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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-05 |
Unraveling Nature's Pharmacy: Transforming Medicinal Plants into Modern Therapeutic Agents
2025-Jun-07, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17060754
PMID:40574066
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综述 | 探讨天然产物在药物发现中的潜力,重点介绍传统知识与现代药物开发技术的结合 | 强调传统知识与现代药物发现技术的融合,并重点介绍基因工程、代谢工程、合成生物学等前沿技术在天然产物药物开发中的应用 | 天然产物药物发现仍存在若干问题和固有挑战需要克服 | 探索天然产物在药物发现和开发过程中的潜力 | 天然产物和药用植物 | NA | NA | 基因工程, 代谢工程, 植物细胞培养, 合成生物学, 组学技术, 计算方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 562 | 2025-10-05 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-27, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文讨论了通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产物合成与积累的方法 | 提出三种创新策略:信号序列引导的蛋白质靶向与工程化亚细胞环境结合、多功能融合伴侣的应用、异源酶共表达实现正交翻译后修饰 | NA | 优化本氏烟草中重组蛋白质、多肽和小分子的生产与积累 | 本氏烟草中的重组产物(蛋白质、多肽、小分子) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Nicotiana benthamiana(本氏烟草) | 信号序列融合、合成细胞器、异源酶共表达途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 563 | 2025-10-05 |
Development and flight-testing of modular autonomous cultivation systems for biological plastics upcycling aboard the ISS
2025-Jun-25, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00463-2
PMID:40562752
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研究论文 | 开发并测试用于国际空间站塑料生物升级回收的模块化自主培养系统 | 开发了具有全程序化连续传代和样品保存功能的自主载荷系统MOBP,并在国际空间站进行了首次塑料生物升级回收飞行测试 | NA | 实现空间环境中微生物的自主培养和塑料废弃物的生物升级回收 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料的生物酶解和微生物转化 | 合成生物学 | NA | 微生物培养、酶催化、生物转化 | NA | 传感器监测数据、生物样品 | NA | NA | 微生物 | NA | 环境,能源,材料 |
| 564 | 2025-10-05 |
Systems and synthetic biology for plant natural product pathway elucidation
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115715
PMID:40382775
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综述 | 本文综述了系统生物学和合成生物学在植物天然产物代谢途径解析与工程化中的应用进展 | 整合多种系统生物学方法与深度学习技术解析植物复杂代谢途径,并提出代谢组工程和AI整合等未来发展方向 | NA | 阐明植物天然产物的生物合成途径并提高其生产效率 | 植物天然产物代谢途径 | 合成生物学 | NA | 共表达分析、基因簇鉴定、代谢物分析、深度学习、全基因组关联研究、蛋白质复合物鉴定 | 深度学习 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 代谢工程 | 植物 | 代谢途径工程、代谢组工程 | 医药、工业生物技术 |
| 565 | 2025-10-05 |
Hammerhead Ribozymes: Structural Insights, Catalytic Mechanisms, and Cutting-Edge Applications in Synthetic Biology
2025-Jun-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125624
PMID:40565088
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综述 | 全面回顾了锤头状核酶在合成生物学中的最新研究进展、当前挑战和未来发展方向 | 系统总结了锤头状核酶的结构特性、催化机制及其在合成生物学中的前沿应用 | NA | 为锤头状核酶的生物医学应用提供有价值的观点和见解 | 锤头状核酶(具有催化活性的小RNA分子) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因调控, 疾病治疗, 生物传感 |
| 566 | 2025-10-05 |
The Sustainable Production of Terpenoids in Cyanobacterial Chassis
2025-Jun-10, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13061342
PMID:40572229
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综述 | 本文全面总结了萜类化合物的生物合成途径及利用蓝细菌作为底盘细胞生产萜类化合物的研究进展 | 系统综述了利用光合微生物蓝细菌通过光能和二氧化碳可持续生产外源萜类化合物的最新策略 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学技术增强蓝细菌萜类化合物产量的策略 | 萜类化合物及其在蓝细菌中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 蓝细菌 | 萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 567 | 2025-10-05 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
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综述 | 本文综述了利用植物病毒载体在本氏烟草中建立瞬时表达系统生产生物药物的技术进展与应用前景 | 重点探讨病毒载体瞬时表达系统在突发公共卫生事件中的快速响应能力,以及结合水培技术、可控环境农业和糖基化工程等创新方法提升系统性能 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证,主要基于现有文献分析 | 评估植物分子农业中瞬时表达系统在生物制药领域的应用潜力 | 本氏烟草瞬时表达系统及其在重组蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 病毒载体瞬时表达、糖基化工程、水培技术 | NA | 文献数据 | NA | 植物病毒载体 | 本氏烟草 | 重组蛋白表达系统 | 医药, 工业生物技术 |
| 568 | 2025-10-05 |
Cell-Based Therapies for Solid Tumors: Challenges and Advances
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125524
PMID:40564987
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综述 | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体瘤治疗中的挑战与进展 | 系统比较了肿瘤浸润淋巴细胞、T细胞受体工程化T细胞、CAR-T细胞、CAR-NK细胞和巨噬细胞等新兴细胞疗法的优缺点,并探讨了自体与异体细胞来源的临床意义 | NA | 探讨细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的应用前景和发展方向 | 实体瘤及其微环境 | NA | 实体瘤 | 基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞 | 嵌合抗原受体、药物偶联巨噬细胞 | 医学 |
| 569 | 2025-10-05 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
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研究论文 | 本研究表征了三种小分子诱导和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化控制 | 首次在小鼠胚胎干细胞中系统表征多种合成生物学工具,并展示其可用于驱动直接神经元分化 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 开发控制小鼠胚胎干细胞表达和分化的合成生物学系统 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成发育生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 小鼠胚胎干细胞 | 小分子诱导系统、细胞接触诱导系统 | 基础研究 |
| 570 | 2025-10-05 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
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研究论文 | 本研究提出了一种在巨型单层囊泡中组装细胞核的方法 | 通过改进倒置乳液法提高GUV形成效率,首次在合成脂质体环境中实现功能性核组装 | NA | 在合成细胞中重建真核细胞核结构 | 非洲爪蟾卵提取物和巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法、免疫染色 | NA | 显微镜图像 | NA | 无细胞系统 | 非洲爪蟾 | 核组装系统 | 合成生物学 |
| 571 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-May-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
|
研究论文 | 本研究在单个大肠杆菌底盘细胞中同时构建了两种外源抗原多糖的生物合成途径 | 首次在单一宿主中实现Wzy/Wzx依赖和ABC转运蛋白依赖两种不同生物合成途径的多糖同时生产 | 共表达水平中等程度降低,诱导初期存在弱竞争相互作用 | 开发针对耐药病原体的多价结合疫苗的生产平台 | 大肠杆菌W3110细胞 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 全细胞蛋白质组分析、MFUZZ聚类、基因本体分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 双途径生物合成系统:Wzy/Wzx依赖途径和ABC转运蛋白依赖途径 | 医药 |
| 572 | 2025-10-05 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
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研究论文 | 开发了一个高效的基因组基础模型GenomeOcean,通过大规模宏基因组组装数据训练,提升对稀有微生物物种的表征能力 | 直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练,采用字节对编码(BPE)标记化策略,实现150倍更快的序列生成速度,同时保持高生物保真度 | NA | 开发高效的基因组基础模型,改进对稀有微生物物种的表征能力 | 宏基因组数据集中的微生物物种和蛋白质编码基因 | 机器学习 | NA | 宏基因组测序,字节对编码(BPE) | 生成式基础模型 | 基因组序列数据 | 220TB宏基因组数据集,包含超过600Gbp的高质量重叠群 | NA | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 573 | 2025-10-05 |
Degradable living plastics programmed by engineered spores
2025-Jul, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01713-2
PMID:39169270
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和聚合物工程开发了可降解的活性塑料 | 利用工程化孢子构建可编程降解的活性塑料系统,孢子能在材料加工过程中保持活性并在触发后释放降解酶 | 未明确说明该技术的规模化生产成本和实际应用环境中的降解效率 | 开发可生物降解的环保塑料材料 | 枯草芽孢杆菌孢子和聚己内酯塑料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、基因电路工程 | NA | NA | NA | 基因电路 | 枯草芽孢杆菌 | 木糖诱导型分泌表达伯克霍尔德菌脂肪酶的基因电路 | 环境,材料 |
| 574 | 2025-10-05 |
Autonomous chemo-metabolic construction of anisotropic cell-in-shell nanobiohybrids in enzyme-powered cell microrobots
2025-Jun-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5451
PMID:40561036
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研究论文 | 提出一种化学代谢耦合策略,在细胞生长培养基中自主构建细胞-外壳纳米生物杂合体 | 利用乙醇发酵与酶级联反应自主驱动聚多巴胺纳米壳形成,实现细胞增殖与外壳构建的同步进行 | NA | 开发具有生物自主性的细胞-外壳结构构建方法 | 细胞-外壳纳米生物杂合体 | 合成生物学 | NA | 乙醇发酵、酶级联反应(醇氧化酶和辣根过氧化物酶) | NA | NA | NA | NA | NA | 化学代谢耦合系统 | 合成生物学, 细胞治疗 |
| 575 | 2025-10-05 |
Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening
2025-Jun-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00857
PMID:40375477
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研究论文 | 本研究通过微生物代谢工程构建了一个大规模色胺衍生物库,用于神经精神疾病药物筛选 | 开发了基于生物合成的色胺衍生物大规模生产策略,克服了传统合成化学在通量和多样性方面的限制 | 有63种目标化合物未被检测到,且仅对17种新型N-乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化 | 建立生物发酵平台用于神经精神疾病药物的大规模筛选 | 色胺衍生物及其在神经精神疾病相关受体和转运体上的生物活性 | 合成生物学 | 神经精神疾病 | 微生物代谢工程、发酵技术、酶工程 | NA | 生物活性筛选数据 | 344种推测的生物转化,产生279种产物,17种新型N-乙酰化衍生物进行放大培养 | 代谢工程、合成生物学 | 大肠杆菌 | 色胺生物合成途径,包含脱羧酶、卤化酶、甲基转移酶、异戊烯基转移酶等多种酶的组合 | 医药 |
| 576 | 2025-10-05 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 本研究开发并验证了pXpressome质粒工具包,用于稳健表达和改造α-羧酶体 | 开发了首个能够稳健表达完整功能性α-羧酶体的质粒工具包,通过荧光标记构建体实现了更均匀的表达和更好的细胞健康 | NA | 开发合成生物学工具包以促进羧酶体研究和重新设计 | α-羧酶体及其结构蛋白 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、荧光标记、蛋白质纯化 | NA | 蛋白质表达数据、形态学观察数据 | NA | 质粒工具包 | 微生物 | α-羧酶体表达系统,包含顶点帽蛋白和面形成蛋白的调控元件 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 577 | 2025-10-05 |
Microbial Metabolites: A Sustainable Approach to Combat Plant Pests
2025-Jun-19, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15060418
PMID:40559442
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综述 | 探讨微生物代谢物作为生物活性化合物在植物病虫害综合治理中的应用潜力 | 系统阐述微生物代谢物的分类、生物合成途径及生态功能,并提出利用合成生物学工具增强代谢物生产的创新策略 | NA | 研究微生物代谢物在可持续农业病虫害防治中的应用 | 微生物(细菌、真菌、放线菌)产生的代谢物 | 农业生物技术 | 植物病虫害 | 合成生物学、代谢途径工程 | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学工具 | 细菌, 真菌, 放线菌 | 代谢途径工程 | 农业 |
| 578 | 2025-10-05 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
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研究论文 | 开发了用于枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性菌的高效克隆工具包SubtiToolKit | 首个专门针对革兰氏阳性菌的Golden Gate克隆工具包,填补了该领域空白 | NA | 为革兰氏阳性菌提供标准化合成生物学工具 | 枯草芽孢杆菌及其他革兰氏阳性菌 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Bacillus subtilis, Escherichia coli, Geobacillus, Parageobacillus | 转录单元、操纵子、基因敲入/敲除部件,包含启动子、核糖体结合位点、荧光蛋白、蛋白标签、终止子、基因组整合部件等模块化DNA部件库 | 工业生物技术 |
| 579 | 2025-10-05 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
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研究论文 | 研究碱基修饰如何影响RNA三维结构的折叠和功能 | 首次揭示碱基修饰通过改变堆叠能量而非碱基配对来驱动RNA构象变化 | 仅研究了5mC和N1Ψ两种修饰类型 | 探索碱基修饰对RNA结构折叠和功能的影响机制 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 结构数据, 能量数据 | 两种RNA结构(合成和天然) | RNA折纸技术 | NA | RNA纳米结构 | 医学, 合成生物学 |
| 580 | 2025-10-05 |
Cyanobacterial Peptides in Anticancer Therapy: A Comprehensive Review of Mechanisms, Clinical Advances, and Biotechnological Innovation
2025-May-29, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23060233
PMID:40559642
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综述 | 本文全面综述蓝藻来源多肽作为抗癌药物的作用机制、临床进展与生物技术创新 | 系统整合蓝藻多肽的靶向递送技术、联合治疗策略及合成生物学生产方案 | 存在肿瘤选择性有限、系统毒性和生产可扩展性等挑战 | 挖掘蓝藻多肽在肿瘤治疗领域的临床应用潜力 | 蓝藻来源的生物活性多肽 | NA | 癌症 | 合成生物学、基因组挖掘 | NA | 临床研究数据、临床前研究数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |