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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-02-06 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 本研究旨在开发一种用于大肠杆菌的快速、无标记、多位点、多拷贝基因组编辑系统,并探索构建AMP-ATP循环系统 | 鉴定出单个ppk基因(No.8)可完成AMP-ATP循环反应,并利用MUCICAT技术将其插入基因组不同位置和拷贝数,实现与质粒相当的表达水平 | 未明确说明实验规模或样本量,且研究主要聚焦于大肠杆菌,可能限制其直接应用于其他生物系统 | 开发高效的大肠杆菌基因组编辑系统,以降低ATP依赖反应的成本并推进合成生物学应用 | 大肠杆菌(Escherichia coli)及其ATP合成途径相关基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | AMP-ATP循环系统 | 工业生物技术 |
| 382 | 2026-02-06 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文全面回顾了基于细菌的肿瘤治疗策略,包括其分类、机制、工程化方法以及临床转化挑战 | 系统整合了合成生物学与纳米医学于工程化细菌中,以增强治疗效果和可控性 | NA | 探讨利用细菌进行精准肿瘤治疗的原理和未来前景 | 工程化细菌及其与纳米材料的杂合系统 | NA | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤细胞杀伤、抗肿瘤免疫激活的基因回路 | 医学 |
| 383 | 2026-02-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,在人类细胞系和原代T细胞中实现了可编程的DNA甲基化和基因沉默 | 在DNMT3A催化核心引入突变,稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时保持DNA甲基化和基因沉默功能,并首次在原代人T细胞中验证了工程化dCas-DNMTs的功能 | 研究主要限于体外细胞实验,尚未在体内模型或更复杂的生理环境中验证 | 开发更稳定、高效的CRISPR/Cas9基础的表观遗传编辑工具,用于哺乳动物细胞的可编程DNA甲基化调控 | 人类细胞系(包括Jurkat T细胞)和供体来源的原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9表观遗传编辑、DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白系统 | 表观遗传数据、基因表达数据 | 多种人类细胞系及供体来源的原代T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系、原代人T细胞 | dCas9与DNMT3A/3L甲基转移酶融合构建的表观遗传编辑系统 | 医学、基础研究 |
| 384 | 2026-02-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
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研究论文 | 本文介绍了一种用于植物生物工程的快速、自动化、高通量管道FAST-PB,通过整合自动化生物铸造、基因组编辑和单细胞质谱分析,以增强玉米和本氏烟草中的脂质生产 | 开发了FAST-PB管道,整合了自动化生物铸造、Golden Gate克隆、CRISPR编辑和单细胞MALDI-MS分析,实现了高通量植物基因组工程和表型分析,显著提高了脂质产量 | NA | 开发一种自动化高通量管道,以加速植物生物工程过程,特别是增强脂质生产 | 玉米(Zea mays)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana)的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、Golden Gate克隆、单细胞MALDI-MS、自动化生物铸造 | NA | 质谱数据、脂质组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 玉米, 本氏烟草 | 通过CRISPR激活脂质控制基因来增强脂质生产,涉及多基因盒的引入 | 农业, 能源 |
| 385 | 2026-02-05 |
A synthetic biology toolkit for rationally designing genetic circuits in Acinetobacter baumannii
2025, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2025.1668595
PMID:41626556
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研究论文 | 本研究开发了一个用于鲍曼不动杆菌的合成生物学工具包,包括BioBrick部件库和模块化CRISPRi平台,以对抗抗菌素耐药性 | 首次在鲍曼不动杆菌中系统表征BioBrick部件并开发模块化CRISPRi平台,为理性设计基因电路提供基础 | NA | 通过合成生物学方法对抗鲍曼不动杆菌的抗菌素耐药性 | 鲍曼不动杆菌及其基因电路 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | CRISPR干扰 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 鲍曼不动杆菌 | 基因电路,包括诱导型和组成型启动子库以及CRISPRi介导的抑制系统 | 医学 |
| 386 | 2026-02-03 |
Wheat Plasma Membrane Receptors: Orchestrating Immunity and Bridging to Crop Improvement
2025-Dec-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010002
PMID:41614833
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综述 | 本文综述了小麦质膜受体的多样性、分类、信号机制及其在植物免疫中的核心作用,并探讨了其在作物改良中的应用潜力 | 系统整合了小麦质膜受体在大型六倍体基因组背景下的功能特征化挑战,并首次详细阐述了其家族规模从10个到3424个成员的巨大差异,以及将基础研究与作物改良策略(如标记辅助选择、基因叠加和受体工程)相连接 | 小麦基因组庞大、基因重复和功能冗余阻碍了质膜受体的功能表征,且遗传冗余和多效性效应是主要障碍 | 阐明小麦质膜受体的功能、信号机制及其在免疫与作物抗病改良中的作用 | 小麦质膜受体,特别是受体样激酶家族 | 植物生物学/作物遗传改良 | 植物病害(如小麦叶锈病) | 多组学、系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 小麦 | NA | 农业 |
| 387 | 2026-02-03 |
Cancer Reversion Therapy: Prospects, Progress and Future Directions
2025-Dec-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47121049
PMID:41614813
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综述 | 本文综述了癌症逆转疗法的前景、进展和未来方向,这是一种通过重编程恶性细胞使其恢复为非恶性状态而非摧毁它们的新型治疗范式 | 系统性地整合了癌症逆转疗法的生物学基础、现有策略、新兴技术,并提出了未来发展的关键方向,强调从“摧毁”到“重编程”的范式转变 | 许多报道的“逆转”现象可能只是刺激依赖的可塑性或短暂生长停滞,而非稳定的表型正常化;真正的癌症逆转需要持久、可遗传的表型改变,这在实现上仍面临重大挑战 | 探讨将恶性细胞重编程为非恶性状态的癌症治疗新策略 | 癌症细胞及其微环境 | NA | 癌症 | 单细胞分析、CRISPR基因编辑、患者来源类器官、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 388 | 2026-02-03 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 本文深入回顾了Cupriavidus necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略方面的技术进步,并探讨了其作为可持续生物制造宿主的潜力 | 系统总结了C. necator从一种Knallgas细菌演变为有前景的生物制造宿主的过程,强调了其在推动可持续生物经济中的关键作用 | NA | 探讨C. necator作为多样化微生物底盘在合成生物学和可持续生物制造中的应用潜力 | Cupriavidus necator(一种多功能的微生物) | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 389 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
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综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力,包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展,包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 390 | 2026-02-02 |
Intracellularly coupled oscillators for synthetic biology
2025-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67893-0
PMID:41423683
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研究论文 | 本文提出并建模了细胞内耦合振荡器作为合成生物学的高级构建模块,旨在指导未来细菌合成生物学实验 | 基于耦合强度对振荡器进行分类,并预测了包括混沌和同步在内的多种动态行为,为振荡器计算提供新方向 | NA | 工程化或重新设计生命系统以实现复杂功能 | 细胞内耦合振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基于振荡器的电路设计,包括独立、弱耦合、强耦合和深度耦合振荡器 | 工业生物技术 |
| 391 | 2026-02-02 |
Intratumoral microorganisms and artificial antitumor bacteria
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.06.002
PMID:41613448
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物在癌症进展和治疗中的作用,并探讨了基于合成生物学技术编程的人工抗肿瘤细菌在精准癌症诊断和治疗中的应用前景 | 强调了通过合成生物学技术编程细菌以增强时空可控性,结合免疫疗法或其他强效抗肿瘤剂,可能开启下一代精准癌症诊断和治疗 | NA | 探讨肿瘤内微生物在癌症发展和治疗中的角色,以及基于活菌的新型治疗和诊断方法 | 肿瘤内微生物和人工编程的抗肿瘤细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 392 | 2026-02-02 |
Gene circuit-based sensors
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.06.011
PMID:41613450
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综述 | 本文综述了基于合成生物学基因回路构建的生物传感器的设计原理、工程化方法及其在多个领域的应用,并重点探讨了基于无细胞系统的生物传感器的研究进展 | 整合合成生物学基本概念,全面描述了基因回路的设计与工程化,并重点聚焦于基于无细胞系统的生物传感器的设计理念、构建原则及其在生物检测领域的新前沿 | NA | 综述基于合成生物学基因回路的生物传感器的设计、构建与应用,并讨论该领域的新前沿与待解决的挑战 | 基于合成生物学基因回路的生物传感器,特别是基于无细胞系统的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物(泛指),无细胞系统 | 基因回路,包括具有不同响应机制、逻辑门和逻辑回路的传感器 | 生物制造过程监控, 环境监测, 食品安全, 医疗诊断与监测 |
| 393 | 2026-02-02 |
Nano-synthetic biology for disease diagnosis and treatment
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.07.002
PMID:41613477
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2026-02-02 |
Nanoscale synthetic biology with innovative medicinal applications
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.006
PMID:41613444
