合成生物学相关文章
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当前共找到 1525 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-12-08 |
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-Dec-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c16214
PMID:41258773
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于T7 RNA聚合酶的工具箱，用于选择性miRNA检测、信号放大和蛋白质表达 | 开发了无泄漏的T7 RNAP工具箱，通过模块化T7-Locks实现选择性寡核苷酸检测和门控转录，具有高正交性和超过100的开关比 | NA | 构建一个可编程的合成生物学平台，连接输入感知、放大和输出合成 | miRNA检测、转录调控和蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | T7 RNA聚合酶工具箱、细胞无转录-翻译系统 | NA | 寡核苷酸序列、蛋白质表达数据 | NA | T7 RNAP工具箱、T7-Locks、C12间隔子 | 细胞无系统 | 模块化T7-Locks、正反馈信号放大电路、门控转录系统 | 医学、工业生物技术 |
| 262 | 2025-12-08 |
Advances in the microbial biosynthesis of therapeutic terpenoids
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103374
PMID:41161185
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程在微生物中生物合成治疗性萜类化合物的最新进展 | 总结了利用自动化、机器学习和人工智能等新兴方法加速微生物生物合成研究的新兴策略 | NA | 促进治疗性萜类化合物的微生物生物合成，以实现规模化生产和经济可行的成本目标 | 天然及新型萜类化合物（如青蒿素、紫杉醇、长春花碱、QS-21和环巴胺） | NA | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌，酿酒酵母 | NA | 医药 |
| 263 | 2025-12-08 |
Designing novel peptides with amyloid-β binding and clearance potential using BiLSTM and molecular dynamics
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1709505
PMID:41346856
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研究论文 | 本研究提出了一种基于双向长短期记忆网络（BiLSTM）和分子动力学的两阶段框架，用于设计具有与淀粉样蛋白-β结合和清除潜力的新型肽段 | 开发了一种新颖的两阶段BiLSTM框架，该框架在具有特定基因本体（GO）注释的全长蛋白质上进行训练，并在实验验证的肽段片段上进行微调，以生成针对特定靶点（如Aβ42）的功能性短肽 | 训练数据包含了与Aβ清除相关的蛋白质，但计算验证仅涉及结合相互作用；清除潜力仍是一个有待未来实验验证的假设 | 开发一种可推广的、人工智能驱动的功能性肽段设计流程，用于治疗发现和合成生物学 | 针对阿尔茨海默病关键病理因子Aβ42的新型肽段 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 分子动力学模拟，AlphaFold2结构建模，pyDockWEB对接 | BiLSTM | 序列数据（蛋白质和肽段序列） | 从1000个AI生成的序列中筛选出25个候选，最终优先考虑11个（ADNP1-ADNP11） | NA | NA | NA | 医学 |
| 264 | 2025-12-07 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本文通过构建启动子库和设计新型混合启动子，扩展了群体感应工具箱，用于动态遗传电路的优化与应用 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库，并设计了一种新型混合启动子，需要两种自诱导剂激活，实现了多阶段遗传开关的动态控制 | NA | 扩展群体感应工具箱，优化动态遗传电路的设计与调谐 | 群体感应系统、启动子库、混合启动子、遗传电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | NA | 多阶段遗传开关，包括生长阶段和两个顺序生产阶段，使用混合启动子实现动态控制 | 工业生物技术 |
| 265 | 2025-12-07 |
Characterization and orthogonality assessment of two quorum sensing systems for synthetic biology applications
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.08.001
PMID:40835148
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研究论文 | 本研究全面表征了LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统在大肠杆菌中的功能，并评估了它们的正交性以避免交叉干扰 | 首次在模型宿主大肠杆菌中全面表征这两种群体感应系统，并通过突变策略解决了系统间的交叉干扰问题，实现了功能正交 | 研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他宿主中验证，且突变体可能影响系统在其他环境下的性能 | 优化和标准化群体感应系统以扩展合成生物学应用范围 | LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 理性设计突变 | 大肠杆菌 | 群体感应系统，包括启动子、信号分子和合酶组件 | 工业生物技术 |
| 266 | 2025-12-07 |
Reengineering of ergosterol biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae and its sustainable application in citrus peel processing industry
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.10.002
PMID:41072655
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研究论文 | 本研究通过合成生物学策略重新工程化酿酒酵母中的麦角固醇生物合成，并探索其在柑橘皮加工工业中的可持续应用 | 首次报道了在酿酒酵母中重新工程化麦角固醇生物合成以抵抗D-柠檬烯胁迫，为柑橘皮加工工业提供可持续生物能源解决方案 | NA | 重新工程化麦角固醇生物合成并应用于柑橘皮加工工业的可持续生物能源开发 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略，包括MVA途径模块、后角鲨烯途径模块和麦角固醇生物合成模块 | NA | NA | 摇瓶和5升生物反应器发酵实验 | 合成生物学策略 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 麦角固醇生物合成途径的重新工程化，涉及MVA途径、后角鲨烯途径和麦角固醇生物合成模块 | 能源, 工业生物技术 |
| 267 | 2025-12-07 |
Monoclonal antibodies production in microbial systems: Current status, challenges and perspectives
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.10.005
PMID:41075867
|
综述 | 本文全面综述了微生物系统生产单克隆抗体的现状、挑战与前景，重点讨论了微生物表达平台的优势、基因编辑与合成生物学技术的应用，以及AI驱动的优化策略 | 系统整合了CRISPR/Cas9基因编辑、合成生物学重建哺乳动物糖基化通路、以及AI驱动的高通量优化等前沿技术，提出微生物平台作为哺乳动物细胞系统的高效替代方案 | 微生物系统在蛋白质正确折叠、翻译后修饰（如糖基化）的精确性方面仍存在局限性，可能影响某些治疗性抗体的功能与安全性 | 探索微生物系统作为单克隆抗体工业化生产的替代平台，以解决传统哺乳动物细胞系统成本高、周期长的问题 | 单克隆抗体（mAbs） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、合成生物学、AI优化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物系统（具体未指定，可能包括大肠杆菌、酵母等） | 哺乳动物糖基化通路重建 | 医药、生物医学研究 |
| 268 | 2025-12-07 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2025-Dec-05, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
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研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物模型狗尾草中，通过配体诱导型合成电路激活内源性花青素通路，并利用高光谱成像进行远程非破坏性检测 | 首次在单子叶植物中适配配体诱导型传感器以操纵内源性色素生产，并开发了结合高光谱成像和判别性目标表征方法的远程检测技术 | 研究主要基于模型植物狗尾草，尚未在主要粮食作物中验证；配体摄取可能受物理屏障影响，需进一步优化 | 开发单子叶植物中的可诱导合成生物电路，用于远程传感应用 | 狗尾草（Setaria viridis）的原生质体和整株植物 | 合成生物学 | NA | 高光谱成像、判别性目标表征方法 | NA | 图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及狗尾草原生质体和整株植物 | 配体诱导型传感器、合成电路设计 | 狗尾草（Setaria viridis） | 配体诱导型传感器激活内源性花青素通路，涉及两个转录因子作为单一转录本表达 | 农业 |
| 269 | 2025-12-07 |
Cellular and viral RNA polymerases: evolutionary insights into eukaryotic origins
2025-Dec-04, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.11.008
PMID:41350153
|
综述 | 本文综述了细胞与病毒RNA聚合酶的结构与功能差异，探讨了病毒驱动的RNA聚合酶进化及其在真核生物起源中的作用 | 提出将病毒视为进化合作者的新视角，为RNA聚合酶的适应性研究提供了新见解，并连接了病毒学、进化生物学和合成生物学等多个领域 | NA | 探讨核质大DNA病毒编码的多亚基RNA聚合酶在真核生物起源中的进化作用 | 核质大DNA病毒与真核生物的RNA聚合酶 | 进化生物学 | NA | 系统发育分析、结构研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2025-12-07 |
Integrating Microbiomes for Regenerative Food Systems: Recent Insights, Implementations, and Emerging Trends
2025-Dec, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.71312
PMID:41341407
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综述 | 本文综述了微生物组在食品科学中的核心作用，涵盖可持续农业、发酵、食品安全和营养等领域，整合了传统方法与新技术策略 | 整合了传统微生物组方法（如自然发酵）与新兴高科技策略（如精准微生物组工程、合成生物学和机器学习），并强调了社会经济背景下的应用差异 | NA | 探讨微生物组在构建弹性和可持续食品系统中的应用，促进食品科学、农业和营养健康的整合 | 微生物组在食品系统中的角色，包括食品质量、安全、可持续性和人类健康 | NA | NA | 精准微生物组工程、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品、农业、环境 |
| 271 | 2025-12-07 |
Automated Genetic Manipulation for the Construction of Pichia pastoris Cell Factories
2025-Nov-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00033
PMID:41340629
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研究论文 | 本研究开发了一种基于BioFoundry的自动化遗传操作流程，用于快速构建毕赤酵母细胞工厂 | 首次报道了针对毕赤酵母的自动化高通量遗传操作系统，实现了高效的基于热激的转化和基因组编辑，并自动化表征了96个内源启动子 | 研究主要针对毕赤酵母，其他非模式酵母的适用性有待进一步验证 | 构建和优化微生物细胞工厂，特别是用于重组蛋白表达和天然产物生物合成 | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 合成生物学 | NA | 自动化遗传操作、基因组编辑、启动子表征 | NA | NA | 96个内源启动子 | BioFoundry | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 细胞工厂构建，用于生产倍半萜α-檀香烯和α-檀香醇 | 工业生物技术 |
| 272 | 2025-12-07 |
In silico approaches for discovering microbial antiviral defense systems
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf619
PMID:41348595
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综述 | 本文综述了用于发现微生物抗病毒防御系统的计算策略，包括序列同源性、结构引导、基因组上下文和人工智能方法 | 将计算方法分为四大策略，并讨论了新兴工具如保守基因簇发现工具和基因组基础模型，以支持合成模块的生成设计 | 序列同源性方法在检测高度分化或新系统方面有限，结构引导方法计算成本高 | 系统探索微生物免疫系统，指导理性噬菌体疗法、微生物组工程和合成生物学应用 | 原核生物的多样化抗病毒防御系统 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | 人工智能方法 | 基因组数据 | NA | NA | 原核生物 | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 273 | 2025-12-07 |
Genome-based exploration of volatile flavor diversity from food yeast species
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf067
PMID:41269214
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综述 | 本文综述了基于基因组技术探索食品酵母物种中挥发性风味多样性的最新进展，重点关注酯类、苯类、硫化合物和酚类衍生物的形成途径，并展望了通过共发酵和合成生物学推动食品发酵创新的未来方向 | 利用基因组尺度技术重新定义风味多样性研究，结合共发酵策略和组学分析，为下一代食品发酵创新提供新视角 | 作为一篇小型综述，可能未全面覆盖所有相关研究或实验细节 | 探索食品酵母物种中挥发性风味化合物的遗传和进化驱动因素，以促进食品发酵创新 | 各种酵母物种，特别是酿酒酵母与非传统酵母物种 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度技术、组学分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 酿酒酵母、非传统酵母物种 | 酯类、苯类、硫化合物和酚类衍生物的生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 274 | 2025-12-06 |
The evolving landscape of precise DNA insertion in plants
2025-Dec-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66715-7
PMID:41330932
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综述 | 本文回顾了植物基因组中精确DNA插入技术的发展历程，从随机方法到基于CRISPR-Cas系统的工具，并分析了当前挑战与新兴解决方案 | 系统梳理了CRISPR-Cas系统在植物精确DNA插入中的应用演进，包括基因靶向、先导编辑及基于重组酶/转座酶的平台，并探讨了从理论到实践的转化路径 | 本文为综述性文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献分析，可能未覆盖最新技术突破 | 探讨植物基因组精确DNA插入技术的演变、当前局限性与未来发展方向，以推动作物改良和合成生物学应用 | 植物基因组编辑技术，特别是CRISPR-Cas系统及相关工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、基因靶向(GT)、先导编辑(PE)、重组酶/转座酶平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 275 | 2025-12-06 |
Advances in trypsin research: sources, structural insights, applications and protein engineering for industrial use
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148996
PMID:41232883
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综述 | 本文综述了胰蛋白酶的研究进展，包括其来源、结构、应用以及为工业用途进行的蛋白质工程改造 | 系统总结了通过定点突变等蛋白质工程方法增强胰蛋白酶抗自降解能力和热稳定性的最新进展，并提出了整合AI驱动蛋白质设计与合成生物学工具的未来研究方向 | 在阐明动态酶-底物相互作用、利用天然序列多样性以及在工业规模条件下实现最佳产量方面仍存在挑战 | 综述胰蛋白酶的研究进展，并探讨通过蛋白质工程改进其工业应用性能 | 胰蛋白酶（一种丝氨酸蛋白酶） | NA | NA | 定点突变，蛋白质工程，重组蛋白表达 | NA | NA | NA | NA | 微生物重组表达系统 | NA | 工业生物技术 |
| 276 | 2025-12-06 |
Targeting and tracking mRNA lipid nanoparticles at the particle, transcript and protein level
2025-Oct, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01511-8
PMID:41102346
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综述 | 本文综述了用于监测RNA负载脂质纳米颗粒体内行为的现有及新兴技术，并讨论了改善组织与细胞靶向的策略，以扩展该技术的应用范围 | 系统整合了脂质纳米颗粒化学修饰、生物工程及合成生物学方法（如利用microRNA靶位点）来调控mRNA递送与表达，并探讨了通过修饰编码蛋白来控制有效载荷的稳定性与亚细胞定位 | NA | 扩展RNA负载脂质纳米颗粒在非肝脏疾病治疗中的应用，并加速其临床转化 | RNA负载脂质纳米颗粒 | NA | NA | 脂质纳米颗粒技术、合成生物学方法、microRNA靶向技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 277 | 2025-12-06 |
The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies
2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01795-9
PMID:40634759
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综述 | 本文综述了急性髓系白血病（AML）免疫治疗的机制、挑战与未来方向，重点探讨了免疫检查点抑制剂和疫苗策略 | 系统解码AML的免疫逃逸途径，并整合检查点阻断、疫苗及联合策略等新兴免疫疗法，提出通过单细胞基因组学、人工智能和合成生物学识别新靶点及改善患者分层 | 面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性（如贫血、细胞因子释放综合征）、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战 | 评估AML免疫治疗的机制、挑战与未来方向，旨在改善临床疗效 | 急性髓系白血病（AML）及其免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 278 | 2025-12-05 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
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综述 | 本文综述了整合多组学与人工智能在系统生物学中的应用，强调其在癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的原理、方法及案例 | 提出整合多组学与人工智能作为系统生物学的新范式，克服高维度、异质性和上下文限制的挑战 | 存在数据异质性和可解释性等当前限制 | 评估多组学整合的原理、方法及应用，以推动生物系统预测模型和生物技术应用 | 基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据 | 系统生物学 | 癌症 | 高通量组学技术、单细胞组学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 279 | 2025-12-05 |
Plant-derived peptides: From identification to agronomic applications
2025-Dec-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.11.004
PMID:41243283
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综述 | 本文综述了植物源肽作为生物农药和生物刺激剂的潜力，并提出了一个整合肽鉴定、分子设计、生物制造和生态评估的框架 | 提出结合人工智能、纳米技术和合成生物学等新兴技术，以克服植物源肽商业化中的瓶颈 | 商业化受限，包括多样性探索不足、生产成本高、生态风险评估不完整和应用场景未定义 | 探索植物源肽作为环保型生物农药和生物刺激剂在农业中的应用潜力 | 植物源肽及其在农业中的鉴定、设计和应用 | 农业生物技术 | NA | 人工智能、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 280 | 2025-12-05 |
PyFuRNAce: an integrated design engine for RNA origami
2025-Dec-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66290-x
PMID:41326357
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研究论文 | 介绍了一个名为pyFuRNAce的开源、基于Python的RNA纳米结构设计软件包，专注于共转录RNA折纸设计 | 开发了首个将RNA折纸完整工作流程（从基序定义到序列生成）集成到单一用户友好平台的集成设计引擎 | NA | 开发用户友好的RNA纳米结构设计工具以推动RNA纳米技术发展 | RNA纳米结构，特别是共转录RNA折纸 | 合成生物学 | NA | 原子力显微镜，共聚焦荧光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA折纸纳米结构（包括自组装RNA丝、RNA液滴和大型共转录RNA折纸） | 医学，生物技术，合成生物学 |