合成生物学相关文章
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当前共找到 431 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-04-03 |
Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273
PMID:40129278
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research paper | 该研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术，提高了工程酵母细胞内人参皂苷的生产和输出效率 | 结合长期酵母培养与原位提取技术，显著提高人参皂苷的生产效率，并实现酵母的多次重复利用 | 研究未提及大规模工业化生产中的潜在挑战或成本效益分析 | 提高人参皂苷的生产效率，支持其工业化生产 | 工程酵母细胞内的人参皂苷 | 合成生物学 | NA | 酵母培养与原位提取技术 | NA | NA | 单次摇瓶培养 |
| 22 | 2025-04-03 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Apr-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
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研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统，用于DNA信息存储和处理 | 利用三种正交丝氨酸整合酶构建模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统，并成功应用于级联生物转化过程 | 研究仅限于体外环境，尚未在活体生物中进行验证 | 开发先进的体外遗传记忆系统以存储和处理遗传信息 | 基于DNA的遗传记忆系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 23 | 2025-04-03 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究通过文献计量和知识图谱方法，探索了亚胺还原酶（IREDs）的研究格局和演变 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示，揭示了当前趋势和新兴主题 | 研究仅基于Web of Science Core Collection的数据，可能存在遗漏 | 评估IRED研究的现状和发展趋势，为学者提供研究方向和潜在合作者信息 | 239篇关于IREDs的研究文章和综述 | 生物催化 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法（CiteSpace, VOSviewer, Pajek, Scimago Graphica） | NA | 文献数据 | 239篇研究文章和综述（2010-2024年） |
| 24 | 2025-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Mar-25, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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研究论文 | 本文探讨了利用高通量突变筛选技术理解、抑制和设计膜转运蛋白的方法 | 提出了高通量筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力，特别是在理解多特异性转运的分子基础和设计抑制剂方面的创新 | 高通量筛选方法在膜转运蛋白领域的应用仍不广泛，影响力有限 | 研究膜转运蛋白的功能和多特异性转运的分子基础，以及如何利用这些知识设计抑制剂和工程化转运蛋白 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学与生物技术 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA |
| 25 | 2025-04-03 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域中数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域与人工智能、大模型和高性能计算等信息技术融合的发展方向与新兴技术方法 | 未具体说明所涵盖研究的样本量或数据规模 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术应用 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
| 26 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用及其进展 | 总结了AI在生物制造中核酸元件设计方面的最新工具和应用案例 | 生物系统的复杂性及缺乏高度量化的训练数据限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨AI如何加速生物制造中核酸元件的设计与优化 | 生物制造中的核酸元件（如启动子、核糖体结合位点、终止子等） | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
| 27 | 2025-04-03 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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综述 | 本文全面总结了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 人工智能技术，尤其是机器学习，通过分析高通量测序数据，革新了sgRNA设计，提高了编辑效率并高精度预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用 | CRISPR-Cas系统 | 合成生物学 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 测序数据 | NA |
| 28 | 2025-04-03 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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review | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的应用，并讨论了当前挑战及未来趋势 | 探讨了机器学习如何从传统试错方法转向标准化、智能化的工程设计，为合成生物学提供创新支持 | 未具体说明机器学习模型在复杂遗传电路设计中的实际效果及数据需求 | 推动合成生物学从经验驱动向智能工程设计的范式转变 | 合成生物学部件（如启动子、RNA调控元件、转录因子）及简单遗传电路 | machine learning | NA | 机器学习算法 | NA | 生物数据 | NA |
| 29 | 2025-04-03 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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review | 本文全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 首次从跨膜蛋白和传感器蛋白、自然细胞的适应调控机制以及应用场景三个方面系统性地综述了细胞代谢和环境适应的调控 | 缺乏对具体实验数据和案例的深入分析 | 探讨细胞感知代谢和环境变化的机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2025-04-03 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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综述 | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型重建与优化的最新研究进展 | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用，为高精度构建细胞生理代谢网络模型提供了新机遇 | 未提及具体模型在实际应用中的性能局限或验证不足 | 为定量合成生物学和系统生物学研究提供计算生物学工具支持 | 细胞生理代谢网络模型（包括GEMs、动力学模型和ecGEMs） | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型构建技术、人工智能技术 | GEMs、动力学模型、ecGEMs | 代谢网络数据 | NA |
