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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-05-18 |
Genome-Wide Simplification of the AcMNPV Genome Using Synthetic Biology
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00156
PMID:40910264
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研究论文 | 利用合成生物学方法系统性简化AcMNPV基因组,获得能产生出芽病毒的最小功能基因组 | 基于合成生物学的“设计-构建-测试-学习”框架,采用共转染线性化基因组片段的策略,快速迭代评估基因组缺失,最终获得删除约28 kb、涵盖39个非必需基因的最小功能基因组AcMNPV-Syn-mini | 未提及具体局限性 | 实现AcMNPV基因组的大规模简化,开发高容量杆状病毒载体,并加深对杆状病毒功能基因组学的理解 | 苜蓿银纹夜蛾多核型多角体病毒(AcMNPV) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组简化、共转染 | NA | 基因组序列、病毒滴度数据 | 35个不同大小的简化基因组 | 合成生物学设计-构建-测试-学习框架 | 昆虫细胞 | NA | 生物技术、医学 |
| 262 | 2026-05-18 |
Engineering Noncanonical Cofactors To Expand Cellular Functions
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00473
PMID:40923492
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综述 | 探讨利用非经典辅因子扩展细胞功能的方法与应用 | 通过使用非经典辅因子隔离特定代谢反应,无需物理屏障即可实现与宿主细胞天然机制的独立运行 | 对非经典辅因子依赖型酶的工程化进展及实际应用潜力仍需进一步实验验证 | 综述非经典辅因子的类型、合成方法、酶工程进展及其在合成生物学中的应用前景 | 非经典辅因子及其依赖性酶和利用细胞 | 合成生物学 | NA | 酶工程, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 非经典辅因子依赖代谢通路 | 合成生物学 |
| 263 | 2026-05-18 |
Engineering of a Complex of the DNase Domain of Colicin E9 with the Immunity Protein Im9 Activated by the Protease pS273R of African Swine Fever Virus
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00398
PMID:40925015
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研究论文 | 设计了一种由ASFV pS273R蛋白酶激活的DNase E9与Im9蛋白复合物,作为病毒触发型杀灭开关 | 通过将病毒蛋白酶切割位点插入免疫蛋白Im9的暴露环中,构建了仅当ASFV蛋白酶存在时才释放DNase活性的蛋白质开关,提供了一种可推广的利用病毒编码蛋白酶触发休眠效应物的合成生物学策略 | 尚未在活体细胞或动物模型中验证该开关的有效性和安全性,且对非靶标蛋白酶的特异性需进一步评估 | 开发一种针对非洲猪瘟病毒的合成限制系统,通过病毒DNA降解使猪细胞对ASFV不具允许性 | 大肠杆菌素E9的DNase结构域及其免疫蛋白Im9的复合物 | 合成生物学 | 非洲猪瘟 | 蛋白质工程,蛋白酶切割位点插入,体外酶活测定 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白开关(蛋白酶切割激活的DNase) | 农业,医学 |
| 264 | 2026-05-18 |
RNA Polymerase III Promoters Compatible with CRISPR Gene Regulation in Saccharomyces cerevisiae
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00122
PMID:40824237
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研究论文 | 表征了不同酵母物种和哺乳动物来源的20种RNA聚合酶III启动子在酿酒酵母中实现CRISPR基因调控的功能 | 首次系统比较跨物种RNA Pol III启动子在CRISPR激活和抑制中的功能,发现启动子架构和核心序列基序影响功能,并证明支架介导的多效应子招募可补偿弱启动子功能 | 部分启动子功能可能受限于特定环境或基因靶点,未测试所有可能的启动子组合 | 扩展酿酒酵母中用于CRISPR sgRNA表达的RNA聚合酶III启动子库,实现多重基因调控 | 跨物种RNA聚合酶III启动子(来自不同酵母、酿酒酵母自身及哺乳动物) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因表达数据 | 20种启动子 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CRISPR激活与抑制回路 | 合成生物学, 代谢工程, 表型工程 |
| 265 | 2026-05-18 |
Recent Advances in the Biological Synthesis of l-Tyrosine Derivatives by Genetically Engineered Microbes
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00475
PMID:40833382
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综述 | 总结了利用基因工程微生物生物合成l-酪氨酸衍生物的最新进展 | 系统综述了多种l-酪氨酸衍生物(如酪醇、左旋多巴、对香豆酸等)在微生物中的生物合成,并介绍了代谢工程、酶修饰和菌株育种等提高产量的策略 | 未具体说明,但综述性文章可能缺乏原始实验数据和定量比较 | 概述l-酪氨酸衍生物的微生物合成研究现状及未来发展趋势 | l-酪氨酸衍生物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶修饰、菌株育种 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | 生物合成途径 | 食品, 化妆品, 制药 |
| 266 | 2026-05-18 |
Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00368
PMID:40844977
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研究论文 | 本文鉴定了黑曲霉中最强的翻译延伸因子1-α基因启动子及其首个内含子,并构建了高效的报告系统 | 首次报道了tef1α启动子及其内含子作为黑曲霉中最强的启动子,活性超过常用gpdA启动子20倍以上,并验证了其在多基因共表达和核定位中的高效性能 | 未提及在工业发酵条件下或长时间培养中的启动子稳定性及可能存在的调控复杂性 | 开发并验证黑曲霉中强启动子驱动的报告系统,用于真菌合成生物学和代谢工程 | 黑曲霉 | 机器学习 | NA | 荧光报告基因检测、共表达系统、融合构建 | NA | 荧光信号图像、染色信号 | 使用多个报告基因(EGFP、mCherry、mRFP1、GUS)和多个融合构建进行实验 | NA | 黑曲霉 | 强启动子驱动的报告系统和双顺反子表达系统 | 工业生物技术 |
| 267 | 2026-05-18 |
Progress in the Synthesis of Sterols and Related Natural Products by Manipulating the Ergosterol Biosynthetic Pathway in Saccharomyces cerevisiae
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00438
PMID:40859817
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综述 | 综述了通过操纵酿酒酵母麦角固醇生物合成途径合成甾醇及相关天然产物的研究进展 | 系统总结了利用合成生物学策略在酿酒酵母中实现多种高价值甾醇从头合成的最新代谢工程进展 | 未明确指出当前研究方法的具体局限,如产率瓶颈或代谢负担 | 回顾和总结酿酒酵母中甾醇生物合成的代谢工程研究进展 | 甾醇及酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢工程 | 酿酒酵母 | 麦角固醇生物合成途径 | 农业, 医药 |
| 268 | 2026-05-18 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
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研究论文 | 通过重新编程酶的催化残基,将通用碱基替换为具有更高固有pKa值的可电离残基,实现酶在碱性pH下的高效催化 | 提出了一种整合理性设计催化残基与定向进化的酶工程策略,通过将羧酸盐介导的质子转移机制转变为酚盐介导的机制,实现了酶在碱性pH下的高效催化,并将最优pH值移动了超过3个单位 | 该策略目前主要在TEM β-内酰胺酶中验证,对其他类型水解酶的普适性有待进一步研究 | 开发一种通用的酶工程方法,使酶能够在碱性pH条件下发挥功能,扩展酶在工业和环境生物催化中的应用范围 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体YR5-2 | 生物催化 | NA | 定向进化、分子动力学模拟 | NA | 酶动力学数据、模拟数据 | 涉及多种变体(E166Y、YR5-2及Y166E回复突变体)的动力学表征 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物催化、环境生物催化 |
| 269 | 2026-05-18 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
|
研究论文 | 提出利用预印本批判性分析和探究式实验课程提升合成生物学学习体验的教学方法 | 将预印本引入教学,通过对比手稿与最终发表版本培养学生的批判性分析能力,并结合基于CRISPRi基因电路的实践实验,完整覆盖设计-构建-测试-学习循环 | 未具体指出研究局限性 | 改进合成生物学教学模式,结合主动学习工作流提升学生批判性分析能力与概念掌握程度 | 大学合成生物学课程的学生 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | NA | 学生群体,具体数量未说明 | CRISPRi | NA | 基于CRISPRi的基因电路 | 教育 |
| 270 | 2026-05-17 |
CTRL Enables Gene-Specific RNA Regulation Using CRISPR-Cas7-11
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00658
PMID:41202215
|
研究论文 | 利用CRISPR-Cas7-11效应器开发了一种名为CTRL的基因特异性RNA调控工具,实现对mRNA和蛋白质表达的高效、可调抑制 | 首次利用CRISPR-Cas7-11的直接重复序列加工活性开发基因抑制工具,实现可调控的基因特异性RNA调控,并在多种模式系统中展示广泛适用性 | NA | 开发一种新型基因表达调控工具以实现精确的RNA靶向抑制 | 合成mRNA分子及Cas7-11效应器的多种变异体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas7-11 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas7-11 | 多种模式系统 | CRISPR-Cas转基因可抑制元件,用于靶向合成mRNA | 医学, 生物技术 |
| 271 | 2026-05-17 |
Harnessing Fungal Secretion Systems for Precision Fermentation of Food Proteins
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00521
PMID:41220338
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综述 | 探讨利用真菌分泌系统进行食品蛋白质精密发酵的策略与挑战 | 系统阐述了酵母和丝状真菌分泌途径在精密发酵生产食品蛋白质中的作用,并强调数据驱动的分泌效率工程是从小规模生产向工业化制造的关键 | 未提供具体实验数据支持,仅基于现有研究提出观点和未来方向 | 分析如何通过修饰分泌途径提高蛋白质分泌效率,以实现精密发酵食品蛋白质的成本效益和规模化生产 | 酵母和丝状真菌等微生物宿主及其蛋白质分泌途径 | 合成生物学, 蛋白质工程, 生物加工优化 | NA | 精密发酵, 蛋白质分泌工程 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 丝状真菌 | 蛋白质分泌途径修饰 | 食品工业, 替代蛋白质生产 |
| 272 | 2026-05-17 |
Advanced Large DNA Manipulation Technologies for Constructing Microbial Cell Factories
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00539
PMID:41105858
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综述 | 系统总结大DNA操作技术四类核心原理及其在构建微生物细胞工厂中的应用进展 | 首次从克隆、组装、递送和重排四类技术角度系统归纳大DNA操作技术,并探讨其在复杂生物合成基因簇获取、多基因途径构建及代谢网络优化中的关键作用 | 未提及具体技术细节的比较或局限性分析 | 为构建高性能微生物细胞工厂提供大DNA操作技术参考 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 大DNA操作技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 生物制造 |
| 273 | 2026-05-17 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 综述了利用合理与非理性策略构建原核细胞工厂生产芳香族氨基酸衍生物的研究进展 | 重点总结了合理与非理性策略在构建原核细胞工厂中的应用,并探讨了未来发展方向 | 未具体提及研究局限,但可能涉及当前发酵生产面临的高滴度和产率挑战 | 为生产芳香族氨基酸衍生物的原核细胞工厂的构建和优化提供见解和指导 | 原核细胞工厂 | 代谢工程与合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物 | NA | 工业生物技术 |
| 274 | 2026-05-17 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
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综述 | 探讨合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何为开发具有环境响应功能的可编程纳米材料创造机遇 | 提出生物相容性从静态特性向动态可编程特性的根本性重新概念化,实现纳米材料像复杂生物实体而非传统治疗剂运行 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在显著挑战 | 综述下一代绿色纳米材料中可编程生物界面与自适应功能性的研究进展 | 绿色纳米材料 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术, 4D生物打印 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 工程微生物系统 | 基因电路驱动的响应系统, DNA刺激响应结构, 分子逻辑门 | 医学 |
| 275 | 2026-05-17 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
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综述 | 回顾SBOL Visual标准过去十年的发展历程,从最初的21个图形符号演变为全面的生物设计图解语言,并分析其采纳情况与未来展望 | 系统梳理了SBOL Visual标准从1.0到3.0版本的演变过程,并首次评估了其在科学出版物、可视化工具开发及遗传设计信息交流中的采纳趋势 | 尽管采纳率稳步增长,但实现完全合规和最佳实践的广泛应用仍需额外努力 | 回顾SBOL Visual标准十年发展并评估其采纳情况,为合成生物学图形标准优化提供参考 | SBOL Visual标准及其在合成生物学领域的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本和图形数据 | NA | SBOL Visual, SBOL | NA | 遗传设计图解语言 | 工业生物技术 |
| 276 | 2026-05-17 |
Automated Strain Construction for Biosynthetic Pathway Screening in Yeast
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00554
PMID:41063332
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研究论文 | 本文提出了一个自动化菌株构建工作流程,用于在酵母中筛选生物合成途径 | 通过Hamilton Microlab VANTAGE机器人集成离线硬件,实现了构建步骤的自动化,提高了通量至每周2000次转化,并开发了用户界面支持参数定制 | 未提及,但从技术说明性质看,可能缺乏大规模验证或通用性测试 | 自动化合成生物学中的菌株构建流程,加速途径发现与优化 | 工程酵母菌株中生产维拉嗪(一种甾体生物碱生物合成关键中间体)的基因库 | 合成生物学 | NA | 自动化菌株构建、基因库筛选 | NA | 基因序列数据 | 每周2000次转化(通量数据) | NA | 酿酒酵母 | 生物合成途径(维拉嗪生产) | 工业生物技术、医药 |
| 277 | 2026-05-17 |
Engineering Fibroblast Growth Factor-2 (FGF2) Production in Cyanobacteria
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00388
PMID:41045549
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research paper | 本研究通过将成纤维细胞生长因子2(FGF2)与藻蓝蛋白CpcB亚基融合,在蓝细菌中实现了FGF2的稳定表达和生物活性保持 | 首次通过融合藻蓝蛋白CpcB亚基的方法,克服了FGF2因仅含β-折叠结构而在异源系统中难以稳定表达的问题,并保持了融合蛋白的双重生物活性 | 研究仅测试了单一种类的蓝细菌(集胞藻PCC 6803),且未探讨融合蛋白的规模化生产或长期稳定性 | 实现对难于表达的FGF2蛋白在蓝细菌中的稳定重组表达 | 成纤维细胞生长因子2(FGF2)和集胞藻PCC 6803 | synthetic biology | NA | 基因融合、密码子优化 | NA | NA | NA | NA | 集胞藻PCC 6803 | FGF2与藻蓝蛋白CpcB亚基的融合基因构建 | 医学、生物技术 |
| 278 | 2026-05-17 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 利用工程化生物分子凝聚体构建人工细胞器,实现代谢途径的区室化通量控制 | 首次设计FUSLCD-GCN4融合蛋白系统创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来增强代谢途径效率 | 该研究仅以2'-岩藻糖基乳糖合成途径为模型,未验证在其他代谢途径中的通用性 | 建立基于生物分子凝聚体的合成生物学平台,实现通量区室化控制以提高微生物细胞工厂的生物合成效率 | 工程化大肠杆菌及其中的人工细胞器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 蛋白质融合设计 | 大肠杆菌 | 人工细胞器(基于FUSLCD-GCN4的区室化途径) | 工业生物技术 |
| 279 | 2026-05-17 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 结合分支卷积神经网络设计和高通量微流控荧光激活细胞分选,筛选增强型合成酵母启动子 | 首次将分支卷积神经网络(B-CNN)与遗传算法结合,用于预测和重新设计酵母启动子核心区域,并集成微流控荧光激活细胞分选(μFACS)系统实现高吞吐量单细胞分选 | 未提及大规模验证或其他酵母菌株的通用性 | 实现合成酵母启动子的理性设计和高效高通量筛选,提升基因表达和代谢物生物合成性能 | 酵母酒精氧化酶1启动子(P_AOX1)及其突变体 | 机器学习 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS)、分支卷积神经网络(B-CNN)、遗传算法 | 分支卷积神经网络(B-CNN) | 序列数据和荧光图像 | GFP表达文库,具体数量未给出;细胞吞吐量7000个/秒 | NA | 酵母(毕赤酵母) | 合成启动子(P_AOX1核心区重新设计)及GFP报告基因表达电路 | 工业生物技术、医药 |
| 280 | 2026-05-17 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 在酿酒酵母中通过代谢与脂滴工程联合策略实现弗里德林的全新合成 | 首次在酿酒酵母中构建弗里德林的全新生物合成途径,并结合脂滴工程技术极大提高产量至1500 mg/L | 仅进行了摇瓶发酵,尚未进行中试或大规模生产验证 | 开发高效、可持续的弗里德林微生物生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 弗里德林生物合成途径 | 医药 |