合成生物学相关文章
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当前共找到 1530 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 362 | 2026-02-25 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 本文提出了一种名为Toehold-VISTA的机器学习框架，用于快速设计高性能RNA传感器，并成功应用于针对SARS-CoV-2 RNA的传感器设计 | 结合生物物理建模与机器学习（PLS-DA框架），通过高通量实验数据训练预测模型，实现了对RNA传感器性能关键决定因素的捕捉与优化设计 | NA | 加速RNA传感器的设计与工程化，解决传统设计方法耗时长的挑战 | RNA传感器（以toehold switches为模型）与靶标RNA（如SARS-CoV-2 RNA）的相互作用 | 机器学习 | NA | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、生物物理建模 | PLS-DA（偏最小二乘判别分析） | RNA序列与结构数据 | NA | NA | NA | RNA传感器（toehold switches） | 生物技术、诊断应用 |
| 363 | 2026-02-24 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子，系统表征了Komagataella phaffii中Mxr1转录因子的九个氨基酸反式激活结构域（9aaTADs）的功能与机制 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面鉴定21个推测的9aaTADs，发现其中10个具有功能，并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制激活转录 | 研究主要基于Δmxr1突变株的体外功能验证，体内生理环境下的调控网络及与其他转录因子的相互作用尚未完全阐明 | 探究K. phaffii中Mxr1转录因子的9aaTADs结构域的功能特性与分子机制 | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母）的Mxr1转录因子及其9aaTADs结构域 | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除株功能互补、靶基因转录激活分析 | NA | 分子生物学实验数据 | 21个推测的9aaTADs结构域（包括TAD A-V） | 合成生物学设计（合成转录因子构建） | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母） | 由Mxr1ZF DNA结合域与串联9aaTADs组成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 364 | 2026-02-22 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
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综述 | 本文综述了通过相分离驱动的合成生物分子凝聚体（SBMCs）的最新进展，包括其构建原理、调控方法以及在基础与应用研究中的潜力 | 利用合成生物学方法从头合成生物分子凝聚体，并系统阐述其内在构建原理、调控方法及在染色体结构、疾病机制、生物制造等领域的应用 | 对生物分子凝聚体的内部组织和外部调控机制的理解仍处于早期阶段，未来在生物材料、生物技术和生物医学领域仍面临机遇与挑战 | 探讨合成生物分子凝聚体的构建方法、调控机制及其在基础科学与应用研究中的潜力 | 合成生物分子凝聚体（SBMCs） | 合成生物学 | 肿瘤发生、衰老 | 相分离、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物材料、生物技术、生物医学、药物递送、人工细胞设计、生物制造 |
| 365 | 2026-02-19 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能，并首次在拟南芥中验证了该模块的调控机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制，并利用异源表达策略验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证，尚未在小麦本物种中完成完整功能验证 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制，开发增强作物耐冷性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号（Dn1）及转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | NA | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS和MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化指标数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥植株（具体数量未明确说明） | 转基因技术 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | tae-miR164-TaNAC6A基因调控模块 | 农业 |
| 366 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属（类）抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制，并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 367 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合，用于生物通路预测分析，特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中，以模拟人类思维过程并增强决策，为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大，整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识，以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型，促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |
| 368 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
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综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略，重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性，并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用，以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母（酿酒酵母） | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 369 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq，利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需，仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶，并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序（NGS）、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 370 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
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综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展，重点探讨了其与宿主（细菌和真核细胞）的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证，且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主（包括哺乳动物组织）的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌（噬菌体天然宿主）、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 371 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统，以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂，用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境，并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台，以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性，并推动临床转化 | 工程化微生物系统（如大肠杆菌Nissle 1917）及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据（389篇同行评审研究） | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路，用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 372 | 2026-02-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，创建了具有可定制拷贝数的质粒，并利用合成RNA调控器实现独立拷贝控制，展示了合成复制起点（SynORI）的模块化工程应用 | 开发了合成复制起点（SynORI）技术，实现了质粒拷贝数的可定制化、兼容性和模块化调控，并创建了正交质粒库 | NA | 研究合成生物学中质粒复制起点的工程化改造，以提高其可调性、兼容性和模块化 | 质粒的复制起点和合成RNA调控器 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控器技术 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | 大肠杆菌 | 合成复制起点（SynORI）和正交质粒库，用于实现可调拷贝数控制和环境信号的多重报告 | 工业生物技术 |
