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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-05 |
Engineering DNA nanopores: from structural evolution to sensing and transport
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102137
PMID:40761509
|
综述 | 本文回顾DNA纳米孔的结构演变历程,并探讨其在分子传感和跨膜传输中的应用前景 | 首次将DNA纳米孔的结构演进分为三个发展阶段进行系统梳理,并整合了稳定性、可扩展性等关键局限性的分析 | NA | 系统总结DNA纳米孔的技术发展路径,为合成生物学和纳米医学领域的应用提供优化路线图 | DNA纳米孔的结构设计与功能特性 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸术 | NA | NA | NA | DNA折纸术 | NA | 仿生纳米孔、跨膜传输系统 | 合成生物学, 纳米医学 |
| 362 | 2025-10-05 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的发展前景和应用潜力 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,实现植物基因组的精确修饰,并强调人工智能与合成生物学的融合 | 面临监管审批和公众接受的挑战,需要进行严格的多领域测试以确保可重复性 | 通过合成生物学技术解决全球粮食安全挑战,建立更具韧性和可持续的农业系统 | 植物基因组和农业系统 | 合成生物学 | NA | 遗传工程、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光合作用效率优化、固氮途径、抗逆性通路、生物强化代谢途径 | 农业 |
| 363 | 2025-10-05 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文系统探讨了顺式酰基转移酶聚酮合酶的结构特征与理性工程策略 | 聚焦于基于结构机制的模块化构建块选择与催化域设计的多维度工程方法 | 未涉及具体实验验证数据(因属综述类型) | 推动聚酮类化合物的合成生物学应用与天然产物发现 | 顺式酰基转移酶聚酮合酶系统 | 合成生物学 | NA | 酶工程 | NA | 结构生物学数据 | NA | NA | NA | 多模块酶组装线 | 医药 |
| 364 | 2025-10-05 |
[Research progress in the fungal bioluminescence pathway]
2025-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250138
PMID:40769542
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综述 | 本文综述真菌生物发光途径在植物工程中的应用进展及其在生物传感和农业生物技术中的潜力 | 将真菌生物发光途径基因工程改造至植物中创建自发光标本,克服传统报告系统底物限制,并结合机器学习方法优化表型 | NA | 探讨植物真菌生物发光途径工程化应用及其在农业生物技术和环境监测中的创新机会 | 真菌生物发光途径及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、机器学习 | NA | NA | NA | 基因工程 | 植物 | 真菌生物发光途径(催化内源性咖啡酸氧化产生绿色生物发光) | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 365 | 2025-10-05 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
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综述 | 本文综述了红酵母作为食品生物技术底盘细胞的潜力,涵盖多组学研究、细胞工厂构建及食品废弃物增值转化 | 系统评估红酵母作为新型食品生物技术底盘的综合潜力,整合多组学数据与合成生物学工具开发进展 | 红酵母代谢工程面临多组学信息挖掘不足、遗传操作工具效率低下及独特代谢特征认知有限等挑战 | 探索红酵母作为可持续食品生物技术底盘细胞的开发潜力与应用前景 | 红酵母属微生物,特别是用于食品加工废弃物增值转化的菌种 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 红酵母 | 细胞工厂设计,用于生产脂质、类胡萝卜素、酶和糖醇等食品成分 | 食品, 工业生物技术 |
| 366 | 2025-10-05 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
|
研究论文 | 本研究通过挖掘UDP-葡萄糖基转移酶开发大黄酚葡萄糖苷的高效生产策略 | 评估了10种高效的大黄酚UDP-葡萄糖基转移酶,开发了全细胞催化系统实现78.9%的高转化率,并揭示了OsUGT的双位点葡萄糖基化活性 | 丝状真菌中植物源蛋白表达存在挑战,阻碍了进一步优化 | 开发大黄酚葡萄糖苷的高效生物合成方法 | 大黄酚-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄酚-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 序列分析、结构分析、系统发育分析 | NA | NA | 10种UDP-葡萄糖基转移酶 | 合成生物学方法 | 丝状真菌 | 大黄酚葡萄糖苷生物合成途径 | 医药 |
| 367 | 2025-10-05 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
|
综述 | 系统总结植物异戊烯基转移酶的多样性、催化机制及其在异源生产异戊烯化天然产物中的应用 | 首次对160余种植物UbiA型异戊烯基转移酶和代表性异戊烯二磷酸合酶进行系统性总结,涵盖酶工程策略和异源生产应用 | 植物异戊烯基转移酶的功能多样性仍未完全阐明 | 推进植物异戊烯基转移酶的表征与应用,为基于异戊烯化天然产物的药物开发奠定基础 | 植物异戊烯基转移酶和异戊烯二磷酸合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组学、合成生物学、酶工程 | NA | 文献数据 | 超过160种植物UbiA型异戊烯基转移酶及代表性异戊烯二磷酸合酶 | NA | NA | NA | 医药 |
| 368 | 2025-10-05 |
