合成生物学相关文章
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当前共找到 491 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-03-17 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Mar-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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评论 | 本文描述了一个分析学术界与产业界在合成生物学领域接口的研讨会 | 强调了从学术研究到成功生物技术企业的转化过程中各组成部分的必要性和协作性 | 未提及具体的研究数据或案例 | 探讨如何将学术研究转化为成功的生物技术企业 | 学术界与产业界在合成生物学领域的合作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2025-03-16 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-Mar, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文综述了玉米中氮素吸收、同化和再分配的遗传和分子调控机制，强调了关键基因和代谢途径在提高氮利用效率（NUE）中的作用 | 深入探讨了玉米根系发育与氮素分布的适应性关系，以及根际微生物对NUE的影响和植物-微生物相互作用的复杂调控 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于已有研究的综述 | 提高玉米氮利用效率（NUE），推动可持续农业发展 | 玉米 | 植物分子生物学 | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA |
| 203 | 2025-03-16 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
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研究论文 | 本文介绍了一种名为逻辑“与”门双靶点基因电路（LAG-DTGC）的合成基因电路，用于膀胱癌治疗 | LAG-DTGC通过整合多个信号实现对膀胱癌细胞中多种信号通路的全面重编程，利用逻辑“与”门仅在特定癌症生物标志物异常表达时激活电路 | 研究处于临床前阶段，尚未进行人体试验 | 开发一种精确、低毒的膀胱癌治疗方法 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析 | 逻辑“与”门双靶点基因电路（LAG-DTGC） | 基因表达数据 | NA |
| 204 | 2025-03-16 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
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研究论文 | 本文对酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的冻融耐受基因集进行了系统表征和分析，以优化低温培养条件下的生物合成效率 | 首次在统一的遗传背景下（BY4741实验室菌株）对冻融耐受基因家族进行标准化表征，揭示了这些基因在冻融和热激应激下的生存能力增强 | 研究仅限于BY4741实验室菌株，未涵盖其他遗传背景的酵母菌株 | 研究冻融耐受基因在低温培养条件下对酵母生存能力的影响，以优化生物合成效率 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的冻融耐受基因 | 合成生物学 | NA | 基因突变技术（KanMX6抗性盒） | NA | 基因表达数据 | BY4741实验室菌株及其突变体 |
| 205 | 2025-03-16 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
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综述 | 本文综述了真核生物中5'非翻译区（5' UTR）在翻译控制中的结构特征及其功能影响 | 详细阐述了5' UTR的结构特征如何独立或通过反式作用因子调节翻译，并探讨了其在合成生物学和基于mRNA的靶向治疗中的潜在应用 | NA | 探讨5' UTR在真核生物翻译控制中的作用及其在生物医学中的潜在应用 | 真核生物的5'非翻译区（5' UTR） | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2025-03-15 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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研究论文 | 本文提出了一种新的可解释性框架GELKcat，用于预测酶转换数（kcat），结合了预训练的酶嵌入和自适应门网络 | 开发了一种端到端的双表示可解释性框架GELKcat，利用图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入，并通过自适应门网络整合底物和酶特征 | NA | 提高酶转换数（kcat）预测的准确性和可解释性，以支持合成生物学和早期药物发现 | 多物种酶-底物对的转换数数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图变换器、CNN、自适应门网络 | 分子数据、酶嵌入数据 | NA |
| 207 | 2025-03-15 |
Unleashing the potential of biotechnological strategies for the sustainable production of microalgal polysaccharides
2025-Mar-14, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2475240
PMID:40084718
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综述 | 本文探讨了利用生物技术策略可持续生产微藻多糖的潜力 | 提出了利用合成生物学和代谢工程克服微藻多糖生产中的技术生物复杂性，并实现大规模生产的关键策略 | 尽管合成生物学有进展，但微藻产品的商业化生产仍未被充分利用 | 探索可持续的生物原料，特别是通过光合作用生产多糖的微藻，以实现碳封存和绿色生产有价值的代谢物 | 微藻及其多糖生物合成途径 | 生物技术 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA |
| 208 | 2025-03-15 |
RmZHD Surface-Displayed Escherichia coli for High Efficiency and Low-Cost Degradation of Zearalenone
2025-Mar-13, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c01994
PMID:40080174
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研究论文 | 本文构建了一种基于合成生物学和表面展示方法的工程化大肠杆菌，用于高效低成本降解玉米赤霉烯酮（ZEN） | 该工程化大肠杆菌无需额外操作即可表面展示RmZHD酶，且生产成本低，能在1小时内降解94%的ZEN，并有效降解ZEN衍生物 | NA | 开发一种高效、低成本且环境可持续的ZEN降解方法，适用于工业规模应用 | 玉米赤霉烯酮（ZEN）及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 表面展示方法 | NA | NA | NA |
| 209 | 2025-03-15 |
Identification, Characterization, and Catalytic Mechanism of Regioselective UbiA Prenyltransferases in Morus Plants
2025-Mar-13, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504190
PMID:40080387
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研究论文 | 本文研究了桑树中UbiA预酰基转移酶的识别、表征及其催化机制，特别是区域选择性的精确控制 | 通过分子对接、动力学模拟和量子化学计算揭示了底物诱导的构象变化，以及不同MaPTs与moracin M之间的差异结合，并讨论了预酰基供体的识别和区域选择性逆转的潜在机制 | 尽管识别了10种MaPTs，但其催化机制，特别是区域选择性的精确控制仍不完全清楚 | 研究桑树中UbiA预酰基转移酶的催化机制，特别是区域选择性的控制 | 桑树中的UbiA预酰基转移酶及其底物moracin M | 生物化学 | NA | 分子对接、动力学模拟、量子化学计算 | NA | 分子结构数据 | 10种MaPTs |
| 210 | 2025-03-15 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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研究论文 | 本文综述了利用合成生物学策略创建人工微生物群落的最新进展，特别是通过光遗传学技术在酵母群落中实现空间和时间调控的创新应用 | 利用光遗传学技术通过光刺激在群落水平上操纵关键酵母表型，实现了前所未有的空间和时间调控 | NA | 探索自然系统的复杂性及其相互作用的机制，推动代谢工程策略的创新 | 人工微生物群落，特别是酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 211 | 2025-03-15 |
A globular protein exhibits rare phase behavior and forms chemically regulated orthogonal condensates in cells
2025-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57886-4
PMID:40069234
|
研究论文 | 本文发现了一种具有化学可调节相分离特性的球状蛋白，其在体外和细胞内形成正交凝聚体，并可通过小分子调控 | 发现了一种具有罕见LCST型可逆相分离特性的球状蛋白LplA，并展示了其在细胞中形成正交凝聚体的能力 | 研究主要集中于LplA蛋白的相行为及其调控机制，尚未探讨其在更广泛生物医学应用中的潜力 | 研究蛋白质的相分离行为及其在合成生物学和生物医学中的应用 | 球状蛋白LplA及其在E. coli和人类U2OS细胞中的相行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | E. coli和人类U2OS细胞 |
| 212 | 2025-03-15 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Mar-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
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review | 本文探讨了影响寿命的基因回路，并强调了反馈回路在维持细胞平衡中的作用 | 通过系统生物学和合成生物学的方法，提出了稳定单细胞中反馈回路的策略，以增强其对衰老相关损伤的抵抗力 | 主要基于酵母模型，可能不直接适用于其他生物体 | 探索基因回路如何影响寿命，并提出延长寿命的策略 | 基因回路，特别是SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 213 | 2025-03-15 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Dsembler的基于网络的软件应用，旨在组装长DNA序列，以解决合成生物学中的基因组装挑战 | Dsembler通过提供具有最佳熔解温度和GC重叠的寡核苷酸集合，提高了寡核苷酸设计的准确性，解决了合成生物学中的关键挑战 | NA | 开发一种工具以促进寡核苷酸的组装，支持合成生物学、基因工程和分子生物学的进步 | 长DNA序列的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | NA |
| 214 | 2025-03-15 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-Feb-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在作物改良中的应用，包括基因电路设计、基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程和AI等策略 | 首次系统性地综述了AI驱动的合成生物学在植物工程中的应用，并提出了通过AI赋能的合成生物技术开发SMART作物的概念 | 尚未解决合成生物学发展中的挑战，如技术复杂性和伦理问题 | 探讨合成生物学和人工智能在作物改良中的应用，以提高作物产量、营养吸收、抗逆性和营养质量 | 作物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程 | AI | 基因数据、蛋白质数据、多组学数据 | NA |
| 215 | 2025-03-15 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNIPR的合成受体架构，用于响应可溶性配体并激活定制细胞功能，展示了其在调节工程治疗细胞活性方面的临床应用潜力 | 开发了一种新型的合成受体平台SNIPR，能够通过内吞和pH依赖的切割机制响应自然和合成的可溶性因子，具有低基线活性和高激活倍数 | 目前仅针对可溶性配体进行了验证，尚未广泛测试其在多种疾病模型中的应用 | 开发模块化的合成受体，以响应可溶性配体并激活定制细胞功能，用于调节工程治疗细胞的活性 | 合成受体SNIPR及其在工程治疗细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成受体工程 | SNIPR | NA | NA |
| 216 | 2025-03-14 |
Advances in innovative extraction techniques for polysaccharides, peptides, and polyphenols from distillery by-products: Common extraction techniques, emerging technologies, and AI-driven optimization
2025-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.143326
PMID:39986087
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review | 本文综述了从酒厂副产品中提取多糖、肽和多酚的创新提取技术，包括传统方法和新兴技术，并探讨了人工智能在优化提取过程中的应用 | 本文的创新点在于综合评估了多种新兴提取技术，如超临界流体提取、加压液体提取、脉冲电场和合成生物学，并探讨了机器学习和人工智能在优化提取参数和扩大生产规模中的潜力 | 本文的局限性在于主要集中于技术综述，缺乏对具体实验数据和实际应用案例的深入分析 | 本文的研究目标是促进酒厂行业的可持续发展，强调经济可行性、环境影响和资源优化，以开发高附加值产品 | 本文的研究对象是酒厂副产品，如酒糟、酒糟液和酒糟渣 | NA | NA | 酶法提取、超声波辅助提取、微波辅助提取、超临界流体提取、加压液体提取、脉冲电场、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | NA | NA |
| 217 | 2025-03-14 |
Emerging biotechnological strategies advancing biological lignin valorization towards polyhydroxyalkanoates
2025-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132278
PMID:39986625
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综述 | 本文综述了木质素转化为高价值产品的整个途径，重点介绍了微生物过程在合成聚羟基脂肪酸酯（PHA）中的优势，并探讨了合成生物学技术和代谢调控策略在增强微生物PHA合成中的应用 | 本文的创新点在于整合了微生物PHA合成与木质素生物转化，不仅促进了木质素的增值利用，还支持了PHA的可持续生产，对生物质资源的利用和可持续发展做出了重要贡献 | 木质素的顽固性和异质性对其微生物降解和增值利用构成了重大挑战 | 研究目的是探讨木质素转化为高价值产品的途径，特别是通过微生物过程合成PHA，并促进木质素的生物升级 | 木质素和聚羟基脂肪酸酯（PHA） | 生物技术 | NA | 合成生物学技术和代谢调控策略 | NA | NA | NA |
| 218 | 2025-03-14 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2025-Mar-12, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文综述了Ectoine作为一种后生元治疗剂的潜力，包括其作用机制、应用及未来发展方向 | 探讨了Ectoine在抗衰老、癌症预防及神经系统疾病治疗中的新应用，并提出了利用人工智能优化其药物配方和临床应用的新方向 | Ectoine在真核细胞中的生物利用度低，工业化生产的可扩展性受限，以及合成生物学方法的高成本 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂在多种疾病管理中的有效性和安全性 | Ectoine及其在鼻炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫性疾病和代谢综合征中的应用 | 生物医学 | 鼻炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫性疾病、代谢综合征 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2025-03-14 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于分析植物生长素激素信号通路的复杂生化特性 | AuxInYeast系统利用酵母作为植物合成生物学底盘，结合荧光蛋白报告基因，通过高通量方法如流式细胞术定量测量信号动态 | NA | 研究玉米生长素激素信号通路的生化特性 | 玉米生长素信号通路的关键组件，包括受体（ZmTIR1/AFB）、阻遏物（ZmIAA）、共阻遏物（REL2）、转录因子（ZmARF）和生长素响应元件（auxRE） | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白报告基因、流式细胞术 | NA | 生化数据 | NA |
| 220 | 2025-03-14 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，以分析玉米生长素信号通路 | 开发了AuxInYeast系统，利用酵母作为异源表达平台，结合荧光标记，实现了对植物生长素信号通路的高通量定量测量 | 该方法主要适用于实验室环境，可能不适用于所有植物种类或复杂的自然条件 | 研究目的是通过合成生物学方法，解析和工程化植物生长素信号通路，以促进玉米的生长和发育 | 研究对象是AuxInYeast菌株，特别是那些用于测量玉米生长素感知的菌株 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未明确 |