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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-05-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2026-07-24 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-06-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 利用合成生物学与化学结合的方法,设计并研究具有抗菌活性的生物基羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物库 | 首次将真菌宿主异源生产的单体前体与化学修饰及开环聚合相结合,合成出具有抗菌和生物膜破坏能力且可降解的聚合物材料 | 具体聚合物对微生物的长期稳定性及体内应用效果未充分探讨 | 开发具有抗菌活性的可降解生物基聚合物,对抗抗生素耐药性 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-co-丙交酯聚合物 | 合成生物学与材料化学 | 细菌感染及相关耐药性疾病 | 异源表达、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据(聚合度、抗菌活性测试结果) | 不同聚合度(M/I = 5-30)的聚合物样品 | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 真菌宿主 | 羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物的合成代谢通路 | 医药 |
| 203 | 2026-07-24 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发一种不改变内源基因编码序列即可实现基因感测与响应的方法 | 通过将生物传感器整合到内源基因的终止子区域而不修改其编码序列,利用sgRNA激活下游电路,避免了传统方法可能对内源基因调控的不可预测影响 | 该方法可能依赖于特定宿主细胞类型(如CHO-K1细胞),且传感器响应的调谐范围可能存在限制 | 开发一种平台技术,用于不改变内源基因编码序列的条件下实现基因感测与响应控制 | CHO-K1细胞中的内源基因及其终止子区域 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基因传感器整合 | 数学模型用于预测传感器响应 | 基因表达数据 | NA(主要基于工程化的CHO-K1细胞系) | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 细胞应激传感器与致动器电路,通过下游电路条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞疗法 |
| 204 | 2026-07-24 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-02-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 探讨合成生物学与人工智能在作物改良中的应用,综述了工程原理、遗传电路设计方法及未来发展方向 | 系统性地将人工智能驱动的合成生物学路径应用于植物工程,并提出开发SMART作物的概念 | 尚未有系统性综述整合AI与合成生物学的作物改良途径 | 探索作物合成生物学的工程原理及其在作物改良中的应用,并展望AI增强的合成生物技术 | 作物(包括光合效率、植株结构、代谢途径、环境适应性、养分吸收等性状) | 机器学习和数字农业 | NA | 基因编辑、合成核酸技术、合成蛋白技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 作物(植物) | 遗传电路(包括基因编辑、合成核酸和蛋白质回路、代谢通路设计) | 农业 |
| 205 | 2026-07-23 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-07-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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研究论文 | 探讨基于细菌的免疫疗法作为癌症治疗的经济替代方案,以降低全球医疗成本 | 结合合成生物学与人工智能技术,开发低成本(每剂<10美元)、无需冷链的细菌疗法,实现相比细胞疗法超过30000倍的成本节约 | 未具体说明细菌疗法的临床有效性和安全性数据,以及大规模生产的可行性挑战 | 解决癌症治疗中昂贵免疫疗法的可及性问题,提出细菌免疫疗法作为经济可行替代方案 | 癌症患者群体及全球癌症护理系统 | 机器学习 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌免疫治疗回路 | 医学,工业生物技术 |
| 206 | 2026-07-23 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-04-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 从七叶一枝花中鉴定4'-O-鼠李糖基转移酶并实现甾体三糖苷的生物合成 | 首次鉴定七叶一枝花中负责4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶,并通过半理性设计获得酶活性增强的突变体;利用合成生物学在烟草中重建了甾体皂苷二辛苷的生物合成途径 | 在烟草中重建的合成系统产量相对较低(3.12±0.11 μg/g干重),且UGT73DY2对底物具有严格特异性 | 阐明七叶一枝花甾体皂苷中4'-O-鼠李糖基化的生物合成机制,并开发异源生产方法 | 七叶一枝花中的甾体皂苷及其糖基转移酶UGT73DY2 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, 分子动力学模拟, 亚细胞定位分析, 共表达 | NA | 序列数据 | NA | 半理性设计, 合成生物学 | 本氏烟草 | 二辛苷生物合成途径 | 医药 |
| 207 | 2026-07-22 |
A long road ahead to reliable and complete medicinal plant genomes
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57448-8
PMID:40032878
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综述 | 该论文综述了长读长测序技术推动药用植物基因组学发展的现状,指出当前基因组组装和注释中存在的缺陷 | 提出在完善现有基因组的基础上,借鉴作物基因组学经验并应用前沿技术,重点关注多样化品种的完整基因组组装 | 仅讨论了基因组组装和注释的改进方向,未深入涉及具体的实验验证或应用案例 | 推动药用植物基因组学的发展,实现高质量完整基因组以支持次级代谢产物相关基因的鉴定和合成生物学应用 | 药用植物基因组 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序,基因组组装 | NA | 基因组数据 | 截至2025年2月,来自203种植物的400多个基因组 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 208 | 2026-07-22 |
Harnessing the polysaccharide production potential to optimize and expand the application of probiotics
2025-02-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.122951
PMID:39643409
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综述 | 这篇综述总结了用于多糖生产的益生菌底盘和遗传工具,介绍了通过代谢工程和合成生物学策略优化益生菌多糖合成的方法及其在食品、医药等领域的应用 | 系统性地归纳了合成生物学技术提高益生菌多糖产量、控制分子量及合成非天然多糖的策略,并探讨了外源和内源多糖对益生菌稳定性、生物活性和治疗效果的作用 | 未提及具体实验数据或定量比较不同策略的效果,缺乏对现有技术局限性的详细分析 | 优化和扩大益生菌多糖的生产潜力以促进其在生物技术中的应用 | 益生菌及其生产的多糖 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 食品, 医药, 工业生物技术 |
| 209 | 2026-07-20 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-10-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
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综述 | 该文章综述了紫杉烷类化合物的生物合成途径、多样性及其在合成生物学和工程化生产方面的研究进展 | 提出了通过人工智能引导的定向进化改造细胞色素P450酶、利用植物或微生物底盘以及基因回路技术来扩大紫杉烷类化合物库和可持续生产的策略 | 论文未提供实验验证,仅为策略性综述,缺乏具体实施结果和实际产率数据 | 阐明紫杉烷类化合物的生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类化合物及其生物合成途径中的关键酶,如二萜合酶、细胞色素P450酶、乙酰转移酶和BAHD酰基转移酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因调控、人工智能引导的定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi-dCas9基因回路、代谢分区化技术 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢通量调控回路、代谢分区化酶复合体 | 医学 |
| 210 | 2026-07-19 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-05-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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研究论文 | 通过设计生物相容性前体,精确调控细胞内量子点的合成,实现细胞长期追踪 | 发现细胞适应性硒代胱氨酸可被还原为低毒硒前体,与及时添加的Ag-谷胱甘肽结合生成近红外AgSe量子点,抑制细胞毒性物质产生并显著提高细胞活力和量子点荧光强度 | NA | 实现细胞内近红外量子点的生物相容性合成,并维持细胞增殖和肿瘤发生能力以用于长期追踪 | 细胞及其合成的近红外AgSe量子点 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 图像 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生物相容性前体耦合法用于细胞内量子点合成 | 医学, 生物成像 |
| 211 | 2026-07-14 |
Ultrasensitive Multiplexed Detection of Protein Biomarkers via Aptamer-Driven T7 RNA Polymerase Amplification
2025-11-04, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04805
PMID:41123957
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研究论文 | 报道了一种通过适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增系统,实现血清中蛋白生物标志物的超灵敏、双通道可视化检测 | 将蛋白响应核酸电路与等温RNA转录结合,利用荧光RNA-染料复合物产生红绿荧光信号,实现免仪器的超灵敏多靶标检测,并通过红绿荧光逻辑门直观解读结果 | 未明确提及局限性,但可能涉及适配体筛选的复杂度、临床样本中基质效应及长期稳定性等潜在挑战 | 开发一种简单、高灵敏、无干扰的蛋白生物标志物多重检测方法,用于早期诊断和精准医疗 | 以甲胎蛋白和人血清白蛋白为模型蛋白的生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌(甲胎蛋白相关) | 适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增 | NA | 荧光信号数据 | 加标和临床样本验证,回收率90%-110%,与ELISA结果高度一致 | NA | NA | 适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增电路,产生荧光RNA-染料复合物,实现逻辑门操作 | 医学 |
| 212 | 2026-07-14 |
Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing
2025-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003
PMID:40645879
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综述 | 综述了CRISPR技术在基因组编辑之外的应用扩展,涵盖分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用图谱和单细胞分析等领域 | 系统总结了CRISPR技术从基因组编辑向多领域拓展的最新进展,特别是结合合成生物学、AI和空间组学的交叉应用 | 当前CRISPR技术在临床转化中仍存在脱靶效应、递送效率低和特异性不足等限制,需进一步研究克服 | 全面阐述CRISPR技术在基因组编辑之外的多样化应用及其未来发展方向 | CRISPR-Cas系统及其相关技术(如dCas蛋白、侧切活性等) | 分子生物学、合成生物学 | NA | CRISPR, Cas酶, 侧切活性, 催化失活Cas蛋白, CRISPR引导邻近标记, 单细胞CRISPR筛选 | NA | 核酸、离子、代谢物、蛋白质、空间组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13, dCas9, dCas13 | NA | NA | 分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用分析、单细胞分析 |
| 213 | 2026-07-14 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面综述了甘草属植物的分类学、药理学、活性成分生物合成及合成生物学,旨在为甘草的分子育种和合成生物学研究提供基础 | 整合了甘草属植物的系统分类、多组学研究及生物合成途径,特别强调了代谢工程和微生物绿色生产在提高活性成分产量中的应用 | 未提及具体的研究数据或实验验证,依赖于现有文献的总结 | 提供甘草属植物的综合视角,促进分子育种和合成生物学领域的发展 | 甘草属物种、活性成分(三萜类、黄酮类、多糖)及其药理活性 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径 | 医药、资源保护 |
| 214 | 2026-07-14 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 在毕赤酵母中设计和构建光调控基因转录与蛋白质翻译系统 | 首次在毕赤酵母中构建了光调控的基因转录和蛋白质翻译双系统,通过光敏传感器和稀有密码子刹车设计实现精确调控 | 光调控系统的性能优化可能依赖于特定配置(如LRE位置和拷贝数),且可能未在复杂蛋白表达场景中验证 | 开发具有优异表达能力和光敏感性的光调控基因转录与蛋白质翻译系统,以优化毕赤酵母在生物技术和合成生物学中的应用 | 光调控基因转录和蛋白质翻译系统 | 合成生物学 | NA | 光调控基因表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 光敏传感器(WC-1)、顺式元件(LRE)设计、稀有密码子刹车 | 毕赤酵母(P. pastoris) | 光诱导启动子、光抑制启动子、光抑制翻译系统(稀有密码子刹车) | 生物技术、合成生物学 |
| 215 | 2026-07-13 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-03-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本研究展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性引发原子转移自由基反应,实现丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸类单体在胞内聚合 | 首次证实细菌细胞可利用天然生物分子引发胞内自由基聚合,提供了一种新的细胞工程和合成生物学工具 | 仅使用了有限类型的单体(丙烯酰胺、丙烯酸、甲基丙烯酸类),未探索更广范围的单体和聚合条件 | 探究细菌细胞作为活催化剂进行胞内自由基聚合的可行性及细胞相容性 | 细菌细胞(具体菌种未在摘要中明确指定) | 合成生物学 | NA | NMR, GPC, 荧光标记, 荧光显微镜, 流式细胞术 | NA | 图像, 光谱, 色谱数据 | NA | NA | 细菌(未具体指定) | 胞内自由基聚合体系(基于原子转移自由基聚合引发剂) | 细胞工程, 合成生物学 |
| 216 | 2026-07-10 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-12, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
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综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症免疫治疗中的应用 | 系统总结了脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶及智能纳米载体等纳米平台在细胞因子靶向、可控和持续递送中的创新设计,并探讨其与免疫检查点抑制剂、化疗、放疗及细胞治疗的协同作用 | 面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性和制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送能否克服传统细胞因子疗法的局限性并提升胃肠道癌症免疫治疗效果 | 胃肠道癌症(结直肠癌、胃癌、食管癌)中的细胞因子免疫治疗 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 纳米递送技术 | NA | 文献综述资料 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 217 | 2026-07-10 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中甲萘醌前体DHNA的合成受遗传、酶学和代谢的联合调控机制,平衡其生长益处与毒性 | 首次阐明微生物中醌类水平通过可逆通量与别构反馈抑制的相互作用实现两相调控模式,并发现MenF与MenD的相对表达比例决定调控酶的角色 | 研究仅限于乳酸菌中的DHNA合成途径,未探索其他醌类或微生物系统中的普适性 | 探究微生物调控醌类水平的机制,为代谢工程优化醌类生产提供理论基础 | 乳酸菌中甲萘醌前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的合成调控 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 甲萘醌前体DHNA的生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 218 | 2026-07-10 |
Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01976-25
PMID:40824035
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和适应性实验室进化,使工业相关土壤细菌恶臭假单胞菌能够利用甲酸和甲醇作为唯一碳源和能源,实现严格的一碳代谢 | 首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸和甲醇营养型生长,通过线性还原性甘氨酸途径和进化工程拓展了该菌株的底物利用范围 | 初始菌株在混合营养条件下培养,进化后菌株的倍增时间较长,甲酸和甲醇的生长速率仍有优化空间 | 构建能高效利用甲酸和甲醇作为唯一碳源的恶臭假单胞菌菌株 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 代谢工程,适应性实验室进化 | NA | 基因组数据 | 多个工程菌株,包括rG·F和rG·M菌株,具体数量未提供 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 线性还原性甘氨酸途径 | 工业生物技术 |
| 219 | 2026-07-10 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 利用合成生物学改造费氏弧菌,使其能够生物修复含盐废水和土壤中的复杂有机污染物 | 通过插入tfoX基因增强DNA吸收和整合能力,并结合酵母组装和迭代自然转化方法,成功向费氏弧菌中转移五个总长43kb的降解基因簇,实现对联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯等多种有机污染物的同时降解 | 未提及 | 开发能够高效降解复杂有机污染物且耐盐的工程菌株,用于含盐废水和土壤的生物修复 | 费氏弧菌菌株Vmax | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酵母组装、迭代自然转化 | NA | NA | 实验室废水样品(来自氯碱厂和石油炼厂) | CRISPR-Cas9 | 费氏弧菌(Vibrio natriegens) | 代谢途径(降解基因簇) | 环境 |
| 220 | 2026-07-10 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-01-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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research paper | 利用合成生物学研究种子植物中独脚金内酯物种间生物合成的进化 | 发现CYP722A酶将香豆酸转化为16-羟基香豆酸(非经典SL),并证明其在进化上是经典独脚金内酯生物合成的前体 | NA | 阐明种子植物中独脚金内酯生物合成的进化机制 | 独脚金内酯生物合成途径中的CYP722A和CYP722C酶 | 植物生物学, 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NB | NA | 合成生物学 | NA | 独脚金内酯生物合成途径 | 农业 |