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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
|
研究论文 | 本研究探索从头设计的卷曲螺旋肽组装体的动态特性,重点关注不同寡聚态之间的肽交换行为 | 开发了荧光报告检测方法研究肽交换动力学,发现设计肽存在同型交换忠实性和异型交换混杂性,并提出两种提高正交性的设计策略 | NA | 研究从头设计卷曲螺旋肽组装体的动态交换特性 | 系列卷曲螺旋肽组装体(从二聚体到七聚体) | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测、肽设计 | NA | 荧光数据、动力学数据 | NA | NA | NA | 卷曲螺旋肽组装体 | 化学生物学, 合成生物学 |
| 222 | 2025-10-06 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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综述 | 本文讨论在合成细胞中构建从头开始的机械敏感信号通路的研究进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中创建全新的机械敏感信号通路 | NA | 通过合成生物学方法研究机械转导机制并开发新型生物技术 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成细胞 | 机械敏感信号通路 | 医学诊断, 微反应器, 治疗 |
| 223 | 2025-10-06 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
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研究论文 | 本研究开发了一种利用平行生物反应器快速确定生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法,并以甲羟戊酸生产为例进行验证 | 采用平行生物反应器策略快速绘制产物形成速率、底物利用速率与生长速率之间的耦合关系,并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究仅以甲羟戊酸为例进行验证,方法在其他生物生产系统中的普适性需要进一步验证 | 开发快速评估生物生产过程中生长-产物耦合关系的方法,提高生物制造的经济可行性 | 甲羟戊酸生物生产过程中的生长-产物耦合关系 | 合成生物学 | NA | 平行生物反应器技术、基因编辑 | NA | 生物过程数据、代谢产物数据 | 使用大肠杆菌BW25113菌株及其基因编辑变体 | 基因编辑 | 大肠杆菌 | 通过敲除ackA-pta操纵子和poxB基因重构代谢通路 | 工业生物技术,能源,材料 |
| 224 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,用于程序化基因表达控制 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,并通过定向进化获得高活性变体,解决了T7 RNAP在真核系统中缺乏5'甲基鸟苷帽的局限性 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因调控系统 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP-based遗传电路 | 工业生物技术 |
| 225 | 2025-10-06 |
RDBSB: a database for catalytic bioparts with experimental evidence
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae844
PMID:39360609
|
研究论文 | 开发了一个包含实验证据的催化生物元件数据库RDBSB | 整合了83,193个经过人工整理的催化生物元件,提供详细的定性和定量催化信息及分析工具 | NA | 为合成生物学中的代谢途径设计提供全面的催化生物元件资源 | 催化生物元件及其功能特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物元件功能数据 | 83,193个催化生物元件,其中超过1000个通过社区提交系统贡献 | NA | NA | 代谢途径设计工具 | 工业生物技术 |
| 226 | 2025-10-06 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
|
综述 | 本文全面综述甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性、生物制造及结构修饰研究进展 | 首次系统总结甘草三萜类化合物整体特征(而非仅关注甘草酸和甘草次酸),并应用drugCIPHER算法预测其药理活性 | NA | 探索甘草三萜类化合物的发现、生物制造和结构修饰策略 | 甘草三萜类化合物(以甘草酸和甘草次酸为代表) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、drugCIPHER算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 227 | 2025-10-06 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
|
综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins抗菌肽的结构多样性、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的治疗潜力 | 聚焦农场动物特异性cathelicidins,系统阐述其结构多样性、多重作用机制及作为抗生素替代品的临床前景 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的免疫机制及其对抗菌素耐药性的治疗应用 | 农场动物中的cathelicidins抗菌肽家族 | NA | 感染性疾病 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | 农场动物 | NA | 医药 |
| 228 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了藏红花成分藏花酸的生物合成与分泌 | 首次在工业酵母解脂耶氏酵母中实现藏花酸的从头生物合成,并通过两步温度转换发酵策略使产量提高2.3倍 | 研究仅限于摇瓶发酵规模,尚未进行大规模发酵验证 | 开发藏花酸的可持续生物生产方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | 代谢物分析数据、发酵参数 | 工程酵母菌株 | CRISPR-Cas9, 吉布森组装 | 解脂耶氏酵母 | 藏花酸生物合成途径、β-胡萝卜素代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 229 | 2025-10-06 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
|
综述 | 本文深入探讨了合成气发酵技术,涵盖微生物利用、气体成分影响、分离技术及商业化进展 | 系统综述了遗传工具和代谢工程在扩展合成气发酵产品范围方面的最新进展,特别关注非模式生物的菌株开发加速技术 | NA | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代方案的技术发展现状和挑战 | 合成气发酵微生物、气体成分、分离技术和商业化应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传工具开发 | NA | NA | NA | NA | 乙酰原核生物及其他非模式微生物 | Wood-Ljungdahl代谢途径 | 能源, 环境 |
| 230 | 2025-10-06 |
Programming mammalian cell behaviors by physical cues
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.014
PMID:39179464
|
综述 | 本文综述了通过物理信号调控哺乳动物细胞行为的合成生物学研究进展 | 探讨了利用光、磁场、温度、机械力、超声波和电信号等物理线索精确控制细胞行为的转基因开关设计 | 现有工具存在精度和效率方面的限制 | 开发响应物理信号的合成生物学工具以调控哺乳动物细胞行为 | 工程化哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因开关设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 物理信号响应开关 | 医学 |
| 231 | 2025-10-06 |
Intratumoral Injection of Engineered Mycobacterium smegmatis Induces Antitumor Immunity and Inhibits Tumor Growth
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0130
PMID:39780958
|
研究论文 | 通过合成生物学改造耻垢分枝杆菌,使其表达Flt3L和CD40激动剂融合蛋白,瘤内注射可激活树突状细胞并诱导抗肿瘤免疫反应 | 首次利用合成生物学技术改造非致病性分枝杆菌作为活体免疫激动剂递送平台,实现瘤内原位激活树突状细胞 | 研究仅限于小鼠黑色素瘤模型,尚未在更多肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发新型肿瘤免疫治疗方法,通过激活树突状细胞增强抗肿瘤免疫应答 | B16F10小鼠黑色素瘤模型和工程化耻垢分枝杆菌 | 合成生物学与免疫治疗 | 黑色素瘤 | 合成生物学改造、蛋白质工程 | NA | 动物实验数据、免疫细胞分析数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 耻垢分枝杆菌 | Flt3L与CD40激动剂融合蛋白表达系统 | 医学 |
| 232 | 2025-10-06 |
Ion-Selective Mobility Differential Amplifier: Enhancing Pressure-Induced Voltage Response in Hydrogels
2025-Jan-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415000
PMID:39545315
|
研究论文 | 提出使用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器来增强离子型聚乙烯醇水凝胶压力诱导电压响应的策略 | 首次采用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器,将压电离子系数提升30倍至1490 nV/Pa | NA | 增强压电离子器件的刺激响应能力 | 离子型聚乙烯醇水凝胶 | 材料科学 | NA | 压电离子技术 | NA | 电信号数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 软体机器人, 合成生物学 |
| 233 | 2025-10-06 |
Herbal Multiomics Provide Insights into Gene Discovery and Bioproduction of Triterpenoids by Engineered Microbes
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08372
PMID:39666531
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综述 | 本文综述了利用多组学技术和合成生物学方法解析三萜类化合物生物合成途径及微生物异源生产的最新进展 | 整合多组学技术与合成生物学策略,系统阐述三萜类化合物生物合成途径解析和微生物工程化生产的创新方法 | NA | 阐明三萜类化合物的生物合成途径并提高其在底盘细胞中的产量 | 三萜类化合物的生物合成途径和微生物异源生产系统 | 合成生物学 | NA | 多组学技术、代谢工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 微生物 | 三萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术, 农业 |
| 234 | 2025-10-06 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学策略改造粘质沙雷氏菌,实现了高效生产(-)-α-红没药醇 | 首次在非模式微生物中引入古菌MVA途径和分子伴侣协同表达,创下(-)-α-红没药醇最高产量纪录 | 未明确说明菌株对(-)-α-红没药醇耐受性的具体机制 | 开发可持续高效的(-)-α-红没药醇微生物生产方法 | 粘质沙雷氏菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | 5 L生物反应器规模验证 | CRISPR-Cas9, 基因敲除 | Serratia marcescens | 古菌MVA途径,(-)-α-红没药醇生物合成途径,分子伴侣DnaK/J共表达系统 | 医药,化妆品 |
| 235 | 2025-10-06 |
Construction and Optimization of Engineered Saccharomyces cerevisiae for De Novo Synthesis of Phloretin and Its Derivatives
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09893
PMID:39723863
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在酿酒酵母中构建并优化了根皮素及其衍生物的生物合成途径 | 首次在同一宿主中系统比较三种根皮素合成途径,并通过途径优化实现了根皮素及其多种衍生物的高效合成,其中4-甲基根皮素和橙皮素二氢查尔酮为首次合成 | NA | 解决二氢查尔酮类化合物日益增长的需求,并为更复杂衍生物的生物合成奠定基础 | 根皮素及其衍生物(根皮苷、三叶苷、诺索芬、4-甲基根皮素、橙皮素二氢查尔酮) | 合成生物学 | NA | 理性设计、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 三种根皮素生物合成途径(最终确定对香豆酰-CoA途径最有效),异源途径与内源代谢的协调 | 食品,制药 |
| 236 | 2024-12-25 |
Ergothioneine biosynthesis: The present state and future prospect
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.10.008
PMID:39717282
|
综述 | 本文综述了麦角硫因(ERG)的生物合成现状及未来前景 | 本文介绍了利用合成生物学工具在ERG生产中的最新进展,并讨论了提高ERG产量的策略 | 本文主要讨论了ERG生产的挑战,但未提供具体的实验数据或解决方案 | 探讨麦角硫因的生物合成及其在不同领域的应用前景 | 麦角硫因的生物合成及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-12-18 |
Carotenoids: resources, knowledge, and emerging tools to advance apocarotenoid research
2025-Jan, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112298
PMID:39442633
|
综述 | 本文综述了类胡萝卜素及其衍生物阿朴类胡萝卜素的生物合成、调控及其在植物发育、应激反应和植物-有机体相互作用中的作用 | 本文强调了异源表达平台和合成生物学工具在扩展阿朴类胡萝卜素发现、知识和应用方面的价值,并提出了未来研究的新方向 | NA | 探讨类胡萝卜素生物合成的调控及其对阿朴类胡萝卜素形成和生物活性效应的影响 | 类胡萝卜素及其衍生物阿朴类胡萝卜素 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-12-18 |
Bacterial 5' UTR: A treasure-trove for post-transcriptional regulation
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108478
PMID:39551455
|
综述 | 本文综述了细菌5' UTR在转录后调控中的作用及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 本文整合了当前对5' UTR调控功能的理解,展示了5' UTR元件设计和筛选的最新进展,并更新了开发的工具和调控策略 | 本文强调了未来建立可靠的生物信息学分析方法和非模式细菌底盘的挑战和必要性 | 探讨细菌5' UTR衍生的调控元件及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 细菌5' UTR及其调控元件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-12-18 |
Harnessing microbial heterogeneity for improved biosynthesis fueled by synthetic biology
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.11.004
PMID:39686977
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综述 | 本文综述了微生物异质性对生物合成的影响,并探讨了合成生物学工具和策略如何通过调控微生物异质性来提高生物合成效率 | 提出了利用微生物异质性(IHP-RHR)的工作流程,通过增加遗传异质性筛选高产菌株,并在生产过程中减少异质性以获得高稳健性菌株 | 未具体讨论实际应用中的挑战和解决方案 | 探讨如何通过合成生物学和单细胞技术调控微生物异质性,以提高微生物细胞工厂的效率和稳健性 | 微生物异质性及其对生物合成的影响 | 合成生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-12-17 |
Synthetic biology approaches to improve tolerance of inhibitors in lignocellulosic hydrolysates
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108477
PMID:39551454
|
研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性 | 本文提出了多种合成生物学策略,包括氧化还原平衡、膜工程、组学引导技术、保护剂和转录因子的表达、非理性工程、细胞絮凝和其他新技术,以提高微生物的耐受性 | 本文未详细讨论具体的技术实现细节和实验验证结果 | 提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性,促进可持续发展和工业生产 | 木质纤维素水解液中的抑制剂和微生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分子生物学、高通量测序、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |