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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-05 |
A path to perpetual chemical synthesis via photocatalytic cofactor regeneration
2025-Jun-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc02770e
PMID:40453794
|
综述 | 探讨通过光催化辅因子再生实现可持续化学合成的设计原则与前景 | 提出将光催化辅因子再生与天然酶循环整合以实现连续化学生产的新范式 | 集成系统存在现有技术限制,需多学科协同解决 | 开发可持续的化学合成方法以降低碳足迹 | 辅因子再生系统与酶催化循环 | 合成生物学 | NA | 光催化、生物催化 | NA | NA | NA | NA | NA | 辅因子再生循环系统 | 工业生物技术, 能源 |
| 582 | 2025-10-05 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
|
研究论文 | 本研究开发了分支卷积神经网络结合微流控荧光激活细胞分选技术,用于合成酵母启动子的理性设计与高通量筛选 | 提出分支卷积神经网络学习天然启动子的序列组成和结构特性,结合微流控FACS系统实现高通量单细胞分选,筛选效率达7000细胞/秒 | NA | 开发酵母合成启动子的理性设计与高通量筛选方法 | 酵母启动子(特别是乙醇氧化酶1启动子P) | 合成生物学 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS),分支卷积神经网络(B-CNN) | 分支卷积神经网络(B-CNN),遗传算法 | DNA序列数据,荧光图像数据 | NA | 遗传算法 | 酵母 | 合成启动子设计,代谢途径工程 | 工业生物技术,医药 |
| 583 | 2025-10-05 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
|
研究论文 | 开发了一种基于完全翻译后修饰的合成磷酸化网络平台SPN-FLUX,用于快速实时报告细胞信号事件 | 首次将合成磷酸化网络与分裂荧光/发光蛋白整合,创建了不依赖转录过程的快速响应平台 | 目前仅在哺乳动物细胞模型中验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发能够快速实时监测细胞信号事件的合成生物学工具 | 合成磷酸化网络、分裂荧光蛋白、分裂发光蛋白、哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 合成磷酸化网络、荧光蛋白成像、发光蛋白检测 | NA | 荧光信号、发光信号 | NA | 合成生物学平台设计 | 哺乳动物细胞 | 膜结合受体配体诱导二聚化激活、组成型活性细胞内生物传感器、缺氧响应生物传感器 | 生物医学研究,环境监测 |
| 584 | 2025-10-05 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
|
研究论文 | 开发了一套用于革兰氏阴性细菌的标准化群体感应工具系统 | 基于SEVA质粒架构开发了包含发送器和接收器模块的三种标准化群体感应系统,提供了数学模型和速率参数支持 | 主要针对合成生物学底盘细菌进行测试,在其他细菌物种中的应用可能需要进一步验证 | 开发标准化的群体感应工具以促进合成微生物联盟的工程化 | 革兰氏阴性细菌和合成微生物联盟 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统构建、数学建模 | NA | 实验数据、数学模型参数 | NA | SEVA质粒系统 | 合成生物学底盘细菌 | 群体感应发送器和接收器模块、微生物联盟通信系统 | 工业生物技术 |
| 585 | 2025-10-05 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-Jun-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
|
研究论文 | 开发了一种通过转录因子调控CRISPR-Cas12a活性的合成生物学平台 | 首次利用工程化DNA转换器实现转录因子对CRISPR-Cas12a反式切割活性的调控 | 仅测试了TATA结合蛋白和Myc-Max两种转录因子模型 | 建立转录因子调控CRISPR-Cas系统的新型合成生物学平台 | CRISPR-Cas12a系统、转录因子、DNA转换器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a、DNA结构转换技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas13a | NA | TF调控的CRISPR网络、人工多分子通讯通路、荧光RNA适体激活系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 586 | 2025-10-05 |
Smart coacervate microdroplets: biomimetic design, material innovations, and emerging applications in biomacromolecule delivery
2025-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.06.016
PMID:40547321
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综述 | 系统探讨凝聚微滴的设计原理、材料创新及其在生物大分子递送中的前沿应用 | 提出多室结构凝聚系统的仿生设计理念,开发具有环境响应功能的智能递送平台 | 存在热力学不稳定性、载物泄漏和免疫原性等技术瓶颈 | 开发新一代凝聚微滴系统用于生物大分子和活细胞递送 | 凝聚微滴的物理化学特性及功能化材料 | 生物材料 | NA | 液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多室结构设计 | 医学, 合成生物学 |
| 587 | 2025-10-05 |
Biosynthesis, characterisation and biocompatibility of a unique and elastomeric medium chain-length polyhydroxyalkanoates for kidney glomerular tissue engineering
2025-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101932
PMID:40547486
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法生产了一种中链长度聚羟基脂肪酸酯(mcl-PHA),并评估其在肾小球组织工程中的生物相容性 | 首次报道了由CH50菌株通过葡萄糖发酵生产的具有独特弹性和低熔点的mcl-PHA,并验证其在肾小球细胞培养中的适用性 | 在增殖条件下胶原IV表达降低,且仅测试了两种肾小球细胞类型 | 开发用于肾小球组织工程的生物相容性生物材料 | 中链长度聚羟基脂肪酸酯(mcl-PHA)及其与人肾小球细胞的相互作用 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 批量发酵、溶剂浇铸薄膜制备、resazurin测定法 | NA | 材料特性数据、细胞代谢活性数据、蛋白质表达数据 | 使用条件性永生化人足细胞(CiHP)和条件性永生化人肾小球内皮细胞(CiGEnC)进行测试 | 合成生物学方法 | CH50菌株 | 通过葡萄糖作为唯一碳源的代谢途径生产mcl-PHA | 医学 |
| 588 | 2025-10-05 |
Bacterial Autonomous Intelligent Microrobots for Biomedical Applications
2025 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.70011
PMID:40235203
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综述 | 本文综述了细菌自主智能微机器人在生物医学领域的传感控制机制、工程设计与应用前景 | 提出利用合成生物学技术将具有自主运动智能的细菌改造为可实现闭环控制的微机器人 | NA | 探讨细菌微机器人在生物医学领域的闭环控制机制与应用发展 | 细菌微机器人的传感控制系统与生物医学应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 细菌 | 输入传感器、信号响应与记忆系统 | 医学 |
| 589 | 2025-10-05 |
Review on Advancement of AI in Cell Engineering and Molecular Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_10
PMID:40553333
|
综述 | 本文综述了人工智能在分子生物学和细胞工程领域的最新进展与应用 | 展示了AI在组织工程研究中通过自动识别组织水平模式和设计原则带来的全新研究范式 | NA | 探讨人工智能在分子生物学和细胞工程领域的应用潜力 | 分子生物学机制和细胞工程应用 | 机器学习 | NA | NA | 机器学习 | 分子数据、生物医学图像 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 590 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence in CRISPR-Cas Systems: A Review of Tool Applications
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_14
PMID:40553337
|
综述 | 本文综述了人工智能在CRISPR-Cas系统工具应用中的整合与发展 | 将人工智能与CRISPR-Cas系统相结合,为基因工程研究开辟新视角 | NA | 探讨人工智能在基因编辑工具中的应用潜力 | CRISPR-Cas系统与人工智能的整合应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 591 | 2025-10-05 |
Review on Advancement of AI in Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_26
PMID:40553349
|
综述 | 探讨人工智能在合成生物学领域的最新进展及其应用 | 系统阐述AI技术如何推动合成生物学在预测建模、系统优化和生物系统设计方面的革新 | 高质量生物数据集匮乏,计算与实验科学家之间存在跨学科鸿沟 | 分析人工智能与合成生物学交叉融合的发展现状与未来前景 | 合成生物学中的基因组编辑、代谢通路优化和生物电路设计 | 机器学习 | NA | 深度学习,机器学习 | NA | 生物数据集 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因电路开发 | 医学, 生物技术, 环境 |
| 592 | 2025-10-05 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 本研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器平台,用于实现模块化途径区室化以提升生物合成效率 | 利用工程化生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器,通过空间组织酶促反应克服扩散限制反应 | NA | 开发合成生物学平台实现精确通量控制 | 生物分子凝聚物、人工细胞器、2'-岩藻糖基乳糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、途径区室化 | NA | NA | NA | FUSLCD、GCN4支架蛋白 | 大肠杆菌 | 人工细胞器、模块化途径区室化、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 593 | 2025-10-05 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
|
研究论文 | 本研究通过在酿酒酵母中构建弗雷德林从头合成途径,结合代谢工程和脂滴工程显著提高了弗雷德林产量 | 首次在酿酒酵母中实现弗雷德林的从头生物合成,通过代谢通路优化和脂滴工程使产量达到创纪录的1500 mg/L | 研究仅在摇瓶发酵规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发高效可持续的弗雷德林微生物生产方法 | 弗雷德林(五环三萜类化合物)及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程、脂滴工程、摇瓶发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 弗雷德林从头生物合成途径,包括弗雷德林合酶基因表达、关键酶活性增强、竞争通路代谢流减少 | 医药 |
| 594 | 2025-10-05 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
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研究论文 | 本研究开发了一种在植物中可预测编程的遗传开关装置 | 首次在植物中实现了基于定量表征遗传元件和计算机模型指导的遗传开关电路设计 | 需要更广泛的遗传元件定量表征和数学建模支持 | 开发可预测和可编程的植物遗传装置 | 植物遗传元件和遗传开关电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、数学建模 | 计算机模型 | 遗传元件定量数据 | 稳定工程化植物 | 遗传电路组装 | 植物 | 遗传开关(相互抑制基因调控装置) | 农业, 环境 |
| 595 | 2025-10-05 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
|
研究论文 | 提出了一种基于整合酶的细菌接合介导的细胞间DNA信息传递策略 | 首次将整合酶应用于通过水平基因转移实现细胞间DNA信息传递和逻辑控制 | NA | 开发基于整合酶的细胞间DNA信息传递系统 | 大肠杆菌菌株和接合质粒 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | 布尔逻辑门 | NA | NA | 整合酶 | 大肠杆菌 | 双层布尔逻辑门、四层单处理通路、双层多处理系统 | 合成生物学 |
| 596 | 2025-10-05 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
|
综述 | 通过系统生物学视角探讨细胞异质性,提出从细胞角度概念化异质性的框架并总结相关研究工具 | 提出将细胞视为'命运之轮'的系统生物学框架,强调细胞异质性的生物学意义而非技术变异 | NA | 探索细胞异质性的本质及其在干细胞研究和再生医学中的意义 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 再生医学, 发育生物学 |
| 597 | 2025-10-05 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
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研究论文 | 本文报道了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其具有独特的四组氨酸和羧化赖氨酸配位中心及非典型催化机制 | 发现具有独特四组氨酸-羧化赖氨酸配位中心的非典型非血红素铁双加氧酶,揭示了修饰Kcx在促进C-C键断裂中的关键作用 | NA | 研究BTG13相关金属酶的配位模式和催化机制及其在合成生物学中的应用潜力 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | NA | NA | 分子动力学模拟、量子化学计算、系统发育分析 | NA | NA | NA | NA | 多种生物体 | NA | 合成生物学 |
| 598 | 2025-10-05 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
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综述 | 探讨非编码RNA的结构预测方法及其在生物医学中的功能与应用 | 整合计算与实验技术推进非编码RNA结构预测,并展望多组学数据融合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模精度不足,对RNA动态折叠机制理解有限 | 解析非编码RNA结构以理解其生物功能并开发治疗策略 | microRNAs、小干扰RNA、长链非编码RNA等非编码RNA分子 | 计算生物学 | NA | 计算方法与实验技术结合 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 599 | 2025-10-05 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
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综述 | 探讨生物技术在应对蜜蜂种群威胁、保护传粉服务方面的创新解决方案 | 提出结合人工智能的组学工具、分子生物处理及合成生物学技术(如工程化肠道微生物组)来增强蜜蜂适应能力 | 未提及具体技术实施的生态风险评估或规模化应用挑战 | 通过生物技术手段保护蜜蜂种群健康以维持全球粮食安全和生物多样性 | 蜜蜂种群及其传粉服务系统 | 生物技术 | NA | 组学工具、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蜜蜂肠道微生物 | 工程化肠道微生物组、人工饲料生物合成通路 | 农业,环境 |
| 600 | 2025-10-05 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程策略及其在不同工业领域的应用 | 系统总结了合成生物学工具(如CRISPR-Cas和动态调控回路)在优化糖酸生物生产中的应用进展 | NA | 探讨通过代谢工程优化微生物菌株实现高效糖酸生物合成的策略 | C5和C6糖酸及其生产微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶转化、全细胞生物转化、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 动态调控回路 | 食品, 建筑, 医疗, 纺织, 聚合物工业 |