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当前共找到 1531 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-26 |
PyFuRNAce: an integrated design engine for RNA origami
2025-Dec-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66290-x
PMID:41326357
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研究论文 | 本文介绍了一个名为pyFuRNAce的开源Python软件包，提供图形用户界面，用于设计复杂的RNA纳米结构，特别是共转录RNA折纸结构，涵盖从基序定义、蓝图设计到序列生成和引物选择的完整工作流程 | 将RNA折纸的整个设计流程整合到单一用户友好平台中，基于基序组装范式，通过直观的Web界面和实时3D可视化实现自定义RNA纳米结构的创建和修改，并设计了迄今最大的共转录RNA折纸结构（2501个核苷酸） | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发用户友好的RNA折纸设计工具，降低RNA纳米技术门槛，加速功能性RNA折纸结构在医学、生物技术和合成生物学中的应用开发 | RNA纳米结构和RNA折纸结构，包括自组装RNA丝、RNA液滴和共转录RNA折纸 | 合成生物学 | NA | 原子力显微镜，共聚焦荧光成像 | NA | 图像 | 三种不同的RNA纳米结构（自组装RNA丝、RNA液滴和2501个核苷酸的共转录RNA折纸） | NA | NA | 基于基序的组装范式设计的RNA纳米结构，包括自组装RNA丝、RNA液滴和共转录RNA折纸 | 医学，生物技术，合成生物学 |
| 42 | 2026-09-26 |
Integrating Microbiomes for Regenerative Food Systems: Recent Insights, Implementations, and Emerging Trends
2025-Dec, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.71312
PMID:41341407
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综述 | 本文综述了微生物组在食品系统中的最新进展，涵盖可持续农业、发酵、食品安全和营养，并讨论了传统方法与精准微生物组工程、合成生物学和机器学习等新技术 | 整合了微生物组在食品系统中的传统与前沿应用，并考虑了社会经济背景，强调高收入国家与中低收入国家在方法上的差异 | 营养和健康效应仅作为下游后果讨论，未深入探讨；未提供具体实验数据或案例的定量分析 | 综述微生物组在食品系统中的应用，包括可持续农业、发酵、食品安全和营养，并探讨传统与先进技术的前景与挑战 | 微生物组及其在食品系统中的应用 | 机器学习 | NA | 精准微生物组工程、合成生物学、机器学习 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业, 医学, 环境 |
| 43 | 2026-09-26 |
On the Choice of the Right Plasmid Vector(s) in the Times of Synthetic Biology
2025-12, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70273
PMID:41395802
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综述 | 本文综述了在合成生物学时代如何选择正确的质粒载体，重点讨论了决定质粒性能的架构和功能特征，如复制起点、拷贝数、装载容量、选择标记和稳定性系统，并探讨了广宿主范围载体、模块化架构、替代选择策略和增强稳定性的方法。 | 文章系统性地整合了质粒载体选择的多方面因素，强调了从便利性到信息选择的转变，并讨论了标准化与定制化的融合以及AI辅助质粒设计工具等新兴趋势。 | 文章指出，为了确保工程化功能在实验室、工业和环境中的稳健部署，需要对质粒-宿主相互作用有更深入的系统级理解。 | 简要说明本文的研究目的或领域：为合成生物学中质粒载体的选择提供指导，并探讨质粒工程的新兴策略。 | 质粒载体及其与宿主细菌的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA合成，AI辅助质粒设计，mini-transposons，recombinase-assisted platforms，CRISPR-associated transposases | NA | 文本 | NA | CRISPR-associated transposases, mini-transposons, recombinase-assisted platforms | 非模型细菌 | NA | 医学，工业生物技术，环境 |
| 44 | 2026-09-26 |
Recent advances of engineered probiotics for therapeutic applications
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100039
PMID:41415685
