合成生物学相关文章
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当前共找到 1521 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-05 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
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研究论文 | 本研究通过SpyRing系统实现TEV蛋白酶环化，结合AlphaFold结构预测优化设计，显著提高了酶的热稳定性 | 首次将SpyTag/SpyCatcher介导的环化系统与AlphaFold结构预测相结合，成功实现了N端和C端相距较远（约40 Å）的TEV蛋白酶环化 | 研究仅针对特定TEVp变体（L56V, S135G, S219V, Δ238-242），未验证在其他蛋白酶或蛋白质中的普适性 | 开发一种计算引导的蛋白质环化策略，提高蛋白酶的热稳定性 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp）及其环化变体 | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher环化系统，AlphaFold结构预测 | NA | 蛋白质结构数据，酶活性数据 | NA | SpyRing系统 | NA | 通过SpyTag和SpyCatcher结构域融合实现分子内环化 | 合成生物学，工业生物技术 |
| 522 | 2025-10-05 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
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综述 | 本文探讨巴西合成生物学发展现状及国家合成生物学网络的建立意义 | 首次系统阐述巴西合成生物学网络的建设框架与发展潜力 | 国际社会对巴西科研监管环境认知不足 | 分析巴西合成生物学生态系统关键要素并推动国家生物技术能力建设 | 巴西合成生物学研究群体与基础设施 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 523 | 2025-10-05 |
Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis
2025-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85266-x
PMID:39775135
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研究论文 | 通过比较猫须草不同组织的转录组分析，揭示与黄酮类化合物生物合成相关的差异表达基因 | 首次对猫须草所有组织进行黄酮类化合物合成生物学的比较转录组分析，发现根部黄酮含量更高并鉴定出212个与根部黄酮积累强相关的差异表达基因 | 研究仅限于猫须草单一物种，未进行功能验证实验 | 探究猫须草不同组织中黄酮类化合物生物合成的分子机制 | 猫须草（Orthosiphon aristatus）的根、茎、叶等不同组织 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | 高效液相色谱分析, 转录组分析, 实时定量PCR | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 猫须草不同组织样本 | NA | 猫须草（Orthosiphon aristatus） | 黄酮类化合物生物合成通路 | 医药 |
| 524 | 2025-10-05 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
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研究论文 | 介绍专门用于RNA-蛋白质相互作用动力学数据的数据库KDBI-RP | 首个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的专用数据库，扩展了原有的KDBI数据库 | NA | 建立RNA-蛋白质相互作用动力学数据的系统化数据库资源 | RNA-蛋白质相互作用动力学数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 动力学数据、序列数据、结构数据 | 包含3657个结合速率常数条目、3761个解离速率常数条目和175,932个平衡解离常数条目 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 525 | 2025-10-05 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2025-Sep-30, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
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综述 | 本文探讨了受控环境农业如何加速植物科学成果向农业应用的转化 | 提出将受控环境农业作为多功能研究平台和高产生产系统，整合新兴育种、基因组和合成生物学工具 | NA | 通过受控环境农业加速植物科学基础研究成果向农业应用的转化 | 作物设计和农业生产系统 | 农业生物技术 | NA | 育种技术、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 526 | 2025-10-05 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
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综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及其发展历程 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等新型多功能工具的演变 | 未完全涵盖所有相关研究内容 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签格式 | 蛋白质标签和肽标签及其去除方法 | 生物技术 | NA | 基因融合技术、下拉实验、免疫沉淀 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、治疗设计 |
| 527 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
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综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'的研究范式，整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、CRISPR | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 药用植物、微生物系统、异源植物宿主 | 萜类化合物生物合成代谢途径 | 医药、工业生物技术 |
| 528 | 2025-10-05 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出DySEEP方法，通过动态通量平衡分析和经济指标评估工业生物产品的生产潜力，并以PHB生产为案例进行研究 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标评估的新型方法DySEEP，用于系统评估生物产品生产的经济潜力 | 由于DFBA模拟的性质，无法预测某些关键聚合物性质 | 评估不同微生物生产PHB的经济潜力，优化生物塑料生产工艺 | 重组大肠杆菌、重组谷氨酸棒杆菌和重组罗尔斯通氏菌的PHB生产能力 | 代谢工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | 代谢网络模型 | 代谢通量数据 | 三种重组微生物的模拟分析 | CRISPR-Cas9, 基因敲除, 合成生物学 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌, 罗尔斯通氏菌 | 遗传拨动开关, NADPH依赖的PHB合成途径, 代谢途径调控 | 工业生物技术, 环境 |
| 529 | 2025-10-05 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜解析了蓝藻噬菌体A4的完整结构，揭示了其双稳定衣壳内的五聚体预喷射体结构 | 首次发现由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构，并观察到基因组DNA沿带正电荷环形裂隙分布的独特特征 | NA | 阐明蓝藻噬菌体A4的结构特征及其基因组包装和喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4病毒颗粒 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜 | NA | 冷冻电镜图像数据 | NA | NA | 蓝藻 | NA | 合成生物学 |
| 530 | 2025-10-05 |
From nonexistence to novel applications: Nullomers and related k-mer based concepts in bioinformatics
2025, Advances in clinical chemistry
DOI:10.1016/bs.acc.2025.06.009
PMID:41033729
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综述 | 本章节系统阐述了生物信息学中未被充分代表的k-mer序列（包括空位体和相关概念）的研究进展与应用前景 | 提出了基于缺失序列（空位体和新位体）的创新研究框架，为癌症检测、组织溯源和进化研究提供了新方法 | 讨论了分析缺失序列时面临的计算挑战 | 探索k-mer序列在基因组学和蛋白质组学中的基础与应用研究价值 | 空位体、新位体和准素数等未被充分代表的k-mer序列 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer分析，液体活检 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | 医学诊断，药物发现，合成生物学 |
| 531 | 2025-10-05 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2025-Oct, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
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综述 | 本文全面综述了虾青素生物合成的研究进展，重点关注微生物发酵生产策略 | 系统比较了天然宿主Xanthophyllomyces dendrorhous与异源宿主Yarrowia lipolytica和Saccharomyces cerevisiae在虾青素生物合成中的应用 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法实现虾青素的大规模微生物生产 | 虾青素生物合成途径及相关微生物宿主 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | Xanthophyllomyces dendrorhous, Yarrowia lipolytica, Saccharomyces cerevisiae | 虾青素生物合成途径 | 饲料,食品,化妆品,医药 |
| 532 | 2025-10-05 |
Bio-Photo Dual Action of Intracellular Radical Polymerization
2025-Oct-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10871
PMID:40977043
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研究论文 | 开发了一种生物标志物和光门控的细胞内自由基聚合策略，用于精确细胞器干预 | 首次提出刺激响应型光催化剂策略，通过AND门控机制实现生物标志物和光照双重控制的细胞内聚合 | NA | 实现细胞内聚合的时空控制，推进治疗发现和合成生物学应用 | 细胞内自由基聚合过程 | 合成生物学 | NA | 光诱导电子/能量转移-可逆加成-断裂链转移(PET-RAFT)聚合 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | AND门控生物传感器，响应内源性活性氧/硫物种(ROS/RSS)或酶 | 医学, 合成生物学 |
| 533 | 2025-10-05 |
Rubisco-Centric Strategies for Carbon Conservation in Synthetic Biology
2025-Oct-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04813
PMID:41031513
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综述 | 本文系统总结了Rubisco酶的基础研究及其在合成生物学中提升碳固定效率的策略与应用 | 首次系统整合了从经典定向进化到人工智能理性设计的五种酶效率提升策略，并提出了跨尺度的设计框架 | NA | 开发碳效率更高的生物制造技术以应对全球气候危机 | Rubisco酶及其在自养和异养微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 定向进化、人工智能理性设计 | NA | NA | NA | NA | 自养微生物,异养微生物 | 卡尔文循环碳固定途径 | 工业生物技术,环境 |
| 534 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven biosensors for healthcare applications: A roadmap toward programmable and intelligent diagnostics
2025-Sep-26, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118036
PMID:41027168
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综述 | 探讨合成生物学驱动的生物传感器在医疗健康等领域的创新应用与发展路线 | 整合合成基因电路、CRISPR控制系统和逻辑门架构实现可编程诊断 | 存在电路稳定性、生物安全性和大规模部署的挑战 | 开发智能响应型生物传感器以满足精准诊断需求 | 合成生物传感器及其在医疗环境监测中的应用 | 合成生物学 | 癌症、代谢失衡、传染病 | CRISPR技术、RNA调控、逻辑门设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 微生物平台 | 合成基因电路、逻辑门架构、生物传感器、治疗诊断系统 | 医疗健康,环境监测 |
| 535 | 2025-10-05 |
Molecular Paleontology Meets Drug Discovery: The Case for De-extinct Antimicrobials
2025-Sep-23, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05530
PMID:41018632
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综述 | 探讨从灭绝生物中重建抗菌分子的新兴领域及其在药物开发中的应用 | 将古基因组学、古蛋白质组学与合成生物学相结合，从灭绝生物中重建抗菌分子 | 面临技术挑战和伦理考量 | 开发新型抗菌剂以应对抗生素耐药性问题 | 从灭绝生物中重建的生物活性肽、抗生素和其他生物活性剂 | 合成生物学 | 抗生素耐药性感染 | 高通量DNA测序, 质谱分析, 计算生物学, 古基因组学, 古蛋白质组学 | NA | 遗传序列, 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 536 | 2025-10-05 |
Synthetic antimicrobial peptides: Combatting antimicrobial resistance for sustainable aquaculture
2025-Sep-16, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108029
PMID:40967516
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综述 | 本文综述了合成抗菌肽在水产养殖中作为抗生素替代品的设计策略、计算工具应用及环境意义 | 整合合成生物学与计算建模方法设计具有增强稳定性、靶向抗菌活性的合成抗菌肽 | NA | 开发可持续水产养殖疾病控制的抗生素替代方案 | 合成抗菌肽及其设计策略 | 计算生物学 | 水产养殖疾病 | 机器学习、计算建模 | 机器学习 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 水产养殖, 环境 |
| 537 | 2025-10-06 |
Streamline automated biomedical discoveries with agentic bioinformatics
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf505
PMID:41016012
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综述 | 探讨基于大语言模型的智能代理在计算生物学中形成的代理生物信息学新领域的核心原理、方法和应用 | 提出将自主、自适应和智能代理系统应用于解决复杂生物问题的新型研究范式 | NA | 探索代理生物信息学在推动生物医学发现和临床应用的潜力 | 代理生物信息学系统及其在生物医学领域的应用 | 计算生物学 | NA | 大语言模型 | 智能代理系统 | 生物数据集 | NA | NA | NA | NA | 个性化医疗, 药物发现, 合成生物学 |
| 538 | 2025-10-05 |
Targeting the gut-liver axis in cholangiocarcinoma: mechanisms, therapeutic advances, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1646897
PMID:41018102
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综述 | 探讨肠道-肝脏轴在胆管癌发病机制中的作用及靶向该轴线的治疗进展 | 系统阐述肠道微生物失调、胆汁酸代谢紊乱与免疫微环境重塑在胆管癌中的协同作用机制 | 微生物群异质性和受体信号双重性等挑战尚未解决，临床转化需更深入机制研究和标准化方案 | 研究肠道-肝脏轴在胆管癌发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 胆管癌患者肠道/胆道微生物组、胆汁酸代谢通路及肿瘤免疫微环境 | 医学肿瘤学 | 胆管癌 | 多组学分析、人工智能 | NA | 临床数据、微生物组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 工程化微生物群 | NA | 医学 |
| 539 | 2025-10-05 |
Therapeutic potential of the gut commensal bacterium Parabacteroides goldsteinii in human health and disease treatment
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1618892
PMID:41019532
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综述 | 系统探讨肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的潜在应用价值 | 首次系统综述该菌株通过短链脂肪酸分泌、胆汁酸转化和免疫调节等多重机制对抗多种疾病的治疗潜力 | 面临培养条件优化、剂量效应表征和遗传工具开发等转化挑战 | 评估Parabacteroides goldsteinii作为益生菌在疾病治疗和健康促进中的应用前景 | 肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii及其与宿主互作机制 | 微生物组研究 | 代谢紊乱、神经系统疾病、炎症性疾病、恶性肿瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 540 | 2025-10-05 |
A fragment in the 5' untranslated region of alcohol oxidase 1 promoter significantly influencing gene expression of Komagataella phaffii
2025-Oct-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149745
PMID:40902693
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii的醇氧化酶1启动子5'非翻译区鉴定出一个13bp的负调控元件D3，敲除该片段可使异源蛋白表达提高3.5倍 | 首次在K. phaffii醇氧化酶1启动子5'UTR区鉴定出具有负调控功能的13bp顺式作用元件D3 | NA | 解析K. phaffii醇氧化酶1启动子调控机制并提高异源蛋白表达效率 | Komagataella phaffii醇氧化酶1启动子的5'非翻译区 | 合成生物学 | NA | 基因片段敲除、转录组分析、电泳迁移率变动分析、DNA pull-down、液相色谱-质谱联用 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | 基因敲除 | Komagataella phaffii | 启动子工程改造 | 工业生物技术 |