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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-05 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Jun-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
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综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的策略 | 整合针对饲料作物和产甲烷古菌的双重基因编辑策略,提出跨学科解决方案 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等挑战 | 开发可持续农业的气候变化缓解方案 | 反刍动物甲烷排放机制及调控方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 甲烷生成代谢通路调控 | 农业, 环境 |
| 622 | 2025-10-05 |
DNA-programmed responsive microorganism assembly with controlled patterns and behaviors
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads8651
PMID:40512851
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研究论文 | 通过DNA编程实现微生物的响应式组装与行为控制 | 首次利用功能性DNA作为可编程表面受体调控微生物群落的空间模式和行为,实现了多组分微生物的精确空间组装和刺激响应性聚集 | 需要外源性DNA修饰和特定的化学标记过程 | 开发可编程的微生物相互作用控制方法 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和休眠孢子等多种微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢标记、疏水插入、DNA编程技术 | NA | NA | 多种微生物类型 | DNA编程 | 革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌,休眠孢子 | DNA介导的微生物组装系统,包括核心-壳结构和选择性簇状结构,具有刺激响应功能的生物传感器设计 | 合成生物学,医学 |
| 623 | 2025-10-05 |
Establishing Halomonas as a chassis for industrial biotechnology: advances in synthetic biology tool development and metabolic engineering strategies
2025-Jun-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02757-2
PMID:40506695
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综述 | 本文综述了盐单胞菌作为工业生物技术底盘生物的发展现状,重点介绍了合成生物学工具开发和代谢工程策略 | 将盐单胞菌确立为新一代工业生物技术的底盘生物,利用其耐高盐特性实现开放非无菌培养 | NA | 建立盐单胞菌作为工业生物技术的底盘生物平台 | 盐单胞菌属微生物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 克隆载体, 基因组编辑系统 | 盐单胞菌 | 代谢工程, 生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 624 | 2025-10-05 |
Complexity Meets Risk-The Next Generation of Genome-Edited Plants Challenges Established Concepts for Environmental Risk Assessment in the EU
2025-Jun-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14111723
PMID:40508397
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研究论文 | 分析新一代基因组编辑植物对欧盟环境风险评估框架的挑战 | 提出针对复杂代谢途径修饰植物的假设驱动评估方法,补充现有比较评估的不足 | 基于案例研究分析,需要更多实证研究验证建议方法的有效性 | 评估欧盟现行环境风险评估方法对复杂基因组编辑植物的适用性 | 基因组编辑植物及其环境风险评估方法 | NA | NA | 基因组编辑技术 | NA | 案例研究数据 | NA | 基因组编辑 | 植物 | 复杂代谢途径修饰 | 农业,环境 |
| 625 | 2025-10-05 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
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综述 | 本章全面概述了水疱性口炎病毒(VSV)的工程技术,重点关注通过整合促凋亡基因XAF1增强抗肿瘤免疫效果的策略 | 利用合成生物学技术将促凋亡基因XAF1精准整合到VSV基因组中,增强其诱导肿瘤细胞死亡的能力 | NA | 通过病毒工程技术增强VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水疱性口炎病毒(VSV)基因组和肿瘤细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传学 | NA | 促凋亡基因XAF1整合到VSV基因组 | 医学 |
| 626 | 2025-10-05 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
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研究论文 | 本文介绍了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法及其应用前景 | 开发了WSN毒株的基因工程方法,为研究抗病毒和抗肿瘤免疫提供了新工具 | NA | 研究基因工程流感病毒在抗病毒免疫和肿瘤免疫治疗中的应用 | H1N1流感病毒WSN毒株 | 合成生物学 | 流感 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传系统 | NA | 条件控制遗传元件 | 医学 |
| 627 | 2025-10-05 |
From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005
PMID:40510533
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综述 | 本文综述了生物合成路径设计中的关键计算方法,包括生物大数据、逆合成方法和酶工程 | 整合生物大数据、逆合成方法和酶工程三个关键组件来提升生物合成路径设计的效率和准确性 | NA | 提高生物合成路径设计的效率和准确性 | 生物合成路径设计计算方法 | 合成生物学 | NA | 数据挖掘、逆合成分析、酶工程设计 | NA | 化合物、反应/路径、酶数据 | NA | NA | NA | 生物合成路径 | 工业生物技术 |
| 628 | 2025-10-05 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选和表征酵母双向启动子,揭示了其调控机制并开发了AI指导的工程化方法 | 首次系统鉴定749个酵母双向启动子,发现启动子强度不对称性,并利用AI模型DREAM-CNN预测关键调控基序 | 研究仅限于酿酒酵母体系,未在其他生物系统中验证 | 解析双向启动子的调控机制并开发合成生物学应用 | 酿酒酵母中的749个双向启动子候选序列 | 合成生物学 | NA | 全基因组筛选、转录组分析、荧光报告基因分析、计算机诱变 | DREAM-CNN | 基因组序列、转录组数据、荧光表达数据 | 749个双向启动子候选序列 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 双向启动子调控的基因共表达系统、代谢通路调控 | 工业生物技术 |
| 629 | 2025-10-05 |
Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture
2025-Jun-03, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04279-x
PMID:40459729
|
综述 | 探讨利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌中绿脓菌素产量的前景 | 首次系统探讨合成生物学工具在绿脓菌素生物合成中的应用潜力 | NA | 通过基因水平操作提高绿脓菌素产量以满足水产养殖需求 | 铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径 | 合成生物学 | 弧菌病 | 基因水平操作 | NA | NA | NA | NA | 铜绿假单胞菌 | 绿脓菌素生物合成途径 | 农业 |
| 630 | 2025-10-05 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
|
研究论文 | 开发了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用合成生物学技术在大肠杆菌中实现安全信息存储和传输 | 将DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态相结合,通过咖啡因浓度和温度调控信息传输,并具备温度敏感的自毁机制 | 多次传输后菌株存活率快速下降,可能影响长期传输稳定性 | 开发安全可控的微生物信息存储和传输系统 | 工程化大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、DNA存储技术 | NA | DNA编码信息 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 咖啡因降解通路、温度敏感自毁机制、条件生长控制系统 | 信息安全、数据存储 |
| 631 | 2025-10-05 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
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综述 | 本文全面综述了黄酮类化合物的生物合成、调控机制及产量提升策略,并提出了整合合成生物学与人工智能的可持续生产新路径 | 首次将植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和人工智能驱动的代谢工程进行系统性整合,为黄酮类化合物生产提出创新路线图 | NA | 探索黄酮类化合物生物合成的潜力及产量提升策略 | 黄酮类化合物的生物合成途径、调控机制和运输过程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、人工智能 | NA | 代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 黄酮类化合物生物合成途径 | 医药,营养,化妆品 |
| 632 | 2025-10-05 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶并验证其中14种的定位,确定了6种对寄生虫存活至关重要的tRNA修饰酶 | 首次系统性地定义了恶性疟原虫顶质体这一简化细胞器的最小tRNA修饰酶集合,揭示了反密码子环修饰在细胞器维持中的核心作用 | 两个基因无法被成功敲除,其中一个具有双重定位可能在其他细胞区室发挥功能,另一个可能具有代谢旁路无法替代的关键功能 | 解析恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用机制 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶及其功能 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶,其中14种验证定位,12种进行基因敲除研究 | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 633 | 2025-10-05 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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综述 | 本文综述了糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出了临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | NA | 探讨糖基化对蛋白质折叠的影响及其在合成生物学中的应用 | 糖基化修饰的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医药 |
| 634 | 2025-10-05 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 本研究表征了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物合成苯乙烯 | 通过真菌铁酸盐脱羧酶的多序列比对设计出首个共识蛋白PSC1,解决了苯乙烯生物合成中关键脱羧步骤的挑战 | NA | 开发高效的微生物合成苯乙烯的生物工艺 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质晶体学、定点突变、共识设计 | NA | 蛋白质结构数据、酶活性数据 | NA | 遗传工程 | 恶臭假单胞菌DOT-T1E | 苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→反式肉桂酸→苯乙烯的两步代谢途径 | 工业生物技术 |
| 635 | 2025-10-05 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行封装 | 首次通过无细胞表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并实现300 µg/mL的特定产量 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构,传统表达系统无法充分表达该蛋白 | 开发跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达方法 | FGFR3-TACC3融合蛋白(受体酪氨酸激酶疾病变异体) | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE),SMA共聚物封装 | NA | 蛋白功能数据 | NA | 无细胞表达系统 | 无细胞系统 | NA | 医学 |
| 636 | 2025-10-05 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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研究论文 | 通过随机矩阵理论分析较大网络的雅可比矩阵,揭示图灵模式在生物系统中出现的概率及其最优网络规模 | 发现图灵模式的出现概率高于预期,且最稳健的图灵网络存在仅包含少量分子物种的最优规模 | NA | 分析复杂基因调控通路中图灵模式的形成机制 | 基因调控网络和图灵模式 | 系统生物学 | NA | 随机矩阵理论 | 图灵激活-抑制模型 | NA | NA | NA | NA | 图灵网络 | 合成生物学 |
| 637 | 2025-10-05 |
Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857
PMID:40496019
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综述 | 探讨人工智能如何优化噬菌体疗法以应对抗菌素耐药性威胁 | 将人工智能与合成生物学相结合,推动下一代合成噬菌体的遗传优化设计 | NA | 通过人工智能方法改进噬菌体疗法的开发流程 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用机制 | 机器学习 | 抗菌素耐药性感染 | 人工智能方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌 | NA | 医学 |
| 638 | 2025-10-05 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Jul, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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综述 | 本文系统回顾了CAR-T细胞疗法从第一代到第五代的发展历程及其在癌症治疗中的革命性应用 | 整合了合成生物学技术开发第五代CAR-T细胞,引入共刺激结构域、双信号通路和细胞因子释放机制等创新设计 | 在实体瘤治疗中仍面临肿瘤免疫抑制微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR-T细胞疗法的发展历程和未来方向 | CAR-T细胞疗法的技术演进和临床应用 | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 细胞工程技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 嵌合抗原受体设计,包括信号传导通路和细胞因子释放机制 | 医学 |
| 639 | 2025-10-05 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
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研究论文 | 开发了一种基于核酸序列扩增和toehold开关传感器的无细胞表达系统,用于检测太子参中的芜菁花叶病毒 | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器,实现了快速、高灵敏度的病毒检测,可直接用于田间样品 | 未明确说明检测系统的稳定性和长期保存性能 | 开发高效检测太子参中芜菁花叶病毒的诊断系统 | 太子参植物和芜菁花叶病毒 | 合成生物学 | 植物病毒感染 | 核酸序列扩增(NASBA), toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 田间样品(纯化和粗提RNA提取物) | toehold开关 | 无细胞表达系统 | toehold开关传感器结合视觉报告基因 | 农业,医学 |
| 640 | 2025-10-05 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-Jun-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和化学方法开发了具有抗菌活性的可降解生物源聚合物 | 结合真菌工程宿主异源生产单体前体与化学修饰,构建了新型羟基苯甲酸-丙交酯共聚物库 | 仅针对革兰氏阳性菌进行了测试,缺乏对其他病原体的广谱抗菌活性验证 | 开发具有抗菌活性的可降解生物源聚合物以应对抗生素耐药性问题 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧基-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-丙交酯基聚合物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 异源生产、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据 | 通过改变[单体]/[引发剂]比例(M/I = 5-30)制备不同聚合度的聚合物 | 合成生物学 | 工程真菌 | NA | 医药 |