合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 435 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-01-25 |
Long oligos: direct chemical synthesis of genes with up to 1728 nucleotides
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06958g
PMID:39759933
|
研究论文 | 本文报道了在自动化合成仪上直接合成长达800个核苷酸的绿色荧光蛋白基因和1728个核苷酸的29 DNA聚合酶基因的方法 | 通过在平滑表面而非传统多孔支持物上进行合成，以及使用捕获聚合（CBP）方法从复杂混合物中分离全长寡核苷酸，实现了长寡核苷酸直接化学合成的突破 | NA | 开发一种能够直接化学合成超长寡核苷酸的方法，以应用于合成生物学、基因编辑和蛋白质工程等领域 | 绿色荧光蛋白基因和29 DNA聚合酶基因 | 合成生物学 | NA | 直接化学合成 | NA | NA | NA |
| 362 | 2025-01-25 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii细胞工厂可持续生产(+)-valencene的方法 | 首次在Komagataella phaffii中引入(+)-valencene合成酶，并通过CRISPR/Cas9系统成功构建了(+)-valencene生产菌株，产量提高了82倍 | 研究主要局限于实验室水平的摇瓶培养，未涉及大规模工业化生产 | 开发一种可持续生产(+)-valencene的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii细胞工厂 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统 | NA | NA | NA |
| 363 | 2025-01-24 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-Jan-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
|
研究论文 | 本文研究了利用量子隧穿传输和机器学习技术对八种人工合成的DNA碱基进行电学识别 | 通过将人工合成的DNA碱基嵌入固态纳米间隙结中，结合机器学习模型，实现了高达100%的DNA碱基预测准确率和99.80%的传输读数准确率 | 研究仅限于人工合成的DNA碱基，未涉及天然DNA或其他生物分子 | 探索人工合成DNA碱基的电学识别方法，以推动遗传研究、合成生物学和诊断技术的进步 | 八种人工合成的DNA碱基 | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输 | 机器学习模型 | 电传输数据 | 八种人工合成的DNA碱基 |
| 364 | 2025-01-24 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
|
研究论文 | 本文探讨了在设计的卷曲螺旋肽组装体中肽交换的动态特性，并开发了一种荧光报告检测方法 | 开发了一种简便的荧光报告检测方法，用于研究肽交换，并提出了两种设计策略以提高不同寡聚体的正交性 | 研究主要关注肽交换的动态特性，对其他动态特性的探讨较少 | 研究设计的卷曲螺旋肽组装体中的肽交换动态特性 | 卷曲螺旋肽组装体，包括从二聚体到七聚体的不同寡聚体 | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测 | NA | 实验数据 | NA |
| 365 | 2025-01-23 |
Environment signal dependent biocontainment systems for engineered organisms: Leveraging triggered responses and combinatorial systems
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.12.005
PMID:39830078
|
综述 | 本文评估了环境信号依赖的生物遏制系统在工程生物中的应用，重点是利用触发响应和组合系统来提高安全性 | 本文创新地探讨了如何利用化学、光、温度和pH等环境信号设计生物遏制系统，并强调组合生物遏制系统的重要性 | 本文主要基于理论分析和案例研究，缺乏实验验证和大规模应用的数据支持 | 评估环境信号依赖的生物遏制系统在工程生物中的应用，以提高生物安全性 | 基因工程生物（GEOs）及其生物遏制系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2025-01-23 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
|
研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在Chlamydomonas reinhardtii中实现了外源基因表达的快速、稳定和可逆调控 | 首次在微藻中应用DD/Shield-1系统，展示了其作为分子开关的潜力，并成功构建了基因编辑蛋白LbCas12a的诱导表达菌株 | 研究中未提及该系统在其他微藻或更广泛生物系统中的适用性 | 开发一种在Chlamydomonas reinhardtii中调控外源基因表达的新方法 | Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统 | NA | NA | NA |
| 367 | 2025-01-23 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-Jan-21, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
|
综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展和前景，包括用于生产燃料、化学品、蛋白质和肽的酵母菌株的开发，以及合成生物学工具和数学建模的进展 | 本文强调了合成生物学和代谢模型在加速代谢工程设计-构建-测试-学习周期中的重要作用，展示了酵母菌株在复杂表型开发中的潜力 | 本文主要关注酵母代谢工程，未涉及其他微生物细胞工厂的应用和比较 | 探讨酵母作为工业生物技术平台细胞工厂的代谢工程进展 | 酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具和数学建模 | NA | NA | NA |
| 368 | 2025-01-23 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
|
研究论文 | 本文讨论了在合成细胞中从头构建机械敏感信号通路的最新进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中，创建新的机械敏感信号通路 | NA | 研究机械转导的机制，并开发新的生物技术应用 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2025-01-23 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
|
review | 本文回顾了自1961年Jacob和Monod描述操纵子以来，基于转录因子的生物传感器的发展历程，并探讨了其未来的前景和挑战 | 分析了从1960年代到2000年代的基础研究里程碑以及2000年代以后的工程策略，提供了对未来视角的深入见解 | 尽管取得了许多进展，但仍有许多障碍需要克服，以充分发挥生物传感器技术的潜力 | 回顾和总结基于转录因子的生物传感器的发展历程，并探讨其未来的应用前景 | 基于转录因子的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA |
| 370 | 2025-01-23 |
Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00551
PMID:39754601
|
研究论文 | 本文通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境，探索了遗传开关的设计空间，并展示了如何通过结合这两种调制方法来微调开关特性 | 首次系统地探索了宿主环境和核糖体结合位点调制在遗传开关设计中的联合应用，揭示了宿主环境对性能的显著影响 | 研究仅涉及九种核糖体结合位点组成和三种宿主环境，可能未涵盖所有可能的组合 | 探索遗传开关的设计空间，以优化其性能特性 | 遗传开关的27种变体 | 合成生物学 | NA | 核糖体结合位点调制和宿主环境变化 | NA | 遗传开关输出和宿主生长动态数据 | 27种电路变体 |
| 371 | 2025-01-23 |
ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00697
PMID:39754602
|
研究论文 | 本研究扩展了PURE系统，通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统，实现了从丙酮酸再生ATP | 提出了一种新的ATP再生途径，能够独立或与现有的肌酸基系统结合使用，显著提高了蛋白质合成效率 | 需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液（约10 mM），这可能会在某些应用中受到限制 | 工程化PURE系统，以增强其在无细胞合成生物学和合成细胞构建中的应用 | PURE系统及其ATP再生途径 | 合成生物学 | NA | ATP再生系统 | NA | NA | 多个批次的自制PURE系统和商业系统（如PURExpress） |
| 372 | 2025-01-23 |
Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00618
PMID:39757539
|
研究论文 | 本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统，用于延长PURE无细胞系统中的蛋白质合成反应寿命和提高产量 | 使用易于组装的商业组件构建中尺度透析系统，实现了PURE系统中蛋白质合成的长期稳定性和高产率 | 需要定期更换喂养溶液，且系统依赖于商业组件，可能限制了其广泛应用 | 延长PURE无细胞系统中的蛋白质合成反应寿命和提高产量 | PURE无细胞系统 | 合成生物学 | NA | 透析技术 | NA | NA | NA |
| 373 | 2025-01-23 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用平行生物反应器快速绘制特定产物形成速率、特定底物利用速率和特定生长速率之间生长耦合关系的方法，并以甲羟戊酸为例进行了研究 | 使用平行生物反应器快速评估生产力和生长速率与产物收率系数之间的生长耦合关系，并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究中形成的乙酸盐可能会减缓生长并在下游处理中引起问题 | 研究生物制造的经济可行性，特别是通过工程微生物从可再生原料生产化合物 | 甲羟戊酸的生产 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 实验数据 | 使用大肠杆菌BW25113进行实验 |
| 374 | 2025-01-22 |
A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates
2025-Jan-21, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13838
PMID:39835880
|
研究论文 | 本文介绍了一种合成生物学方法，通过在大肠杆菌中建立的重构系统，识别负责从特定蛋白质底物上去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶 | 利用合成生物学方法在大肠杆菌中建立重构系统，用于识别植物SUMO化酶 | NA | 识别负责去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶 | 植物泛素样蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 375 | 2025-01-22 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Jan-15, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为hDIRECT的平台，用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性，以支持基于细胞的疗法 | 开发了hDIRECT平台，利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂来控制细胞因子的活性，实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用 | 研究仍处于概念验证阶段，尚未进行大规模临床试验 | 开发一种能够控制细胞因子活性的平台，以支持基于细胞的疗法 | 细胞因子（IL-2、IL-6和IL-10）及其活性控制 | 合成生物学 | 癌症免疫疗法 | 人类蛋白酶及其抑制剂的使用 | NA | 蛋白质数据 | NA |
| 376 | 2025-01-22 |
Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400712
PMID:39834096
|
研究论文 | 本文主要探讨了在酿酒酵母中异源表达萜类化合物的方法，以提高其大规模生产的效率 | 利用合成生物学和代谢工程技术，构建高效的微生物细胞工厂，通过细胞微区室、关键P450酶的高效表达策略以及宿主代谢的调控和优化来增强萜类化合物的合成 | 当前仍面临一些挑战，需要进一步优化酵母底盘以提高萜类化合物的生产效率 | 提高萜类化合物的大规模生产效率 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 377 | 2025-01-21 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
|
研究论文 | 本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于可编程基因表达 | 通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合，进化出高活性变体，显著提高了蛋白质表达水平 | 未提及具体局限性 | 开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统，提高合成生物学应用的多样性和效率 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化技术 | NA | NA | NA |
| 378 | 2025-01-20 |
Liquid-liquid phase separation in microorganisms: Insights into existence, functions, and applications
2025-Mar, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.128026
PMID:39705832
|
综述 | 本文综述了微生物中液-液相分离（LLPS）的存在、功能及其应用，探讨了LLPS在微生物中的形成和调控机制 | 本文首次系统整合了微生物中LLPS的研究成果，强调了LLPS在环境适应、应激响应和细胞过程中的作用，并提出了LLPS作为合成生物学和病原微生物治疗干预的潜在靶点 | 目前对微生物中LLPS的分子调控机制了解仍有限，且相关研究技术存在挑战，需要进一步研究以揭示详细的分子机制并开发新的应用 | 探讨微生物中液-液相分离的形成、调控机制及其在环境适应和细胞过程中的作用 | 微生物中的液-液相分离现象 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2025-01-20 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jan-17, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
|
综述 | 本文探讨了微生物次级代谢物在微生物过程和关系中的关键作用，以及其在人类健康和农业等经济领域中的价值 | 基因组测序的进展揭示了次级代谢物的生物合成潜力，新的预测工具和分子生物学技术加速了新代谢物的发现 | NA | 加速微生物次级代谢物的发现及其应用 | 微生物次级代谢物及其生物合成基因簇（BGCs） | 生物技术 | NA | 基因组测序、细胞和无细胞表达技术、代谢物检测和鉴定技术 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
| 380 | 2025-01-19 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
|
研究论文 | 本文介绍了BioTRY，一个包含超过5,000种生物化学品和3,800种菌株的综合知识库，旨在评估发酵过程的经济可行性 | BioTRY是首个提供生物合成TRY（滴度、速率和产量）数据的数据库，这些数据来自原始研究 | NA | 评估发酵过程的经济可行性，帮助研究人员和决策者了解生物合成的当前发展状态 | 生物化学品和菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物化学数据 | 超过5,000种生物化学品和3,800种菌株，以及52,000个TRY条目 |