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当前共找到 1530 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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| 21 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2026-09-18 |
A comprehensive review of genomic-scale genetic engineering as a strategy to improve bacterial productivity
2025-11, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001628
PMID:41182907
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综述 | 本文综述了细菌基因组工程工具从随机诱变到CRISPR/Cas等精准多重编辑策略的演进，及其在提升细菌生产力中的应用。 | 针对该领域缺乏统一概述的问题，整合历史里程碑与实际应用，提供基因组工程工具演进与前景的全面视角。 | 未提及具体实验验证或数据，属于文献综述，缺乏原始实验数据支持。 | 总结基因组规模遗传工程工具在细菌中的发展历程与应用，以提升细菌生产力。 | 细菌基因组工程工具及其在细菌生产中的应用。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术 |
| 23 | 2026-09-18 |
From Nano to Quantum: Ethics Through a Lens of Continuity
2025-10-13, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-025-00557-w
PMID:41082020
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研究论文 | 本文通过连续性视角，借鉴纳米技术伦理讨论的经验教训，分析和指导量子技术伦理话语的塑造 | 提出使用连续性视角，将纳米伦理讨论中的关键特征作为分析工具，用于评估和分析新兴的量子技术伦理话语，避免重复过去的错误 | 文章主要基于理论分析和文献回顾，缺乏实证数据支持，且未提供具体的量子技术伦理框架或操作指南 | 探讨如何借鉴纳米技术伦理讨论的经验，指导量子技术伦理和负责任创新的早期话语发展 | 纳米技术和量子技术的伦理讨论话语 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 24 | 2026-09-18 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 该文提出foldtuning方法，利用蛋白质语言模型生成远离天然序列的蛋白质变体，构建了覆盖700多个天然折叠的模型库，并通过实验验证了三个不同折叠靶标的稳定性与功能。 | 提出foldtuning方法，将蛋白质语言模型重新定义为探索蛋白质“深空”区域的探针，通过生成和自反馈机制，在强制核心结构约束下，探索与天然示例同源性极低或没有可检测同源性的序列空间，并构建了覆盖700多个天然折叠的模型库。 | 摘要中未明确提及研究局限性，可能包括实验验证仅针对三个折叠靶标，且对生成蛋白的功能验证范围有限。 | 探索蛋白质序列-结构映射中未被探索的区域，超越定向进化等金标准实验方法的限制，研究远离天然序列的蛋白质序列空间。 | 蛋白质序列-结构映射、蛋白质语言模型、SCOP数据库中的700多个天然折叠，包括GPCR、小GTP酶、细胞表面受体、DNA结合域、信号/调节域等。 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型、foldtuning、生成与自反馈 | 蛋白质语言模型 | 蛋白质序列与结构数据 | 覆盖SCOP数据库中超过700个天然折叠，实验验证了三个折叠靶标：SH3结构域、barnase抑制剂barstar和胰岛素 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 25 | 2026-09-18 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 本文介绍了STRAIGHT-IN Dual平台，能够在一周内以100%效率同时将两个DNA有效载荷单拷贝整合到人类诱导多能干细胞中 | 实现了双DNA有效载荷的同时、等位基因特异性、单拷贝整合，效率达到100%，且在一周内完成；利用STRAIGHT-IN平台实现近乎无疤痕的货物整合，便于组件回收利用；设计了grazoprevir诱导的synZiFTR系统，可与四环素诱导系统互补，在同一细胞内独立、可调、时序控制不同转录因子的表达 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种高效、快速的双DNA有效载荷和基因电路整合平台，用于人类诱导多能干细胞的精确基因工程 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 合成生物学 | NA | STRAIGHT-IN Dual平台、synZiFTR系统 | NA | NA | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人类诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导的synZiFTR系统 | 医学、工业生物技术 |
| 26 | 2026-09-18 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究在微藻中开发了一种利用GP1糖蛋白的PPSPX基序将蛋白质锚定在细胞壁上，并通过pH敏感内含肽实现可控释放的双系统 | 首次鉴定出GP1糖蛋白中的PPSPX基序是细胞壁锚定的关键信号，并创新性地结合pH敏感内含肽实现了蛋白质的时空可控释放 | 摘要中未明确说明该系统的局限性 | 开发一种在微藻中实现蛋白质细胞壁锚定和可控释放的双系统，以优化蛋白质定位和环境触发释放 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统，包括GP1糖蛋白、PHL7塑料降解酶、mCherry荧光蛋白和RecA来源的pH敏感内含肽 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学分析、Western blot分析 | NA | 蛋白质表达与释放数据、荧光数据、Western blot图像 | NA | 内含肽介导的蛋白质剪接 | 微藻 | GP1-PPSPX锚定系统与pH敏感内含肽切割释放系统组合 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 27 | 2026-09-16 |
Turbo-charging crop improvement: harnessing multiplex editing for polygenic trait engineering and beyond
2025-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70527
PMID:41092254
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综述 | 本文综述了多重CRISPR编辑技术在作物改良中的应用，涵盖多基因性状工程、基因家族功能解析、染色体工程及无转基因编辑等方面，并讨论了载体结构创新、高通量测序检测及计算工作流程等最新进展 | 系统整合了多重CRISPR编辑在作物改良中的前沿应用，包括表观遗传调控、转录调控、染色体工程及无转基因编辑；强调了启动子和支架工程等载体结构创新对编辑效率的提升；指出长读长测序技术可解析标准基因分型常遗漏的结构重排；提出对用户友好、合成生物学兼容的可扩展计算工作流程的迫切需求 | 多重编辑仍面临技术挑战，包括复杂的构建体设计和对稳健、可扩展突变检测的需求；缺乏实验验证的诱导型或组织特异性启动子以实现时空精准调控；针对重复或串联间隔位点时结构重排常被标准基因分型遗漏；多倍体、未驯化野生近缘种和长世代物种的编辑难度较大 | 探讨多重CRISPR编辑技术在作物改良中的应用潜力，总结当前工具包和最新创新，分析技术挑战，并展望其作为下一代作物改良基础技术的发展方向，以应对农业、可持续性和气候韧性方面的挑战 | 作物基因组，包括一年生物种、多倍体、未驯化野生近缘种和长世代物种 | 农业基因组学, 合成生物学 | NA | 多重CRISPR编辑, 高通量测序, 长读长测序 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 多重gRNA表达盒, 启动子工程, 支架工程 | 农业 |
| 28 | 2026-09-16 |
Synthetic allopolyploidy unveils hybridization-driven transcriptional reprogramming underlying thermal adaptation in Cucumis
2025-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70507
PMID:41056532
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研究论文 | 通过实验重建的同源四倍体黄瓜属物种（C. × hytivus）及其二倍体种间杂交亲本（异源二倍体），解析杂交与全基因组加倍对异源多倍体形成及热适应性的独立与联合贡献 | 首次利用人工合成的异源四倍体及其异源二倍体亲本，解耦杂交与全基因组加倍在异源多倍体热适应中的相对贡献，揭示杂交主导热响应转录可塑性，而全基因组加倍稳定这些适应 | 研究仅基于一个实验重建的异源四倍体系统，且聚焦于热胁迫下的短期转录响应，未涉及长期进化或田间多环境验证 | 解耦并探究种间杂交与全基因组加倍对异源多倍体形成后遗传与表型后果的独立和联合贡献，特别是热适应性 | 实验重建的异源四倍体黄瓜属物种C. × hytivus（2n=4x=38）及其二倍体种间杂交亲本异源二倍体（2n=2x=19），以及亲本物种 | 植物基因组学与进化生物学 | NA | RNA-seq（转录组测序）、WGCNA、比较转录组分析 | NA | 转录组数据、生理表型数据 | 异源二倍体和异源四倍体在热胁迫（45°C）和对照（28°C）条件下的15,680个同源基因对 | NA | 黄瓜属植物（Cucumis） | NA | 农业 |
| 29 | 2026-09-16 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了可编程DNA纳米结构（包括Tile组装、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶）在刺激响应药物递送和多模态生物传感中的最新进展 | 系统整合了DNA纳米结构在肿瘤微环境刺激响应药物释放与多模态生物传感（FRET探针、电化学发光放大电路、SERS基底、细胞可变区传感技术）中的创新应用，并提出人工智能驱动设计与合成生物学-临床肿瘤学桥接的未来方向 | 仍存在可规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化以及长期纳米毒性严格评估等转化挑战，且主要基于临床前结果 | 全面分析DNA工程化纳米结构的模块化设计策略、稳定性改进和多配体靶向能力，并总结其在多模态检测和精准癌症诊疗中的应用前景 | DNA纳米结构（Tile组装体、DNA折纸框架、球形核酸、刺激响应水凝胶）及其在癌症诊疗中的应用 | 数字病理学 | 肺癌 | DNA纳米技术, FRET, 电化学发光, SERS, 循环肿瘤DNA检测, 外泌体检测 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 刺激响应药物释放纳米平台, 荧光共振能量转移探针, 电化学发光放大电路, SERS基底 | 医学 |
| 30 | 2026-09-16 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-02, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
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研究论文 | 该文章构建了由信号响应型DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡组成的合成细胞模型，实现了纳米尺度DNA筏重塑与微尺度GUV重塑的耦合 | 首次将可重构DNA纳米筏与合成细胞界面结合，实现纳米尺度DNA筏在脂质膜上可逆的各向同性与短程局部有序转变，并编程化重塑GUV形态；利用生物孔辅助在GUV形状恢复过程中使局部有序DNA筏穿孔膜，形成可密封的合成通道用于大货物运输 | 未明确提及 | 构建合成细胞模型，探索可重构DNA纳米结构与合成细胞的界面交互平台 | 信号响应型DNA纳米筏、生物孔、巨型单层囊泡（GUVs） | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 材料 |
| 31 | 2024-12-28 |
Targeted Activation of Programmed Cell Death Pathways by Optogenetics
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_5
PMID:39724344
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光遗传学技术激活三种主要程序性细胞死亡（凋亡、坏死性凋亡和焦亡）的协议 | 开发了新的合成生物学工具，通过化学或光遗传学方法在选定的细胞中特异性诱导程序性细胞死亡 | 目前难以在不影响邻近细胞的情况下，在细胞群或复杂组织中靶向和诱导选定细胞的死亡 | 研究如何利用光遗传学技术激活程序性细胞死亡 | 细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2026-01-03 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以动态控制细胞器功能 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控，为细胞工程和合成生物学提供创新范式 | NA | 开发一种光遗传学方法来调控细胞器功能，特别是线粒体-溶酶体接触 | 真核细胞中的细胞器，特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 光遗传学调控的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 医学 |
| 33 | 2026-09-14 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
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综述 | 本文综述了先天淋巴细胞（ILCs）在免疫调节、组织稳态和疾病发病机制中的作用，并探讨其作为生物标志物和创新免疫治疗蓝图的潜力。 | 系统整合了ILC亚群的功能多样性、可塑性和组织驻留性，强调其作为预测、诊断和治疗靶点的作用，并提出结合多组学、单细胞图谱和合成生物学指导ILC疗法设计的新视角。 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床转化的障碍。 | 综述ILC生物学和转化研究进展，探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力，并展望下一代精准免疫治疗。 | 先天淋巴细胞（ILCs），包括ILC1s、ILC2s、ILC3s和淋巴组织诱导细胞（LTi） | 免疫学，免疫治疗 | 自身免疫疾病，癌症 | NA | NA | 文本 | NA | 嵌合抗原受体（CARs） | NA | NA | 医学 |
| 34 | 2026-09-13 |
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-12-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c16214
PMID:41258773
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研究论文 | 本文开发了一个无泄漏的T7 RNA聚合酶工具箱，通过模块化T7-Locks将选择性miRNA检测与信号放大和蛋白质表达相连接 | 设计了模块化T7-Locks，仅在特异性寡核苷酸结合时释放活性T7启动子，实现了ON/OFF比超过100的定量和正交miRNA检测；通过C12间隔区在T7模板中引入位点特异性转录终止子，利用正反馈实现可控信号放大；在无细胞TX-TL系统中利用工程化粘性末端基因实现了miRNA触发的蛋白质表达 | 仅在无细胞TX-TL系统中验证了蛋白质表达，尚未在活细胞内测试；信号放大依赖正反馈可能引入非特异性激活；系统的长期稳定性和通用性有待进一步验证 | 构建一个模块化、无泄漏的T7 RNA聚合酶工具箱，将输入传感、信号放大和输出合成相连接，为合成生物学中DNA或RNA驱动的信息处理提供通用策略 | miRNA、T7 RNA聚合酶、T7启动子、T7-Locks、无细胞TX-TL系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞TX-TL系统、T7 RNA聚合酶转录、化学合成寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 模块化T7-Locks介导的miRNA传感级联、正反馈信号放大电路、转录门控蛋白质表达回路 | 医学、工业生物技术 |
| 35 | 2026-09-13 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于Web的工具，用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | 同时考虑DNA序列和形状读取模式，利用Deep DNAshape进行超快速DNA形状预测，并提供多种核苷酸序列编码方法 | 未明确提及 | 研究基因调控以及合成生物学应用，如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | Deep DNAshape | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 36 | 2026-09-12 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-12-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组驱动宫颈癌治疗耐药的机制及临床转化应用 | 系统整合了阴道微生物失调通过乳酸介导代谢重编程、免疫检查点稳定和药物代谢改变驱动耐药的机制，并提出了合成生物学驱动的精准微生物组疗法和多中心标准化试验方案 | 缺乏统一的临床试验标准，地理变异（如撒哈拉以南非洲HIV合并感染）对治疗反应的影响尚未充分阐明，机制研究向临床转化的证据仍有限 | 阐明微生物组驱动宫颈癌治疗耐药的机制并推动临床转化 | 宫颈癌患者阴道微生物组及治疗耐药 | 数字病理学 | 宫颈癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 37 | 2026-09-12 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-11-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
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研究论文 | 评估大丝氨酸重组酶Kp03在水稻和拟南芥中高效介导长达27.3 kb DNA片段位点特异性整合的能力。 | 首次系统评估Kp03重组酶在植物细胞中实现kb级DNA片段定点整合，并展示其与NM-PE基因组编辑系统联用实现内源位点靶向整合。 | 研究主要基于瞬时原生质体和水稻愈伤组织，尚未获得稳定遗传的转基因植株；整合效率随片段增大而下降。 | 开发高效植物基因组大片段定点整合工具，推动植物合成生物学发展。 | 水稻和拟南芥原生质体、水稻愈伤组织。 | 合成生物学, 植物基因组工程 | NA | 大丝氨酸重组酶介导的位点特异性整合, 原生质体瞬时转化, NM-PE基因组编辑 | NA | 分子实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | Kp03重组酶, NM-PE | 水稻, 拟南芥 | 位点特异性重组系统 | 农业, 合成生物学 |
| 38 | 2026-09-12 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-01-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
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研究论文 | 本文描述了在酿酒酵母中利用CRISPR介导的盒交换系统，实现基因组整合盒的标准化交换或移除，将模块化提升到菌株水平 | 首次实现了对已整合到基因组中的表达盒进行标准化交换或移除，通过条形码靶向CRISPR（Cas9和Cas12a）一步完成盒的替换或野生型位点恢复，将模块化原则扩展到菌株水平 | 目前仅应用于荧光蛋白表达盒的交换，未展示在复杂代谢途径或工业相关菌株中的应用，效率约90%仍有提升空间 | 开发一种系统，能够轻松地通过CRISPR介导交换或移除先前整合的盒，从而将模块化带到菌株水平，增强修改现有菌株的可能性并减少步骤 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的基因组整合表达盒 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | 酿酒酵母 | 基因组整合的荧光蛋白表达盒交换系统 | 工业生物技术 |
| 39 | 2026-09-12 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-01-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用基因组尺度代谢建模研究植物-微生物相互作用的研究进展 | 系统梳理了代谢建模在共生、致病和微生物群落系统中的应用，并探讨了其作为合成微生物群落设计测试平台的潜力 | 作为综述，未提供原始实验数据，且指出了该领域仍面临的挑战，如模型精度和整合多组学数据的困难 | 总结代谢建模在理解植物-微生物相互作用中的应用，并展望未来方向 | 植物-微生物相互作用，包括共生、致病和微生物群落系统 | 系统生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 基因组尺度代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型组等多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 40 | 2026-09-12 |
Strength in diversity: unlocking the full potential of engineered living materials with multistrain collaboration
2025-01-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf055
PMID:41206547
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综述 | 本文综述了多菌株协作工程活材料（ELMs）的发展潜力，探讨了通过多菌株分工突破单菌株功能限制的策略 | 提出多菌株协作是解锁工程活材料全部潜力的新方向，通过分工合作克服单菌株代谢负担和功能局限 | 多菌株ELMs仍处于早期发展阶段，面临菌株间协调、竞争和稳定共存的挑战 | 探讨多菌株协作如何拓展工程活材料的功能性和应用范围 | 工程活材料（ELMs）中的微生物系统，包括细菌、真菌、植物和藻类 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 真菌, 植物, 藻类 | 多菌株协作系统 | 医学, 建筑, 农业 |