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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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261 | 2025-03-05 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本文研究了一种新型的双靶向CAR-NK细胞(dtCAR-NK92),用于治疗肺癌 | 设计了一种新型的双靶向CAR(dtCAR),结合了PD-L1纳米抗体和NKG2D,增强了NK细胞的细胞毒性和细胞因子产生 | 研究中未提及长期疗效和潜在副作用 | 探索双靶向CAR-NK细胞在肺癌治疗中的效果 | 肺癌H1299细胞 | 免疫治疗 | 肺癌 | 合成生物学,CAR-NK细胞工程 | 双靶向CAR(dtCAR) | 体外和体内实验数据 | 未明确提及样本数量 |
262 | 2025-03-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的方法和工具,并讨论了其在生物制造中的应用 | 本文详细讨论了转录调控、模板依赖和非模板依赖的方法,并全面总结了进化酿酒酵母在提高环境应激耐受性和细胞代谢性能方面的应用 | 未明确提及具体的研究局限性 | 探讨合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
263 | 2025-03-04 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Mar-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
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综述 | 本文介绍了合成生物学纳米医学的基本概念,并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与区别 | 提出了合成生物学纳米医学这一新概念,区别于传统或仿生纳米医学,采用基因工程策略进行设计 | 讨论了利用合成生物学开发纳米医学的潜在优势和挑战,但未具体说明具体挑战内容 | 探索合成生物学与纳米医学的融合,推动纳米医学在疾病诊断和治疗中的应用 | 合成生物学纳米医学 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
264 | 2025-03-04 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SHIP的算法,用于在真核生物中系统地识别基因组安全港(GSHs) | SHIP算法通过基因组一般特征注释,系统地识别基因组安全港,填补了现有方法主要依赖经验识别的空白 | 研究主要基于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)进行实验验证,尚未在其他真核生物中广泛验证 | 开发一种系统识别基因组安全港的工具,以支持合成生物学中多基因模块的研究 | 真核生物的基因组安全港 | 基因组工程 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | 算法(SHIP) | 基因组数据 | 基于酿酒酵母的实验验证 |
265 | 2025-03-04 |
Self-Driven CuAAC Reaction Catalyzed by Photosensitive Biohybrids Energized by Lactate for Boosting Cancer Immunotherapy
2025-Feb-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425018
PMID:39973575
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研究论文 | 本文构建了一种光辅助靶向电活性细菌装备的生物正交催化剂系统,用于增强癌症免疫治疗 | 创新点在于利用细菌在肿瘤部位厌氧代谢乳酸并转移电子至生物正交催化剂,从而触发CuAAC反应原位生成活性药物,并通过光照加速反应 | NA | 开发一种不依赖化学还原剂的高效CuAAC反应,用于癌症免疫治疗 | 肿瘤代谢与CuAAC反应 | 合成生物学 | 癌症 | CuAAC反应、光辅助催化 | NA | NA | NA |
266 | 2025-03-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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研究论文 | 本文探讨了计算代谢建模方法的演变,并提出了将生物分子模拟和机器学习预测结合以指导结构导向的合成生物学应用的新阶段 | 首次将生物分子模拟与代谢模型相结合,开创了结构导向的合成生物学应用的新范式 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型结合的具体技术细节和实现方法 | 优化和理解代谢途径,以改善蛋白质和小分子产品的生物生产,应用于健康、环境、能源和可持续性领域 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟,机器学习 | NA | NA | NA |
267 | 2025-03-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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review | 本文综述了蛋白质工程在设计功能性治疗和生物技术应用的生物纳米分子组装体方面的最新进展 | 利用AI工具(如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN)显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在生物纳米分子组装体设计中的应用及其在生物技术和生物医学领域的潜力 | 有限组装体(如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构)和扩展组装体(如丝状体和2D/3D晶格) | 生物技术 | NA | AI工具(AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN) | NA | NA | NA |
268 | 2025-03-03 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
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研究论文 | 本文讨论了机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用,以及如何通过机器学习增强从单个组件到电路层面的工程设计 | 提出了机器学习与机制建模相结合的混合方法,以利用数据驱动模型的优势与基于机制的模型的规范性能力 | 需要克服的挑战包括如何有效地整合机器学习与机制建模,以及如何在实际应用中实现这些方法的潜力 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的应用,以解决设计空间大、组件与宿主细胞机器之间复杂交互的挑战 | 合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型(机器学习与机制建模) | NA | NA |
269 | 2025-03-03 |
Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms
2025-Apr, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001
PMID:39923900
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综述 | 本文综述了通过代谢工程改进有机酸生物合成的最新研究进展,特别是L-苹果酸(L-MA)和琥珀酸(SA)的生产 | 总结了利用合成生物学和高通量筛选等新技术改进有机酸生物合成的最新进展 | 微生物发酵的低产量和长发酵周期限制了其工业应用 | 改进有机酸生物合成,特别是L-苹果酸和琥珀酸的生产 | 工业上重要的工程微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、高通量筛选 | NA | NA | NA |
270 | 2025-03-03 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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研究论文 | 本文探讨了通过代谢工程、合成生物学和实验室进化增强假单胞菌细胞工厂的底物范围,以利用多样化的废弃物底物 | 提出了通过代谢工程和合成生物学手段增强假单胞菌的底物利用能力,以应对工业生物技术中的新挑战 | 自然分离的假单胞菌并不总是适合高要求的生物技术应用,需要进一步的工程改造 | 探索和扩展假单胞菌细胞工厂的底物范围,以利用多样化的废弃物底物 | 假单胞菌物种 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、实验室进化 | NA | NA | NA |
271 | 2025-03-03 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
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研究论文 | 本研究探讨了重组人胶原XVII(RHCXVII)在保护皮肤基底膜完整性方面的功效及其作用机制 | 首次揭示了RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路的磷酸化来保护皮肤基底膜完整性的机制 | 研究仅基于体外实验,未涉及体内实验或临床试验 | 阐明RHCXVII在保护皮肤基底膜完整性中的作用机制 | 人类HaCaT角质形成细胞 | 生物医学 | 皮肤损伤 | 逆转录定量PCR、蛋白质印迹分析、磷酸化抗体阵列 | NA | 细胞实验数据 | UVB照射的HaCaT细胞 |
272 | 2025-03-03 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物,能够通过活性粒子诱导的网络张力波动进行重塑 | 开发了一种毫米大小的脂质泡沫组织模拟物,具有自愈能力,并展示了由游泳细菌驱动的网络张力波动促进组织重塑 | 现有原型组织的横向尺寸较小或缺乏重塑能力 | 理解和模拟生物组织的结构和力学特性 | 脂质泡沫组织模拟物 | 合成生物学 | NA | 脂质双层技术 | NA | NA | NA |
273 | 2025-03-02 |
Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate)
2025-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018
PMID:39581772
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研究论文 | 本文描述了开发用于Rhodococcus jostii RPET菌株的遗传工具,以从废弃PET瓶中生产多种化学品 | 开发了两种可诱导和可调节的表达系统以及基于丝氨酸整合酶的重组工具(SIRT),用于RPET菌株的基因组编辑,并成功生产了多种化学品,包括番茄红素、脂质和琥珀酸 | 非模式微生物的合成生物学工具稀缺,限制了微生物细胞工厂的开发 | 通过生物升级循环废弃PET,生产多种化学品 | Rhodococcus jostii RPET菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、可诱导和可调节的表达系统、丝氨酸整合酶重组工具(SIRT) | NA | NA | 废弃PET瓶 |
274 | 2025-03-02 |
Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0319337
PMID:40014593
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研究论文 | 本文通过调查13个欧洲国家的公众态度,探讨了合成细胞技术在抗癌治疗、CO2排放转化为生物燃料和工业废物回收等领域的潜在应用 | 首次在多个欧洲国家进行大规模调查,探讨公众对合成细胞技术的态度,并使用数据驱动技术构建决策树模型分析影响因素 | 调查仅涵盖欧洲国家,可能无法代表全球公众态度 | 探讨公众对合成细胞技术的态度及其潜在应用 | 13个欧洲国家的8,382名公众 | 合成生物学 | 癌症 | 数据驱动技术 | 决策树模型 | 调查数据 | 8,382名来自13个欧洲国家的公众 |
275 | 2025-03-01 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 本文提出了一种在不改变内源基因编码序列的情况下,将基因传感器整合到内源基因中的方法 | 通过将单导RNA插入到基因的终止区域,实现了在不改变内源基因编码序列的情况下激活下游电路 | 该方法可能对基因的终止区域功能产生影响,且需要进一步验证其在不同细胞类型和基因中的适用性 | 开发一种在不改变内源基因编码序列的情况下,实现基因传感和响应的方法 | CHO-K1细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | 数学模型 | 基因表达数据 | CHO-K1细胞 |
276 | 2025-03-01 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
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研究论文 | 本文介绍了一种在哺乳动物细胞中实现定向进化和达尔文适应的正交RNA复制系统 | 开发了一种正交的RNA复制系统,通过RNA复制酶辅助的连续进化(REPLACE)在增殖的哺乳动物细胞中进行定向进化 | NA | 推进合成生物学和细胞工程应用 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 正交RNA复制系统 | NA | RNA | NA |
277 | 2025-03-01 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本文通过基因组学、转录组学和合成生物学方法,揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物emodin和endocrocin的生物合成途径,以及它们甲基化为黄色色素physcion和dermolutein的过程 | 发现了Cortinarius蘑菇中非还原性聚酮合酶(nrPKSs)和特异性O-甲基转移酶(OMTs)的平行进化起源,并成功在酵母中异源合成了physcion和dermolutein | 化学合成复杂且不经济,从森林中大量采集野生蘑菇不可行 | 研究Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物的生物合成途径及其应用 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 |
278 | 2025-03-01 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-Feb-25, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源天然产物生物合成中的关键作用,特别是在下游合成途径和骨架合成后的结构修饰中的重要性 | 强调了细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的关键催化步骤,并概述了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 探讨细胞色素P450酶在植物源天然产物生物合成中的作用,以促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源天然产物,包括萜类、生物碱、黄酮类、甾体皂苷等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
279 | 2025-03-01 |
Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041492
PMID:40003958
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研究论文 | 本文报道了从中国临泽沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇的研究 | 成功克隆并异源表达了一个完全沉默的次级代谢生物合成基因簇,发现了一种新的羊毛硫肽dmxorosin | NA | 研究SPC6菌株的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 耐盐放线菌SPC6及其次级代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接克隆、异源表达 | NA | 基因组数据 | 1株耐盐放线菌SPC6 |
280 | 2025-03-01 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
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综述 | 本文更新并批判性地讨论了水稻微生物组的多样性、功能角色以及增强生物施肥和抗逆性的微生物组工程策略 | 强调了微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的进展,以及利用微生物组塑造基因(M基因)提高作物抗逆性的创新方法 | 需要进一步探索M基因以培育抗病性状,且商业化成功的关键因素包括土壤特性、实际环境条件和植物基因型 | 增强水稻的生物施肥、抗逆性和气候适应能力,以实现可持续水稻生产 | 水稻及其微生物组 | 农业生物技术 | NA | 微生物组工程、合成生物学 | NA | NA | NA |