合成生物学相关文章
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当前共找到 1531 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-05-25 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-09-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 通过多组学分析和CRISPR-Cas基因编辑，破译海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物的降解途径，发现β-酮己二酸途径与β-氧化途径在硫解步骤的交叉对话 | 首次揭示海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物降解的完整途径，并发现途径交叉对话的新机制 | 研究主要基于模型化合物，对其他芳香化合物的适用性及海洋环境中的实际降解效率尚待验证 | 阐明海洋细菌中芳香化合物的生物转化途径，为环境修复和生物碳循环利用奠定基础 | 海洋玫瑰杆菌分支菌中的芳香化合物降解途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析, CRISPR-Cas基因编辑, NGS | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 海洋玫瑰杆菌分支菌 | β-酮己二酸途径与β-氧化途径的交叉对话 | 环境, 工业生物技术 |
| 262 | 2026-05-25 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-09-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
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研究论文 | 本研究利用SCRaMbLE方法对关键基因进行进化，构建了由三株工程化大肠杆菌组成的合成菌群，用于高效降解菲 | 首次将SCRaMbLE方法应用于多环芳烃降解菌群关键基因的定向进化，显著提升了菲的降解效率 | 研究仅测试了100 mg/L的菲浓度，未评估其他浓度或实际污染环境中菌群的降解性能 | 开发基于合成生物学和SCRaMbLE的微生物菌群策略，以增强菲的生物降解 | 菲，一种多环芳烃污染物 | 环境工程 | NA | SCRaMbLE | NA | 生物降解数据 | 三个工程化大肠杆菌菌株（E. coli SCRPHE033、E. coli SCRKA065、E. coli CRSA）在含有100 mg/L菲的MSM培养基中测试 | SCRaMbLE | 大肠杆菌BL21(DE3) | 菲完全矿化的三个分解代谢模块（上游、下游及辅助模块），整合17个关键基因 | 环境生物修复 |
| 263 | 2026-05-25 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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评论 | CTGCT卓越中心旨在将科学发现转化为针对神经系统罕见遗传病和癌症的先进基因与细胞疗法 | 斯洛文尼亚首个此类中心，整合合成生物学工具、基因编辑、RNA技术、免疫调控工程及新型递送系统，建立GMP设施推动临床转化 | 尚未提供具体实验数据或临床结果评估 | 推动基因与细胞疗法从基础研究向临床应用转化 | 神经系统罕见遗传病和癌症 | 数字病理学 | 神经系统罕见遗传病, 癌症 | 基因编辑, 剪接技术, RNA技术, 免疫调控工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 264 | 2026-05-23 |
Cancer-associated transporters: Molecular drivers and drug delivery gateways
2025-12, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117376
PMID:41046076
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综述 | 系统描述p53对膜转运蛋白的调控及其在癌症代谢、耐药和治疗中的角色 | 整合p53野生型、突变型和淀粉样构象对多种转运蛋白（糖、氨基酸、金属离子、脂质转运蛋白及ABC转运蛋白）的转录和转录后调控，并探索双重靶向p53异常和膜转运蛋白的合成生物学与精准递送策略 | p53调控转运蛋白的转录后机制和淀粉样构象的作用仍未被充分研究 | 阐明p53调控膜转运蛋白的分子机制，并探讨其在癌症代谢重编程和耐药中的治疗潜力 | p53野生型、突变型和淀粉样形式调控的膜转运蛋白（如GLUTs、MCTs、NIS、P-gp、LAT1等） | 癌症生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9, 小分子抑制剂, siRNA, 纳米颗粒共递送系统 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成生物学和精准递送途径（双靶向策略） | 医学 |
| 265 | 2026-05-23 |
Artificial cells with liquid-liquid phase separation-regulated cell-free protein synthesis
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511283122
PMID:41269793
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研究论文 | 该论文展示了利用液-液相分离调控的工程聚合物，实现对细胞自由蛋白质合成活性的可逆调控，从而构建具有可控蛋白质表达功能的人工细胞 | 提出利用液-液相分离诱导蛋白质聚集的机制，实现批量酶的抑制效果，并开发了一种微流控平台制造封装CFPS系统的人工细胞，在体内胆汁结扎小鼠模型中验证了碱性条件下蛋白质表达的显著差异 | 体内实验仅针对胆汁结扎小鼠模型，可能限制了其普适性评估 | 构建具有可调蛋白质合成能力的人工细胞，实现精确的时空蛋白质表达控制 | 液-液相分离调控的聚合物、细胞自由蛋白质合成系统、巨大单层囊泡、胆汁结扎小鼠模型 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离、微流控技术 | NA | 实验数据 | 胆汁结扎小鼠模型（样本量未明确说明） | NA | NA | 液-液相分离调控的蛋白质聚集回路 | 生物医学 |
| 266 | 2026-05-23 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.05.673737
PMID:40950212
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研究论文 | 开发了基于簇定位调控因子的链霉菌自诱导剂生物传感器及合成其配体的途径 | 首次系统开发了八种基于CSR的自诱导剂生物传感器，并验证了其在共培养和正交信号系统中的应用潜力 | 仅测试了部分非认知CSR与自诱导剂之间的串扰，且生物传感器的工业适用性有待进一步评估 | 开发和应用基于CSR的自诱导剂生物传感器以解析链霉菌群体感应回路并增强遗传回路复杂性 | 链霉菌中的簇定位调控因子及其自诱导剂配体 | 合成生物学 | NA | 生物传感器构建、共培养分析 | NA | 基因表达数据 | 八个CSR-自诱导剂系统及配体合成途径 | NA | 链霉菌, 大肠杆菌 | 生物传感器、正交信号系统、多输入遗传回路 | 工业, 农业 |
| 267 | 2026-05-22 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
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综述 | 总结通过转录和翻译调控因子提高中国仓鼠卵巢（CHO）细胞中重组蛋白表达的策略 | 系统综述了转录因子和翻译调控因子在CHO细胞重组治疗蛋白生产中的应用，并提出了结合基因组学和合成生物学进展优化表达的新方法 | 未具体说明实验验证数据或量化不同策略的效果对比 | 提高CHO细胞中重组治疗蛋白的表达效率并降低生产成本 | CHO细胞中的转录因子和翻译调控因子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，基因组学 | NA | 综述文献 | NA | NA | CHO细胞 | NA | 医学 |
| 268 | 2026-05-21 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-12-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香族聚酮化合物生物合成中的氧化重排反应 | 系统总结了黄素依赖性单加氧酶催化的Baeyer-Villiger和Favorskii型氧化重排、酮还原酶和双加氧酶催化的创新碳骨架重排以及CYP450或NmrA样蛋白催化的分子间二聚化等独特反应，并揭示了相关酶的结构特征和催化机制 | 时间范围截止至2025年4月，可能未涵盖近期最新研究进展 | 阐述细菌芳香族聚酮生物合成中天然酶如何利用氧化还原化学创造新碳骨架 | 细菌芳香族聚酮化合物生物合成中的氧化重排反应和相关酶类 | 天然产物生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 芳香族聚酮生物合成途径中的氧化重排反应 | 医学 |
| 269 | 2026-05-21 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-09, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在长期脱碳中的潜力，并采用自上而下的方法量化其影响 | 首次从宏观角度系统评估合成生物学不同应用领域对全球脱碳的贡献潜力，并分析其对碳价等经济因素的敏感性 | 采用自上而下的方法，可能忽略具体技术细节和区域差异 | 评估合成生物学技术在不同领域的脱碳潜力，并为气候减缓政策提供优先方向 | 合成生物学技术在农业恢复、食品生产、土壤碳汇、工业减排和地球工程等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业 |
| 270 | 2026-05-21 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 利用合成生物学技术构建新型嵌合转录因子（Sphnx）作为全细胞生物传感器，用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac），实现口腔鳞状细胞癌的早期非侵入性诊断 | 通过嵌合体技术创建新型合成神经氨酸传感器，首次将工程细菌的全细胞生物传感器应用于口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物检测 | 尚未进行临床验证，传感器性能在真实唾液样本中的灵敏度和特异性待评估，平台仍需优化以提高检测通量和稳定性 | 开发能够检测口腔鳞状细胞癌相关唾液生物标志物的合成生物传感器，为口腔及全身疾病的临床筛查提供概念验证平台 | N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac）和工程细菌菌株 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学、嵌合体技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | 工程细菌 | 嵌合转录因子（Sphnx）传感回路 | 医学 |
| 271 | 2026-05-21 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-03, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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综述 | 本文综述了细菌荧光素酶及其辅助酶的机制和应用 | 阐明了C4a-氢过氧化黄素形成机制并鉴定出关键催化残基His44，通过蛋白质工程和合成生物学改进了LuxAB的生物发光特性 | 实现红移发射、优化信号强度和识别与发光物种生成相关的机制等问题仍有待探索 | 总结LuxAB的反应机制及其在生物技术中的应用进展 | 细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶（如LuxG） | 合成生物学 | NA | 生物发光分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | lux操纵子编码的自发光系统 | 生物成像, 生物报告器, 生物传感, 代谢工程, 生物燃料生产 |
| 272 | 2026-05-20 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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研究论文 | 建立一种高效的一步重组工程方法MOSAIC，用于质粒编辑和多样化 | 利用单链DNA退火蛋白CspRecT高效整合DNA寡核苷酸，实现高达90%的单靶点编辑效率，并在单次转化中生成覆盖四个靶区域的组合质粒文库，同时集成基于Nanopore测序的用户友好验证流程 | 未明确说明具体局限性，可能包括对寡核苷酸设计的依赖或某些质粒类型的适用性限制 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和文库构建方法 | 质粒的定向编辑和组合文库生成 | 合成生物学 | NA | 重组工程，Nanopore测序 | NA | 序列数据 | NA | CspRecT蛋白，重组工程 | 细菌（具体未指定） | 质粒编辑和组合文库构建系统 | 分子生物学，合成生物学 |
| 273 | 2026-05-20 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细菌构建单层人工神经网络，实现3位二进制码到3位格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换，扩展了神经形态计算在合成生物学中的应用能力 | 目前处于概念验证阶段，实际应用场景和规模尚需进一步探索 | 开发基于基因工程细胞的生物计算机技术与合成生物电路设计 | 基因工程改造的细菌种群（大肠杆菌） | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络（ANN） | NA | 5个工程细菌种群 | NA | 大肠杆菌 | 单层人工神经网络（3位二进制到格雷码转换器） | 工业生物技术、计算机科学 |
| 274 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略，推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性，但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |
| 275 | 2026-05-20 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究利用合成的苜蓿花叶病毒34S启动子变体结合两个相同的sgRNA结合位点，在植物细胞中开发了CRISPRi正交抑制系统 | 首次系统评估不同启动子的CRISPRi抑制效率，并发现两个相同sgRNA结合位点的启动子比异质位点更易被抑制；同时结合Cre/loxP RNA支架正交系统设计了基因开关 | 研究仅在烟草叶片中进行瞬时表达评估，缺乏稳定转化和更广泛植物物种的验证 | 开发用于植物细胞基因表达精确调控的CRISPRi正交抑制系统和遗传开关 | 植物细胞中的不同启动子（尤其是34S启动子变体） | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 瞬时基因表达, 农杆菌浸润 | NA | 表达数据 | 33个34S启动子变体 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 烟草 | CRISPRi抑制系统, Cre/loxP RNA支架正交系统, 基因开关 | 农业, 合成生物学 |
| 276 | 2026-05-20 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 研究合成细菌群落中劳动分工生产紫色杆菌素的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个亚群中，实现了2.5倍的产量提升，并揭示了亚群生长速率和比例对生产效率的影响 | 仅使用大肠杆菌为基础，未探索其他宿主或更复杂的群落结构 | 评估劳动分工策略在合成微生物群落中提高紫色杆菌素生产效率的可行性 | 基于大肠杆菌的合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个共培养和单培养实验条件 | NA | 大肠杆菌 | 代谢途径拆分（VioABE和VioDC亚群） | 工业生物技术 |
| 277 | 2026-05-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
|
research paper | 开发了一种基于Tn5转座酶的高效全基因组基因激活系统，用于大肠杆菌的功能基因组学研究 | 基于Tn5转座酶构建高效全基因组基因激活突变文库，实现条件性基因激活和高通量筛选 | 未明确说明局限性，但可能涉及插入位点偏好性或激活效率的进一步优化需求 | 开发一种高效的全基因组基因激活工具，用于基因功能解析和菌株优化 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | synthetic biology, functional genomics | NA | Tn5 transposase-based system | NA | DNA sequence data | NA | Tn5 transposase | E. coli | inducible gene activation system with tetracycline-inducible promoter Ptet and kanamycin resistance gene | synthetic biology, industrial biotechnology |
| 278 | 2026-05-20 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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研究论文 | 本研究通过敲除恶臭假单胞菌中的oprF或oprI基因，揭示了两种基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次比较了oprF和oprI缺失对恶臭假单胞菌膜囊泡生产的差异效应，并发现通过过表达plsB可以改善膜完整性同时维持囊泡形成 | 研究仅在单一平台菌株KT2440中进行，且未评估这些策略在工业规模下的长期稳定性 | 探究膜囊泡工程在生物技术中的应用潜力，特别是优化蛋白质分泌系统 | 恶臭假单胞菌KT2440中oprF和oprI基因敲除株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除, 蛋白质过表达, 膜囊泡分析 | NA | 实验数据 | 多个突变株和野生型对照的比较实验 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌 KT2440 | 膜囊泡生产与蛋白质分泌系统 | 工业生物技术 |
| 279 | 2026-05-20 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
|
综述 | 系统综述了食用药用真菌的抗抑郁潜力及其作用机制 | 整合了肠脑轴、色氨酸-犬尿氨酸通路及神经炎症调节等多维机制，并探讨了3D食品打印与合成生物学等技术创新 | 缺乏临床验证、标准化不足 | 评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及营养学应用 | 灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草等食用药用真菌及其生物活性化合物 | 机器学习 | 抑郁症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 280 | 2026-05-19 |
Innovations in Yeast Synthetic Biology: Engineered Discovery Systems for Immunotherapy
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00321
PMID:40802971
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综述 | 概述酵母合成生物学在免疫治疗蛋白发现中的创新工具，包括表面展示技术、自动进化系统和计算设计策略 | 整合酵母表面展示、自动进化系统（如OrthoRep）和计算设计，创建新型DBTL工作流，直接用于免疫工程和下一代生物治疗药物开发 | NA | 探讨酵母合成生物学如何加速免疫治疗蛋白的发现与工程化，桥接合成生物学与免疫学 | 酵母工程平台、免疫治疗蛋白（如纳米抗体）、免疫受体（如GPCRs、TCRs） | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、自动进化系统、计算设计 | NA | NA | NA | OrthoRep | 酵母 | 免疫治疗蛋白发现与筛选系统 | 医学 |