| 373 | 2026-02-10 |
Harnessing semiochemicals for parasitoid-based biological control: from laboratory identification to field applications
2025-Nov-30, Crop health
DOI:10.1007/s44297-025-00061-4
PMID:41649713
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综述 | 本文综述了信息化学物质在调控寄生蜂行为中的作用，评估了行为操纵方法，并探讨了合成生物学与信息化学物质结合在可持续害虫管理中的潜力和局限性 | 通过合成生物学手段，利用植物和酵母的遗传与代谢工程释放关键信息化学物质，以操纵寄生蜂行为，这是生物防治领域的前沿创新点 | 合成生物学与信息化学物质结合的应用仍处于探索阶段，存在技术实施复杂性和生态安全性等潜在限制 | 研究信息化学物质在寄生蜂行为调控中的作用，并探索通过合成生物学手段增强生物防治效果的可持续害虫管理策略 | 寄生蜂（如Campoletis chlorideae）及其相关的信息化学物质（如性信息素、植物源协同素和寄主源利他素） | 农业生物技术 | NA | 气相色谱-触角电位检测（GC-EAD）、异位表达系统、遗传工程、代谢工程 | NA | 化学数据、行为数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 酵母 | 生物传感器、代谢途径 | 农业 |
| 374 | 2026-02-08 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，并训练机器学习模型预测基因回路行为 | 结合长读长和短读长NGS技术，首次实现对多kb长度基因回路设计（>10^5种）的并行定量评估，建立了“组成-功能”映射关系 | NA | 加速合成生物学中基因回路的设计与优化，建立数据驱动的复杂遗传系统设计方法 | 包含多种遗传元件组合的基因回路设计（5-20 kb长度） | 合成生物学 | NA | 长读长与短读长下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 单次实验可测量超过10^5种基因回路设计 | NA | 人类细胞 | 基因回路（包含多种遗传元件组合） | 工业生物技术 |
| 375 | 2026-02-08 |
Advances in promoter engineering strategies for enhanced recombinant protein expression in plants
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1747353
PMID:41635682
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综述 | 本文综述了针对植物系统、旨在增强重组蛋白表达的启动子工程策略的最新进展 | 重点介绍了利用CRISPR转录控制、高通量筛选和机器学习辅助启动子设计等新兴合成生物学工具，创建适用于复杂多基因表达的可调、正交启动子 | NA | 推进植物分子农业，扩展植物作为高价值重组蛋白多功能生物工厂的作用 | 用于植物系统的启动子（天然、合成、杂交、诱导型和组织特异性启动子） | 合成生物学 | NA | CRISPR转录控制，高通量筛选，机器学习辅助启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR | 植物，植物细胞培养物 | NA | 医药，工业生物技术，农业 |
| 376 | 2026-02-08 |
Engineered probiotics for inflammatory bowel disease therapy: mechanisms, delivery strategies, and precision medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1696524
PMID:41640410
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的应用，包括其作用机制、递送策略和精准医学前景 | 聚焦于工程化益生菌的设计，以克服传统益生菌在胃肠道环境中的存活、定植和靶向性不足等限制，并探讨了基于个体肠道微生物组谱的个性化干预 | 工程化益生菌在长期安全性、稳定性以及治疗反应准确预测方面仍面临关键挑战 | 探索工程化益生菌作为炎症性肠病治疗的新型替代方案 | 炎症性肠病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病 | NA | 炎症性肠病 | 基因工程、合成生物学、先进封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 377 | 2026-02-07 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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研究论文 | 本研究通过阐明NADPH依赖酶的电子转移机制，系统性地工程化酿酒酵母的电子转移过程，以高效生产胆固醇和孕烯醇酮 | 首次系统性地工程化电子转移链，包括DHCR7和P450酶的电子转移残基、电子转移组件以及NADPH再生途径，显著缩短并稳定电子转移链 | NA | 提高类固醇的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子转移工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 代谢途径工程，包括电子转移链和NADPH再生途径 | 医药，工业生物技术 |
| 378 | 2026-02-06 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
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综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、作用机制及生物技术进展，重点讨论了其作为精神健康治疗候选药物的前景以及通过微生物平台实现规模化生产的生物技术策略 | 整合了裸盖菇素的临床研究、作用机制和生物技术生产进展，强调了利用工程化微生物（如酿酒酵母、构巢曲霉和大肠杆菌）进行异源表达以提高产量（达2000 mg/L）的创新方法 | NA | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力、作用机制及通过生物技术实现可持续规模化生产的途径 | 裸盖菇素（一种来自裸盖菇属蘑菇的色胺衍生生物碱）及其生物合成 | NA | 精神健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 379 | 2026-02-06 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
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综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、靶向甲基化或去甲基化的主要技术，以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 系统总结了利用融合蛋白（如锌指蛋白、TALE或CRISPR/dCas9与甲基化酶结合）实现靶向甲基化的新兴技术，并展望了通过鉴定更多细菌甲基化酶特性来开发新工具的潜力 | NA | 探讨细菌DNA甲基化酶作为分子和合成生物学工具的最新发展与应用 | 细菌DNA甲基化酶及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 靶向甲基化技术、DNA组装技术 | NA | NA | NA | CRISPR/dCas9, TALEN, 锌指蛋白 | 细菌, 作物植物 | NA | 遗传工程, 细菌学, 生物技术, 农业 |
| 380 | 2026-02-06 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶以开发整合生物加工（CBP）酵母菌株的当前策略与进展，并探讨了利用合成生物学工具优化菌株的工业应用前景 | 系统总结了通过理性菌株设计和现代合成生物学工具优化CBP酵母的策略，并指出组学策略对未来菌株开发的指导作用 | 目前报道的一步法纤维素底物转化乙醇的滴度和产率远低于工业要求，CBP尚未实现工业化规模应用 | 开发能够高效利用纤维素、实现整合生物加工的酵母菌株，用于将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其工程化菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具、组学策略（omics strategies）、理性菌株设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 纤维素酶表达系统、核心纤维素酶组合表达、分泌途径优化 | 能源、工业生物技术 |