合成生物学相关文章
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当前共找到 1525 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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| 21 | 2026-02-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调控基因表达的潜力，特别是在ALOX5基因中的应用 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应来优化核糖开关功能，并开发了能够切换5-LO野生型与缺失外显子13的异构体表达的新型核糖开关剪接概念 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型 | 研究合成核糖开关在调控哺乳动物细胞中基因表达和异构体切换的潜力与优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因（ALOX5）在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控、核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | 使用HEK293细胞系 | 合成核糖开关、基因编辑 | 哺乳动物细胞（HEK293） | 四环素核糖开关控制的盒式外显子系统，用于调控选择性剪接和异构体切换 | 医学、合成生物学 |
| 22 | 2026-02-28 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一新兴领域，整合化学、生物学、物理学和工程学方法，以合成和操纵脂质及生物膜来理解其复杂性质与功能 | 首次将跨学科研究系统化为“合成脂质生物学”框架，强调通过构建与分析脂质及膜系统来深化理解，类比合成生物学的核心理念 | NA | 通过合成、编辑和检测脂质及生物膜，揭示其性质、行为和功能，以应对脂质生物学复杂性 | 脂质分子、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2026-02-27 |
Advances and Future Perspectives of Synechocystis sp. as a Microbial Cell Factory for Biomanufacturing
2025-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70162
PMID:41311002
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综述 | 本文综述了集胞藻作为微生物细胞工厂在生物制造中的最新进展、面临的挑战及未来研究方向 | 整合了生物信息学概述与合成生物学应用的最新进展，并提出了规模化、工业化及组学策略整合的未来方向 | NA | 推动蓝藻在工业生物技术中的应用，促进可持续、低碳、高效的生物生产系统发展 | 集胞藻 | 工业生物技术 | NA | 组学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学设计 | 集胞藻 | NA | 工业生物技术 |
| 24 | 2026-02-26 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
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研究论文 | 本研究解析了α-羧化体内部碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA的六聚体三聚体结构，证明其封装不依赖锌离子和连接蛋白CsoS2，并阐明了其在羧化体内部连接Rubisco与外壳的桥梁作用 | 研究主要基于合成微型外壳和细菌模型，体内完整羧化体的动态组装过程仍需进一步验证 | 阐明α-羧化体中碳酸酐酶的结构特征及其在微区室内的封装机制 | 化能自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧化体碳酸酐酶CsoSCA | 结构生物学 | NA | 分子结构解析、合成微型外壳技术 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学技术 | Halothiobacillus neapolitanus（化能自养细菌） | 羧化体微区室封装系统（包含Rubisco和碳酸酐酶的半透性蛋白质外壳） | 合成生物学、生物技术 |
| 25 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 26 | 2026-02-25 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 本文提出了一种名为Toehold-VISTA的机器学习框架，用于快速设计高性能RNA传感器，并成功应用于针对SARS-CoV-2 RNA的传感器设计 | 结合生物物理建模与机器学习（PLS-DA框架），通过高通量实验数据训练预测模型，实现了对RNA传感器性能关键决定因素的捕捉与优化设计 | NA | 加速RNA传感器的设计与工程化，解决传统设计方法耗时长的挑战 | RNA传感器（以toehold switches为模型）与靶标RNA（如SARS-CoV-2 RNA）的相互作用 | 机器学习 | NA | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、生物物理建模 | PLS-DA（偏最小二乘判别分析） | RNA序列与结构数据 | NA | NA | NA | RNA传感器（toehold switches） | 生物技术、诊断应用 |
| 27 | 2026-02-24 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子，系统表征了Komagataella phaffii中Mxr1转录因子的九个氨基酸反式激活结构域（9aaTADs）的功能与机制 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面鉴定21个推测的9aaTADs，发现其中10个具有功能，并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制激活转录 | 研究主要基于Δmxr1突变株的体外功能验证，体内生理环境下的调控网络及与其他转录因子的相互作用尚未完全阐明 | 探究K. phaffii中Mxr1转录因子的9aaTADs结构域的功能特性与分子机制 | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母）的Mxr1转录因子及其9aaTADs结构域 | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除株功能互补、靶基因转录激活分析 | NA | 分子生物学实验数据 | 21个推测的9aaTADs结构域（包括TAD A-V） | 合成生物学设计（合成转录因子构建） | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母） | 由Mxr1ZF DNA结合域与串联9aaTADs组成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 28 | 2026-02-22 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
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综述 | 本文综述了通过相分离驱动的合成生物分子凝聚体（SBMCs）的最新进展，包括其构建原理、调控方法以及在基础与应用研究中的潜力 | 利用合成生物学方法从头合成生物分子凝聚体，并系统阐述其内在构建原理、调控方法及在染色体结构、疾病机制、生物制造等领域的应用 | 对生物分子凝聚体的内部组织和外部调控机制的理解仍处于早期阶段，未来在生物材料、生物技术和生物医学领域仍面临机遇与挑战 | 探讨合成生物分子凝聚体的构建方法、调控机制及其在基础科学与应用研究中的潜力 | 合成生物分子凝聚体（SBMCs） | 合成生物学 | 肿瘤发生、衰老 | 相分离、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物材料、生物技术、生物医学、药物递送、人工细胞设计、生物制造 |
| 29 | 2026-02-21 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本文展示了如何将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚物界面结合，以控制液-液相分离隔室的性质 | 首次将细菌微区室壳蛋白与由内在无序域形成的蛋白质凝聚物界面结合，开发出可完全编码的涂层系统，用于控制凝聚物的表面性质和稳定性 | 涂层形成依赖于pH和蛋白质浓度，且一旦形成后不与稀相交换，可能限制了动态调控的灵活性 | 开发用于合成细胞和细胞器的可控液-液相分离隔室系统 | 细菌微区室壳蛋白（来自Haliangium ochraceum的BMC-H）与工程化RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、液-液相分离技术 | NA | NA | NA | 基因融合、蛋白质工程 | NA | 蛋白质涂层系统（BMC-H-T2变体在液滴表面形成稳定涂层，防止液滴合并） | 合成生物学、生物医学工程 |
