合成生物学相关文章
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当前共找到 1563 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-28 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Dec-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
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研究论文 | 本研究为致病真菌新型隐球菌开发了基因编码的氧化还原传感器，用于实时监测细胞内氧化还原状态 | 首次为新型隐球菌优化设计了基因编码的氧化还原传感器，并建立了多种基于荧光的实时监测技术 | 该研究主要针对新型隐球菌，在其它真菌中的应用仍需进一步验证 | 开发用于致病真菌的氧化还原生物传感器，研究真菌毒力相关的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原蛋白 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器技术、荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器 | 医学 |
| 22 | 2026-01-25 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
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综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用中的表观遗传调控机制及其在疾病发病中的作用 | 系统总结了不同物种利什曼原虫的表观遗传变化，并探讨了寄生虫如何通过表观遗传途径操纵宿主免疫信号，同时提出了合成基因回路调控宿主和寄生虫表观基因组的新策略 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨利什曼病中寄生虫与宿主相互作用的表观遗传调控机制，并评估基于表观遗传学和合成生物学的治疗策略潜力 | 利什曼原虫及其宿主（包括人类）的表观遗传修饰与相互作用 | NA | 利什曼病 | 文献综述（Web of Science、PubMed、Scopus数据库检索） | NA | 文本（文献数据） | NA | 合成基因回路 | 人类（宿主） | 用于调控宿主和寄生虫表观基因组的合成基因回路 | 医学 |
| 23 | 2025-12-19 |
Engineered Clostridium butyricum: a promising application of synthetic biology in comprehensive health
2025-Dec-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02901-y
PMID:41408287
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-01-24 |
Medium dependent factors govern the functionality of engineered type III secretion systems
2025-Dec-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00600-1
PMID:41402848
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研究论文 | 本研究探讨了细菌宿主培养条件对基于III型分泌系统（T3SS）的工程化电路功能的影响，并开发了可诱导的iT3SS系统 | 首次系统研究了培养介质对T3SS工程化系统性能的影响，揭示了介质依赖性因素如何通过宿主资源分配策略影响分泌效率 | 研究仅基于沙门氏菌模型，未在其他细菌宿主中验证；提出的翻译和翻译后负担假设需要进一步实验验证 | 优化工程化分泌系统在合成生物学应用中的性能，理解培养条件对T3SS功能的影响机制 | 沙门氏菌中的工程化III型分泌系统（iT3SS），包括PrgH-GFP融合蛋白和效应蛋白SptP | 合成生物学 | NA | RNA-seq分析，GFP荧光监测，IPTG诱导系统 | NA | 基因表达数据，蛋白质分泌效率数据，RNA-seq转录组数据 | 在丰富LB培养基和葡萄糖最小培养基中培养的沙门氏菌细胞，使用不同IPTG浓度处理 | 基因融合，IPTG诱导系统 | 沙门氏菌（Salmonella enterica） | IPTG诱导的工程化III型分泌系统（iT3SS），将prgH基因与GFP编码序列融合以监测表达 | 工业生物技术，合成生物学 |
| 25 | 2026-01-24 |
Insights into microalgal biotechnology: Current applications, key challenges, and future prospects
2025-Nov, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.127263
PMID:40961787
|
综述 | 本文综述了微藻生物技术的当前应用、关键挑战及未来前景，探讨了其在碳捕集、可再生能源生产、环境修复和高价值生物产品合成等方面的多功能潜力 | 系统整合了微藻生物技术的最新进展，包括生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥等低能耗采收技术，以及CRISPR/Cas基因组编辑、光生物反应器设计创新和生命周期评估，并提出了模块化生物精炼系统、智能过程控制和支持性政策框架等未来发展方向 | 未提供具体实验数据或案例研究，主要基于文献综述，缺乏对特定技术经济障碍的定量分析 | 评估微藻生物技术的现状、挑战和未来潜力，以推动其大规模应用和可持续发展 | 微藻生物技术及其在能源、环境和生物产品领域的应用 | 工业生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥、光生物反应器设计、生命周期评估 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 26 | 2026-01-24 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 本文介绍了一种通过具有3'-突出端的引物对进行高效定点诱变的优化方法 | 利用部分互补且具有3'-突出端的引物对设计，显著提高了诱变效率并降低了错误率 | NA | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | NA | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 27 | 2026-01-24 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动力学和转运机制 | 首次通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证来确认预测的突变效果 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，为工程化改造提供原子层面的见解 | 蓝藻的碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学与计算生物学 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | BicA二聚体的模拟数据（超过1毫秒） | NA | 蓝藻 | NA | 能源、粮食生产、气候变化应对 |
