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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-12-12 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本文通过数学模型探讨了配体-受体相互作用如何使细胞群体通过响应异质性编码配体身份,揭示了受体二聚化在配体识别中的新机制 | 提出了配体识别可在群体水平通过响应异质性实现的新机制,特别强调了异二聚体受体在调控群体响应异质性中的功能优势 | 研究基于数学模型,可能未完全涵盖体内复杂生物环境的影响,且主要聚焦于特定信号通路如I型干扰素通路 | 探究细胞如何通过信号通路在群体水平区分不同配体信号,以理解免疫调节和组织发育的机制 | 配体-受体相互作用、细胞群体响应异质性、二聚体受体(特别是异二聚体) | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 222 | 2025-12-12 |
Governing Synthetic Biology: A Co-Evolutionary Framework for Sustainable Innovation
2025-Nov-26, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2508.08001
PMID:41309363
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综述 | 本文回顾了合成生物学的发展历程,分析了其面临的监管与政策挑战,并基于经合组织的框架提出了一个促进技术与制度框架共同演化的“协同演化”治理模型 | 提出了一个基于经合组织“新兴技术预见性治理框架”的“协同演化”模型,强调研发、战略情报、社会信任构建、敏捷监管和国际合作五个关键要素的协同 | 本文是一篇综述性文章,主要进行理论分析和框架构建,未涉及具体的实验验证或案例数据 | 探讨如何通过协同治理框架,使合成生物学的技术发展与社会制度、监管及公众接受度同步,以实现可持续创新 | 合成生物学领域的整体发展、监管政策框架及社会接受度 | NA | NA | NA | 协同演化模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 223 | 2025-12-12 |
A stable and antibiotic-free plasmid expression system for Salmonella typhimurium VNP20009 in tumor therapy
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113863
PMID:41362775
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研究论文 | 本研究为鼠伤寒沙门氏菌VNP20009开发了一种稳定且无抗生素的质粒表达系统,用于肿瘤治疗 | 通过比较不同复制子、转录控制和稳定模块,构建了无抗生素依赖的质粒平台,利用axe/txe毒素-抗毒素系统实现质粒稳定保留,并实现超过100倍的基因表达动态调控 | 研究仅在鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10)中测试,未涉及其他肿瘤类型或更广泛的体内环境 | 开发用于肿瘤基因治疗的稳定无抗生素质粒表达系统 | 鼠伤寒沙门氏菌VNP20009作为肿瘤靶向载体 | 合成生物学 | 肿瘤 | 质粒工程、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | 鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10) | Gibson Assembly, BioBrick | Salmonella typhimurium VNP20009 | 质粒表达系统,包含复制子、可调启动子-RBS组合和axe/txe毒素-抗毒素稳定模块 | 医学 |
| 224 | 2025-12-12 |
A Computational Framework for Optimal and Model Predictive Control of Stochastic Gene Regulatory Networks
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 本文开发了一个用于随机基因调控网络的最优和模型预测控制的计算框架,旨在高效管理分子噪声并精确调控细胞群体行为 | 通过部分积分-微分方程高效近似化学主方程,实现高计算效率、精确控制概率密度函数以微调细胞群体复杂行为,并稳健处理内在分子噪声 | NA | 为合成生物学中随机生物分子系统的精确控制提供高效计算框架 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 部分积分-微分方程近似、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导基因调控回路 | 合成生物学 |
| 225 | 2025-12-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文全面综述了在微流控系统中,利用外部电场调控软物质多相系统(如液滴和囊泡)的传输动力学 | 系统性地探讨了电场强度、流体性质与膜特性之间的耦合作用,并强调了囊泡双层脂膜带来的独特动力学行为,为下一代微流控设备设计提供了新视角 | NA | 研究电场如何调控软物质多相系统在微流控通道中的传输行为,以优化其操控与应用 | 软物质多相系统,特别是液滴和囊泡 | NA | NA | 高精度成像、微操控、复杂计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送、合成生物学、材料制造、芯片实验室平台、生物分析工具 |
| 226 | 2025-12-11 |
Engineered living materials: emerging frontiers in therapeutic innovation and management of skin disorders
2025-Dec-11, Zeitschrift fur Naturforschung. C, Journal of biosciences
DOI:10.1515/znc-2025-0208
PMID:41369022
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综述 | 本文综述了工程化活性材料在皮肤疾病治疗创新与管理中的新兴前沿,探讨了其作为新型治疗剂的潜力 | 将合成生物学与材料工程相结合,创造出具有实时感知、自适应响应和局部治疗递送功能的动态活性材料系统 | 临床转化面临生物安全性、可扩展性和监管问题等挑战 | 探索工程化活性材料作为皮肤疾病新型治疗平台的开发与应用 | 慢性伤口、烧伤、感染和皮肤病等皮肤并发症 | 合成生物学 | 皮肤病 | 遗传电路工程、支架优化、生物相容性增强 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌, 真菌 | 生物传感器、逻辑门、治疗性肽类释放系统 | 医学 |
| 227 | 2025-12-11 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-Dec-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香聚酮生物合成中的氧化重排反应,重点介绍了相关氧化还原酶在结构多样性和生物活性形成中的作用 | 系统总结了细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排的化学规律和酶学机制,包括Baeyer-Villiger、Favorskii型重排及创新碳骨架重排 | NA | 阐明细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的化学和酶学基础 | 细菌芳香聚酮生物合成途径中的氧化还原酶及其催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 228 | 2025-12-11 |
Advances in Producing Health-Promoting Punicic Acid: From Extraction Technologies to Cutting-Edge Biotechnology Innovations
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12722
PMID:41284366
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综述 | 本文综述了促进健康pun酸的生产进展,从提取技术到前沿生物技术创新 | 探讨了微波、超声波、酶辅助和超临界流体辅助提取技术,以及合成生物学在植物和微生物中优化pun酸积累的生物技术进展 | NA | 提高pun酸的产量、纯度和稳定性,以促进其在功能性食品中的广泛应用 | pun酸(一种ω-5多不饱和脂肪酸) | NA | NA | 微波提取、超声波提取、酶辅助提取、超临界流体辅助提取、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物、微生物 | 调整脂肪酸谱以促进pun酸积累 | 食品、工业生物技术 |
| 229 | 2025-12-11 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-Dec, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
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综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症治疗中的应用、优势与挑战 | 系统总结了利用脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶和智能纳米载体等纳米平台实现细胞因子的靶向、可控和持续释放,以增强抗肿瘤免疫并克服传统细胞因子疗法的局限性 | 仍面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性以及制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送平台如何改善胃肠道癌症免疫疗法的疗效与安全性 | 胃肠道癌症(包括结直肠癌、胃癌和食管癌)及其肿瘤微环境 | NA | 胃肠道癌症 | 纳米技术递送平台(脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶、智能纳米载体等) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 230 | 2025-12-11 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
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综述 | 本文综述了微生物生产类胡萝卜素torulene的现状、策略、生物特性及其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 系统总结了通过上游和下游工艺提高torulene产量的策略,并探讨了其在多个工业领域的应用潜力 | torulene的研究仍有限,其商业化潜力尚未充分开发,微生物生产面临挑战 | 总结torulene的微生物生产策略、生物特性及潜在应用,推动其商业化发展 | 红酵母生产的类胡萝卜素torulene | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 红酵母(如Rhodotorula和Sporobolomyces) | NA | 食品,化妆品,制药 |
| 231 | 2025-12-10 |
Methyltransferase Detection Based on Target-Responsive Transcription Amplification of Light-Up Aptamer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05886
PMID:41296341
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研究论文 | 开发了一种基于目标响应转录扩增的DNA甲基转移酶检测新方法 | 提出了一种名为MTA的简单、无标记、通用策略,利用Broccoli RNA光敏适配体和转录扩增实现高灵敏度检测,并支持逻辑门设计和多目标检测 | NA | 开发高灵敏度、高特异性的DNA甲基转移酶检测方法 | DNA甲基转移酶(如Dam和M.SssI MTase) | 合成生物学 | NA | 转录扩增、光敏适配体检测 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于甲基化响应开关的转录调控电路,支持逻辑门设计 | 生物医学 |
| 232 | 2025-12-10 |
Phenotyping and Selection of Cells Using Mass Spectrometry and a Microfluidic Droplet Printer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05032
PMID:41309380
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研究论文 | 本文介绍了一种结合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机的系统,用于无标记细胞表型分析和选择 | 整合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机,实现在线分析和捕获含细胞液滴,提供无标记表型分析和选择能力 | 系统操作速率限制在0.4-1.2液滴/秒范围内,可能影响高通量筛选效率 | 开发一种高通量、无标记的细胞表型分析和选择方法 | 含细胞的微流控液滴 | 合成生物学 | NA | 液滴电喷雾电离质谱、微流控电压介导液滴打印 | NA | 质谱数据、图像数据 | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 合成生物学、酶工程 |
| 233 | 2025-12-10 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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综述 | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用,旨在通过可持续方式增强鱼类免疫力并控制疾病爆发 | 提出了基于微藻的口服疫苗的理性设计,并讨论了其口服递送和免疫益处,结合合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动创新 | NA | 探讨微藻基疫苗在水产养殖中的可持续应用,以增强鱼类免疫力和减少疾病 | 微藻基口服疫苗及其在水产养殖鱼类中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 农业 |
| 234 | 2025-12-09 |
Discovery of a Heme-Dependent Enzyme Catalyzing Nitrogen-Nitrogen Bond Formation in Kinamycin Biosynthesis
2025-Dec-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202513778
PMID:41137433
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研究论文 | 本文报道了在kinamycin生物合成中,发现了一种依赖血红素的新酶Alp1J,它催化氮-氮键的形成,并与伴侣铁氧还蛋白Alp1I形成稳定复合物以保护辅因子 | 首次鉴定出属于血红素依赖酶新家族的Alp1J,能催化kinamycin生物合成中的氮-氮键形成,并揭示其与伴侣铁氧还蛋白Alp1I的复合物对活性的关键作用 | NA | 探究kinamycin和lomaiviticin等天然产物中氮-氮键形成的生物合成机制 | kinamycin生物合成途径中的酶Alp1J及其伴侣铁氧还蛋白Alp1I | NA | NA | 定点诱变、生化研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 235 | 2025-12-09 |
Next-Generation Probiotics in Allergy Therapy: Scientific Evidence and Clinical Applications
2025-Dec-04, Anti-inflammatory & anti-allergy agents in medicinal chemistry
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综述 | 本文综述了下一代益生菌在过敏性疾病治疗中的科学证据和临床应用 | 探讨了下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila、Faecalibacterium prausnitzii)相比传统益生菌更具靶向性的免疫调节和肠道屏障修复作用 | 存在菌株特异性、剂量、免疫受损个体安全性以及监管分类问题 | 评估益生菌在过敏性疾病免疫调节和肠道屏障功能恢复中的治疗潜力 | 过敏性疾病(如特应性皮炎、过敏性鼻炎、哮喘、食物过敏)及其免疫失调机制 | NA | 过敏性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 236 | 2025-12-09 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Dec, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 本文综述了将原始细胞组装成原始组织的方法,以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 系统探讨了多种原始细胞模型的构建及其组装成具有通信、集体行为等功能的原始组织的化学与物理方法,为合成生物学和再生医学提供了设计思路 | NA | 探索原始细胞组装成原始组织的构建方法、特性及其在生物医学中的应用潜力 | 原始细胞模型(如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层、乳液液滴)及其组装形成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 再生医学 |
| 237 | 2025-12-09 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2025-Nov-07, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 本文综述了2020年至2025年间,人工智能和机制建模在表征天然产物生物合成途径中的应用与进展 | 整合人工智能预测方法和机制模拟,以加速天然产物的发现、工程化及应用,特别是在药物发现和生物技术领域 | NA | 加速天然产物的发现、工程化及其在药物发现、生物技术和合成生物学中的应用 | 天然产物的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 人工智能、机制建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 238 | 2025-12-09 |
Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications
2025-Nov-03, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00055f
PMID:41181914
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综述 | 本文综述了卤化酶和脱卤酶在机制、工程改造及应用方面的最新进展,重点关注其在生物合成和生物修复中的集成应用 | 系统总结了不同类型卤化酶和脱卤酶的最新工程化进展,并探讨了将其整合到可扩展平台中的合成生物学策略 | NA | 探讨卤化酶和脱卤酶在生物催化卤化与脱卤反应中的机制、工程改造潜力及其工业与环境应用 | 卤化有机化合物、卤化酶(包括卤过氧化物酶、黄素依赖型、α-酮戊二酸依赖型、SAM依赖型等)和脱卤酶(还原型、水解型、氧化型) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶工程、生物催化 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 239 | 2025-12-09 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2025-Sep-09, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文全面分析了2004年至2024年间超过450项关于在链霉菌宿主中异源表达生物合成基因簇的研究,探讨了其在天然产物发现和合成生物学中的应用 | 首次从数据驱动角度提供了该领域二十年来的定量趋势分析,包括BGC类型、供体物种和宿主菌株偏好,并整合了合成生物学工具和基因组工程进展 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成中的潜力和应用 | 链霉菌宿主和来自不同微生物来源的生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、合成生物学工具 | NA | 文本(文献综述) | 超过450项同行评审研究 | CRISPR-Cas9, 基因组工程 | 链霉菌 | 生物合成基因簇的异源表达、组合生物合成 | 药物发现、工业生物技术 |
| 240 | 2025-12-09 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2025-Jul-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了将非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统转化为理性设计平台的最新进展 | 整合基因组挖掘、高通量筛选、合成生物学工具和计算建模(包括深度学习方法),以加速定制天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶生物合成途径,以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |