合成生物学相关文章
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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-01-04 |
The Role of SF1 and SF2 Helicases in Biotechnological Applications
2024-Dec, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05027-w
PMID:39093351
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review | 本文综述了SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制，并探讨了它们在生物技术应用中的潜力 | 强调了SF1解旋酶中独特的1B和2B结构域及其对酶活性的影响，并讨论了UvrD解旋酶的活性形式及解旋后解离的争议 | NA | 总结SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制，并探讨其在生物技术中的应用 | SF1和SF2解旋酶 | 生物技术 | NA | 纳米孔测序、蛋白质测序、等温扩增 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-01-01 |
Machine Learning-Driven Innovations in Microfluidics
2024-Dec-13, Biosensors
DOI:10.3390/bios14120613
PMID:39727877
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综述 | 本文探讨了机器学习在微流体生物传感器设计、制造和应用中的整合，强调了机器学习算法如何通过提高设计准确性、操作效率和管理复杂诊断数据集来增强性能 | 将机器学习与微流体技术结合，开发出能够自动化实验流程、实时数据分析和支持决策的智能系统 | 未具体提及研究的局限性 | 研究机器学习在微流体生物传感器中的应用，以提升其性能和效率 | 微流体生物传感器 | 机器学习 | NA | 机器学习 | NA | 复杂诊断数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-12-29 |
Advanced metabolic Engineering strategies for the sustainable production of free fatty acids and their derivatives using yeast
2024-Dec-27, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00473-w
PMID:39731138
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综述 | 本文综述了利用酵母进行代谢工程策略以可持续生产游离脂肪酸及其衍生物的研究进展 | 探讨了酵母利用替代碳源（如CO、甲醇和乙酸）的工程策略，超越了传统的糖类 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 推动可持续工业脂质生产技术的发展 | 酵母 | 代谢工程 | NA | 合成生物学和代谢工程工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-12-29 |
Enhanced Eicosapentaenoic Acid Production via Synthetic Biological Strategy in Nannochloropsis oceanica
2024-Dec-19, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md22120570
PMID:39728144
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研究论文 | 本研究通过合成生物学策略提高海洋微藻Nannochloropsis oceanica中EPA的产量 | 首次在Nannochloropsis oceanica中应用合成生物学策略，通过基因过表达和敲除技术显著提高EPA产量 | 研究仅限于实验室环境，未进行大规模生产验证 | 提高Nannochloropsis oceanica中EPA的产量 | 海洋微藻Nannochloropsis oceanica | 合成生物学 | NA | 基因过表达、基因敲除、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-12-26 |
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-Dec-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264
PMID:39658019
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综述 | 本文综述了细菌金属稳态的机制，包括金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输 | 提供了金属调节蛋白和金属感应核糖开关的多样性视角，并讨论了其在合成生物学和生物技术中的应用 | 文章指出在金属稳态理解方面仍存在一些空白，需要进一步研究 | 探讨细菌如何通过金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输来维持金属稳态 | 细菌 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-12-26 |
Intron RPS25Ai, a Novel DNA Element, Has Global Effects on Synthetic Pathway Engineering by Empowering Protein Synthesis
2024-Dec-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11278
PMID:39660479
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研究论文 | 本研究探讨了内含子作为多功能新型生物DNA元件在合成生物学中的潜力，展示了其在转录和翻译层面的时空调控模式，并应用于工程酵母中的异源代谢途径，显著提高了β-胡萝卜素的产量 | 首次将内含子RPS25Ai作为多级调控遗传元件应用于合成生物学，展示了其在转录前和成熟RNA水平的表达增强效果，并实现了基因组规模的调控 | 研究主要局限于酵母细胞，未在其他生物系统中验证其广泛适用性 | 探索内含子作为新型生物DNA元件在合成生物学中的应用潜力 | 内含子RPS25Ai及其在工程酵母中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢途径工程 | NA | 基因表达数据 | 工程酵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-12-25 |
