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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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261 | 2025-06-04 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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research paper | 该研究评估了五种代表性DNA存储编码方法在生物安全性方面的风险,分析了它们与自然生物DNA的序列相似性 | 首次系统评估了DNA信息存储技术中人工合成DNA序列的生物安全风险,并提出了随机化策略以降低潜在风险 | 研究仅评估了五种编码方法,可能无法涵盖所有DNA存储技术的生物安全风险 | 探索DNA信息存储技术的生物安全影响 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码) | 合成生物学 | NA | Kraken2分类、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种代表性DNA存储编码方法产生的序列 |
262 | 2025-06-03 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路,该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入 | 开发了PSR电路,通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收,提高了生物传感器的灵敏度 | 未提及具体局限性 | 扩展无细胞生物传感技术的能力,提高生物传感器的灵敏度 | 无细胞系统中的基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收(PSR),DNA链置换电路 | NA | 核酸 | NA |
263 | 2025-06-03 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Jun-01, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 该研究开发了一种能够长时间产生硫化氢(H₂S)用于治疗性血管舒张的红细胞微反应器 | 通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中,创建了一种新型的合成生物催化微反应器系统,实现了持续可控的H₂S生成 | 仅进行了体外实验验证,尚未进行体内研究 | 开发用于心血管治疗的气体递质递送平台 | 红细胞微反应器及其在血管舒张中的应用 | 合成生物学与生物工程 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法封装技术 | NA | 生物化学数据、荧光成像数据 | 体外实验使用分离的胸主动脉环 |
264 | 2025-06-03 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-May-24, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本文对钩吻的基因组、转录组和代谢组进行了综合研究,并挖掘了与钩吻碱生物合成相关的酶基因 | 首次对钩吻的基因组进行测序和组装,并构建了全面的转录组cDNA文库,鉴定了29种生物碱,并验证了两个候选基因在钩吻碱生物合成中的功能 | 钩吻碱的生物合成途径研究较少,理解不足,限制了通过育种或合成生物学提高钩吻碱产量的能力 | 研究钩吻中钩吻碱的生物合成途径 | 钩吻(Gelsemium elegans) | 合成生物学 | NA | PacBio测序、液相色谱-质谱技术 | NA | 基因组、转录组、代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 |
265 | 2025-06-03 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-May-23, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 本研究提出了一种利用光响应DNA液滴通过动态相分离控制酶级联途径的新方法 | 设计了带有偶氮苯修饰粘性末端的Y-motif序列,形成光响应DNA液滴,实现了对酶级联途径的动态调控 | 仅测试了两种酶级联系统,需要更多系统验证方法的普适性 | 开发一种调控酶级联途径的新方法 | 光响应DNA液滴和酶级联系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | 测试了两种酶级联系统(GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT) |
266 | 2025-06-02 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统,用于调控蛋白质间相互作用 | 利用噬菌体展示方法筛选出可与FDA批准小分子药物相互作用的纳米抗体,建立化学诱导解离系统(CIDiss) | NA | 开发一种可诱导调控蛋白质功能的化学方法,用于合成生物学和细胞治疗 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示 | NA | NA | NA |
267 | 2025-06-02 |
A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine
2025-May-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102613
PMID:40449069
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research paper | 探讨噬菌体作为精准医学解决方案以应对抗生素耐药性细菌感染 | 结合基因工程、合成生物学和人工智能技术,定制化设计噬菌体以扩大宿主范围、克服细菌免疫系统并调节宿主细菌 | NA | 解决抗生素耐药性危机,提供精准医学替代方案 | 抗生素耐药性细菌感染 | precision medicine | bacterial infections | genetic engineering, synthetic biology, artificial intelligence, machine learning | NA | NA | NA |
268 | 2025-06-02 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-May-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学原理设计变构调节及其在生物医学和生物技术中的应用潜力 | 通过合成生物学策略设计变构蛋白调节机制,包括变构调节剂的设计、从头变构蛋白开关的生成以及工程化变构机制在细胞功能控制中的应用 | NA | 探索合成生物学在变构调节设计中的应用及其在生物医学领域的潜力 | 蛋白质的变构调节机制 | 合成生物学 | NA | 人工智能生成蛋白质设计 | NA | NA | NA |
269 | 2025-06-02 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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review | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新策略和进展 | 介绍了合成生物学在微生物生产倍半萜醇中的创新方法,包括适应性合成酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及对萜类相关毒性的耐受性 | 低产量和高生产成本阻碍了其工业规模应用 | 探讨倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略和进展 | 倍半萜醇 | 合成生物学 | NA | 微生物系统异源合成 | NA | NA | NA |
270 | 2025-06-02 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究利用工程化的酿酒酵母构建甲基对羟基苯甲酸酯(MP)的生物合成途径,并应用多种代谢工程策略突破合成过程中的瓶颈 | 通过调控内源莽草酸途径的限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达,实现了MP在酿酒酵母中的高效合成,产量达到68.59 mg/L,为目前报道的最高水平 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵或工业化生产的测试 | 开发环境友好的MP生物合成方法以替代传统化学合成工艺 | 工程化改造的酿酒酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程、基因敲除 | NA | NA | NA |
271 | 2025-06-02 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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research paper | 该研究开发了位点选择性交联探针,用于构象约束和解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与其伴侣酶域之间的相互作用 | 利用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合域活性位点的缩合过程,并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | 研究主要关注于酪氨酸生物合成前两个模块的载体蛋白与缩合域的相互作用,可能未涵盖其他模块的类似过程 | 理解非核糖体肽合成酶的分子细节,为未来合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白及其伴侣酶域 | 生物化学 | NA | 四嗪点击化学, 冷冻电镜, X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
272 | 2025-06-02 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 本研究开发了一种体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了大型DNA片段在小立碗藓中的插入效率 | 开发了含有两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体,能够在体内释放线性模板,从而提高大片段DNA的插入效率 | 该方法目前仅适用于能够进行原生质体转化和再生的作物 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓(Physcomitrium patens) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | DNA序列数据 | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 |
273 | 2025-06-01 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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research paper | 该研究探讨了动力学模块在生化网络中对浓度鲁棒性的作用,并提出了一种无需参数值即可识别这些模块的方法 | 提出了一种基于稳态反应速率耦合的动力学模块识别方法,无需参数值,并发现有序结合酶机制比随机结合更能增强代谢物浓度的鲁棒性 | 研究仅基于34个代谢网络模型,可能无法涵盖所有生化网络的复杂性 | 研究动力学模块在生化网络中的作用及其对浓度鲁棒性的影响 | 生化网络中的动力学模块和代谢物浓度 | 生物化学网络 | NA | 质量作用动力学 | NA | 代谢网络模型 | 34个代谢网络模型,涵盖26种生物 |
274 | 2025-06-01 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过基因剂量优化、表达盒设计和内质网分泌途径重编程三种策略,优化了Pichia pastoris中scFv的分泌效率 | 挑战了结构同源性(63%氨基酸同一性;RMSD 0.47 Å)确保一致优化结果的假设,强调了在合成生物学中需要针对蛋白质量身定制工程策略 | 研究仅针对两种结构同源的scFv变体PR961和PR953,可能不适用于其他蛋白质 | 优化Pichia pastoris中scFv的分泌效率,以支持AI驱动的生物制剂制造 | 两种结构同源的scFv变体PR961和PR953 | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌途径重编程 | NA | NA | 两种scFv变体PR961和PR953 |
275 | 2025-06-01 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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research paper | 该研究通过转录组学和代谢组学分析,探讨了濒危植物胡黄连中三萜类化合物的生物合成途径及其关键酶编码基因的表达模式 | 鉴定了8个参与三萜类生物合成的上游氧化角鲨烯环化酶(OSCs),其中NsOSC2是一种双功能酶,能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇 | 研究未涉及其他可能影响三萜类生物合成的环境或发育因素 | 揭示胡黄连中三萜类化合物的生物合成分子机制 | 濒危多年生草本植物胡黄连(Neopicrorhiza scrophulariiflora) | 合成生物学 | NA | 转录组学、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 不同组织的胡黄连样本 |
276 | 2025-06-01 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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research paper | 本文提出了一种改进的细菌转化实验设计(Griffith transformation experiment design 2.0),旨在实现DNA和非DNA结构及信息的有效交换,从而创造出具有显著形态/代谢表型差异的单细胞杂交微生物 | 提出了Griffith转化实验设计2.0,扩展了传统DNA转化范围,包括非DNA结构和调控信息的转移,为创造新型微生物提供了新方法 | 该方法仍处于概念阶段,实际应用效果和跨物种适用性有待验证 | 探索更高效的微生物遗传物质交换方法,创造具有新特性的杂交微生物 | 细菌细胞及其遗传物质 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验 | NA | NA | NA |
277 | 2025-06-01 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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review | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染中的作用 | 讨论了生物类似物开发中的障碍及创新技术,如抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成 | 未提及具体研究数据或样本量,主要基于现有文献的综述 | 探讨生物类似物在治疗感染性疾病中的潜力和挑战 | 细菌、真菌、寄生虫和病毒等病原体 | NA | infectious diseases | antibody engineering, synthetic biology, cell-free protein synthesis | NA | NA | NA |
278 | 2025-06-01 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-Apr-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 探讨了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制,加速基因组编辑过程 | 讨论了双生病毒载体在实际应用中面临的障碍 | 评估双生病毒载体在植物基因组编辑中的效果和潜力 | 植物基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | 病毒载体介导的基因编辑 | NA | NA | NA |
279 | 2025-05-31 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-Sep-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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review | 本文综述了鞘聚糖的结构、生物合成途径及其通过代谢工程和合成生物学策略高效合成与定制的方法 | 结合代谢工程和合成生物学策略,利用基因组代谢网络模型(GSMM)和CRISPR等高效工具调控代谢途径,以及通过分子量调控和可控取代基修饰定制不同分子量的鞘聚糖 | 野生型菌株研究背景不清晰及合成路径复杂等问题仍需进一步解决 | 提高鞘聚糖的生产能力并实现其定制化设计 | 鞘聚糖及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组代谢网络模型(GSMM)、CRISPR、高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
280 | 2025-05-31 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Jul, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
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综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系,以及它们在成功利用昆虫宿主方面的能力 | 强调了昆虫病原线虫与细菌共生体之间的共生关系及其在自然产物研究中的模型系统作用 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系及其在生态学和进化生物学中的模型作用 | 昆虫病原线虫(Steinernema和Heterorhabditis)及其细菌共生体(Xenorhabdus和Photorhabdus) | 生态学与进化生物学 | NA | 合成生物学方法和高通量技术 | NA | NA | NA |