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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-07 |
Bacillus velezensis LoaP promotes antitermination by antagonizing NusA
2025-12-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01429-25
PMID:41147751
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研究论文 | 本研究揭示了Bacillus velezensis中LoaP蛋白通过特异性拮抗NusA因子促进转录抗终止的机制,证明了LoaP类NusG旁系同源物的抗终止复合物比预期更简单,且与RfaH范式显著不同。 | 首次阐明了LoaP类NusG旁系同源物的抗终止机制,发现其通过特异性拮抗NusA而非招募其他因子来实现抗终止,这与已知的RfaH机制形成鲜明对比。 | 研究仅限于Bacillus velezensis中的difficidin操纵子,未对其他菌种或操纵子进行验证,且未探讨LoaP在其他条件下的功能。 | 阐明LoaP蛋白在细菌转录抗终止中的分子机制,并比较其与已知NusG旁系同源物(如RfaH)的差异。 | Bacillus velezensis中的RNA聚合酶、转录因子(包括LoaP和NusA)以及difficidin操纵子的5'前导区。 | 微生物学 | NA | 体外转录重构 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | Bacillus velezensis | 抗终止复合物(difficidin操纵子) | 合成生物学 |
| 2 | 2026-08-07 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-02-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞系统和脚趾开关技术的生物传感器,结合核酸序列扩增技术,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒。 | 将脚趾开关技术与NASBA扩增技术相结合,显著提高了检测灵敏度,达到2.9 aM的检测限,解决了脚趾开关在低丰度目标检测中的固有局限性。 | 摘要中未提及明显的局限性,可能需要进一步评估其实际样本性能或稳定性。 | 开发一种快速、灵敏、低成本的寨卡病毒检测方法,应对全球健康需求。 | 寨卡病毒及其核酸序列。 | 合成生物学 | 寨卡病毒感染 | NASBA | NA | DNA/RNA序列 | NA | 脚趾开关技术 | 无细胞提取物 | 脚趾开关传感器 | 医学诊断 |
| 3 | 2026-08-06 |
Kappa(κ)Chip: a modular microfluidic device for analyte screening using parallelized assays and a multiple shear rate approach
2025-10-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00349k
PMID:40878128
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研究论文 | 本文介绍了一种新型微流控芯片κChip,通过并行化设计和多剪切率方法,实现对多种蛋白质粘附性能的高通量筛选。 | κChip芯片采用并行化设计,可从单一输入流同时进行24次粘附测试,大幅减少实验时间和试剂消耗,并首次结合微加工、微流控、材料科学、合成生物学、多物理场模拟和机器学习,实现对生物粘合剂的快速筛选。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高通量微流控筛选平台,用于评估蛋白质(如疏水蛋白)对底物的粘附性能,并促进新型生物粘合剂的发现。 | 真菌疏水蛋白经工程化展示在细胞表面,用于评估粘附特性。 | 微流控、合成生物学 | NA | 微流控、细胞粘附测试 | 机器学习模型(具体类型未指定) | 粘附性能数据(图像或定量数据) | 24个并行测试(具体样本数量未说明) | NA | 真菌细胞(用于展示疏水蛋白) | 微流控芯片设计(包括微通道和剪切率控制) | 材料科学、生物医学、海洋防污 |
| 4 | 2026-08-04 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-09-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 本文介绍了一种基于确定性侧向位移(DLD)的微流控平台,用于通过大小分离叶绿体,实现高效、自动化的叶绿体分离和分类。 | 该平台集成了四个具有不同临界直径的平行DLD阵列,实现带通滤波和同时分离不同大小的叶绿体,提高了可重复性,并避免了传统蔗糖密度梯度方法缺乏精确大小分离的缺点。 | 分离效率在50-85%之间,纯度在17-66%之间,表明仍有提升空间,可能受限于样本复杂性和微流控设计。 | 开发一种基于微流控的叶绿体分离方法,用于植物研究、生物技术和合成生物学应用。 | 叶绿体,大小范围3至8微米。 | 微流控技术 | NA | 微流控DLD技术 | NA | 实验数据 | 叶绿体样本,大小范围3-8微米,未提供具体数量。 | NA | 植物细胞 | NA | 植物研究, 生物技术, 合成生物学 |
| 5 | 2026-08-03 |
Insight into the eminent biotechnological applications of xylanolytic enzymes for sustainable bioprocessing
2025-Aug, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04415-1
PMID:40657403
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综述 | 本文全面综述了木聚糖的结构、木聚糖酶在降解中的作用及其在造纸、食品、纺织和制药等行业的工业应用,并讨论了通过纳米生物技术和CRISPR/CAS等先进工具提高木聚糖酶热稳定性的方法。 | 整合了纳米生物技术、CRISPR/CAS技术、宏基因组生物勘探、蛋白质工程和合成生物学等前沿方法,用于木聚糖酶的热稳定性提升和应用拓展,并强调了监管框架和标准化对可持续性的重要性。 | 未详细讨论木聚糖酶大规模工业应用的经济可行性和潜在环境风险。 | 全面阐述木聚糖酶在生物技术和可持续生物加工中的多功能作用,并指出未来研究创新方向。 | 木聚糖及其降解酶(木聚糖酶) | 生物技术 | NA | CRISPR/CAS技术、纳米生物技术、宏基因组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢通路(木聚糖降解通路) | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-08-01 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
|
观点文章 | 本文探讨了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的应用,强调通过基因组工程、动态基因回路和高维生物传感器实现细胞和组织的精确控制,并讨论了将组学数据与人工智能结合以推动系统级建模的潜力。 | 提出将合成生物学与人工智能引导的回路设计结合,以实现高分辨率的细胞和组织尺度模型,并强调跨系统整合和共享优先事项。 | 面临的主要挑战包括递送、转基因稳定性和生理相关模型中的稳健时空控制。 | 理解和工程化心脏、肺、血液及睡眠系统,以推动多细胞生物学和系统级建模。 | 心脏、肺、血液和睡眠系统相关的细胞和组织。 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因回路、高维生物传感器、组学技术 | 系统级模型、多细胞模型 | 组学数据、生物传感器数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 可调转录调控器、合成组织器、反馈回路 | 医学、药物开发、基因疗法 |
| 7 | 2026-07-30 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
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研究论文 | 本文研究了5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等修饰碱基对RNA三维折叠景观及结构-功能关系的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变关键连接处的堆积能量而非碱基配对来驱动RNA构象转变,并影响其动力学成熟 | 未涉及其他常见修饰碱基(如假尿苷、N6-甲基腺苷)的影响,且仅在两种特定RNA结构中进行验证 | 阐明碱基修饰对RNA折叠和功能的影响机制,为合成生物学和治疗方法中功能性RNA的开发提供设计原则 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学, 结构生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 图像 | 两种RNA结构 | RNA折纸 | NA | RNA折纸纳米结构, 核酶 | 医学, 合成生物学 |
| 8 | 2026-07-30 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 提出一种利用激光诱导高速微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现按需、可靠且可重复地生成细胞大小脂质体 | 未提及具体局限性 | 开发一种按需生产脂质体的新方法,推动合成生物学和膜科学的发展 | 细胞大小的脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物化学研究,合成生物学 |
| 9 | 2026-07-30 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
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research paper | 该研究开发了一种正交的α病毒RNA复制系统,能够在哺乳动物细胞中实现RNA基装置的定向进化和达尔文适应 | 首次在哺乳动物细胞中建立正交RNA复制系统用于定向进化,无需宿主基因组干扰,可产生大规模连续多样化RNA文库,并支持达尔文适应性进化 | 目前仅针对RNA基装置进行进化,未验证对DNA基或蛋白质基装置的适用性;系统复杂性可能影响其普适性和易用性 | 开发哺乳动物细胞中高效、可控的RNA定向进化平台 | RNA基装置(如荧光蛋白和转录因子) | synthetic biology | NA | RNA replication, directed evolution | NA | NA | NA | NA | mammalian cells | orthogonal alphaviral RNA replication system | synthetic biology, cell engineering |
| 10 | 2026-07-29 |
Engineered probiotics: a new era in treating inflammatory bowel disease
2025-11-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07271-y
PMID:41188868
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综述 | 总结了工程益生菌在炎症性肠病诊断和治疗中的最新研究进展,探讨其通过基因编辑工具构建以调节肠道微环境的机制 | 首次全面阐述利用CRISPR-Cas9等基因编辑工具构建的工程益生菌在IBD治疗中的多种机制,包括靶向递送抗炎因子、清除活性氧、恢复屏障完整性和调节微生物稳态,并结合智能响应系统实现实时监测和动态释放治疗分子 | 文中提及主要为临床前研究,缺乏大规模临床试验验证,可能存在的长期安全性和免疫原性问题未详细讨论 | 总结工程益生菌在炎症性肠病诊断和治疗中应用的进展,为微生物组驱动的IBD治疗干预提供见解 | 工程益生菌及其在炎症性肠病治疗中的应用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 多种微生物(具体种类未指定) | 智能响应型工程益生菌回路,包括靶向递送抗炎因子、清除活性氧、恢复屏障功能和调节微生物稳态 | 医药 |
| 11 | 2026-07-29 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
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综述 | 全面概述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的应用 | 系统整合了植物转座因子的功能机制与前沿生物技术应用,为作物育种和植物合成生物学提供新视角 | 未提及具体实验验证或定量比较不同转座子方法的优缺点 | 综述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的发现、机制与技术应用 | 植物转座因子 | 基因组学 | NA | 功能基因组学、表观遗传调控 | NA | 基因组序列 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-07-29 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-05-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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研究论文 | 本研究介绍Ponceau S作为蛋白质液-液相分离的选择性调节剂,并在牛血清白蛋白和溶菌酶中监测相分离过程 | 首次发现Ponceau S可作为蛋白质液-液相分离的靶向调节剂,同时利用其荧光增强特性实现相分离的可视化监测 | 仅针对两种模型蛋白进行研究,缺乏在复杂细胞环境中的验证 | 探索小分子Ponceau S对蛋白质液-液相分离的精确调控能力 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 机器学习 | NA | 荧光光谱分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物分子工程、药物递送、合成生物学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
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综述 | 探讨合成生物学和生物材料在改善CAR-T细胞免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料作为精准递送载体、人工抗原呈递细胞和高通量筛选平台,结合合成生物学电路设计增强CAR-T细胞在肿瘤微环境中的功能 | NA | 通过合成生物学和生物材料技术克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的局限性 | CAR-T细胞免疫疗法和肿瘤微环境 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成生物学电路设计用于增强CAR-T细胞功能 | 医学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-05-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子(特别是非天然氨基酸)的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降,且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性,为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 15 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-05-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-07-24 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-06-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 利用合成生物学与化学结合的方法,设计并研究具有抗菌活性的生物基羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物库 | 首次将真菌宿主异源生产的单体前体与化学修饰及开环聚合相结合,合成出具有抗菌和生物膜破坏能力且可降解的聚合物材料 | 具体聚合物对微生物的长期稳定性及体内应用效果未充分探讨 | 开发具有抗菌活性的可降解生物基聚合物,对抗抗生素耐药性 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-co-丙交酯聚合物 | 合成生物学与材料化学 | 细菌感染及相关耐药性疾病 | 异源表达、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据(聚合度、抗菌活性测试结果) | 不同聚合度(M/I = 5-30)的聚合物样品 | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 真菌宿主 | 羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物的合成代谢通路 | 医药 |
| 17 | 2026-07-24 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发一种不改变内源基因编码序列即可实现基因感测与响应的方法 | 通过将生物传感器整合到内源基因的终止子区域而不修改其编码序列,利用sgRNA激活下游电路,避免了传统方法可能对内源基因调控的不可预测影响 | 该方法可能依赖于特定宿主细胞类型(如CHO-K1细胞),且传感器响应的调谐范围可能存在限制 | 开发一种平台技术,用于不改变内源基因编码序列的条件下实现基因感测与响应控制 | CHO-K1细胞中的内源基因及其终止子区域 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基因传感器整合 | 数学模型用于预测传感器响应 | 基因表达数据 | NA(主要基于工程化的CHO-K1细胞系) | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 细胞应激传感器与致动器电路,通过下游电路条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞疗法 |
| 18 | 2026-07-24 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-02-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 探讨合成生物学与人工智能在作物改良中的应用,综述了工程原理、遗传电路设计方法及未来发展方向 | 系统性地将人工智能驱动的合成生物学路径应用于植物工程,并提出开发SMART作物的概念 | 尚未有系统性综述整合AI与合成生物学的作物改良途径 | 探索作物合成生物学的工程原理及其在作物改良中的应用,并展望AI增强的合成生物技术 | 作物(包括光合效率、植株结构、代谢途径、环境适应性、养分吸收等性状) | 机器学习和数字农业 | NA | 基因编辑、合成核酸技术、合成蛋白技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 作物(植物) | 遗传电路(包括基因编辑、合成核酸和蛋白质回路、代谢通路设计) | 农业 |
| 19 | 2026-07-23 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-07-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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研究论文 | 探讨基于细菌的免疫疗法作为癌症治疗的经济替代方案,以降低全球医疗成本 | 结合合成生物学与人工智能技术,开发低成本(每剂<10美元)、无需冷链的细菌疗法,实现相比细胞疗法超过30000倍的成本节约 | 未具体说明细菌疗法的临床有效性和安全性数据,以及大规模生产的可行性挑战 | 解决癌症治疗中昂贵免疫疗法的可及性问题,提出细菌免疫疗法作为经济可行替代方案 | 癌症患者群体及全球癌症护理系统 | 机器学习 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌免疫治疗回路 | 医学,工业生物技术 |
| 20 | 2026-07-23 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-04-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 从七叶一枝花中鉴定4'-O-鼠李糖基转移酶并实现甾体三糖苷的生物合成 | 首次鉴定七叶一枝花中负责4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶,并通过半理性设计获得酶活性增强的突变体;利用合成生物学在烟草中重建了甾体皂苷二辛苷的生物合成途径 | 在烟草中重建的合成系统产量相对较低(3.12±0.11 μg/g干重),且UGT73DY2对底物具有严格特异性 | 阐明七叶一枝花甾体皂苷中4'-O-鼠李糖基化的生物合成机制,并开发异源生产方法 | 七叶一枝花中的甾体皂苷及其糖基转移酶UGT73DY2 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, 分子动力学模拟, 亚细胞定位分析, 共表达 | NA | 序列数据 | NA | 半理性设计, 合成生物学 | 本氏烟草 | 二辛苷生物合成途径 | 医药 |