合成生物学相关文章
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当前共找到 1530 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-06-30 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-02-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 提出一种名为HEEL的高效酵母文库转化方法，通过热激与电穿孔双重处理提高单转化细胞比例，实现精确的表型-基因型映射 | 首次将热激与电穿孔结合，将单转化细胞比例从20%提升至超过70%，并实现近100倍转化效率提升，结合双条形码及自动化基因分型流程，克服了文库大小与质量之间的长期权衡 | NA | 开发一种高转化效率且能保持高质量单基因型细胞的酵母文库转化方法，促进精确表型-基因型测量，用于改进计算机建模 | 高多样性酵母突变文库 | NA | NA | 热激电穿孔 (HEEL)，Sanger测序 | NA | 基因型数据 | NA | NA | 酿酒酵母 (S. cerevisiae) | NA | 分子生物学, 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 182 | 2026-06-29 |
Overcoming barriers in CAR-NK immunotherapy: CRISPR-Driven advances in checkpoint editing and allogeneic design
2025-Dec-17, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01778-9
PMID:41405764
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综述 | 探讨CRISPR技术如何推动CAR-NK免疫疗法发展，重点综述检查点编辑和同种异体设计的进展 | 系统阐述CRISPR/Cas9基因编辑在CAR-NK细胞工程中的多重应用，包括抑制性检查点基因敲除、CAR基因安全位点敲入、多重编辑以及免疫细胞因子武装等创新策略 | CRISPR递送优化、脱靶效应和体内持久性提升仍面临挑战 | 综述CRISPR技术在CAR-NK细胞免疫疗法中的应用进展 | CAR-NK细胞和CRISPR基因编辑技术 | 数字病理学 | 癌症 | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 自然杀伤细胞 | 检查点编辑、同种异体设计、免疫细胞因子武装 | 医学 |
| 183 | 2026-06-26 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-10-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 利用集成学习技术基于分子指纹预测利什曼病活性 | 首次引入集成模型方法用于利什曼病药物发现，结合三种分子指纹算法和多种机器学习模型，实现了83.65%的高精度预测 | 数据集仅来自PubChem数据库，且依赖Alamar Blue法评估，可能限制化合物的多样性；模型尚未经过体外或体内实验验证 | 开发基于机器学习和化学信息学的计算方法，预测化合物抗利什曼原虫前鞭毛体的活性 | 65,057个分子（来自PubChem数据库）以及其抗利什曼原虫活性数据 | 机器学习 | 利什曼病 | 分子指纹编码（Avalon、MACCS Key、Pharmacophore）、Alamar Blue法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 分子结构数据（SMILES符号） | 65,057个分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 184 | 2026-06-26 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-08-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发了一种具有多酶纳米酶活性的仿生脂质体，用于调节外源植入物引起的促炎因子，从而促进组织再生 | 首次将CeO纳米颗粒与人工膜自组装形成仿生脂质体，兼具抗血液成分粘附和调节生化微环境稳态的双重功能 | NA | 设计并构建能在初始移植阶段复制天然细胞功能的治疗性脂质体，用于组织工程中的合成生物学 | 多酶纳米酶脂质体及CeO纳米颗粒 | NA | NA | 自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 185 | 2026-06-26 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-08-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法，解析多因素条件下三链DNA的热稳定性和pH稳定性 | 首次预测了不同温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性，并揭示了离子强度对Hoogsteen氢键的双重作用机制 | 未明确提及 | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA稳定性，并建立预测模型 | 三链DNA结构 | 分子生物学、核酸结构生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光信号、熔解温度数据 | 414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 基因靶向治疗、合成生物学应用 |
| 186 | 2026-06-26 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 通过体外重建和突变分析，揭示了两种聚酮链通过非经典缩合结构域融合形成马来环丙醇活性丁烯内酯核心的机制 | 首次阐明硫模板介导的聚酮链头对头融合及还原环化构建丁烯内酯的非常规生物合成途径，扩展了合成生物学工具箱 | 未明确提及该反应在体内的效率或对病原菌整体毒力的定量影响 | 揭示马来环丙醇中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 类鼻疽伯克霍尔德菌群的毒力因子马来环丙醇及其生物合成酶系 | 合成生物学 | 类鼻疽伯克霍尔德菌感染 | 化学合成、体外重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（用于突变分析） | NA | 由PKS-NRPS杂合合成酶催化的聚酮链融合及还原环化丁烯内酯形成途径 | 医学（抗毒力策略开发） |
| 187 | 2026-06-26 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 通过光响应DNA液滴动态相分离控制酶级联途径 | 提出利用光响应DNA液滴通过液-液相分离选择性隔离酶，实现紫外光和可见光调控酶级联反应，无需改变总酶浓度 | 未提及在复杂生物环境中的稳定性和长期应用效果 | 开发光响应DNA液滴用于精确调控酶级联途径 | 光响应DNA液滴和酶级联系统（GOx、HRP、CAT和GAO、MPO、CAT） | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 光响应DNA液滴（Y-motif序列与偶氮苯修饰的粘性末端）和酶级联途径 | 合成生物学, 微反应器设计, 生物工程 |
| 188 | 2026-06-26 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路，用于实现原始细胞与活细胞群落中的自我调节双向通信 | 设计了包含识别、激活和反馈模块的DNA电路，使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号，自我调节与活细胞的相互作用，并具备可再生能力，能连续与多个目标活细胞互动 | 仅描述了原理验证，未提及在复杂生物环境中的应用限制或长期稳定性问题 | 开发合成生物学工具，控制细胞间信号传递，实现原始细胞与活细胞群落中的动态信号传播调控 | 原始细胞（非生物细胞模拟物）与活细胞（目标细胞） | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA | DNA组装技术 | 原始细胞（非生物） | 信号电路，包含识别模块、激活模块和反馈模块，用于自我调节双向通信 | 医学（细胞疗法） |
| 189 | 2026-06-26 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种基于水凝胶颗粒的无纯化方法，用于测量合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶保真度 | 通过在磁性水凝胶颗粒基质内进行XNA转录和逆转录步骤，避免了传统方法中耗时的聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化步骤 | NA | 简化XNA聚合酶保真度测量流程 | XNA聚合酶 | NA | NA | 水凝胶颗粒技术, DNA/RNA合成 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 190 | 2026-06-19 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-11-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 通过将葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶共封装于二氧化硅纳米胶囊内，构建自放大质子生成的类线粒体ATP纳米发生器，实现人工细胞自主能量供应和代谢耦合 | 首次通过定量共封装葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶于二氧化硅纳米胶囊中，建立自增强酶级联反应放大质子生成，并结合ATP酶整合脂质体双层涂层，实现高效ATP合成 | 研究主要基于人工细胞模型（巨型单层囊泡），在更复杂细胞环境中长期稳定性和集成效率有待验证 | 构建能够自主供应能量并耦合代谢的人工线粒体，推动自下而上合成生物学发展 | 人工细胞模型中的线粒体模拟ATP纳米发生器 | 合成生物学 | NA | 酶共封装、纳米胶囊合成、ATP酶整合脂质体涂层 | NA | NA | NA | NA | NA | 自增强酶级联反应（葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶）驱动的质子梯度，耦合ATP合酶实现ATP合成 | 合成生物学 |
| 191 | 2026-06-19 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-10-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
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研究论文 | 提出一种基于Pickering乳液的封装方法，将无膜凝聚层转化为多室混合微反应器，用于高效酶催化 | 首次利用Pickering乳液封装法将无膜凝聚层转化为具有层级分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室混合微反应器，实现空间有序调控生物和非生物催化反应，显著提升催化活性、热稳定性和长期耐久性 | 未提及限制，但可能涉及方法的普适性和规模化应用挑战 | 设计构建具有组织复杂性、功能多样性和实际应用性的人工原细胞，用于体外合成生物学和生物工程 | 无膜凝聚层（凝聚层室）和混合微反应器 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装、脂肪酶催化动力学拆分 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 多室混合微反应器（分级结构、分子拥挤环境、选择性渗透膜） | 医学、工业生物技术 |
| 192 | 2026-06-19 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-10-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
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综述 | 本文综述了拓扑工程引导RNA（TE-gRNA）在实现CRISPR/Cas系统可编程调控中的应用 | 通过设计聚合物、环状和树枝状等拓扑结构，TE-gRNA实现了CRISPR活性的精确空间控制、可逆性和可编程激活，优于传统线性gRNA | TE-gRNA在合成可行性、稳定性及降低脱靶效应方面仍面临挑战，其在大规模应用中表现有待进一步验证 | 探讨拓扑工程引导RNA如何实现对CRISPR/Cas活动的精准时序和条件控制 | 拓扑工程引导RNA（TE-gRNA）及其在CRISPR/Cas系统中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 功能基因组学, 治疗干预 |
| 193 | 2026-06-19 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-09-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
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research paper | 提出一种可编程DNA纳米笼策略，用于构建稳定且自适应的合成细胞器网络 | 通过DNA纳米笼模块化设计，实现机械增强的仿生纳米笼，并集成逻辑门控DNA元件作为动态接触位点，实现环境响应性的空间组织与信号重配置 | 当前研究以细胞外囊泡为模型，未来需验证其在其他合成细胞器系统中的普适性与体内应用稳定性 | 构建具有自适应反馈机制的稳定合成细胞器网络 | 细胞外囊泡与四面体DNA框架组装的DNA纳米笼 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、回文杂交链式反应、逻辑门控DNA元件 | NA | NA | NA | DNA纳米笼、回文杂交链式反应 | NA | 逻辑门控DNA元件作为动态接触位点，响应环境信号重配置空间组织与信号传递 | 合成生物学、生物医学、智能材料设计 |
| 194 | 2026-06-19 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-09-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
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研究论文 | 提出一种基于DNA酶的单链DNA辅助双链DNA切口产生的PCR-free定点突变方法 | 首次利用DNA酶在无PCR条件下对重复序列进行定点突变，扩展了DNA酶的底物范围至双链超螺旋质粒，且仅使用未修饰的DNA寡核苷酸，成本低、制备简单 | 该研究对DNA酶在重复序列上的效率与通用性可能仍需更多验证 | 开发一种无PCR的定点突变方法，用于处理包含高重复序列的DNA模板 | 含有PCR不相容重复序列的质粒DNA | 合成生物学 | NA | DNA酶介导的定点突变 | NA | DNA序列 | 使用单个含有重复序列的质粒作为样本 | NA | NA | 单链DNA辅助的DNA酶切口系统（DANDA） | 生物化学与生物技术应用 |
| 195 | 2026-06-18 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
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研究论文 | 通过合成操纵子调控大肠杆菌表面组实现选择性水氧化 | 首次在微生物基因组层面设计合成操纵子，通过冰核蛋白锚定真菌胆红素氧化酶于细胞表面，实现接近零过电位的选择性水氧化，并完全抑制氧还原反应 | NA | 开发可再生的微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面组工程改造 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、蛋白质表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 合成操纵子、冰核蛋白锚定、IPTG诱导表达系统 | 能源、环境、生物催化 |
| 196 | 2026-06-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 利用合成生物学策略，通过基因电路在小细胞外囊泡内自组装siRNA，靶向LRRK2基因，减轻帕金森病模型中的神经退行性变 | 开发了一种基于合成生物学的基因电路，通过静脉注射后能在肝脏中自组装并递送LRRK2 siRNA进入黑质，实现非侵入性靶向治疗 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证；长期安全性和有效性尚需评估 | 开发一种通过小细胞外囊泡递送siRNA以治疗帕金森病的方法 | 帕金森病小鼠模型（LRRK2R1441G小鼠） | 合成生物学 | 帕金森病 | 基因电路设计、小细胞外囊泡、siRNA技术 | NA | NA | 多个小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 小鼠 | 包含神经元靶向RVG标签和LRRK2 siRNA的基因电路 | 医学 |
| 197 | 2026-06-18 |
Engineering biology and chemical approaches to the construction of vitamin B12 analogues and antivitamins B12 as probes and therapeutic agents
2025, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2025.07.003
PMID:40846392
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综述 | 综述利用工程生物学和化学方法构建维生素B12类似物及抗维生素B12作为探针和治疗剂的研究进展 | 通过合成生物学在E. coli中异源表达有氧B12生物合成途径，高产生物合成中间体和无钴B12前体，并用于生成含铑、镍、锌等过渡金属的金属取代类似物及有机抗代谢物和荧光标记衍生物，用于探针B12依赖酶、追踪维生素运输和选择性破坏微生物或疾病相关代谢 | 文中未明确论述局限性，可能包括合成类似物的体内稳定性、特异性及临床转化的挑战 | 探索合成维生素B12类似物和抗维生素B12在生物研究和治疗中的应用 | 维生素B12类似物、抗维生素B12、金属取代类似物、荧光标记衍生物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | E. coli | 维生素B12生物合成途径 | 医学, 农业, 环境 |
| 198 | 2026-06-17 |
Discovery of a Heme-Dependent Enzyme Catalyzing Nitrogen-Nitrogen Bond Formation in Kinamycin Biosynthesis
2025-12-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202513778
PMID:41137433
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研究论文 | 发现了在kinamycin生物合成中催化氮-氮键形成的一种新型血红素依赖酶Alp1J | 首次发现了一种属于新家族的血红素依赖酶Alp1J催化氮-氮键形成，并揭示了其与铁氧还蛋白Alp1I形成稳定复合物保护辅因子及催化活性的机制 | 未明确提及局限性 | 揭示kinamycin生物合成中氮-氮键形成的酶学机制 | Alp1J酶及其伴侣铁氧还蛋白Alp1I | NA | NA | 诱变、生物化学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 199 | 2026-06-17 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2025-Sep, PRX life
DOI:10.1103/99bt-4ss4
PMID:42281556
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研究论文 | 提出一种通过底物依赖性酶聚集提高代谢效率的自我组织策略 | 首次提出可通过底物可利用性调控酶的“粘性”以实现接近最优大小和间距的酶簇自我组织，从而显著提高代谢通量并降低毒性代谢物 | 主要基于数学模型研究，缺乏体内实验验证；实际细胞环境中酶粘性的变构调控机制需进一步探索 | 探索一种超越现有自然和工程酶簇范式的自我组织策略，以提高代谢效率 | 简单代谢通路中的酶簇 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 数学建模, 热力学约束分析 | NA | 数学模拟数据 | NA | NA | NA | 底物依赖性相分离酶簇 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 200 | 2026-06-17 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 通过评估大肠杆菌中近50万个独特gRNA的活性，揭示了Cas9靶向的广泛功能性及gRNA设计规则 | 首次大规模实验评估了所有独特Cas9原型间隔序列，发现93%以上的gRNA具有功能性，并识别出非功能性gRNA的自我相互作用特征，提出了简单设计规则进行排除 | 研究仅针对大肠杆菌K12 MG1655基因组，未验证其他细菌或真核宿主中的通用性 | 解决关于Cas9 gRNA特异性的矛盾报道，为微生物合成生物学提供功能性和非功能性gRNA的全面评估及实验流程 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, NGS | NA | DNA序列 | 近500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | Cas9靶向系统 | 工业生物技术，医药 |