Designed to breathe: synthetic biology applications in plant hypoxia
2024-Dec-23, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae623
PMID:39673416
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综述 | 本文综述了近年来在植物低氧响应监测工具方面的进展，特别是通过合成生物学方法设计的新型遗传电路 | 本文介绍了从细菌和动物研究中改编或专为植物设计的氧气响应报告器、染料和纳米探针，并强调了合成生物学视角在设计植物氧气依赖响应遗传电路中的应用 | 本文讨论了在植物低氧生物学领域实施合成生物学解决方案的当前限制和挑战 | 总结植物低氧响应监测工具的最新进展，并探讨合成生物学在植物低氧生物学中的应用 | 植物低氧响应监测工具和合成生物学方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-12-21 |
Strategies and tools to construct stable and efficient artificial coculture systems as biosynthetic platforms for biomass conversion
2024-Dec-19, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02594-2
PMID:39702246
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具构建稳定高效的人工共培养系统作为生物质转化生物合成平台的策略和方法 | 本文重点介绍了近期在生物质转化方面的进展，并提供了未来研究方向的见解 | 维持系统长期的最优种群比例和平衡合成代谢与分解代谢仍然存在挑战 | 探讨如何改进人工共培养系统的稳定性和生产力，以促进生物质转化 | 人工共培养系统及其在生物质转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-12-20 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-Dec-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本文综述了近年来对天然产物生物合成中异戊烯侧链修饰的酶学机制及其在天然产物多样性和复杂性中的作用 | 本文总结了几种新颖的生物合成机制，如环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、不寻常的C-C键断裂和氧化环化 | NA | 揭示异戊烯侧链修饰在天然产物生物合成中的化学和酶学机制，指导未来在发现、表征和应用这些修饰方面的努力 | 天然产物生物合成中的异戊烯侧链修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-12-20 |
Post-genomic illumination of paclitaxel biosynthesis
2024-12, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01869-8
PMID:39604636
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综述 | 本文总结了紫杉醇生物合成研究的关键里程碑，并强调了通过基因组水平分析潜在关键基因所取得的最新进展 | 通过基因组测序和组装揭示了紫杉醇生物合成所需的最小基因集，为合成生物学方法促进紫杉醇的工业化生产铺平了道路 | 紫杉醇生物合成途径的完整阐明仍面临重大挑战，许多中间产物尚未通过实验确定 | 总结紫杉醇生物合成研究进展，探讨通过合成生物学方法实现紫杉醇工业化生产的可能性 | 紫杉醇的生物合成途径及其关键基因 | NA | NA | 基因组测序和组装 | NA | 基因组数据 | 三种红豆杉（Taxus）基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-12-19 |
Discovery and Functional Identification of 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Cytochrome P450s in Triterpenoid Metabolic Pathways of Actinidia eriantha
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06937
PMID:39648448
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研究论文 | 本研究通过转录组测序分析结合合成生物学方法，在酵母中异源表达，鉴定了参与猕猴桃三萜代谢途径的关键酶基因 | 首次鉴定了两个2,3-氧化角鲨烯环化酶（AeOSC2和AeOSC3）和两个细胞色素P450（AeCYP716A8和AeCYP716A9），并成功重建了猕猴桃中乌索烷型和齐墩果烷型三萜的生物合成途径 | NA | 探索猕猴桃中三萜代谢途径的关键酶基因及其功能 | 猕猴桃中的三萜化合物及其生物合成途径 | 代谢组学 | NA | 转录组测序分析，合成生物学 | NA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-12-19 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本文利用微流控平台结合数学模型，在单细胞水平上精确表征了与真菌次级代谢相关的基因调控回路 | 首次将微流控平台与数学模型结合，用于单细胞水平上精确表征真菌基因调控回路，并成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 研究仅限于两种代表性真菌基因调控回路，样本量较小 | 探索真菌基因调控回路在次级代谢中的作用，发现新的天然产物 | 真菌基因调控回路及其在次级代谢中的表达强度和时序 | 合成生物学 | NA | 微流控平台 | 数学模型 | 基因表达数据 | 30个转录因子-启动子组合，来自两种代表性真菌基因调控回路，使用模式真菌Aspergillus nidulans | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-12-19 |
Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02487-0
PMID:39572716
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研究论文 | 本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确预测RNA的三维结构 | RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道，并在多个评估中表现优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法，以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发 | 单链RNA的三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 语言模型 | 序列 | 约2370万条RNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
|
研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络（GAN）和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库，并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法，推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络（GAN），多模型融合 | 生成对抗网络（GAN），双向长短期记忆网络（BiLSTM），卷积神经网络（CNN） | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
|
综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述，未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力，并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-12-17 |
Perspectives of cyanobacterial cell factories
2024-Dec, Photosynthesis research
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s11120-023-01056-4
PMID:37966575
|
综述 | 本文综述了蓝藻作为细胞工厂在生产异戊二烯和高价值蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 强调了蓝藻在特殊化学品和蛋白质生产中的挑战与前景，特别是异戊二烯产品和生物制药蛋白质 | 未提及具体的技术限制或实验挑战 | 探讨蓝藻在生产有用化学品和蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 蓝藻、异戊二烯、高价值蛋白质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-12-16 |
Chemically Driven Division of Protocells by Membrane Budding
2024-Dec-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c08226
PMID:39603809
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研究论文 | 本研究探讨了通过化学能量驱动的膜出芽机制实现原细胞分裂的过程 | 本研究首次展示了通过化学燃料驱动简单脂肪酸基囊泡出芽分裂的机制，类似于现有生命的分裂方式，为原细胞自主复制提供了新的可能性 | 本研究主要集中在实验室条件下的小规模实验，尚未在大规模或自然环境中验证其可行性 | 探索原细胞分裂的机制，并为合成细胞的发展提供基础 | 脂肪酸基囊泡及其在化学能量驱动下的分裂行为 | NA | NA | NA | NA | NA | 不同脂肪酸基囊泡的多种样本 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-12-16 |
Harnessing microbes to pioneer environmental biophotoelectrochemistry
2024-Dec, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.005
PMID:39095256
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综述 | 本文综述了微生物生物光电化学系统（BPEC）在环境可持续性策略中的应用 | 强调了从传统生物能源系统向复杂BPEC应用的转变，并展示了其在利用太阳能进行重要生化转化方面的潜力 | 讨论了环境BPEC系统在性能改进和未来应用方面的挑战 | 探讨微生物生物光电化学系统在环境可持续性中的应用 | 微生物生物光电化学系统及其在碳氮固定、污染物降解和废水能源回收中的应用 | NA | NA | 微生物生物光电化学（BPEC） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-12-14 |
Genetically Engineered Liposwitch-Based Nanomaterials
2024-Dec-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c01388
PMID:39495202
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研究论文 | 本文探讨了使用基因工程脂开关调控无序蛋白驱动的纳米组装 | 提出了“脂开关”概念，通过结合别构效应和翻译后修饰来调控融合蛋白的组装 | NA | 开发一种新的策略来控制无序蛋白驱动的纳米组装 | 无序蛋白和球状蛋白的融合纳米材料 | 合成生物学 | NA | 动态光散射、冷冻透射电子显微镜 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-12-14 |
Towards AI-designed genomes using a variational autoencoder
2024-Dec, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2024.1457
PMID:39657811
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研究论文 | 本文开发了一个概念验证框架，利用变分自编码器训练机器学习算法来建模细菌基因组组成 | 提出了DeepGenomeVector模型，能够有效捕捉基因组网络中的复杂依赖关系，并通过定性和定量指标验证了其性能 | 本文仅展示了概念验证，尚未实现AI设计完整基因组的能力 | 探索机器学习在合成生物学中的应用，展示AI设计基因组的可能性 | 细菌基因组及其编码的基因网络 | 机器学习 | NA | 变分自编码器 | 变分自编码器 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |