合成生物学相关文章
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当前共找到 435 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-01-19 |
CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00632
PMID:39680738
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综述 | 本文综述了过去五年中开发的大片段DNA整合方法，特别关注新兴的CRISPR相关技术 | 重点介绍了CRISPR相关的同源定向修复（HDR）、CRISPR-转座酶和CRISPR-重组酶策略，这些策略有望革新复杂疾病的基因治疗 | 现有技术在整合大片段基因时面临效率低、脱靶效应和高成本的问题 | 开发能够精确插入千碱基大小DNA片段到哺乳动物基因组中的高效工具，以支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用 | 大片段DNA的整合 | 基因编辑 | 复杂疾病 | CRISPR/Cas, HDR, CRISPR-转座酶, CRISPR-重组酶 | NA | NA | NA |
| 382 | 2025-01-19 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
|
研究论文 | 本文研究了种子植物中跨生物体独脚金内酯（SLs）的生物合成进化 | 揭示了CYP722A在将CLA转化为非经典SLs中的关键作用，并提出了16-OH-CLA作为经典SLs进化中的代谢中间体的假设 | 研究主要集中在开花植物中的SLs生物合成，未涵盖所有种子植物 | 探讨独脚金内酯在种子植物中的生物合成进化及其功能 | 种子植物中的独脚金内酯及其生物合成途径 | 植物生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 383 | 2025-01-16 |
Synthetic biology for the food industry: advances and challenges
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2340530
PMID:38797660
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综述 | 本文综述了合成生物学在食品工业中的最新进展和应用，包括传统食品、功能性食品和绿色食品的替代品 | 探讨了合成生物学技术在食品工业中的应用，特别是在创建适合食品工业生产的细胞工厂和将可再生原料转化为重要食品成分、功能性食品添加剂和营养化学品方面的创新 | 未具体提及研究中存在的局限性 | 解决食品工业面临的问题，确保安全、营养和可持续的食品供应 | 食品工业中的传统食品、功能性食品和绿色食品 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 384 | 2025-01-16 |
Recent advances in genome mining and synthetic biology for discovery and biosynthesis of natural products
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2383754
PMID:39134459
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综述 | 本文综述了基因组挖掘和合成生物学在天然产物发现和生物合成中的最新进展 | 结合基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程和系统生物学，提出了解决天然产物生产中多样性不足、效率低下和产量低等挑战的新方法 | NA | 探讨基因组挖掘和合成生物学在天然产物生产中的应用，以解决传统方法的效率低下和成本高昂问题 | 天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程、系统生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 385 | 2025-01-16 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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研究论文 | 本文研究了丹参根皮细胞中丹参酮的运输机制，发现ABC转运蛋白SmABCG1在丹参酮ⅡA和丹参酮Ⅰ的外排中起关键作用 | 首次发现ABC转运蛋白SmABCG1在丹参酮运输中的作用，并揭示了其与丹参酮生物合成基因CYP76AH3的潜在调控关系 | 研究主要基于丹参毛状根模型，未在完整植株中验证SmABCG1的功能 | 探究丹参酮从丹参根皮细胞向外运输的分子机制 | 丹参根皮细胞及其中的丹参酮 | 植物代谢工程 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 丹参毛状根及培养液样本 |
| 386 | 2025-01-15 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
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review | 本文综述了甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性，并利用drugCIPHER算法预测其药理活性，同时回顾了利用合成生物学方法生物制造甘草三萜类化合物的进展和策略 | 本文不仅总结了甘草三萜类化合物的整体特性，还预测了其药理活性，并提出了利用合成生物学方法进行生物制造的新策略 | 本文主要集中于甘草三萜类化合物的综述，可能未涵盖所有相关研究的最新进展 | 研究甘草三萜类化合物的结构、药理活性及其生物制造方法 | 甘草三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | drugCIPHER算法 | NA | NA |
| 387 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
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研究论文 | 本文描述了使用模块化克隆系统MoClo组装多基因构建体的协议 | 利用MoClo系统进行多基因构建体的组装，通过一系列的一锅法组装步骤实现，提高了构建效率并促进了构建体变体库的生成 | NA | 开发一种高效的多基因构建体组装方法，以支持生物学研究和合成生物学 | 多基因构建体 | 合成生物学 | NA | MoClo系统 | NA | DNA序列 | NA |
| 388 | 2025-01-15 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
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研究论文 | 本文介绍了一种用于创建SBOL表示的软件工具，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个软件工具，用于创建SBOL表示的构建计划，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 未提及具体限制 | 开发一种软件工具，用于标准化Golden Gate组装元数据的表示 | 合成生物学中的DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA |
| 389 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了使用Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件的协议 | 提供了克隆MoClo标准部件的详细步骤，包括定义部件类型、设计引物、PCR扩增、Golden Gate克隆和测序 | 对于大型标准部件，需要先克隆子部件作为中间体，增加了复杂性 | 开发高效的DNA组装方法以促进合成生物学领域的研究 | MoClo标准部件（level 0模块） | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、PCR | NA | DNA序列 | NA |
| 390 | 2025-01-15 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的方法 | 利用声波分配器在nL范围内转移液体，实现了Golden Gate克隆反应的微型化和并行化，减少了塑料废物和试剂使用 | NA | 提高Golden Gate克隆反应的效率和可持续性 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
| 391 | 2025-01-15 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的纳米孔扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了一种名为DuBA.flow的工作流程，用于从单个菌落到最终易于解读的测序报告的全过程验证 | NA | 验证Golden Gate组装的高阶组合复杂性 | Golden Gate组装的高阶组合 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 392 | 2025-01-15 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
|
研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源的Python包，用于自动化Golden Gate组装，以减少复杂DNA构建的失败率、资源消耗和培训需求 | AssemblyTron提供了低成本的自动化解决方案，使用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人，扩展了Golden Gate组装的能力，包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变体库组装和模块化克隆索引质粒库组装 | NA | 提高Golden Gate组装的自动化水平，降低复杂DNA构建的失败率和资源消耗 | Golden Gate组装技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装，易错PCR | NA | NA | NA |
| 393 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并提出了辅助寡核苷酸设计的G-GArden工具 | 提出了基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并开发了辅助设计的G-GArden工具 | NA | 开发一种快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的小RNA（sRNAs） | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 394 | 2025-01-15 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
|
研究论文 | 本文介绍了一种无细胞转录和翻译（TXTL）系统中快速生成线性DNA模板的Golden-Gate辅助工作流程 | 通过Golden-Gate组装和PCR扩增，无需克隆步骤，快速生成功能性DNA模板，显著加速合成生物学中的设计-构建-测试-学习周期 | 未提及具体实验样本量或数据集的详细信息 | 开发一种快速生成线性DNA模板的方法，用于无细胞转录和翻译系统中的基因调控元件和电路测试 | 线性DNA模板，包括启动子、核糖体结合位点（RBS）、编码序列和终止子等基本遗传部分 | 合成生物学 | NA | Golden-Gate组装、PCR扩增 | NA | DNA序列 | NA |
| 395 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
|
研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中用于转基因表达的遗传盒的组装 | 使用Golden Gate克隆和模块化克隆（MoClo）标准化合成生物学工作流程，简化了遗传元件的组装 | NA | 开发快速高效的克隆策略，用于组装新的转录单元或整个通路 | 单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆（MoClo） | NA | NA | NA |
| 396 | 2025-01-15 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
|
综述 | 本文综述了低渗透性土壤中微生物适应和基因工程方法在增强生物修复效果方面的最新知识 | 整合了微生物适应和基因工程策略，提供了全面的概述，指导当前实践和未来研究 | NA | 提高低渗透性土壤中的生物修复效果 | 低渗透性土壤中的微生物 | 环境科学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 397 | 2025-01-15 |
Electro-bioremediation of wastewater: Transitioning the focus on pure cultures to elucidate the missing mechanistic insights upon electro-assisted biodegradation of exemplary pollutants
2025-Jan, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.123726
PMID:39729711
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研究论文 | 本文探讨了通过纯培养研究电生物修复技术对特定污染物的降解机制，以填补现有研究中的知识空白 | 从混合培养转向纯培养研究，以揭示电辅助生物降解的机制，并提出通过基因组注释、转录动力学等方法优化微生物水平的降解效率 | 目前关于纯培养的电生物降解机制研究较少（少于40项），且主要集中在降解潜力而非机制解析 | 研究电生物修复技术在废水处理中的应用，特别是通过纯培养揭示降解机制 | 含氮、磷、硫化合物、碳氢化合物、金属和偶氮染料等典型水污染物 | 环境工程 | NA | 基因组注释、转录动力学、合成生物学、数学建模 | NA | 分子水平数据（基因、酶、蛋白质、代谢物） | 少于40项研究 |
| 398 | 2025-01-14 |
Cardiomyocyte engineering: The meeting point of transcription factors, signaling networks, metabolism and function
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14271
PMID:39801134
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review | 本文综述了直接心脏重编程或转分化在再生治疗、心血管疾病建模和药物发现中的最新进展 | 特别关注了合成生物学，尤其是CRISPR系统在将特定成纤维细胞亚群转化为心肌细胞方面的潜力 | 尽管有多种新方法被开发，获得功能性和代谢成熟的心肌细胞仍然是一个挑战 | 探讨心脏成纤维细胞的功能和多样性，以及体外人类心肌细胞模型的替代细胞来源 | 心脏成纤维细胞和诱导的心肌细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |
| 399 | 2025-01-14 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins的结构多样性、作用机制及其在抗菌耐药性背景下的治疗潜力 | 强调了cathelicidins作为抗菌肽在抗菌耐药性日益严重的背景下作为传统抗生素替代品的潜力 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的结构多样性、作用机制及其在治疗感染、炎症性疾病和癌症中的潜力 | 农场动物中的cathelicidins | 生物医学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2025-01-13 |
Expression of Viral DNA Polymerase in Synthetic Recombinant Adeno-Associated Virus Producer Cell Line Enhances Full Particle Productivity
2025-Feb, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28885
PMID:39578398
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研究论文 | 本文介绍了一种通过表达HSV-1 DNA聚合酶来提高重组腺相关病毒（rAAV）生产效率和完整颗粒含量的合成生物学策略 | 通过将HSV-1的DNA聚合酶复合物编码序列整合到HEK293细胞系中，显著提高了rAAV基因组的扩增效率和完整颗粒含量 | 研究仅针对rAAV2和rAAV8两种血清型，未验证其他血清型的效果 | 提高重组腺相关病毒的生产效率和完整颗粒含量，以满足基因治疗中日益增长的临床需求 | 重组腺相关病毒（rAAV） | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略，HSV-1 DNA聚合酶表达 | NA | NA | HEK293细胞系及其衍生细胞系（如GX6B） |