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当前共找到 1531 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-05 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
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研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一个低成本、3D打印、开源的第二代喷墨式DNA微阵列合成器平台，用于实验室环境的寡核苷酸合成 | 将设备体积缩小至原版OpenIDS的三分之一，通过定制PCB集成所有控制电子元件，采用蠕动泵基批量溶液输送系统提高操作稳定性和制造可及性，大部分机械部件设计为可3D打印，显著增强了作为开源硬件平台的可重复性和全球可及性 | 仅在CPG基底上成功合成了15-mer poly(dT)序列，验证的序列长度和类型有限，尚未展示更复杂或更长寡核苷酸序列的合成能力 | 开发一种低成本、开源、可重复构建的台式寡核苷酸合成平台，降低实验室自动化的入门门槛 | DNA寡核苷酸合成设备及15-mer poly(dT)序列 | 合成生物学 | NA | 喷墨式DNA合成、亚磷酰胺化学、urea-PAGE、HPLC | NA | NA | 15-mer poly(dT)序列合成样本 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-11-02 |
In silico evolutionary origin, structural properties, molecular docking, following expression analysis of the nitrate transporters in maize to explore their roles in abiotic stress tolerance
2025-Nov, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01669-0
PMID:41245216
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研究论文 | 该文章通过生物信息学分析、分子对接、基因表达分析和亚细胞定位实验，研究了玉米硝酸盐转运蛋白的结构特性及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 结合计算机模拟的结构分析、分子对接和蛋白质相互作用网络预测，并辅以qRT-PCR、RNA-Seq和GFP标记的亚细胞定位实验验证，全面揭示了玉米硝酸盐转运蛋白家族的特征和功能，并提出了基于NRT的基因电路设计思路 | 研究主要依赖生物信息学预测和初步实验验证，缺乏转基因功能验证和田间实验数据；分子对接的结合亲和力解释有限；未进行完整的基因电路构建和测试 | 探究玉米硝酸盐转运蛋白的结构特性、进化关系、表达模式及其在非生物胁迫耐受性中的作用，为通过合成生物学手段改良玉米氮素利用效率提供理论基础 | 玉米硝酸盐转运蛋白（ZmNRTs）家族成员及其在热、盐、干旱等非生物胁迫下的表达 | 植物生物学, 生物信息学, 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、分子对接、qRT-PCR、RNA-Seq、亚细胞定位（GFP标记） | NA | 序列数据、结构数据、表达数据、图像数据 | 83个转运蛋白用于蛋白互作分析；未明确说明qRT-PCR和RNA-Seq的样本数量 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 3 | 2026-11-02 |
Frontiers on the application of cellulase in aquaculture: future prospects and challenges
2025-Nov, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04577-y
PMID:41140567
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综述 | 本文综述了纤维素酶在水产养殖中的应用前沿，涵盖分类、功能多样性、产酶菌、极端温度适应性酶、基因工程与合成生物学优化策略及AI/ML应用前景 | 将冷活性和耐热纤维素酶整合应用于极端气候区域水产养殖，并桥接传统酶应用与人工智能、机器学习等前沿创新，为纤维素酶剂量优化、性能建模和成本降低提供预测框架 | 在大规模、成本效益高且符合法规的纤维素酶生产方面仍面临挑战 | 探讨纤维素酶在水产养殖中的应用前景与挑战，包括提高饲料利用率和可持续性 | 纤维素酶及其在水产养殖中的应用，包括鱼类肠道微生物中的产纤维素酶细菌 | 水产养殖, 生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR | NA | NA | 水产养殖, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-11-02 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了用于聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生物合成的非天然微生物宿主及代谢工程改造策略 | 系统总结了所有用于PHB生物合成的非天然微生物宿主，并讨论了辅因子工程、代谢途径重构、细胞形态工程和CRISPR/Cas9基因组编辑等代谢工程方法 | 非天然微生物宿主仍需进一步的基因工程改造才能更适合大规模PHB生产 | 总结非天然微生物生产PHB的研究进展及代谢工程策略 | 非天然微生物宿主（如大肠杆菌） | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 代谢工程, 合成生物学, CRISPR/Cas9 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌及其他非天然微生物宿主 | PHB生物合成途径, 代谢途径重构, 辅因子工程 | 医学, 生物医学, 材料 |
| 5 | 2026-11-02 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 综述了利用合成生物学和基因工程改造曲霉以提高有机酸产量的策略与进展 | 系统总结了代谢途径重构、副产物消除、调控途径改造和菌丝形态工程等策略，并重点讨论了基于CRISPR的生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用与挑战 | 文中未明确提及具体局限性，作为综述缺乏原始实验数据验证 | 为提升曲霉菌株在工业有机酸生产中的效率提供理论指导和创新方法 | 曲霉（Aspergillus） | 合成生物学 | NA | 基因工程、CRISPR、生物传感器 | NA | 文本 | NA | CRISPR | 曲霉 | 生物传感器 | 工业生物技术、食品、医药 |
| 6 | 2026-11-01 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
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研究论文 | 该论文开发了一套用于革兰氏阴性菌的标准化群体感应工具，包含发送和接收模块，基于SEVA质粒构建，并提供了数学模型和速率参数 | 利用SEVA质粒骨架构建标准化QS系统，使复制起点或抗生素标记等质粒特征易于替换，提高了工具的通用性，并提供了配套的数学模型和速率参数 | 仅在模式菌株中进行了表征，未在非模式细菌中验证；工具的实际应用范围有待进一步测试 | 开发标准化群体感应工具以促进细胞间通讯，从而支持合成菌群工程化实现分布式功能 | 革兰氏阴性菌的群体感应系统（发送和接收模块） | 合成生物学 | NA | SEVA质粒构建、群体感应系统表征 | 数学模型 | 实验数据、数学模型参数 | NA | SEVA质粒系统 | 革兰氏阴性菌（具体菌株未明确） | 群体感应通讯系统（发送模块和接收模块） | 医学、工业生物技术 |
| 7 | 2026-11-01 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2025-02-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本文通过突变Fab-7元件中的转录因子结合位点，研究了果蝇中跨代表观遗传的建立和维持机制 | 证明了染色质接触单独足以建立跨代表观遗传，揭示了半合子性通过染色质接触在反式远距离位点建立表观遗传记忆的机制 | 研究仅基于果蝇模型，未验证其他物种的普适性 | 探究果蝇中Fab-7调控元件介导的跨代表观遗传的分子机制 | 果蝇Fab-7调控元件及其同源位点 | 表观遗传学 | NA | 位点特异性突变、染色质接触分析、合成生物学系统 | NA | 分子生物学数据、表型数据 | NA | NA | 果蝇 | 体内合成生物学系统用于诱导染色质接触 | 基础研究 |
| 8 | 2026-10-31 |
Expanding the biocatalytic and oxidative landscape of the old yellow enzyme family
2025-11, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70363
PMID:41158077
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研究论文 | 该研究结合生物信息学与合成生物学技术，系统挖掘并表征老黄酶（OYE）家族的天然多样性，发现新的氧化化学功能与优良生物催化剂 | 利用蛋白质相似性网络对超过115,000个OYE家族成员进行系统分析，表征了118个多样化的新型酶，发现了在环境条件下广泛存在的反向氧化化学，并鉴定了14个具有增强催化活性或改变立体特异性的潜在生物催化剂，其中两个酶被结晶以揭示新OYE亚类中不寻常的环构象 | 仅对OYE家族约0.1%的已鉴定成员进行了实验表征，大多数成员的序列-功能关系仍未充分探索 | 系统组织和筛选OYE家族的天然多样性，扩展其生物催化和氧化功能景观，并鉴定用于不对称氢化和氧化的优良生物催化剂 | 老黄酶（OYE）家族中的烯烃还原酶 | 合成生物学, 生物催化 | NA | 生物信息学, 蛋白质相似性网络, 合成生物学, 酶学表征, X射线晶体学 | NA | 蛋白质序列, 结构, 生化数据 | 超过115,000个OYE家族成员（序列分析），118个酶（表征），14个潜在生物催化剂，2个结晶结构 | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-10-31 |
Current AI technologies in cancer diagnostics and treatment
2025-06-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02369-9
PMID:40457408
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综述 | 系统综述了当前人工智能技术在癌症诊断和治疗中的应用现状 | 系统全面地整合了AI在癌症影像诊断、基因组学、液体活检、治疗决策、药物发现、放疗、机器人手术及患者管理等多方面的应用，并提出了联邦学习、合成生物学和量子增强AI等未来方向 | 讨论了数据隐私、可解释性和监管问题等挑战，但作为综述未提供原始实验数据验证 | 综述AI技术在癌症诊断和治疗中的当前应用状况及未来发展方向 | 癌症诊断与治疗相关的AI技术及应用 | 医学人工智能 | 癌症 | 深度学习、影像组学、基因组学分析、液体活检 | 深度学习 | 图像、文本、基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-10-31 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
