于合成生物学应用 | NA | 模拟天然酶的特性，开发一种可控的RNA聚合酶用于合成生物学应用 | T7 RNA聚合酶及其在不同细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | 理性设计 定向进化 | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-12-21 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究通过在Escherichia coli中利用组合生物合成途径，合成了含有鸟氨酸的乳酸素481类似物 | 本研究首次展示了SyncM酶能够通过识别设计的混合前导肽，催化生成含有鸟氨酸和（甲基）羊毛硫氨酸的活性乳酸素481类似物 | 本研究未详细探讨鸟氨酸在乳酸素481特定位点上的结合限制机制 | 研究旨在通过合成生物学途径，探索OspR和SyncM的底物偏好，并为未来的乳酸素生物工程提供指导 | 乳酸素481及其含有鸟氨酸的类似物的合成与抗菌活性 | NA | NA | 组合生物合成 | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-12-21 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究通过在Komagataella phaffii中使用膜结合的香豆酸特异性二戊烯转移酶AcPT1，实现了生物活性酚丙烷类化合物Artepillin C的从头合成 | 通过增强戊基二磷酸供应途径，显著提高了Artepillin C的产量，并实现了在批次培养条件下创纪录的合成量 | 研究中仍存在香豆酸供应的瓶颈，限制了Artepillin C的进一步产量提升 | 开发一种稳定的合成生物学方法，用于生产具有多种药理益处的Artepillin C | Komagataella phaffii细胞中的Artepillin C合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-12-21 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 本文报道了一种名为EPDA的合成受体平台，通过理性设计实现基于肽配体识别的可逆细胞反应 | 开发了一种新的计算算法PETEI用于构建候选单体，并设计了EPDA受体平台，能够实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信 | 实验中仅测试了30个单体，可能未涵盖所有潜在的有效配体 | 旨在设计一种能够实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信的合成受体 | 研究对象为基于肽配体识别的合成受体EPDA及其在细胞反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超过2000个候选单体，最终测试了30个单体 |
| 45 | 2024-12-21 |
Strategies and tools to construct stable and efficient artificial coculture systems as biosynthetic platforms for biomass conversion
2024-Dec-19, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02594-2
PMID:39702246
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具构建稳定高效的人工共培养系统作为生物质转化生物合成平台的策略和方法 | 本文重点介绍了近期在生物质转化方面的进展，并提供了未来研究方向的见解 | 维持系统长期的最优种群比例和平衡合成代谢与分解代谢仍然存在挑战 | 探讨如何改进人工共培养系统的稳定性和生产力，以促进生物质转化 | 人工共培养系统及其在生物质转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-12-20 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本文通过基因工程改造细菌，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应，用于癌症免疫治疗 | 开发了一种高色氨酸表达的细菌菌株L-Trp CB，能够在系统给药后严格定植于肿瘤，通过产生丁酸抑制IDO活性，并释放大量色氨酸支持CD8+ T细胞的激活和能量代谢 | NA | 开发一种增强肿瘤免疫治疗的新策略 | IDO抑制剂在癌症治疗中的应用及CD8+ T细胞反应的重编程 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔子的多种肿瘤模型 |
| 47 | 2024-12-20 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-Dec-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本文综述了近年来对天然产物生物合成中异戊烯侧链修饰的酶学机制及其在天然产物多样性和复杂性中的作用 | 本文总结了几种新颖的生物合成机制，如环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、不寻常的C-C键断裂和氧化环化 | NA | 揭示异戊烯侧链修饰在天然产物生物合成中的化学和酶学机制，指导未来在发现、表征和应用这些修饰方面的努力 | 天然产物生物合成中的异戊烯侧链修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-12-20 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2024-Dec-19, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和代谢工程策略，构建了一种高产(-)-α-Bisabolol的Serratia marcescens菌株 | 引入了Haloarchaea类型的甲羟戊酸(MVA)途径和(-)-α-Bisabolol生物合成途径，并成功构建了能够生产(-)-α-Bisabolol的菌株，同时通过敲除基因减少了副产物法尼醇(FOH)的生成，最终在5 L生物反应器中实现了30.2 g/L的(-)-α-Bisabolol产量，创下了最高纪录 | NA | 提高(-)-α-Bisabolol的微生物生产效率 | (-)-α-Bisabolol的生物合成 | 代谢工程 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-12-20 |
Post-genomic illumination of paclitaxel biosynthesis
2024-12, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01869-8
PMID:39604636
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综述 | 本文总结了紫杉醇生物合成研究的关键里程碑，并强调了通过基因组水平分析潜在关键基因所取得的最新进展 | 通过基因组测序和组装揭示了紫杉醇生物合成所需的最小基因集，为合成生物学方法促进紫杉醇的工业化生产铺平了道路 | 紫杉醇生物合成途径的完整阐明仍面临重大挑战，许多中间产物尚未通过实验确定 | 总结紫杉醇生物合成研究进展，探讨通过合成生物学方法实现紫杉醇工业化生产的可能性 | 紫杉醇的生物合成途径及其关键基因 | NA | NA | 基因组测序和组装 | NA | 基因组数据 | 三种红豆杉（Taxus）基因组 |
| 50 | 2024-12-19 |
Discovery and Functional Identification of 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Cytochrome P450s in Triterpenoid Metabolic Pathways of Actinidia eriantha
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06937
PMID:39648448
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研究论文 | 本研究通过转录组测序分析结合合成生物学方法，在酵母中异源表达，鉴定了参与猕猴桃三萜代谢途径的关键酶基因 | 首次鉴定了两个2,3-氧化角鲨烯环化酶（AeOSC2和AeOSC3）和两个细胞色素P450（AeCYP716A8和AeCYP716A9），并成功重建了猕猴桃中乌索烷型和齐墩果烷型三萜的生物合成途径 | NA | 探索猕猴桃中三萜代谢途径的关键酶基因及其功能 | 猕猴桃中的三萜化合物及其生物合成途径 | 代谢组学 | NA | 转录组测序分析，合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
| 51 | 2024-12-19 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2024-Dec-18, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
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研究论文 | 本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装（bioPISA）生成的人工细胞囊泡的形成和特性，包括尺寸分布和后组装加载 | 首次展示了通过bioPISA方法生成具有均匀尺寸和可控内部结构的囊泡，并成功演示了将大分子加载到预形成的囊泡中的可行性 | 研究主要集中在实验室规模，尚未在大规模应用中验证 | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡，用于合成生物学等应用 | 通过bioPISA生成的囊泡的尺寸分布、形态和内部结构，以及后组装加载大分子的可行性 | 合成生物学 | NA | 生物催化聚合诱导自组装（bioPISA），荧光相关光谱（FCS），电穿孔 | NA | 囊泡 | 未明确提及具体样本数量 |
| 52 | 2024-12-19 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本文利用微流控平台结合数学模型，在单细胞水平上精确表征了与真菌次级代谢相关的基因调控回路 | 首次将微流控平台与数学模型结合，用于单细胞水平上精确表征真菌基因调控回路，并成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 研究仅限于两种代表性真菌基因调控回路，样本量较小 | 探索真菌基因调控回路在次级代谢中的作用，发现新的天然产物 | 真菌基因调控回路及其在次级代谢中的表达强度和时序 | 合成生物学 | NA | 微流控平台 | 数学模型 | 基因表达数据 | 30个转录因子-启动子组合，来自两种代表性真菌基因调控回路，使用模式真菌Aspergillus nidulans |
| 53 | 2024-12-19 |
Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02487-0
PMID:39572716
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研究论文 | 本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确预测RNA的三维结构 | RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道，并在多个评估中表现优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法，以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发 | 单链RNA的三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 语言模型 | 序列 | 约2370万条RNA序列 |
| 54 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法，通过工程化细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein，使其自组装形成多硅酸盐“生物玻璃”涂层，从而增强光聚焦能力 | 本文首次利用工程化细菌自组装形成多硅酸盐涂层，并展示了其显著的光聚焦能力，亮度比未修饰的细菌高出近一个数量级 | 本文未详细讨论该技术的实际应用场景和大规模生产的可能性 | 探索合成生物学在生产具有独特光学特性的光子组件中的应用 | 工程化细菌及其自组装形成的多硅酸盐涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
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研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络（GAN）和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库，并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法，推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络（GAN），多模型融合 | 生成对抗网络（GAN），双向长短期记忆网络（BiLSTM），卷积神经网络（CNN） | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 56 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
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综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述，未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力，并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-12-17 |
Perspectives of cyanobacterial cell factories
2024-Dec, Photosynthesis research
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s11120-023-01056-4
PMID:37966575
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综述 | 本文综述了蓝藻作为细胞工厂在生产异戊二烯和高价值蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 强调了蓝藻在特殊化学品和蛋白质生产中的挑战与前景，特别是异戊二烯产品和生物制药蛋白质 | 未提及具体的技术限制或实验挑战 | 探讨蓝藻在生产有用化学品和蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 蓝藻、异戊二烯、高价值蛋白质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-12-16 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2024-Dec-13, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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研究论文 | 本文通过工程化的酵母G蛋白偶联受体（GPCR）生物传感器，优化了酵母中蛋白质分泌的高通量筛选方法 | 本文创新性地利用GPCR生物传感器量化与目标蛋白（POI）共分泌的肽标签浓度，从而实现蛋白质分泌效率的高通量筛选 | NA | 优化酵母中异源蛋白质表达策略的分泌效率 | 酵母中的蛋白质分泌效率 | 合成生物学 | NA | 组合式Golden Gate克隆 | GPCR生物传感器 | 荧光报告基因 | 超过6000种启动子、信号肽（SP）和终止子的组合 |
| 59 | 2024-12-16 |
Chemically Driven Division of Protocells by Membrane Budding
2024-Dec-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c08226
PMID:39603809
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研究论文 | 本研究探讨了通过化学能量驱动的膜出芽机制实现原细胞分裂的过程 | 本研究首次展示了通过化学燃料驱动简单脂肪酸基囊泡出芽分裂的机制，类似于现有生命的分裂方式，为原细胞自主复制提供了新的可能性 | 本研究主要集中在实验室条件下的小规模实验，尚未在大规模或自然环境中验证其可行性 | 探索原细胞分裂的机制，并为合成细胞的发展提供基础 | 脂肪酸基囊泡及其在化学能量驱动下的分裂行为 | NA | NA | NA | NA | NA | 不同脂肪酸基囊泡的多种样本 |
| 60 | 2024-12-16 |
Harnessing microbes to pioneer environmental biophotoelectrochemistry
2024-Dec, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.005
PMID:39095256
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综述 | 本文综述了微生物生物光电化学系统（BPEC）在环境可持续性策略中的应用 | 强调了从传统生物能源系统向复杂BPEC应用的转变，并展示了其在利用太阳能进行重要生化转化方面的潜力 | 讨论了环境BPEC系统在性能改进和未来应用方面的挑战 | 探讨微生物生物光电化学系统在环境可持续性中的应用 | 微生物生物光电化学系统及其在碳氮固定、污染物降解和废水能源回收中的应用 | NA | NA | 微生物生物光电化学（BPEC） | NA | NA | NA |