合成生物学相关文章
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当前共找到 589 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-04-26 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
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研究论文 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制，包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控，以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 研究叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用潜力 | 植物、藻类和光合细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2025-04-26 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
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综述 | 本文综述了基于细菌孢子的材料的最新进展，并讨论了开发高性能、时间和成本效益高的孢子基材料的未来挑战 | 利用细菌孢子的休眠和抗恶劣条件特性，克服了传统工程活材料（ELMs）寿命短和需要冷链物流的缺点 | 未提及具体的实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探讨细菌孢子在材料科学中的应用及其未来发展方向 | 细菌孢子及其在材料中的应用 | 材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 243 | 2025-04-26 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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research paper | 提出了一种通过从线性模型分析中推断非线性Hill函数型模型的动力学参数的反向工程方法，以设计实现完美适应的生物控制器 | 结合线性系统理论和非线性建模，设计能够实现完美适应的基因电路 | 理论分析在保证非线性模型（如Hill函数）的控制器特性方面仍具挑战性 | 为合成生物学设计具有完美适应能力的生物控制器 | 生物网络基序控制器 | synthetic biology | NA | reverse engineering, Hill function-type models | linear models, nonlinear models | simulation data | three biological network motif-based controllers |
| 244 | 2025-04-26 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文综述了叶绿体在植物生长、发育和防御机制中的多面性作用，以及其在应对全球农业挑战中的核心地位 | 独特整合了叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学的最新进展，提出了优化植物生长和胁迫耐受的整体视角 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于文献综述 | 探讨叶绿体在植物生长与防御平衡中的调控作用，以及其在可持续农业中的应用潜力 | 叶绿体及其在植物中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学）、合成生物学、纳米技术 | NA | 组学数据 | NA |
| 245 | 2025-04-26 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
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research paper | 介绍了一个名为BioTRY的综合知识库，用于收集生物合成的滴度、速率和产量(TRY)数据 | BioTRY是首个可用的生物合成TRY数据数据库，包含超过52,000条TRY条目 | NA | 评估发酵过程的经济可行性，并帮助研究人员和决策者了解生物合成的发展现状 | 生物合成的滴度、速率和产量(TRY)数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物合成数据 | >5,000种生化物质和>3,800种菌株，以及超过52,000条TRY条目 |
| 246 | 2025-04-25 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了抗生素偶联物作为克服抗生素耐药性的新策略的研究现状 | 提出利用'特洛伊木马'策略将抗生素与生物活性成分偶联，以增强抗生素对耐药病原体的效果 | 抗生素偶联物的临床转化面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对抗生素耐药性危机 | 抗生素与单克隆抗体(mAbs)、抗菌肽(AMPs)和铁螯合载铁体的偶联物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学和生物信息学 | NA | NA | NA |
| 247 | 2025-04-25 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-Apr-24, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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research paper | 该研究设计并构建了一种能够与活细胞进行高阶组装的合成治疗性原细胞，用于靶向消除癌细胞 | 通过宿主-客体化学构建正交多糖基原细胞，并引入细胞靶向配体和催化活性纳米颗粒，形成具有完全功能的细胞靶向生物催化杀手原细胞 | 研究目前仅限于体外实验，尚未进行体内验证 | 开发一种新型的合成治疗性原细胞系统，用于癌症治疗 | 癌细胞 | 合成生物学与生物工程 | 癌症 | 宿主-客体化学，电静力驱动自组装 | NA | 实验数据 | NA |
| 248 | 2025-04-25 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-Apr-24, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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review | 本文综述了深度突变扫描和CRISPR基因组编辑技术在病毒基因组研究中的应用 | 结合深度突变扫描和CRISPR技术，实现对病毒蛋白的全面突变和功能表征 | NA | 探讨病毒进化与适应的分子机制，为疫苗开发和治疗策略提供新见解 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
| 249 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在玉米胚胎发育研究中的联合应用及其协同效果 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学两种技术研究玉米胚胎发育，提供单细胞分辨率和空间背景的基因表达模式 | 单细胞技术难以识别特定细胞簇，空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 理解玉米胚胎发育的基本机制，促进农业改良、体细胞胚胎发生条件的优化和植物合成生物学 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 250 | 2025-04-25 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红光和远红光组合能够增强本氏烟草中异源蛋白和代谢物的生产 | 首次探索了光质对瞬时表达效率的影响，并发现红远光组合能显著提高异源蛋白和代谢物的产量 | 研究仅在本氏烟草中进行，未在其他植物中验证 | 探索光质对植物瞬时表达系统效率的影响 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | 未明确说明样本数量 |
| 251 | 2025-04-25 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
|
research paper | 该研究结合扩散模型和Transformer模型，用于增强合成启动子的设计和强度预测 | 首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，相比传统方法表现更优 | 研究仅针对模型细菌和蓝藻细菌进行验证，未在其他生物体中测试 | 优化外源基因表达和代谢途径效率，开发高性能合成启动子 | 合成启动子序列 | synthetic biology | NA | deep learning | diffusion model, Transformer, CNN, variational autoencoder | biological sequence data | NA |
| 252 | 2025-04-25 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Apr-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
|
research paper | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用及其对鱼类免疫力的提升作用 | 利用合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动基于微藻的疫苗创新 | NA | 探索和开发可持续的水产养殖疫苗以增强鱼类免疫力和减少疾病爆发 | 微藻基疫苗及其在水产养殖中的应用 | 生物技术 | 水产养殖疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 253 | 2025-04-25 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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research paper | 该研究通过电子传递工程优化人工设计的细胞工厂，实现了胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 阐明了NADPH依赖酶的电子传递机制，并系统性地改造了酿酒酵母的电子传递链，显著加速了去质子化和质子耦合电子传递过程 | 未提及具体实验规模的限制或潜在的应用障碍 | 提高类固醇生物合成的效率和产量 | 人工设计的细胞工厂（酿酒酵母）及其电子传递系统 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程（ETE） | NA | NA | NA |
| 254 | 2025-04-25 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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research paper | 该研究调查了四种常用质粒骨架在克隆和野生型大肠杆菌菌株中形成多聚体的情况，并提出了避免多聚体产生的解决方案 | 首次系统调查了不同质粒骨架在多聚体形成方面的差异，并提出了通过单基因敲除避免多聚体产生的方法 | 研究仅针对大肠杆菌的两种菌株(JM109和MG1655)，未在其他宿主系统中验证 | 优化基于质粒的合成生物学电路设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架在JM109和MG1655大肠杆菌菌株中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的测试 |
| 255 | 2025-04-25 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
|
研究论文 | 本文提出了一种多层自催化反馈策略，用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 引入多层反馈策略，实现了种群水平的积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过不同细胞群体间的协调互动产生 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和跨尺度环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和细胞群体控制 | 合成生物学 | NA | 数学建模、多层反馈控制 | 自催化积分反馈控制器 | 数学模型、基因表达数据 | NA |
| 256 | 2025-04-25 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的敏感性和稳健性，通过五个示例电路分析了生物反馈的准确性 | 提出了多目标优化框架来研究生物反馈的性能权衡，填补了生物反馈理论框架的空白 | 仅分析了五种示例电路，可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 研究生物反馈系统的稳健性和准确性，为合成生物学和系统生物学提供理论支持 | 五种生物反馈电路（正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈） | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
| 257 | 2025-04-25 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自重楼(Paris polyphylla)的4'-O-鼠李糖基转移酶(UGT73DY2)，并揭示了其在甾体皂苷生物合成中的作用 | 首次发现并表征了UGT73DY2酶，阐明了4'-O-鼠李糖基化过程，并通过合成生物学方法建立了重楼甾体皂苷的生物合成系统 | 酶催化效率仍有提升空间，生物合成系统产量相对较低 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发其生物合成方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、代谢工程 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 258 | 2025-04-25 |
Effect of Local Heterogeneities on Single-Layer DNA-Directed Protein Lattices Through Non-Averaged Single-Molecule 3D Structure Determination
2025-Apr-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6095207/v1
PMID:40235486
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research paper | 该研究通过非平均单分子3D结构确定，探讨了局部异质性对单层DNA导向蛋白质晶格的影响 | 利用个体粒子冷冻电子断层扫描（IPET）技术分析DNA折纸八面体笼子形成的2D晶格的3D结构，揭示了晶格缺陷的分子起源 | 研究主要关注DNA笼子的柔软性和粒子间连接对晶格缺陷的影响，未涉及其他可能的结构异质性来源 | 探究DNA导向蛋白质晶格的结构异质性及其改进方法 | DNA折纸八面体笼子及其形成的2D蛋白质晶格 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子断层扫描（cryo-ET），分子动力学模拟 | NA | 3D结构数据 | 不同铁蛋白负载百分比（100%、70%、0%）的DNA笼子 |
| 259 | 2025-04-25 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
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research paper | 该研究开发了一种合成生物学策略，通过重编程宿主肝脏作为组织底盘，诱导和递送体内自组装siRNA以靶向ATXN3基因，从而治疗Machado-Joseph病 | 利用合成生物学策略重编程肝脏作为组织底盘，实现体内自组装siRNA的生成和递送，克服了siRNA递送效率低的障碍 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 开发一种针对Machado-Joseph病的有效治疗方法 | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | siRNA技术 | NA | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 |
| 260 | 2025-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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review | 本文综述了CRISPR/Cas基因编辑技术的发展与创新，特别是非DSB编辑器BE和PE的进展，以及其在基因治疗等领域的应用 | 重点讨论了基于CRISPR系统的非DSB编辑器BE和PE的创新策略，包括“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路 | 未提及具体的实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探讨CRISPR/Cas基因编辑技术的创新策略及其在基因治疗等领域的应用前景 | 非DSB编辑器BE和PE | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA |