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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-05 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究开发了基于FMV 34S启动子变体的CRISPRi正交抑制系统,用于植物细胞中基因表达的精确调控 | 首次系统评估33种34S启动子变体在CRISPRi中的抑制效率,发现相同sgRNA结合位点比异质位点具有更高抑制效率,并成功构建了与Cre/loxP RNA支架正交系统组合的遗传开关 | 研究采用农杆菌浸润叶片的瞬时转基因表达系统,尚未在稳定转基因植物中进行验证 | 开发植物合成生物学工具箱中的逻辑门元件,实现基因表达的精确调控 | FMV 34S启动子变体库、CRISPRi系统、植物细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPRi、农杆菌浸润、瞬时转基因表达 | NA | 基因表达数据 | 33种启动子变体 | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 遗传开关、正交抑制系统、逻辑门 | 农业 |
| 302 | 2025-10-05 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
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综述 | 本文综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 探索了人工智能和机器学习在菌株设计与过程控制中的整合应用,为克服代谢瓶颈和扩大生产提供新方案 | 面临代谢负担等挑战 | 开发可持续和可扩展的化妆品成分生物合成方法 | 酿酒酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程、途径模块化、发酵优化 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 代谢途径工程 | 化妆品工业 |
| 303 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
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研究论文 | 开发了一种在解脂耶氏酵母中实现大规模基因组装和基因组整合的新策略 | 实现了数十个基因(超过30kb)的稳定组装和整合,突破了目前最多只能组装整合5个外源基因(约13kb)的限制 | NA | 提高解脂耶氏酵母的遗传操作和代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 大规模基因组装和基因组整合 | NA | NA | 构建了包含35个外源基因(总计93.5kb)的底盘细胞,优化菌株包含15个外源基因 | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢工程途径,用于调控番茄红素的异源合成 | 工业生物技术 |
| 304 | 2025-10-05 |
Harnessing synthetic biology to empower a circular plastics economy
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0053
PMID:40638940
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综述 | 本文概述了利用合成生物学和微生物群落工程技术降解和升级回收塑料废物的策略 | 整合合成生物学与微生物群落工程,提出增强塑料生物处理效率的互补策略 | NA | 探讨生物技术如何支持循环塑料经济发展 | 塑料废物处理与升级回收 | 合成生物学 | NA | 微生物群落工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 生物降解与升级回收通路 | 环境, 工业生物技术 |
| 305 | 2025-10-05 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
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综述 | 探讨内共生菌在植物-病毒-媒介昆虫三方互作系统中的作用及其在可持续病毒病害管理中的潜力 | 系统阐述内共生菌通过调控宿主反应、影响杀虫剂抗性和病毒传播等机制参与三方互作,并提出利用基因工程改造内共生菌的创新病害控制策略 | NA | 阐明内共生菌在植物病毒病害传播中的作用机制并探索可持续管理策略 | 植物-病毒-节肢动物媒介的三方互作系统及其内共生菌 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 基因改造、生物技术、RNA干扰、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 节肢动物媒介 | NA | 农业 |
| 306 | 2025-10-05 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Sep, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 本研究开发了一种名为DASH的高容量基因堆叠系统,用于植物合成生物学应用 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种高容量且多功能的基因组装系统,用于植物合成生物学 | 基因组装系统和植物合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、重组工程、位点特异性重组 | NA | DNA序列数据 | NA | GoldenBraid, PhiC31整合酶, FLP重组酶, CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因堆叠系统,包含35个转录单元的97kb货物DNA | 农业 |
| 307 | 2025-10-05 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-Aug-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
|
综述 | 本文综述了2014-2024年间利用合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 聚焦蓝藻系统合成生物学创新,解决天然宿主操作困难和异源表达平台有限的障碍 | NA | 促进多样化蓝藻天然产物家族的发现和生产 | 蓝藻生物合成基因簇和天然产物 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、组合生物合成、转录和翻译调控 | NA | NA | NA | NA | Synechocystis sp. PCC 6803, Synechococcus UTEX 2973, Anabaena sp. PCC 7120 | 生物合成基因簇克隆、宿主工程 | 医药 |
| 308 | 2025-10-05 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
|
综述 | 本文综述光合作用工程化策略及其在细胞工厂应用中的潜力 | 系统整合纳米材料辅助、微流控技术、合成生物学和光生物电化学系统等多种工程策略优化光合作用 | NA | 探讨工程化光合系统在能源和物质转化领域的应用潜力 | 光合作用系统及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助技术、微流控技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | 代谢通路优化 | 能源, 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 309 | 2025-10-05 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
|
综述 | 探讨光合内共生系统的分子与生化特征,比较自然系统与工程化系统的异同 | 整合自然内共生系统研究与人工工程化尝试,揭示内共生转化为细胞器的关键分子机制 | NA | 理解光合内共生系统的进化机制与工程化应用潜力 | 线粒体、叶绿体等内共生细胞器及人工构建的光合内共生系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、比较基因组学 | NA | 文献数据、实验数据 | NA | iGEM | 光合细菌、宿主细胞 | 内共生代谢通路、基因转移系统 | 能源, 环境 |
| 310 | 2025-10-05 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
|
研究论文 | 本研究开发了利用金属-酚网络(MPN)对肽基凝聚体进行可移除膜化包覆的方法,显著增强了凝聚体的结构稳定性和化学耐受性 | 首次将金属-酚网络应用于凝聚体的可控制膜化包覆,实现了膜厚度和渗透性的可调调控,并能通过氧化还原反应实现膜的可逆组装与解离 | 研究主要聚焦于铁离子和单宁酸体系,尚未系统探索其他金属-酚网络组合的效果 | 开发一种稳定和保护肽基凝聚体免受化学有害物质影响的膜化策略 | 聚-L-赖氨酸和三磷酸腺苷(ATP)凝聚体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振波谱 | NA | 光谱数据 | NA | 金属-酚网络(MPN) | NA | 凝聚体膜化保护系统 | 合成生物学, 前生命化学 |
| 311 | 2025-10-05 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
|
综述 | 探讨人工智能与基因组编辑技术的融合及其在生物技术领域的革命性应用 | 首次系统阐述AI技术如何通过优化sgRNA设计、发现新型Cas蛋白和增强基因调控网络分析来推动基因组编辑发展 | 存在数据偏差、算法透明度不足和潜在非预期基因修饰等伦理问题 | 研究人工智能与基因组编辑技术的交叉融合及其应用前景 | 基因组编辑技术及其AI增强方法 | 机器学习 | 遗传疾病 | CRISPR基因编辑技术 | 深度学习预测器, 蛋白质语言模型 | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 312 | 2025-10-05 |
Synergizing CRISPR-Cas9 with Advanced Artificial Intelligence and Machine Learning for Precision Drug Delivery: Technological Nexus and Regulatory Insights
2025, Current gene therapy
IF:3.8Q2
|
综述 | 探讨CRISPR-Cas9基因编辑技术与人工智能和机器学习在精准药物递送中的协同应用及监管框架 | 首次系统整合CRISPR-Cas9技术与深度学习模型(如DeepCRISPR)在精准医疗中的协同应用,并提出技术融合的监管路径 | 未涉及具体临床实验数据,主要聚焦技术原理和理论框架层面的讨论 | 探索基因编辑技术与人工智能在精准药物递送领域的交叉应用及监管策略 | CRISPR-Cas9基因编辑系统及其计算辅助工具 | 机器学习 | 镰状细胞病,β-地中海贫血 | CRISPR-Cas9, 深度学习, NGS | DeepCRISPR | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 313 | 2025-10-05 |
Engineered Microbial-Based Therapeutics Nose No Bounds: Extending Innovation to Rhinologic Disease Management
2025-Sep, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23619
PMID:40825097
|
综述 | 探讨合成生物学在鼻科疾病治疗中应用工程化微生物的前景 | 首次系统提出利用鼻腔天然微生物生态系统开发工程化治疗菌株的创新策略 | 该治疗模式在鼻科疾病领域尚未充分探索,缺乏临床实践验证 | 开发针对鼻窦疾病的靶向可控精准疗法 | 鼻腔黏膜天然微生物生态系统及工程化治疗细菌 | 合成生物学 | 鼻窦疾病 | 微生物工程 | NA | NA | NA | NA | 鼻腔天然微生物 | 局部微生物群调节和免疫调节回路 | 医学 |
| 314 | 2025-10-05 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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综述 | 本文系统阐述了蛋白酶工程的方法、工具及新兴趋势,重点关注通过定向进化等技术调控蛋白酶活性与特异性的策略 | 涵盖了抗体-蛋白酶融合介导的邻近催化、外源蛋白互作驱动的特异性转换等新兴工程策略,以及分裂蛋白酶和自抑制蛋白酶的设计原理 | NA | 总结蛋白酶工程的最新进展,重点介绍实现蛋白酶活性和特异性精确控制的方法学 | 蛋白酶工程策略与工具 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酵母, 噬菌体, 无细胞系统 | 分裂蛋白酶电路, 自抑制蛋白酶模块, 蛋白质信号处理电路 | 生物医学, 蛋白质组学, 化学与合成生物学 |
| 315 | 2025-10-05 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 开发了一种可被可溶性配体激活的合成膜内蛋白水解受体平台 | 首次将SNIPR受体架构适配用于可溶性配体激活,具有低基线活性和高倍数激活特性 | NA | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体并激活定制细胞功能 | 合成膜内蛋白水解受体和工程化治疗细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | 内吞pH依赖性切割机制 | NA | NA | NA | SNIPR, CAR-T | 哺乳动物细胞 | 合成信号网络,细胞间通讯系统 | 医学 |
| 316 | 2025-10-05 |
Microbial proteases as emerging anti-inflammatory therapeutics: a comprehensive review
2025-Aug-19, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04409-w
PMID:40828296
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综述 | 本文全面探讨微生物蛋白酶作为抗炎治疗药物的潜力,包括其分子机制、生产策略及作为传统抗炎药物替代方案的临床应用前景 | 重点关注未充分研究的细菌属类,提出连接实验室发现与实际治疗应用的转化视角,并强调通过菌株工程、封装技术和合成生物学方法提升治疗效果 | 存在免疫系统敏感性、生理条件下稳定性差、与其他酶源比较数据有限、监管审批和靶向递送挑战等临床转化障碍 | 评估微生物蛋白酶在炎症管理中的治疗潜力 | 微生物蛋白酶及其抗炎机制 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 发酵技术、基因改造、菌株工程、封装技术、合成生物学方法 | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学方法 | 微生物 | NA | 医药 |
| 317 | 2025-10-05 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
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综述 | 本文重点介绍了利用合成生物学技术生产粘康酸的最新研究进展 | 系统总结了包括辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化在内的新型生产策略 | NA | 探讨微生物合成生物学在粘康酸生产中的应用 | 粘康酸生物合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 318 | 2025-10-05 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
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综述 | 本文全面综述了利用合成生物学和代谢工程工具改造肠道微生物组的最新进展,特别以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例 | 系统分析从早期重组益生菌到先进合成生物学平台的发展历程,重点阐述工程化大肠杆菌Nissle 1917产生苯丙氨酸解氨酶(PAL)和L-氨基酸脱氨酶(LAAD)用于苯丙酮尿症(PKU)治疗 | NA | 探讨微生物群落工程在生物技术领域的进展及其在肠道健康相关疾病治疗中的应用潜力 | 肠道微生物组、工程化肠道细菌、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症 | 酶工程、代谢工程、生物催化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通路、生物传感器、免疫调节化合物生物合成、短链脂肪酸生产、有害代谢物分解 | 医学 |
| 319 | 2025-10-05 |
Advancing fungal phylogenetics: integrating modern sequencing, dark taxa discovery, and machine learning
2025-Jul-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04392-2
PMID:40643763
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综述 | 本文综述了现代分子技术如何革新真菌系统发育学研究,重点关注DNA指纹图谱、新一代测序和三代测序技术在物种鉴定、系统发育重建和疾病管理中的应用 | 整合现代测序技术、暗分类群发现和机器学习方法,提出解决真菌分类难题和抗药性预测的多组学综合研究框架 | 在解决基因组内变异、协调基因树不一致性以及标准化大规模真菌群体研究流程方面仍存在挑战 | 推进真菌系统发育学研究,提高真菌疾病诊断和管理能力 | 真菌多样性、进化关系和致病机制 | 生物信息学 | 真菌感染疾病 | 新一代测序(NGS)、三代测序(TGS)、DNA指纹图谱、多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | 机器学习算法 | 基因组数据、分子标记数据 | NA | CRISPR、合成生物学平台 | NA | NA | 农业、医疗、环境 |
| 320 | 2025-10-05 |
Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
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研究论文 | 本研究开发了响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,用于动态调控中心代谢的代谢通量分布 | 建立了可响应中心代谢物丙酮酸的生物传感器系统,突破了传统遗传工具对特定途径的依赖,实现了对中心代谢通量的动态调控 | NA | 开发能够动态调控中心代谢通量的遗传电路,提高微生物细胞工厂中目标化合物的生物合成效率 | PdhR生物传感器系统及其在海藻糖和4-羟基香豆素生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 生物传感器表征、计算分析、定点突变 | NA | NA | NA | 生物传感器、定点突变 | 微生物细胞工厂 | 丙酮酸响应型生物传感器系统,动态调控代谢通量分布 | 工业生物技术 |