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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-07-11 |
Minimal logic gates for probiotic Escherichia coli Nissle 1917 sensing and treatment of dual-bacteria intestinal infection
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2530156
PMID:40619672
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研究论文 | 本研究设计了最小逻辑门编程益生菌大肠杆菌Nissle 1917,用于检测和治疗由两种细菌引起的肠道感染 | 设计了正交基因电路和'AND'逻辑门,使益生菌能够同时检测和杀死两种病原体,并在小鼠模型中验证了预防和治疗效果 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发针对双重细菌感染的预防和治疗方法 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917和两种病原体 | 合成生物学 | 肠道感染 | 基因电路设计、正交基因电路 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 |
2 | 2025-07-11 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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综述 | 本文综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用及其潜力 | 突出了粘细菌在生物技术应用中的未开发潜力及其在生物质转化等商业酶生产中的新兴作用 | 遗传工程挑战、生长缓慢以及代谢重塑和表达策略的限制阻碍了粘细菌细胞工厂的构建 | 探讨粘细菌及其酶在农业和工业中的潜在应用 | 粘细菌及其产生的酶 | 生物技术 | NA | 生物勘探和计算方法 | NA | NA | NA |
3 | 2025-07-11 |
Cell-Penetrating Peptide-Based Triple Nanocomplex Enables Efficient Nuclear Gene Delivery in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29019
PMID:40342143
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研究论文 | 开发了一种基于细胞穿透肽的三重纳米复合系统,用于在莱茵衣藻中实现高效的核基因递送 | 整合了细胞穿透肽(CPPs)、核定位信号(NLS)肽和质粒DNA的新型三重纳米复合系统,显著提高了质粒DNA的核转位效率 | 仅测试了两种CPP(pVEC-ORI和pVEC-R6A)在野生型莱茵衣藻细胞中的效果 | 开发高效的基因递送系统以促进微藻合成生物学发展 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞穿透肽(CPPs)技术、核定位信号(NLS)技术 | NA | NA | NA |
4 | 2025-07-11 |
Research progress in high-throughput DNA synthesis and its applications
2025-Jul-10, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb00869g
PMID:40530447
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综述 | 本文综述了高通量DNA合成技术的研究进展及其在基因组学和合成生物学中的应用 | 系统性地分类并比较了不同代际的高通量DNA合成技术,探讨了酶法合成技术的优势及潜在应用 | 未涉及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探讨高通量DNA合成技术的发展现状、优势、局限性及未来方向 | 高通量DNA合成技术 | 合成生物学 | NA | 光刻法、喷墨法、电化学法、热控合成技术、酶法合成 | NA | NA | NA |
5 | 2025-07-11 |
Magnetic metal-organic frameworks as an antisense delivery platform and their performance in a cell-free protein expression system
2025-Jul-10, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00788g
PMID:40552643
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研究论文 | 本研究探讨了磁性金属有机框架(nMOF)作为反义传递平台的性能及其在无细胞蛋白质表达系统中的表现 | 展示了磁性nMOFs通过反义有效载荷传递调节基因表达且不抑制蛋白质合成,并利用无细胞蛋白质系统(CFPS)在更受控条件下研究基因表达 | 仅少数研究探讨了磁性nMOFs的潜在毒性及其降解对细胞机制和翻译过程的影响 | 评估磁性nMOFs作为药物传递载体的性能及其在基因表达调控中的应用 | 磁性金属有机框架(nMOF)及其在无细胞蛋白质表达系统中的表现 | 生物医学应用 | NA | 无细胞蛋白质系统(CFPS) | NA | NA | NA |
6 | 2025-07-11 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-Jul-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/dCas的对抗沉默技术(CRISPRcosi),用于重新编程dCas蛋白以对抗异源沉默蛋白 | 首次利用CRISPR/dCas技术对抗Lsr2样异源沉默蛋白,实现无需启动子工程的反沉默效果 | 研究仅在放线菌中进行验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发一种精确上调异源沉默靶基因表达的新方法 | Lsr2样核相关蛋白(如CgpS和Lsr2)及其靶启动子 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas系统 | NA | 基因组转录组数据 | 使用不同sgRNA/dCas组合的系统报告基因研究,全基因组转录组分析 |
7 | 2025-07-11 |
The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies
2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01795-9
PMID:40634759
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综述 | 本文综述了急性髓系白血病(AML)的免疫逃逸机制,并探讨了免疫检查点抑制剂、疫苗及联合治疗策略的创新方法 | 揭示了AML的免疫逃逸机制,并提出了针对TP53突变AML的免疫检查点抑制剂联合去甲基化药物的新策略,以及通过树突状细胞融合靶向白血病相关抗原的治疗疫苗 | 面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性(如贫血、细胞因子释放综合征)、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战 | 评估AML免疫治疗的机制、挑战及未来方向,重点关注免疫检查点抑制剂和疫苗以改善治疗效果 | 急性髓系白血病(AML)及其免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 急性髓系白血病 | 免疫检查点抑制剂(如抗PD-1 nivolumab、抗CD47 magrolimab)、去甲基化药物(HMAs)、树突状细胞融合疫苗、单细胞基因组学、AI、合成生物学 | NA | NA | NA |
8 | 2025-07-11 |
Data-driven synthetic microbes for sustainable future
2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00556-4
PMID:40624030
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perspective | 本文提出数据驱动的合成微生物(DDSM)作为解决全球环境危机的生物技术方案 | 整合组学、机器学习和系统生物学设计工程微生物,以应对PFAS降解、温室气体减排和可持续生物制造等挑战 | NA | 推动合成生物学向环境韧性和循环生物经济方向发展 | 工程微生物 | 合成生物学 | NA | 组学、机器学习、系统生物学 | NA | NA | NA |
9 | 2025-07-11 |
Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast
2025-Jul-03, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936
PMID:40614874
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综述 | 本文综述了酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展 | 强调结构相关衍生物共有的生物合成逻辑,并将其分为两大类:叶黄素(角黄素、玉米黄质、虾青素和紫黄质)和类胡萝卜素(藏红花酸、视黄醇、β-紫罗兰酮、β-环柠檬醛和独脚金内酯) | 未来工作可能需要关注在不同酵母宿主中扩大产品多样性并提高生物合成效率以实现更可持续的生产 | 探讨酵母中β-胡萝卜素及其衍生物的微生物生产方法 | 酵母,特别是酿酒酵母和解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略和发酵优化方法 | NA | NA | NA |
10 | 2025-07-11 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
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综述 | 本文综述了麦角硫因的微生物合成研究进展及其发展前景 | 系统探讨了合成生物学和基因工程技术在提高麦角硫因生物合成效率中的应用 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨麦角硫因的微生物合成方法及其在食品、医药和化妆品行业的应用潜力 | 麦角硫因及其微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、发酵工艺优化 | NA | NA | NA |
11 | 2025-07-11 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
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研究论文 | 该研究描述了一种在酿酒酵母中实现基因组整合表达盒交换或移除的系统,将模块化原则扩展到菌株水平 | 开发了一种基于CRISPR的系统,允许对已整合到基因组中的表达盒进行标准化交换或移除,突破了现有工具的限制 | 目前仅在酿酒酵母中进行了验证,尚未在其他微生物系统中测试 | 提高微生物细胞工厂构建的灵活性和效率 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | CRISPR (Cas9和Cas12a核酸酶) | NA | 基因组数据 | 使用荧光蛋白表达盒进行测试 |
12 | 2025-07-11 |
Molecular mechanisms and applications of natural transformation in bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1578813
PMID:40630188
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综述 | 本文详细概述了细菌自然转化的过程,从启动到完成,并探讨了其在基因编辑中的应用 | 聚焦于革兰氏阳性和阴性细菌中自然转化的分子机制,并分析了影响自然转化激活的因素 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 增强对自然转化基本原理的理解,以提升其生物技术应用 | 细菌的自然转化过程 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
13 | 2025-07-11 |
High-yield bioproduction of virus-free virus-like P4-EKORhE multi-lysin transducing particles as an antimicrobial gene therapeutic
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1561443
PMID:40636261
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研究论文 | 本文描述了生物工程P4-EKORhE的构建及一种高产病毒样颗粒的综合方法,用于通过合成生物学和优化的上下游处理传递基因编码的抗菌剂 | 利用P4和P2噬菌体的病毒学特性建立高产转导颗粒的生物过程,同时避免天然病毒污染并保持最终产品的抗菌效果 | NA | 开发高产病毒样颗粒作为抗菌基因治疗剂 | P4-EKORhE病毒样颗粒及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、优化的上下游处理 | NA | NA | 纯细菌培养物和与A549永生化人类上皮组织细胞共培养的噬菌体感染模型 |
14 | 2025-07-10 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-Jul-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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综述 | 本文综述了受自然界隐生现象启发的单细胞纳米封装技术(SCNE)在人工孢子构建中的最新进展 | 通过化学合成方法构建具有保护性和功能性的'细胞-壳'结构,赋予细胞外源性表型特征 | 未提及具体技术瓶颈或实验限制条件 | 开发具有定制功能的人工孢子结构 | 单细胞纳米封装技术(SCNE)构建的人工孢子 | 合成生物学/生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装(SCNE) | NA | NA | NA |
15 | 2025-07-10 |
Magnesium-Free Assembly of Cationic Peptide/DNA Nanostructures with Defined Geometries for Anticancer Drug Delivery
2025-Jul-09, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c07816
PMID:40560802
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研究论文 | 本研究提出了一种利用阳离子靶向肽替代传统镁离子促进DNA纳米结构自组装的方法,用于抗癌药物递送 | 使用细胞穿透肽(TAT)与癌细胞靶向肽(RGD)结合的阳离子靶向肽替代镁离子,显著提高了DNA纳米结构的膜穿透性、靶向性和稳定性 | 研究仅在免疫缺陷小鼠肿瘤模型中进行验证,尚未在更复杂的生理环境中测试 | 开发更高效的DNA纳米结构药物递送系统 | DNA纳米结构和抗癌药物(阿霉素和KRAS siRNA) | 纳米医学 | 癌症 | DNA纳米结构自组装技术 | NA | NA | 免疫缺陷小鼠肿瘤模型 |
16 | 2025-07-10 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Jul-07, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
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research paper | 本文探讨了藻类在食品生物技术中的进展及其在营养和微生物组健康中的应用 | 利用合成生物学和发酵技术提升藻类营养成分,开发新型功能性食品和共生食品 | 未提及具体藻类品种的应用限制或规模化生产的挑战 | 研究藻类作为可持续营养资源的潜力及其在食品生物技术中的应用 | 藻类及其衍生物(如多糖、寡糖) | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶水解 | NA | NA | NA |
17 | 2025-07-10 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-Jul-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了一个工程化大肠杆菌联合体,用于增强菲的降解效率 | 利用SCRaMbLE方法对关键基因进行实验室进化,显著提高了菲的降解效率 | 研究仅针对菲这一种多环芳烃,未测试其他PAHs的降解效果 | 开发高效降解多环芳烃(PAHs)的生物修复系统 | 工程化大肠杆菌BL21(DE3)联合体 | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE方法 | NA | NA | 三种工程化大肠杆菌菌株(SCRPHE033, SCRKA065, CRSA) |
18 | 2025-07-10 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程,并以细菌孤儿受体CU228为模型系统,发现了三种能显著提高其热稳定性的配体 | 首次将生物信息学分析、差示扫描荧光法、微流控调制光谱和饱和转移差示NMR技术相结合,系统性地筛选并验证了孤儿PAS蛋白的小分子配体 | 仅测试了约760种化合物片段库,可能遗漏其他潜在配体;研究局限于单一模型蛋白CU228 | 开发一种系统性筛选小分子配体的方法,以增强孤儿PAS蛋白的稳定性 | 来自Candidatus Solibacter usitatus的PAS-HTH转录因子CU228 | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法(DSF)、微流控调制光谱(MMS)、饱和转移差示NMR(STD-NMR) | NA | 蛋白质结构数据、热稳定性数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库筛选,最终鉴定出3种有效配体 |
19 | 2025-07-10 |
An artificial intelligence-based approach for identifying the proteins regulating liquid-liquid phase separation
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf313
PMID:40632496
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研究论文 | 本文提出了一种基于人工智能的方法来识别调控液液相分离(LLPS)的蛋白质 | 利用ESM2_t36预训练蛋白质语言模型提取蛋白质序列的语义信息,并结合多层感知机分类器,显著优于传统序列分析方法 | 模型在测试数据集上的准确率为0.78,仍有提升空间 | 识别调控液液相分离(LLPS)的蛋白质,以应用于生物技术、材料科学和医学领域 | 蛋白质序列 | 生物信息学 | NA | ESM2_t36预训练蛋白质语言模型 | 多层感知机分类器 | 蛋白质序列数据 | 913个阳性蛋白质序列和6584个阴性蛋白质序列 |
20 | 2025-07-10 |
Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots
2025-Jul, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01133-5
PMID:40097832
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研究论文 | 开发了一种在活细胞内合成生物兼容量子点的方法,并验证了其在多种细胞中的应用 | 通过精确的空间和时间序列耦合细胞内代谢途径,实现了量子点在活细胞内的合成,提高了生物兼容性 | 需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该流程 | 开发生物兼容量子点的合成方法,以扩展其在生物医学中的应用 | 酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7和MDCK细胞 | 合成生物学 | NA | 活细胞合成和准生物合成 | NA | NA | 酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7和MDCK细胞 |