本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-08-12 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-01-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
|
综述 | 本文综述了通过化学修饰和基因工程等手段改造噬菌体以对抗多重耐药细菌的研究进展,并讨论了其在病原体检测和杀灭中的应用 | 结合合成生物学和纳米技术的跨学科方法,系统总结了噬菌体工程在扩大宿主范围、赋予新功能方面的创新策略 | 天然噬菌体的窄宿主范围、未表征特性以及指数复制和进化带来的潜在风险仍限制其应用 | 探索噬菌体工程在病原体控制和多重耐药细菌治疗中的应用潜力 | 多重耐药细菌及其噬菌体工程改造策略 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因工程、化学修饰 | NA | 文献资料 | NA | 基因工程工具 | 噬菌体宿主细菌(未特指) | 噬菌体工程改造(增强宿主范围、赋予新功能) | 医学 |
| 182 | 2026-08-12 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-01-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
|
综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术的最新进展及其在化学生物学、合成生物学和医学等领域的应用 | 系统总结了GCE技术中aaRS/tRNA优化、翻译系统工程和筛选方法等关键突破,并展望了其在基因编辑和疫苗生产等新兴领域的应用前景 | 未详细讨论GCE技术的具体局限性和潜在风险,如脱靶效应和体内递送效率等问题 | 全面概述GCE技术的现状,包括原理、发展和应用,并展望其未来方向 | 非规范氨基酸及其位点特异性掺入蛋白质系统,涉及氨基酸tRNA合成酶/tRNA系统 | 化学生物学, 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展, 氨基酸tRNA合成酶/tRNA系统优化, 翻译系统工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 工业生物技术 |
| 183 | 2026-08-12 |
Meeting report: 400 synthetic biology projects promote sustainable development
2025, Sustainable microbiology
DOI:10.1093/sumbio/qvaf018
PMID:42576861
|
会议报告 | 本文报道了2024年iGEM Grand Jamboree会议,总结了超过400个合成生物学项目在促进可持续发展方面的努力和成果 | 强调通过基础合成生物学原理应用于多样化问题来解决可持续发展挑战,并突出展示了四个典型项目 | 未提供具体项目结果的详细评估或数据支持 | 展示合成生物学在应对和解决广泛可持续发展挑战中的应用前景 | 会议中展示的合成生物学项目,特别是四个代表性项目(斯德哥尔摩、色萨利、鲁汶、哥本哈根) | 合成生物学 | NA | 分子克隆、微生物工程 | NA | 文本 | 超过400个来自高中和大学的学生团队项目 | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物 | 代谢通路、生物传感器、逻辑门等(根据项目特性) | 医疗保健, 人类进步, 环境 |
| 184 | 2026-08-11 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
|
研究论文 | 本文表征了小鼠胚胎干细胞中三种小分子诱导和两种细胞接触诱导的基因表达与分化控制系统,并展示其驱动神经分化的能力 | 首次系统表征多种合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的功能,并展示其组合使用以精确调控分化 | 未提及具体限制,但可能包括系统在体内或复杂环境下的稳定性及组合使用的潜在干扰 | 评估并优化小鼠胚胎干细胞中可诱导的基因表达和分化控制工具,以支持合成发育生物学研究 | 小鼠胚胎干细胞及其神经元分化模型 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、细胞分化诱导 | NA | 实验数据 | 未具体说明样本量 | NA | 小鼠胚胎干细胞 | 小分子诱导系统和细胞接触诱导系统 | 医学、生物技术 |
| 185 | 2026-08-11 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
|
研究论文 | 本文探讨了利用天然产物、合成生物学和人工智能技术来工程化非核糖体肽合成酶和聚酮合酶,以创造新型生物活性化合物,应对抗生素耐药性和癌症等挑战。 | 提出了结合硫醇化结构域交换单元和人工智能驱动工具(如合成智能)的创新方法,用于扩展化学空间和优化生物合成途径,实现精确和可扩展的治疗解决方案。 | 未提及具体局限性。 | 推动下一代治疗药物的开发,革新药物发现和患者护理。 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶。 | 合成生物学 | 抗生素耐药性、癌症 | 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 186 | 2026-08-09 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
|
访谈 | 本文是一篇关于Sarah Soliman和Zara Weinberg研究工作的访谈,介绍了他们开发的用于控制小鼠胚胎干细胞基因表达和分化的小分子及细胞接触诱导系统 | 开发了一套小分子和细胞接触诱导系统,能够在时间和空间上精确控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | NA | 利用合成生物学工具重现发育过程,研究发育生物学原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 小鼠 | 小分子和细胞接触诱导的基因表达和分化调控系统 | 医学 |
| 187 | 2026-08-08 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用细菌记忆电路和高变DNA条形码的高通量筛选平台,用于从多种肠道细菌中识别宿主诱导的生物传感器,并验证了其在炎症疾病监测和自主控制合成功能方面的应用 | 创新点在于扩展了生物传感器筛选平台的灵活性和能力,通过自定义的双组分系统识别和克隆流程构建来自不同肠道细菌的传感器库,并利用高变DNA条形码在单个实验中并行追踪数千个独特克隆 | 未提供明确的局限性信息 | 旨在开发一种发现平台,以识别来自多样来源的宿主诱导细菌生物传感器,促进合成生物学工具在复杂环境中的应用 | 肠道细菌中的双组分系统和生物传感器克隆,以及小鼠体内的传感器活性 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | DNA条形码、双组分系统识别和克隆 | NA | 基因序列和传感器活性数据 | 约150个推定生物传感器,涉及数千个独特克隆,并在小鼠模型中评估 | NA | 肠道细菌、小鼠模型 | 细菌记忆电路和生物传感器 | 医学、生物技术 |
| 188 | 2026-08-08 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
|
研究论文 | 开发了红细胞微反应器用于持续产生硫化氢气体递质,实现血管舒张,并在体外验证其疗效 | 首次利用红细胞作为微反应器,通过封装PLP-PLys复合物,结合血红蛋白实现级联反应合成硫化氢,提供了一种可控且持续的气体递质递送策略 | 仅在体外试验中验证,未进行体内实验 | 设计模拟天然细胞功能的治疗性微反应器,用于气体递质递送和血管舒张治疗 | 红细胞微反应器,装载PLP-PLys复合物,用于产硫化氢 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法 | NA | 实验数据 | 使用离体胸主动脉环,具体数量未提及 | NA | 红细胞 | 级联反应途径,包括PLP-PLys复合物和血红蛋白介导的L-半胱氨酸转化为硫化氢 | 医学 |
| 189 | 2026-08-07 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-02-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞系统和脚趾开关技术的生物传感器,结合核酸序列扩增技术,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒。 | 将脚趾开关技术与NASBA扩增技术相结合,显著提高了检测灵敏度,达到2.9 aM的检测限,解决了脚趾开关在低丰度目标检测中的固有局限性。 | 摘要中未提及明显的局限性,可能需要进一步评估其实际样本性能或稳定性。 | 开发一种快速、灵敏、低成本的寨卡病毒检测方法,应对全球健康需求。 | 寨卡病毒及其核酸序列。 | 合成生物学 | 寨卡病毒感染 | NASBA | NA | DNA/RNA序列 | NA | 脚趾开关技术 | 无细胞提取物 | 脚趾开关传感器 | 医学诊断 |
| 190 | 2026-08-06 |
Kappa(κ)Chip: a modular microfluidic device for analyte screening using parallelized assays and a multiple shear rate approach
2025-10-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00349k
PMID:40878128
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型微流控芯片κChip,通过并行化设计和多剪切率方法,实现对多种蛋白质粘附性能的高通量筛选。 | κChip芯片采用并行化设计,可从单一输入流同时进行24次粘附测试,大幅减少实验时间和试剂消耗,并首次结合微加工、微流控、材料科学、合成生物学、多物理场模拟和机器学习,实现对生物粘合剂的快速筛选。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高通量微流控筛选平台,用于评估蛋白质(如疏水蛋白)对底物的粘附性能,并促进新型生物粘合剂的发现。 | 真菌疏水蛋白经工程化展示在细胞表面,用于评估粘附特性。 | 微流控、合成生物学 | NA | 微流控、细胞粘附测试 | 机器学习模型(具体类型未指定) | 粘附性能数据(图像或定量数据) | 24个并行测试(具体样本数量未说明) | NA | 真菌细胞(用于展示疏水蛋白) | 微流控芯片设计(包括微通道和剪切率控制) | 材料科学、生物医学、海洋防污 |
| 191 | 2026-08-04 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-09-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于确定性侧向位移(DLD)的微流控平台,用于通过大小分离叶绿体,实现高效、自动化的叶绿体分离和分类。 | 该平台集成了四个具有不同临界直径的平行DLD阵列,实现带通滤波和同时分离不同大小的叶绿体,提高了可重复性,并避免了传统蔗糖密度梯度方法缺乏精确大小分离的缺点。 | 分离效率在50-85%之间,纯度在17-66%之间,表明仍有提升空间,可能受限于样本复杂性和微流控设计。 | 开发一种基于微流控的叶绿体分离方法,用于植物研究、生物技术和合成生物学应用。 | 叶绿体,大小范围3至8微米。 | 微流控技术 | NA | 微流控DLD技术 | NA | 实验数据 | 叶绿体样本,大小范围3-8微米,未提供具体数量。 | NA | 植物细胞 | NA | 植物研究, 生物技术, 合成生物学 |
| 192 | 2026-08-03 |
Insight into the eminent biotechnological applications of xylanolytic enzymes for sustainable bioprocessing
2025-Aug, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04415-1
PMID:40657403
|
综述 | 本文全面综述了木聚糖的结构、木聚糖酶在降解中的作用及其在造纸、食品、纺织和制药等行业的工业应用,并讨论了通过纳米生物技术和CRISPR/CAS等先进工具提高木聚糖酶热稳定性的方法。 | 整合了纳米生物技术、CRISPR/CAS技术、宏基因组生物勘探、蛋白质工程和合成生物学等前沿方法,用于木聚糖酶的热稳定性提升和应用拓展,并强调了监管框架和标准化对可持续性的重要性。 | 未详细讨论木聚糖酶大规模工业应用的经济可行性和潜在环境风险。 | 全面阐述木聚糖酶在生物技术和可持续生物加工中的多功能作用,并指出未来研究创新方向。 | 木聚糖及其降解酶(木聚糖酶) | 生物技术 | NA | CRISPR/CAS技术、纳米生物技术、宏基因组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢通路(木聚糖降解通路) | 工业生物技术 |
| 193 | 2026-07-30 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
|
研究论文 | 本文研究了5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等修饰碱基对RNA三维折叠景观及结构-功能关系的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变关键连接处的堆积能量而非碱基配对来驱动RNA构象转变,并影响其动力学成熟 | 未涉及其他常见修饰碱基(如假尿苷、N6-甲基腺苷)的影响,且仅在两种特定RNA结构中进行验证 | 阐明碱基修饰对RNA折叠和功能的影响机制,为合成生物学和治疗方法中功能性RNA的开发提供设计原则 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学, 结构生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 图像 | 两种RNA结构 | RNA折纸 | NA | RNA折纸纳米结构, 核酶 | 医学, 合成生物学 |
| 194 | 2026-07-30 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
|
研究论文 | 提出一种利用激光诱导高速微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现按需、可靠且可重复地生成细胞大小脂质体 | 未提及具体局限性 | 开发一种按需生产脂质体的新方法,推动合成生物学和膜科学的发展 | 细胞大小的脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物化学研究,合成生物学 |
| 195 | 2026-07-30 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
|
research paper | 该研究开发了一种正交的α病毒RNA复制系统,能够在哺乳动物细胞中实现RNA基装置的定向进化和达尔文适应 | 首次在哺乳动物细胞中建立正交RNA复制系统用于定向进化,无需宿主基因组干扰,可产生大规模连续多样化RNA文库,并支持达尔文适应性进化 | 目前仅针对RNA基装置进行进化,未验证对DNA基或蛋白质基装置的适用性;系统复杂性可能影响其普适性和易用性 | 开发哺乳动物细胞中高效、可控的RNA定向进化平台 | RNA基装置(如荧光蛋白和转录因子) | synthetic biology | NA | RNA replication, directed evolution | NA | NA | NA | NA | mammalian cells | orthogonal alphaviral RNA replication system | synthetic biology, cell engineering |
| 196 | 2026-07-29 |
Engineered probiotics: a new era in treating inflammatory bowel disease
2025-11-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07271-y
PMID:41188868
|
综述 | 总结了工程益生菌在炎症性肠病诊断和治疗中的最新研究进展,探讨其通过基因编辑工具构建以调节肠道微环境的机制 | 首次全面阐述利用CRISPR-Cas9等基因编辑工具构建的工程益生菌在IBD治疗中的多种机制,包括靶向递送抗炎因子、清除活性氧、恢复屏障完整性和调节微生物稳态,并结合智能响应系统实现实时监测和动态释放治疗分子 | 文中提及主要为临床前研究,缺乏大规模临床试验验证,可能存在的长期安全性和免疫原性问题未详细讨论 | 总结工程益生菌在炎症性肠病诊断和治疗中应用的进展,为微生物组驱动的IBD治疗干预提供见解 | 工程益生菌及其在炎症性肠病治疗中的应用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 多种微生物(具体种类未指定) | 智能响应型工程益生菌回路,包括靶向递送抗炎因子、清除活性氧、恢复屏障功能和调节微生物稳态 | 医药 |
| 197 | 2026-07-29 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
|
综述 | 全面概述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的应用 | 系统整合了植物转座因子的功能机制与前沿生物技术应用,为作物育种和植物合成生物学提供新视角 | 未提及具体实验验证或定量比较不同转座子方法的优缺点 | 综述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的发现、机制与技术应用 | 植物转座因子 | 基因组学 | NA | 功能基因组学、表观遗传调控 | NA | 基因组序列 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 198 | 2026-07-29 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-05-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
|
研究论文 | 本研究介绍Ponceau S作为蛋白质液-液相分离的选择性调节剂,并在牛血清白蛋白和溶菌酶中监测相分离过程 | 首次发现Ponceau S可作为蛋白质液-液相分离的靶向调节剂,同时利用其荧光增强特性实现相分离的可视化监测 | 仅针对两种模型蛋白进行研究,缺乏在复杂细胞环境中的验证 | 探索小分子Ponceau S对蛋白质液-液相分离的精确调控能力 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 机器学习 | NA | 荧光光谱分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物分子工程、药物递送、合成生物学 |
| 199 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
|
综述 | 探讨合成生物学和生物材料在改善CAR-T细胞免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料作为精准递送载体、人工抗原呈递细胞和高通量筛选平台,结合合成生物学电路设计增强CAR-T细胞在肿瘤微环境中的功能 | NA | 通过合成生物学和生物材料技术克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的局限性 | CAR-T细胞免疫疗法和肿瘤微环境 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成生物学电路设计用于增强CAR-T细胞功能 | 医学 |
| 200 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-05-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
|
研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子(特别是非天然氨基酸)的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降,且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性,为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |