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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-14 |
Host Factors Promoting the LTR Retrotransposon Life Cycle in Plant Cells: Current Knowledge and Future Directions
2025-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010374
PMID:41516247
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综述 | 本文综述了植物细胞中促进LTR反转座子生命周期的主机因素,探讨了其与宿主过程的整合及未来研究方向 | 提出整合植物移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学和互作组学来阐明植物特异性机制 | 精确机制在植物中仍不明确,尤其是针对富含LTR反转座子的植物 | 探讨促进植物中LTR反转座子转座的主机蛋白质 | LTR反转座子及其与植物宿主细胞的相互作用 | 植物生物学 | NA | 移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学、互作组学 | NA | 文献分析 | NA | 基因组编辑 | 植物细胞 | NA | 农业 |
| 42 | 2026-01-14 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的通用策略,用于设计在小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子 | 首次将深度学习模型应用于哺乳动物活体组织的增强子设计,成功实现了在复杂调控环境下对组织特异性基因表达的程序化控制 | 研究仅在小鼠胚胎中验证了三种组织(心脏、肢体、中枢神经系统)的增强子功能,尚未扩展到更多组织类型或成年动物模型 | 开发能够预测和设计在哺乳动物活体组织中有效工作的组织特异性增强子的通用框架 | 小鼠胚胎的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 深度学习,全基因组染色质可及性分析,迁移学习 | 卷积神经网络(CNN) | 基因组序列数据,染色质可及性数据 | 使用了已验证的人类和小鼠增强子数据进行迁移学习,并设计了15个合成增强子在小鼠胚胎中进行测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性基因表达增强子 | 功能基因组学,合成生物学,基因治疗 |
| 43 | 2026-01-14 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66964-6
PMID:41422091
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的细胞游离基因表达工作流程,用于优化基于变构转录因子的生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离工作流程,结合方向性标签训练模型,快速优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器,用于环境监测和人类健康中的铅污染检测 | 变构转录因子PbrR作为生物传感器,用于饮用水中的铅检测 | 合成生物学 | NA | 细胞游离基因表达、机器学习模型训练 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 序列到功能数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于定向进化中,但未明确指定),机器学习框架 | 细胞游离系统(无特定宿主生物) | 基于变构转录因子的生物传感器,用于铅检测 | 环境监测 |
| 44 | 2026-01-14 |
Cyanobacteria-Derived Extracellular Vesicles: A Novel Frontier in Drug Delivery and Therapeutics
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010004
PMID:41515885
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综述 | 本文综述了蓝藻来源的细胞外囊泡作为新型药物递送载体的潜力、优势、应用领域及面临的挑战 | 首次系统性地探讨蓝藻细胞外囊泡作为专用纳米载体平台的潜力,并与现有合成载体进行比较分析 | 蓝藻细胞外囊泡的大规模分离和表征仍存在挑战,其相对于现有系统的具体优势和局限性尚未被系统总结 | 探索蓝藻细胞外囊泡在药物递送和治疗应用中的潜力 | 蓝藻来源的细胞外囊泡 | NA | 癌症、神经退行性疾病、感染性疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 医药 |
| 45 | 2026-01-14 |
[Building on 40 Years, Now Pioneering the Future: Preface to the 40th Anniversary Issue of the Chinese Journal of Biotechnology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250804
PMID:41457585
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评论 | 本文是《中国生物技术杂志》创刊40周年特刊的序言,回顾了期刊的贡献并展望了未来 | 作为40周年特刊的序言,系统总结了期刊在推动中国生物技术创新与转化方面的历史作用 | NA | 纪念期刊创刊40周年,展示生物技术领域的最新进展并展望未来发展方向 | 《中国生物技术杂志》及其40周年特刊收录的40篇文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物制造、健康、能源、农业 |
| 46 | 2026-01-14 |
Artificial intelligence in biology and medicine
2025-Oct-17, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02029-4
PMID:41107683
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综述 | 本文探讨了人工智能在生物学和医学领域的角色、应用、未来趋势、挑战及伦理问题 | 系统性地综述了AI在生物学多个子领域(如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞与合成生物学)及医学领域(如诊断、疫苗开发、疾病治疗)的应用,并探讨了可解释AI、生物启发模型、以及AI与机器人学、纳米技术等先进技术的协同作用 | 分析了AI面临的局限与挑战,包括伦理与法律问题、数据质量问题以及标准化的需求 | 探讨人工智能在生物学和医学领域的应用潜力、未来发展方向及其带来的机遇与风险 | 人工智能技术及其在生物学(如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞生物学、合成生物学)和医学(如疾病诊断、疫苗开发、治疗,包括COVID-19)中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 47 | 2026-01-13 |
Overcoming the eIF2α Brake in Human Cell-Derived Translation Systems
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688697
PMID:41497621
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研究论文 | 本研究通过基因编辑和表达调控策略,克服了人源细胞无细胞翻译系统中由eIF2α磷酸化抑制的翻译瓶颈 | 系统探索了在可编辑和难编辑的人源细胞类型中,通过基因编辑eIF2α-S52A、敲除PKR激酶,以及利用piggyBac系统表达GADD34/K3L来绕过eIF2α磷酸化抑制的互补策略 | 基因编辑在某些细胞类型(如原代细胞)中不适用,表达策略可能引入额外的调控复杂性 | 提高人源细胞无细胞翻译系统的翻译效率和生产力 | 人源细胞无细胞翻译系统、eIF2α磷酸化调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、piggyBac转座子系统、Tet诱导表达系统 | NA | NA | Expi293F悬浮细胞、诱导多能干细胞(iPSCs)、原代人成纤维细胞、心肌细胞 | CRISPR-Cas9, piggyBac | 人源细胞(Expi293F, iPSCs, 原代成纤维细胞, 心肌细胞) | Tet诱导启动子控制的GADD34/K3L表达盒,用于调控eIF2α磷酸化状态 | 医学, 工业生物技术 |
| 48 | 2026-01-11 |
A review on squalene production by engineered yeasts: Current advances and perspectives
2025-Dec-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108792
PMID:41475586
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综述 | 本文综述了利用工程化酵母生产角鲨烯的当前进展与前景 | 首次对工程化酵母生产角鲨烯的研究进行了全面系统的总结,并探讨了新兴酵母菌种的潜力及未来可能应用的技术 | NA | 总结和探讨利用合成生物学策略通过工程化酵母生产角鲨烯的方法与前景 | 工程化酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 49 | 2026-01-11 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能与分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制,并通过异源表达策略验证其功能 | 研究主要在拟南芥异源系统中进行,尚未在小麦本物种中完全验证;分子调控网络细节需进一步解析 | 探究非编码RNA调控植物耐冷性的分子机制,为作物分子模块育种提供理论基础 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)及转基因拟南芥 | 植物分子生物学 | 非疾病研究(植物非生物胁迫) | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS与MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥株系(具体数量未明确说明) | 转基因技术 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | NA | 农业 |
| 50 | 2026-01-10 |
Spatial engineering for biocatalytic cascade control through biomolecular compartmentalization
2025-Dec-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108786
PMID:41475588
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综述 | 本文系统评估了通过生物分子区室化实现生物催化级联控制的空间工程平台 | 建立了理解不同空间控制原理的框架,并展望了面向合成生物学和细胞工程的多功能空间组织工具和仿生平台的未来发展 | 当前在机制阐明、动态调控和跨系统兼容性方面存在局限 | 通过生物分子区室化实现生物催化过程的代谢通量调控 | 空间工程平台,包括支架化区室(脂质体、DNA折纸、聚合物囊泡和细菌微区室)和无支架组装体(无膜细胞器和凝聚层) | 合成生物学 | NA | 生物分子区室化 | NA | NA | NA | DNA折纸, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 哺乳动物细胞 | 代谢通路, 生物传感器 | 工业生物技术, 医药 |
