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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的最新进展 | 重点介绍了微生物联合体的协同作用机制及其在提高诊断准确性和治疗效果方面的创新应用 | 存在细菌长期存活与安全性保障、非模式菌株基因编辑技术缺乏、潜在毒性控制及与宿主微生物组相互作用机制不明确等挑战 | 系统总结工程化细菌在疾病诊断与治疗领域的研究现状与发展前景 | 经过合成生物学改造的工程细菌及微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症, 肠道疾病, 代谢疾病 | 合成生物学技术, 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌 | 微生物联合体协同作用系统 | 医学 |
| 142 | 2025-10-05 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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综述 | 本文综述了从极端微生物宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从极端环境样本中挖掘新型糖苷水解酶,无需实验室培养极端微生物 | 极端微生物来源基因在常温宿主中表达困难、酶活性产量低以及规模化应用挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的来源,用于工业应用 | 极端微生物宏基因组中的糖苷水解酶基因 | 宏基因组学 | NA | 高通量测序, 生物信息学分析, 蛋白质工程 | 机器学习 | 环境DNA序列数据 | NA | 合成生物学工具 | 常温宿主 | NA | 工业生物技术 |
| 143 | 2025-10-05 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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综述 | 本文系统总结了植物合成生物学中用于黄酮类化合物生产的分子元件的酶动力学特性 | 首次从不同植物物种来源系统比较天然和工程化分子元件的酶动力学特性,为黄酮类化合物生物合成途径优化提供新见解 | NA | 通过植物合成生物学方法实现黄酮类化合物的可持续生产 | 黄酮类化合物生物合成相关的分子元件和酶 | 合成生物学 | NA | 酶动力学分析、代谢工程 | NA | 酶动力学数据 | NA | NA | 植物、微生物 | 黄酮类化合物生物合成途径重构 | 制药、营养保健品、化妆品 |
| 144 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
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综述 | 本文系统回顾了遗传密码扩展技术的最新进展及其在生物学和医学领域的应用 | 全面总结了遗传密码扩展技术在氨基酸酰基-tRNA合成酶/tRNA系统优化、翻译系统工程和非经典氨基酸生物合成方面的最新突破 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体细节 | 系统梳理遗传密码扩展技术的发展现状、挑战机遇及其在生物学和医学领域的应用前景 | 遗传密码扩展技术及其相关应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 文献资料 | NA | 氨基酸酰基-tRNA合成酶/tRNA系统 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 145 | 2025-10-05 |
Electro-bioremediation of wastewater: Transitioning the focus on pure cultures to elucidate the missing mechanistic insights upon electro-assisted biodegradation of exemplary pollutants
2025-Jan, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.123726
PMID:39729711
|
综述 | 本文聚焦于利用纯培养物研究典型水污染物的电生物降解机制,以弥补混合培养物研究在机理认知上的不足 | 提出将研究重点从混合培养物转向纯培养物以揭示电辅助生物降解的分子机制,为优化废水处理技术提供新途径 | 目前仅有不到40项相关研究,且主要关注电生物降解潜力而非机理研究,存在明显的研究空白 | 通过纯培养物研究揭示典型污染物电生物降解的分子机制,推动废水处理技术的优化发展 | 含氮、磷、硫化合物、碳氢化合物、金属和偶氮染料等典型水污染物 | 环境生物技术 | NA | 组学技术、基因组注释、转录动力学、基因工程、合成生物学、数学建模 | NA | 分子生物学数据、基因表达数据、代谢物数据 | 少于40项相关研究 | 基因工程, 合成生物学 | 纯培养微生物 | NA | 环境 |
| 146 | 2025-10-05 |
Two highly specific growth-coupled biosensor for glycolaldehyde detection across micromolar and millimolar concentrations
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf004
PMID:40292364
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研究论文 | 本研究开发了两种高度特异性的生长偶联生物传感器,用于检测微摩尔至毫摩尔浓度范围的乙醇醛 | 通过创建乙醇醛依赖性营养缺陷型菌株,首次将菌株生长与乙醇醛依赖性生物合成必需维生素吡哆醛-5-磷酸和2-酮戊二酸相偶联 | NA | 开发能够检测乙醇醛的生物传感器并应用于代谢工程 | 工程菌株和乙醇醛生物传感器 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、生物传感器设计 | NA | 生物传感数据 | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 工程菌株 | 生长偶联生物传感器、代谢途径设计 | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 147 | 2025-10-05 |
Modular Access to C2'-Aryl/Alkenyl Nucleosides with Electrochemical Stereoselective Cross-Coupling
2025-Jan-27, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418806
PMID:39620453
|
研究论文 | 开发了一种通过电化学镍催化交叉偶联合成C2'-α-芳基/烯基核苷的新方法 | 首次采用电化学镍催化交叉偶联技术实现C2'-位点的高效立体选择性修饰 | NA | 开发高效、模块化且具有选择性的修饰核苷合成方法 | C2'-芳基/烯基修饰的核苷及寡核苷酸 | 合成化学 | NA | 电化学镍催化交叉偶联 | NA | 化学合成数据、热力学数据、酶解实验数据 | 多种(杂)芳基和烯基碘化物底物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 148 | 2025-10-05 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
|
综述 | 本文综述了噬菌体工程技术在对抗多重耐药细菌方面的应用 | 系统总结了噬菌体工程技术,包括化学修饰和基因工程方法,并探讨了其在病原菌检测和清除中的跨学科应用 | 天然噬菌体存在宿主范围窄、特性未明、指数复制和进化带来的潜在风险 | 开发对抗多重耐药细菌的新型解决方案 | 噬菌体及其工程改造技术 | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学修饰, 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学, 纳米技术 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 149 | 2025-10-05 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
|
研究论文 | 开发了一种包裹工程化益生菌的粘液微球凝胶递送系统,用于炎症性肠病的诊断和治疗 | 设计了具有外部粘膜涂层和内部微球的双重保护结构,显著延长工程菌在肠道的定植时间达24小时 | NA | 开发能够有效递送工程菌至肠道病变部位并实现持续定植的治疗系统 | 炎症性肠病模型 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | 能够检测和治疗肠炎的基因工程菌 | 医学 |
| 150 | 2025-10-05 |
An independent biosynthetic route to frame a xanthanolide-type sesquiterpene lactone in Asteraceae
2025-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17199
PMID:39642193
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研究论文 | 本研究阐明了菊科植物中黄烷内酯类化合物8-表黄烷素的完整生物合成途径 | 揭示了黄烷骨架直接来源于中心前体大牻牛儿烯A酸,通过一种不寻常的细胞色素P450催化的氧化重排反应形成 | NA | 解析黄烷内酯类化合物的生物合成途径 | 黄烷内酯类化合物(特别是8-表黄烷素) | 合成生物学 | NA | 生物合成途径解析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 黄烷内酯生物合成途径 | 医药 |
| 151 | 2025-10-05 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
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综述 | 本文综述了微生物适应性和基因工程方法在低渗透性土壤生物修复中的应用与进展 | 整合了微生物自然适应机制与合成生物学技术,提出了定制微生物群落协同修复低渗透性土壤污染的新策略 | NA | 提高低渗透性土壤中生物修复的有效性 | 低渗透性土壤中的微生物及其基因工程改造 | 环境生物技术 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 定制微生物群落 | 环境 |
| 152 | 2025-10-05 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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研究论文 | 本研究揭示了丹参根中ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮从周皮细胞向外转运的机制 | 首次发现丹参酮可从周皮细胞转运至土壤环境,并鉴定出负责丹参酮IIA和丹参酮I外排的ABC转运蛋白SmABCG1 | NA | 探究植物二萜类化合物的转运机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根中的丹参酮转运过程 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达、基因敲除和过表达 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据、细胞定位数据 | 丹参毛状根培养体系 | CRISPR-Cas9 | 非洲爪蟾卵母细胞, 丹参毛状根 | NA | 代谢工程, 合成生物学 |
| 153 | 2025-10-05 |
Evaluation of the Salmonella type 3 secretion system (T3SS) as part of a protein production platform for space biology applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1567596
PMID:40242353
|
研究论文 | 评估沙门氏菌III型分泌系统作为太空生物学应用中蛋白质生产平台的可行性 | 首次在模拟微重力条件下评估SPI-1 T3SS的蛋白质分泌能力,为太空生物学应用提供新型生物技术平台 | 研究基于地面模拟微重力环境,未在真实太空环境中验证;仅针对沙门氏菌单一系统进行评估 | 开发适用于太空环境的微生物蛋白质生产平台 | 沙门氏菌SPI-1 III型分泌系统 | 合成生物学 | NA | NASA设计的微重力模拟生物反应器系统 | NA | 细胞生长数据、应激反应数据、蛋白质分泌数据 | NA | NA | 沙门氏菌 | 病原岛1(SPI-1)III型分泌系统作为蛋白质分泌平台 | 太空生物学 |
| 154 | 2025-10-05 |
Integrating microbial communities into algal biotechnology: a pathway to enhanced commercialization
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1555579
PMID:40236480
|
综述 | 本文系统阐述了藻类微生物组的分类多样性、生态功能及其在增强藻类生物技术商业化应用中的潜力 | 首次综合探讨微生物组工程通过调控藻类-微生物互作来突破藻类培养经济与环境壁垒的变革潜力 | NA | 探索藻类微生物组在促进微藻培养可持续性和经济可行性方面的生物技术潜力 | 微藻及其关联的微生物群落 | 生物技术 | NA | 合成生物学、生态学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | 通过营养交换、生长调控、病原防御和环境调节增强藻类-微生物互作的工程化设计 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 155 | 2025-10-05 |
Analysis of the intrinsic value of life in the context of synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1536403
PMID:40230464
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研究论文 | 基于Ronald Sandler内在价值理论分析合成生命的伦理价值 | 首次系统构建合成生命内在价值的分析框架,提出从合成微生物到合成人类的价值递增序列 | 理论分析缺乏实证支持,价值判断标准存在主观性 | 探讨合成生命的内在价值以指导其伦理建构与应用 | 合成生命体(微生物、植物、无脊椎动物、脊椎动物、人类) | 合成生物学伦理 | NA | NA | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 156 | 2025-10-05 |
Current Approaches for Genetic Manipulation of Streptomyces spp.-Key Bacteria for Biotechnology and Environment
2025-Jan-02, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14010003
PMID:39846552
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综述 | 本文综述了链霉菌遗传操作的最新方法与挑战,重点介绍了合成生物学策略在开发这类重要生物技术细菌中的应用 | 总结了DNA测序、分析和编辑技术进步带来的新策略,能够克服菌株和构建体特异性工程难题 | 现有方法仍存在菌株和设计依赖性的限制 | 探索、理解和操纵链霉菌作为生物技术关键细菌的能力 | 链霉菌属细菌 | 合成生物学 | NA | DNA测序、基因组挖掘、遗传构建体组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境 |
| 157 | 2025-10-05 |
High throughput construction of species characterized bacterial biobank for functional bacteria screening: demonstration with GABA-producing bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1545877
PMID:40212379
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研究论文 | 开发了一种高通量细菌生物库构建和功能筛选平台,并成功筛选出高产GABA的功能菌株 | 采用双末端条形码策略实现数千个细菌分离株的混合纳米孔测序,开发了模块化荧光生物传感器系统用于代谢物检测 | 仅针对GABA产生能力进行了概念验证筛选,平台在其他代谢物检测中的适用性需要进一步验证 | 建立高效的功能细菌发现平台,推动工业生物技术发展 | 来自中国各地发酵食品和婴儿粪便的细菌分离株 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 全长16S rDNA测序, 桑格测序, 荧光生物传感 | NA | 基因组测序数据, 荧光信号数据 | 15,337个细菌分离株(生物库), 1,740个分离株(GABA筛选) | 双质粒系统 | 细菌 | 模块化生物传感器, 代谢物传感与信号报告解耦系统 | 工业生物技术, 益生菌开发 |
| 158 | 2025-10-05 |
Determination of the genome-scale metabolic network of Bartonella quintana str. Toulouse to optimize growth for its use as chassis for synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1527084
PMID:40213639
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研究论文 | 本研究重建了Bartonella quintana str. Toulouse的基因组尺度代谢网络模型,以优化其作为合成生物学底盘细胞的生长条件 | 首次构建了Bartonella quintana的基因组尺度代谢模型,并通过实验验证确定了2-酮戊二酸等关键代谢物对其生长的必要性 | 模型准确性仍需进一步提高,某些补充条件下观察到意外的生存率下降现象 | 优化Bartonella quintana的生长条件,开发其作为合成生物学底盘细胞的潜力 | Bartonella quintana str. Toulouse菌株及其代谢网络 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢网络重建、通量平衡分析、蛋白质组学分析 | 基因组尺度代谢模型 | 基因组数据、代谢数据、蛋白质组数据 | NA | NA | Bartonella quintana | NA | 工业生物技术 |
| 159 | 2025-10-05 |
An inhibitor-free, versatile, fast, and cheap precipitation-based DNA purification method
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317658
PMID:40198694
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研究论文 | 开发了一种无需抑制剂、快速廉价的新型DNA纯化方法 | 通过使用离液盐和醇/聚乙二醇实现蛋白质去除和DNA沉淀的单步操作,突破了传统方法需要多步骤的限制 | 未明确说明方法的适用范围和可能存在的其他限制因素 | 解决商业硅胶柱纯化方法中存在的酶反应抑制问题 | DNA纯化技术 | 合成生物学 | NA | DNA沉淀纯化技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | E. coli | NA | 分子生物学, 合成生物学 |
| 160 | 2025-10-05 |
Potential applications of engineered bacteria in disease diagnosis and treatment
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.57
PMID:40207274
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综述 | 探讨工程菌在疾病诊断与治疗中的潜在应用及其作用机制 | 系统阐述利用合成生物学技术改造益生菌作为药物递送系统、生物传感器和黏膜疫苗的创新方法 | 未提及具体临床转化障碍和监管挑战 | 评估工程菌在疾病管理中的应用潜力 | 经过基因编辑的工程菌 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 代谢疾病, 癌症, 神经退行性疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 益生菌 | 药物递送系统, 生物传感器, 黏膜疫苗 | 医学 |