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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Review on Advancement of AI in Cell Engineering and Molecular Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_10
PMID:40553333
|
综述 | 本文综述了人工智能在分子生物学和细胞工程领域的最新进展与应用 | 展示了AI在组织工程研究中通过自动识别组织水平模式和设计原则带来的全新研究范式 | NA | 探讨人工智能在分子生物学和细胞工程领域的应用潜力 | 分子生物学机制和细胞工程应用 | 机器学习 | NA | NA | 机器学习 | 分子数据、生物医学图像 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 42 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence in CRISPR-Cas Systems: A Review of Tool Applications
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_14
PMID:40553337
|
综述 | 本文综述了人工智能在CRISPR-Cas系统工具应用中的整合与发展 | 将人工智能与CRISPR-Cas系统相结合,为基因工程研究开辟新视角 | NA | 探讨人工智能在基因编辑工具中的应用潜力 | CRISPR-Cas系统与人工智能的整合应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 43 | 2025-10-05 |
Review on Advancement of AI in Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_26
PMID:40553349
|
综述 | 探讨人工智能在合成生物学领域的最新进展及其应用 | 系统阐述AI技术如何推动合成生物学在预测建模、系统优化和生物系统设计方面的革新 | 高质量生物数据集匮乏,计算与实验科学家之间存在跨学科鸿沟 | 分析人工智能与合成生物学交叉融合的发展现状与未来前景 | 合成生物学中的基因组编辑、代谢通路优化和生物电路设计 | 机器学习 | NA | 深度学习,机器学习 | NA | 生物数据集 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因电路开发 | 医学, 生物技术, 环境 |
| 44 | 2025-10-05 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
|
综述 | 探讨非编码RNA的结构预测方法及其在生物医学中的功能与应用 | 整合计算与实验技术推进非编码RNA结构预测,并展望多组学数据融合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模精度不足,对RNA动态折叠机制理解有限 | 解析非编码RNA结构以理解其生物功能并开发治疗策略 | microRNAs、小干扰RNA、长链非编码RNA等非编码RNA分子 | 计算生物学 | NA | 计算方法与实验技术结合 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 45 | 2025-10-05 |
Viral vector-based transient expression systems for plant biotechnology research at PUIs
2025, Frontiers in education
IF:1.9Q2
DOI:10.3389/feduc.2025.1598673
PMID:40520985
|
综述 | 介绍基于病毒载体的瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用优势与实施策略 | 提出将病毒载体瞬时表达系统作为传统稳定遗传转化在本科院校的替代方案,实现单学期内完成有意义的本科生研究项目 | NA | 推广病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用 | 植物病毒载体(如TMV或双生病毒)及其在植物中的瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 病毒载体瞬时表达、农杆菌浸润 | NA | NA | NA | 农杆菌浸润 | 植物 | 基于植物病毒载体的基因瞬时表达系统 | 教育, 工业生物技术 |
| 46 | 2025-10-05 |
"Open science" meets commercial realities: a qualitative study of factors influencing sharing in synthetic biology research in Australia
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1604509
PMID:40529177
|
研究论文 | 本研究通过质性方法探讨澳大利亚合成生物学研究中数据与材料共享的影响因素,特别关注知识产权监管与商业化需求对共享行为的影响 | 首次对合成生物学领域共享行为进行社会法律视角的交叉研究,揭示研究人员在开放科学与商业化需求间的双重管理策略 | 研究范围限于澳大利亚,样本可能无法完全代表全球合成生物学研究现状 | 分析合成生物学研究中数据与材料共享的驱动因素和障碍 | 大学和商业机构的合成生物学家及商业化专业人士 | 合成生物学 | NA | 质性研究方法 | NA | 访谈数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 47 | 2025-10-05 |
Emerging technologies transforming the future of global biosecurity
2025, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2025.1622123
PMID:40534823
|
综述 | 探讨人工智能与合成生物学融合如何改变全球生物安全格局,分析其机遇与挑战 | 首次系统分析AI与合成生物学在生物安全领域的协同效应及治理需求 | 未涉及具体技术实施细节和定量风险评估 | 批判性审视新兴技术对全球生物安全的影响 | 人工智能应用、合成生物学技术、生物安全治理框架 | 生物安全 | NA | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、公共安全 |
| 48 | 2025-06-19 |
Editorial: Immune responses at barrier tissues: insights from synthetic biology in therapeutics, diagnostics, mechanisms, and beyond
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621688
PMID:40529376
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2025-10-05 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
|
研究论文 | 开发了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具,用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 首次发现聚苏氨酸-丙氨酸重复序列能够形成具有可忽略成核势垒的淀粉样组装体,并可通过调整重复序列长度精确调控蛋白质饱和浓度 | NA | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系,开发控制蛋白质浓度阈值的实验工具 | 蛋白质自组装和相分离 | 合成生物学 | NA | 系统筛选二肽重复序列 | NA | NA | NA | 遗传编码工具 | 细胞 | 基于聚TA重复序列的可调亲和融合标签系统 | 细胞生物学, 发育生物学, 合成生物学 |
| 50 | 2025-10-05 |
Multi-strategy ugt mining, modification and glycosyl donor synthesis facilitate the production of triterpenoid saponins
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1586295
PMID:40519597
|
综述 | 本文综述了三萜皂苷糖基化研究进展,重点探讨了UGT酶的挖掘、改造及糖基供体合成策略 | 整合多组学技术与合成生物学平台进行UGT高通量筛选,结合定向进化与理性设计进行酶功能改造 | NA | 提高三萜皂苷的生产效率和应用潜力 | UDP-糖基转移酶(UGTs)和三萜皂苷 | 合成生物学 | NA | 多组学方法(基因组学、转录组学、代谢组学)、系统发育分析、PSPG基序分析 | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 工程微生物 | 代谢途径优化 | 医药、营养补充剂 |
| 51 | 2025-10-05 |
Microbial electrosynthesis meets synthetic biology: Bioproduction from waste feedstocks
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.05.001
PMID:40519649
|
综述 | 本文探讨合成生物学如何促进微生物电合成技术发展,实现利用废弃物原料进行生物生产 | 将微生物电合成与合成生物学相结合,通过工程化改造微生物提升电子传递效率和代谢通路性能 | NA | 推动可持续化学品生产和脱碳技术发展 | 电活性微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 微生物电合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 电活性微生物 | 电子传递通路, 代谢通路 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 52 | 2025-10-05 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
|
综述 | 本章全面概述了水疱性口炎病毒(VSV)的工程技术,重点关注通过整合促凋亡基因XAF1增强抗肿瘤免疫效果的策略 | 利用合成生物学技术将促凋亡基因XAF1精准整合到VSV基因组中,增强其诱导肿瘤细胞死亡的能力 | NA | 通过病毒工程技术增强VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水疱性口炎病毒(VSV)基因组和肿瘤细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传学 | NA | 促凋亡基因XAF1整合到VSV基因组 | 医学 |
| 53 | 2025-10-05 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
|
研究论文 | 本文介绍了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法及其应用前景 | 开发了WSN毒株的基因工程方法,为研究抗病毒和抗肿瘤免疫提供了新工具 | NA | 研究基因工程流感病毒在抗病毒免疫和肿瘤免疫治疗中的应用 | H1N1流感病毒WSN毒株 | 合成生物学 | 流感 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传系统 | NA | 条件控制遗传元件 | 医学 |
| 54 | 2025-10-05 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
|
研究论文 | 开发了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用合成生物学技术在大肠杆菌中实现安全信息存储和传输 | 将DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态相结合,通过咖啡因浓度和温度调控信息传输,并具备温度敏感的自毁机制 | 多次传输后菌株存活率快速下降,可能影响长期传输稳定性 | 开发安全可控的微生物信息存储和传输系统 | 工程化大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、DNA存储技术 | NA | DNA编码信息 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 咖啡因降解通路、温度敏感自毁机制、条件生长控制系统 | 信息安全、数据存储 |
| 55 | 2025-10-05 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
|
综述 | 本文全面综述了黄酮类化合物的生物合成、调控机制及产量提升策略,并提出了整合合成生物学与人工智能的可持续生产新路径 | 首次将植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和人工智能驱动的代谢工程进行系统性整合,为黄酮类化合物生产提出创新路线图 | NA | 探索黄酮类化合物生物合成的潜力及产量提升策略 | 黄酮类化合物的生物合成途径、调控机制和运输过程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、人工智能 | NA | 代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 黄酮类化合物生物合成途径 | 医药,营养,化妆品 |
| 56 | 2025-10-05 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
|
研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行封装 | 首次通过无细胞表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并实现300 µg/mL的特定产量 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构,传统表达系统无法充分表达该蛋白 | 开发跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达方法 | FGFR3-TACC3融合蛋白(受体酪氨酸激酶疾病变异体) | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE),SMA共聚物封装 | NA | 蛋白功能数据 | NA | 无细胞表达系统 | 无细胞系统 | NA | 医学 |
| 57 | 2025-10-05 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
|
研究论文 | 通过随机矩阵理论分析较大网络的雅可比矩阵,揭示图灵模式在生物系统中出现的概率及其最优网络规模 | 发现图灵模式的出现概率高于预期,且最稳健的图灵网络存在仅包含少量分子物种的最优规模 | NA | 分析复杂基因调控通路中图灵模式的形成机制 | 基因调控网络和图灵模式 | 系统生物学 | NA | 随机矩阵理论 | 图灵激活-抑制模型 | NA | NA | NA | NA | 图灵网络 | 合成生物学 |
| 58 | 2025-10-05 |
Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857
PMID:40496019
|
综述 | 探讨人工智能如何优化噬菌体疗法以应对抗菌素耐药性威胁 | 将人工智能与合成生物学相结合,推动下一代合成噬菌体的遗传优化设计 | NA | 通过人工智能方法改进噬菌体疗法的开发流程 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用机制 | 机器学习 | 抗菌素耐药性感染 | 人工智能方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌 | NA | 医学 |
| 59 | 2025-10-05 |
Application of bifidobacterium in tumor therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1551924
PMID:40469191
|
综述 | 总结双歧杆菌在肿瘤成像和治疗中的最新进展,探讨其作用机制、工程策略和临床应用 | 利用双歧杆菌的厌氧特性实现肿瘤靶向,并通过合成生物学技术改造为具有治疗功能的微机器人 | NA | 探索双歧杆菌在肿瘤治疗中的应用潜力 | 双歧杆菌及其工程化改造 | 合成生物学 | 肿瘤 | 细菌工程、分子成像 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 双歧杆菌 | 药物或基因递送系统、肿瘤微环境调节 | 医学 |
| 60 | 2025-10-05 |
Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587215
PMID:40458805
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综述 | 本文全面综述了植物来源的萜类化合物及其治疗应用 | 系统阐述萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢疾病中的药理活性 | 对特定生物活性物质的作用机制理解尚不完整 | 阐明萜类化合物在代谢疾病中的生物化学特性和药理活性 | 植物来源的萜类化合物 | 天然产物研究 | 代谢疾病 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、化妆品、营养保健品 |