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研究论文 | 本文介绍了一种基于PCR的合成生物学平台DRIMS，能够实现DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | DRIMS平台利用不依赖recA的重组途径，通过单步扩增、DpnI消化和转化即可完成多种DNA修饰，并可通过连续PCR扩增实现无需模板的DNA合成，相比Gibson和体内组装等方法具有显著优势 | 文中未明确说明该平台的局限性 | 开发一种简单、快速、成本效益高的DNA修饰和合成平台，以加速合成生物学和疗法开发 | DNA片段、DNA结合序列、嵌合抗原受体组件、人工microRNA、点突变、DNA序列 | 合成生物学 | 癌症 | PCR、DpnI消化、重组 | NA | DNA序列 | 进行了4种删除、64种替换、4种嵌合抗原受体组件替换、51种插入、5种点突变和8个DNA序列的合成 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 11 | 2026-10-30 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
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综述 | 本章全面概述了水疱性口炎病毒（VSV）的工程化改造技术，重点介绍了将促凋亡基因XAF1整合到VSV基因组中的方法及详细实验流程 | 系统总结了利用反向遗传学和合成生物学技术对VSV进行精确工程化改造的策略，特别是整合促凋亡基因XAF1以增强抗肿瘤免疫和治疗效果 | 作为综述章节，未提供原始实验数据，可能缺乏对具体实验结果的定量分析和验证 | 提高VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水疱性口炎病毒（VSV）及其工程化改造体 | 肿瘤免疫治疗、病毒治疗 | 癌症（肿瘤） | 反向遗传学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | 反向遗传学、合成生物学 | 哺乳动物细胞（用于病毒包装和扩增） | 整合促凋亡基因XAF1的VSV基因组 | 医学 |
| 12 | 2026-10-30 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
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研究方法论文 | 本文描述了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法，并探讨了其在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | 利用反向遗传学和合成生物学技术对流感病毒进行条件性控制改造，提高疫苗安全性并诱导强免疫反应，拓展了工程化流感病毒在肿瘤免疫治疗中的应用 | 文中未明确提及具体限制 | 开发基于反向遗传系统的流感病毒基因工程改造方法，并探索其在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | 甲型流感病毒H1N1毒株WSN | 合成生物学, 病毒学, 免疫学 | 流感, 肿瘤 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传系统 | NA | 条件控制基因元件 | 医学, 疫苗开发, 肿瘤免疫治疗 |
| 13 | 2026-10-28 |
Advances and obstacles of T cell-based immunotherapy in gynecological malignancies
2025-07-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02411-w
PMID:40713697
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综述 | 本文综述了T细胞免疫疗法在妇科恶性肿瘤中的进展与障碍，重点分析了CAR-T细胞疗法的作用机制、临床进展及应对免疫抑制肿瘤微环境的策略 | 系统整合了CAR-T技术在妇科肿瘤中的临床前与转化临床数据，提出了结合个性化新抗原疫苗和微环境重编程剂的协同策略框架 | 文章为综述性质，未提供原始实验数据；治疗持久性和生产一致性等局限仍有待解决 | 综合分析CAR-T细胞疗法在妇科肿瘤学中的进展，建立推进过继性T细胞疗法的战略框架 | 妇科恶性肿瘤，包括卵巢癌、宫颈癌和子宫内膜癌 | 肿瘤免疫学、数字病理学 | 卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌 | CAR-T细胞疗法、多组学指导的抗原筛选、合成生物学方法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-10-27 |
[Engineering Rhodotorula toruloides based on exogenous targeting signal peptides]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250498
PMID:41457588
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研究论文 | 本研究在解脂红酵母中研究三种靶向信号肽（内质网、线粒体、过氧化物酶体）的定位性能，并用于靶蛋白的亚细胞区室化 | 首次系统验证三种外源靶向信号肽在解脂红酵母中的亚细胞定位功能，并成功将FAP靶向定位实现蓝光下烷烃生产 | 信号肽在解脂红酵母中的研究仍然有限，仅验证了三种定位序列，烷烃产量未量化报道 | 研究外源靶向信号肽在解脂红酵母中的细胞器定位性能，拓展其在细胞区室化工程中的应用 | 解脂红酵母（Rhodotorula toruloides） | 合成生物学 | NA | 信号肽融合、荧光定位、发酵 | NA | 荧光图像 | NA | NA | 解脂红酵母 | 信号肽介导的亚细胞区室化定位通路 | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-10-25 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文综述了来源于低等生物的多种酶，这些酶可影响与衰老相关的过程，并提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的潜在工具 | 提出异源合成生物学策略，即利用来自其他物种的酶来逆转年龄相关的代谢变化，而非仅仅靶向自身基因 | 本文为综述，未提供原始实验数据，所提出的策略尚未在人体中验证 | 探讨利用非哺乳动物酶延缓衰老和年龄相关疾病的潜力 | 与衰老相关的代谢参数及来源于低等生物的酶 | 合成生物学 | 衰老及年龄相关疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2026-10-24 |
A minimal genetic circuit for cellular anticipation
2025-10, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0528
PMID:41119990
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研究论文 | 该文设计并评估了能够预测环境趋势的最小基因回路，通过确定性定和随机分析验证其稳健的预期响应 | 借鉴金融趋势分析中的移动平均收敛-发散原则，首次提出并通过合成生物学实现可实验测试的预期基因回路 | 研究主要为理论建模与计算机模拟，缺乏实际实验验证 | 探索合成生物学中实现细胞预期能力的最小基因回路设计 | 最小基因回路（合成基因网络） | 合成生物学 | NA | 确定性分析和随机分析 | 基因回路模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基于移动平均收敛-发散原则的预期基因回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-10-24 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-06-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
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研究论文 | 该论文对酿酒酵母中749个双向启动子进行了全基因组筛选和表征，揭示了其强度不对称性，并利用AI模型指导的突变分析识别了关键调控基序，展示了其在代谢通量调控中的应用 | 首次大规模表征了含有单一共享核小体缺失区域的双向启动子，发现了强度不对称性可用于精细调控代谢通量；结合DREAM-CNN模型进行计算机突变预测，识别了保守的激活因子结合热点 | 研究仅在酿酒酵母中开展，未在其他宿主中验证；AI预测的基序功能验证限于少数启动子；代谢产物产量仅测试了萜类化合物 | 鉴定和表征酿酒酵母双向启动子，理解其调控机制，并探索其在合成生物学中用于基因共表达和代谢通量调控的潜力 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）中的双向启动子 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、荧光报告基因分析、计算机突变、AI预测模型 | DREAM-CNN | 基因组序列、转录组数据、荧光数据 | 749个双向启动子候选 | NA | 酿酒酵母 | 双向启动子驱动的基因共表达系统 | 医药、工业生物技术 |
| 18 | 2026-10-24 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-05-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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研究论文 | 该文描述了RNA-DNA三链体通过诱导双链DNA结构应变来调控大肠杆菌启动子转录增强或抑制的机制 | 首次提供实验证据证明RNA-DNA三链体可通过扭曲双链DNA结构来调控转录速率，并将三链体序列与合成生物学构建相结合验证其功能 | 研究仅在大肠杆菌启动子基设计架构中验证，尚未在更复杂的真核生物或哺乳动物体系中证实该机制的普遍性 | 探究非编码RNA与基因组DNA形成三链体后对转录过程的调控机制 | 细菌启动子文库中的三链体相关序列及RNA-DNA三链体复合物 | 合成生物学 | NA | 体外表征、合成生物学方法、三链体-启动子复合物建模 | 三链体-启动子复合物模型 | 序列、文本 | 一个细菌启动子文库中的三链体相关序列 | NA | 大肠杆菌 | 启动子基转录调控架构 | 医学、工业生物技术 |
| 19 | 2026-10-24 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-05-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 通过改造σ54及其关联启动子的RpoN box，构建了三组正交表达系统，并在多种细菌中验证了其正交性和可转移性 | 首次基于σ54-R456H、R456Y和R456L突变体及其偏好启动子，构建了相互正交且与天然σ54正交的表达系统，并证明其正交性可转移至非模式细菌，且可与不同bEBPs组合响应环境或化学信号 | 未明确说明正交系统在复杂宿主中的长期稳定性及与内源网络的潜在交叉干扰 | 扩展σ54依赖的转录过程，开发正交基因表达工具以提升合成生物学中基因线路的可靠性和可预测性 | σ54因子及其关联启动子、细菌增强子结合蛋白（bEBPs）、非模式细菌 | 合成生物学 | NA | 知识驱动的筛选与RpoN box重编程 | NA | NA | 三种非模式细菌 | NA | 非模式细菌 | 正交转录系统、复杂生物通路与遗传线路 | 医学, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-10-24 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-05-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 该研究开发了一种受量子计算启发的合成生物学平台，利用双向启动子和合成转录因子构建压缩型遗传逻辑电路，实现多输入多输出的复杂逻辑操作 | 首次将量子计算原理引入转录编程，设计合成双向启动子构建1输入2输出的QUBIT和PAULI-X逻辑门，并层级化构建FEYNMAN和TOFFOLI门，以及2输入4输出的量子操作，同时开发基于重组酶的存储器实现逻辑门真值表重映射 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 提高生物系统决策操作的复杂性，超越标准布尔逻辑，同时最小化对底盘细胞的代谢负担 | 合成遗传电路和转录编程系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 双向启动子、合成转录因子、QUBIT逻辑门、PAULI-X逻辑门、FEYNMAN门、TOFFOLI门、基于重组酶的存储器 | 医学、工业生物技术 |