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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-05 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Jun-06, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
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研究论文 | 通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白将亚硝酸盐转化为一氧化氮的催化机制 | 首次通过QM/MM等方法揭示了YtfE活性位点结构重组在亚硝酸盐还原机制中的关键作用 | 计算模拟研究,需要后续实验验证 | 阐明YtfE蛋白催化亚硝酸盐还原的分子机制 | 大肠杆菌YtfE蛋白及其活性位点 | 计算生物学 | NA | 量子力学/分子力学(QM/MM), QM/MM元动力学, 量子力学计算 | NA | 计算模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 环境修复 |
| 662 | 2025-10-05 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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评论 | 本文通过研讨会分析合成生物学在学术界与产业界交界处的发展,探讨研究成果如何成功转化为生物技术企业 | 提出'需要一个村庄'的协作理念,强调各要素合作对学术想法转化为现实技术的重要性 | NA | 分析学术研究向生物技术企业转化的过程与支持体系 | 学术界与产业界在合成生物学领域的合作机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 663 | 2025-10-05 |
Application of bifidobacterium in tumor therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1551924
PMID:40469191
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综述 | 总结双歧杆菌在肿瘤成像和治疗中的最新进展,探讨其作用机制、工程策略和临床应用 | 利用双歧杆菌的厌氧特性实现肿瘤靶向,并通过合成生物学技术改造为具有治疗功能的微机器人 | NA | 探索双歧杆菌在肿瘤治疗中的应用潜力 | 双歧杆菌及其工程化改造 | 合成生物学 | 肿瘤 | 细菌工程、分子成像 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 双歧杆菌 | 药物或基因递送系统、肿瘤微环境调节 | 医学 |
| 664 | 2025-10-05 |
A review on the expanding biotechnological frontier of Pedobacter
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108588
PMID:40294724
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综述 | 本文综述了Pedobacter属细菌的生物技术应用潜力及其天然产物的研究进展 | 通过生物信息学分析揭示该属细菌基因组中蕴含大量未被发现的天然产物,并整合合成生物学方法开发其工业应用潜力 | 目前仅对少数Pedobacter物种进行了表征,且只有一小部分天然产物被鉴定 | 探索Pedobacter属细菌的生物技术应用前景和天然产物开发 | Pedobacter属细菌及其天然产物 | 生物技术 | NA | 基因组生物信息学分析 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学 | Pedobacter属细菌 | NA | 医药, 水产养殖, 能源, 工业生物技术 |
| 665 | 2025-10-05 |
Exploring oxidosqualene cyclases and cytochrome P450s from Aralia elata for the synthesis of diverse pentacyclic triterpene sapogenins in Nicotiana benthamiana
2025-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110047
PMID:40435688
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研究论文 | 本研究通过挖掘辽东楤木中的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450,在烟草中合成多种五环三萜皂苷元 | 首次系统鉴定辽东楤木中PTS生物合成关键酶,并通过组合生物合成策略在异源宿主中产生19种PTS(其中14种为新发现) | 辽东楤木中PTS积累量有限且生物合成途径复杂,工业化应用面临挑战 | 解析辽东楤木中五环三萜皂苷元的生物合成途径并实现异源生产 | 辽东楤木(Aralia elata)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | 代谢组学、转录组学、农杆菌介导的异源表达 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | NA | 农杆菌介导的转化 | 本氏烟草 | 氧化角鲨烯环化酶与细胞色素P450的组合表达系统 | 食品,化妆品,制药 |
| 666 | 2025-10-05 |
Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions
2025-Sep, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128227
PMID:40440870
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综述 | 探讨盐生植物与嗜盐/耐盐植物促生细菌在盐渍土壤修复中的协同作用机制与应用前景 | 系统阐述盐生植物与HP/HT PGPB的协同互作机制,并提出多组学、合成生物学等整合策略 | 对具体协同互作机制和盐适应策略的理解仍有限 | 研究盐胁迫耐受机制及其在盐渍土壤修复中的应用 | 盐生植物和嗜盐/耐盐植物促生细菌 | 可持续农业 | NA | 多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 667 | 2025-10-05 |
Current AI technologies in cancer diagnostics and treatment
2025-Jun-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02369-9
PMID:40457408
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综述 | 系统综述人工智能技术在癌症诊断和治疗领域的当前应用现状与发展前景 | 全面整合AI在癌症诊疗各环节的应用,包括影像诊断、基因组学、液体活检、治疗规划和药物发现等多个前沿领域 | 未涉及具体临床验证数据,主要基于技术现状分析 | 探讨人工智能技术在癌症诊疗中的应用价值与发展方向 | 癌症诊疗相关的AI技术应用 | 数字病理 | 癌症 | 深度学习 | NA | 医学影像、基因组数据、临床数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 668 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas: a game-changer in vaccine development and the fight against viral infections
2025-Jun, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.02.006
PMID:40069074
|
综述 | 探讨CRISPR-Cas系统在病毒-宿主相互作用研究和抗病毒策略开发中的最新应用进展 | 系统阐述CRISPR-Cas技术在病毒学研究中的革命性应用,包括识别病毒感染关键受体和宿主因子,以及开发新型病毒疫苗 | NA | 推进对病毒发病机制的认识并开发有效抗病毒策略 | 病毒-宿主相互作用机制及新发再发病毒 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 669 | 2025-10-05 |
Rewiring heme biosynthesis for improved pollutant degradation by Shewanella oneidensis
2025-Aug-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.121777
PMID:40324620
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法重构希瓦氏菌血红素合成途径,提升其胞外电子传递效率及污染物降解能力 | 采用模块化合成生物学策略重构血红素合成途径,首次实现通过增强血红素水平显著拓宽胞外电子传递通路 | 研究仅针对模式偶氮染料甲基橙进行降解测试,未验证对其他污染物的普适性 | 解决电活性微生物胞外电子传递速率受限的瓶颈问题 | 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)及其胞外电子传递系统 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学、微生物电化学系统 | NA | 电化学性能数据、污染物降解动力学数据 | 工程菌株在MEC和MFC系统中的性能测试 | 合成生物学方法 | Shewanella oneidensis | 血红素合成与组装的功能模块设计 | 环境修复 |
| 670 | 2025-10-05 |
Magnetically driven lipid vesicles for directed motion and light-triggered cargo release
2025-Jun-05, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00942a
PMID:40396421
|
研究论文 | 本研究开发了磁驱动脂质体系统,实现定向运动与光触发释放功能的结合 | 首次将磁性颗粒封装于巨型单层囊泡中实现磁控定向运动,并与光诱导不对称氧化释放技术相结合 | 仅进行了概念验证研究,尚未开展体内实验验证实际治疗效果 | 开发具有导航控制和按需释放能力的脂质基药物递送系统 | 封装磁性颗粒的巨型单层囊泡(magGUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术、晶格玻尔兹曼模拟、光诱导不对称氧化 | 晶格玻尔兹曼模拟框架 | 实验测量数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 671 | 2025-10-05 |
Harnessing flavonoids to control probiotic function: in situ application of a naringenin-responsive genetic circuit
2025-Jun-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02890-24
PMID:40277392
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研究论文 | 本研究开发了一种基于柚皮素响应的基因回路,并在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中实现了在宿主肠道环境中的原位应用 | 首次将黄酮类化合物响应基因回路应用于宿主-微生物环境中,实现了通过外部化合物给药调控益生菌表型 | 未评估较低柚皮素剂量和富含柚皮素食物作为替代输入的效果 | 通过合成生物学方法增强益生菌功能,利用天然植物化合物调控益生菌表型 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917和小鼠模型 | 合成生物学 | NA | 基因回路工程,生物发光监测 | NA | 生物发光数据,体外和体内实验数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | FdeR系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 基于FdeR的柚皮素响应基因回路,包含Nanoluc报告基因 | 医学,益生菌治疗 |
| 672 | 2025-10-05 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2025-Jun-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
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综述 | 探讨利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白的发展趋势与挑战 | 将非谷物原料利用从传统一碳原料(如甲醇)扩展到二氧化碳,并整合混合生物系统 | 菌株鲁棒性不足、基因组编辑精度不够、低密度非谷物原料物流困难及电化学能源载体安全风险 | 开发可持续蛋白质生产技术以应对全球粮食需求与环境危机 | 非谷物原料生产的单细胞蛋白 | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 673 | 2025-10-05 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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研究论文 | 提出一种从菌丝体生成活纤维分散体的可持续方法,结合生物聚合物纤维的材料形成特性和活材料的高度动态特性 | 首次开发出结合生物聚合物纤维优异材料形成特性和活材料动态特性的活纤维分散体平台 | NA | 开发可持续的先进智能材料制造平台 | 菌丝体活纤维分散体 | 材料科学 | NA | 液体培养、机械解纤 | NA | 材料性能数据 | NA | 合成生物学 | 菌丝体 | NA | 材料,工业生物技术 |
| 674 | 2025-10-05 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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综述 | 探讨丝状真菌中基因调控网络操作工具及其在转录重编程和代谢工程中的应用潜力 | 系统阐述丝状真菌中响应物理信号(光/温度)的顺式元件应用,实现前所未有的时空精准基因表达控制 | NA | 探索丝状真菌基因调控网络重编程在合成生物学中的潜力 | 丝状真菌(以粗糙脉孢菌为例)的基因调控网络 | 合成生物学 | NA | 转录重编程、启动子工程、模块化工具包 | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌, 粗糙脉孢菌 | 生物传感器、代谢通路、昼夜节律振荡器 | 工业生物技术, 基础研究 |
| 675 | 2025-10-05 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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综述 | 系统总结芳香异戊二烯基转移酶的催化机制与工程化研究进展 | 提出整合人工智能和深度学习的创新工程方法开发高性能生物催化剂 | 催化活性欠佳、底物特异性窄、多酶级联系统和固定化技术存在局限 | 指导芳香异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化与规模化应用 | 芳香异戊二烯基转移酶及其催化的异戊二烯化反应 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、异源表达、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物宿主 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 676 | 2025-10-05 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究论文 | 本文开发了从植物乳杆菌生成和纯化微细胞的实验方案 | 首次在植物乳杆菌中通过删除minD基因成功构建微细胞生产平台,拓展了微细胞技术在非模式益生菌中的应用 | NA | 建立从益生菌植物乳杆菌生产微细胞的技术方案 | 植物乳杆菌微细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心、过滤、药物处理、显微镜检查、流式细胞术 | NA | NA | NA | 同源重组 | 植物乳杆菌 | 通过删除minD基因破坏细胞分裂形成球形微细胞 | 医药 |
| 677 | 2025-10-05 |
Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587215
PMID:40458805
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综述 | 本文全面综述了植物来源的萜类化合物及其治疗应用 | 系统阐述萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢疾病中的药理活性 | 对特定生物活性物质的作用机制理解尚不完整 | 阐明萜类化合物在代谢疾病中的生物化学特性和药理活性 | 植物来源的萜类化合物 | 天然产物研究 | 代谢疾病 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、化妆品、营养保健品 |
| 678 | 2025-10-05 |
Super-robust synthetic microorganism can get chlorine resistance in advance and transfer their inserted DNA sequence in genome to indigenous bacteria in water
2025-Aug-01, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123594
PMID:40188791
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研究论文 | 本研究揭示了基因编辑超级鲁棒合成微生物在水环境中能够转移基因组插入序列给本土细菌并表现出更强的氯抗性 | 首次发现超级鲁棒合成微生物能将基因组插入DNA序列转移给水体本土细菌,并阐明其通过减少细胞膜损伤、维持呼吸活性和DNA修复系统来获得氯抗性的机制 | 研究主要关注表面水环境,未涉及其他环境介质或长期生态影响评估 | 探究超级鲁棒合成微生物在水环境中的归趋及其对人类健康的环境风险 | 基因编辑超级鲁棒合成微生物和水中本土细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas | 合成微生物 | 基因组插入序列 | 环境 |
| 679 | 2025-10-05 |
Bridging chemistry and biology for light-driven new-to-nature enantioselective photoenzymatic catalysis
2025-Jun-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00561a
PMID:40351234
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教程综述 | 本文系统介绍光驱动酶催化这一新兴交叉领域,重点阐述其对非天然对映选择性反应的应用前景 | 融合光激发的高反应性与生物催化的卓越选择性,开创非天然酶促反应新范式 | 未涉及具体实验数据验证,主要进行理论框架梳理 | 推动可持续不对称合成发展 | 光酶催化反应体系 | 合成生物学 | NA | 酶工程、光催化 | NA | 文献综述 | NA | 酶工程 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 680 | 2025-10-05 |
Fusions of Catalytically Inactive RusA to FokI Nuclease Coupled with PNA Enable Programmable Site-Specific Double-Stranded DNA Breaks
2025-May-27, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11282
PMID:40454070
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研究论文 | 开发了一种结合PNA序列特异性结合能力和FokI核酸酶催化效率的PC-FIRA系统,用于实现程序化位点特异性DNA双链断裂 | 将催化失活的RusA与FokI核酸酶融合,并与PNA偶联,克服了现有位点特异性核酸酶的引导依赖性和脱靶效应限制 | 需要优化反应条件(温度、缓冲液组成、离子浓度和切割时间)并进行适用性验证 | 开发新型程序化位点特异性DNA双链断裂系统 | DNA分子(包括Holliday连接体、线性和环状DNA) | 合成生物学 | NA | PNA(肽核酸)技术、核酸酶融合技术 | NA | 分子生物学实验数据 | 多种DNA结构测试 | PNA, FokI核酸酶, RusA解离酶 | NA | NA | 生物技术, 医学, 农业, 合成生物学 |