合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1524 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-19 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-11-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
|
研究论文 | 通过将葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶共封装于二氧化硅纳米胶囊内，构建自放大质子生成的类线粒体ATP纳米发生器，实现人工细胞自主能量供应和代谢耦合 | 首次通过定量共封装葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶于二氧化硅纳米胶囊中，建立自增强酶级联反应放大质子生成，并结合ATP酶整合脂质体双层涂层，实现高效ATP合成 | 研究主要基于人工细胞模型（巨型单层囊泡），在更复杂细胞环境中长期稳定性和集成效率有待验证 | 构建能够自主供应能量并耦合代谢的人工线粒体，推动自下而上合成生物学发展 | 人工细胞模型中的线粒体模拟ATP纳米发生器 | 合成生物学 | NA | 酶共封装、纳米胶囊合成、ATP酶整合脂质体涂层 | NA | NA | NA | NA | NA | 自增强酶级联反应（葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶）驱动的质子梯度，耦合ATP合酶实现ATP合成 | 合成生物学 |
| 2 | 2026-06-19 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-10-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
|
研究论文 | 提出一种基于Pickering乳液的封装方法，将无膜凝聚层转化为多室混合微反应器，用于高效酶催化 | 首次利用Pickering乳液封装法将无膜凝聚层转化为具有层级分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室混合微反应器，实现空间有序调控生物和非生物催化反应，显著提升催化活性、热稳定性和长期耐久性 | 未提及限制，但可能涉及方法的普适性和规模化应用挑战 | 设计构建具有组织复杂性、功能多样性和实际应用性的人工原细胞，用于体外合成生物学和生物工程 | 无膜凝聚层（凝聚层室）和混合微反应器 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装、脂肪酶催化动力学拆分 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 多室混合微反应器（分级结构、分子拥挤环境、选择性渗透膜） | 医学、工业生物技术 |
| 3 | 2026-06-19 |
From Nano to Quantum: Ethics Through a Lens of Continuity
2025-10-13, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-025-00557-w
PMID:41082020
|
评论 | 文章通过连续性视角审视从纳米科技到量子技术的伦理讨论，强调避免重复造轮子 | 将纳米伦理的经验系统应用于量子技术伦理的早期讨论，提出连续性分析框架而非强调新兴技术的独特性 | NA | 探讨如何借鉴过往新兴科学技术的伦理研究经验，指导量子技术伦理讨论 | 纳米科技伦理讨论与量子技术伦理讨论 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-06-19 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-10-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
|
综述 | 本文综述了拓扑工程引导RNA（TE-gRNA）在实现CRISPR/Cas系统可编程调控中的应用 | 通过设计聚合物、环状和树枝状等拓扑结构，TE-gRNA实现了CRISPR活性的精确空间控制、可逆性和可编程激活，优于传统线性gRNA | TE-gRNA在合成可行性、稳定性及降低脱靶效应方面仍面临挑战，其在大规模应用中表现有待进一步验证 | 探讨拓扑工程引导RNA如何实现对CRISPR/Cas活动的精准时序和条件控制 | 拓扑工程引导RNA（TE-gRNA）及其在CRISPR/Cas系统中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 功能基因组学, 治疗干预 |
| 5 | 2026-06-19 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-09-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
|
research paper | 提出一种可编程DNA纳米笼策略，用于构建稳定且自适应的合成细胞器网络 | 通过DNA纳米笼模块化设计，实现机械增强的仿生纳米笼，并集成逻辑门控DNA元件作为动态接触位点，实现环境响应性的空间组织与信号重配置 | 当前研究以细胞外囊泡为模型，未来需验证其在其他合成细胞器系统中的普适性与体内应用稳定性 | 构建具有自适应反馈机制的稳定合成细胞器网络 | 细胞外囊泡与四面体DNA框架组装的DNA纳米笼 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、回文杂交链式反应、逻辑门控DNA元件 | NA | NA | NA | DNA纳米笼、回文杂交链式反应 | NA | 逻辑门控DNA元件作为动态接触位点，响应环境信号重配置空间组织与信号传递 | 合成生物学、生物医学、智能材料设计 |
| 6 | 2026-06-19 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-09-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
|
研究论文 | 提出一种基于DNA酶的单链DNA辅助双链DNA切口产生的PCR-free定点突变方法 | 首次利用DNA酶在无PCR条件下对重复序列进行定点突变，扩展了DNA酶的底物范围至双链超螺旋质粒，且仅使用未修饰的DNA寡核苷酸，成本低、制备简单 | 该研究对DNA酶在重复序列上的效率与通用性可能仍需更多验证 | 开发一种无PCR的定点突变方法，用于处理包含高重复序列的DNA模板 | 含有PCR不相容重复序列的质粒DNA | 合成生物学 | NA | DNA酶介导的定点突变 | NA | DNA序列 | 使用单个含有重复序列的质粒作为样本 | NA | NA | 单链DNA辅助的DNA酶切口系统（DANDA） | 生物化学与生物技术应用 |
| 7 | 2026-06-18 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
|
研究论文 | 通过合成操纵子调控大肠杆菌表面组实现选择性水氧化 | 首次在微生物基因组层面设计合成操纵子，通过冰核蛋白锚定真菌胆红素氧化酶于细胞表面，实现接近零过电位的选择性水氧化，并完全抑制氧还原反应 | NA | 开发可再生的微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面组工程改造 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、蛋白质表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 合成操纵子、冰核蛋白锚定、IPTG诱导表达系统 | 能源、环境、生物催化 |
| 8 | 2026-06-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
|
研究论文 | 利用合成生物学策略，通过基因电路在小细胞外囊泡内自组装siRNA，靶向LRRK2基因，减轻帕金森病模型中的神经退行性变 | 开发了一种基于合成生物学的基因电路，通过静脉注射后能在肝脏中自组装并递送LRRK2 siRNA进入黑质，实现非侵入性靶向治疗 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证；长期安全性和有效性尚需评估 | 开发一种通过小细胞外囊泡递送siRNA以治疗帕金森病的方法 | 帕金森病小鼠模型（LRRK2R1441G小鼠） | 合成生物学 | 帕金森病 | 基因电路设计、小细胞外囊泡、siRNA技术 | NA | NA | 多个小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 小鼠 | 包含神经元靶向RVG标签和LRRK2 siRNA的基因电路 | 医学 |
| 9 | 2026-06-18 |
Engineering biology and chemical approaches to the construction of vitamin B12 analogues and antivitamins B12 as probes and therapeutic agents
2025, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2025.07.003
PMID:40846392
|
综述 | 综述利用工程生物学和化学方法构建维生素B12类似物及抗维生素B12作为探针和治疗剂的研究进展 | 通过合成生物学在E. coli中异源表达有氧B12生物合成途径，高产生物合成中间体和无钴B12前体，并用于生成含铑、镍、锌等过渡金属的金属取代类似物及有机抗代谢物和荧光标记衍生物，用于探针B12依赖酶、追踪维生素运输和选择性破坏微生物或疾病相关代谢 | 文中未明确论述局限性，可能包括合成类似物的体内稳定性、特异性及临床转化的挑战 | 探索合成维生素B12类似物和抗维生素B12在生物研究和治疗中的应用 | 维生素B12类似物、抗维生素B12、金属取代类似物、荧光标记衍生物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | E. coli | 维生素B12生物合成途径 | 医学, 农业, 环境 |
| 10 | 2026-06-17 |
Discovery of a Heme-Dependent Enzyme Catalyzing Nitrogen-Nitrogen Bond Formation in Kinamycin Biosynthesis
2025-12-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202513778
PMID:41137433
|
研究论文 | 发现了在kinamycin生物合成中催化氮-氮键形成的一种新型血红素依赖酶Alp1J | 首次发现了一种属于新家族的血红素依赖酶Alp1J催化氮-氮键形成，并揭示了其与铁氧还蛋白Alp1I形成稳定复合物保护辅因子及催化活性的机制 | 未明确提及局限性 | 揭示kinamycin生物合成中氮-氮键形成的酶学机制 | Alp1J酶及其伴侣铁氧还蛋白Alp1I | NA | NA | 诱变、生物化学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 11 | 2026-06-17 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2025-Sep, PRX life
DOI:10.1103/99bt-4ss4
PMID:42281556
|
研究论文 | 提出一种通过底物依赖性酶聚集提高代谢效率的自我组织策略 | 首次提出可通过底物可利用性调控酶的“粘性”以实现接近最优大小和间距的酶簇自我组织，从而显著提高代谢通量并降低毒性代谢物 | 主要基于数学模型研究，缺乏体内实验验证；实际细胞环境中酶粘性的变构调控机制需进一步探索 | 探索一种超越现有自然和工程酶簇范式的自我组织策略，以提高代谢效率 | 简单代谢通路中的酶簇 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 数学建模, 热力学约束分析 | NA | 数学模拟数据 | NA | NA | NA | 底物依赖性相分离酶簇 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 12 | 2026-06-17 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
|
研究论文 | 通过评估大肠杆菌中近50万个独特gRNA的活性，揭示了Cas9靶向的广泛功能性及gRNA设计规则 | 首次大规模实验评估了所有独特Cas9原型间隔序列，发现93%以上的gRNA具有功能性，并识别出非功能性gRNA的自我相互作用特征，提出了简单设计规则进行排除 | 研究仅针对大肠杆菌K12 MG1655基因组，未验证其他细菌或真核宿主中的通用性 | 解决关于Cas9 gRNA特异性的矛盾报道，为微生物合成生物学提供功能性和非功能性gRNA的全面评估及实验流程 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, NGS | NA | DNA序列 | 近500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | Cas9靶向系统 | 工业生物技术，医药 |
| 13 | 2026-06-15 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-12, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
|
综述 | 综合评价多组学整合的原则、方法及应用，强调其在系统生物学中的范式转变 | 利用人工智能与单细胞组学等前沿技术解决多组学数据的高维度、异质性和特定上下文扰动等挑战 | 数据异质性、可解释性不足等当前限制 | 系统生物学中多组学整合的原则、方法及应用 | 癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的多组学数据 | 机器学习 | 癌症 | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学） | 机器学习模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 14 | 2026-06-15 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
|
综述 | 提出理解和预测土壤微生物群落中基因转移的路线图 | 针对土壤复杂异质性环境下合成DNA工程菌的基因转移预测难题，提出构建土壤标准、利用新兴技术测量宿主范围等系统策略，并强调生物防控措施的责任性社区参与 | 未提供具体实验数据或验证结果，主要基于现有知识缺口提出理论框架 | 建立环境特异性模型以预测工程微生物在土壤中的基因转移风险，推动安全合成生物学应用 | 土壤微生物群落中的工程微生物及天然微生物 | 合成生物学 | NA | 合成DNA技术 | 群落尺度环境特异性模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 土壤微生物 | NA | 环境, 农业, 能源, 食品 |
| 15 | 2026-06-06 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
|
