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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
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研究论文 | 开发了一种用于创建SBOL表示构建计划的软件工具,以模拟IIS型介导的组装反应并存储相关元数据 | 首次实现了使用SBOL标准化表示Golden Gate组装元数据的软件工具 | NA | 为合成生物学领域提供标准化的DNA组装元数据表示方法 | DNA组装构建计划 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA | Golden Gate Assembly, SBOL | NA | DNA组装构建计划 | 工业生物技术 |
| 162 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了MoClo系统标准部件的Golden Gate克隆方案 | 提供了标准部件克隆的详细步骤方案,包括大片段标准部件的中间构建策略 | NA | 开发合成生物学中DNA组装的高效方法 | MoClo系统的标准部件(level 0模块) | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,PCR,DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 标准部件(启动子、编码序列、终止子等遗传元件) | 工业生物技术 |
| 163 | 2025-10-06 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文提供了使用声波分配器在1μL总体积中执行和并行化Golden Gate克隆反应的逐步方案 | 首次将声波分配技术应用于Golden Gate DNA组装反应,实现反应体积从10-25μL缩小至1μL的微型化 | NA | 开发自动化和小型化的DNA组装方法 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, 声波分配器 | NA | 模块化分层DNA片段组装 | 工业生物技术 |
| 164 | 2025-10-06 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文提出了一种使用纳米孔测序平台进行高度多重双条形码扩增子测序的详细方案,用于验证Golden Gate组装结果 | 开发了名为DuBA.flow的完整工作流程,实现从单菌落到最终易解读测序报告的一站式解决方案 | NA | 为Golden Gate组装提供高效可靠的序列验证方法 | Golden Gate组装产物 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 双条形码扩增子测序, PCR | NA | DNA测序数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元组装, 多基因构建体 | 工业生物技术 |
| 165 | 2025-10-06 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 介绍开源Python软件包AssemblyTron如何通过低成本开源机器人实现Golden Gate克隆的自动化 | 开发了AssemblyTron的升级功能,包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变库组装和索引质粒库组装 | NA | 为合成生物学提供经济高效的Golden Gate组装自动化解决方案 | DNA构建体和组合文库 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、易错PCR | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, OpenTrons OT-2 | NA | 模块化克隆系统、组合突变库、索引质粒库 | 工业生物技术 |
| 166 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 介绍基于Golden Gate组装技术快速构建细菌合成小RNA表达质粒的方法和工具 | 开发了用于大肠杆菌的质粒系列和G-GArden工具,支持无疤痕组装策略的寡核苷酸设计 | NA | 建立合成小RNA表达质粒的快速高效构建方法 | 细菌小RNA和合成生物学构建模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, G-GArden | Escherichia coli | 合成小RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 167 | 2025-10-06 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 开发了一种基于Golden Gate组装的无克隆工作流程,用于快速生产线性DNA模板以用于无细胞转录翻译系统 | 通过Golden Gate组装和PCR扩增实现无细胞快速原型设计,无需耗时的大肠杆菌转化和克隆步骤 | NA | 加速合成生物学中设计-构建-测试-学习周期的新功能开发 | 线性DNA模板和遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、PCR、无细胞转录翻译(TXTL) | NA | 遗传元件功能数据 | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 转录单元组装,包括启动子、核糖体结合位点(RBS)、编码序列和终止子 | 工业生物技术 |
| 168 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了利用Golden Gate组装和模块化克隆技术在莱茵衣藻中构建转基因表达遗传盒的方法 | 将模块化克隆技术应用于单细胞模型藻类莱茵衣藻的转基因表达 | NA | 开发快速高效的克隆策略用于合成生物学中转基因单元或通路的组装 | 莱茵衣藻中的转基因表达遗传盒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, Modular Cloning | Chlamydomonas reinhardtii | 转基因表达遗传盒 | 工业生物技术 |
| 169 | 2025-10-06 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins抗菌肽的结构多样性、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的治疗潜力 | 聚焦农场动物特异性cathelicidins,系统阐述其结构多样性、多重作用机制及作为抗生素替代品的临床前景 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的免疫机制及其对抗菌素耐药性的治疗应用 | 农场动物中的cathelicidins抗菌肽家族 | NA | 感染性疾病 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | 农场动物 | NA | 医药 |
| 170 | 2025-10-06 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 本文综述了工程化酿酒酵母在医学领域的三大应用方向:作为药物和疫苗的细胞工厂、诊断用生物传感器以及肠道疾病活体治疗产品 | 系统梳理了酿酒酵母从食品工业到医学应用的身份转变,聚焦其在合成生物学推动下的创新医疗应用场景 | 该领域仍面临技术挑战和商业化障碍(文中未具体说明样本规模或实验数据局限) | 探讨工程化酿酒酵母在医学应用中的发展现状与前景 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因工程改造体 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 基因工程技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 生物传感器、活体治疗系统 | 医学 |
| 171 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了藏红花成分藏花酸的生物合成与分泌 | 首次在工业酵母解脂耶氏酵母中实现藏花酸的从头生物合成,并通过两步温度转换发酵策略使产量提高2.3倍 | 研究仅限于摇瓶发酵规模,尚未进行大规模发酵验证 | 开发藏花酸的可持续生物生产方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | 代谢物分析数据、发酵参数 | 工程酵母菌株 | CRISPR-Cas9, 吉布森组装 | 解脂耶氏酵母 | 藏花酸生物合成途径、β-胡萝卜素代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 172 | 2025-10-06 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
|
综述 | 本文深入探讨了合成气发酵技术,涵盖微生物利用、气体成分影响、分离技术及商业化进展 | 系统综述了遗传工具和代谢工程在扩展合成气发酵产品范围方面的最新进展,特别关注非模式生物的菌株开发加速技术 | NA | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代方案的技术发展现状和挑战 | 合成气发酵微生物、气体成分、分离技术和商业化应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传工具开发 | NA | NA | NA | NA | 乙酰原核生物及其他非模式微生物 | Wood-Ljungdahl代谢途径 | 能源, 环境 |
| 173 | 2025-10-06 |
Programming mammalian cell behaviors by physical cues
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.014
PMID:39179464
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综述 | 本文综述了通过物理信号调控哺乳动物细胞行为的合成生物学研究进展 | 探讨了利用光、磁场、温度、机械力、超声波和电信号等物理线索精确控制细胞行为的转基因开关设计 | 现有工具存在精度和效率方面的限制 | 开发响应物理信号的合成生物学工具以调控哺乳动物细胞行为 | 工程化哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因开关设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 物理信号响应开关 | 医学 |
| 174 | 2025-10-06 |
Intratumoral Injection of Engineered Mycobacterium smegmatis Induces Antitumor Immunity and Inhibits Tumor Growth
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0130
PMID:39780958
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研究论文 | 通过合成生物学改造耻垢分枝杆菌,使其表达Flt3L和CD40激动剂融合蛋白,瘤内注射可激活树突状细胞并诱导抗肿瘤免疫反应 | 首次利用合成生物学技术改造非致病性分枝杆菌作为活体免疫激动剂递送平台,实现瘤内原位激活树突状细胞 | 研究仅限于小鼠黑色素瘤模型,尚未在更多肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发新型肿瘤免疫治疗方法,通过激活树突状细胞增强抗肿瘤免疫应答 | B16F10小鼠黑色素瘤模型和工程化耻垢分枝杆菌 | 合成生物学与免疫治疗 | 黑色素瘤 | 合成生物学改造、蛋白质工程 | NA | 动物实验数据、免疫细胞分析数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 耻垢分枝杆菌 | Flt3L与CD40激动剂融合蛋白表达系统 | 医学 |
| 175 | 2025-10-06 |
Ion-Selective Mobility Differential Amplifier: Enhancing Pressure-Induced Voltage Response in Hydrogels
2025-Jan-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415000
PMID:39545315
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研究论文 | 提出使用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器来增强离子型聚乙烯醇水凝胶压力诱导电压响应的策略 | 首次采用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器,将压电离子系数提升30倍至1490 nV/Pa | NA | 增强压电离子器件的刺激响应能力 | 离子型聚乙烯醇水凝胶 | 材料科学 | NA | 压电离子技术 | NA | 电信号数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 软体机器人, 合成生物学 |
| 176 | 2025-10-06 |
Herbal Multiomics Provide Insights into Gene Discovery and Bioproduction of Triterpenoids by Engineered Microbes
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08372
PMID:39666531
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综述 | 本文综述了利用多组学技术和合成生物学方法解析三萜类化合物生物合成途径及微生物异源生产的最新进展 | 整合多组学技术与合成生物学策略,系统阐述三萜类化合物生物合成途径解析和微生物工程化生产的创新方法 | NA | 阐明三萜类化合物的生物合成途径并提高其在底盘细胞中的产量 | 三萜类化合物的生物合成途径和微生物异源生产系统 | 合成生物学 | NA | 多组学技术、代谢工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 微生物 | 三萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术, 农业 |
| 177 | 2025-10-06 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
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研究论文 | 本研究通过合成生物学策略改造粘质沙雷氏菌,实现了高效生产(-)-α-红没药醇 | 首次在非模式微生物中引入古菌MVA途径和分子伴侣协同表达,创下(-)-α-红没药醇最高产量纪录 | 未明确说明菌株对(-)-α-红没药醇耐受性的具体机制 | 开发可持续高效的(-)-α-红没药醇微生物生产方法 | 粘质沙雷氏菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | 5 L生物反应器规模验证 | CRISPR-Cas9, 基因敲除 | Serratia marcescens | 古菌MVA途径,(-)-α-红没药醇生物合成途径,分子伴侣DnaK/J共表达系统 | 医药,化妆品 |
| 178 | 2025-10-06 |
Construction and Optimization of Engineered Saccharomyces cerevisiae for De Novo Synthesis of Phloretin and Its Derivatives
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09893
PMID:39723863
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在酿酒酵母中构建并优化了根皮素及其衍生物的生物合成途径 | 首次在同一宿主中系统比较三种根皮素合成途径,并通过途径优化实现了根皮素及其多种衍生物的高效合成,其中4-甲基根皮素和橙皮素二氢查尔酮为首次合成 | NA | 解决二氢查尔酮类化合物日益增长的需求,并为更复杂衍生物的生物合成奠定基础 | 根皮素及其衍生物(根皮苷、三叶苷、诺索芬、4-甲基根皮素、橙皮素二氢查尔酮) | 合成生物学 | NA | 理性设计、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 三种根皮素生物合成途径(最终确定对香豆酰-CoA途径最有效),异源途径与内源代谢的协调 | 食品,制药 |
| 179 | 2025-10-06 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-Jan-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母的新型技术,用于从工业废水中高效去除铅污染物 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案,开发低成本工程培养基 | NA | 解决工程酵母在重金属去除应用中面临的高成本和工艺放大挑战 | 工业含铅废水中的铅离子(Pb²⁺) | 环境生物技术 | NA | 合成生物学,响应面优化法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | 基因敲除 | 酵母 | 通过敲除O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶基因构建产硫化氢工程酵母 | 环境 |
| 180 | 2025-01-07 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文系统阐述了基于细菌的肿瘤治疗的分类和机制,以及构建细菌-纳米材料纳米生物杂化体的策略 | 整合合成生物学和纳米医学到工程化细菌中,以增强其疗效和可控性 | 质量控制和基于细菌的肿瘤治疗的监管挑战 | 探讨基于细菌的肿瘤治疗的原理和未来前景 | 肿瘤细胞和肿瘤免疫抑制微环境 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |