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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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341 | 2025-05-23 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-May-21, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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综述 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传学平台的发展、主要特点、当前应用及未来挑战,该平台用于在活细胞中控制蛋白质定位 | 介绍了SLIPT-PM这一新型化学遗传学平台,能够快速将目标蛋白从细胞质招募到质膜,并具有可控的可逆性和重复性 | 未明确提及具体局限性 | 开发用于操纵细胞信号网络的化学遗传学工具 | 细胞信号蛋白和脂质 | 化学生物学与合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白转位)技术 | NA | NA | NA |
342 | 2025-05-23 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
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研究论文 | 通过计算机模拟分析细菌代谢动力学对外部扰动的响应,揭示了代谢网络中辅因子和网络稀疏性的硬编码响应特性 | 发现三种不同动力学模型在非线性状态下对扰动表现出一致的强响应,并识别出腺苷辅因子和网络结构是影响代谢系统响应性的关键因素 | 研究基于计算机模拟,需要进一步实验验证 | 发展定量稳态理论,理解生化系统在扰动下的动力学特性 | 细菌中心碳代谢的动力学模型 | 计算系统生物学 | NA | 动力学模型模拟 | 非线性动力学模型 | 计算机模拟数据 | 三种不同的动力学模型 |
343 | 2025-05-23 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
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研究论文 | 该研究通过合成生物学技术实现了创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生产,并评估了其抗结核活性 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物,并首次报道卤化去甲创新霉素衍生物,实现了实验室水平的最高产量 | 未提及临床前或临床试验数据,活性测试仅限于体外实验 | 开发新型抗结核药物候选物 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、激活子过表达、启动子优化、发酵培养基筛选、HR-MS、HR-MS/MS、NMR | NA | 化学分析数据、生物活性数据 | 11种卤化创新霉素衍生物(其中6种纯化鉴定) |
344 | 2025-05-23 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程细胞在药物递送中的新兴应用 | 探讨了合成生物学与纳米技术在药物递送中的前沿融合,强调了工程细胞的模块化、标准化和智能化发展趋势 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 推动先进药物递送系统的构建 | 合成生物学工程细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA |
345 | 2025-05-23 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学原理精确控制细菌中肝素糖生物合成的新方法,旨在生产低分子量和低分散指数的肝素糖 | 设计了一种生物分子控制器,通过生物传感器检测肝素糖前体,精确调控肝素糖生物合成过程 | NA | 开发一种能够精确控制肝素糖生物合成的方法,以生产具有特定性能的肝素糖材料 | 肝素糖的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学设计原理 | NA | NA | NA |
346 | 2025-05-22 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025-May-21, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法生成适应悬浮生长的HEK293细胞系,用于重组腺相关病毒(rAAV)的可扩展生产 | 开发了能够在无血清悬浮培养基中生长的GX6Bs细胞系,并研究了其转录组变化对rAAV产量的影响 | 悬浮培养的GX6Bs细胞病毒滴度显著降低,即使恢复贴壁培养条件,产量也只能恢复到GX6B的25%-50% | 开发可扩展的rAAV生产技术 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | GX6B和GX6Bs细胞系 |
347 | 2025-05-22 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-May-21, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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综述 | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在化学生产、人类健康和环境修复中的具体应用,为未来研究提供了指导 | NA | 研究机器学习与合成生物学在生物制造中的协同作用及其潜在价值 | 微生物细胞工厂及其在化学生产、人类健康和环境修复中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA |
348 | 2025-05-22 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-May-20, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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research paper | 本文综述了2013年至2024年间核糖体合成并经翻译后修饰的肽(RiPP)天然产物的研究进展,重点介绍了通过翻译后修饰(PTMs)重塑肽骨架的酶及其催化机制 | 揭示了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶及其催化机制,为功能性肽类药物的理性设计和生产提供了新的生物学工具 | NA | 加深对RiPP生物合成的理解,并增强利用合成生物学策略理性设计、开发和生产功能性肽类药物的能力 | 核糖体合成并经翻译后修饰的肽(RiPP)天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA |
349 | 2025-05-22 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展,包括两种研究策略及其相关酶学和生物合成知识 | 提出了基于Kitasatospora的两种肽类天然产物研究策略,并总结了相关生物合成酶的最新发现 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究方法和生物合成机制 | Kitasatospora属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 天然产物化学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络构建 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA |
350 | 2025-05-22 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNIPR的合成受体平台,能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能,应用于工程化治疗细胞的调控 | 开发了一种新型合成受体SNIPR,能够通过内吞和pH依赖性切割机制响应可溶性配体,具有低基线活性和高激活倍数 | NA | 开发模块化合成受体以调控工程化治疗细胞的活性 | 合成受体SNIPR及其在CAR T细胞中的应用 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学技术 | SNIPR | NA | NA |
351 | 2025-05-21 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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review | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在人类健康和农业等领域的应用潜力 | 探讨了基因组测序技术揭示的次级代谢产物生物合成能力的新领域,以及预测工具和分子生物学技术在发现新代谢物和理解生物合成酶学中的应用 | NA | 加速发现微生物次级代谢产物的新生物化学、功能和应用 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇(BGCs) | 生物技术 | NA | 基因组测序、生物合成基因簇预测工具、分子生物学和合成生物学工具 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
352 | 2025-05-21 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析,揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次鉴定了常春藤中参与齐墩果烷型三萜骨架修饰的CYP450基因,并验证了其功能 | 研究仅聚焦于CYP450基因在齐墩果烷型三萜生物合成中的功能,未涉及其他代谢途径 | 解析常春藤中齐墩果烷型皂苷的生物合成途径 | 常春藤(Hedera helix L.)及其代谢产物 | 植物代谢工程 | NA | 转录组测序、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内功能验证 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | NA |
353 | 2025-05-21 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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research paper | 本文提出了一种蛋白酶响应性构象抑制系统(PRCIS),用于设计可编程的人工转录因子(ATF)以构建正交和可组合的转录调控工具 | 通过分子内连接将ATF的自由DNA结合域与受限二聚化区域相连,实现转录结合的构象失活,并在蛋白酶切割连接后恢复DNA结合功能 | NA | 开发一种通用的蛋白酶响应性构象抑制系统,用于合成生物学中的基因调控 | 人工转录因子(ATF)和蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白酶响应性构象抑制系统(PRCIS) | NA | NA | NA |
354 | 2025-05-21 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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research paper | 该研究开发了一种主动学习方法,用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 采用主动学习策略,结合合成生物学和不确定性采样,生成多轮信息性训练数据,以训练能够区分功能相反的相同序列CRX位点的模型 | 模型主要针对CRX结合位点,可能不适用于其他转录因子的调控元件 | 开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型,以更好地理解转录因子在不同上下文中的激活或抑制功能 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | machine learning | NA | active learning, massively parallel reporter assays | deep learning | genomic sequences | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 |
355 | 2025-05-21 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
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review | 本文综述了非传统酵母在合成生物学应用中的最新进展,重点关注新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程的发展 | 利用合成生物学技术开发新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程,以充分挖掘非传统酵母的生物技术潜力 | 非传统酵母的潜力尚未被充分探索,存在技术挑战和应用限制 | 探讨非传统酵母在生物技术中的应用潜力及其在可持续生物制造中的角色 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢途径工程 | NA | NA | NA |
356 | 2025-05-20 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声遗传学在合成生物学中的最新进展及其作为非侵入性精确控制细胞和分子过程工具的潜力 | 结合超声波与基因工程效应器,克服了组织穿透性和侵入性的限制,扩展了超声在生物系统中的应用 | 参数标准化和基础机制理解方面的挑战 | 探讨超声遗传学在研究和治疗应用中的潜力 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 超声波、基因工程、声学造影剂(如微泡和气体囊泡) | NA | NA | NA |
357 | 2025-05-20 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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研究论文 | 介绍了一种名为'基因组签名'的生物化学稳定且防篡改的DNA标记系统,用于创建自我认证的基因组 | 利用Golomb-ruler衍生的Genome-Comb技术,显著提高了错误纠正和数据编码能力,能够在活体大肠杆菌中记录450万核苷酸的基因组 | NA | 提高合成基因组材料的真实性和完整性,以促进科学知识的进步和生物安全性的增强 | 大肠杆菌的基因组 | 合成生物学 | NA | Genome Signature技术 | NA | DNA序列数据 | 450万核苷酸的基因组 |
358 | 2025-05-20 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
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研究论文 | 通过组合代谢工程改造Yarrowia lipolytica,实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 通过整合LPPS和SCS基因、优化蛋白融合与多拷贝基因整合、增强GGPP前体供应及调控甲羟戊酸途径,显著提高了sclareol产量 | 研究仅在摇瓶条件下进行,未涉及大规模发酵验证 | 开发可持续的sclareol微生物合成方法 | Yarrowia lipolytica酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因整合与过表达 | NA | NA | NA |
359 | 2025-05-20 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-May-16, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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研究论文 | 本文综述了迷幻药物生物合成途径工程的最新进展 | 总结了在真核和原核生产宿主中合成迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了一系列相关的生物合成酶 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 迷幻化合物(如色胺类、麦角类和苯乙胺类) | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
360 | 2025-05-20 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑料球群落和浮游动物的影响,并探讨了基于自然群落水平的新型修复策略 | 提出了基于塑料球群落和浮游动物适应性响应的新型修复策略,并探讨了纳米技术等创新方法在微塑料去除中的应用 | 需要进一步研究以开发更先进的微塑料处理技术,并深入了解微塑料对海洋生态系统的毒性影响 | 探讨微塑料污染对环境和生物的影响,并提出修复策略 | 微塑料、塑料球群落、浮游动物、海洋生态系统 | 环境科学 | NA | DNA meta-barcoding、膜生物反应器、合成生物学、有机硅烷技术、生物膜介导修复、纳米材料技术 | NA | 文献数据 | NA |