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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2025-Sep-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的BT模型,用于预测转录因子BmoR的关键残基区域,并通过半理性工程获得具有严格信号分子正交性的BmoR突变体,应用于生物燃料高产菌株筛选 | 首次证明氢键计数在TF-SM相互作用中的主导作用,并建立了机器学习引导的TF进化框架,实现了严格信号分子正交性 | NA | 设计具有严格信号分子正交性的生物传感器以最大化可再生生物燃料的过量生产 | 转录因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 合成生物学 | NA | 随机森林算法、Discovery Studio模拟、微尺度热泳动(MST)亲和力测定 | 随机森林 | 蛋白质-配体复合物结构数据 | 245个TF-SM复合物的转录激活效应验证,5,700个BmoR突变体与4种信号分子的结合模拟 | 半理性工程 | 微生物 | 基于BmoR的生物传感器 | 能源,工业生物技术 |
| 182 | 2025-10-05 |
Developmental regulatory factors promote the efficiency of crop genetic transformation
2025-Sep, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-345
PMID:40962472
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综述 | 系统探讨发育调控因子在提高作物遗传转化效率中的应用与前景 | 首次系统梳理发育调控因子在克服遗传转化技术瓶颈中的多重作用机制 | NA | 探讨发育调控因子如何提升作物遗传转化技术的效率和应用范围 | 主要农作物及其遗传转化技术体系 | 农业生物技术 | NA | 农杆菌介导转化、基因枪技术 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 183 | 2025-10-05 |
De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007
PMID:40951686
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研究论文 | 本研究首次在酿酒酵母中实现了Asperosaponin VI的完整生物合成途径重构 | 首次在酿酒酵母中采用模块化合成生物学策略完整重建ASA VI生物合成途径,包括UDP-阿拉伯糖原位生物合成和多个糖基化步骤 | 产量仍处于痕量水平(395 ng/L),下游糖基化步骤和UDP-阿拉伯糖供应可能是主要限速因素 | 开发可持续生产Asperosaponin VI及相关阿拉伯糖基化皂苷的微生物平台 | Asperosaponin VI(ASA VI)三萜皂苷及其生物合成中间体 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 异源基因表达、多拷贝表达 | 酿酒酵母 | 完整生物合成途径包括:UDP-阿拉伯糖原位生物合成、三萜骨架生成(齐墩果酸生产)、下游修饰(C-23羟基化、C-28逐步葡萄糖基化、C-3阿拉伯糖基化) | 医药 |
| 184 | 2025-10-05 |
Microreactors derived from water-in-water pickering emulsions for Bacillus amyloliquefaciens proliferation and synthesis of 4-methyl-5-thiazoleethanol
2025-Dec, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133231
PMID:40882929
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研究论文 | 开发了一种基于水包水Pickering乳液微反应器,用于提高枯草芽孢杆菌增殖和4-甲基-5-噻唑乙醇的生物合成效率 | 结合合成生物学与胶体组装技术构建新型微反应器平台,通过工程化硫胺素酶II突变体和界面屏障优化酶-底物相互作用 | NA | 解决4-甲基-5-噻唑乙醇生物合成中产率低和挥发性损失的问题 | 枯草芽孢杆菌及其工程化硫胺素酶II突变体 | 合成生物学 | NA | 水包水Pickering乳液、甲基纤维素/羟丙基甲基纤维素水相分离、液体发酵 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 枯草芽孢杆菌 | 硫胺素酶II突变体(A82Y/Y113A/T163K/F169L)的代谢工程改造 | 食品工业,香料工业 |
| 185 | 2025-10-05 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本研究通过整合基因组、转录组和代谢组分析,探索钩吻中钩吻素甲生物合成途径及相关酶基因 | 首次完成钩吻基因组测序组装,结合多组学数据鉴定出20个钩吻素甲生物合成候选基因,并对其中两个基因进行了功能验证 | 仅对两个候选基因进行了初步功能验证,完整的生物合成途径仍需进一步研究 | 解析钩吻中钩吻素甲生物合成途径,挖掘相关酶基因 | 钩吻植物及其生物活性成分钩吻素甲 | 合成生物学 | 炎症和焦虑症 | PacBio测序, 液相色谱-质谱联用技术 | NA | 基因组, 转录组, 代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 | NA | 钩吻植物 | 钩吻素甲生物合成途径 | 医药 |
| 186 | 2025-10-05 |
Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins
2025-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70284
PMID:40944421
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研究论文 | 开发了能够准确预测无序蛋白质热响应相行为的残基分辨率模型Mpipi-T | 通过整合原子尺度溶剂化自由能数据和实验浊点测量,参数化了短程非键相互作用,同时解析地标度长程静电相互作用随温度的变化 | NA | 定量预测蛋白质的LCST型相变行为 | 无序蛋白质的热响应相行为 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 原子尺度溶剂化自由能计算,实验浊点测量 | 残基分辨率模型Mpipi-T | 蛋白质序列数据,相变实验数据 | 三个关键蛋白质:hTau40、Pab1、ELF3 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 187 | 2025-10-05 |
Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01976-25
PMID:40824035
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造恶臭假单胞菌,使其能够通过还原甘氨酸途径利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源和能源 | 首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸营养和甲醇营养,通过途径重连和适应性实验室进化实现高效C1同化 | NA | 扩展微生物宿主范围以实现高效C1原料利用,开发碳效率生物制造工艺 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化(ALE),代谢工程,途径工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 质粒整合, 转座子模块 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 还原甘氨酸途径,甲酸脱氢酶途径,甲醇脱氢酶途径 | 工业生物技术, 环境 |
| 188 | 2025-10-05 |
Engineering chimeric polyhydroxyalkanoate synthases for enhanced copolymerization of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate): A promising biotechnological approach
2025-Sep-10, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133307
PMID:40939657
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研究论文 | 通过交换PHA合酶的N端结构域构建嵌合酶,提高聚羟基脂肪酸酯共聚物中3-羟基己酸酯的掺入效率并优化颗粒形态 | 通过结构域交换构建嵌合PHA合酶,解决了传统嵌合酶设计中的β链干扰问题,实现了3HHx掺入量和颗粒形态的同步优化 | NA | 开发高性能生物可降解塑料的合成生物学策略 | 聚羟基脂肪酸酯合酶(PhaCs) | 合成生物学 | NA | 结构预测、嵌合酶构建 | NA | NA | NA | 结构域交换 | NA | 嵌合酶设计 | 材料, 工业生物技术 |
| 189 | 2025-10-05 |
DNA Vaccines in the Post-mRNA Era: Engineering, Applications, and Emerging Innovations
2025-Sep-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178716
PMID:40943636
|
综述 | 本文全面探讨DNA疫苗在mRNA疫苗时代的技术进展、工程原理、临床应用及创新方向 | 系统阐述DNA疫苗通过合成基因电路、自扩增DNA和DNA编码单克隆抗体等技术实现的免疫原性突破 | NA | 评估DNA疫苗在精准免疫治疗中的技术优势和发展路线 | DNA疫苗技术平台及其临床应用 | 合成生物学 | 传染病、癌症、免疫介导疾病 | 合成基因电路、自扩增DNA、DNA编码单克隆抗体、电穿孔、冻干技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 合成基因电路、自扩增DNA系统、DNA编码单克隆抗体表达系统 | 医学 |
| 190 | 2025-10-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,在人类细胞系和原代T细胞中实现了差异化的甲基化和基因沉默活性 | 在DNMT3A催化核心引入突变,稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时保持DNA甲基化和基因沉默功能 | 研究主要局限于人类细胞系和原代T细胞,尚未在其他哺乳动物细胞类型中验证 | 开发优化的表观遗传编辑工具,用于在哺乳动物细胞中实现可编程的DNA甲基化 | 人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 表观遗传编辑, DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白 | 表观遗传数据, 基因表达数据 | 多种人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系, 原代人类T细胞 | 表观遗传编辑系统, DNA甲基转移酶融合蛋白 | 医学, 生物技术 |
| 191 | 2025-10-05 |
Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899
PMID:40207161
|
综述 | 系统回顾沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性和抗菌潜力 | 聚焦沙特独特生态系统(极端环境等)中放线菌的抗菌潜力,结合基因组挖掘、AI生物信息学等前沿技术 | 稀有菌株培养困难、基因组表征有限、生产成本高 | 探索新型抗菌剂以应对抗菌素耐药性 | 沙特阿拉伯不同环境来源的放线菌 | 微生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 基因组挖掘、宏基因组学、AI生物信息学、CRISPR基因激活、质谱分析、液相色谱、核磁共振波谱 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 放线菌 | NA | 医学, 农业 |
| 192 | 2025-10-05 |
Yarrowia lipolytica as a promising cell factory for microbial production of value-added nutraceuticals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673169
PMID:40948964
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综述 | 总结解脂耶氏酵母作为细胞工厂生产高附加值营养保健品的工程策略与进展 | 系统整合代谢工程与合成生物学工具,重点突出细胞器区室化工程和生物传感器驱动筛选等先进策略 | NA | 开发解脂耶氏酵母作为可持续生产营养保健品的微生物平台 | 解脂耶氏酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学、多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 生物传感器 | 解脂耶氏酵母 | 代谢通路工程、异源基因表达优化、前体供应增强、竞争途径重定向 | 食品, 工业生物技术 |
| 193 | 2025-10-05 |
Reprogramming cancer immunity with next-generation combination therapies
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1652047
PMID:40950404
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综述 | 本文全面分析新一代癌症免疫联合疗法的机制基础与临床整合策略 | 系统整合多模态免疫治疗策略,结合纳米技术、免疫工程和人工智能建模等前沿技术 | 存在免疫相关不良事件和治疗反应异质性等挑战 | 探讨通过新一代联合疗法重编程癌症免疫应答 | 癌症免疫治疗策略及其临床应用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 多组学分析、纳米技术、人工智能建模 | NA | NA | NA | 免疫工程 | NA | NA | 医学 |
| 194 | 2025-10-05 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2025-Sep-16, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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系统综述 | 系统综述虫媒病毒病的进化机制、宿主-媒介相互作用及新型控制策略 | 整合基因组分析、荟萃流行病学综合和预测建模的多学科分析框架,系统评估CRISPR基因驱动和RNAi抗病毒等新型控制策略 | 基因编辑和微生物干预存在伦理、生态和监管问题需要谨慎考虑 | 理解虫媒病毒的进化机制和传播动态,探索有效疾病控制策略 | 虫媒病毒(登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗河病毒)及其传播媒介(蚊子和蜱) | 传染病学 | 虫媒病毒病 | 基因组分析、预测建模、荟萃流行病学分析 | 预测模型 | 基因组数据、流行病学数据 | 从16,320条初始记录中筛选出12项高质量研究 | CRISPR基因驱动 | NA | NA | 医学 |
| 195 | 2025-10-05 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Nov, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了基于SacB的基因编辑系统,用于木葡糖酸醋杆菌的标记自由基因编辑,并探索细菌纤维素合酶功能 | 开发了pK18mobsacB系统实现高达83.33%效率的标记自由基因编辑,首次系统研究bcs操纵子对细菌纤维素合成和结构的影响 | NA | 开发高效基因编辑工具并研究细菌纤维素合酶功能 | 木葡糖酸醋杆菌CGMCC 2955及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | 基因编辑效率数据、纤维素结构表征数据 | 木葡糖酸醋杆菌CGMCC 2955菌株 | pK18mobsacB, SacB系统 | Komagataeibacter xylinus(木葡糖酸醋杆菌) | 基因删除、插入和替换操作 | 生物技术,食品,医药,工业生物技术 |
| 196 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-Oct-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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综述 | 本文探讨利用合成生物学原理设计蛋白质变构调控及其在生物医学领域的应用潜力 | 整合人工智能生成式蛋白质设计方法开发新型变构调控系统,实现对外部信号响应的精准蛋白质功能调控 | NA | 通过合成生物学方法设计蛋白质变构调控机制,开发新型治疗策略 | 蛋白质变构调控系统 | 合成生物学 | NA | 结构域插入、从头蛋白质开关设计、工程化变构机制 | AI生成式蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | 变构蛋白质开关、变构调节剂、配体结合响应系统 | 医学 |
| 197 | 2025-10-05 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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综述 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传平台的发展历程、主要特性及其在细胞信号操控中的应用 | 开发了基于自定位配体的蛋白质易位技术,能够可逆且重复地操控细胞内膜信号传导 | NA | 开发用于解析细胞信号网络和工程化细胞功能的化学遗传工具 | 细胞信号蛋白和脂质 | 合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白易位) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞, 大肠杆菌 | 蛋白质易位系统,光诱导空间调控蛋白招募,多重信号操控 | 医学 |
| 198 | 2025-10-05 |
Engineering Proteinosomes with Cellular-Like Functionalities
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500448
PMID:40810682
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综述 | 本文综述了蛋白质体作为仿生结构在模拟细胞功能方面的研究进展,包括构建方法、功能化策略及其在人工细胞模型和生物医学应用中的潜力 | 详细阐述了通过界面自组装、聚合物膜模板和混合脂质-聚合物系统构建具有可调渗透性、机械稳定性和刺激响应行为的蛋白质体,并强调了其在构建原型组织方面的创新 | NA | 探索蛋白质体作为人工细胞模型的构建方法和功能化策略 | 蛋白质体及其仿生结构 | 合成生物学 | 癌症 | 界面自组装、聚合物膜模板、混合脂质-聚合物系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应材料、多室结构、原型组织构建 | 医学 |
| 199 | 2025-10-05 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 通过分析Pepper RNA变体揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦关系 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦现象,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度的重要影响 | 仅研究了53种变体,可能未覆盖所有关键序列变异 | 理解RNA适配体配体识别和荧光激活的序列-结构-功能关系,为理性设计荧光RNA适配体提供框架 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建、结合亲和力测定、荧光强度测量 | NA | 生物化学数据、荧光数据 | 53种Pepper变体 | NA | NA | 荧光RNA适配体 | 医学, 合成生物学 |
| 200 | 2025-10-05 |
Multivalent engineering of bio interfaces with DNA-based nanomaterials
2025-Oct, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115681
PMID:40865643
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综述 | 本文探讨了基于DNA的纳米材料在生物界面多价工程中的应用与进展 | 提出从传统多价结合向'多价工程'的概念转变,通过DNA纳米材料实现配体空间排列的精确编程 | 在复杂体内环境中实现系统全部潜力仍需解决重大挑战 | 开发生物界面多价工程系统以模拟或利用自然相互作用模式 | DNA纳米材料及其在生物界面工程中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米材料 | NA | 配体空间组织、几何依赖型靶向策略 | 诊断, 治疗, 合成生物学 |