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综述 | 本文综述了纳米尺度合成生物学(NSB)在生物医学领域的应用,包括常见纳米载体、纳米生物组装系统及具体应用 | 整合合成生物学与纳米科学,通过纳米尺度操控实现更高效可控的生物工程,促进疾病治疗、生物成像、生物催化和生物传感的创新 | NA | 探讨NSB在生物医学中的应用,以推动科学技术进步并应对重大社会挑战 | 包括细胞、细菌和病毒在内的各种生物体 | 合成生物学 | NA | 基因调控系统(如CRISPR、mRNA、siRNA、质粒)、纳米酶、药物和特定纳米探针的递送 | NA | NA | NA | CRISPR, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细胞, 细菌, 病毒 | 生物传感器, 代谢途径 | 医学 |
| 395 | 2026-01-30 |
Microbial therapeutics for canine periodontal disease: current status and future perspectives
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1748968
PMID:41602620
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综述 | 本文综述了犬牙周病的微生物疗法现状,包括益生菌、后生元、噬菌体及合成生物学等策略,并讨论了其未来前景与挑战 | 从生态失调角度而非单一病原体视角分析犬牙周病,并系统评估了多种新兴微生物疗法(如噬菌体、合成生物学工具)在该领域的应用潜力 | 现有疗法存在微生物定植短暂、兽医临床证据有限、生物安全性担忧以及缺乏标准化监管路径等问题 | 探讨通过调节口腔微生物群落结构与功能来治疗犬牙周病的非抗生素策略 | 犬牙周病及其相关的口腔微生物群落 | NA | 牙周病 | 测序技术、定量分子分析 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 396 | 2026-01-29 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本研究开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制气囊蛋白的组装因子和外壳蛋白的表达,以解决异源表达气囊时引起的细胞生长抑制和裂解问题 | 首次观察到气囊诱导后8-16小时细胞密度下降的现象,并设计了时序诱导策略,在维持气囊产量的同时恢复了细菌正常生长 | 研究仅在大肠杆菌中进行验证,未在其他宿主中测试该调控系统的普适性 | 优化气囊在非天然宿主中的异源表达,减少其对细胞生长的负面影响 | 气囊蛋白的组装过程及其对宿主细胞的影响 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统、时序诱导策略 | NA | NA | NA | 双诱导转录调控系统 | 大肠杆菌 | 时序调控的基因回路,通过正交控制组装因子蛋白和外壳蛋白的表达时序与化学计量比 | 生物医学工程、合成生物学 |
| 397 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角,系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章,主要基于现有文献进行整合分析,未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用,探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子(如GLP-1)的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 398 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
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研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型,利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变,模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞,实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行,尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制,构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统,以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构,形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 399 | 2026-01-28 |
Antifungal Biocontrol in Sustainable Crop Protection: Microbial Lipopeptides, Polyketides, and Plant-Derived Agents
2025-Dec-27, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12010022
PMID:41590434
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综述 | 本文综述了微生物和植物来源的抗真菌生物防治剂在可持续作物保护中的应用,重点介绍了环状脂肽和聚酮类等次级代谢产物的结构、生物合成途径及作用机制 | 整合了当前关于微生物次级代谢产物(特别是环状脂肽和聚酮类)和植物来源抗真菌剂的最新知识,并强调了基因组学、代谢工程和合成生物学在加速菌株改良和新化合物发现方面的进展 | NA | 探讨抗真菌生物防治剂作为合成杀菌剂替代品在可持续作物保护中的作用 | 微生物(如芽孢杆菌属、假单胞菌属、链霉菌属)和植物产生的抗真菌次级代谢产物 | NA | NA | 基因组学、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 400 | 2026-01-28 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Dec-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
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研究论文 | 本研究为致病真菌新型隐球菌开发了基因编码的氧化还原传感器,用于实时监测细胞内氧化还原状态 | 首次为新型隐球菌优化设计了基因编码的氧化还原传感器,并建立了多种基于荧光的实时监测技术 | 该研究主要针对新型隐球菌,在其它真菌中的应用仍需进一步验证 | 开发用于致病真菌的氧化还原生物传感器,研究真菌毒力相关的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原蛋白 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器技术、荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器 | 医学 |