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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-11-14 |
Systematic and synthetic biology insights into copper homeostasis in Escherichia coli
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113715
PMID:41210969
|
研究论文 | 通过系统与合成生物学方法研究大肠杆菌铜稳态调控机制 | 揭示了Cus系统特异性响应Cu⁺而非Cu²⁺,发现CusR存在信号串扰导致基线表达,并阐明CusS根据铜存在状态兼具激酶和磷酸酶功能 | NA | 阐明大肠杆菌铜稳态调控机制 | 大肠杆菌铜稳态调控系统(cueR和cus) | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 铜稳态调控网络 | 工业生物技术 |
| 382 | 2025-11-14 |
Rational Construction of a Robust Bacillus amyloliquefaciens Cell Factory for Acid-Stable α Amylase Production
2025-Nov-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04227
PMID:41165493
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了能够高效生产耐酸α-淀粉酶的解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 建立了高效的CRISPR-nCas9编辑流程,理性删除了导致细胞自溶的前噬菌体基因簇和阻碍外源蛋白表达的次级代谢生物合成基因簇 | 研究主要针对解淀粉芽孢杆菌,结果在其他底盘细胞中的适用性需要进一步验证 | 开发高效的工业蛋白生产底盘细胞 | 解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | CRISPR-nCas9基因编辑,分批补料发酵 | NA | NA | 5升发酵规模 | CRISPR-Cas9 | 解淀粉芽孢杆菌 | 前噬菌体基因簇删除,次级代谢生物合成基因簇优化 | 工业生物技术 |
| 383 | 2025-11-14 |
From Plants to Microbes: Harnessing Enzyme Promiscuity for Natural Product Synthesis
2025-Nov-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c09273
PMID:41171120
|
综述 | 系统探讨酶混杂性在微生物天然产物合成中的表现及缓解策略 | 首次系统剖析酶混杂性在微生物天然产物生物合成中的双重作用并评估当代缓解策略 | 未涉及具体实验验证,主要基于文献综述 | 推进对酶混杂性机制的理解并建立高效生物合成平台基础框架 | 植物和微生物系统中的酶混杂性现象 | 合成生物学 | NA | 生物催化、生物合成、蛋白质工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 天然产物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 384 | 2025-11-14 |
Engineering artificial biosynthetic pathways for efficient microbial production of psilocybin and psilocin
2025-Nov-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.11.002
PMID:41202968
|
研究论文 | 本研究通过设计和优化人工生物合成途径,在大肠杆菌中实现了裸盖菇素和脱磷酸裸盖菇素的高效微生物生产 | 开发了绕过天然途径中CYP450羟化酶(PsiH)瓶颈的人工生物合成途径,创下了裸盖菇素生产的最高记录 | NA | 开发高效的微生物生产方法以替代从天然蘑菇中提取裸盖菇素 | 裸盖菇素和脱磷酸裸盖菇素 | 合成生物学 | 抑郁症 | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 人工生物合成途径,代谢途径工程 | 医药 |
| 385 | 2025-11-14 |
Biotransformation of Pesticides across Biological Systems: Molecular Mechanisms, Omics Insights, and Biotechnological Advances for Environmental Sustainability
2025-Nov-04, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c06484
PMID:41210834
|
综述 | 全面探讨农药在不同生物系统中的生物转化机制、关键酶类、环境影响因素及生物技术应用 | 整合组学技术和合成生物学最新进展,系统分析农药生物转化产物的环境归趋 | 存在未解决的科学问题和技术挑战,部分转化产物的环境行为尚不明确 | 阐明农药生物转化机制以减轻化学污染,促进环境可持续发展 | 有机磷、有机氯和三嗪类农药在微生物、植物和动物系统中的生物转化过程 | 环境生物技术 | NA | 组学技术(omics)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物、植物、动物 | 增强降解能力的工程化设计 | 环境、农业 |
| 386 | 2025-11-14 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
|
研究论文 | 本文探讨在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计,在大肠杆菌和酵母线粒体中实现部分固氮酶重构,并通过低氧环境规避氧敏感性限制 | 尚未完全解决能量需求高和氮水平反馈调节的问题 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在非豆科植物中的功能表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、人工智能辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 固氮酶代谢通路重构 | 农业, 环境 |
| 387 | 2025-11-14 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
|
综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的研究进展与挑战 | 提出通过同时编辑饲料作物和瘤胃产甲烷古菌基因组来减少甲烷排放的创新策略 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等方面的挑战 | 开发可持续农业中减少反刍动物甲烷排放的有效解决方案 | 反刍动物、饲料作物、瘤胃产甲烷古菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 产甲烷途径干扰、脂质和次级代谢物合成途径增强 | 农业, 环境 |
| 388 | 2025-11-14 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
|
研究论文 | 开发了一种内含子优化的双碱基编辑器,用于增强构巢曲霉中棘球白素B的耐受性并优化调控回路 | 采用真菌内含子策略阻断大肠杆菌中的翻译,开发了PAM-less SpRY-CABE系统,实现了高效双碱基编辑 | NA | 解决棘球白素B生产中的调控机制理解不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其棘球白素B生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(CABE)、启动子诱变、发酵优化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 双碱基编辑器 | 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 调控回路优化、启动子工程、β-1,3-葡聚糖合成酶进化 | 工业生物技术, 医药 |
| 389 | 2025-11-14 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-Oct-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
|
perspective | 提出新的分类概念来描述非树状进化模式的生物体 | 引入epaktovars和xenotypes两个互补概念,为描述水平基因转移导致的进化模式提供新框架 | 概念性论文,缺乏实证数据验证 | 澄清和统一描述非树状进化生物体的术语 | 具有水平基因转移特征的生物体 | 进化生物学 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 灭绝物种重建 |
| 390 | 2025-11-14 |
Biparental plastid inheritance and its implications in plastid genome engineering
2025-Oct-10, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03631-6
PMID:41073605
|
综述 | 本文综述了植物质体双亲遗传的机制及其在质体基因组工程中的应用潜力 | 系统探讨了通过调控遗传和环境因素将母系质体遗传转变为双亲遗传的机制,及其在植物适应性和质体工程中的重要意义 | 质体双亲遗传机制相对研究不足,许多具体分子机制尚不明确 | 探讨质体遗传模式(特别是双亲遗传)的机制、进化意义及在植物工程中的应用 | 植物质体(叶绿体)和线粒体的遗传模式 | 植物遗传学 | NA | 质体基因组工程 | NA | 文献综述数据 | 约20%的被子植物表现出双亲质体遗传 | NA | 被子植物 | NA | 农业,合成生物学 |
| 391 | 2025-11-14 |
Engineering microorganisms for enhanced tolerance to toxic end-products and intermediates
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf053
PMID:41137716
|
综述 | 系统概述通过合成生物学策略增强微生物对有毒终产物和中间体耐受性的方法 | 全面总结细胞包膜工程、胞内组分工程和胞外工程等多元化的耐受性增强策略 | NA | 促进有毒终产物和中间体微生物生产的工业转化和商业化 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 392 | 2025-11-14 |
Biotechnological advancements enabling cannabinoid biosynthesis in engineered fungi: a mini review
2025, Frontiers in fungal biology
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/ffunb.2025.1660661
PMID:41209486
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程技术在工程真菌中生物合成大麻素的最新进展 | 利用工程真菌作为大麻素生物合成的替代生产平台,克服传统植物提取的限制 | 面临产物毒性、代谢负担和监管考虑等持续挑战 | 探索大麻素微生物生物合成的生物技术进展 | 工程真菌中的大麻素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑、代谢工程、途径重建 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 真菌 | 大麻素生物合成途径 | 医药、保健品、工业生物技术 |
| 393 | 2025-11-14 |
Prokaryotic homeostasis - a solution to thrive and survive
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1704789
PMID:41209587
|
综述 | 本文探讨原核生物通过复杂调控机制维持细胞内稳态的能力及其科学应用价值 | 系统性地将细菌确立为单细胞稳态研究的理想模型,并阐明其稳态调控网络在合成生物学和抗菌治疗中的转化潜力 | 未涉及具体实验验证或定量分析,主要为理论框架梳理 | 解析细菌维持内外环境稳态的分子机制及其应用意义 | 原核生物(细菌)的稳态调控系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 稳态调控网络(包括转录网络、第二信使系统、DNA拓扑结构调控) | 医学, 工业生物技术 |
| 394 | 2025-11-13 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
|
研究论文 | 本研究开发了用于哺乳动物基因组工程和分子记录的标准化启动子和gRNA支架元件库 | 创建了首个针对哺乳动物系统的标准化遗传元件库,包含数千个经过验证的高效编辑元件 | 研究主要在人源和小鼠细胞系中进行验证,尚未在更多生物模型或体内环境中测试 | 开发用于哺乳动物系统基因组工程和分子记录的标准化遗传元件工具 | 聚合酶III启动子和引导RNA(gRNA)支架的变体库 | 合成生物学 | NA | 多重prime editing、饱和突变筛选 | NA | 基因组编辑效率数据 | 人类和小鼠细胞系 | CRISPR-Cas9, prime editing | 人类细胞, 小鼠细胞 | 分子记录阵列、十键阵列、复杂遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 395 | 2025-11-12 |
A Comprehensive Review on Engineering Lactic Acid Bacteria: Emerging Genetic Tools and Synthetic Biology Strategies
2025-Nov-10, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70079
PMID:41215480
|
综述 | 本文系统综述了乳酸菌基因工程和合成生物学策略的最新进展及其在食品、医药和环境领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统等新兴基因编辑工具和合成生物学方法在乳酸菌工程化中的应用前景 | 存在质粒不稳定性、代谢负担和监管障碍等技术挑战 | 探讨通过基因工程和合成生物学策略增强乳酸菌功能性的方法 | 乳酸菌(如乳酸杆菌和乳酸球菌)的基因组结构和代谢特性 | 合成生物学 | NA | 电穿孔、接合转移、CRISPR-Cas系统、基因电路、核糖开关、生物传感器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸菌, Lactobacillus, Lactococcus | 基因电路、生物传感器、代谢途径优化 | 食品, 医药, 环境, 工业生物技术, 农业 |
| 396 | 2025-11-11 |
Characterization of recombinase activity across cellular growth phases
2025-Aug-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17024-y
PMID:40855116
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研究论文 | 研究细菌生长阶段如何影响重组酶Bxb1介导的DNA修饰效率 | 首次系统揭示静止期重组酶活性特征及诱导时机对重组效率的优化作用 | 仅使用大肠杆菌和Bxb1重组酶作为模型系统 | 探索细菌生长阶段对重组酶活性的影响机制 | 大肠杆菌和丝氨酸重组酶Bxb1 | 合成生物学 | NA | 遗传工程系统、重组效率定量分析 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 遗传工程系统 | 大肠杆菌 | 重组酶介导的DNA修饰系统 | 生物医学研究, 基因治疗, 合成生物学 |
| 397 | 2025-11-10 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2025-Oct-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
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研究论文 | 报道世界首例基因编辑猪辅助肝异种移植到活人体的成功案例,患者存活达171天 | 首次实现基因编辑猪到活人体肝脏异种移植,使用10基因编辑平台,突破合成生物学在临床移植中的界限 | 术后出现异种移植相关血栓性微血管病,反复上消化道出血导致患者死亡 | 探索猪到人肝脏异种移植作为人类肝移植桥梁方法的可行性 | 患有大型肝细胞癌且不适合根治性切除的患者 | 合成生物学 | 肝细胞癌 | 基因编辑 | NA | 临床监测数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9 | 猪 | 敲除异种抗原基因,敲入7个人类转基因以实现免疫和凝血兼容性 | 医学 |
| 398 | 2025-11-09 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
|
研究论文 | 本研究通过重构真菌β-氧化样酶级联反应,优化了免疫抑制剂霉酚酸的生产途径 | 首次在真菌天然产物生物合成中实现了完整β-氧化样酶级联反应的功能重构 | 研究仅针对特定真菌菌株,未验证在其他宿主中的普适性 | 优化免疫抑制剂霉酚酸的生物合成途径 | 短密青霉菌NRRL864及其β-氧化酶系统 | 合成生物学 | 免疫抑制治疗 | 体外酶活性测定、途径工程 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | NA | 途径优化、基因过表达 | 短密青霉菌 | β-氧化样代谢途径,包含氧化、脱氢、水合、还原、异构化和逆克莱森缩合反应 | 医药 |
| 399 | 2025-11-09 |
[Application and prospects of synthetic biology in the genetic improvement of rice]
2025-Oct-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250347
PMID:41203287
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综述 | 系统总结合成生物学在水稻遗传改良中的应用进展与突破成果 | 通过模块化、标准化和系统化方法实现精准基因组和代谢途径工程,有效克服传统育种周期长和性状改良能力受限的局限性 | NA | 探讨合成生物学在水稻遗传改良中的应用前景 | 水稻遗传改良 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、遗传电路设计、代谢工程、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 遗传电路设计、代谢途径工程 | 农业 |
| 400 | 2025-11-09 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 本文介绍了转酮醇酶的生物物理和结构研究协议,包括活性分析、催化机制和结构研究方法 | 提供了一套全面的转酮醇酶研究工具包,整合了稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测和快速动力学研究等多种光谱和生物物理技术 | NA | 深入理解转酮醇酶的机制和结构,促进其在酶学、合成生物学和药物开发等领域的应用 | 转酮醇酶及其催化机制 | 酶学 | 癌症、代谢疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、辅因子结合研究、催化中间体检测、快速动力学研究、光谱技术、生物物理技术 | NA | 生物物理数据、结构数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发、生物催化、合成生物学 |