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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-01-09 |
Synthetic bacterium-facilitated colonization of nitrogen-fixing bacteria for remodeling the rhizosphere microbiome and improving plant yield
2025-Nov-29, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02189-5
PMID:41318663
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,利用表达多糖结合蛋白的工程菌EcCMC,促进固氮细菌在豆科植物根部的定殖,从而改善根际微生物组、提高固氮效率和植物产量 | 首次设计并应用表达表面展示人工多糖识别蛋白Cmc的合成细菌EcCMC,以增强固氮细菌在植物根部的定殖能力,从而调控根际微生物组 | 研究仅针对两种豆科植物(紫云英和紫花苜蓿)进行了短期(28天)实验,样本量较小(n=3),且未评估长期效应或在不同环境条件下的适用性 | 通过合成生物学手段改善固氮细菌在植物根部的定殖效率,以增强生物固氮作用、提高土壤肥力和植物产量 | 豆科植物(紫云英和紫花苜蓿)及其根际微生物组,包括固氮细菌(如Sinorhizobium meliloti和Sphingomonas endophytica)和工程菌EcCMC | 合成生物学 | NA | 16S rRNA基因扩增子测序、代谢组学分析、氮酶活性测定 | NA | 微生物组测序数据、代谢物数据、生化指标数据 | 每组3个重复,共3个处理组(对照组、NFBs加EcM组、NFBs加EcCMC组) | 基因工程 | 大肠杆菌(E. coli) | 设计表达表面展示人工多糖识别蛋白Cmc的合成细菌EcCMC,用于结合植物根部多糖并促进固氮细菌定殖 | 农业 |
| 262 | 2026-01-09 |
Recent advances in nucleic acid nanotechnology-driven artificial transcriptional components
2025-Nov-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03210e
PMID:41221719
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综述 | 本文综述了核酸纳米技术在转录调控中的应用,重点介绍了其在模块化设计、动态响应和逻辑信息处理方面的优势 | 利用核酸纳米技术的可编程性、时空精确性和分子级可控性,构建人工转录组件以实现精确的转录调控 | NA | 探讨核酸纳米技术在转录调控领域的应用潜力 | 人工转录组件及其在转录过程中的调控机制 | 合成生物学 | NA | 核酸纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工转录组件,包括模块化设计、动态响应和逻辑信息处理 | 生物计算、智能生物制造、生物传感 |
| 263 | 2026-01-09 |
Recent advances in the transformation of maleimides via annulation
2025-Jan-02, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d4ob01632g
PMID:39545834
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综述 | 本文综述了2019年至2024年间马来酰亚胺通过环化反应转化的最新研究进展,重点介绍了其在环化、苯环化、环加成和螺环化等反应中的应用 | 总结了光催化和电化学等新兴方法在马来酰亚胺环化反应中的应用,拓展了其合成复杂分子的可持续性和选择性途径 | 某些反应如基于环加成的环化、光环化和电化学转化在制药和化学工业中潜力巨大但尚未被充分探索 | 系统梳理马来酰亚胺环化策略的研究进展,探讨其在合成生物学和材料科学中的新应用方向 | 马来酰亚胺骨架及其环化反应 | 有机化学 | NA | 光催化、电化学方法、C-H活化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物化学、药物发现、材料科学 |
| 264 | 2026-01-09 |
Harnessing mass spectrometry-based proteomics for continuous directed evolution
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf017
PMID:41492657
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研究论文 | 本文探讨了如何利用基于质谱的蛋白质组学技术来支持连续定向进化过程,以AtMS1和AtMS2甲硫氨酸合酶的连续进化为例 | 首次将基于质谱的蛋白质组学(包括全蛋白质组分析和靶向蛋白质组学)系统性地应用于连续定向进化过程中,以监测目标酶丰度、识别群体构建缺陷、测量代谢适应并指导进化策略决策 | NA | 开发并展示一种利用蛋白质组学技术来增强连续定向进化效率和理解进化机制的方法 | 甲硫氨酸合酶AtMS1和AtMS2的连续定向进化过程 | 合成生物学 | NA | 基于质谱的蛋白质组学(全蛋白质组分析、靶向蛋白质组学) | NA | 蛋白质组数据 | NA | 连续定向进化 | 平台细胞(具体未指明) | NA | 工业生物技术 |
| 265 | 2026-01-09 |
Emerging trends in genome integration tools for precision engineering of diverse bacterial species
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf019
PMID:41492658
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综述 | 本文综述了用于多种细菌物种精确基因编辑的基因组整合工具的新兴趋势,重点关注自包含、便携式系统 | 强调CRISPR引导系统与整合酶结合的最新进展,以及面向非模式生物的工程化趋势 | 依赖宿主DNA修复机制的传统技术限制了在缺乏这些能力的生物中的应用 | 探索和推动细菌基因组精确整合工具的发展,以实现细胞表型的全面工程化和新生物技术的创建 | 细菌物种,特别是非模式生物 | 合成生物学 | NA | 同源重组、CRISPR引导系统、整合酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 重组工程技术 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 266 | 2026-01-07 |
Harnessing microalgae for bioproducts: innovations in synthetic biology
2025-Dec-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04727-7
PMID:41359128
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综述 | 本文综述了合成生物学在微藻工程中的应用,以促进可持续生物燃料和高价值生物产品的生产 | 整合CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库和动态环境响应调控电路等最新合成生物学工具,提升微藻代谢途径的精确重编程能力 | 菌株鲁棒性和生物过程转化方面仍存在挑战 | 推动微藻作为可持续生物制造平台的发展,以支持低碳生物经济 | 微藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库、动态调控电路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆系统 | 微藻 | 动态环境响应调控电路,用于控制脂质和色素生物合成 | 能源, 工业生物技术 |
| 267 | 2026-01-07 |
Exploiting Salmonella typhimurium as a novel cancer therapeutic agent: from tumor colonization to metabolic engineering
2025-Nov-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04716-w
PMID:41307628
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综述 | 本文综述了利用鼠伤寒沙门氏菌作为新型癌症治疗剂的机制、代谢工程进展及临床转化挑战 | 首次系统整合鼠伤寒沙门氏菌的多重抗癌机制(凋亡诱导、自噬诱导、免疫调节等),并从代谢工程与合成生物学角度提出增强治疗特异性的统一视角 | 细菌介导的癌症疗法仅能作为现有癌症治疗的补充手段,无法完全替代传统疗法,且存在生物安全性与临床转化挑战 | 探讨利用细菌天然靶向肿瘤特性开发新型癌症治疗策略 | 鼠伤寒沙门氏菌及其代谢工程改造菌株 | NA | 癌症 | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 鼠伤寒沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 268 | 2026-01-07 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-Oct-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
|
研究论文 | 本研究提出了一种结合机器学习和化学信息学的新方法,利用分子指纹预测化合物对利什曼原虫前鞭毛体的活性,以加速抗利什曼病药物的发现 | 首次将Avalon、MACCS Key和Pharmacophore三种分子指纹算法与随机森林、多层感知器、梯度提升和决策树等多种机器学习算法结合,并引入了集成模型,用于针对利什曼病的化合物活性预测 | 研究仅针对利什曼原虫的前鞭毛体阶段进行活性预测,未涵盖无鞭毛体阶段;模型性能仍有提升空间(最高准确率83.65%) | 开发一种高效的计算方法来预测和筛选具有抗利什曼病活性的化合物,以应对现有疗法副作用大和耐药性上升的挑战 | 来自PubChem数据库的65,057个化合物分子,针对利什曼原虫前鞭毛体 | 机器学习 | 利什曼病 | 化学信息学、分子指纹编码(基于SMILES)、Alamar Blue检测法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 化学结构数据(分子指纹) | 65,057个化合物分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 269 | 2026-01-06 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
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综述 | 本文系统综述了膳食皂苷作为抗衰老剂的分子机制、营养干预及产品开发 | 系统总结了膳食皂苷通过多种信号通路(如Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制、构效关系及产品开发,并提出了未来研究方向 | NA | 探讨膳食皂苷的抗衰老作用及其应用潜力 | 膳食皂苷 | NA | 衰老相关疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药, 食品 |
| 270 | 2026-01-06 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Dec, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
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综述 | 本文综述了1-羟基吩嗪(1-HP)作为应对抗菌素耐药性(AMR)的新型抗菌策略的潜力,涵盖其历史、作用机制、生物合成及在农业、生物技术和医学中的应用前景 | 系统整合了1-HP作为毒力因子和治疗支架的双重角色,并强调通过合成生物学、代谢工程和纳米载体递送系统实现规模化生产与毒性降低的创新策略 | NA | 探索应对抗菌素耐药性的新型抗菌策略,重点关注吩嗪类化合物特别是1-HP的潜力 | 1-羟基吩嗪(1-HP)及其作为抗菌剂和抗癌先导化合物的特性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程,纳米载体递送系统,结构修饰(如卤化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业,生物技术,医学 |
| 271 | 2026-01-05 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
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综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展,探讨其在精准医疗和微创治疗领域的应用前景 | 将纳米工程、合成生物学与智能计算相结合,推动静态结构向能动态导航胃肠环境的智能代理发展,实现分子水平的智能微创手术 | 面临自主性控制、脱靶效应、伦理法律框架等重大挑战,临床转化仍需跨学科协作 | 探讨纳米机器人技术在胃肠外科精准医疗和微创治疗中的应用与发展路径 | 手术纳米机器人及其在胃肠环境中的应用 | NA | NA | 纳米工程、合成生物学、智能计算 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 272 | 2026-01-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 通过流体动力学模拟和单分子追踪实验,研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学行为 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分,可诱导并稳定单个脂筏,且聚合物吸附物可作为膜异质性的生物传感器 | 研究基于简化模型和实验条件,实际生物膜环境更复杂,需进一步验证 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术和细胞过程中的作用 | 线性聚合物在二元脂质膜上的吸附与扩散行为 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟、单分子追踪实验 | Saffman-Delbrück扩散模型、Zimm模型、Stokes-Einstein模型 | 模拟数据、实验追踪数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物传感、治疗、合成生物学 |
| 273 | 2026-01-04 |
A Review of Receptor Recognition Mechanisms in Coronaviruses
2025-Dec-16, Viruses
DOI:10.3390/v17121628
PMID:41472297
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综述 | 本文综述了冠状病毒家族中不同属的宿主受体识别机制,并总结了病毒受体的鉴定和阐明方法 | 整合结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学和人工工程化病毒受体,为阐明冠状病毒-受体相互作用提供了一个强大的框架 | NA | 阐明冠状病毒的受体识别机制,以更好地理解病毒感染、传播和发病机制,并支持广谱抗病毒药物、智能生物传感器和针对新兴冠状病毒的干预策略的开发 | 冠状病毒家族及其宿主受体 | NA | 冠状病毒感染 | 结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 274 | 2026-01-04 |
CRISPR Treatments for AI-Designed Synthetic Viruses: Rapid Programmable Countermeasures for Emerging and Engineered Viruses
2025-Dec-05, Viruses
DOI:10.3390/v17121588
PMID:41472258
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综述 | 本文综述了利用可编程CRISPR技术对抗新兴及人工合成病毒的快速应对策略 | 提出将实时测序、AI辅助gRNA筛选与多重CRISPR盒设计相结合的快速响应管线,并强调多gRNA鸡尾酒疗法、持续基因组监测及自适应gRNA轮换等创新策略 | NA | 构建基于CRISPR的抗病毒对策以应对自然爆发和人工智能设计的生物威胁 | 新兴及人工合成的DNA与RNA病毒 | 合成生物学 | 病毒性疾病 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13, 实时测序, AI辅助设计 | NA | 基因组序列 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13 | NA | 多重CRISPR盒设计 | 医学 |
| 275 | 2026-01-04 |
A Bioorthogonal and Programmable Bacterial Delivery System for Spatiotemporally Targeted Therapy of Solid Tumors
2025-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240396
PMID:41476656
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研究论文 | 本文设计了一种基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的时空靶向递送系统,用于实体瘤治疗,通过叠氮修饰的透明质酸水凝胶和近红外辐射控制,实现安全有效的肿瘤靶向治疗 | 开发了一种结合温度驱动基因状态开关和生物正交水凝胶的时空靶向系统,能精准控制细菌在肿瘤微环境中的治疗输出,增强肿瘤浸润淋巴细胞活性 | NA | 开发一种安全、可编程的细菌递送系统,用于实体瘤的时空靶向治疗,以克服传统细菌疗法对健康组织的潜在危害 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917、叠氮修饰的透明质酸水凝胶、近红外辐射诱导系统 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工程、温度驱动基因开关、近红外辐射诱导 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 温度驱动的遗传状态开关,用于控制治疗性输出的产生和释放 | 医学 |
| 276 | 2026-01-04 |
Bioengineering hybrid artificial life
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1676359
PMID:41477590
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综述 | 本文探讨了生物工程与人工生命(ALife)的融合,旨在通过标准化生物部件设计适应性、进化性的人工生命系统,以解决实际问题 | 提出了一种混合合成人工生命设计方法论,结合数字和生物进化设计方法,以克服当前合成人工生命在进化适应性和任务适应性方面的限制 | 当前合成人工生命在定向进化、适应度景观映射和适应度近似方面存在显著不足,导致其无法持续进化并适应变化的任务和环境 | 旨在解决合成人工生命在定向进化中的开放挑战,推动生物工程化问题解决型人工生命的实现 | 人工生命系统,特别是通过生物工程和合成生物学方法设计的适应性、进化性系统 | 合成生物学 | NA | 定向进化、遗传多样性生成、适应度映射、适应度估计 | NA | NA | NA | 标准化生物部件(如启动子、核糖体) | 微生物(如用于环境清理或抗体生产的工程微生物) | 问题解决型人工生命系统,可能涉及逻辑门、生物传感器或代谢途径 | 环境、医学、工业生物技术 |
| 277 | 2026-01-03 |
Temperature-Dependent Recombinase-Based Genetic Circuits
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412055
PMID:41465482
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研究论文 | 本文设计并表征了一套基于温度依赖的DNA重组酶遗传电路,通过整合RNA温度计实现基因表达的精确、不可逆控制 | 首次将RNA温度计与位点特异性DNA重组酶整合,实现了温度依赖的不可逆基因表达控制,并展示了空间图案生成、温度梯度记录和可控细胞裂解等创新应用 | 未明确说明电路的长期稳定性、在不同宿主中的普适性以及大规模应用时的能耗问题 | 开发温度调控的遗传电路以实现可编程、空间分辨且不可逆的基因表达控制 | 基于Bxb1丝氨酸重组酶和FourU RNA温度计的遗传电路系统 | 合成生物学 | NA | RNA温度计技术、位点特异性DNA重组技术 | NA | 基因表达数据、空间图案数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于重组酶系统) | 大肠杆菌(根据合成生物学常规推断) | 温度敏感型重组开关电路,包含RNA温度计调控的重组酶表达模块 | 合成生物学, 生物传感, 生物生产 |
| 278 | 2026-01-03 |
Synthetic Pentatricopeptide Repeat Proteins: Building a Toolkit for Precise RNA Control
2025-Dec-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412033
PMID:41465458
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综述 | 本文综述了合成五肽重复(synPPR)蛋白作为可编程RNA工程工具的最新进展,包括其设计原理、应用及在生物医学领域的潜力 | 利用可预测的氨基酸-核苷酸识别密码理性设计合成PPR蛋白,并将其与催化结构域融合,创建可在多种生物系统中实现精确碱基编辑的可定制酶 | NA | 总结PPR介导的RNA编辑的结构与机制原理,并探讨合成PPR蛋白在RNA工程中的应用前景 | 合成五肽重复(PPR)蛋白及其作为RNA结合因子和编辑工具的特性 | 合成生物学 | RNA介导的疾病 | 理性蛋白质设计、结构域融合 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌, 植物, 人类细胞 | 可编程RNA稳定器、翻译调节器、靶向C-to-U或U-to-C编辑器 | 基础研究, 生物技术, 生物医学 |
| 279 | 2026-01-03 |
Development of the Efficient Electroporation Protocol for Leuconostoc mesenteroides
2025-Dec-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411933
PMID:41465360
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种适用于肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株的高效、可重复的电穿孔转化方案 | 首次为该菌株建立了稳定可重复的转化方法,通过顺序优化细胞壁处理、电刺激参数和恢复条件,并结合质粒甲基化模式匹配,使转化效率提升约40倍 | 方法具有菌株特异性,可能不完全适用于其他乳酸菌,且未在更广泛的工业菌株中进行验证 | 克服肠膜明串珠菌的遗传操作障碍,为其代谢工程和合成生物学应用建立高效的基因转移技术 | 肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株 | NA | NA | 电穿孔转化 | NA | NA | NA | 电穿孔 | 肠膜明串珠菌 | NA | 食品工业, 工业生物技术 |
| 280 | 2026-01-03 |
From Ancient Fermentations to Modern Biotechnology: Historical Evolution, Microbial Mechanisms, and the Role of Natural and Commercial Starter Cultures in Shaping Organic and Sustainable Food Systems
2025-Dec-10, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14244240
PMID:41464947
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综述 | 本文回顾了天然发酵剂从古代自发发酵到现代生物技术的历史演变,探讨了其微生物机制、全球应用,并与商业发酵剂进行了对比,同时分析了其在有机和可持续食品系统中的角色与未来创新方向 | 系统性地将天然发酵剂的历史演变、微生物机制、全球应用与有机食品生产及可持续发展原则相结合,并探讨了组学技术、合成生物学等新兴创新如何在不损害其真实性的前提下提升其安全性、稳定性和功能性 | 当前监管框架主要集中于酵母,对更广泛的认证构成了挑战和机遇,且天然发酵剂的高微生物多样性虽带来功能韧性,但也引入了可变性和安全性挑战 | 探讨天然发酵剂在塑造有机和可持续食品系统中的作用,并分析其历史发展、微生物机制、应用现状及未来创新路径 | 天然发酵剂(由乳酸菌、酵母和丝状真菌组成的复杂微生物群落)及其在全球各类食品(谷物、豆类、乳制品、蔬菜、饮料、海鲜和肉类)中的应用 | NA | NA | 组学驱动的菌株选择、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业, 工业生物技术 |