| 30 | 2026-02-19 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能，并首次在拟南芥中验证了该模块的调控机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制，并利用异源表达策略验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证，尚未在小麦本物种中完成完整功能验证 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制，开发增强作物耐冷性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号（Dn1）及转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | NA | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS和MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化指标数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥植株（具体数量未明确说明） | 转基因技术 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | tae-miR164-TaNAC6A基因调控模块 | 农业 |
| 31 | 2026-02-19 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了DNA纳米结构在刺激响应性药物递送和多模态生物传感方面的最新进展 | 系统分析了DNA纳米结构的模块化设计策略、稳定性改进（如PEG功能化）以及针对癌症特异性生物标志物的多配体靶向能力，并展望了与人工智能设计工具的未来整合 | 仍存在规模化制造瓶颈、免疫相容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等关键转化挑战 | 解决精准医学中靶向药物递送和生物医学成像的关键挑战 | DNA工程纳米结构（包括基于瓦片的组装体、折纸框架、球形核酸和刺激响应性水凝胶） | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术、FRET、电化学发光放大电路、SERS、细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应性药物递送系统、多模态生物传感器 | 医学 |
| 32 | 2026-02-18 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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综述 | 本文全面总结了植物异戊烯基转移酶的多样性、催化活性、机制及其在异源生产异戊烯化天然产物中的应用 | 系统回顾了超过160种已报道的植物UbiA型异戊烯基转移酶和代表性异戊烯二磷酸合酶，填补了植物异戊烯基转移酶功能多样性理解的不足 | NA | 推进植物异戊烯基转移酶的表征和应用，为基于异戊烯化天然产物的药物开发奠定基础 | 植物异戊烯基转移酶和异戊烯化天然产物 | NA | NA | 植物基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 33 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属（类）抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制，并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 34 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合，用于生物通路预测分析，特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中，以模拟人类思维过程并增强决策，为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大，整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识，以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型，促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |
| 35 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
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综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略，重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性，并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用，以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母（酿酒酵母） | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 36 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq，利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需，仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶，并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序（NGS）、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 37 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
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综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展，重点探讨了其与宿主（细菌和真核细胞）的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证，且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主（包括哺乳动物组织）的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌（噬菌体天然宿主）、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 38 | 2026-02-14 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 开发了一种名为IMPACT的新框架，通过聚合物介导的空间控制方法，实现CAR-T细胞在肿瘤微环境中的特异性激活 | 首次将合成生物学与生物材料方法结合，创建了聚合物介导的IF-THEN门控CAR-T细胞系统，实现解剖学水平的空间控制 | 目前仅在小鼠肿瘤模型中进行了验证，尚未在人体临床试验中测试 | 提高CAR-T细胞疗法的特异性，减少脱靶毒性 | CAR-T细胞、肿瘤归巢聚合物、小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学方法、生物材料工程 | NA | 实验数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | T细胞 | IF-THEN门控电路：当工程化细胞与肿瘤定位聚合物结合（IF条件）后，驱动特定蛋白在肿瘤内选择性表达（THEN条件） | 医学 |
| 39 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统，以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂，用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境，并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台，以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性，并推动临床转化 | 工程化微生物系统（如大肠杆菌Nissle 1917）及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据（389篇同行评审研究） | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路，用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 40 | 2026-02-11 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 本文综述了用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂的挑战、构建策略及最新技术，特别关注了理性与非理性策略的应用 | 聚焦于原核细胞工厂在芳香族氨基酸衍生化学品生产中的独特优势，系统总结了结合理性与非理性策略的构建方法，并探讨了该领域的未来潜在方向 | 本文是一篇综述，不包含原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和分析 | 为生产芳香族氨基酸衍生化学品的专用细胞工厂的构建与优化提供有价值的见解和指导 | 用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核细胞 | NA | 工业生物技术 |