| 28 | 2026-01-23 |
Editorial: Synthetic biology and metabolomics: novel insight in oncology research
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1768397
PMID:41568228
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2026-01-21 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
|
研究论文 | 介绍一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，该平台结合长读长和短读长测序技术，用于高通量评估任意长度、包含多样化部件组合的基因构建体 | 开发了CLASSIC平台，首次实现对多kb长度尺度、多部件组合的基因电路设计进行超高通量（>10^5种设计）定量评估，并利用所得数据训练机器学习模型预测电路行为 | NA | 加速合成生物学发展，通过筛选多样化基因电路设计并学习“组成-功能”映射关系，以揭示遗传部件的可组合性规则 | 基因电路设计（长度5-20 kb） | 合成生物学 | NA | 长读长和短读长下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据、表达谱数据 | 单次实验可测量超过10^5种基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 包含多样化部件组合的基因电路 | 工业生物技术 |
| 30 | 2026-01-20 |
Editorial: Synthetic biology approaches for biocatalytic production of value-added chemicals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1755163
PMID:41550373
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2026-01-19 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的高效自复制DNA折纸二聚体系统，用于研究达尔文进化并应用于纳米技术 | 使用热稳定T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤，实现更快的循环时间和高达200万倍的扩增效率，并引入竞争机制以模拟达尔文式进化 | 未明确提及系统在复杂生物环境中的稳定性或长期演化潜力 | 研究人工自复制系统的竞争与灭绝机制，并探索其在生物相容性应用中的潜力 | DNA折纸二聚体自复制系统 | 合成生物学 | NA | 酶促连接（使用T4 DNA连接酶），DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 自复制DNA折纸二聚体系统，可结合其他酶如RNA聚合酶实现反馈调节 | 合成生物学，智能材料 |
| 32 | 2026-01-18 |
Research progress and applications of reverse genetics systems for infectious bronchitis virus
2025-Dec-19, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106312
PMID:41447763
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综述 | 本文系统综述了传染性支气管炎病毒反向遗传学系统的发展、应用与挑战 | 全面比较了包括痘病毒支持系统、体外连接转录、靶向RNA重组、细菌人工染色体克隆、转化相关重组和环状聚合酶延伸反应在内的多种反向遗传学平台，并展望了CRISPR/Cas9、合成生物学与计算方法的整合应用前景 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献进行归纳分析 | 为研究者选择适当的反向遗传学策略提供指导，并启发IBV防控的创新解决方案 | 传染性支气管炎病毒 | NA | 禽类传染病 | 反向遗传学、CRISPR/Cas9、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 农业 |
| 33 | 2026-01-17 |
Rewiring central metabolism in Komagataella phaffii for efficient mannose synthesis
2025-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02886-8
PMID:41366679
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，优化其中心代谢途径，实现了高效甘露糖合成 | 采用双碳源系统（甘油用于生物质生成，葡萄糖用于甘露糖合成），通过敲除和下调关键基因（如pfk2、pfk1、zwf1）来重定向碳通量，并过表达大肠杆菌来源的磷酸酶基因yniC以促进甘露糖生物合成，最终在发酵中达到约121.1 g/L的甘露糖产量，创下微生物发酵的最高纪录 | NA | 通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，实现高效甘露糖生产 | Komagataella phaffii酵母及其甘露糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因敲除、基因下调、过表达、高细胞密度补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 甘露糖生物合成途径的重构，包括碳通量重定向至果糖-6-磷酸积累、抑制副产物生成 | 工业生物技术 |
| 34 | 2026-01-17 |
[A review of security, safety, and duality issues in the field of biology]
2025-Nov-18, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.188
PMID:41251134
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综述 | 本文综述了生物学领域中的安全、安保及双重用途问题，并评估了法国为限制这些风险所采取的措施 | 在当前生物研究繁荣和地缘政治不稳定的背景下，系统性地审视了生物风险，特别是结合合成生物学和测序技术发展带来的新挑战 | NA | 评估生物学研究中可接受的风险，平衡研究对健康、环境和生活质量的重要性与安全、安保及双重用途问题的考量 | 生物学研究中的安全、安保及双重用途问题，以及法国的风险管理措施 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2026-01-17 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 结合合成生物学和不确定性采样，通过多轮大规模平行报告基因检测迭代训练模型，解决了传统模型无法解释同一转录因子在不同背景下激活或抑制转录的问题 | NA | 开发能够区分具有相同序列但相反功能的CRX结合位点的调控DNA模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 大规模平行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 基因组中几乎所有结合的CRX位点 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-01-16 |
Decoding necrosome assembly: harmonizing signal amplification and attenuation through optimal RIP3 stoichiometry
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67098-5
PMID:41436733
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研究论文 | 本研究通过定量STORM和数学建模揭示了坏死小体组装中RIP3与RIP1的最优化学计量比约为3:1，以调控坏死性凋亡的信号放大与衰减 | 首次定义了坏死小体中RIP3与RIP1的最优化学计量比，并发现过度RIP3寡聚化可作为内在尺寸控制机制来衰减信号 | NA | 探究坏死小体组装的时空规则及其在坏死性凋亡中的作用机制 | 坏死小体、RIP3、RIP1、MLKL、Caspase-8、c-FLIP | 分子生物学 | 神经退行性疾病、缺血性损伤、炎症性疾病 | 定量STORM、数学建模 | NA | 成像数据、数学模型 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 37 | 2026-01-16 |
Reconstituting transcription-translation-coupled DNA replication within complex in vitro biological systems
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67411-2
PMID:41398169
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研究论文 | 本研究开发了一种名为LoopReX的无细胞系统，利用大肠杆菌粗提物重建了转录-翻译耦合的DNA复制过程，为合成生命构建提供了新平台 | 首次使用粗提物而非纯化组分重建TTcDR，引入机器学习优化系统效率，并利用CipB介导的区室化形成人工核样结构 | 系统仍依赖外源添加的phi29和T7聚合酶，且长期稳定性和遗传保真度有待进一步验证 | 在人工系统中重建转录-翻译耦合的DNA复制过程以推进合成生命构建 | 无细胞转录翻译系统与DNA复制机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统构建、机器学习优化 | NA | 实验性能数据 | NA | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 转录-翻译耦合的DNA复制系统、人工核样区室化结构 | 合成生物学、生物技术、生物混合系统 |
| 38 | 2026-01-15 |
Molecular life sciences in the era of the Fourth Industrial Revolution: sequencing, multi-omics and artificial intelligence
2025-Dec-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20253019
PMID:41385245
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综述 | 本文探讨了第四次工业革命背景下，人工智能与多组学技术在分子生命科学中的整合应用及其未来发展趋势 | 综述了人工智能与低成本高通量测序在多组学领域的结合，实现了前所未有的数据解析速度 | NA | 概述人工智能如何整合到多组学研究中，并预测该领域未来的研究方向 | 分子生命科学中的多组学数据 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2026-01-15 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
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研究论文 | 本研究开发了一种群体感应控制的I型CRISPRi工具包，用于动态调控代谢通量，并在枯草芽孢杆菌中成功应用于D-泛酸和核黄素的生物合成 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰技术整合，创建了可响应细胞密度的动态基因调控工具包，并通过优化关键组件显著提升了调控效率 | 未明确说明该工具包在其他宿主微生物中的普适性，且大规模发酵应用可能面临工程菌株稳定性挑战 | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、群体感应系统、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应控制的基因调控回路，包含PhrQ/RapQ信号系统与CRISPRi的整合设计 | 工业生物技术 |
| 40 | 2026-01-15 |
Engineered bacteria as living therapeutics: Next-generation precision tools for health, industry, environment, and agriculture
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025042
PMID:41522435
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌作为活体疗法方面的最新进展，探讨了其在医疗、工业、环境和农业领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统、合成基因电路和模块化质粒架构，结合计算建模与机器学习，实现了对微生物行为的精细调控 | 存在遗传稳定性、生物安全性、临床与工业环境可重复性等挑战，伦理与监管框架仍需完善 | 探讨工程化细菌作为下一代精准工具在健康、工业、环境和农业领域的应用潜力 | 工程化细菌（活体疗法） | NA | NA | CRISPR-Cas系统、合成基因电路、模块化质粒架构 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 合成基因电路（如生物传感器、逻辑门等） | 医学, 工业, 环境, 农业 |