合成生物学相关文章
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当前共找到 1521 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
|
研究论文 | 提出STRAIGHT-IN Dual平台，实现人类诱导多能干细胞中双DNA载荷的等位基因特异性单拷贝整合，效率达100%且一周内完成 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA载荷，效率高达100%，且支持近无痕整合和组件循环利用 | 未提及长期稳定性和脱靶整合风险 | 开发高效精准的人类诱导多能干细胞基因工程平台 | 人类诱导多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 位点特异性整合、基因回路设计 | NA | NA | NA | STRAIGHT-IN平台、synZiFTR系统 | 人类诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统、四环素诱导系统 | 医学、再生医学 |
| 2 | 2026-05-07 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 通过嵌合转录因子构建检测口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物Neu5Ac的全细胞生物传感器 | 通过嵌合体技术创建新型嵌合转录因子Sphnx，实现Neu5Ac的检测，为唾液生物标志物检测提供概念验证平台 | 仅作为概念验证，尚未应用于临床筛查，检测灵敏度和特异性有待进一步验证 | 开发基于合成生物学的全细胞生物传感器，用于早期非侵入性诊断口腔鳞状细胞癌 | 唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 嵌合体技术 | NA | NA | NA | 嵌合体技术 | 工程细菌 | 全细胞生物传感器，嵌合转录因子 | 医学 |
| 3 | 2026-05-06 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
|
研究论文 | 利用CsrA蛋白与uxuB mRNA之间的浓度依赖性调控机制，设计了一种转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白对uxuB mRNA的浓度依赖性双重调控（激活和抑制）特性，设计了一种基于RNA-蛋白质相互作用的转录后带通滤波器，减少了合成电路组件数量 | 未来需要对天然调控RNA-蛋白质系统进行进一步表征，以实现更复杂的RNP基电路 | 开发基于CsrA-uxuB相互作用的转录后带通滤波器，实现多信号控制 | uxuB mRNA的5'UTR和100个核苷酸编码序列与碳储存调控蛋白CsrA的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 带通滤波器，基于CsrA浓度调控的ON/OFF状态转换电路 | 合成生物学 |
| 4 | 2026-05-06 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 提供转酮醇酶活性、催化机制和结构分析的实验方案，涵盖稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测及快速动力学研究 | 整合多种生物物理和结构生物学方法，形成用于转酮醇酶基础与应用研究的综合工具集 | 未涉及具体疾病模型或临床验证，未讨论不同来源转酮醇酶间的差异 | 建立转酮醇酶功能与结构分析的标准实验方案，推动酶学、合成生物学及药物开发 | 转酮醇酶 | 结构生物学 | 癌症、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、光谱学、快速动力学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物催化 |
| 5 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
|
综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性，恢复RT-qPCR测量的准确性，首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证，未涉及体内复杂环境或多种核酶类型，潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性，以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶（自切割RNA） | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 7 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
|
研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-04-29 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
|
研究论文 | 开发了一种全可见光谱抗原稳定荧光纳米抗体平台，实现多色标记和功能成像 | 通过将二十多种荧光蛋白和生物传感器工程化到八个纳米抗体中，建立了通用型抗原稳定荧光纳米抗体设计，实现仅在与同源抗原结合时才发出明亮荧光 | NA | 开发一种合成生物学驱动的抗原稳定荧光纳米抗体工具包，用于高特异性和低背景的细胞内蛋白动态研究和功能成像 | 荧光蛋白、生物传感器、纳米抗体、小鼠脑、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光纳米抗体工程化、荧光成像 | NA | 图像 | 二十多种荧光蛋白和生物传感器、八种纳米抗体 | NA | 小鼠、斑马鱼 | 抗原稳定荧光纳米抗体电路 | 医学、生物学 |
| 9 | 2026-04-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
|
综述 | 综述了利用植物病毒载体在本氏烟中瞬时表达系统生产生物制药的关键作用与最新进展 | 阐述了病毒载体修饰、水培法和受控环境农业等创新技术如何提升可扩展性和法规合规性，并通过糖基化工程拓宽可生产的生物制药范围 | 未明确讨论瞬时表达系统在工业生产中的长期稳定性或大规模生产成本控制的具体挑战 | 强调瞬时表达系统在生物制药生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用潜力，并推动植物分子农业成为现代生物技术的关键组成部分 | 本氏烟中的瞬时表达系统及植物病毒载体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达 | NA | NA | NA | 病毒载体 | 本氏烟 | 植物病毒载体驱动的瞬时表达系统 | 医药, 生物技术 |
| 10 | 2026-04-28 |
Advances in the microbial biosynthesis of ʟ-tryptophan and its derivatives
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100046
PMID:42038707
|
综述 | 综述L-色氨酸及其衍生物的微生物合成进展 | 系统总结了提高微生物L-色氨酸产量的优化策略及工程菌株在合成高价值衍生物方面的应用，并探讨了合成生物学快速进化为衍生物生产带来的变革性机遇 | 仍存在若干关键瓶颈，但未具体阐述 | 优化微生物合成途径以高效生产L-色氨酸及其衍生物 | L-色氨酸及其衍生物的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 微生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 生物合成途径 | 医药, 食品 |
| 11 | 2026-04-28 |
Four enzymes from button bush enable de novo biosynthesis of spirooxindole alkaloids in yeast
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100049
PMID:42038706
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研究论文 | 本文从风箱树中发现了四种酶，并在酵母中实现了螺环氧化吲哚生物碱的从头生物合成 | 首次发现并表征了四条酶的级联反应途径，能够在酵母中完全从头合成异育亨宾型氧化吲哚生物碱，阐明了氧化吲哚形成的酶学逻辑 | 未明确提及局限性 | 揭示异育亨宾型氧化吲哚生物碱的生物合成途径并实现其在酵母中的异源重建 | 风箱树中的四种酶（CoAJS、CoHYC3O、CoHYC3R、CoOIS）及相应生物碱产物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、生化验证、酶动力学分析、酵母工程改造 | NA | NA | NA | 酵母菌株工程 | 酿酒酵母 | 四酶级联途径，将鹰爪豆碱苷元转化为异育亨宾型氧化吲哚生物碱（米曲菲林、异米曲菲林、uncarine F） | 医药、工业生物技术 |
| 12 | 2026-04-28 |
DeepCodon: A deep learning codon-optimization model to enhance protein expression
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100042
PMID:42038710
|
研究论文 | 提出一种名为DeepCodon的深度学习密码子优化模型，用于增强蛋白质表达 | 首次在密码子优化中保留功能上重要的稀有密码子簇，采用条件概率策略保护保守稀有密码子 | 未详细说明模型的泛化能力或在不同宿主物种中的表现 | 开发一种多目标密码子优化工具，平衡宿主密码子偏好、GC含量和mRNA二级结构等因素以提高异源基因表达 | Enterobacteriaceae序列、P450和G3PDH基因 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN | 序列数据 | 150万个天然肠杆菌科序列，7种低产量P450和13种AI设计的G3PDH | NA | E. coli | NA | 合成生物学、基因工程 |
| 13 | 2026-04-28 |
Protein design drives synthetic biology research of plant natural products
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100048
PMID:42038708
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综述 | 本文综述了蛋白质设计技术在植物天然产物合成生物学研究中的前沿进展，探讨如何通过人工智能与合成生物学深度融合解决植物天然产物微生物生产中的关键瓶颈 | 系统阐述了蛋白质设计技术在解决植物天然产物生物合成中未知酶步骤和植物源酶功能表现不佳等难题方面的突破性进展，并强调了人工智能与合成生物学深度融合的潜力 | 未深入讨论蛋白质设计技术的具体实验验证细节及其在工业规模化生产中的实际应用挑战 | 总结蛋白质设计技术在植物天然产物生物合成中的应用，探索解决微生物生产瓶颈的方法 | 植物天然产物及其相关的植物源酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 植物天然产物的生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品 |
| 14 | 2026-04-28 |
The convergence of AI and synthetic biology: the looming deluge
2025-Jul-01, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00021-1
PMID:42032179
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评论 | 探讨人工智能与合成生物学融合带来的机遇与风险，并提出监管策略 | 首次综合性地分析AI驱动合成生物学在医学、农业和可持续发展领域的创新潜力，同时系统性地评估双重用途风险、治理缺口和伦理困境 | 未提供具体实验数据或案例研究，分析较为宏观，缺乏实证支持 | 探讨AI与合成生物学融合如何加速生物工程流程，并识别相关风险与治理需求 | AI驱动合成生物学的应用场景及治理框架 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 可持续性 |
| 15 | 2026-04-28 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 利用合成生物学将Vibrio natriegens改造成能修复含复杂有机污染物的盐废水及土壤的菌株 | 通过插入tfoX基因增强DNA摄取和整合能力，并利用酵母组装五个降解基因簇（总长43 kb）转移至Vmax菌株，实现从单环到多环有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）的广谱修复 | NA | 解决有机污染物复杂性及盐胁迫耐受受限的问题，开发海洋微生物在生物修复中的应用 | 复杂有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）及盐废水/土壤样本 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 来自氯碱厂和炼油厂的工业废水样本 | 酵母组装 | Vibrio natriegens | 代谢途径（五个降解基因簇） | 环境 |
| 16 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 17 | 2026-04-28 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本文从云南金不换中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的苄基异喹啉生物碱7-O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5，并通过对底物结合微环境的操作改变其催化区域选择性 | 首次发现通过操纵底物结合微环境中的三个残基（R143/L156/H163和F154/F167/G174），可将SyOMT4转化为高度特异的BIA 6OMT（SyOMT4-WFE），并将SyOMT5工程化为BIA N-甲基转移酶（SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD），拓展了BIA OMT的功能谱 | 未评估工程化酶在合成生物学和代谢工程中的实际应用效果 | 研究云南金不换中苄基异喹啉生物碱O-甲基转移酶的功能并通过蛋白工程改变其区域选择性 | 来自云南金不换（Stephania yunnanensis）转录组数据的两种O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | NA | NA | 转录组测序、定点突变、结构建模 | NA | 转录组数据 | 从云南金不换转录组数据中鉴定两种酶 | 定点突变 | NA | NA | 医学、合成生物学、代谢工程 |
| 18 | 2026-04-27 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
|
综述 | 总结了通过转录和翻译调控因子提高CHO细胞中重组蛋白表达的策略 | 利用合成生物学和基因组学进展设计特定转录因子和翻译因子，优化重组蛋白表达 | NA | 综述通过转录因子和翻译因子提高CHO细胞重组蛋白表达的方法 | CHO细胞中重组蛋白表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,基因组学 | NA | NA | NA | NA | CHO细胞 | NA | 医学,工业生物技术 |
| 19 | 2026-04-26 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
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综述 | 本文探讨了细菌表面展示技术用于药物递送的发展现状与未来方向 | 提出利用AlphaFold等计算工具理性设计外膜锚定蛋白，将合成生物学与免疫工程结合推进工程菌临床转化 | 面临监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 评估细菌表面展示技术在药物递送中的应用潜力并规划发展路线 | 细菌表面展示系统（包括革兰氏阴性菌和阳性菌的锚定机制） | 机器学习 | 癌症 | 细菌表面展示 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌 | 生物传感器, 偶联系统 | 医学, 农业 |
| 20 | 2026-04-25 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文综述了利用生物策略实现木质素增值以及将木质素转化为生物制造原料的最新进展 | 综合了木质素降解酶、代谢工程、合成生物学和人工智能驱动技术等多学科交叉方法，提出利用数字系统和人工智能技术促进木质素商业化的创新观点 | 主要基于现有文献分析，可能缺乏大规模实际应用验证数据，且未深入探讨技术经济可行性 | 探索木质素增值的有效生物转化途径，推动将其作为可持续原料用于生物基制造 | 木质素及其衍生物的降解与转化工艺、相关酶系统、代谢途径及工程菌株 | NA | NA | 木质素降解酶、代谢工程、遗传工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环代谢路径重定向 | 环境、能源、工业生物技术 |