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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了使用Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件的协议 | 提供了克隆MoClo标准部件的详细步骤,包括定义部件类型、设计引物、PCR扩增、Golden Gate克隆和测序 | 对于大型标准部件,需要先克隆子部件作为中间体,增加了复杂性 | 开发高效的DNA组装方法以促进合成生物学领域的研究 | MoClo标准部件(level 0模块) | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、PCR | NA | DNA序列 | NA |
142 | 2025-01-15 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的方法 | 利用声波分配器在nL范围内转移液体,实现了Golden Gate克隆反应的微型化和并行化,减少了塑料废物和试剂使用 | NA | 提高Golden Gate克隆反应的效率和可持续性 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
143 | 2025-01-15 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的纳米孔扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了一种名为DuBA.flow的工作流程,用于从单个菌落到最终易于解读的测序报告的全过程验证 | NA | 验证Golden Gate组装的高阶组合复杂性 | Golden Gate组装的高阶组合 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | NA |
144 | 2025-01-15 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron,一个开源的Python包,用于自动化Golden Gate组装,以减少复杂DNA构建的失败率、资源消耗和培训需求 | AssemblyTron提供了低成本的自动化解决方案,使用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人,扩展了Golden Gate组装的能力,包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变体库组装和模块化克隆索引质粒库组装 | NA | 提高Golden Gate组装的自动化水平,降低复杂DNA构建的失败率和资源消耗 | Golden Gate组装技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装,易错PCR | NA | NA | NA |
145 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法,并提出了辅助寡核苷酸设计的G-GArden工具 | 提出了基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法,并开发了辅助设计的G-GArden工具 | NA | 开发一种快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的小RNA(sRNAs) | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
146 | 2025-01-15 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种无细胞转录和翻译(TXTL)系统中快速生成线性DNA模板的Golden-Gate辅助工作流程 | 通过Golden-Gate组装和PCR扩增,无需克隆步骤,快速生成功能性DNA模板,显著加速合成生物学中的设计-构建-测试-学习周期 | 未提及具体实验样本量或数据集的详细信息 | 开发一种快速生成线性DNA模板的方法,用于无细胞转录和翻译系统中的基因调控元件和电路测试 | 线性DNA模板,包括启动子、核糖体结合位点(RBS)、编码序列和终止子等基本遗传部分 | 合成生物学 | NA | Golden-Gate组装、PCR扩增 | NA | DNA序列 | NA |
147 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中用于转基因表达的遗传盒的组装 | 使用Golden Gate克隆和模块化克隆(MoClo)标准化合成生物学工作流程,简化了遗传元件的组装 | NA | 开发快速高效的克隆策略,用于组装新的转录单元或整个通路 | 单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,模块化克隆(MoClo) | NA | NA | NA |
148 | 2025-01-15 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
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综述 | 本文综述了低渗透性土壤中微生物适应和基因工程方法在增强生物修复效果方面的最新知识 | 整合了微生物适应和基因工程策略,提供了全面的概述,指导当前实践和未来研究 | NA | 提高低渗透性土壤中的生物修复效果 | 低渗透性土壤中的微生物 | 环境科学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
149 | 2025-01-15 |
Electro-bioremediation of wastewater: Transitioning the focus on pure cultures to elucidate the missing mechanistic insights upon electro-assisted biodegradation of exemplary pollutants
2025-Jan, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.123726
PMID:39729711
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研究论文 | 本文探讨了通过纯培养研究电生物修复技术对特定污染物的降解机制,以填补现有研究中的知识空白 | 从混合培养转向纯培养研究,以揭示电辅助生物降解的机制,并提出通过基因组注释、转录动力学等方法优化微生物水平的降解效率 | 目前关于纯培养的电生物降解机制研究较少(少于40项),且主要集中在降解潜力而非机制解析 | 研究电生物修复技术在废水处理中的应用,特别是通过纯培养揭示降解机制 | 含氮、磷、硫化合物、碳氢化合物、金属和偶氮染料等典型水污染物 | 环境工程 | NA | 基因组注释、转录动力学、合成生物学、数学建模 | NA | 分子水平数据(基因、酶、蛋白质、代谢物) | 少于40项研究 |
150 | 2025-01-14 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins的结构多样性、作用机制及其在抗菌耐药性背景下的治疗潜力 | 强调了cathelicidins作为抗菌肽在抗菌耐药性日益严重的背景下作为传统抗生素替代品的潜力 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的结构多样性、作用机制及其在治疗感染、炎症性疾病和癌症中的潜力 | 农场动物中的cathelicidins | 生物医学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA |
151 | 2025-01-13 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 本文综述了工程化酿酒酵母在医学领域的主要应用,包括作为药物和疫苗的细胞工厂、诊断和仿生测定的生物传感器,以及用于智能原位治疗肠道疾病的活体生物治疗产品 | 探讨了酿酒酵母从食品工业工具到医疗应用的转变,特别是在合成生物学推动下的创新应用 | 该领域仍面临挑战,尽管发展迅速,但仍需克服一些主要障碍 | 研究工程化酿酒酵母在医学领域的应用潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | 肠道疾病 | 基因工程 | NA | NA | NA |
152 | 2025-01-12 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和发酵优化,首次在工业酵母Yarrowia lipolytica中实现了藏红花成分crocetin的从头生物合成,并达到了比已知报告更高的产量 | 首次在Yarrowia lipolytica中实现crocetin的从头生物合成,并通过温度转换发酵策略和培养基优化显著提高了crocetin和zeaxanthin的产量 | 研究主要局限于实验室规模的摇瓶发酵,尚未进行大规模工业应用的验证 | 通过代谢工程和合成生物学方法,实现crocetin的可持续生产 | Yarrowia lipolytica酵母 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | NA | NA |
153 | 2025-01-12 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
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综述 | 本文综述了合成生物学方法和生物分离技术在合成气发酵中的应用,探讨了微生物、气体组成影响、分离技术、技术经济分析及商业化努力 | 本文强调了基因工具和代谢工程在扩展产品范围方面的进展,以及加速非模式生物菌株开发的关键技术 | 合成气成分不可预测和微生物发酵污染等问题仍是规模化应用的挑战 | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代品的潜力及其在环境挑战中的解决方案 | 合成气发酵中的微生物及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因工具、代谢工程、生物分离技术 | NA | NA | NA |
154 | 2025-01-12 |
Programming mammalian cell behaviors by physical cues
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.014
PMID:39179464
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综述 | 本文综述了在工程化哺乳动物细胞中物理控制蛋白表达领域的最新进展,探讨了用于感知物理信号并产生相应输出的遗传工具和合成策略 | 探讨了利用物理信号(如光、磁场、温度等)精确调控细胞行为的最新进展和遗传工具 | 讨论了这些工具在精确性和效率方面的局限性 | 研究物理信号如何调控工程化哺乳动物细胞的行为 | 工程化哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
155 | 2025-01-11 |
Intratumoral Injection of Engineered Mycobacterium smegmatis Induces Antitumor Immunity and Inhibits Tumor Growth
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0130
PMID:39780958
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研究论文 | 本文研究了通过瘤内注射工程化耻垢分枝杆菌(rM-FC)来诱导抗肿瘤免疫并抑制肿瘤生长 | 使用合成生物学方法改造耻垢分枝杆菌,使其表达Fms样酪氨酸激酶3配体和共刺激分子CD40darpin的融合蛋白,从而有效招募和激活树突状细胞,增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探索通过工程化微生物增强抗肿瘤免疫反应的方法 | B16F10小鼠黑色素瘤模型 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 合成生物学 | NA | NA | B16F10小鼠模型 |
156 | 2025-01-07 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文系统阐述了基于细菌的肿瘤治疗的分类和机制,以及构建细菌-纳米材料纳米生物杂化体的策略 | 整合合成生物学和纳米医学到工程化细菌中,以增强其疗效和可控性 | 质量控制和基于细菌的肿瘤治疗的监管挑战 | 探讨基于细菌的肿瘤治疗的原理和未来前景 | 肿瘤细胞和肿瘤免疫抑制微环境 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA |
157 | 2025-01-07 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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研究论文 | 本文介绍了斯洛文尼亚国家化学研究所建立的基因与细胞治疗技术卓越中心(CTGCT),旨在推动癌症免疫治疗和神经系统罕见遗传疾病的个性化治疗 | CTGCT是斯洛文尼亚首个此类中心,致力于将基础研究成果转化为临床应用,特别是在基因和细胞治疗领域 | 文章未提及具体的研究限制或挑战 | 推动基因和细胞治疗技术的发展,特别是癌症免疫治疗和神经系统罕见遗传疾病的个性化治疗 | 癌症患者和神经系统罕见遗传疾病患者 | 基因与细胞治疗 | 癌症、神经系统罕见遗传疾病 | 基因编辑、RNA技术、免疫调节工程、病毒和非病毒传递系统 | NA | NA | NA |
158 | 2025-01-04 |
Recent advances in the transformation of maleimides via annulation
2025-Jan-02, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d4ob01632g
PMID:39545834
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综述 | 本文综述了过去五年中马来酰亚胺支架在有机合成中的应用,特别是在通过环化和C-H活化形成环状分子方面的作用 | 本文总结了马来酰亚胺在环化、苯环化、环加成和螺环化等反应中的最新进展,并探讨了光催化和电化学方法在马来酰亚胺化学中的应用 | 尽管马来酰亚胺化学已被广泛研究,但某些反应如基于环加成的环化、光环化和电化学转化仍未被充分探索 | 本文旨在总结和讨论马来酰亚胺基环化策略的底物范围、反应多样性和工业相关性,并探索其在合成生物学和材料科学中的新应用 | 马来酰亚胺及其在有机合成中的应用 | 有机化学 | NA | 光催化、电化学方法 | NA | NA | NA |
159 | 2024-12-28 |
Targeted Activation of Programmed Cell Death Pathways by Optogenetics
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_5
PMID:39724344
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光遗传学技术激活三种主要程序性细胞死亡(凋亡、坏死性凋亡和焦亡)的协议 | 开发了新的合成生物学工具,通过化学或光遗传学方法在选定的细胞中特异性诱导程序性细胞死亡 | 目前难以在不影响邻近细胞的情况下,在细胞群或复杂组织中靶向和诱导选定细胞的死亡 | 研究如何利用光遗传学技术激活程序性细胞死亡 | 细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
160 | 2024-12-25 |
Ergothioneine biosynthesis: The present state and future prospect
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.10.008
PMID:39717282
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综述 | 本文综述了麦角硫因(ERG)的生物合成现状及未来前景 | 本文介绍了利用合成生物学工具在ERG生产中的最新进展,并讨论了提高ERG产量的策略 | 本文主要讨论了ERG生产的挑战,但未提供具体的实验数据或解决方案 | 探讨麦角硫因的生物合成及其在不同领域的应用前景 | 麦角硫因的生物合成及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |