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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-05 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Sep-12, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
|
综述 | 本文探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战及突破性进展 | 整合合成生物学与基因工程技术开发新一代CAR-T疗法,增强细胞适应性、靶向能力和抗肿瘤效果 | 现有临床前模型(如免疫缺陷小鼠异种移植模型)在评估疗效和安全性方面存在局限性 | 克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的障碍并推动临床应用 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学,基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 多抗原靶向系统,肿瘤微环境重编程 | 医学 |
| 202 | 2025-10-05 |
From marsh to market: taming Vibrio natriegens for sustainable bioproduction
2025-Sep-11, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103353
PMID:40945411
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综述 | 本文探讨了利用天然最快生长细菌Vibrio natriegens作为生物技术底盘实现可持续生物生产的发展前景 | 提出通过系统生物技术方法结合菌株与工艺工程,优化Vibrio natriegens用于可扩展的新一代生物制造 | 在实现高产品产量和处理难降解底物方面仍存在重要限制 | 开发Vibrio natriegens作为可持续生物生产的生物技术底盘 | Vibrio natriegens细菌及其生物合成能力 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、系统水平分析 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | Vibrio natriegens | 代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 203 | 2025-10-05 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文系统分析DNA纳米结构在刺激响应型药物递送和多模式生物传感中的创新应用 | 重点阐述DNA纳米结构对肿瘤微环境刺激的动态响应能力及其在多模式检测中的创新应用 | 存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等关键转化挑战 | 解决精准医疗中靶向药物递送和生物医学成像的关键挑战 | DNA工程纳米结构(包括瓦片组装体、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶) | 合成生物学 | 癌症 | FRET探针、电化学发光放大电路、SERS底物、细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 刺激响应型药物递送系统、多模式生物传感电路 | 医学 |
| 204 | 2025-10-05 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
|
综述 | 介绍生物分子技术领域的最新进展及其在基础科学和实际应用中的机会 | 汇集了基于工程生物分子的多种技术,涵盖小分子、核酸和蛋白质,展示生物分子设计的模块化和可调性 | NA | 概述生物分子技术在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | 工程生物分子(小分子、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 205 | 2025-10-05 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
|
研究论文 | 本研究揭示了植物中苄基异喹啉生物碱(BIA)生物合成途径的保守性与多样化机制,重点关注基因复制和基因簇形成的作用 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的酚偶联反应,揭示了BIA骨架形成基因在木兰类和毛茛目之间的保守性,并发现CYP80B与4'OMT、6-OMT基因的动态簇聚现象 | 研究主要集中于蕺菜(Houttuynia cordata),对其他木兰类植物的BIA生物合成研究仍较少 | 探究植物中苄基异喹啉生物碱生物合成的进化机制和基因组织方式 | 蕺菜(Houttuynia cordata)及其他被子植物中的BIA生物合成基因 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析、酶学表征 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 206 | 2025-10-05 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 提出一种生物分子自适应控制器,通过合成生物学方法优化干细胞分化过程中的细胞命运决策 | 设计了一种类似非相干前馈环(IFFL)拓扑结构的自适应控制器,无需详细内源网络机制知识即可实现细胞命运偏置 | 需要足够的隔离速率才能实现理想的微分输出特性,且性能受参数扰动影响 | 优化基于干细胞的治疗方法,提高特定细胞类型的产量 | 干细胞分化过程中的细胞命运决策机制 | 合成生物学 | 创伤或疾病相关的细胞替代治疗 | 合成基因电路设计 | 自适应控制器 | 理论分析和计算模拟 | NA | 合成基因电路 | 干细胞 | 基于隔离机制和中间物种延迟的非相干前馈环(IFFL)拓扑结构 | 医学 |
| 207 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
|
研究论文 | 利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌Kay病毒进行结构修饰,实现成像和生物传感应用 | 首次报道葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,开发了双菌株编辑策略结合CRISPR-Cas10反选系统 | 仅针对812h1噬菌体进行验证,未测试其他噬菌体系统的适用性 | 开发噬菌体结构蛋白工程化方法并验证其生物应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1及其尾部鞘蛋白 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、同源重组、荧光显微镜、生物层干涉术、ELISA、流式细胞术 | NA | 图像数据、生物传感数据 | NA | CRISPR-Cas10 | 葡萄球菌噬菌体 | 在尾部鞘蛋白暴露环中插入多组氨酸标签 | 医学,纳米技术,合成生物学 |
| 208 | 2025-10-05 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
|
研究论文 | 本研究通过优化FapR/FapO生物传感器,开发了一种用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性的重构无细胞系统 | 通过工程化T7启动子与FapO操纵子间的间隔序列,开发了具有宽检测范围(50-1500 μM)的无细胞丙二酰辅酶A生物传感器系统,最大动态范围达到95.3倍 | NA | 开发高灵敏度的丙二酰辅酶A生物传感器用于ACC的高通量筛选和定向进化 | FapR/FapO生物传感器系统和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统,定向进化,高通量筛选 | NA | 荧光信号数据 | NA | 启动子工程,同源筛选 | NA | FapR/FapO生物传感器系统,可将丙二酰辅酶A浓度转换为荧光信号 | 工业生物技术,医药 |
| 209 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
|
研究论文 | 本研究利用自主生物发光技术优化了三种双生病毒载体在植物合成生物学中的应用 | 首次使用自主生物发光作为实时报告系统来表征双生病毒载体的基因表达特性 | BCTV载体表现出较差的表达控制水平 | 优化双生病毒载体作为植物生物技术工具 | 菜豆黄矮病毒(BeYDV)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 生物发光信号数据 | 三种双生病毒复制子系统 | Gibson Assembly | 植物 | 合成复制子、多基因表达系统 | 农业,工业生物技术 |
| 210 | 2025-10-05 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
|
研究论文 | 本研究通过工程化细胞分裂素调节因子实现对植物根系发育的精确调控 | 利用工程化B型响应调节因子调控细胞分裂素依赖性生长发育过程,通过组织特异性启动子实现可预测的表型调控 | 未提及具体局限性 | 开发精确控制植物发育表型的合成生物学工具 | 植物根系发育,特别是侧根数量的调控 | 合成生物学 | NA | 基因工程,组织特异性表达 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 植物 | 工程化转录因子调控网络,组织特异性表达系统 | 农业 |
| 211 | 2025-10-05 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
|
研究论文 | 开发了结合预印本分析和实验实践的主动学习工作流程,以改善合成生物学教学体验 | 使用预印本作为教育资源让学生批判性分析手稿与最终发表作品的差异,并设计基于CRISPRi基因电路的实践实验环节 | NA | 改进合成生物学的教学方法,提升学生的学习体验和技能 | 大学生 | 合成生物学教育 | NA | CRISPRi | NA | 教育反馈数据 | 学生群体(具体数量未明确说明) | CRISPRi | NA | 基于CRISPRi的基因电路 | 教育 |
| 212 | 2025-10-05 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
|
研究论文 | 提出一种结合机器学习的RNA传感器设计方法Toehold-VISTA,用于快速设计高性能RNA传感器 | 将传感器和靶标RNA的生物物理建模与PLS-DA机器学习框架相结合,通过高通量实验数据训练预测模型 | NA | 加速RNA传感器在生物技术和诊断应用中的工程设计 | RNA传感器与靶标RNA的相互作用 | 机器学习 | COVID-19 | 高通量实验测量、序列结构特征提取 | PLS-DA | RNA序列和结构数据 | NA | toehold switches | NA | RNA生物传感器 | 生物技术, 诊断 |
| 213 | 2025-10-05 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
|
研究论文 | 开发用于蛋白质结构预测和设计工具的容器化解决方案,以解决高计算需求和部署难题 | 开发了针对多种计算架构优化的容器化解决方案,并创建了OmniFold包装平台实现多工具并行运行和自动质量报告生成 | 未提及具体性能提升的量化数据或与其他部署方法的直接比较 | 解决蛋白质结构预测和设计工具的高计算需求和部署困难问题 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion等蛋白质结构预测和设计工具 | 计算生物学 | NA | 容器化技术、GPU优化计算 | 深度学习模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、疾病治疗 |
| 214 | 2025-10-05 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
|
研究论文 | 本文证明肽凝聚层可通过液-液相分离形成无膜细胞器,有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的关联性凝聚层能高效保护寡核苷酸,并可通过离子强度或温度变化实现可控释放 | 基于黏附-间隔模型肽的简单凝聚层保护效果有限 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传物质的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 215 | 2025-10-05 |
Expanding Immunotherapy Beyond CAR T Cells: Engineering Diverse Immune Cells to Target Solid Tumors
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172917
PMID:40941014
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综述 | 本文综述了除CAR-T细胞外多种工程化免疫细胞在实体瘤治疗中的最新进展 | 探讨γδ T细胞、iNKT细胞、病毒特异性T细胞、NK细胞及髓系效应细胞等作为CAR平台替代方案的独特优势 | NA | 扩展细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的应用范围 | 工程化免疫细胞(γδ T细胞、iNKT细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CAR工程技术 | 人类免疫细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 216 | 2025-10-05 |
One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.28.672974
PMID:40909620
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研究论文 | 开发了一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台 | 将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译系统结合,实现无需中间纯化或细菌扩增的遗传变异高效生成与筛选 | NA | 建立高通量克隆和蛋白质工程的通用自动化方法 | 荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术 |
| 217 | 2025-10-05 |
Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development
2025-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178292
PMID:40943213
|
综述 | 系统总结油菜除草剂抗性分子机制及抗性种质开发策略 | 首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的应用潜力 | NA | 为抗除草剂油菜的可持续发展提供安全有效的创新方法指导 | 油菜及其除草剂抗性机制 | 农业生物技术 | NA | 基因编辑、合成生物学、定向蛋白进化、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 油菜 | NA | 农业 |
| 218 | 2025-10-05 |
Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178119
PMID:40943047
|
综述 | 本文综述了利用乳酸菌和分子生物学策略释放牛β-酪蛋白中生物活性肽的方法 | 系统整合合成生物学、分子生物技术和系统生物学方法增强β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现与生产 | NA | 提高β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现和生产效率 | 牛β-酪蛋白中的生物活性肽 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统、多组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 诱导型表达平台、无细胞系统 | 食品, 医药 |
| 219 | 2025-10-05 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 开发了一种能够检测和治疗肠道炎症的微生物生物传感器 | 首次开发了针对临床验证生物标志物钙卫蛋白的合成生物传感器,兼具诊断记录和治疗功能 | NA | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物系统 | 肠道炎症生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症疾病 | 合成生物学技术 | NA | 生物分子数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 锌摄取调节因子(Zur)控制启动子与记忆电路耦合的生物传感器,结合抗炎细胞因子IL10产生系统 | 医学 |
| 220 | 2025-10-05 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全和生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险分析扩展为定量评估,构建了针对iGEM项目的攻击树模型 | 主要针对中低风险场景,且参与者经验相对不足可能影响评估准确性 | 评估合成生物学项目中的生物安全和生物安保风险 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | 攻击树模型 | 项目风险评估数据 | 2022年iGEM项目 | iGEM | NA | NA | 生物安全 |