合成生物学相关文章
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当前共找到 1521 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-25 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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研究论文 | 提出一种逆向工程方法，从线性模型分析推断非线性Hill函数模型的动力学参数，用于设计实现完美适应的生物控制器 | 首次提出将线性系统理论与非线性Hill函数建模相结合进行逆向工程，实现生物网络基序控制器的设计 | 研究仅通过仿真验证了方法的有效性，缺乏实验验证 | 设计能够实现完美适应的合成生物控制器 | 三种基于生物网络基序的控制器 | 系统生物学 | NA | NA | Hill函数模型、线性模型 | 仿真数据 | NA | NA | NA | 生物网络基序控制器 | 合成生物学 |
| 22 | 2026-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 重点介绍基于CRISPR平台的非DSB编辑器BE和PE的开发与创新，探讨改进策略及未来理想编辑器的发展前景 | 系统归纳了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路在BE和PE开发中的应用，并阐述了CRISPR技术创新中的巧妙思维反转与跳跃 | 未具体探讨CRISPR碱基编辑技术在实际应用中可能面临的脱靶效应或伦理问题 | 综述CRISPR碱基编辑技术通过创新策略和思路的进展，展望未来理想编辑器的开发 | 基于CRISPR平台的碱基编辑器（BE）和先导编辑器（PE） | 合成生物学 | NA | CRISPR碱基编辑, 先导编辑, AAV递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 碱基编辑器, 先导编辑器, 小型编辑器 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 23 | 2026-04-25 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
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研究论文 | 利用可重构DNA纳米筏构建合成细胞模型，实现形态重塑和膜通道形成 | 将DNA纳米筏在纳米尺度的重塑与巨型单层囊泡在微米尺度的重塑耦合，通过可编程方式改变囊泡形态，并利用生物孔辅助形成可密封的合成通道 | NA | 探索可重构DNA纳米结构与合成细胞之间的界面，扩展DNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | 信号响应型DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡组成的合成细胞模型 | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 可重构DNA纳米筏网络 | 合成生物学 |
| 24 | 2026-04-23 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 实现了紧密调控、可滴定且具有低重组率和最小基础活性的Cre重组酶系统，并成功应用于缺氧环境下的砷酸盐生物传感 | NA | 开发一种可调控的低速率基因组重组工具，以增强环境生物传感和合成生物学的应用能力 | Escherichia coli（大肠杆菌）中的Cre-lox重组系统 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的低速率基因组重组系统，用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 25 | 2026-04-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SNIPR的合成受体平台，能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能，用于增强工程化治疗细胞的特异性 | 首次将SNIPR受体架构改造为可被可溶性配体激活的平台，实现了低基线活性与高倍数激活，并通过内吞和pH依赖性切割机制工作 | 未明确说明受体平台在复杂生理环境中的长期稳定性及潜在免疫原性问题 | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体，用于精准调控工程化治疗细胞功能 | 合成受体平台（SNIPR）、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA | SNIPR平台 | 哺乳动物细胞 | 可溶性配体激活的合成受体、正交于天然信号通路的细胞间通信网络 | 医学 |
| 26 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺，涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径，并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展，特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺，这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-04-21 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然性质潜力及关键修饰策略，以增强其功能，并讨论了其在生物医学领域的多样化应用 | 通过化学修饰、基因工程和仿生矿化等策略，克服天然铁蛋白的局限性，扩展其功能范围，特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化方面的应用潜力 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化方面的挑战 | 优化铁蛋白纳米颗粒的修饰策略，提高纳米递送系统的稳定性和靶向效率，并整合人工智能和合成生物学等新技术，构建高效、低毒、多功能的纳米递送系统 | 铁蛋白纳米颗粒及其修饰后的衍生物 | NA | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 28 | 2026-04-20 |
Isolation, engineering and ecology of temperate phages from the human gut
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09614-7
PMID:41094135
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研究论文 | 本研究从人类肠道细菌中分离、表征了134个可诱导的前噬菌体，并构建了一个合成微生物组，以探索温和噬菌体在肠道环境中的多样性和功能 | 通过大规模培养和诱导实验，首次系统性地扩展了人类肠道温和噬菌体的实验验证对，揭示了前噬菌体诱导的复杂机制和遗传多样性 | 研究中仅18%的计算预测前噬菌体能在纯培养中被诱导，表明现有预测方法存在局限性，且实验条件可能未完全模拟体内环境 | 研究人类肠道温和噬菌体的多样性、遗传特征及其与宿主细菌的相互作用机制 | 人类肠道细菌分离株中的可诱导前噬菌体 | 微生物学 | NA | 宏基因组学、数据挖掘、培养诱导实验、合成微生物组共培养 | NA | 基因组序列、培养实验数据 | 252个人类肠道细菌分离株 | 合成微生物组构建 | 人类肠道细菌（具体未指定）、Caco2人结肠细胞 | NA | 合成生物学、生物技术、微生物组研究 |
| 29 | 2026-04-20 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文揭示了一种人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 通过结合ADH模块和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性，首次在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物，扩展了异戊二烯类化合物的化学空间 | 未明确提及具体实验规模或下游酶应用的限制 | 研究人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性及其在异戊二烯生物合成中的应用 | ADH模块中的酸磷酸酶PhoN、异戊烯基激酶IPK和下游芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成途径工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 酒精依赖性半萜途径，包括PhoN和IPK酶模块，用于生产烷基焦磷酸盐 | 工业生物技术 |
| 30 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法，通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案，开发了低成本工程培养基，并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 31 | 2026-04-17 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用，以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统，实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制，并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 包括递送、转基因稳定性和在生理相关模型中稳健的时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统 | 心脏、肺、血液和睡眠系统的细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据 | 系统级模型、AI引导的电路设计 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学 |
| 32 | 2026-04-16 |
Advances in synthetic microbial ecosystems approach for studying ecological interactions and their influencing factors
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100205
PMID:41982405
|
综述 | 本文综述了合成微生物生态系统在生态相互作用及其影响因素研究方面的进展 | 系统整合了当前关于合成微生物生态系统的知识，并强调了其相较于自然生态系统的简化性和可控性优势 | NA | 增强对微生物群落相互作用的理解，特别是群落稳定性、关键物种识别和群落结构调控等生态学关键问题 | 合成微生物生态系统及其中的生态相互作用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 33 | 2026-04-16 |
The Kongming defense: Host-pathogen battles take a new face
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100209
PMID:41982408
|
评论 | 本文评论了Kongming细菌防御系统的新机制，该系统利用噬菌体衍生的酶合成dITP，通过消耗NAD+触发宿主免疫，揭示了宿主与病原体间持续的进化军备竞赛 | 首次揭示了Kongming防御系统利用噬菌体酶合成dITP并触发NAD+消耗的独特免疫机制，以及噬菌体相应进化出对抗策略 | NA | 探讨细菌免疫系统与噬菌体之间的进化相互作用机制 | 细菌防御系统（特别是Kongming系统）与噬菌体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |
| 34 | 2026-04-16 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
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综述 | 本文综述了跨学科增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用，并展望了如何将打印响应性生物材料整合到日常物品和建筑中以改善环境和人类健康 | 提出了将打印响应性生物材料集成到日常产品和建筑环境中的新愿景，强调通过生物、化学或物理过程实现环境交互的多感官互动新时代 | NA | 探索增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用及其在环境和健康领域的整合潜力 | 响应性生物材料及其在增材制造中的应用 | NA | NA | 增材制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 医学, 建筑 |
| 35 | 2026-04-16 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
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综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物通过多种信号通路调节宿主免疫的机制，并探讨了基于这些代谢物的新兴治疗策略 | 整合了空间代谢组学、合成生物学和纳米医学的最新进展，提出了时空递送免疫调节代谢物的新治疗途径，并展望了结合多组学和AI预测模型的个性化调控方向 | NA | 阐明肠道微生物代谢物在免疫调节中的作用机制并探索其治疗应用前景 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生吲哚等）及其对宿主免疫系统的影响 | NA | 炎症性和自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、合成生物学、纳米医学、多组学、AI驱动预测建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 36 | 2026-04-16 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
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研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一种低成本、开源、基于喷墨技术的第二代DNA合成器，旨在实现实验室环境中灵活且低成本的寡核苷酸合成 | OpenIDS2通过3D打印机械组件、定制PCB集成控制电子和蠕动泵批量溶液输送系统，显著减小设备体积、提高操作稳定性和制造可及性，增强了开源硬件平台的再现性和全球可访问性 | NA | 开发一种低成本、开源的DNA合成平台，以降低实验室自动化的入门门槛 | DNA合成器（OpenIDS2）及其在寡核苷酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 喷墨技术、磷酸胺化学、尿素-PAGE、HPLC | NA | NA | 成功合成了15-mer poly(dT)序列在CPG基板上 | 3D打印、定制PCB | NA | NA | 合成生物学、分子诊断、生物技术 |
| 37 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增，旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力，并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别，这是一种新的策略 | 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增，但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作，且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增，表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 | 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌） | 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP，并测试过表达限速基因GcpE | 医学 |
| 38 | 2026-04-13 |
Using the Droplet Transfer Method to Reliably Prepare Giant Unilamellar Vesicles
2025-09-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68340
PMID:41052083
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠制备巨型单层囊泡（GUVs）的液滴转移方法，并提供了详细的实验协议和关键参数分析 | 提出了针对GUV制备中关键参数的系统性指南，包括成本有效的氧气和湿度控制措施，以及一次性去除油相的简便方法 | 方法可能因不同磷脂和油的选择而需要调整，且对初学者可能存在学习曲线 | 优化GUVs的制备方法，以促进其在合成生物学和微机器人等领域的应用 | 巨型单层囊泡（GUVs）的制备过程 | 合成生物学 | NA | 液滴转移方法（倒置乳液法） | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 微机器人 |
| 39 | 2026-04-12 |
Efficient Sampling of Genetically Encoded Biosensor Design Space Enabled with a Design of Experiments and Automation Workflow
2025-10-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68448
PMID:41182995
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研究论文 | 本文提出了一种结合高通量自动化和计算方法的流程，用于高效采样基于变构转录因子的生物传感器设计空间，以生成具有数字和模拟剂量响应曲线的不同配置 | 采用实验设计算法和高通量自动化平台，实现生物传感器组合设计空间的高效统计映射和分数采样，优化筛选策略 | NA | 开发和优化生物传感器系统及遗传电路，为合成生物学社区提供调控工具包 | 基于变构转录因子的生物传感器设计空间 | 合成生物学 | NA | 实验设计算法、高通量自动化平台、效应物滴定分析 | NA | 表达数据、组合设计空间映射 | NA | 自动化平台 | 微生物（如用于酶优化、菌株开发） | 基于变构转录因子的生物传感器，包括启动子和核糖体结合位点库，具有数字和模拟剂量响应曲线 | 工业生物技术、酶优化、菌株开发、微生物过程控制 |
| 40 | 2026-04-10 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体必需的tRNA修饰酶，揭示了其最小翻译系统的组成与功能 | 首次系统鉴定了顶质体定位的tRNA修饰酶，并证明其中6个催化反密码子环修饰的酶对寄生虫生存和细胞器维持至关重要 | 有两个基因无法被敲除，其中一个可能具有顶质体外的必需功能，另一个的作用机制尚未完全阐明 | 阐明恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其对细胞器维持的影响 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |