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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-12-26 |
Development of new Thermus thermophilus-Escherichia coli shuttle vectors
2025-Dec-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02102-25
PMID:41283684
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研究论文 | 本研究开发了基于Thermus thermophilus的新型穿梭载体pIOK,并验证了其与现有载体的兼容性及稳定性 | 从日本Senami温泉分离的Thermus thermophilus菌株中鉴定了新型复制蛋白和毒素-抗毒素样模块,构建了兼容且高稳定性的穿梭载体系统 | NA | 开发适用于Thermus thermophilus的合成生物学工具,特别是多质粒系统 | Thermus thermophilus菌株及其质粒 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、质粒构建、定量PCR、转化实验 | NA | 基因组序列数据、质粒稳定性数据 | 从日本Senami温泉分离的Thermus thermophilus菌株及其质粒 | 质粒克隆、Gibson Assembly | Thermus thermophilus, Escherichia coli | 木聚糖利用途径(约13 kbp)被分割并克隆到两个兼容质粒中,实现功能重构 | 工业生物技术 |
| 482 | 2025-12-26 |
A Reporter System for Assessment of Transcription from Divergently Oriented Promoters in Pseudomonas putida
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00723
PMID:41367291
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研究论文 | 本文开发了一种针对恶臭假单胞菌的质粒基双报告系统,用于同时监测含有反向启动子的启动子区域的基因表达 | 开发了优化的双报告系统,结合荧光蛋白选择、质粒骨架工程和毒素-抗毒素模块,支持无抗生素选择和动态转录评估 | 在测试条件下,基于excludon的转录抑制效率有限 | 研究恶臭假单胞菌的基因调控,开发基因表达监测工具 | 恶臭假单胞菌的启动子区域和基因表达 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、荧光报告系统、共聚焦显微镜 | NA | 荧光图像、基因表达数据 | NA | 质粒构建、毒素-抗毒素模块 | 恶臭假单胞菌 | 双报告系统,用于监测反向启动子的转录活动 | 工业生物技术 |
| 483 | 2025-12-26 |
Site-Specific OaAEP1 Mediated Functional Proteins Immobilization on Magnetic Nanoparticles and the Recyclings
2025-Dec-17, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502540
PMID:41273006
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研究论文 | 本文开发了一种基于肽连接酶OaAEP1的位点特异性蛋白质固定化策略,用于在磁性纳米颗粒上实现功能蛋白质的定向高效固定 | 利用OaAEP1酶催化N端GL和C端NGL基序的连接,实现了蛋白质在纳米颗粒表面的可控定向固定,避免了传统方法的非特异性结合和活性损失 | NA | 开发一种精确稳定的蛋白质固定化方法,以推进生物催化、生物传感和合成生物学领域的应用 | 功能蛋白质和酶(如荧光蛋白、TEV蛋白酶、Taq聚合酶)在FeO和FeO@SiO磁性纳米颗粒上的固定化 | 合成生物学 | NA | 肽连接酶催化技术 | NA | NA | NA | OaAEP1 | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 484 | 2025-12-26 |
Research progress on the evaluation, screening, and mechanisms of salinity tolerance in Azolla
2025-Dec, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202512.035
PMID:41445342
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综述 | 本文综述了红萍耐盐性评价、耐盐种质筛选及其生理与分子机制的研究进展 | 系统总结了红萍-固氮蓝藻共生体系在盐碱地可持续修复中的潜力,并提出了整合基因编辑、合成生物学及共生互作等技术的未来研究方向 | 当前研究存在缺乏统一的评价标准、对耐盐遗传基础理解不完整、对复合胁迫及其机制探索有限等问题 | 筛选和培育耐盐植物,以实现盐碱地的可持续利用 | 红萍及其与固氮蓝藻形成的专性共生体系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因编辑, 合成生物学 | 红萍, 固氮蓝藻 | NA | 农业, 环境 |
| 485 | 2025-12-25 |
Antisense transcription can induce expression memory via stable promoter repression
2025-Dec-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03875-1
PMID:41422243
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研究论文 | 本研究探讨了反义转录如何通过稳定启动子抑制诱导基因表达记忆,结合数学模型、基因组学和合成生物学方法 | 建立了定量框架预测反义介导的顺式记忆在生理相关条件下产生,并揭示干细胞在分化过程中调整记忆能力 | 未具体说明实验模型的局限性或样本量不足等问题 | 理解反义转录生成表达记忆的条件和机制 | 反义基因对、小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 数学模型、基因组学分析、合成生物学方法 | NA | 基因组数据、实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 反义基因对形成的切换开关,涉及启动子抑制和染色质状态 | 医学 |
| 486 | 2025-12-25 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Dec, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
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综述 | 本文探讨了构建模拟生物细胞基本功能的合成细胞时,脂质多样性与简约性在定义膜需求方面的作用 | 对比了自下而上和自上而下两种构建合成细胞的方法,并强调了膜蛋白与其周围脂质环境之间关键相互作用的重要性 | NA | 定义自繁殖合成细胞所需的最小脂质组要求 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 环境科学 |
| 487 | 2025-12-25 |
An alternative view on the ethics of synthetic biology: an Indian Hindu perspective
2025, Global bioethics = Problemi di bioetica
DOI:10.1080/11287462.2025.2518798
PMID:41425232
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评论 | 本文从印度教哲学的非二元世界观出发,重新审视合成生物学的伦理问题,提出一种强调互联性、责任感和对所有生命形式尊重的伦理框架 | 首次将印度教哲学的非二元世界观应用于合成生物学的伦理讨论,突破了传统二元对立(如自然/人工、人类/机器)的伦理框架限制 | NA | 为合成生物学的伦理讨论提供一种非二元、更全面包容的哲学视角 | 合成生物学的伦理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 环境 |
| 488 | 2025-12-24 |
A Novel Salicylaldehyde Dehydrogenase from Alpine Soil Metagenome Reveals a Unique Catalytic Mechanism
2025-Dec, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05445-4
PMID:41182549
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研究论文 | 本研究从高山土壤宏基因组中发现并全面表征了一种新型水杨醛脱氢酶(SALD),揭示了其独特的催化机制和生态意义 | 首次实验表征了Alphaproteobacterial来源的SALD,发现其形成独特的进化分支,并提出了涉及ASN-137等残基的非经典催化配置模型 | 高浓度金属和溶剂会抑制酶活性,且对脂肪醛的催化效率较低 | 探索高山土壤宏基因组中新型酶的催化机制及其生态和生物技术应用 | 从高山土壤宏基因组中获得的SALD酶 | NA | NA | 宏基因组学、系统发育分析、动力学分析、差示扫描荧光法、结构比对和分子对接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物修复、合成生物学 |
| 489 | 2025-12-24 |
Derepression of transposable elements in mouse prefrontal cortex disrupts social behavior
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646358
PMID:40236017
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法,通过改造TRIM28蛋白在小鼠前额叶皮层中的功能,探究其对社交行为的影响 | 首次通过合成生物学手段在活体小鼠中逆转TRIM28的转录调控功能,揭示其通过稳定转座元件调控免疫基因表达以维持社交行为的新机制 | 研究主要关注前额叶皮层,未全面评估其他脑区的影响;实验对象仅限于小鼠,人类相关性有待验证 | 探究TRIM28-KZFP相互作用在调控转座元件和免疫基因表达中对小鼠社交行为的影响 | 雄性和雌性小鼠的前额叶皮层及TRIM28蛋白功能 | 合成生物学 | NA | RNA测序、病毒介导的基因递送 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 雄性和雌性小鼠(具体数量未明确) | 病毒载体系统 | 小鼠 | 通过替换TRIM28的转录抑制域为激活域VP64-p65-Rta,或删除调控域,构建功能逆转的TRIM28变体 | 医学 |
| 490 | 2025-12-24 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
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综述 | 本文回顾了转录因子生物传感器从1960年代至今的发展历程,包括基础研究和工程策略的关键里程碑,并探讨了未来前景、挑战和未开发机遇 | 系统分析了转录因子生物传感器在基础知识和工程策略上的历史演变,并整合了多学科方法如高通量工具和计算学习来扩展其应用 | NA | 回顾转录因子生物传感器的发展历史,分析其工程策略,并讨论未来研究方向 | 转录因子生物传感器,包括其DNA和蛋白质层面的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录因子生物传感器,基于原核生物转录调控机制 | 生物技术 |
| 491 | 2025-12-22 |
Engineered Peptide Scrambling for Enhanced Drug Delivery to Resistant Breast Cancer Cells via Small Extracellular Vesicles
2025-Dec-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00582
PMID:41321158
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研究论文 | 本研究开发了一种通过工程化肽序列扰乱来增强小细胞外囊泡靶向药物递送至耐药乳腺癌细胞的方法 | 利用双报告平台定量评估肿瘤归巢肽功能化小细胞外囊泡的结合,并通过氨基酸序列扰乱设计增强结合能力的肽变体,结合机械刺激提高药物负载效率 | 方法主要基于体外细胞实验,尚未进行体内验证;技术对小细胞外囊泡表面靶向部分的表征仍有限制 | 优化肿瘤靶向药物递送,克服耐药性 | 乳腺癌细胞(MDA-MB-231)和HEK293FT细胞 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 生物发光测定、荧光显微镜、小细胞外囊泡工程 | NA | 体外细胞实验数据 | 24种扰乱变体肽在MDA-MB-231细胞中评估 | 细胞外囊泡表面功能化 | HEK293FT细胞 | 肿瘤归巢肽功能化的小细胞外囊泡作为靶向药物递送系统 | 医学 |
| 492 | 2025-12-22 |
DrEFO: A Fermented Oil Rich in Dihydroquercetin With High Antioxidant Activity
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70612
PMID:41413727
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造酿酒酵母生产二氢槲皮素,并利用其发酵制备富含二氢槲皮素的十一籽发酵油(DrEFO),评估其抗氧化及促进胶原合成的护肤功效 | 首次通过合成生物学改造酵母生产二氢槲皮素并用于植物油发酵,显著提升天然油的抗氧化活性与护肤价值,开创了利用发酵技术增强天然油护肤功效的新策略 | 研究主要基于体外化学实验和细胞模型,缺乏完整的动物实验或人体临床试验数据验证实际护肤效果 | 提升天然植物油的护肤功效,解决其因功效不足难以应对复杂皮肤问题 | 二氢槲皮素(DHQ)及其发酵制备的十一籽发酵油(DrEFO) | 合成生物学 | NA | 发酵工程、DPPH/ABTS/羟基/超氧阴离子/PTIO/ROS自由基清除实验、细胞模型 | NA | 化学实验数据、细胞实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(S. cerevisiae) | 用于生产二氢槲皮素(DHQ)的代谢途径 | 化妆品、护肤品 |
| 493 | 2025-12-22 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战、近期临床试验的突破,以及整合合成生物学和基因工程的新策略 | 重点介绍了整合合成生物学和基因工程的突破性策略,以增强CAR-T细胞的适应性、效力、持久性,激活宿主免疫,重编程肿瘤微环境,并实现多抗原靶向 | 讨论了当前临床前模型(如免疫缺陷小鼠的人源异种移植、人源化或同基因模型)在评估CAR-T细胞疗法疗效和安全性方面的优缺点 | 探讨如何克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性,并推动下一代CAR-T疗法的发展 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学,基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 494 | 2025-12-22 |
Microwave-Activated Bacterial Biorobot for Multimodal Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504603
PMID:40789052
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研究论文 | 本文开发了一种微波激活的细菌生物机器人,用于实现多模态癌症治疗 | 利用微波对工程化大肠杆菌进行局部激活,结合葡萄糖氧化酶表达与表面CuO纳米颗粒的类芬顿反应,协同诱导多种肿瘤细胞死亡方式 | 未明确说明长期生物安全性、免疫原性及临床转化潜力 | 开发一种安全、可精确控制的多模态癌症治疗平台 | 工程化大肠杆菌(MG1655)及肿瘤细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、纳米材料修饰、转录组分析 | NA | 体外实验数据、体内实验数据、转录组数据 | NA | 合成生物学工程 | 大肠杆菌 | 微波激活的葡萄糖氧化酶表达系统 | 医学 |
| 495 | 2025-12-22 |
Computational tools for nonnatural pathway design: Algorithms, applications, and challenges
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100041
PMID:41415682
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综述 | 本文综述了用于非天然代谢途径设计的计算工具,包括算法、应用及挑战 | 系统比较了基于模板和无模板两类主要计算方法,并汇编了55个实验验证的非天然途径数据集以评估方法优劣 | 计算预测与实验可行性之间存在差距,代谢负担增加和有毒中间体积累等挑战尚未完全解决 | 通过理性设计非天然代谢途径扩展生物转化的范围和效率 | 非天然代谢途径的计算设计方法 | 合成生物学 | NA | 计算建模与生物信息学分析 | NA | 代谢途径数据与文献数据集 | 55个实验验证的非天然途径 | NA | 微生物细胞工厂 | 非天然代谢途径 | 工业生物技术 |
| 496 | 2025-12-22 |
Recent advances of engineered probiotics for therapeutic applications
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100039
PMID:41415685
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在癌症、胃肠道疾病、传染病和代谢性疾病等人类疾病治疗中的最新应用进展 | 利用合成生物学技术开发工程化益生菌作为诊断工具和疾病治疗方法,强调其在多因素疾病治疗中的创新应用 | NA | 总结工程化益生菌在人类疾病治疗领域的最新研究进展,并探讨其发展挑战与机遇 | 工程化益生菌及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症、胃肠道疾病、传染病、代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 497 | 2025-12-22 |
Enzyme promiscuity in the field of synthetic biology applied to white biotechnology: Opportunities and weaknesses
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100026
PMID:41415683
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综述 | 本文探讨了酶的多功能性在合成生物学应用于白色生物技术中的机遇与弱点 | 强调了酶多功能性作为地下代谢的来源,在构建高效生产路径中的优势,同时指出其可能导致产量损失和代谢干扰的挑战 | 未提供具体实验数据或案例研究,主要基于理论分析和展望 | 改善微生物细胞工厂在生物生产中的性能,通过理解酶多功能性来优化工程策略 | 微生物代谢网络和酶的多功能性 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学工具 | 机器学习 | 遗传、代谢、酶学和发酵过程数据 | NA | NA | 微生物 | 代谢网络工程 | 工业生物技术 |
| 498 | 2025-12-22 |
Innovative tools for customized yeast cell factory
2025-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100010
PMID:41416100
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综述 | 本文简要综述了合成生物学创新工具在定制化酵母细胞工厂开发中的最新重要进展与前景 | 系统性地总结了推动酵母细胞工厂快速发展的多种创新工具,包括基因组编辑工具、计算工具、适应性实验室进化和生物DNA部件的标准化,并提供了实用指南 | NA | 为定制化酵母细胞工厂的新型、有效和高效开发提供实用指南 | 酵母细胞工厂及其相关的合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑,适应性实验室进化,DNA部件标准化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 基因、回路、通路和网络的重编程 | 食品,能源,医药,工业生物技术 |
| 499 | 2025-12-22 |
Utilizing plant synthetic biology to accelerate plant-microbe interactions research
2025-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100007
PMID:41416106
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在加速植物-微生物互作研究中的应用,包括分子机制解析、抗病性增强和合成共生工程 | 利用合成生物学工具进行多基因表征和工程化,以解决传统方法在解析复杂通路交叉对话方面的不足 | NA | 加速植物-微生物互作研究,以提升生态系统韧性和作物产量 | 植物与有益及病原微生物的互作机制 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、遗传学、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 合成共生工程 | 农业 |
| 500 | 2025-12-22 |
Towards sustainable freshwater systems through plant synthetic biology engineering plants for sustainability
2025-Mar, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100009
PMID:41415721
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研究论文 | 本文探讨利用植物合成生物学工程化植物,以过滤海水和储存淡水,应对气候变化和淡水需求 | 提出结合自然设计原则和先进合成生物学工具(如计算蛋白质设计和定向进化),工程化植物平台以可持续方式提供淡水 | NA | 通过植物合成生物学开发可持续淡水系统,减少气候变化影响 | 植物作为合成生物学平台 | NA | NA | 计算蛋白质设计,定向进化 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 植物 | 工程化植物以过滤海水和储存淡水,结合自然组件和适应性特性 | 环境 |