研究论文 | 提出一种混合Transformer-CNN模型DNABERT2-CAMP用于大肠杆菌启动子识别 | 首次将预训练DNABERT-2 Transformer与CNN-Attention-Mean Pooling模块结合，同时捕获长程基因组依赖和局部基序特征，显著提升启动子识别准确性和可解释性 | 未提及模型在其他细菌物种或长序列上的泛化能力，以及处理多类型启动子（如σ38、σ54）的表现 | 开发一种高精度、可解释的混合深度学习框架，用于大肠杆菌σ70启动子识别 | 大肠杆菌K-12菌株的σ70启动子序列 | 机器学习 | NA | DNABERT-2, CNN, Attention机制 | 混合Transformer-CNN模型（DNABERT-2 + CAMP模块） | 81-bp核苷酸序列 | 8720条经实验验证的阳性和阴性81-bp序列 | NA | E. coli | NA | 合成生物学, 基因组注释 |
| 16 | 2026-06-04 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
|
综述 | 探讨瘤内微生物群通过炎症和免疫机制重塑肺癌微环境，并展望基于合成生物学的工程菌和纳米抗生素在免疫治疗中的应用 | 首次系统阐述瘤内微生物群在肺癌微环境中通过分泌代谢物、激活信号通路、招募免疫抑制细胞及上调免疫检查点分子表达来主动诱导慢性炎症并促进肿瘤进展，并评估了基于合成生物学的工程菌和靶向纳米抗生素重塑免疫微环境的潜力 | 肺组织低生物量导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响，且常忽视真菌和病毒等非细菌成分在肿瘤生态系统中的协同作用 | 阐明瘤内微生物群影响肺癌细胞和肿瘤微环境的机制，并探索其临床转化潜力 | 瘤内微生物群及其在肺癌微环境中的作用 | 微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序, 多组学技术 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-06-01 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
|
研究论文 | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具，用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列，发现聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）能够形成具有可忽略成核屏障的淀粉样组装体，在任意选择的浓度阈值下实现蛋白质自组装，并通过调整TA重复长度精细调节饱和浓度 | 论文未明确讨论该工具在体内应用时的潜在毒性或脱靶效应，也未涉及在复杂生物环境中的长期稳定性 | 开发一种可调亲和融合标签，用于控制蛋白质自组装和研究蛋白质浓度与细胞功能的关系 | 聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）二肽重复序列 | 合成生物学 | NA | 遗传编码工具、二肽重复序列筛选 | NA | 蛋白质组装数据 | NA | NA | 细胞（未具体说明） | 可调淀粉样蛋白融合标签 | 细胞生物学、发育生物学、合成生物学 |
| 18 | 2026-05-30 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
|
研究论文 | 探讨封装生物系统所需克服的一般约束条件，包括现代生化系统及通用自催化系统的分析 | 首次系统性地量化封装生物系统的物理约束，包括核糖体速率与细胞大小阈值，并建立通用自催化系统的生长速率边界模型 | 基于地球现代生化系统作为测试案例，未验证该约束是否适用于所有可能的生物系统 | 研究封装生物系统时面临的一般性限制条件及其对生命起源、天体生物学和合成生物学的启示 | 现代生化系统（核糖体与细胞）及通用自催化系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 天体生物学, 生命起源研究 |
| 19 | 2026-05-30 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 通过从LUCA代谢映射到原始反应规则，探讨生命起源中从地球化学向生物化学转变的关键过程，并建立综合建模框架进行假设验证 | 提出利用生成模型将LUCA代谢反应规则映射到原始生命反应，结合热力学、行星条件等因子构建综合建模框架，并首次探讨酶混杂性和代谢可进化性在生命起源中的驱动作用 | 尚未提供实验验证结果，仅停留在理论框架和假设层面，缺乏具体案例的定量分析 | 阐明从非生物化学到早期生命代谢的进化联系，为合成生物学应用提供理论基础 | LUCA（最后普遍共同祖先）的代谢网络与原始生命反应规则 | 系统化学，计算生物学 | NA | 生成模型，代谢反应规则映射，计算建模 | 生成模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 20 | 2026-05-30 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
|
综述 | 综述虚拟人工生命的起源、定义、检测及工程实现现状 | 从工程视角综合多种生命定义，提出抽象需求、通用设计与具体实现机制的三层框架，并以此审视现有进展 | 尚未有完全满足所有定义要求的虚拟人工生命实例展示 | 探讨虚拟人工生命的定义、检测与起源机制，促进该领域发展 | 虚拟人工生命（计算机内存在） | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |