合成生物学相关文章
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当前共找到 249 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
|
研究论文 | 本研究探索从头设计的卷曲螺旋肽组装体的动态特性，重点关注不同寡聚态之间的肽交换行为 | 开发了荧光报告检测方法研究肽交换动力学，发现设计肽存在同型交换忠实性和异型交换混杂性，并提出两种提高正交性的设计策略 | NA | 研究从头设计卷曲螺旋肽组装体的动态交换特性 | 系列卷曲螺旋肽组装体（从二聚体到七聚体） | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测、肽设计 | NA | 荧光数据、动力学数据 | NA | NA | NA | 卷曲螺旋肽组装体 | 化学生物学, 合成生物学 |
| 202 | 2025-10-06 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在莱茵衣藻中实现了外源蛋白表达的快速、可逆调控 | 首次将哺乳动物来源的DD/Shield-1系统成功应用于微藻系统，实现了外源基因的快速可逆调控 | 未明确说明该系统在不同外源蛋白中的普适性及长期稳定性 | 开发莱茵衣藻中外源基因表达调控的新方法 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统、基因编辑 | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 分子开关系统，基于配体依赖的蛋白稳定性调控 | 工业生物技术 |
| 203 | 2025-10-06 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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综述 | 本文讨论在合成细胞中构建从头开始的机械敏感信号通路的研究进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中创建全新的机械敏感信号通路 | NA | 通过合成生物学方法研究机械转导机制并开发新型生物技术 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成细胞 | 机械敏感信号通路 | 医学诊断, 微反应器, 治疗 |
| 204 | 2025-10-06 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
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研究论文 | 本研究开发了一种利用平行生物反应器快速确定生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法，并以甲羟戊酸生产为例进行验证 | 采用平行生物反应器策略快速绘制产物形成速率、底物利用速率与生长速率之间的耦合关系，并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究仅以甲羟戊酸为例进行验证，方法在其他生物生产系统中的普适性需要进一步验证 | 开发快速评估生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法，提高生物制造的经济可行性 | 甲羟戊酸生物生产过程中的生长-产物耦合关系 | 合成生物学 | NA | 平行生物反应器技术、基因编辑 | NA | 生物过程数据、代谢产物数据 | 使用大肠杆菌BW25113菌株及其基因编辑变体 | 基因编辑 | 大肠杆菌 | 通过敲除ackA-pta操纵子和poxB基因重构代谢通路 | 工业生物技术,能源,材料 |
| 205 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于程序化基因表达控制 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合，并通过定向进化获得高活性变体，解决了T7 RNAP在真核系统中缺乏5'甲基鸟苷帽的局限性 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因调控系统 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP-based遗传电路 | 工业生物技术 |
| 206 | 2025-10-06 |
RDBSB: a database for catalytic bioparts with experimental evidence
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae844
PMID:39360609
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研究论文 | 开发了一个包含实验证据的催化生物元件数据库RDBSB | 整合了83,193个经过人工整理的催化生物元件，提供详细的定性和定量催化信息及分析工具 | NA | 为合成生物学中的代谢途径设计提供全面的催化生物元件资源 | 催化生物元件及其功能特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物元件功能数据 | 83,193个催化生物元件，其中超过1000个通过社区提交系统贡献 | NA | NA | 代谢途径设计工具 | 工业生物技术 |
| 207 | 2025-10-06 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
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综述 | 本文全面综述甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性、生物制造及结构修饰研究进展 | 首次系统总结甘草三萜类化合物整体特征（而非仅关注甘草酸和甘草次酸），并应用drugCIPHER算法预测其药理活性 | NA | 探索甘草三萜类化合物的发现、生物制造和结构修饰策略 | 甘草三萜类化合物（以甘草酸和甘草次酸为代表） | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、drugCIPHER算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 208 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
|
研究论文 | 介绍使用模块化克隆系统MoClo进行多基因构建体组装的实验方案 | 利用类型IIS酶进行DNA组装的模块化克隆系统，通过一系列一锅法组装步骤实现多基因构建体的高效组装 | NA | 开发高效的多基因构建体组装方法 | 多基因构建体的组装策略和实验流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 多基因构建体 | 生物研究, 合成生物学 |
| 209 | 2025-10-06 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 开发了一种用于创建SBOL表示构建计划的软件工具，以模拟IIS型介导的组装反应并存储相关元数据 | 首次实现了使用SBOL标准化表示Golden Gate组装元数据的软件工具 | NA | 为合成生物学领域提供标准化的DNA组装元数据表示方法 | DNA组装构建计划 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA | Golden Gate Assembly, SBOL | NA | DNA组装构建计划 | 工业生物技术 |
| 210 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
|
研究论文 | 本文详细介绍了MoClo系统标准部件的Golden Gate克隆方案 | 提供了标准部件克隆的详细步骤方案，包括大片段标准部件的中间构建策略 | NA | 开发合成生物学中DNA组装的高效方法 | MoClo系统的标准部件（level 0模块） | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，PCR，DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 标准部件（启动子、编码序列、终止子等遗传元件） | 工业生物技术 |
| 211 | 2025-10-06 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
|
研究论文 | 本文提供了使用声波分配器在1μL总体积中执行和并行化Golden Gate克隆反应的逐步方案 | 首次将声波分配技术应用于Golden Gate DNA组装反应，实现反应体积从10-25μL缩小至1μL的微型化 | NA | 开发自动化和小型化的DNA组装方法 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, 声波分配器 | NA | 模块化分层DNA片段组装 | 工业生物技术 |
| 212 | 2025-10-06 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
|
研究论文 | 本文提出了一种使用纳米孔测序平台进行高度多重双条形码扩增子测序的详细方案，用于验证Golden Gate组装结果 | 开发了名为DuBA.flow的完整工作流程，实现从单菌落到最终易解读测序报告的一站式解决方案 | NA | 为Golden Gate组装提供高效可靠的序列验证方法 | Golden Gate组装产物 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 双条形码扩增子测序, PCR | NA | DNA测序数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元组装, 多基因构建体 | 工业生物技术 |
| 213 | 2025-10-06 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
|
研究论文 | 介绍开源Python软件包AssemblyTron如何通过低成本开源机器人实现Golden Gate克隆的自动化 | 开发了AssemblyTron的升级功能，包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变库组装和索引质粒库组装 | NA | 为合成生物学提供经济高效的Golden Gate组装自动化解决方案 | DNA构建体和组合文库 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、易错PCR | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, OpenTrons OT-2 | NA | 模块化克隆系统、组合突变库、索引质粒库 | 工业生物技术 |
| 214 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
|
研究论文 | 介绍基于Golden Gate组装技术快速构建细菌合成小RNA表达质粒的方法和工具 | 开发了用于大肠杆菌的质粒系列和G-GArden工具，支持无疤痕组装策略的寡核苷酸设计 | NA | 建立合成小RNA表达质粒的快速高效构建方法 | 细菌小RNA和合成生物学构建模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, G-GArden | Escherichia coli | 合成小RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 215 | 2025-10-06 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
|
研究论文 | 开发了一种基于Golden Gate组装的无克隆工作流程，用于快速生产线性DNA模板以用于无细胞转录翻译系统 | 通过Golden Gate组装和PCR扩增实现无细胞快速原型设计，无需耗时的大肠杆菌转化和克隆步骤 | NA | 加速合成生物学中设计-构建-测试-学习周期的新功能开发 | 线性DNA模板和遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、PCR、无细胞转录翻译(TXTL) | NA | 遗传元件功能数据 | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 转录单元组装，包括启动子、核糖体结合位点(RBS)、编码序列和终止子 | 工业生物技术 |
| 216 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
|
研究论文 | 本文描述了利用Golden Gate组装和模块化克隆技术在莱茵衣藻中构建转基因表达遗传盒的方法 | 将模块化克隆技术应用于单细胞模型藻类莱茵衣藻的转基因表达 | NA | 开发快速高效的克隆策略用于合成生物学中转基因单元或通路的组装 | 莱茵衣藻中的转基因表达遗传盒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, Modular Cloning | Chlamydomonas reinhardtii | 转基因表达遗传盒 | 工业生物技术 |
| 217 | 2025-10-06 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
|
综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins抗菌肽的结构多样性、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的治疗潜力 | 聚焦农场动物特异性cathelicidins，系统阐述其结构多样性、多重作用机制及作为抗生素替代品的临床前景 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的免疫机制及其对抗菌素耐药性的治疗应用 | 农场动物中的cathelicidins抗菌肽家族 | NA | 感染性疾病 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | 农场动物 | NA | 医药 |
| 218 | 2025-10-06 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 本文综述了工程化酿酒酵母在医学领域的三大应用方向：作为药物和疫苗的细胞工厂、诊断用生物传感器以及肠道疾病活体治疗产品 | 系统梳理了酿酒酵母从食品工业到医学应用的身份转变，聚焦其在合成生物学推动下的创新医疗应用场景 | 该领域仍面临技术挑战和商业化障碍（文中未具体说明样本规模或实验数据局限） | 探讨工程化酿酒酵母在医学应用中的发展现状与前景 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的基因工程改造体 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 基因工程技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 生物传感器、活体治疗系统 | 医学 |
| 219 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母，实现了藏红花成分藏花酸的生物合成与分泌 | 首次在工业酵母解脂耶氏酵母中实现藏花酸的从头生物合成，并通过两步温度转换发酵策略使产量提高2.3倍 | 研究仅限于摇瓶发酵规模，尚未进行大规模发酵验证 | 开发藏花酸的可持续生物生产方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | 代谢物分析数据、发酵参数 | 工程酵母菌株 | CRISPR-Cas9, 吉布森组装 | 解脂耶氏酵母 | 藏花酸生物合成途径、β-胡萝卜素代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 220 | 2025-10-06 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
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综述 | 本文深入探讨了合成气发酵技术，涵盖微生物利用、气体成分影响、分离技术及商业化进展 | 系统综述了遗传工具和代谢工程在扩展合成气发酵产品范围方面的最新进展，特别关注非模式生物的菌株开发加速技术 | NA | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代方案的技术发展现状和挑战 | 合成气发酵微生物、气体成分、分离技术和商业化应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传工具开发 | NA | NA | NA | NA | 乙酰原核生物及其他非模式微生物 | Wood-Ljungdahl代谢途径 | 能源, 环境 |