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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-05-17 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 综述了利用合理与非理性策略构建原核细胞工厂生产芳香族氨基酸衍生物的研究进展 | 重点总结了合理与非理性策略在构建原核细胞工厂中的应用,并探讨了未来发展方向 | 未具体提及研究局限,但可能涉及当前发酵生产面临的高滴度和产率挑战 | 为生产芳香族氨基酸衍生物的原核细胞工厂的构建和优化提供见解和指导 | 原核细胞工厂 | 代谢工程与合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物 | NA | 工业生物技术 |
| 322 | 2026-05-17 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
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综述 | 探讨合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何为开发具有环境响应功能的可编程纳米材料创造机遇 | 提出生物相容性从静态特性向动态可编程特性的根本性重新概念化,实现纳米材料像复杂生物实体而非传统治疗剂运行 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在显著挑战 | 综述下一代绿色纳米材料中可编程生物界面与自适应功能性的研究进展 | 绿色纳米材料 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术, 4D生物打印 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 工程微生物系统 | 基因电路驱动的响应系统, DNA刺激响应结构, 分子逻辑门 | 医学 |
| 323 | 2026-05-17 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
|
综述 | 回顾SBOL Visual标准过去十年的发展历程,从最初的21个图形符号演变为全面的生物设计图解语言,并分析其采纳情况与未来展望 | 系统梳理了SBOL Visual标准从1.0到3.0版本的演变过程,并首次评估了其在科学出版物、可视化工具开发及遗传设计信息交流中的采纳趋势 | 尽管采纳率稳步增长,但实现完全合规和最佳实践的广泛应用仍需额外努力 | 回顾SBOL Visual标准十年发展并评估其采纳情况,为合成生物学图形标准优化提供参考 | SBOL Visual标准及其在合成生物学领域的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本和图形数据 | NA | SBOL Visual, SBOL | NA | 遗传设计图解语言 | 工业生物技术 |
| 324 | 2026-05-17 |
Automated Strain Construction for Biosynthetic Pathway Screening in Yeast
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00554
PMID:41063332
|
研究论文 | 本文提出了一个自动化菌株构建工作流程,用于在酵母中筛选生物合成途径 | 通过Hamilton Microlab VANTAGE机器人集成离线硬件,实现了构建步骤的自动化,提高了通量至每周2000次转化,并开发了用户界面支持参数定制 | 未提及,但从技术说明性质看,可能缺乏大规模验证或通用性测试 | 自动化合成生物学中的菌株构建流程,加速途径发现与优化 | 工程酵母菌株中生产维拉嗪(一种甾体生物碱生物合成关键中间体)的基因库 | 合成生物学 | NA | 自动化菌株构建、基因库筛选 | NA | 基因序列数据 | 每周2000次转化(通量数据) | NA | 酿酒酵母 | 生物合成途径(维拉嗪生产) | 工业生物技术、医药 |
| 325 | 2026-05-17 |
Engineering Fibroblast Growth Factor-2 (FGF2) Production in Cyanobacteria
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00388
PMID:41045549
|
research paper | 本研究通过将成纤维细胞生长因子2(FGF2)与藻蓝蛋白CpcB亚基融合,在蓝细菌中实现了FGF2的稳定表达和生物活性保持 | 首次通过融合藻蓝蛋白CpcB亚基的方法,克服了FGF2因仅含β-折叠结构而在异源系统中难以稳定表达的问题,并保持了融合蛋白的双重生物活性 | 研究仅测试了单一种类的蓝细菌(集胞藻PCC 6803),且未探讨融合蛋白的规模化生产或长期稳定性 | 实现对难于表达的FGF2蛋白在蓝细菌中的稳定重组表达 | 成纤维细胞生长因子2(FGF2)和集胞藻PCC 6803 | synthetic biology | NA | 基因融合、密码子优化 | NA | NA | NA | NA | 集胞藻PCC 6803 | FGF2与藻蓝蛋白CpcB亚基的融合基因构建 | 医学、生物技术 |
| 326 | 2026-05-17 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 利用工程化生物分子凝聚体构建人工细胞器,实现代谢途径的区室化通量控制 | 首次设计FUSLCD-GCN4融合蛋白系统创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来增强代谢途径效率 | 该研究仅以2'-岩藻糖基乳糖合成途径为模型,未验证在其他代谢途径中的通用性 | 建立基于生物分子凝聚体的合成生物学平台,实现通量区室化控制以提高微生物细胞工厂的生物合成效率 | 工程化大肠杆菌及其中的人工细胞器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 蛋白质融合设计 | 大肠杆菌 | 人工细胞器(基于FUSLCD-GCN4的区室化途径) | 工业生物技术 |
| 327 | 2026-05-17 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 结合分支卷积神经网络设计和高通量微流控荧光激活细胞分选,筛选增强型合成酵母启动子 | 首次将分支卷积神经网络(B-CNN)与遗传算法结合,用于预测和重新设计酵母启动子核心区域,并集成微流控荧光激活细胞分选(μFACS)系统实现高吞吐量单细胞分选 | 未提及大规模验证或其他酵母菌株的通用性 | 实现合成酵母启动子的理性设计和高效高通量筛选,提升基因表达和代谢物生物合成性能 | 酵母酒精氧化酶1启动子(P_AOX1)及其突变体 | 机器学习 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS)、分支卷积神经网络(B-CNN)、遗传算法 | 分支卷积神经网络(B-CNN) | 序列数据和荧光图像 | GFP表达文库,具体数量未给出;细胞吞吐量7000个/秒 | NA | 酵母(毕赤酵母) | 合成启动子(P_AOX1核心区重新设计)及GFP报告基因表达电路 | 工业生物技术、医药 |
| 328 | 2026-05-17 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
|
研究论文 | 在酿酒酵母中通过代谢与脂滴工程联合策略实现弗里德林的全新合成 | 首次在酿酒酵母中构建弗里德林的全新生物合成途径,并结合脂滴工程技术极大提高产量至1500 mg/L | 仅进行了摇瓶发酵,尚未进行中试或大规模生产验证 | 开发高效、可持续的弗里德林微生物生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 弗里德林生物合成途径 | 医药 |
| 329 | 2026-05-17 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本文利用定量表征的植物遗传元件和计算机模型,设计并验证了一种在稳定转基因植物中功能可预测的遗传双稳态开关 | 首次在稳定遗传工程化植物中实现可预测的遗传双稳态开关,并通过计算模型指导元件选择和电路迭代优化,克服了植物生命周期长、环境影响大的挑战 | 未讨论该遗传开关在不同植物物种或环境条件下的通用性,且长期稳定性尚未验证 | 开发可编程、可预测的植物遗传电路,特别是双稳态开关,以推动植物合成生物学应用 | 植物遗传元件(如启动子、转录因子)及其组装成的双稳态开关电路 | 合成生物学 | NA | NA | 计算机模型(in silico model) | 定量功能数据 | 稳定转基因植物(具体数量未提及) | NA | 植物(具体种类未提及) | 双稳态开关(mutually inhibitory gene-regulatory device) | 农业、环境 |
| 330 | 2026-05-17 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
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研究论文 | 提出一种名为SPN-FLUX的合成磷酸化网络平台,集成分裂荧光素酶或发光蛋白,实现快速可调的细胞过程报告 | 首次实现完全翻译后水平的合成磷酸化网络,能够在1小时内响应胞外刺激,克服了传统转录介导报告过程无法快速实时监测的局限 | 目前仅基于哺乳动物细胞模型验证,可能在其他系统(如细菌或植物)中的效果未知;且局限于缺氧等少数环境刺激的检测 | 开发一种基于翻译后修饰的快速、可调控的合成受体平台,用于实时监测细胞信号事件 | 哺乳动物细胞(如HEK293细胞) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分裂荧光素酶/发光蛋白、配体诱导二聚化 | NA | 荧光/发光信号 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 合成磷酸化网络,包括膜结合受体(配体诱导二聚化激活)和组成型活性细胞内生物传感器 | 生物医学研究,环境监测 |
| 331 | 2026-05-17 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 设计和验证了pXpressome工具包,用于稳健表达和重新设计α-羧酶体 | 开发了pXpressome工具包,实现α-羧酶体的稳健表达、纯化后保持完整和功能,并通过基因缺失实验揭示蛋白质比例可理性影响形态 | 未提及,但可能涉及工具包在复杂环境或不同宿主中的适用性限制 | 促进羧酶体的研究和重新设计,以增强碳固定或作为纳米封装平台 | α-羧酶体及其组成蛋白(Rubisco、碳酸酐酶、顶点蛋白、面形成蛋白) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | pXpressome工具包,Gibson Assembly | 大肠杆菌(E. coli) | 羧酶体表达系统,包括荧光标记构建体 | 环境,工业生物技术 |
| 332 | 2026-05-16 |
Genetically Reprogramming Crops and Rhizobacteria for Nutritional Iron Biofortification
2025-12-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00614
PMID:41252749
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综述 | 本文综述了利用植物和根际细菌合成生物学方法实现作物营养铁生物强化的策略 | 提出将植物-微生物-金属效应器作为基因回路设计的模块化组件,通过跨宿主途径转移和表达调控优化铁吸收 | 未涉及具体实验验证或田间试验数据,主要基于现有文献分析潜在靶点 | 探讨通过合成生物学手段提高作物铁含量的可行性及关键靶点 | 作物与根际细菌 | 合成生物学 | 贫血 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物,根际细菌 | 植物-微生物-金属效应器模块化基因回路 | 农业,食品,医疗 |
| 333 | 2026-05-16 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
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评论 | 总结2025年春季日英合成生物学会议,探讨国际合作如何推动工程生物学发展 | 强调通过跨国合作促进合成生物学从研究向可持续生物经济转型的视角 | 未深入分析具体技术瓶颈,仅概述会议讨论的挑战与趋势 | 促进合成生物学领域的全球协作,推动生物基经济转型 | 合成生物学研究者及国际合作机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 334 | 2026-05-16 |
Engineered Biomolecular Condensates Limit Tobacco Mosaic Virus Accumulation and Symptom Development
2025-06, Molecular plant pathology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/mpp.70113
PMID:40544335
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研究论文 | 本文通过工程化生物分子凝聚体限制烟草花叶病毒积累和症状发展 | 首次利用液-液相分离形成的工程化人工凝聚体作为靶向抗病毒策略,限制植物病毒积累 | NA | 开发工程化生物分子凝聚体以减轻植物病毒积累和疾病严重程度 | 烟草花叶病毒(TMV)和本氏烟草 | 合成生物学 | 植物病毒病 | 液-液相分离(LLPS) | NA | 生物分子数据 | NA | MS2噬菌体发夹、MS2外壳蛋白(MCP) | 本氏烟草 | 人工生物分子凝聚体(基于TDP-43的凝聚体) | 农业 |
| 335 | 2026-05-16 |
p-Hydroxycinnamic Acids: Advancements in Synthetic Biology, Emerging Regulatory Targets in Gut Microbiota Interactions, and Implications for Animal Health
2025-04, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.01.034
PMID:39900184
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综述 | 本文综述了对羟基肉桂酸在合成生物学中的进展、与肠道微生物群的相互作用及其对动物健康的影响 | 强调了对羟基肉桂酸与肠道微生物群相互作用的复杂机制,并探讨了合成生物学的最新进展 | NA | 阐明对羟基肉桂酸的生物活性及其对动物健康的影响机制 | 对羟基肉桂酸、肠道微生物群、动物健康 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物资源 | NA | 食品、动物饲料 |
| 336 | 2026-05-15 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
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研究论文 | 开发了一种黏液包封微球凝胶递送系统,用于封装基因工程益生菌,实现对炎症性肠病的诊断和治疗 | 设计了外部黏膜涂层(透明质酸和表没食子儿茶素没食子酸酯)与内部高生物相容性聚丝氨酸改性藻酸盐微球结合的双层递送系统,有效保护工程菌免受胃部恶劣环境影响并延长肠道定殖时间至24小时 | 实验仅基于炎症性肠病模型,未提及在人类患者中的验证结果 | 解决工程菌递送至病变部位并实现持续定殖的挑战,推动活体生物治疗产品的临床转化 | 基因工程益生菌(用于检测和治疗肠炎) | 合成生物学, 生物医学工程 | 炎症性肠病 | 合成生物学, 微球凝胶封装 | NA | 体内动物模型数据 | NA | 基因工程 | 益生菌(具体种类未说明) | 生物标志物检测与Avcystatin释放回路 | 医学 |
| 337 | 2026-05-15 |
Revolutionizing structural biology: AI-driven protein structure prediction from AlphaFold to next-generation innovations
2025, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.04.002
PMID:40973394
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综述 | 探讨从AlphaFold到下一代创新中人工智能驱动的蛋白质结构预测如何革命化结构生物学 | 系统回顾蛋白质结构预测从传统方法到AlphaFold及后续模型(如RoseTTAFold和OmegaFold)的演变,并重点分析AlphaFold的设计、方法论和性能,同时指出其局限性及未来方向 | 模型在预测蛋白质复合体和动态变化方面存在不足,且对计算资源要求较高 | 综述人工智能在蛋白质结构预测中的进展与应用,并展望未来发展方向 | 蛋白质结构预测方法及其在生物医学中的应用 | 机器学习, 结构生物学 | NA | AlphaFold, RoseTTAFold, OmegaFold, 同源建模, 从头预测 | 人工智能模型(如AlphaFold) | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 药物发现 |
| 338 | 2026-05-12 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-12, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
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综述 | 探讨细菌表面展示技术在药物递送中的进化与应用,并从合成生物学、免疫工程和转化医学角度提出未来路线图 | 系统阐述了细菌表面展示技术在药物递送中的独特优势(增强定位、延长治疗活性、降低全身毒性),并首次提出利用AlphaFold和计算机筛选等计算工具理性设计最佳外膜锚的路线图 | 监管障碍和微生物稳定性等挑战仍需克服 | 将细菌表面展示技术定位为靶向药物递送的一种强大且尚未充分开发的模式,桥接合成生物学、免疫工程和转化医学 | 细菌(革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌)及其表面展示系统,包括外膜蛋白、分选酶介导的锚定和孢子基系统 | 合成生物学 | 癌症 | 细菌表面展示技术、AlphaFold、计算机筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌 | 表面展示系统(外膜蛋白锚定、分选酶介导锚定、孢子基系统) | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 339 | 2026-05-12 |
Precision therapeutics for inflammatory bowel disease using engineered probiotics: Strategies and optimization
2025-11, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.012
PMID:41083038
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综述 | 本综述总结了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的研究进展,涵盖底盘菌株基因编辑、微生物多维作用、生物工程改造、递送系统优化及人工智能驱动菌株筛选与设计 | 通过基因修饰和合成生物学实现微环境响应和精准靶向治疗,突破传统益生菌功能单一和非靶向作用的局限,在肠道黏膜修复和免疫调节中展现显著疗效 | NA | 综述工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的精度疗法策略与优化方法 | 工程化益生菌,包括底盘菌株、微生物群落、递送系统及人工智能筛选设计 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 基因编辑、合成生物学、生物工程改造、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 肠道益生菌(如乳酸菌、双歧杆菌等) | 微环境响应电路、精准靶向治疗回路(如生物传感器、代谢通路) | 医学 |
| 340 | 2026-05-12 |
Multivalent engineering of bio interfaces with DNA-based nanomaterials
2025-10, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115681
PMID:40865643
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综述 | 综述了利用DNA纳米材料进行生物界面多价工程的基本原理、设计策略及其在诊断、治疗和合成生物学中的应用 | 提出从传统多价结合向多价工程的范式转变,即通过精确的DNA纳米结构空间组织配体,实现对受体分布、密度及局部微环境的可控靶向 | 多价工程系统在复杂体内环境中仍面临稳定性、递送效率及脱靶效应等重大挑战 | 探讨DNA纳米材料用于生物界面多价工程的基本原理、设计策略及应用进展 | 生物界面上的多价相互作用(如细胞信号、免疫识别、粘附等)及DNA纳米材料 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米结构自组装 | NA | 多价配体空间排列(如纳米尺度几何调控) | 诊断, 治疗, 合成生物学 |