合成生物学相关文章
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当前共找到 1531 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-05-12 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-05-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 揭示了甘草素完全生物合成途径，并通过合成生物学方法在酵母中实现从简单碳源的从头重建 | 首次完整阐明甘草素生物合成途径，特别是氧化环化步骤，并鉴定出之前未表征的还原酶和五个P450酶基因 | 未提及具体局限性 | 阐明甘草素生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘草素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养实验、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草、酿酒酵母 | 甘草素从头生物合成途径 | 农业、生物学 |
| 342 | 2026-05-12 |
Maize2035: A decadal vision for intelligent maize breeding
2025-02-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.012
PMID:39827366
|
综述论文 | 概述玉米育种的历史成功、当前挑战及未来十年智能育种的愿景与前沿解决方案 | 提出集成单细胞分析、全生物组、智能育种算法和合成生物的理性设计等跨学科方法，推动数据驱动的精准农业变革 | 未详细讨论各技术路线的实际验证数据或潜在实施障碍 | 提出面向2035年玉米智能育种的发展愿景和协同目标 | 玉米育种体系及其相关技术策略 | 农业科技 | NA | 多组学分析、单细胞分析、智能育种算法、合成生物学 | NA | 多组学数据、农业大数据 | NA | 合成生物学 | 玉米 | 理性设计合成生物回路 | 农业 |
| 343 | 2026-05-10 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
|
综述 | 综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用潜力 | 系统总结了粘细菌基因组多样性和裂解酶挖掘的最新进展，强调了粘细菌作为工业细胞工厂的未充分利用潜力 | 基因工程改造困难、生长缓慢、代谢重塑和表达策略限制等挑战尚未解决 | 探讨粘细菌及其酶在农业和工业生物制造中的应用前景 | 粘细菌及其裂解酶 | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学策略 | 粘细菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 344 | 2026-05-10 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
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综述 | 探讨类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径的工程化策略，涵盖酶工程、合成生物学工具及宿主范围，并展望未来研究方向 | 采用通路模块化视角，系统梳理从前体供应到氧化裂解的每个酶促步骤，重点突出新发现酶变体、诱变研究、融合策略及区室化方法对代谢调控的贡献 | 仅聚焦近期文献，未对工业放大和具体产量指标进行量化比较，缺乏对经济性与规模化瓶颈的深入分析 | 为推进类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素生物合成提供层次化路径理解与工程策略整合 | 类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径中的酶、宿主（植物、真菌、藻类、酵母、细菌）及合成生物学工具 | NA | NA | NGS、RNA-seq、CRISPR-Cas9、Golden Gate Assembly | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 植物、真菌、藻类、酵母、细菌 | 类胡萝卜素生物合成通路（前体供应→GGPP→八氢番茄红素→脱饱和/异构化→环化→羟基化→酮基化→环氧化→氧化裂解） | 医学、农业、食品、工业生物技术 |
| 345 | 2026-05-08 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了用于基因组记录细胞事件的分子电路的发展策略 | 提出了构建能忠实将过去细胞状态编码到基因组DNA记录中的新传感模块和遗传电路架构的需求 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限，其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 探索构建用于基因组记录多种细胞事件的分子电路 | 基于CRISPR的基因组编辑技术和合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 传感模块和遗传电路架构 | NA |
| 346 | 2026-05-08 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-01-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本研究利用量子隧穿纳米间隙结和机器学习技术，对八种人工合成DNA碱基进行了电识别研究 | 首次将量子隧穿传输与机器学习结合用于人工DNA碱基的高精度电识别，实现了高达100%的碱基识别准确率 | 未提及实际生物样本中的验证或系统级应用限制 | 实现人工合成DNA碱基的快速精确电识别，推动遗传研究、DNA数据存储和合成生物学发展 | 八种人工合成DNA碱基（DNA和DNA碱基） | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输 | 机器学习模型 | 序列 | 八种人工合成DNA碱基数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 遗传学, DNA数据存储, 诊断 |
| 347 | 2026-05-06 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 利用CsrA蛋白与uxuB mRNA之间的浓度依赖性调控机制，设计了一种转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白对uxuB mRNA的浓度依赖性双重调控（激活和抑制）特性，设计了一种基于RNA-蛋白质相互作用的转录后带通滤波器，减少了合成电路组件数量 | 未来需要对天然调控RNA-蛋白质系统进行进一步表征，以实现更复杂的RNP基电路 | 开发基于CsrA-uxuB相互作用的转录后带通滤波器，实现多信号控制 | uxuB mRNA的5'UTR和100个核苷酸编码序列与碳储存调控蛋白CsrA的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 带通滤波器，基于CsrA浓度调控的ON/OFF状态转换电路 | 合成生物学 |
| 348 | 2026-05-06 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 提供转酮醇酶活性、催化机制和结构分析的实验方案，涵盖稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测及快速动力学研究 | 整合多种生物物理和结构生物学方法，形成用于转酮醇酶基础与应用研究的综合工具集 | 未涉及具体疾病模型或临床验证，未讨论不同来源转酮醇酶间的差异 | 建立转酮醇酶功能与结构分析的标准实验方案，推动酶学、合成生物学及药物开发 | 转酮醇酶 | 结构生物学 | 癌症、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、光谱学、快速动力学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物催化 |
| 349 | 2026-04-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
|
综述 | 综述了利用植物病毒载体在本氏烟中瞬时表达系统生产生物制药的关键作用与最新进展 | 阐述了病毒载体修饰、水培法和受控环境农业等创新技术如何提升可扩展性和法规合规性，并通过糖基化工程拓宽可生产的生物制药范围 | 未明确讨论瞬时表达系统在工业生产中的长期稳定性或大规模生产成本控制的具体挑战 | 强调瞬时表达系统在生物制药生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用潜力，并推动植物分子农业成为现代生物技术的关键组成部分 | 本氏烟中的瞬时表达系统及植物病毒载体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达 | NA | NA | NA | 病毒载体 | 本氏烟 | 植物病毒载体驱动的瞬时表达系统 | 医药, 生物技术 |
| 350 | 2026-04-28 |
Advances in the microbial biosynthesis of ʟ-tryptophan and its derivatives
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100046
PMID:42038707
|
综述 | 综述L-色氨酸及其衍生物的微生物合成进展 | 系统总结了提高微生物L-色氨酸产量的优化策略及工程菌株在合成高价值衍生物方面的应用，并探讨了合成生物学快速进化为衍生物生产带来的变革性机遇 | 仍存在若干关键瓶颈，但未具体阐述 | 优化微生物合成途径以高效生产L-色氨酸及其衍生物 | L-色氨酸及其衍生物的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 微生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 生物合成途径 | 医药, 食品 |
| 351 | 2026-04-28 |
Four enzymes from button bush enable de novo biosynthesis of spirooxindole alkaloids in yeast
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100049
PMID:42038706
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研究论文 | 本文从风箱树中发现了四种酶，并在酵母中实现了螺环氧化吲哚生物碱的从头生物合成 | 首次发现并表征了四条酶的级联反应途径，能够在酵母中完全从头合成异育亨宾型氧化吲哚生物碱，阐明了氧化吲哚形成的酶学逻辑 | 未明确提及局限性 | 揭示异育亨宾型氧化吲哚生物碱的生物合成途径并实现其在酵母中的异源重建 | 风箱树中的四种酶（CoAJS、CoHYC3O、CoHYC3R、CoOIS）及相应生物碱产物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、生化验证、酶动力学分析、酵母工程改造 | NA | NA | NA | 酵母菌株工程 | 酿酒酵母 | 四酶级联途径，将鹰爪豆碱苷元转化为异育亨宾型氧化吲哚生物碱（米曲菲林、异米曲菲林、uncarine F） | 医药、工业生物技术 |
| 352 | 2026-04-28 |
DeepCodon: A deep learning codon-optimization model to enhance protein expression
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100042
PMID:42038710
|
研究论文 | 提出一种名为DeepCodon的深度学习密码子优化模型，用于增强蛋白质表达 | 首次在密码子优化中保留功能上重要的稀有密码子簇，采用条件概率策略保护保守稀有密码子 | 未详细说明模型的泛化能力或在不同宿主物种中的表现 | 开发一种多目标密码子优化工具，平衡宿主密码子偏好、GC含量和mRNA二级结构等因素以提高异源基因表达 | Enterobacteriaceae序列、P450和G3PDH基因 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN | 序列数据 | 150万个天然肠杆菌科序列，7种低产量P450和13种AI设计的G3PDH | NA | E. coli | NA | 合成生物学、基因工程 |
| 353 | 2026-04-28 |
Protein design drives synthetic biology research of plant natural products
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100048
PMID:42038708
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综述 | 本文综述了蛋白质设计技术在植物天然产物合成生物学研究中的前沿进展，探讨如何通过人工智能与合成生物学深度融合解决植物天然产物微生物生产中的关键瓶颈 | 系统阐述了蛋白质设计技术在解决植物天然产物生物合成中未知酶步骤和植物源酶功能表现不佳等难题方面的突破性进展，并强调了人工智能与合成生物学深度融合的潜力 | 未深入讨论蛋白质设计技术的具体实验验证细节及其在工业规模化生产中的实际应用挑战 | 总结蛋白质设计技术在植物天然产物生物合成中的应用，探索解决微生物生产瓶颈的方法 | 植物天然产物及其相关的植物源酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 植物天然产物的生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品 |
| 354 | 2026-04-28 |
The convergence of AI and synthetic biology: the looming deluge
2025-Jul-01, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00021-1
PMID:42032179
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评论 | 探讨人工智能与合成生物学融合带来的机遇与风险，并提出监管策略 | 首次综合性地分析AI驱动合成生物学在医学、农业和可持续发展领域的创新潜力，同时系统性地评估双重用途风险、治理缺口和伦理困境 | 未提供具体实验数据或案例研究，分析较为宏观，缺乏实证支持 | 探讨AI与合成生物学融合如何加速生物工程流程，并识别相关风险与治理需求 | AI驱动合成生物学的应用场景及治理框架 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 可持续性 |
| 355 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 356 | 2026-04-28 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本文从云南金不换中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的苄基异喹啉生物碱7-O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5，并通过对底物结合微环境的操作改变其催化区域选择性 | 首次发现通过操纵底物结合微环境中的三个残基（R143/L156/H163和F154/F167/G174），可将SyOMT4转化为高度特异的BIA 6OMT（SyOMT4-WFE），并将SyOMT5工程化为BIA N-甲基转移酶（SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD），拓展了BIA OMT的功能谱 | 未评估工程化酶在合成生物学和代谢工程中的实际应用效果 | 研究云南金不换中苄基异喹啉生物碱O-甲基转移酶的功能并通过蛋白工程改变其区域选择性 | 来自云南金不换（Stephania yunnanensis）转录组数据的两种O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | NA | NA | 转录组测序、定点突变、结构建模 | NA | 转录组数据 | 从云南金不换转录组数据中鉴定两种酶 | 定点突变 | NA | NA | 医学、合成生物学、代谢工程 |
| 357 | 2026-04-25 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文综述了利用生物策略实现木质素增值以及将木质素转化为生物制造原料的最新进展 | 综合了木质素降解酶、代谢工程、合成生物学和人工智能驱动技术等多学科交叉方法，提出利用数字系统和人工智能技术促进木质素商业化的创新观点 | 主要基于现有文献分析，可能缺乏大规模实际应用验证数据，且未深入探讨技术经济可行性 | 探索木质素增值的有效生物转化途径，推动将其作为可持续原料用于生物基制造 | 木质素及其衍生物的降解与转化工艺、相关酶系统、代谢途径及工程菌株 | NA | NA | 木质素降解酶、代谢工程、遗传工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环代谢路径重定向 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 358 | 2026-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 重点介绍基于CRISPR平台的非DSB编辑器BE和PE的开发与创新，探讨改进策略及未来理想编辑器的发展前景 | 系统归纳了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路在BE和PE开发中的应用，并阐述了CRISPR技术创新中的巧妙思维反转与跳跃 | 未具体探讨CRISPR碱基编辑技术在实际应用中可能面临的脱靶效应或伦理问题 | 综述CRISPR碱基编辑技术通过创新策略和思路的进展，展望未来理想编辑器的开发 | 基于CRISPR平台的碱基编辑器（BE）和先导编辑器（PE） | 合成生物学 | NA | CRISPR碱基编辑, 先导编辑, AAV递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 碱基编辑器, 先导编辑器, 小型编辑器 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 359 | 2026-04-23 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 实现了紧密调控、可滴定且具有低重组率和最小基础活性的Cre重组酶系统，并成功应用于缺氧环境下的砷酸盐生物传感 | NA | 开发一种可调控的低速率基因组重组工具，以增强环境生物传感和合成生物学的应用能力 | Escherichia coli（大肠杆菌）中的Cre-lox重组系统 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的低速率基因组重组系统，用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 360 | 2026-04-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SNIPR的合成受体平台，能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能，用于增强工程化治疗细胞的特异性 | 首次将SNIPR受体架构改造为可被可溶性配体激活的平台，实现了低基线活性与高倍数激活，并通过内吞和pH依赖性切割机制工作 | 未明确说明受体平台在复杂生理环境中的长期稳定性及潜在免疫原性问题 | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体，用于精准调控工程化治疗细胞功能 | 合成受体平台（SNIPR）、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA | SNIPR平台 | 哺乳动物细胞 | 可溶性配体激活的合成受体、正交于天然信号通路的细胞间通信网络 | 医学 |