| 31 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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review | 本文综述了转录因子(TF)基生物传感器在计算模拟和人工智能辅助下的工程与优化最新进展 | 结合计算模拟和人工智能技术优化转录因子基生物传感器，相比传统工具更准确快速 | NA | 总结转录因子基生物传感器的工程与优化方法，促进新型生物传感器的发展 | 转录因子基生物传感器 | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
| 32 | 2025-04-03 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的实时监测、人工智能优化策略和数字孪生技术的进展 | 整合了在线监测技术、人工智能驱动的动态优化和数字孪生技术，为发酵过程的精确优化和高效放大提供了新范式 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 实现发酵过程的精确优化和高效放大，推动生物制造向更高效率、智能化和可持续发展方向发展 | 发酵过程的实时监测、智能控制和优化策略 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、人工智能、数字孪生 | 人工神经网络、支持向量机、遗传算法 | 实时传感数据 | NA |
| 33 | 2025-04-03 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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评论 | 本期特刊探讨了人工智能驱动的生物制造的机遇、挑战和发展现状 | 综述了人工智能在生物制造领域的创新应用，包括智能设计、构建生物部件、电路和人工细胞，以及智能生物过程控制与优化 | NA | 把握人工智能驱动的生物制造的创新与发展 | 生物制造领域的技术创新和产业发展 | 生物制造 | NA | 人工智能 | NA | 生物大数据 | NA |
| 34 | 2025-04-03 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
|
研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 该方法在早期指数生长期观察到最高转化效率，转化效率高达每细胞每微克质粒DNA 4.4×10转化体，并开发了使用少量培养物和质粒DNA获得大量转化体的方法 | NA | 开发一种高效且稳健的最小细胞转化方法，以促进最小细胞的遗传工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 少于0.2 mL培养物，约1×10-10细胞和10 ng质粒DNA |
| 35 | 2025-04-02 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本文报道了蓝藻噬菌体A4的完整结构，揭示了其双稳定衣壳中的五聚体预喷射体结构 | 首次发现蓝藻噬菌体A4衣壳核心存在由四个喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构，并提出了噬菌体的DNA包装和喷射机制 | 研究主要基于结构观察，具体的分子机制仍需进一步实验验证 | 探究蓝藻噬菌体A4的结构特征及其基因组喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(Cryo-EM) | NA | 冷冻电镜图像 | 单个蓝藻噬菌体A4颗粒 |
| 36 | 2025-04-02 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-Mar-31, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
|
research paper | 本研究开发了一种自动化方法，用于大规模生产具有治疗应用潜力的合成细胞（SCs），并通过机器学习和机器人技术优化了生产过程 | 结合机器人液体处理系统和自动化组织解离器，显著提高了合成细胞的生产效率和规模，同时利用AI图像分析实现了高质量、高通量的SC表征 | 研究主要聚焦于蛋白质表达的SCs，可能不适用于其他类型的合成细胞 | 开发自动化方法以提高合成细胞的生产效率和规模，用于治疗应用 | 合成细胞（SCs） | synthetic biology | NA | robotic liquid handling system, automated tissue dissociator, AI-based image analysis | AI-based image analysis | image | mice administered with large-scale luciferase-expressing SCs |
| 37 | 2025-04-02 |
Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy
2025-Mar-28, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128156
PMID:40158322
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综述 | 本文综述了生物工程微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力 | 探讨了通过合成生物学方法改造微生物以增强抗肿瘤活性和免疫治疗效果的创新策略 | 存在遗传稳定性、有效肿瘤定植和潜在安全性问题等挑战 | 探索微生物组在癌症免疫治疗中的作用及其工程化应用的潜力 | 胃肠道和肿瘤内的微生物群落 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 38 | 2025-04-02 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
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research paper | 该研究探讨了不同来源的PARPs（聚ADP-核糖聚合酶）的调节域（REG）和催化域（CAT）是否可以交叉互补组装成功能性嵌合体，并研究了这些嵌合体的酶活性和结合特性 | 首次展示了不同PARPs的REG和CAT可以跨物种交叉互补组装成功能性嵌合体，并揭示了atPARP2的CAT具有独特的互补能力 | 研究仅限于体外实验，尚未在活细胞中验证这些嵌合体的功能 | 探究PARPs调节域和催化域的交叉互补性及其分子机制 | 来自哺乳动物（hPARP1和hPARP2）、植物（atPARP2）和细菌（haPARP）的PARPs蛋白 | 分子生物学 | NA | 酶活性测定、结合研究 | NA | 生化实验数据 | 多种PARP蛋白的REG和CAT结构域 |
| 39 | 2025-04-02 |
Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency
2025-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81235-y
PMID:39779752
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研究论文 | 本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率，探索了提高植物转化效率的新方法 | 发现根外植体具有显著的再生能力和转化适应性，并揭示了与高再生和转化效率相关的候选基因 | 研究仅针对杨树这一种生物能源作物，未涉及其他重要作物物种 | 提高植物转化效率，优化合成生物学中的设计-构建-测试-学习循环 | 杨树的不同外植体（叶、茎、叶柄和根） | 植物生物技术 | NA | 农杆菌介导的植物转化技术 | NA | 转录组数据 | 多种杨树外植体类型（叶、茎、叶柄和根） |
| 40 | 2025-04-01 |
Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts
2025-Mar-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02692-2
PMID:40155940
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综述 | 本文总结了特定异黄酮的药理特性、其生物合成途径以及在工程酵母中生产异黄酮的技术策略 | 利用合成生物学和先进的生物技术策略，实现生物活性异黄酮的环保生产 | NA | 探讨异黄酮及其前体的生物合成及其在食品、制药和化妆品工业中的应用 | 植物源性异黄酮及其前体 | 合成生物学 | NA | 工程酵母生物合成 | NA | NA | NA |