合成生物学相关文章
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当前共找到 1216 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-18 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-Oct-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
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研究论文 | 本研究结合全细胞模型和机器学习加速大肠杆菌简化基因组的设计 | 使用机器学习代理模型将全细胞模型的计算时间减少95%，并成功设计出移除40%基因的简化大肠杆菌基因组 | 全细胞模型运行时间较长是主要限制因素 | 开发加速基因组设计的计算方法 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 全细胞建模、机器学习 | 机器学习代理模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 简化基因组设计 | 工业生物技术 |
| 22 | 2025-10-18 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Oct, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
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研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶进行了克隆、生化和结构表征 | 首次报道了二聚体氯酸歧化酶在原子分辨率(0.99Å)下的晶体结构，并对其催化机制提供了新见解 | NA | 表征铜绿假单胞菌氯酸歧化酶的生化特性和结构特征 | 铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、稳态动力学 | NA | 结构数据、动力学数据 | NA | 克隆 | 铜绿假单胞菌 | NA | 环境、生物医学、合成生物学 |
| 23 | 2025-10-15 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱和饱和转移差NMR结合用于研究PAS结构域蛋白-配体相互作用 | 仅使用了约760种化合物的片段库，可能遗漏其他潜在配体 | 寻找细菌孤儿受体CU228的新型配体并研究其稳定机制 | CU228蛋白（一种推测的PAS-HTH转录因子） | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库 | NA | 细菌 | NA | 生物技术 |
| 24 | 2025-10-15 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
|
研究论文 | 开发基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交性细胞因子调控系统，避免免疫原性风险 | 仅提供概念验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人类细胞因子（IL-2、IL-6、IL-10）和人源蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症，肌肉再生疾病 | 蛋白质工程，蛋白酶调控技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 基于蛋白酶切割的细胞因子活性调控回路，包含激活和失活机制 | 医学 |
| 25 | 2025-10-14 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
|
研究论文 | 本研究开发了一种可编程控制细菌细胞器空间定位的双蛋白系统 | 首次实现了对多种细菌细胞器类型的可编程空间控制，建立了合成生物学中反应位置可控的新设计原则 | NA | 探索细菌细胞器的空间组织机制并开发工程化控制方法 | 细菌细胞器（包括羧酶体、包裹蛋白、生物分子凝聚体和膜结合细胞器） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、细胞器异源表达 | NA | NA | NA | McdAB双蛋白系统 | 大肠杆菌 | 细胞器空间定位控制系统 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-14 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本研究通过开发foldtuned蛋白质语言模型库，大规模探索了蛋白质序列-结构映射中未开发的区域 | 提出foldtuning方法，将蛋白质语言模型重新设计为能够探索与天然蛋白质无同源性的序列空间的探针，同时保持核心结构约束 | NA | 探索远离天然序列的蛋白质序列-结构映射景观，揭示未被地球进化触及但符合生物物理规律的蛋白质折叠空间 | 700多种天然折叠结构，包括GPCRs、小GTPases、细胞表面受体、DNA结合域和信号调节域 | 计算生物学 | NA | 蛋白质语言模型(PLMs)、foldtuning方法 | 语言模型 | 蛋白质序列和结构数据 | SCOP数据库中700多种天然折叠 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 27 | 2025-10-13 |
Multigene engineering in plants: Technologies, applications, and future prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108697
PMID:40882716
|
综述 | 本文综述了植物多基因工程的技术、应用及未来前景，重点介绍了合成生物学驱动的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了多基因工程在合成生物学DBTL框架下的完整技术流程，并提出了优化路径和未来发展方向 | 在多基因构建稳定性、协调性基因表达和调控可预测性方面仍存在挑战 | 促进多基因工程在可持续农业中的部署应用 | 植物多基因工程技术体系 | 合成生物学 | NA | 多基因工程 | 计算建模 | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 代谢通路、调控通路 | 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 28 | 2025-10-13 |
Engineered microbial production of carotenoids and their cleavage products: Recent advances and prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108708
PMID:40921259
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综述 | 总结类胡萝卜素及其裂解产物微生物合成的最新进展与前景 | 系统阐述代谢工程和合成生物学在异源生物合成中的应用，重点关注类胡萝卜素裂解酶的研究进展 | NA | 探讨类胡萝卜素及其裂解产物的可持续微生物生产策略 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径的代谢通路设计 | 制药，医疗保健，化妆品，食品 |
| 29 | 2025-10-13 |
Intersecting precision fermentation for global cell-based food production innovation: Challenges and opportunities
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108712
PMID:40930311
|
综述 | 探讨精准发酵与全球细胞基食品生产交叉领域的挑战与机遇 | 提出融合合成生物学与精准营养的愿景框架，分析计算机辅助工程和人工智能在发酵过程中的应用潜力 | 存在技术扩展瓶颈、监管碎片化、区域可及性和消费者接受度等实施障碍 | 推动发酵食品生产向高效可持续制造转型 | 微生物细胞工厂生产的食品成分 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、代谢工程、计算机辅助工程(CAE)、人工智能(AI)、自动化 | NA | 案例研究、建模分析 | NA | 合成生物学工具、代谢工程工具 | 微生物细胞工厂 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-13 |
Genetically engineered Escherichia coli: The new recyclers of PET plastic waste
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108713
PMID:40934993
|
综述 | 本文综述了基因工程改造的大肠杆菌作为PET塑料废物生物降解与转化平台的最新进展 | 将PET水解酶在工程化大肠杆菌中进行异源表达和蛋白质工程改造，并整合合成生物学策略构建多酶级联系统和表面展示系统 | NA | 开发能够实现PET塑料高效生物降解和转化的工程微生物平台 | 基因工程改造的大肠杆菌及其在PET生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 多酶级联系统、表面展示系统、代谢通路 | 环境 |
| 31 | 2025-10-13 |
Turing patterns in a morphogenetic model with single regulatory function
2025-Nov, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2025.109536
PMID:40972714
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研究论文 | 本研究通过数学建模分析合成Nodal-Lefty系统中图灵模式的形成机制 | 首次在单调控函数控制的双形态素系统中证明亚临界图灵不稳定性对耗散结构形成的关键作用 | 理论分析基于简化模型，未考虑生物系统中复杂的多尺度相互作用 | 验证图灵形态发生理论在合成生物学系统中的应用 | 合成哺乳动物模式形成系统中的Nodal-Lefty反应扩散系统 | 合成生物学 | NA | 线性稳定性分析、弱非线性分析、多时间尺度方法 | 反应扩散模型 | 数学模型 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 基于短程激活因子Nodal和长程抑制因子Lefty的图灵模式生成系统 | 医学 |
| 32 | 2025-10-13 |
Advancing Genetically Encoded Lysine (GEK) Chemistry: From Precision Modulation to Therapeutic Innovation
2025-Oct-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.5c00401
PMID:41004624
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研究论文 | 本文系统性地推进了基因编码赖氨酸(GEK)化学技术，开发了能够高效整合多样化赖氨酸衍生物的工程化吡咯赖氨酰-tRNA合成酶变体 | 开发了工程化PylRS变体，可高效整合具有定制化学反应性的多样化赖氨酸衍生物，包括生物正交手柄、酰基和亲电弹头、光交联基团及PTM模拟物 | NA | 推进基因编码赖氨酸化学技术，实现蛋白质精确修饰和功能调控 | 蛋白质工程和赖氨酸化学修饰 | 化学生物学 | NA | 基因编码赖氨酸(GEK)化学、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 工程化吡咯赖氨酰-tRNA合成酶(PylRS)变体 | NA | NA | 医学、治疗创新 |
| 33 | 2025-10-12 |
A Photonastic Prototissue Capable of Photo-Mechano-Chemical Transduction
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202502830
PMID:40350988
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研究论文 | 本研究通过自下而上的化学方法构建了具有光-力-化学转导能力的光敏原型组织 | 开发了包含金纳米颗粒光热转导原型细胞器和热响应聚合物原型皮层的先进原型细胞单元，首次实现了原型组织的光诱导可逆收缩与复杂运动 | NA | 构建能够模拟生物组织复杂能量转导过程的原型组织系统 | 原型细胞、原型组织、金纳米颗粒、热响应聚合物 | 合成生物学 | NA | 自下而上组装、光热转导 | NA | NA | NA | NA | NA | 光-力-化学转导系统，能够通过光控机械运动可逆开关内化酶代谢 | 材料科学、工业生物技术 |
| 34 | 2025-10-12 |
RNAtranslator: Modeling protein-conditional RNA design as sequence-to-sequence natural language translation
2025-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013541
PMID:41042819
|
研究论文 | 提出RNAtranslator模型，将蛋白质条件性RNA设计建模为序列到序列的自然语言翻译问题 | 首次将蛋白质条件性RNA设计构建为序列到序列的自然语言翻译问题，无需后生成优化即可直接生成结合RNA序列 | NA | 开发能够为任意蛋白质靶标设计选择性结合RNA序列的计算方法 | 蛋白质-RNA相互作用 | 自然语言处理 | NA | 生成语言模型 | 序列到序列模型 | RNA和蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 35 | 2025-10-11 |
Building climate-resilient crops: genetic, environmental, and technological strategies for heat and drought stress tolerance
2025-Oct-09, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf111
PMID:40062368
|
综述 | 探讨通过遗传、环境和技术策略构建耐热耐旱作物的综合方法 | 强调将基础研究与实际农业环境相结合，并评估新兴技术对作物抗逆性的提升潜力 | 现有育种计划受限于耐受机制的复杂性和农业环境的多变性 | 开发应对气候变化的热旱胁迫耐受型作物 | 小麦、水稻、大豆、玉米等主要粮食作物 | 农业生物技术 | NA | 合成生物学、先进育种技术、高通量表型分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 36 | 2025-10-11 |
Flippase-Mediated Hybrid Vesicle Division
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504519
PMID:40613217
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研究论文 | 本研究在聚合物-脂质杂化囊泡中重构活性脂质翻转酶，实现了蛋白质介导的囊泡分裂 | 首次在杂化囊泡中重构Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶，通过诱导跨膜不对称性实现合成系统的分裂能力 | 仅验证了特定组成和浓度的杂化囊泡系统，尚未实现完全自复制的功能单元 | 在自下而上的合成生物学中构建具有蛋白质介导分裂能力的合成系统 | 聚合物-脂质杂化囊泡和Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶复合物 | 合成生物学 | NA | 脂质翻转酶重构技术、杂化囊泡组装技术 | NA | 实验数据 | 使用不同摩尔百分比(1或2.5 mol%)的两亲性嵌段共聚物和多种疏水嵌段组合的杂化囊泡系统 | NA | NA | 基于脂质翻转酶的跨膜不对称性诱导系统，通过改变双层自发曲率实现囊泡收缩和分裂 | 合成生物学、基础研究 |
| 37 | 2025-10-11 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
|
综述 | 本文总结了合成生物学在天然产物生物合成领域的最新研究进展 | 系统整合了生物信息学工具、异源表达策略和生物合成途径工程三大前沿方向 | NA | 探讨合成生物学在天然产物发现和工程化中的应用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、异源表达、组合生物合成 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 细菌、真菌、植物 | 生物合成途径工程、组装线巨型合酶工程 | 医药、工业生物技术 |
| 38 | 2025-10-11 |
Dimensions, stability, and deformability of DOPC-cholesterol giant unilamellar vesicles formed by droplet transfer
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19149.3
PMID:40771874
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研究论文 | 本研究通过液滴转移法制备不同胆固醇比例的DOPC巨单层囊泡，并系统分析其尺寸分布、时间稳定性和变形能力 | 首次系统研究胆固醇含量对液滴转移法制备的GUVs物理性质的影响，并采用磁性变形实验评估膜机械性能 | 仅研究了DOPC-胆固醇体系，未涉及其他磷脂组成；变形性测试仅使用磁性方法 | 探究胆固醇对合成磷脂膜模型物理性质的影响机制 | DOPC-胆固醇巨单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 相衬显微镜、磁性变形实验、图像分析 | NA | 图像数据 | 4种不同DOPC-胆固醇比例(100:0, 85:15, 71:29, 60:40)的GUVs样本 | 液滴转移法 | NA | NA | 合成生物学, 微机器人技术 |
| 39 | 2025-10-10 |
Population-level bistability in Pseudomonas aeruginosa quorum sensing
2025-Oct-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01713-25
PMID:40928267
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研究论文 | 本研究通过实验证明了铜绿假单胞菌群体感应系统在群体水平上具有双稳态特性 | 首次实验证实天然群体感应系统具有群体水平的双稳态和滞后特性 | 仅研究了铜绿假单胞菌的LasI/LasR系统及部分QS控制基因 | 验证群体感应系统是否作为基因表达开关在群体水平同步响应 | 铜绿假单胞菌的LasI/LasR群体感应系统 | 合成生物学 | 机会性感染 | 单细胞水平表达测量、数学建模 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 铜绿假单胞菌 | 正自调控信号合酶基因回路、双稳态开关 | 医学、合成生物学 |
| 40 | 2025-10-10 |
Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing
2025-Oct, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003
PMID:40645879
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综述 | 本文系统综述了CRISPR技术在基因组编辑以外的多样化应用及其未来发展前景 | 全面总结了CRISPR技术在分子诊断、生物传感、转录调控等非编辑领域的创新应用 | NA | 探讨CRISPR技术超越基因组编辑的多元化应用场景 | CRISPR-Cas系统及其衍生技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas技术, 单细胞分析, 空间组学, 微流控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 生物传感器, 合成生物学组件 | 医学诊断, 生物技术, 分子成像 |