| 51 | 2026-01-10 |
Development and application of synthetic biology tools for improved production of human breast milk components
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.002
PMID:41497495
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综述 | 本文综述了合成生物学工具在提高人乳成分微生物发酵生产效率和构建细胞工厂方面的应用 | 系统总结了合成生物学工具在优化人乳成分生产中的潜在应用,并探讨了相关细胞工厂构建的挑战与机遇 | NA | 提高人乳成分的微生物发酵生产效率,以降低生产成本、简化制造过程并减少环境污染 | 人乳成分及其在微生物细胞工厂中的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞 | 生物传感器, 代谢途径 | 医药, 食品, 工业生物技术 |
| 52 | 2026-01-10 |
Construction of microbial systems for polyethylene terephthalate degradation
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.013
PMID:41497499
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综述 | 本文综述了用于聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解的微生物系统的构建研究现状 | NA | NA | 探讨PET塑料微生物降解的研究现状与未来发展潜力 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料 | 合成生物学 | NA | 微生物降解、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 53 | 2026-01-10 |
[Research advances in biosynthetic pathways of monoterpenes]
2025-Oct, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
综述 | 本文系统梳理了单萜类化合物的已知生物合成途径,重点分析了各阶段调控酶的催化原理与特性,并讨论了单萜异源生产的影响因素 | 通过整合测序技术与合成生物学研究,为单萜生产提供绿色、高效、可持续的生物合成替代方案,并系统分析途径中的关键酶及其作用机制 | NA | 为更好地理解单萜生物合成途径的进化奠定基础,并为利用微生物高效生产高价值活性单萜化合物提供方向 | 单萜类化合物的生物合成途径及其调控酶 | 合成生物学 | NA | 测序技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 单萜生物合成途径 | 食品,化妆品,医药 |
| 54 | 2026-01-10 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的多目标优化方法,用于设计和优化基于变构转录因子的无细胞生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 提出了一种结合机器学习、定向标记和无细胞基因表达的多目标优化框架,可同时优化生物传感器的灵敏度和选择性,克服了传统定向进化的局限性 | NA | 开发用于饮用水铅检测的高性能无细胞生物传感器 | 基于变构转录因子PbrR的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 机器学习、无细胞基因表达、定向进化 | 机器学习模型 | 序列到功能数据、配对数据集 | NA | NA | 无细胞系统 | 基于变构转录因子的生物传感器 | 环境监测 |
| 55 | 2026-01-10 |
Cnidarian toxins: omics approaches and recombinant proteins
2025, The journal of venomous animals and toxins including tropical diseases
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了利用组学技术和重组蛋白方法研究刺胞动物毒素的最新进展、局限性与未来前景 | 整合了组学技术、重组表达系统、合成生物学及人工智能计算工具在刺胞动物毒素研究中的协同应用,并展望了其在生物活性化合物开发中的潜力 | 复杂毒素的功能验证与生产仍具挑战性,尤其是需要复杂折叠或翻译后修饰的毒素;细胞游离蛋白合成系统等新技术的工业可扩展性仍有限 | 探索刺胞动物毒素的分子多样性、药理潜力及其作为生物活性化合物的来源 | 刺胞动物(如水母、海葵等)产生的毒素 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、重组蛋白表达、细胞游离蛋白合成系统 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 56 | 2026-01-09 |
Synthetic bacterium-facilitated colonization of nitrogen-fixing bacteria for remodeling the rhizosphere microbiome and improving plant yield
2025-Nov-29, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02189-5
PMID:41318663
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,利用表达多糖结合蛋白的工程菌EcCMC,促进固氮细菌在豆科植物根部的定殖,从而改善根际微生物组、提高固氮效率和植物产量 | 首次设计并应用表达表面展示人工多糖识别蛋白Cmc的合成细菌EcCMC,以增强固氮细菌在植物根部的定殖能力,从而调控根际微生物组 | 研究仅针对两种豆科植物(紫云英和紫花苜蓿)进行了短期(28天)实验,样本量较小(n=3),且未评估长期效应或在不同环境条件下的适用性 | 通过合成生物学手段改善固氮细菌在植物根部的定殖效率,以增强生物固氮作用、提高土壤肥力和植物产量 | 豆科植物(紫云英和紫花苜蓿)及其根际微生物组,包括固氮细菌(如Sinorhizobium meliloti和Sphingomonas endophytica)和工程菌EcCMC | 合成生物学 | NA | 16S rRNA基因扩增子测序、代谢组学分析、氮酶活性测定 | NA | 微生物组测序数据、代谢物数据、生化指标数据 | 每组3个重复,共3个处理组(对照组、NFBs加EcM组、NFBs加EcCMC组) | 基因工程 | 大肠杆菌(E. coli) | 设计表达表面展示人工多糖识别蛋白Cmc的合成细菌EcCMC,用于结合植物根部多糖并促进固氮细菌定殖 | 农业 |
| 57 | 2026-01-09 |
Recent advances in nucleic acid nanotechnology-driven artificial transcriptional components
2025-Nov-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03210e
PMID:41221719
|
综述 | 本文综述了核酸纳米技术在转录调控中的应用,重点介绍了其在模块化设计、动态响应和逻辑信息处理方面的优势 | 利用核酸纳米技术的可编程性、时空精确性和分子级可控性,构建人工转录组件以实现精确的转录调控 | NA | 探讨核酸纳米技术在转录调控领域的应用潜力 | 人工转录组件及其在转录过程中的调控机制 | 合成生物学 | NA | 核酸纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工转录组件,包括模块化设计、动态响应和逻辑信息处理 | 生物计算、智能生物制造、生物传感 |
| 58 | 2026-01-09 |
Recent advances in the transformation of maleimides via annulation
2025-Jan-02, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d4ob01632g
PMID:39545834
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综述 | 本文综述了2019年至2024年间马来酰亚胺通过环化反应转化的最新研究进展,重点介绍了其在环化、苯环化、环加成和螺环化等反应中的应用 | 总结了光催化和电化学等新兴方法在马来酰亚胺环化反应中的应用,拓展了其合成复杂分子的可持续性和选择性途径 | 某些反应如基于环加成的环化、光环化和电化学转化在制药和化学工业中潜力巨大但尚未被充分探索 | 系统梳理马来酰亚胺环化策略的研究进展,探讨其在合成生物学和材料科学中的新应用方向 | 马来酰亚胺骨架及其环化反应 | 有机化学 | NA | 光催化、电化学方法、C-H活化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物化学、药物发现、材料科学 |
| 59 | 2026-01-09 |
Harnessing mass spectrometry-based proteomics for continuous directed evolution
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf017
PMID:41492657
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研究论文 | 本文探讨了如何利用基于质谱的蛋白质组学技术来支持连续定向进化过程,以AtMS1和AtMS2甲硫氨酸合酶的连续进化为例 | 首次将基于质谱的蛋白质组学(包括全蛋白质组分析和靶向蛋白质组学)系统性地应用于连续定向进化过程中,以监测目标酶丰度、识别群体构建缺陷、测量代谢适应并指导进化策略决策 | NA | 开发并展示一种利用蛋白质组学技术来增强连续定向进化效率和理解进化机制的方法 | 甲硫氨酸合酶AtMS1和AtMS2的连续定向进化过程 | 合成生物学 | NA | 基于质谱的蛋白质组学(全蛋白质组分析、靶向蛋白质组学) | NA | 蛋白质组数据 | NA | 连续定向进化 | 平台细胞(具体未指明) | NA | 工业生物技术 |
| 60 | 2026-01-09 |
Emerging trends in genome integration tools for precision engineering of diverse bacterial species
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf019
PMID:41492658
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综述 | 本文综述了用于多种细菌物种精确基因编辑的基因组整合工具的新兴趋势,重点关注自包含、便携式系统 | 强调CRISPR引导系统与整合酶结合的最新进展,以及面向非模式生物的工程化趋势 | 依赖宿主DNA修复机制的传统技术限制了在缺乏这些能力的生物中的应用 | 探索和推动细菌基因组精确整合工具的发展,以实现细胞表型的全面工程化和新生物技术的创建 | 细菌物种,特别是非模式生物 | 合成生物学 | NA | 同源重组、CRISPR引导系统、整合酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 重组工程技术 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |