本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-05-21 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-09, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
|
研究论文 | 本文探讨了合成生物学在长期脱碳中的潜力,并采用自上而下的方法量化其影响 | 首次从宏观角度系统评估合成生物学不同应用领域对全球脱碳的贡献潜力,并分析其对碳价等经济因素的敏感性 | 采用自上而下的方法,可能忽略具体技术细节和区域差异 | 评估合成生物学技术在不同领域的脱碳潜力,并为气候减缓政策提供优先方向 | 合成生物学技术在农业恢复、食品生产、土壤碳汇、工业减排和地球工程等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业 |
| 222 | 2026-05-21 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
|
研究论文 | 利用合成生物学技术构建新型嵌合转录因子(Sphnx)作为全细胞生物传感器,用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac),实现口腔鳞状细胞癌的早期非侵入性诊断 | 通过嵌合体技术创建新型合成神经氨酸传感器,首次将工程细菌的全细胞生物传感器应用于口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物检测 | 尚未进行临床验证,传感器性能在真实唾液样本中的灵敏度和特异性待评估,平台仍需优化以提高检测通量和稳定性 | 开发能够检测口腔鳞状细胞癌相关唾液生物标志物的合成生物传感器,为口腔及全身疾病的临床筛查提供概念验证平台 | N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac)和工程细菌菌株 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学、嵌合体技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | 工程细菌 | 嵌合转录因子(Sphnx)传感回路 | 医学 |
| 223 | 2026-05-21 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-03, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
|
综述 | 本文综述了细菌荧光素酶及其辅助酶的机制和应用 | 阐明了C4a-氢过氧化黄素形成机制并鉴定出关键催化残基His44,通过蛋白质工程和合成生物学改进了LuxAB的生物发光特性 | 实现红移发射、优化信号强度和识别与发光物种生成相关的机制等问题仍有待探索 | 总结LuxAB的反应机制及其在生物技术中的应用进展 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶(如LuxG) | 合成生物学 | NA | 生物发光分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | lux操纵子编码的自发光系统 | 生物成像, 生物报告器, 生物传感, 代谢工程, 生物燃料生产 |
| 224 | 2026-05-20 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
|
研究论文 | 建立一种高效的一步重组工程方法MOSAIC,用于质粒编辑和多样化 | 利用单链DNA退火蛋白CspRecT高效整合DNA寡核苷酸,实现高达90%的单靶点编辑效率,并在单次转化中生成覆盖四个靶区域的组合质粒文库,同时集成基于Nanopore测序的用户友好验证流程 | 未明确说明具体局限性,可能包括对寡核苷酸设计的依赖或某些质粒类型的适用性限制 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和文库构建方法 | 质粒的定向编辑和组合文库生成 | 合成生物学 | NA | 重组工程,Nanopore测序 | NA | 序列数据 | NA | CspRecT蛋白,重组工程 | 细菌(具体未指定) | 质粒编辑和组合文库构建系统 | 分子生物学,合成生物学 |
| 225 | 2026-05-20 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
|
研究论文 | 利用基因工程细菌构建单层人工神经网络,实现3位二进制码到3位格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换,扩展了神经形态计算在合成生物学中的应用能力 | 目前处于概念验证阶段,实际应用场景和规模尚需进一步探索 | 开发基于基因工程细胞的生物计算机技术与合成生物电路设计 | 基因工程改造的细菌种群(大肠杆菌) | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络(ANN) | NA | 5个工程细菌种群 | NA | 大肠杆菌 | 单层人工神经网络(3位二进制到格雷码转换器) | 工业生物技术、计算机科学 |
| 226 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
|
综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略,推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性,但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |
| 227 | 2026-05-20 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
|
研究论文 | 本研究利用合成的苜蓿花叶病毒34S启动子变体结合两个相同的sgRNA结合位点,在植物细胞中开发了CRISPRi正交抑制系统 | 首次系统评估不同启动子的CRISPRi抑制效率,并发现两个相同sgRNA结合位点的启动子比异质位点更易被抑制;同时结合Cre/loxP RNA支架正交系统设计了基因开关 | 研究仅在烟草叶片中进行瞬时表达评估,缺乏稳定转化和更广泛植物物种的验证 | 开发用于植物细胞基因表达精确调控的CRISPRi正交抑制系统和遗传开关 | 植物细胞中的不同启动子(尤其是34S启动子变体) | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 瞬时基因表达, 农杆菌浸润 | NA | 表达数据 | 33个34S启动子变体 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 烟草 | CRISPRi抑制系统, Cre/loxP RNA支架正交系统, 基因开关 | 农业, 合成生物学 |
| 228 | 2026-05-20 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
|
研究论文 | 研究合成细菌群落中劳动分工生产紫色杆菌素的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个亚群中,实现了2.5倍的产量提升,并揭示了亚群生长速率和比例对生产效率的影响 | 仅使用大肠杆菌为基础,未探索其他宿主或更复杂的群落结构 | 评估劳动分工策略在合成微生物群落中提高紫色杆菌素生产效率的可行性 | 基于大肠杆菌的合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个共培养和单培养实验条件 | NA | 大肠杆菌 | 代谢途径拆分(VioABE和VioDC亚群) | 工业生物技术 |
| 229 | 2026-05-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
|
research paper | 开发了一种基于Tn5转座酶的高效全基因组基因激活系统,用于大肠杆菌的功能基因组学研究 | 基于Tn5转座酶构建高效全基因组基因激活突变文库,实现条件性基因激活和高通量筛选 | 未明确说明局限性,但可能涉及插入位点偏好性或激活效率的进一步优化需求 | 开发一种高效的全基因组基因激活工具,用于基因功能解析和菌株优化 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | synthetic biology, functional genomics | NA | Tn5 transposase-based system | NA | DNA sequence data | NA | Tn5 transposase | E. coli | inducible gene activation system with tetracycline-inducible promoter Ptet and kanamycin resistance gene | synthetic biology, industrial biotechnology |
| 230 | 2026-05-20 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
|
研究论文 | 本研究通过敲除恶臭假单胞菌中的oprF或oprI基因,揭示了两种基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次比较了oprF和oprI缺失对恶臭假单胞菌膜囊泡生产的差异效应,并发现通过过表达plsB可以改善膜完整性同时维持囊泡形成 | 研究仅在单一平台菌株KT2440中进行,且未评估这些策略在工业规模下的长期稳定性 | 探究膜囊泡工程在生物技术中的应用潜力,特别是优化蛋白质分泌系统 | 恶臭假单胞菌KT2440中oprF和oprI基因敲除株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除, 蛋白质过表达, 膜囊泡分析 | NA | 实验数据 | 多个突变株和野生型对照的比较实验 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌 KT2440 | 膜囊泡生产与蛋白质分泌系统 | 工业生物技术 |
| 231 | 2026-05-20 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
|
综述 | 系统综述了食用药用真菌的抗抑郁潜力及其作用机制 | 整合了肠脑轴、色氨酸-犬尿氨酸通路及神经炎症调节等多维机制,并探讨了3D食品打印与合成生物学等技术创新 | 缺乏临床验证、标准化不足 | 评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及营养学应用 | 灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草等食用药用真菌及其生物活性化合物 | 机器学习 | 抑郁症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 232 | 2026-05-19 |
Innovations in Yeast Synthetic Biology: Engineered Discovery Systems for Immunotherapy
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00321
PMID:40802971
|
综述 | 概述酵母合成生物学在免疫治疗蛋白发现中的创新工具,包括表面展示技术、自动进化系统和计算设计策略 | 整合酵母表面展示、自动进化系统(如OrthoRep)和计算设计,创建新型DBTL工作流,直接用于免疫工程和下一代生物治疗药物开发 | NA | 探讨酵母合成生物学如何加速免疫治疗蛋白的发现与工程化,桥接合成生物学与免疫学 | 酵母工程平台、免疫治疗蛋白(如纳米抗体)、免疫受体(如GPCRs、TCRs) | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、自动进化系统、计算设计 | NA | NA | NA | OrthoRep | 酵母 | 免疫治疗蛋白发现与筛选系统 | 医学 |
| 233 | 2026-05-19 |
Unraveling the Constrained Cell Growth in Engineered Living Materials
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00378
PMID:40808544
|
研究论文 | 揭示了工程活材料中受限细胞生长对细胞行为及工程功能的影响 | 首次揭示了空间限制与蓝藻细胞生长之间的动态相互作用,并发现细胞内活性氧水平升高及氧气光合作用受损是导致性能下降的关键内在因素 | 研究主要聚焦于光合蓝藻,未探讨其他微生物或更复杂的合成生物学系统;对空间限制下细胞聚集与生长气泡形成的机制阐释尚待深化 | 阐明工程活材料中细胞生长与空间限制的相互作用及其对工程功能的干扰机制 | 光合蓝藻及工程活材料中的封装细胞 | 合成生物学 | NA | 显微镜成像、荧光检测、材料合成 | NA | 图像、生理测量数据 | 蓝藻细胞样本,具体数量未提及 | NA | 蓝藻 | 光合工程活材料中细胞外基质限制下的生长回路 | 材料科学、合成生物学 |
| 234 | 2026-05-19 |
Multiplexed Genome Editing and Transcriptional Knockdown in Yarrowia lipolytica by CRISPR-Cpf1 and an Orthogonal T7 System
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00104
PMID:40810600
|
研究论文 | 本研究在非常规酵母Yarrowia lipolytica中结合CRISPR-Cpf1和正交T7系统,实现了多重基因组编辑和转录敲低 | 首次将CRISPR-AsCpf1与正交T7启动子结合用于Yarrowia lipolytica的多重基因编辑和转录敲低,实现了高达73.3%的四基因编辑效率和100%的双基因编辑效率 | 同源重组修复效率提升策略仅观察到微小改进 | 开发高效的多重基因组编辑和转录敲低工具,用于Yarrowia lipolytica的工程化改造 | Yarrowia lipolytica菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cpf1, T7转录系统 | NA | NA | 目标基因数量:2至4个 | CRISPR-Cpf1 | Yarrowia lipolytica | CRISPR-Cpf1编辑系统,正交T7转录系统,CRISPR-dCpf1敲低系统 | 工业生物技术 |
| 235 | 2026-05-19 |
Bioengineering of Probiotic Yeast Saccharomyces boulardii for Advanced Biotherapeutics
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00236
PMID:40811432
|
综述 | 综述了益生酵母布拉氏酵母菌在先进生物治疗中的工程化进展 | 首次系统总结了布拉氏酵母菌在遗传修饰、代谢工程和合成生物学策略应用于治疗领域的最新进展 | 未具体说明局限性,但综述性质可能受限于现有文献和技术成熟度 | 探索布拉氏酵母菌作为下一代微生物组治疗平台在人体健康和食品生物技术中的潜力 | 布拉氏酵母菌 | 合成生物学 | NA | 遗传修饰、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 布拉氏酵母菌 | 疾病响应型生物传感器、生物防护菌株设计 | 医学, 食品生物技术 |
| 236 | 2026-05-19 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-09-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
|
研究论文 | 在酿酒酵母中开发并评估了基于camphor调控的RelE毒素系统的生物限制策略,揭示了逃逸机制并建立了设计规则 | 首次系统评估了实验室与工业菌株中杀伤开关的拷贝数和倍性对生物限制效果的影响,并通过CRISPR介导的整合揭示了逃逸突变机制,提出了多位点整合策略来减缓逃逸 | 多位点整合虽降低了逃逸率,但不足以实现持续生物限制,且存在脱靶突变问题 | 建立安全生物系统设计规则,提高生物限制策略的有效性同时保持工程微生物的适应性 | 酿酒酵母实验室菌株和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 基因组重测序 | NA | 基因组序列数据 | 多种基因改造的酿酒酵母菌株(具体数量未明确) | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | camphor调控的RelE毒素杀伤开关,含Cam-反式激活因子(cam-TA)和RelE毒素 | 工业生物技术, 环境 |
| 237 | 2026-05-19 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-08-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
|
研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 首次在酿酒酵母中实现羟基酪醇和红景天苷的高效从头合成,通过优化酪醇生产菌株并增强UDP-葡萄糖供应,显著提高了产量 | 未提及具体局限性 | 实现羟基酪醇和红景天苷在酵母中的高效生物合成,为其工业应用奠定基础 | 酿酒酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,发酵 | NA | 产量数据,发酵数据 | 多个工程菌株,包括ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3等 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 酪醇合成途径,羟基酪醇合成途径,红景天苷合成途径 | 工业生物技术 |
| 238 | 2026-05-19 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
|
综述 | 综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 系统总结了利用酿酒酵母生产抗氧化、修复、保湿和结构维持等化妆品成分的先进策略,并首次探讨了人工智能和机器学习在菌株设计与过程控制中的整合应用 | 存在代谢负担等挑战 | 推动合成生物学在化妆品行业中的应用,实现化妆品成分的可持续规模化生产 | 酿酒酵母 | NA | NA | 代谢工程、遗传工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 化妆品 |
| 239 | 2026-05-19 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
|
研究论文 | 在解脂耶氏酵母中开发了一种大规模基因组装和基因组整合策略,成功实现多基因稳定整合并优化了番茄红素合成途径 | 首次在解脂耶氏酵母中实现超过30 kb的多基因(十数基因)一锅式组装和基因组整合,并构建了含35个外源基因(总长93.5 kb)的工程菌株 | 文中未具体讨论该策略在不同代谢途径中的通用性及可能存在的遗传稳定性问题 | 开发解脂耶氏酵母的大规模基因组装和整合方法,提升代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 基因组装、基因组整合、代谢工程 | NA | 生物化学数据(产量、滴度) | 含15个外源基因的优化工程菌株,在5 L生物反应器中验证 | Gibson Assembly、Golden Gate Assembly | 解脂耶氏酵母 | 多基因组装整合系统,番茄红素合成代谢通路 | 工业生物技术 |
| 240 | 2026-05-19 |
Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00234
PMID:40689784
|
研究论文 | 本文展示了一种利用聚乙二醇二丙烯酸酯水凝胶共固定多种无细胞表达酶的方法,用于化学品的可持续生物生产 | 首次将多种无细胞表达酶共同固定在甘油增强的PEGDA水凝胶中,实现酶的长期保留、可重复使用和更高活性,并利用小角X射线散射验证了水凝胶网孔与酶尺寸的匹配 | 未详细讨论固定化酶在工业规模下的放大可行性及不同底物条件下的长期稳定性 | 开发可重复使用、稳定且耐用的多酶系统,推动无细胞合成生物学在实际部署中的应用 | 三种异源无细胞酶(用于丙酮酸到苹果酸的转化)以及水凝胶固定化体系 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达、小角X射线散射、荧光测量 | NA | 散射数据、荧光测量数据 | NA | 光交联 | 大肠杆菌裂解液 | 多酶生物转化途径(丙酮酸至苹果酸) | 工业生物技术 |