本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2025-Sep-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法异源表达和纯化肠球菌素A,开发了一种生产抗菌肽的有效策略 | 首次从头设计合成完整的肠球菌素A基因盒,建立从包涵体高效回收活性抗菌肽的优化工艺 | 表达产物主要形成包涵体,需要复杂的变复性过程 | 开发替代抗生素的新型抗菌策略 | 肠球菌素A及其对多重耐药病原菌的抗菌活性 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因合成,PCR,DNA测序,Ni-NTA亲和层析 | NA | NA | 5种病原菌:金黄色葡萄球菌ATCC 25923、铜绿假单胞菌ATCC 27853、鲁氏不动杆菌GPE 3002、藤黄微球菌GPE 3001、蜡样芽孢杆菌GPE 3003 | Gibson Assembly | 大肠杆菌BL21(DE3) | 包含功能调控元件和N端His标签的肠球菌素A基因盒 | 医药,食品 |
| 222 | 2025-10-05 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2025-Sep-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
|
研究论文 | 本文综述了在本氏烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略 | 开发了响应化学和电磁信号的新型传感器系统、与可编程转录因子整合的合成启动子、基于重组酶的处理器以及病毒衍生复制子 | 存在转基因沉默、产量低和代谢毒性等限制可扩展性的挑战 | 实现本氏烟草中转基因的精确表达控制和代谢途径优化 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、病毒衍生复制子、重组酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成基因电路、传感器系统、合成启动子、逻辑门、生物传感器 | 农业,工业生物技术,环境 |
| 223 | 2025-10-05 |
Development of a modified RNA circularization system to improve circRNA-based protein expression in mammalian cells
2025-Sep-11, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080733.125
PMID:40935594
|
研究论文 | 开发了一种改进的RNA环化系统,显著提高哺乳动物细胞中基于环状RNA的蛋白质表达 | 通过优化IRES与CMV启动子间距、揭示HRV-B3 IRES的双重功能、整合HIV-1 LTR和WPRE元件来增强Tornado系统的环化效率和转录效率 | NA | 开发新型策略增强哺乳动物细胞中RNA环化效率 | 环状RNA在哺乳动物细胞中的蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | RNA环化技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | Tornado系统 | 哺乳动物细胞 | 改进的RNA环化系统,包含IRES、CMV启动子、HIV-1 LTR和WPRE调控元件 | 医学 |
| 224 | 2025-10-05 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中醌类前体DHNA生物合成的双相调控机制及其与底物限制的协同作用 | 发现MenF和MenD酶通过可逆通量和变构反馈抑制形成双相调控模式,并首次阐明底物可用性对DHNA过量生产的限制作用 | 研究聚焦于乳酸菌中的DHNA调控机制,在其他微生物中的普适性仍需验证 | 阐明微生物调控醌类水平的分子机制,为代谢工程改造微生物生产醌类提供理论基础 | 乳酸菌中醌类前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的生物合成调控机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | 数学模型 | 酶活性数据、代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 醌类生物合成途径调控网络 | 工业生物技术 |
| 225 | 2025-10-05 |
Advancing biomaterial innovation for tissue engineering through microbial synthetic biology: A review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146771
PMID:40803465
|
综述 | 本文综述了微生物合成生物学在组织工程生物材料创新中的应用与前景 | 系统阐述了利用工程化微生物生产生物材料的新策略及其在组织工程中的创新应用 | 面临技术挑战,具体限制未详细说明 | 探讨微生物合成生物学在组织工程生物材料开发中的应用 | 工程化微生物及其生产的生物材料 | 合成生物学 | NA | 微生物基因组改造、代谢调控 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物宿主 | 代谢途径工程 | 医学 |
| 226 | 2025-10-05 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
|
综述 | 本文综述了高通量和基因组规模动力学建模的最新进展与未来发展方向 | 整合机器学习与机制性代谢模型、开发新型动力学参数数据库、使用定制化参数化策略 | NA | 推动动力学建模在系统和合成生物学、代谢工程及医学研究中的应用 | 动力学建模方法 | 机器学习 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机制性代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 227 | 2025-10-05 |
The path to biotechnological singularity: Current breakthroughs and outlook
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108667
PMID:40744238
|
综述 | 探讨生物技术领域突破性进展及其向生物技术奇点发展的路径与展望 | 系统阐述基因编辑、合成生物学、人工智能等多技术融合带来的生物技术范式变革 | 未涉及具体实验数据支撑,主要基于现有技术发展的宏观分析 | 分析生物技术融合发展趋势及其社会影响 | 基因编辑、合成生物学、人工智能等前沿生物技术 | 生物技术 | 遗传疾病、癌症、退行性疾病 | CRISPR基因编辑、深度学习、干细胞技术、脑机接口 | 深度学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药、环境、工业生物技术 |
| 228 | 2025-10-05 |
Microalgal bioengineering for futuristic applications in synthetic and space biology
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108665
PMID:40738416
|
综述 | 探讨微藻生物工程在合成生物学和空间生物学中的前沿应用 | 整合CRISPR基因编辑与多组学、合成基因电路、人工智能等创新技术,开发适应太空环境的微藻系统 | NA | 通过合成生物学技术改造微藻,解决地球和太空环境中的生命支持资源短缺问题 | 微藻及其基因工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑、多组学技术、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 合成基因电路、代谢通路工程 | 环境,能源,太空探索 |
| 229 | 2025-10-05 |
Harnessing biological nitrogen fixation: Multi-scale engineering for self-sustaining agroecosystems
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108687
PMID:40803658
|
综述 | 探讨通过多尺度工程方法利用生物固氮技术构建自维持农业生态系统的研究进展 | 提出从微生物底盘固氮回路设计到根际微生物组重编程,再到工程固氮作物及生态系统水平田间应用的多尺度集成工程方法 | NA | 提高固氮效率并使作物具备生物固氮能力,以替代化学氮肥 | 固氮酶活性分子机制、非固氮宿主中的固氮效率提升策略、合成生物学固氮系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物底盘, 工程作物 | 固氮回路设计, 生物传感器, 代谢通路 | 农业 |
| 230 | 2025-10-05 |
Phage therapy against Klebsiella pneumoniae: An evolving perspective
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108689
PMID:40840758
|
综述 | 本文系统探讨了针对肺炎克雷伯菌的噬菌体疗法,分析了细菌-噬菌体协同进化动态,并提出了结合计算科学的综合治疗策略 | 整合临床案例与临床前研究评估联合策略,提出利用机器学习进行噬菌体表征和宿主互作预测的计算路线图 | NA | 推动噬菌体疗法从实验性治疗向标准化干预转变,解决抗菌素耐药性问题 | 肺炎克雷伯菌及其噬菌体 | NA | 细菌感染 | 噬菌体疗法、机器学习、合成生物学 | 机器学习 | NA | NA | NA | 肺炎克雷伯菌 | NA | 医学 |
| 231 | 2025-10-05 |
Multidimensional strategies for efficient heterologous protein expression in Aspergillus niger
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108690
PMID:40845950
|
综述 | 本文总结并讨论了通过多维度策略提高黑曲霉异源蛋白表达效率的最新进展 | 从表达系统、分泌途径、代谢通量、智能发酵和多组学整合五个维度系统优化黑曲霉异源蛋白生产 | 由于不同蛋白质特性各异,构建通用的黑曲霉底盘细胞仍面临挑战 | 提高黑曲霉异源蛋白表达效率 | 黑曲霉异源蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程策略、多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | NA | 工业生物技术 |
| 232 | 2025-10-05 |
Engineering plant hosts for high-efficiency accumulation of flavonoids: Advances, challenges and perspectives
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108692
PMID:40850536
|
综述 | 本文总结了利用系统和合成生物学方法改造植物宿主以实现高效黄酮类化合物积累的研究进展、挑战与前景 | 提出通过系统和合成生物学方法精确调控黄酮类化合物生物合成路径的创新策略 | 当前在构建下一代高效黄酮生物合成植物宿主方面仍存在技术限制 | 为利用系统和合成生物学方法改造植物黄酮类化合物生物合成提供理论指导 | 植物黄酮类化合物的分布、生物合成途径及调控机制 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 黄酮类化合物生物合成路径改造、代谢通量重平衡 | 农业 |
| 233 | 2025-10-05 |
Machine learning in predictive biocatalysis: A comparative review of methods and applications
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108698
PMID:40885347
|
综述 | 比较分析机器学习在预测生物催化领域的方法与应用 | 系统比较了深度神经网络、卷积网络、图架构和Transformer等不同机器学习方法在生物催化预测中的优劣 | NA | 探讨机器学习在预测生物催化中的应用前景 | 酶功能预测、生物催化剂发现、反应建模和代谢途径优化 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 神经网络, 卷积网络, 图架构, Transformer | 生化数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 绿色生物催化 |
| 234 | 2025-10-05 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Sep-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
|
研究论文 | 通过靶向染色质编辑揭示模拟表观遗传记忆机制 | 首次证明染色质修饰可维持连续梯度基因表达水平,揭示模拟表观遗传记忆的存在 | 未明确说明实验模型系统的具体局限性 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态 | DNA甲基化与组蛋白修饰的表观遗传调控系统 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、表观遗传效应器工程 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因组报告系统与表观遗传效应器 | 合成生物学 |
| 235 | 2025-10-05 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2025-Sep-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
|
研究论文 | 本文探讨混合人工智能在合成生物学农业应用中的潜力与挑战 | 提出混合AI方法能更有效处理多组学复杂性,实现气候智能型高产量作物设计 | 需要清晰流程、精选数据集和自动化平台才能充分发挥潜力 | 利用混合AI技术推动合成生物学在农业领域的应用发展 | 多基因组、多性状和多环境数据驱动的作物工程 | 合成生物学 | NA | 多组学数据分析 | 混合AI | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | 复杂基因网络 | 农业 |
| 236 | 2025-10-05 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2025-Sep-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
|
综述 | 本文探讨利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食品的可持续方法 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂进行精密发酵,超越传统单细胞蛋白生产 | NA | 开发不依赖农业的可持续食品生产技术 | 氢氧化细菌及其工程化应用 | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计、重组蛋白分泌系统 | 食品, 工业生物技术 |
| 237 | 2025-10-05 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-Sep-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
|
研究论文 | 开发了一种无需PCR的位点定向诱变方法,使用DNA切割脱氧核酶和单链DNA辅助实现对重复序列的突变操作 | 首次将DNA切割脱氧核酶的应用范围扩展到双链超螺旋质粒,无需PCR或限制性内切酶即可在重复序列上进行位点定向诱变 | NA | 开发一种能够处理重复序列的PCR-free位点定向诱变技术 | 含有PCR不兼容重复序列的质粒 | 合成生物学 | NA | DNA切割脱氧核酶技术,单链DNA辅助双链DNA切割 | NA | NA | NA | DNA切割脱氧核酶 | NA | 单链DNA辅助双链DNA切割系统(DANDA) | 生物技术, 生物化学 |
| 238 | 2025-10-05 |
Controlling complex rhythms: A hierarchical approach to limit cycle switching
2025-Sep-01, Chaos (Woodbury, N.Y.)
DOI:10.1063/5.0296708
PMID:40932349
|
研究论文 | 本文提出一种分层控制方法,通过周期性调制实现非线性动力系统中极限环之间的可靠切换 | 开发了通过分层逐步周期性调制控制多节律性的方法,能够在保持系统其他特性的同时实现节律状态间的可靠切换 | NA | 研究非线性动力系统中极限环之间的分层动力学转变 | 非线性动力系统中的极限环和节律行为 | 动力系统理论 | NA | 周期性调制控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 神经工程,合成生物学 |
| 239 | 2025-10-05 |
Genome mining and characterization of a heme-dependent enzyme catalyzing intermolecular Nitrogen-Nitrogen bond formation in hydrazinosuccinic acid biosynthesis
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.006
PMID:40918557
|
研究论文 | 通过基因组挖掘发现并表征了一种新型血红素依赖性酶系统,该酶催化分子间氮-氮键形成生成肼基琥珀酸 | 发现首个血红素依赖性酶系统能够催化分子间氮-氮键形成,并提出了涉及活性氮中间体的催化机制 | NA | 探索氮-氮键形成酶在天然产物生物合成中的作用机制 | 血红素酶与铁硫蛋白复合物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、体内外重组、定点诱变、结构建模 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 240 | 2025-10-05 |
Spatial Organization of the Metabolic Pathway for Enhancing l-Fucose Biosynthesis in Engineered Escherichia coli
2025-Sep-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06801
PMID:40853549
|
研究论文 | 本研究通过空间组织策略优化工程大肠杆菌中l-岩藻糖的生物合成途径 | 采用无支架酶组装和工程蛋白质区室化两种空间组织策略,首次系统性地优化l-岩藻糖生物合成途径的空间构型 | NA | 通过合成空间组织提高微生物生物合成效率 | 工程大肠杆菌中的l-岩藻糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多酶复合物组装、蛋白质区室化 | NA | NA | NA | RIAD-RIDD肽相互作用、DIX结构域 | 大肠杆菌 | l-岩藻糖生物合成途径,包含WbgL和AfcA关键酶的多酶复合物,代谢通量导向系统 | 工业生物技术 |