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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-05 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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研究论文 | 提出一种从线性模型反推非线性Hill函数型模型的反向工程方法,用于设计实现完美适应的生物网络基序控制器 | 将线性系统理论与非线性建模相结合的反向工程方法,解决了非线性模型理论分析困难而线性模型无法捕捉基因表达系统非线性动态的问题 | 仅通过仿真验证方法有效性,缺乏实验验证 | 设计能够实现完美适应能力的生物控制器 | 生物网络基序控制器和基因回路 | 合成生物学 | NA | 反向工程方法,Hill函数建模 | 线性模型,非线性Hill函数模型 | 仿真数据 | 三个生物网络基序控制器 | NA | NA | 生物网络基序控制器,完美适应基因回路 | 合成生物学,系统生物学 |
| 522 | 2025-10-05 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
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综述 | 探讨跨学科增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用及其在日常物品和建筑中的整合前景 | 提出将印刷响应性生物材料整合到日常物品和建筑中以增强环境和人类健康的创新愿景 | NA | 综述响应性生物材料的增材制造策略及其在环境和人类健康领域的应用潜力 | 生物基环境交互材料、生物聚合物复合材料、电化学和电阻器件、活性分子、生物传感器、活细胞、孢子或无细胞位点 | 生物材料科学 | NA | 增材制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 医疗, 建筑, 能源 |
| 523 | 2025-10-05 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本研究展示了如何将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚物界面结合,形成稳定的涂层结构 | 首次实现细菌微区室壳蛋白在蛋白质凝聚物表面形成可控涂层,并能防止液滴融合 | 涂层形成依赖于pH值和蛋白质浓度等特定条件 | 开发合成细胞和细胞器的界面控制方法 | 细菌微区室壳蛋白和蛋白质凝聚物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程,液液相分离 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质工程 | Haliangium ochraceum | 细菌微区室壳蛋白涂层系统,蛋白质凝聚物界面工程 | 合成生物学,生物医学工程 |
| 524 | 2025-10-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
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研究论文 | 开发了一种用于植物生物工程的快速自动化高通量管道FAST-PB,用于增强植物细胞中的脂质生产 | 整合自动化生物铸造厂与单细胞MALDI-MS技术,实现了基因组编辑和产品表征的高通量自动化流程 | NA | 提高植物生物工程的效率和通量,增强植物细胞脂质生产 | 玉米和本氏烟草的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、单细胞MALDI-MS、Golden Gate克隆 | NA | 质谱数据、代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | Zea mays, Nicotiana benthamiana | 脂质控制基因的CRISPR激活、多基因盒 | 能源, 工业生物技术 |
| 525 | 2025-10-05 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的电梯式转运机制 | 首次通过毫秒级全原子分子动力学模拟阐明BicA二聚体的构象动态变化机制 | NA | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 分子模拟数据 | 超过1毫秒的分子动力学模拟数据 | NA | 蓝藻 | NA | 能源安全, 粮食生产, 气候变化 |
| 526 | 2025-10-05 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNA和靶标模拟物作为作物改良工具的潜力与应用进展 | 系统总结了利用合成生物学方法设计人工miRNA和靶标模拟物调控基因表达的最新进展,提出了工程化作物性状的新策略 | NA | 探讨人工miRNA和靶标模拟物在作物改良中的应用潜力 | 植物microRNA及其人工调控工具 | 合成生物学 | NA | 人工miRNA技术、靶标模拟技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 合成回路编程 | 农业 |
| 527 | 2025-10-05 |
Scaling Up Postbiotics Production: A Prospective Review of Processes and Health Benefits
2025-Jul-07, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10643-x
PMID:40622649
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综述 | 本文综述了后生元的生产工艺优化工具及其健康益处,重点关注工业化放大面临的挑战 | 系统总结了后生元工业化生产的关键优化工具和合成生物学技术,指出高细胞密度与产量关联性的研究空白 | 后生元作用机制尚未完全阐明,工业化生产在稳定性、质量、产量和一致性方面仍存在挑战 | 探索后生元生产工艺优化和工业化放大策略 | 后生元(包括消化酶、短链脂肪酸、细胞壁成分等生物活性化合物) | 工业生物技术 | 心血管疾病 | Plackett-Burman设计、响应面方法、田口方法、中心复合设计、基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医药,食品 |
| 528 | 2025-10-05 |
Opto-p53: A light-controllable activation of p53 signaling pathway
2025-Jul-04, Cell structure and function
IF:2.0Q4
DOI:10.1247/csf.25017
PMID:40500178
|
研究论文 | 开发了一种光控p53信号通路激活工具Opto-p53 | 首次将光诱导二聚化系统与p53蛋白片段结合,创建了光控p53信号通路工具 | NA | 开发选择性激活p53信号通路的实验系统 | p53蛋白及其信号通路 | 合成生物学 | 肿瘤 | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光诱导二聚化系统 | 细胞 | 通过光控重组p53蛋白N端和C端片段激活信号通路 | 医学 |
| 529 | 2025-10-05 |
Regulation of the tagatose catabolic gene cluster and development of a tagatose-inducible expression system in the probiotic Escherichia coli Nissle 1917
2025-Jul-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02771-4
PMID:40615889
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研究论文 | 在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中开发了一种基于D-塔格糖的可诱导基因表达系统 | 首次在EcN中发现并利用塔格糖代谢基因簇的调控机制,开发了具有剂量依赖性响应和分解代谢物阻遏自诱导功能的新型表达系统 | NA | 开发可靠的可诱导基因表达系统以扩展益生菌大肠杆菌Nissle 1917的应用潜力 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917的塔格糖代谢基因簇及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 差异RNA测序、序列分析 | NA | 基因序列数据、表达数据 | NA | iGEM | 大肠杆菌Nissle 1917 | 塔格糖诱导型表达系统、分解代谢物阻遏自诱导策略 | 医药, 工业生物技术 |
| 530 | 2025-10-05 |
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996
PMID:40032480
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综述 | 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸(DHA)的当前生物技术,涵盖菌株改良、发酵优化、产品提取和安全应用等方面 | 系统总结了裂殖壶菌DHA生产的多方面技术挑战,并提出整合多种育种技术、人工智能优化发酵、纳米颗粒包装改善稳定性等创新解决方案 | NA | 探索提高裂殖壶菌DHA生产效率和产品质量的技术方法,推动其在食品和健康领域的应用发展 | 产油海洋原生生物裂殖壶菌及其生产的二十二碳六烯酸(DHA) | 工业生物技术 | NA | 发酵技术、合成生物学、纳米颗粒包装技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 裂殖壶菌 | DHA合成途径、结构化脂质构建 | 食品,医药 |
| 531 | 2025-10-05 |
Integrating incompatible tandem photobiocatalysis in artificial cells enables metabolic modulation of natural cells
2025-Jul-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu4828
PMID:40614183
|
研究论文 | 本研究开发了具有光生物催化功能的人工细胞,通过空间分离不相容的催化模块实现对肝细胞代谢的调控 | 设计了包含纳米细胞器的光生物催化人工细胞,通过空间隔离光催化辅因子再生和生物催化酒精代谢这两个不相容模块 | NA | 开发能够持续供应辅因子并调控天然细胞代谢的人工细胞系统 | 光生物催化人工细胞和肝细胞 | 合成生物学 | 酒精性氧化应激 | 光催化、生物催化 | NA | NA | NA | NA | 人工细胞、肝细胞 | 包含两个空间隔离模块的纳米细胞器:光催化辅因子再生模块和生物催化酒精代谢模块,其中酒精脱氢酶和醛脱氢酶共定位在同一纳米细胞器中 | 医学, 合成生物学, 生物医学 |
| 532 | 2025-10-05 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
|
研究论文 | 本研究在毕赤酵母中设计和构建了光调控基因转录和蛋白质翻译系统 | 开发了新型光调控转录系统(光诱导/抑制启动子)和首创的光抑制翻译系统(稀有密码子刹车设计) | NA | 解决传统诱导系统在发酵安全性和表达能力方面的缺陷,构建光控基因表达系统 | 毕赤酵母(Pichia pastoris)中的基因转录和蛋白质翻译调控系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、合成生物学设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母(Pichia pastoris) | 光调控转录系统(光诱导启动子4pLRE-cPAOX1、光抑制启动子PGAP-pLRE)、光抑制翻译系统(稀有密码子刹车设计、pLRE-tRNA调控) | 工业生物技术 |
| 533 | 2025-10-05 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2025-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
|
综述 | 探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜的最新进展 | 将合成生物学的最新成果应用于细菌生物膜的功能化调控 | NA | 开发具有新功能的细菌生物膜调控技术 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 534 | 2025-10-05 |
Minimal shuttle vectors for Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf010
PMID:40612073
|
研究论文 | 开发并验证了六种用于酿酒酵母的最小整合型或着丝粒型穿梭载体 | 构建了目前已知最小的酵母穿梭载体(2.6-3.5 kb),释放了约30个限制性酶切位点 | NA | 解决复杂基因工程任务中载体骨架限制性酶切位点不足和连接效率低的问题 | 酿酒酵母穿梭载体 | 合成生物学 | NA | 基因合成 | NA | NA | 六种载体构建 | Gibson Assembly | Saccharomyces cerevisiae, E. coli | 穿梭载体设计包含酵母选择标记、细菌选择标记、复制起点和多克隆位点 | 工业生物技术 |
| 535 | 2025-10-05 |
Optimizing Plant Alkaloid Biosynthesis under Drought Stress: Regulatory Mechanisms and Biotechnological Strategies
2025-Aug, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154545
PMID:40523330
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综述 | 探讨干旱胁迫下植物生物碱生物合成的调控机制及优化策略 | 整合干旱胁迫信号通路与生物碱合成调控机制,提出结合人工智能的跨学科生物技术策略 | 需平衡植物生长与代谢物生产的关系,实验室策略的田间适用性有待验证 | 优化干旱胁迫条件下植物生物碱的生物合成 | 植物生物碱及其合成调控机制 | 合成生物学 | NA | 遗传工程、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 遗传工程, 合成生物学 | 植物 | 生物碱生物合成通路 | 农业, 制药业 |
| 536 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025-Jul-02, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了噬菌体基因组重设计策略在治疗和环境应用中的最新进展 | 系统整合了CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、逆转录子等多种噬菌体工程技术,展示了定制化功能噬菌体的开发潜力 | 面临噬菌体抗性、免疫反应和当前工程方法局限性等挑战 | 探讨噬菌体工程技术在治疗和环境领域的应用潜力 | 工程化噬菌体及其基因组重设计技术 | 合成生物学 | 耐药性感染、癌症 | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、逆转录子、同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 噬菌体 | 宿主范围扩展、生物膜降解、靶向抗菌活性、金属结合肽展示 | 医药,环境 |
| 537 | 2025-10-05 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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研究论文 | 开发基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计出能够自凝聚形成液滴的极简二肽结构,并发现其在不同pH下可形成具有催化功能的纤维形态 | NA | 开发具有酶催化功能的极简肽类超分子材料 | 由疏水残基和极性组氨酸残基组成的二肽分子 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶学, 合成生物学 |
| 538 | 2025-10-05 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
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研究论文 | 开发了BioPKS自动化逆向生物合成流程,结合I型聚酮合酶和单功能酶进行化学物质生物合成设计 | 首次将计算设计的嵌合I型聚酮合酶与酶催化途径相结合,创建了自动化逆向生物合成工具BioPKS | NA | 开发自动化生物合成途径设计工具以扩展生物制造化学品的可及空间 | I型聚酮合酶(PKSs)和单功能酶的组合系统 | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成,计算设计 | NA | 化学结构数据,酶催化反应数据 | 155种生物制造候选化合物 | BioPKS, RetroTide, DORAnet | NA | 嵌合I型聚酮合酶与单功能酶的组合生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 539 | 2025-10-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
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研究论文 | 提出一种抽象层次结构来定义生物铸造厂工作流程和操作,以促进可互操作的合成生物学研究与应用 | 首次提出将生物铸造厂活动组织为项目、服务/能力、工作流程和单元操作四个互操作层次的抽象框架 | NA | 解决生物铸造厂标准化不足问题,提高合成生物学研究的可扩展性和效率 | 生物铸造厂工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | 抽象层次框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 540 | 2025-10-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
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研究论文 | 本研究开发了一种无标记瞬态红外纳米显微镜技术,用于解析单个光开关脂质体在水中的毫秒级动态变化 | 首次结合散射型扫描近场光学显微镜的化学识别和高时空分辨率,实现了对单个光开关脂质体的无标记中红外成像和光谱分析 | 方法尚未在更复杂的生物环境中验证,采样时间虽快但仍可能错过某些超快动力学过程 | 开发非破坏性无标记技术研究纳米载体的生物物理化学性质 | 偶氮苯基光开关脂质体形成的单个脂质体 | 纳米光学成像 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜,中红外成像和光谱 | NA | 红外光谱图像,动态时间序列数据 | 单个脂质体样品 | NA | NA | NA | 医学,药物递送,纳米诊疗,合成生物学 |