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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-07-07 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-07-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
|
研究论文 | 开发CRISPR/dCas介导的反沉默方法,通过将dCas蛋白重新编程为异源沉默因子的拮抗剂,实现对放线菌中Lsr2样沉默蛋白靶基因的精确上调 | 首次利用核酸酶缺陷的dCas酶(dCas9和dCas12a)对抗Lsr2样异源沉默蛋白,无需启动子序列修饰即可实现反沉默,具有高特异性和低脱靶效应 | 不同靶位置和链上存在CRISPR干扰效应的强度差异,可能需要进一步优化gRNA设计以平衡沉默与干扰 | 开发一种不依赖启动子工程的反沉默策略,精确上调异源沉默蛋白靶向的基因表达 | 天蓝色链霉菌中的CgpS沉默蛋白和结核分枝杆菌中的Lsr2沉默蛋白及其靶基因簇 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas介导的反沉默(CRISPRcosi)、全基因组转录组分析 | NA | RNA-seq数据 | 多个天蓝色链霉菌和结核分枝杆菌菌株 | CRISPR-dCas9, CRISPR-dCas12a | 天蓝色链霉菌, 结核分枝杆菌 | CRISPR/dCas介导的反沉默系统(CRISPRcosi),通过gRNA/dCasDNA结合靶向沉默蛋白的成核位点 | 生物技术, 合成生物学 |
| 222 | 2026-07-06 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-06-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 表征一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶,用于苯乙烯的生物合成 | 首次通过真菌阿魏酸脱羧酶的多重序列比对的共识蛋白设计,获得一种高效的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,并解析了其高分辨率的晶体结构(2.1 Å),揭示了关键催化残基 | 苯乙烯对微生物的毒性仍然是一个挑战,且该酶的工业应用还需进一步优化 | 实现从L-苯丙氨酸两步法生物合成苯乙烯,并表征关键酶PSC1的物理化学性质和三维结构 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,以及溶剂耐受菌株DOT-T1E | 合成生物学 | NA | NA | NA | 结构数据(蛋白质晶体结构) | NA | NA | DOT-T1E(溶剂耐受菌株) | 两步法苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→肉桂酸→苯乙烯 | 工业生物技术 |
| 223 | 2026-07-05 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-02-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 提出一种利用肿瘤归巢聚合物实现CAR-T细胞空间激活控制的新框架IMPACT | 首次结合合成生物学与生物材料方法,通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR-T细胞的靶向激活 | 仅在小鼠肿瘤模型中进行了初步验证,未涉及人体临床试验 | 开发一种通过聚合物介导的肿瘤定位策略,以提高CAR-T细胞治疗的特异性并减少脱靶毒性 | CAR-T细胞及肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学, 生物材料 | 肿瘤 | 合成生物学, 生物材料工程 | NA | 动物实验数据 | 小鼠肿瘤模型中的实验样本 | NA | 小鼠 | IF-THEN门控CAR-T细胞电路,通过荧光素标记聚合物触发条件性蛋白表达 | 医学 |
| 224 | 2026-07-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 开发了一种多模块组装先导编辑系统(mPE),显著提高双子叶植物中精确多碱基插入效率 | 首次在双子叶植物中通过拆分PE系统并利用pol II策略表达pegRNA,构建mPE系统,实现高达1288.5倍的效率提升,并能在原始PE2无法编辑的位点进行编辑 | 仅在拟南芥和本氏烟草两种模式植物中验证,尚未在作物或其他双子叶植物中测试,且多碱基插入的改善机制需进一步阐明 | 解决双子叶植物中先导编辑效率低下和不一致的问题 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 数字病理学 | NA | 先导编辑(PE)、农杆菌介导转化、深度扩增子测序 | NA | 序列数据 | 0.2-0.5百万条总清晰读长的深度扩增子测序数据 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装先导编辑系统(mPE) | 农业, 植物合成生物学 |
| 225 | 2026-07-04 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 综述了酿酒酵母在医学应用中的工程化进展,包括药物生产、生物传感器和活体生物治疗产品 | 系统总结了酿酒酵母在医学领域的三类主要应用(药物与疫苗生产、诊断生物传感器、肠道疾病活体治疗)及其学术与商业发展 | 该领域仍面临挑战,但未具体说明主要障碍 | 综述酿酒酵母工程化在医学领域的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 医学 |
| 226 | 2026-07-03 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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研究论文 | 通过挖掘乌头转录组,发现多功能P450酶驱动二萜类化合物结构多样化和功能分化,实现生物活性化合物tripterifordin和隐存atiserenoids的合成 | 首次揭示多功能P450酶催化二萜骨架七个不同位点的氧化,并发现关键残基调控P450活性和产物谱,同时发现tripterifordin在乌头中的趋同进化合成 | 未进一步探索下游二萜途径的详细机制,且体内功能验证可能受限于异源表达系统 | 研究细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构多样化和功能分化 | 乌头(Aconitum carmichaelii 和 Aconitum coreanum)中的二萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 转录组测序,功能验证,蛋白质分析,定点诱变,组合生物合成 | NA | 序列数据 | 两个乌头物种的转录组样本 | NA | NA | 组合生物合成途径,用于生产tripterifordin、guan-fu二萜类化合物A和14种新atiserenoids | 医药 |
| 227 | 2026-07-03 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-06, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计精确的微生物群落以执行特定功能,实现个性化精准治疗 | 需要严格的临床试验来评估工程化微生物群落在不同人群中的安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来根治代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落 | 合成生物学 | 代谢紊乱, 炎症性疾病, 胃肠道感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 人体肠道微生物组 | 人工微生物群落(包含治疗分子产生、免疫调节和抗病原菌等功能模块) | 医学 |
| 228 | 2026-07-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 综述了瘤内微生物群通过炎症和免疫协同重塑肺癌微环境的机制 | 颠覆了传统“无菌肿瘤”观念,揭示了瘤内微生物群通过代谢物分泌、信号通路激活、免疫抑制细胞募集和免疫检查点分子表达上调主动促进肿瘤进展的机制 | 肺组织低生物量特性导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响,且真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明瘤内微生物群在肺癌进展中的作用机制并探索其临床应用潜力 | 肺癌组织和肿瘤微环境中的瘤内微生物群 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 229 | 2026-07-01 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-03-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文概述了利用光遗传学手段调控合成酵母群落的最新进展 | 首次将光遗传学应用于合成微生物群落的时空调控,提出光生态学概念 | 主要基于现有研究总结,未涉及具体实验验证或新方法开发 | 探讨光遗传学在合成酵母群落中的应用潜力及其对复杂生态系统研究的启示 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 光控开关、逻辑门、代谢途径 | 工业生物技术, 环境, 医学 |
| 230 | 2026-06-30 |
Microorganism delivery of cancer vaccines
2025-12-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114288
PMID:41045964
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综述 | 综述微生物介导的癌症疫苗,阐述其与宿主免疫系统的相互作用及抗肿瘤应用 | 综述微生物肿瘤靶向机制及合成生物学在精准表达肿瘤抗原或免疫检查点抑制剂中的应用 | 讨论了微生物癌症疫苗面临的潜在挑战 | 综合介绍微生物癌症疫苗的设计原理、优势及与其它疗法的联合应用 | 微生物(细菌和病毒)及病毒样颗粒在癌症疫苗中的应用 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 病毒 | 微生物癌症疫苗(用于表达肿瘤抗原或免疫检查点抑制剂) | 医学 |
| 231 | 2026-06-30 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-02-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 提出一种名为HEEL的高效酵母文库转化方法,通过热激与电穿孔双重处理提高单转化细胞比例,实现精确的表型-基因型映射 | 首次将热激与电穿孔结合,将单转化细胞比例从20%提升至超过70%,并实现近100倍转化效率提升,结合双条形码及自动化基因分型流程,克服了文库大小与质量之间的长期权衡 | NA | 开发一种高转化效率且能保持高质量单基因型细胞的酵母文库转化方法,促进精确表型-基因型测量,用于改进计算机建模 | 高多样性酵母突变文库 | NA | NA | 热激电穿孔 (HEEL),Sanger测序 | NA | 基因型数据 | NA | NA | 酿酒酵母 (S. cerevisiae) | NA | 分子生物学, 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 232 | 2026-06-29 |
Overcoming barriers in CAR-NK immunotherapy: CRISPR-Driven advances in checkpoint editing and allogeneic design
2025-Dec-17, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01778-9
PMID:41405764
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综述 | 探讨CRISPR技术如何推动CAR-NK免疫疗法发展,重点综述检查点编辑和同种异体设计的进展 | 系统阐述CRISPR/Cas9基因编辑在CAR-NK细胞工程中的多重应用,包括抑制性检查点基因敲除、CAR基因安全位点敲入、多重编辑以及免疫细胞因子武装等创新策略 | CRISPR递送优化、脱靶效应和体内持久性提升仍面临挑战 | 综述CRISPR技术在CAR-NK细胞免疫疗法中的应用进展 | CAR-NK细胞和CRISPR基因编辑技术 | 数字病理学 | 癌症 | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 自然杀伤细胞 | 检查点编辑、同种异体设计、免疫细胞因子武装 | 医学 |
| 233 | 2026-06-26 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-10-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 利用集成学习技术基于分子指纹预测利什曼病活性 | 首次引入集成模型方法用于利什曼病药物发现,结合三种分子指纹算法和多种机器学习模型,实现了83.65%的高精度预测 | 数据集仅来自PubChem数据库,且依赖Alamar Blue法评估,可能限制化合物的多样性;模型尚未经过体外或体内实验验证 | 开发基于机器学习和化学信息学的计算方法,预测化合物抗利什曼原虫前鞭毛体的活性 | 65,057个分子(来自PubChem数据库)以及其抗利什曼原虫活性数据 | 机器学习 | 利什曼病 | 分子指纹编码(Avalon、MACCS Key、Pharmacophore)、Alamar Blue法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 分子结构数据(SMILES符号) | 65,057个分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 234 | 2026-06-26 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-08-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发了一种具有多酶纳米酶活性的仿生脂质体,用于调节外源植入物引起的促炎因子,从而促进组织再生 | 首次将CeO纳米颗粒与人工膜自组装形成仿生脂质体,兼具抗血液成分粘附和调节生化微环境稳态的双重功能 | NA | 设计并构建能在初始移植阶段复制天然细胞功能的治疗性脂质体,用于组织工程中的合成生物学 | 多酶纳米酶脂质体及CeO纳米颗粒 | NA | NA | 自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 235 | 2026-06-26 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-08-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,解析多因素条件下三链DNA的热稳定性和pH稳定性 | 首次预测了不同温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性,并揭示了离子强度对Hoogsteen氢键的双重作用机制 | 未明确提及 | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA稳定性,并建立预测模型 | 三链DNA结构 | 分子生物学、核酸结构生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光信号、熔解温度数据 | 414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 基因靶向治疗、合成生物学应用 |
| 236 | 2026-06-26 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 通过体外重建和突变分析,揭示了两种聚酮链通过非经典缩合结构域融合形成马来环丙醇活性丁烯内酯核心的机制 | 首次阐明硫模板介导的聚酮链头对头融合及还原环化构建丁烯内酯的非常规生物合成途径,扩展了合成生物学工具箱 | 未明确提及该反应在体内的效率或对病原菌整体毒力的定量影响 | 揭示马来环丙醇中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 类鼻疽伯克霍尔德菌群的毒力因子马来环丙醇及其生物合成酶系 | 合成生物学 | 类鼻疽伯克霍尔德菌感染 | 化学合成、体外重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(用于突变分析) | NA | 由PKS-NRPS杂合合成酶催化的聚酮链融合及还原环化丁烯内酯形成途径 | 医学(抗毒力策略开发) |
| 237 | 2026-06-26 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 通过光响应DNA液滴动态相分离控制酶级联途径 | 提出利用光响应DNA液滴通过液-液相分离选择性隔离酶,实现紫外光和可见光调控酶级联反应,无需改变总酶浓度 | 未提及在复杂生物环境中的稳定性和长期应用效果 | 开发光响应DNA液滴用于精确调控酶级联途径 | 光响应DNA液滴和酶级联系统(GOx、HRP、CAT和GAO、MPO、CAT) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 光响应DNA液滴(Y-motif序列与偶氮苯修饰的粘性末端)和酶级联途径 | 合成生物学, 微反应器设计, 生物工程 |
| 238 | 2026-06-26 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路,用于实现原始细胞与活细胞群落中的自我调节双向通信 | 设计了包含识别、激活和反馈模块的DNA电路,使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号,自我调节与活细胞的相互作用,并具备可再生能力,能连续与多个目标活细胞互动 | 仅描述了原理验证,未提及在复杂生物环境中的应用限制或长期稳定性问题 | 开发合成生物学工具,控制细胞间信号传递,实现原始细胞与活细胞群落中的动态信号传播调控 | 原始细胞(非生物细胞模拟物)与活细胞(目标细胞) | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA | DNA组装技术 | 原始细胞(非生物) | 信号电路,包含识别模块、激活模块和反馈模块,用于自我调节双向通信 | 医学(细胞疗法) |
| 239 | 2026-06-26 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种基于水凝胶颗粒的无纯化方法,用于测量合成人工遗传聚合物(XNA)的聚合酶保真度 | 通过在磁性水凝胶颗粒基质内进行XNA转录和逆转录步骤,避免了传统方法中耗时的聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化步骤 | NA | 简化XNA聚合酶保真度测量流程 | XNA聚合酶 | NA | NA | 水凝胶颗粒技术, DNA/RNA合成 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 240 | 2026-06-19 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-11-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 通过将葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶共封装于二氧化硅纳米胶囊内,构建自放大质子生成的类线粒体ATP纳米发生器,实现人工细胞自主能量供应和代谢耦合 | 首次通过定量共封装葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶于二氧化硅纳米胶囊中,建立自增强酶级联反应放大质子生成,并结合ATP酶整合脂质体双层涂层,实现高效ATP合成 | 研究主要基于人工细胞模型(巨型单层囊泡),在更复杂细胞环境中长期稳定性和集成效率有待验证 | 构建能够自主供应能量并耦合代谢的人工线粒体,推动自下而上合成生物学发展 | 人工细胞模型中的线粒体模拟ATP纳米发生器 | 合成生物学 | NA | 酶共封装、纳米胶囊合成、ATP酶整合脂质体涂层 | NA | NA | NA | NA | NA | 自增强酶级联反应(葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶)驱动的质子梯度,耦合ATP合酶实现ATP合成 | 合成生物学 |