A framework for complex signal processing via synthetic biological operational amplifiers
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62464-9
PMID:40745425
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过合成生物学运算放大器处理复杂生物信号的框架 | 通过整合正交运算放大器到标准化生物过程中,实现了高效信号分解和放大,并设计了可扩展的运算放大器 | NA | 开发能够处理复杂生物信号的合成生物学框架 | 遗传电路和全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | σ/anti-σ对工程、核糖体结合位点强度调节、开环和闭环配置 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 运算放大器、全细胞生物传感器、生长状态响应诱导系统 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 369 | 2025-10-05 |
Codon usage and antibiotic resistance: A hidden evolutionary mechanism
2025-Jul-31, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2025.07.027
PMID:40752602
|
综述 | 探讨密码子使用与抗生素耐药性之间的进化机制及其在病原体适应性中的作用 | 揭示传统上被视为遗传编码沉默特征的密码子使用在抗生素耐药性进化中的关键作用 | NA | 解析密码子使用与抗生素耐药性之间的复杂相互作用机制 | 鲍曼不动杆菌、淋病奈瑟菌和肺炎克雷伯菌等病原体 | 生物信息学 | 细菌感染 | 比较基因组分析、密码子适应指数(CAI)、有效密码子数(ENC)、相对同义密码子使用(RSCU)、生物信息学、机器学习 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | 医学 |
| 370 | 2025-10-05 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
|
综述 | 本文综述了迷幻化合物在真核和原核宿主中的生物合成研究进展 | 系统总结了不同类型迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了具有异源活性的生物合成酶列表 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 吲哚胺类(裸盖菇素、N,N-二甲基色胺等)、麦角碱类(麦角酸)和苯乙胺类(麦司卡林)迷幻化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | NA | 真核生物, 原核生物 | 代谢途径工程 | 医药 |
| 371 | 2025-10-05 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
|
综述 | 探讨微生物发酵作为食物废弃物增值的可持续解决方案,将有机质转化为能源、高价值化合物和生物材料 | 强调合成生物学和代谢工程在提升微生物效率、优化底物利用和扩展工业应用方面的作用,并分析生物精炼整合路径 | NA | 研究通过微生物发酵实现食物废弃物增值的技术路径和挑战 | 食物废弃物及其微生物转化过程 | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 372 | 2025-10-05 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
|
研究论文 | 开发了一种结合工程微生物与可摄入光电胶囊的双向通信系统,用于可控的疾病治疗干预 | 首次建立了生物-光学-电子信号处理链,实现体内工程微生物的实时监测和远程控制 | 目前仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发数字健康监测和可控治疗干预的新方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 光遗传学, 生物发光检测 | NA | 生物发光信号, 无线电信号 | 猪模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 炎症检测生物传感器和抗炎纳米抗体表达系统 | 医学 |
| 373 | 2025-10-05 |
Cholesterol modulates membrane elasticity via unified biophysical laws
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62106-0
PMID:40745155
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研究论文 | 本研究通过核自旋技术和计算分析揭示了胆固醇如何通过统一生物物理定律调节膜弹性 | 发现脂质膜在介观尺度表现出统一的弹性行为,与胆固醇含量、脂质不饱和度或温度无关 | 研究主要关注介观尺度,未涉及分子和宏观尺度的完整验证 | 探索胆固醇调节膜弹性的生物物理机制 | 脂质膜的弹性特性 | 生物物理学 | NA | 核自旋技术、计算分析 | NA | 物理测量数据、计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、材料科学 |
| 374 | 2025-10-05 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 本研究通过实验评估了大肠杆菌中所有独特的Cas9引导RNA功能,揭示了gRNA设计的普遍功能性和设计规则 | 首次系统评估了近50万个独特gRNA在基因组中的活性,推翻了关于非功能性gRNA稀有的假设,并发现了间隔序列自相互作用是导致非功能性的主要原因 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未在其他细菌或真核系统中验证 | 评估Cas9引导RNA在细菌基因组中的实际功能效率并建立gRNA设计规则 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的近500,000个独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | 基因组数据、功能活性数据 | 约500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 375 | 2025-10-05 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 开发了一种通过DNA杂交纯化方法获得具有天然转录后修饰的tRNA,用于增强无细胞翻译系统 | 首次开发了结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法,能够高产率获得保留天然修饰的tRNA,并首次提供了特定tRNA的完整修饰谱 | NA | 解决传统体外转录方法无法获得具有天然修饰tRNA的问题,提高无细胞翻译系统的效率和保真度 | 转移RNA(tRNA)及其转录后修饰 | 合成生物学 | NA | DNA杂交纯化、tRNA过表达、无细胞翻译反应 | NA | 生化分析数据、修饰谱数据 | NA | NA | 大肠杆菌(基于上下文推断) | NA | 工业生物技术、医学研究 |
| 376 | 2025-10-05 |
Genetically programmable wearable devices for precision physiological and molecular monitoring
2025-Aug-04, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/adf25a
PMID:40690926
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综述 | 本文综述了基因编程可穿戴设备在生理和分子监测领域的最新进展与应用前景 | 将基因工程和合成生物学整合到可穿戴平台,创建具有增强特异性、响应性和功能多样性的基因可编程生物界面 | 存在生物安全性问题、生物组件不稳定性以及临床转化障碍等挑战 | 开发用于精准医疗的基因编程可穿戴监测设备 | 可穿戴生物传感器和生物界面 | 生物医学工程 | NA | 基因工程, 合成生物学 | NA | 生物化学标记物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞, 微生物细胞 | 生物传感器, 自调节功能电路 | 医疗, 个性化医疗 |
| 377 | 2025-10-05 |
Revolutionizing Caffeic Acid Production: Advanced Microbial Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches
2025-Aug, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70091
PMID:40757780
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综述 | 本文总结了通过微生物代谢工程和合成生物学方法优化咖啡酸生产的五种策略 | 系统整合了咖啡酸生物合成的五种优化策略:生物合成途径、代谢途径修饰、系统生物学与合成生物学、辅因子工程和模块化共培养 | 微生物底盘生产咖啡酸面临前体供应有限、代谢中间体毒性、辅因子利用效率低和宿主微生物种类单一等瓶颈 | 优化咖啡酸的微生物生产方法 | 咖啡酸及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 咖啡酸生物合成途径、代谢途径修饰 | 医药、食品 |
| 378 | 2025-10-05 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-06, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢产物的三大研究方向:吲哚咔唑和RiPPs的生物合成机制,以及通过微生物相互作用激活隐性次级代谢途径 | 开发了无细胞一锅合成平台用于RiPPs类似物生产,并通过放线菌与含分枝杆菌的共培养策略发现了42种新化合物 | NA | 探索放线菌次级代谢产物的生物合成机制及其在药物发现中的应用潜力 | 放线菌(特别是链霉菌)及其产生的次级代谢产物 | 合成生物学 | 癌症 | 共培养策略、无细胞一锅合成、基因修饰 | NA | NA | NA | NA | 放线菌、链霉菌、含分枝杆菌的细菌 | 隐性生物合成途径激活、肽类天然产物生物合成途径 | 医药 |
| 379 | 2025-10-05 |
Applications and prospects of synthetic receptors for therapeutic protein delivery
2025-Sep, European journal of pharmaceutics and biopharmaceutics : official journal of Arbeitsgemeinschaft fur Pharmazeutische Verfahrenstechnik e.V
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.ejpb.2025.114789
PMID:40553909
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综述 | 本文综述了合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用类型、特征及生物医学前景 | 系统归纳了GPCR受体系统、MESA、synNotch受体和SNIPRs等新型合成受体在蛋白质递送领域的创新应用 | 存在安全性问题、递送效率欠佳以及受体设计与优化复杂等挑战 | 探讨合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用现状与发展前景 | 合成受体及其递送的 therapeutic proteins | 合成生物学 | 肿瘤、炎症性免疫疾病、中枢神经系统疾病、关节病、病毒感染 | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | G蛋白偶联受体系统、模块化胞外传感架构、合成Notch受体、合成膜内蛋白水解受体 | 医学 |
| 380 | 2025-10-05 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 系统总结了合成生物学在植物生物强化中的五大核心策略,并重点介绍了中国研究团队的最新突破 | NA | 通过植物合成生物学方法解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物生物强化策略和技术 | 合成生物学 | 营养缺乏症 | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 内源生物合成基因过表达、异源生物合成途径引入、营养特异性转运蛋白表达、转录调控优化、蛋白质定向进化 | 农业, 食品 |