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综述 | 本文综述了近年来工程化益生菌在疾病治疗中的研究进展 | 系统总结了工程化益生菌在癌症、胃肠道疾病、感染性疾病和代谢紊乱等疾病治疗中的最新应用 | 未进行具体实验验证，仅对现有研究进行归纳总结 | 总结工程化益生菌在疾病治疗中的最新进展，并讨论其挑战与机遇 | 工程化益生菌 | 合成生物学 | 癌症, 胃肠道疾病, 感染性疾病, 代谢紊乱 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 45 | 2026-09-26 |
Intergenerational justice, the impending sixth mass extinction, reproduction and advanced biotechnologies, and humanity's future
2025, Cambridge prisms. Extinction
DOI:10.1017/ext.2025.10005
PMID:41322091
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综述 | 探讨代际正义、第六次物种大灭绝、生殖与先进生物技术及人类未来的关系，主张通过生殖生物技术和生物样本库保护物种遗传多样性 | 提出将先进生殖生物技术（包括基因工程和合成生物学）与野生动物生物样本库相结合，通过去灭绝、恢复近期灭绝物种和维持现存物种遗传多样性来实现生物圈管理的新视野 | 先进生殖生物技术在人类利益、物种管理和生物圈可持续性方面的应用受到不断演变的伦理和法律框架的制约，特别是涉及基因工程、超人类主义和古代物种去灭绝方面 | 探讨如何通过生殖和先进生物技术最大化地球生物多样性遗产和生物圈可持续性，以造福未来世代 | 3000多种极度濒危的陆生/淡水物种，包括两栖类、小型鱼类、淡水贻贝、螯虾、爬行动物、鸟类和哺乳动物 | NA | NA | 基因工程，合成生物学，生殖生物技术，生物样本库 | NA | 文本 | 超过3000种极度濒危陆生/淡水物种 | NA | NA | NA | 医学，农业，环境 |
| 46 | 2026-09-26 |
From pandemics to preparedness: harnessing AI, CRISPR, and synthetic biology to counter biosecurity threats
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1711344
PMID:41383331
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综述 | 本文综述了人工智能、CRISPR和合成生物学等新兴技术在生物安全威胁防控中的应用，涵盖疫情预测、病原检测、治疗开发、防护装备及网络生物安全等方面 | 系统整合了AI流行病预测、下一代测序、CRISPR诊断、数字流行病学、mRNA/DNA疫苗平台、纳米抗体疗法、机器人技术、生物传感器和纳米技术防护装备等多种前沿技术，提出将新兴技术与国际合作、公平体系和灵活政策相结合以构建面向未来的生物安全防御体系 | 新兴技术面临伦理、法律和公平性问题，需要负责任地治理并确保所有人都能获得这些技术 | 探讨如何利用AI、CRISPR和合成生物学等新兴技术应对自然暴发、实验室事故和蓄意生物恐怖主义等生物安全威胁 | 生物安全威胁，包括自然疫情暴发、实验室事故和蓄意生物恐怖主义 | 机器学习, 数字病理学 | 传染病 | 人工智能, CRISPR诊断, 下一代测序, 数字流行病学, mRNA疫苗平台, DNA疫苗平台, 单克隆抗体, 纳米抗体疗法, 生物传感器, 纳米技术 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 环境 |
| 47 | 2026-09-26 |
Synthetic biology approaches to enhance cancer immune responses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698158
PMID:41394856
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法增强癌症免疫应答的最新进展，涵盖基于微生物的疗法和CAR-T细胞工程 | 整合了微生物疗法和CAR-T细胞工程两大平台，通过可编程基因电路实现布尔逻辑运算，确保治疗仅在肿瘤特异性生物标志物存在时激活 | 临床转化面临重大障碍，包括安全性问题、免疫清除和制造复杂性 | 总结合成生物学在增强癌症免疫应答方面的最新进展，探讨精准工程化免疫疗法的发展方向 | 基于微生物的疗法、CAR-T细胞工程、合成基因电路 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因电路构建、CAR-T细胞工程 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 哺乳动物细胞 | 可编程基因电路、布尔逻辑门、装甲型CAR-T、逻辑门控CAR-T | 医学 |
| 48 | 2025-12-20 |
What do you most hope we will achieve with mammalian synthetic biology within the next decade?
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101485
PMID:41412111
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2026-09-25 |
Thermodynamically consistent, reduced models of gene regulatory networks
2025-Jul, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.241725
PMID:40746961
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研究论文 | 本文开发了一种热力学一致、计算高效的基因表达动力学模型，并将其用于细胞群体的agent-based建模，以研究toggle switch和repressilator电路行为 | 采用模型降阶方案简化翻译过程，并使用键合图确保热力学一致性，从而构建出既计算高效又符合物理定律的基因表达模型 | 摘要中未明确提及研究限制 | 开发适用于大规模细胞群体agent-based模型的热力学一致且计算高效的基因表达模型，并探索资源可用性和细胞间异质性对电路行为的影响 | 基因调控网络，具体包括toggle switch和repressilator电路，以及细胞群体 | 合成生物学 | NA | NA | 动力学模型, agent-based模型, 键合图 | NA | NA | NA | NA | toggle switch, repressilator | 医学, 工业生物技术 |
| 50 | 2026-09-25 |
How many plasmids can bacteria carry? A synthetic biology perspective
2025-07, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240378
PMID:40730232
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综述 | 本文从合成生物学视角探讨细菌携带质粒数量的理论上限与实践限制，分析多质粒系统的现有证据与应用 | 首次系统性地探讨单一细菌可携带独特质粒的最大数量，从理论和实践两方面进行综合分析，并比较多质粒系统与其他非质粒策略在代谢工程和合成生物学中的优势 | 缺乏实验数据验证理论推测的最大质粒数量，主要基于现有文献的归纳总结而非原创实验研究 | 探讨细菌中多质粒系统的维持机制，明确单一微生物可携带独特质粒的最大数量，并评估多质粒系统在代谢工程和合成生物学中的应用潜力 | 细菌中的多质粒系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 51 | 2026-09-25 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-06-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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综述 | 本文综述了羧酶体的结构、功能及其在提高作物光合效率中的应用前景。 | 系统总结了羧酶体生物发生、Rubisco组织及外壳功能的最新进展，并提出了将其移植到植物叶绿体以提高光合效率的策略。 | 外壳的精确作用机制尚不清楚，缺乏合适的碳酸氢盐转运蛋白，表达水平调控困难。 | 理解羧酶体以增强作物碳固定。 | 羧酶体、Rubisco、碳酸氢盐转运蛋白、植物叶绿体。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 52 | 2026-09-24 |
ChronoSort: Revealing Hidden Dynamics in AlphaFold3 Structure Predictions
2025-Dec, SynBio
DOI:10.3390/synbio3040018
PMID:42583324
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研究论文 | 该研究开发了ChronoSort算法，从AlphaFold3的静态结构预测中提取动态构象信息，并证明其与分子动力学模拟结果高度相关。 | 首次证明AlphaFold3的结构集合包含与分子动力学模拟高度相关的动态信息，并提出ChronoSort算法将静态预测组织成时间连贯的轨迹。 | 未明确说明，可能依赖于AlphaFold3预测质量且仅在四个蛋白质靶标上验证。 | 探索从AlphaFold3结构预测中提取蛋白质动态信息的可行性，并开发相应算法。 | 四种不同的蛋白质靶标。 | 计算生物学、结构生物信息学 | NA | AlphaFold3结构预测、分子动力学模拟 | AlphaFold3 | 蛋白质结构数据 | 四种蛋白质 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、蛋白质工程、药物发现 |
| 53 | 2026-09-24 |
Smart closed-loop drug delivery systems
2025-Oct, Nature reviews bioengineering
DOI:10.1038/s44222-025-00328-z
PMID:42583055
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综述 | 本文综述了智能闭环药物递送系统在可穿戴和可植入技术方面的最新进展，探讨了设备设计、人工智能增强控制算法以及合成生物学整合等关键问题 | 强调将合成生物学和工程化细胞整合到可植入设备中，并利用人工智能增强闭环系统的控制算法以实现更有效和自适应的个性化治疗 | 可穿戴与可植入系统之间存在设计权衡，实时生物传感与自动给药整合仍面临挑战 | 探讨智能闭环系统在长期慢性病管理或治疗中的药物递送应用，勾画下一代闭环系统的发展路径 | 智能闭环药物递送系统，包括可穿戴和可植入技术 | 数字病理学 | NA | 实时生物传感、自动药物递送、人工智能控制算法、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 闭环控制系统 | 医学 |
| 54 | 2026-09-23 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2025-Sep, PRX life
DOI:10.1103/99bt-4ss4
PMID:42281556
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研究论文 | 该文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制，并建立了一个包含热力学约束的数学模型来研究其在简单代谢通路中的应用 | 提出了一种酶通过相分离自组织成近乎最优大小和间距的聚集体的策略，且其“粘性”受局部底物可用性调控，酶簇仅在需要处理底物时和地点形成 | 研究主要基于理论数学模型，尚未在活细胞中进行实验验证，且酶粘性的变构调控机制仍需进一步探索 | 探究酶聚集如何通过底物依赖的粘性实现自组织，以提高代谢通路通量并减少有毒中间产物，为合成生物学和代谢工程提供新策略 | 简单代谢通路中的后续酶及其底物 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 数学建模, 热力学约束分析 | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | 底物依赖的酶自组织聚集通路 | 医学, 工业生物技术 |
| 55 | 2026-09-21 |
Systemic engineering and global regulation enabling high-level bilirubin biosynthesis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67804-3
PMID:41436472
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研究论文 | 本文报道了一种全体外生物合成途径，将血红素转化为胆红素，滴度达到1.7 g/L，转化率为95.8% | 首次实现全体外高效胆红素生物合成，揭示了Fe²⁺诱导中间体氧化降解的隐藏瓶颈，并通过竞争性铁螯合和质子化状态调节缓解降解，同时引入一氧化碳脱氢酶消除CO抑制，结合NADPH再生系统，使产量提高20倍 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 实现胆红素的高水平生物合成并解析其瓶颈 | 胆红素生物合成途径中的酶和中间体 | 合成生物学 | NA | 体外酶催化、DFT计算、NADPH再生 | NA | NA | NA | NA | NA | 体外多酶级联反应途径 | 医药 |
| 56 | 2026-09-21 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-11-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
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综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为通用型生物生产底盘的研究进展、挑战与前景，涵盖遗传工具开发、产物合成及规模化生产策略 | 系统整合了三角褐指藻在合成生物学工具（如CRISPR-Cas基因组编辑、叶绿体基因表达、DNA定点整合）和营养方式改造等方面的最新进展，并首次全面探讨了从模型硅藻到可规模化生物制造平台的转化路径，包括技术经济分析和监管政策 | 未涉及具体实验验证，主要基于现有文献的归纳分析；对某些新兴策略的实际可行性和经济性缺乏定量评估 | 总结三角褐指藻作为光合生物生产底盘的研究现状，分析关键瓶颈，并提出加速其工业化应用的潜在策略 | 海洋硅藻三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统、叶绿体基因表达、DNA定点整合 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻 | NA | 医药、材料、工业生物技术、能源 |
| 57 | 2026-09-20 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 该研究提出了一种利用深度学习设计在活体小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子的通用策略 | 首次证明深度学习设计的组织特异性增强子能够在哺乳动物活体组织的复杂调控环境中可靠发挥作用，并通过迁移学习在已验证的增强子上微调紧凑型CNN模型 | 研究仅在三种组织（心脏、肢体和中枢神经系统）中验证了十五个合成增强子，未涵盖更广泛的组织类型，且未评估长期稳定性和潜在的脱靶效应 | 开发一种能够在哺乳动物活体组织中可靠设计组织特异性增强子的通用策略 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 | 机器学习 | NA | 全基因组染色质可及性测序、深度学习、迁移学习 | CNN | 基因组序列、染色质可及性数据 | 十五个合成增强子，在心脏、肢体和中枢神经系统中验证 | NA | 小鼠 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 58 | 2026-09-20 |
New chlorophylls designed by theoretical spectroscopy and machine learning
2025-Dec-11, Photosynthesis research
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s11120-025-01183-0
PMID:41379254
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研究论文 | 该文章通过理论光谱学和机器学习方法，计算探索了超过25万种叶绿素变体的光学性质，以寻找合成生物学的潜在靶点 | 利用机器学习结合TD-DFT和DFT/MRCI验证，大规模探索了超过25万种叶绿素变体的光学性质，发现Chl f是最佳单取代红移叶绿素，Chl b并非绿色区域光子捕获的最佳选择，且叶绿素T1能量可被微调 | 研究为纯计算预测，未进行实验验证，且叶绿素变体的实际应用需要找到合适的合成途径 | 计算探索扩展的叶绿素变体集合，寻找合成生物学中可用于调控产氧光合作用的潜在靶点 | 超过25万种叶绿素变体，包括Chl b、Chl d、Chl f及二乙烯基叶绿素a和b | 机器学习 | NA | 机器学习、时变密度泛函理论（TD-DFT）、多参考密度泛函理论（DFT/MRCI） | 机器学习模型 | 分子结构及光学性质数据 | 超过250,000种叶绿素变体 | NA | NA | NA | 能源、合成生物学 |
| 59 | 2026-09-20 |
Bacillus velezensis LoaP promotes antitermination by antagonizing NusA
2025-12-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01429-25
PMID:41147751
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研究论文 | 本研究通过纯化RNA聚合酶和转录因子，体外重构了Bacillus velezensis中difficidin操纵子的抗终止活性，发现LoaP通过特异性拮抗NusA来促进抗终止 | 首次证明LoaP类NusG旁系同源物的抗终止机制不同于RfaH范式，LoaP通过特异性拮抗NusA实现抗终止，且不需要其他因子参与；首次在革兰氏阳性菌中研究抗终止复合物 | 研究主要在体外重构系统中进行，体内验证可能有限；仅针对difficidin操纵子进行了研究，未验证其他LoaP调控的操纵子 | 探究LoaP蛋白的抗终止机制及其与NusA的相互作用 | Bacillus velezensis中的LoaP蛋白、NusA蛋白、RNA聚合酶及difficidin操纵子 | 分子生物学 | NA | 体外转录重构、RNA聚合酶和转录因子纯化 | NA | NA | NA | NA | Bacillus velezensis | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 60 | 2026-09-20 |
Overcoming the eIF2α Brake in Human Cell-Derived Translation Systems
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688697
PMID:41497621
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研究论文 | 本研究系统探索了克服人细胞翻译系统中eIF2α磷酸化抑制瓶颈的互补策略，包括基因组编辑和表达型拯救 | 系统性比较了精准基因组编辑（eIF2α-S52A和PKR敲除）与piggyBac介导的GADD34/K3L表达型拯救策略，并首次在iPSC分化的心肌细胞和原代人成纤维细胞中验证了表达型拯救的可行性 | 表达型拯救策略的翻译提升效果可能不如基因组编辑优化，且Tet诱导表达系统需要持续添加诱导剂；研究主要基于Expi293F、iPSC和原代成纤维细胞，未在其他人类细胞类型中广泛验证 | 系统探索克服人细胞无细胞翻译系统中eIF2α磷酸化抑制瓶颈的互补策略，以提高翻译产量 | Expi293F悬浮细胞、KOLF2.1J iPSC及其分化的心肌细胞、原代人成纤维细胞 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、piggyBac转座子系统、Tet诱导表达系统、无细胞翻译系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, piggyBac | 人细胞（Expi293F、iPSC、原代成纤维细胞） | Tet诱导型GADD34和K3L表达盒 | 医学, 工业生物技术 |