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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-11-20 |
Engineering Bacteria as Living Therapeutics in Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507820
PMID:40878391
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术改造细菌作为活体疗法在癌症治疗中的应用 | 将工程化细菌重新定位为能够靶向肿瘤、调节肿瘤微环境和释放抗癌药物的活体治疗剂 | NA | 探讨工程细菌在癌症治疗中的潜力和挑战 | 工程化细菌作为活体治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤微环境调节和抗癌药物释放的遗传回路 | 医学 |
| 362 | 2025-11-19 |
In silico evolutionary origin, structural properties, molecular docking, following expression analysis of the nitrate transporters in maize to explore their roles in abiotic stress tolerance
2025-Nov, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01669-0
PMID:41245216
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究玉米硝酸盐转运蛋白的进化起源、结构特性及其在非生物胁迫耐受中的作用 | 首次系统分析玉米硝酸盐转运蛋白的进化起源、结构特性,并通过分子对接和表达分析揭示其在热胁迫、盐胁迫和干旱胁迫中的功能 | 研究主要基于生物信息学预测,实验验证相对有限,需要更多功能验证实验 | 探索玉米硝酸盐转运蛋白在养分平衡、氮积累和非生物胁迫耐受中的关键作用 | 玉米硝酸盐转运蛋白家族成员 | 生物信息学 | NA | 系统发育分析、分子对接、qRT-PCR、RNA-Seq、亚细胞定位 | NA | 基因组数据、表达数据、蛋白质结构数据 | 83个转运蛋白 | GFP标记、合成生物学方法 | 玉米 | 基于NRT的遗传回路,用于改善氮吸收、转运、动员和积累 | 农业 |
| 363 | 2025-11-19 |
Reprogramming encapsulins into modular carbon-fixing nanocompartments
2025-Oct-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65307-9
PMID:41168233
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于封装蛋白纳米隔室的模块化固碳系统,为在C3作物中引入二氧化碳浓缩机制提供了新方法 | 利用来自嗜热拟杆菌的封装蛋白纳米隔室,通过融合短肽实现多种Rubisco同工型的靶向封装,建立了植物兼容的合成羧酶体模拟系统 | 碳酸酐酶尚未整合到系统中 | 开发模块化固碳纳米隔室系统以增强作物光合效率 | 封装蛋白纳米隔室和Rubisco酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、纳米隔室技术 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质融合技术 | 嗜热拟杆菌 | 固碳纳米隔室系统、合成羧酶体模拟 | 农业 |
| 364 | 2025-11-18 |
Harnessing CRISPR-Cas9 for Lactobacillus improvement in silage production: current knowledge and future perspectives
2025-Nov-15, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01282-x
PMID:41239469
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综述 | 系统回顾CRISPR-Cas9基因编辑技术在乳酸杆菌改良及其在青贮饲料生产中应用的现状与前景 | 首次系统探讨如何利用CRISPR-Cas9技术定向优化乳酸杆菌特性以开发新一代青贮微生物接种剂 | 主要基于现有研究进展进行综述,缺乏实际工程化应用的详细验证数据 | 探讨合成生物学技术在青贮饲料乳酸杆菌改良中的应用潜力 | 乳酸杆菌及其在青贮发酵中的功能特性 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 365 | 2025-11-18 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2025-Nov-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
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综述 | 系统探讨血红蛋白的微生物合成策略、功能定制化修饰方法及其多领域应用前景 | 重点介绍利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰,以及整合帕累托最优和迭代生物工程框架等先进技术 | NA | 解决血红蛋白微生物合成的关键挑战并拓展其应用领域 | 血红蛋白及其突变体和衍生物 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 366 | 2025-11-18 |
Recent advances and perspectives in biosynthesis of paclitaxel: key enzymes and intermediates
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148049
PMID:41043740
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综述 | 本文综述了紫杉醇生物合成的最新进展,重点关注关键酶和中间体的研究 | 强调合成生物学策略在紫杉醇关键中间体生物合成中的新兴趋势 | NA | 探索紫杉醇的可持续生产策略以满足市场需求 | 紫杉醇生物合成途径中的关键酶和中间体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、微生物发酵技术、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 紫杉醇生物合成途径 | 医药 |
| 367 | 2025-11-18 |
Innovative approaches in bioremediation: the role of halophilic microorganisms in mitigating hydrocarbons, toxic metals, and microplastics in hypersaline environments
2025-Aug-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02817-7
PMID:40804729
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综述 | 本文综述了嗜盐微生物在高盐环境中修复碳氢化合物、有毒金属和微塑料污染的作用及生物技术应用 | 系统探讨了工程化嗜盐微生物在极端环境生物修复中的创新应用,结合基因编辑和合成生物学技术提升污染物降解效率 | 存在基因工程菌株优化难度大、生物安全性保障不足、微生物生态理解不深以及规模化应用成本较高等挑战 | 研究嗜盐微生物在高盐环境污染物生物修复中的应用潜力 | 嗜盐和耐盐微生物及其在高盐环境中的生物修复功能 | 环境生物技术 | NA | 基因编辑、重组DNA技术、组学方法 | NA | NA | NA | 基因编辑, 重组DNA | 嗜盐微生物 | 污染物降解代谢通路 | 环境 |
| 368 | 2025-11-17 |
Synthetic peptide vaccines targeting SVA elicit robust protective immune responses in swine
2025-Dec, Veterinary microbiology
IF:2.4Q1
DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110763
PMID:41106188
|
研究论文 | 本研究基于合成生物学原理设计合成针对塞内卡病毒A(SVA)的合成肽疫苗,并在猪体内验证其免疫保护效果 | 首次基于SVA衣壳蛋白VP2的B细胞中和表位和荨麻疹病毒F蛋白的辅助T细胞表位设计合成肽疫苗,并筛选出最佳佐剂组合 | 研究样本量有限,未进行大规模田间试验验证疫苗的长期保护效果 | 开发安全有效的塞内卡病毒A(SVA)合成肽疫苗 | 小鼠和猪的免疫反应及保护效果 | 合成生物学 | 猪水疱病 | 固相肽合成(SPPS) | NA | 免疫学数据 | 小鼠和猪的免疫实验样本 | NA | 小鼠,猪 | 基于B细胞中和表位和T细胞表位的合成肽设计 | 兽医学 |
| 369 | 2025-11-17 |
In Vivo and In Vitro Mechanisms of Equol Synthesis and Key Influencing Factors: A Critical Review
2025-Oct-31, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213449
PMID:41228520
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综述 | 本文系统综述了雌马酚的体内外合成机制、关键影响因素及其潜在分子机制 | 重点探讨了基于合成生物学和基因编辑技术的雌马酚高效体外合成突破路径 | 传统合成技术存在效率低、副产物生成和环境问题等限制因素 | 阐明雌马酚的合成机制及影响因素,推动其高效合成技术发展 | 雌马酚(S-雌马酚和R-雌马酚)及其合成微生物 | 合成生物学 | 更年期症状、衰老、心血管疾病 | 合成生物学、基因编辑技术 | NA | NA | NA | 基因编辑 | 肠道细菌 | NA | 医药 |
| 370 | 2025-11-16 |
M3Site: multiclass multimodal learning for protein active site identification and classification
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf590
PMID:41222559
|
研究论文 | 提出一种多模态多类别学习框架M3Site,用于蛋白质活性位点的识别与分类 | 整合蛋白质序列嵌入、结构图表示和功能文本注释进行残基级多类别活性位点预测,采用功能感知交叉注意力模块和自适应加权融合机制 | NA | 开发更准确的蛋白质活性位点识别与分类方法 | 蛋白质活性位点 | 生物信息学 | NA | 蛋白质语言模型、等变图神经网络、生物医学语言模型 | 多模态深度学习框架 | 蛋白质序列、结构图、功能文本注释 | 25,883个蛋白质(来自UniProt和AlphaFold2) | NA | NA | NA | 药物设计、合成生物学 |
| 371 | 2025-11-16 |
Precision therapeutics for inflammatory bowel disease using engineered probiotics: Strategies and optimization
2025-Nov, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.012
PMID:41083038
|
综述 | 本文总结了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的研究进展,包括底盘菌株基因编辑策略、微生物多维作用、生物工程改造、递送系统优化及人工智能驱动的菌株筛选设计 | 通过基因改造和合成生物学使益生菌具备微环境响应能力和精准治疗靶向性,显著提升IBD治疗效果 | NA | 探索工程化益生菌作为IBD精准治疗策略的开发与应用 | 工程化益生菌及其在炎症性肠病治疗中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 基因编辑、合成生物学、人工智能驱动筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 益生菌底盘菌株 | 微环境响应系统、精准靶向治疗电路 | 医学 |
| 372 | 2025-11-16 |
Harnessing Lactobacillus-derived SCFAs for food and health: Pathways, genes, and functional implications
2025, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100496
PMID:41230178
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综述 | 本文综述了乳酸杆菌产生短链脂肪酸的生物合成能力、代谢工程策略及其在食品与健康领域的应用前景 | 系统评估乳酸杆菌作为短链脂肪酸生产菌的潜力,并整合合成生物学和代谢工程策略提高产量 | 菌株变异性、递送策略和监管障碍限制了临床和食品系统的转化应用 | 探讨乳酸杆菌产生短链脂肪酸的机制及其在健康和食品领域的应用 | 乳酸杆菌及其产生的短链脂肪酸(特别是乙酸盐和乳酸盐) | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、神经免疫疾病 | CRISPR编辑、共培养优化 | NA | NA | NA | CRISPR | 乳酸杆菌 | 基因回路设计 | 食品, 医药 |
| 373 | 2025-11-16 |
Plant synthetic biology: from knowledge to biomolecules
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1562216
PMID:41230228
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综述 | 本文综述植物合成生物学在解决人类健康和农业复杂问题方面的创新方法及其技术基础 | 整合多学科工具系统阐述植物合成生物学从知识到生物分子的转化路径,强调植物系统在表达植物源酶和合成复杂分子方面的独特优势 | 存在转化效率、监管瓶颈和通路稳定性等障碍 | 探讨植物合成生物学作为可持续生物制造和功能生物分子生产的理论基础 | 植物系统及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | DNA合成、可编程基因电路、CRISPR/Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物系统 | 合成电路设计、代谢途径重编程 | 医药, 农业 |
| 374 | 2025-11-15 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
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综述 | 探讨细菌表面展示技术在药物递送领域的重新定位与应用发展 | 提出将计算工具(如AlphaFold)与体外筛选结合以理性设计新一代表面展示平台的技术路线 | 存在监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 研究细菌工程在医学应用中的演进,重点分析表面展示技术实现的药物递送策略 | 革兰氏阴性菌与革兰氏阳性菌的表面展示系统 | 合成生物学 | 癌症 | 细菌表面展示技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌 | 外膜蛋白锚定、分选酶介导锚定、孢子展示系统 | 医学 |
| 375 | 2025-11-15 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired therapies for atopic dermatitis
2025-Nov-13, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
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综述 | 本文综述了针对特应性皮炎皮肤微生物组的各种治疗方法,并展望了利用合成生物学开发工程化活菌治疗产品的未来方向 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为下一代益生菌的治疗策略,能够感知皮肤信号并按需产生治疗物质 | NA | 探索通过调节皮肤微生物组来治疗特应性皮炎的新方法 | 特应性皮炎患者的皮肤微生物组,特别是金黄色葡萄球菌 | 合成生物学 | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 皮肤微生物 | 生物传感器,能够感知皮肤免疫信号和环境因素 | 医学 |
| 376 | 2025-11-15 |
Bacteria-mediated cancer therapy (BMCT): Therapeutic applications, clinical insights, and the microbiome as an emerging hallmark of cancer
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118559
PMID:40967079
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综述 | 探讨微生物群在癌症治疗中的关键作用及工程菌在癌症治疗中的多维度应用 | 提出微生物组作为癌症新兴标志物,系统阐述工程菌与免疫检查点抑制剂的协同机制 | 存在安全性、递送特异性和监管问题等挑战 | 阐明细菌介导癌症疗法(BMCT)的作用机制与临床转化前景 | 共生菌与工程菌(梭菌属、双歧杆菌属、李斯特菌属、沙门氏菌属、大肠杆菌属) | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、精准微生物组工程、粪便微生物群移植 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 377 | 2025-11-15 |
Metabolic engineering of microorganisms for tailor-made biopolymer production: A review
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147922
PMID:41038478
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综述 | 本文综述了通过微生物代谢工程生产定制生物聚合物的最新进展 | 系统比较天然与工程化微生物平台的优缺点,强调代谢工程在开发下一代生物聚合物中的关键作用 | 作为综述文章,未包含原始实验数据 | 提高生物聚合物的产量、质量和功能特性 | 微生物生产的生物聚合物(细菌纤维素、透明质酸、聚羟基脂肪酸酯、聚-γ-谷氨酸等) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学工具(蛋白质组学、基因组学、合成生物学) | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 代谢通路工程 | 食品,医疗,工业生物技术 |
| 378 | 2025-11-15 |
Automated Strain Construction for Biosynthetic Pathway Screening in Yeast
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00554
PMID:41063332
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技术说明 | 开发用于酵母生物合成途径筛选的自动化菌株构建工作流程 | 通过集成化机器人平台实现高通量酵母转化,每周可完成2000次转化,并提供参数定制化用户界面 | NA | 加速合成生物学设计-构建-测试-学习循环中的构建步骤 | 工程化酵母菌株及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 自动化菌株构建、途径筛选 | NA | NA | NA | Hamilton Microlab VANTAGE, Hamilton VENUS | 酵母 | 甾体生物碱生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 379 | 2025-11-15 |
Systematic discovery and engineering of synthetic immune receptors in plants
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx2508
PMID:40906849
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研究论文 | 通过生物信息学和合成生物学方法系统发现并工程化植物中的合成免疫受体SCORE,使其能够感知多种病原体冷休克蛋白肽 | 首次在285种植物中系统表征LRR-RLK-XII受体家族,发现并工程化能够识别多种病原体CSP肽的SCORE受体变体 | 研究主要聚焦于LRR-RLK-XII受体家族,可能未涵盖其他类型的植物免疫受体 | 探索植物免疫受体的多样性并开发工程化免疫受体的策略 | 285种植物中的LRR-RLK-XII受体家族,特别是SCORE受体及其变体 | 合成生物学 | 植物病害 | 生物信息学分析,蛋白质结构预测,合成生物学工程 | NA | 基因组数据,蛋白质序列,结构预测数据 | 285种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物,特别是多年生作物 | 工程化免疫受体,能够检测多种植物病原体CSP肽 | 农业 |
| 380 | 2025-11-14 |
Design principle of successful genome editing applications using CRISPR-based toolkits
2025-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-00979-z
PMID:40591237
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综述 | 探讨基于CRISPR工具包的成功基因组编辑应用设计原则 | 提出整合Cpf1和dCas9的一锅法质粒系统构建策略,并讨论降低脱靶效应的先进方法 | 未提供具体实验验证数据,主要集中于策略性讨论 | 开发微生物宿主中稳健的CRISPR基因编辑系统 | CRISPR-Cas系统及其在微生物宿主中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Cpf1, dCas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 基因编辑系统,一锅法质粒系统 | 工业生物技术 |