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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-10-05 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 开发了一种多模块组装型Prime Editing系统,显著提高了双子叶植物中精确多碱基插入的编辑效率 | 首次在双子叶植物中开发了多模块组装型Prime Editing系统,相比原始PE2系统编辑效率提升1.3-1288.5倍,特别在多碱基插入方面平均提升197.9倍 | 研究主要局限于模式植物拟南芥和本氏烟草,尚未在其他双子叶植物中验证 | 解决Prime Editing在双子叶植物中编辑效率低的问题,开发系统性改进方案 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 植物合成生物学 | NA | Prime Editing, 农杆菌介导转化, 深度扩增子测序 | NA | 基因组测序数据 | 大规模转化实验,测序数据量20-50万条clean reads | CRISPR-Cas9, Prime Editing | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装型Prime Editing系统,采用pol II策略表达pegRNA,将PE系统拆分为多个模块 | 农业, 植物育种 |
| 682 | 2025-10-05 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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研究论文 | 本研究评估了五种DNA信息存储编码方法在生物安全方面的潜在风险 | 首次系统评估DNA信息存储编码方法与自然生物DNA序列的相似性,揭示不同编码方法产生的生物安全风险差异 | 仅分析了五种代表性编码方法,未涵盖所有DNA存储编码策略 | 评估DNA信息存储技术的生物安全风险 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码)产生的序列 | 合成生物学 | NA | Kraken2分类分析、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种编码方法产生的代表性DNA序列 | NA | NA | NA | 数据存储 |
| 683 | 2025-10-05 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 开发了一种基于聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路 | 利用T7 RNA聚合酶脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入,实现了高特异性等温扩增 | NA | 扩展无细胞生物传感能力,提高生物传感器灵敏度 | 核酸靶标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | DNA链置换,等温扩增,转录因子- DNA/配体结合双平衡模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 无细胞系统 | 聚合酶链回收(PSR)电路,变构转录因子生物传感器接口电路 | 生物技术 |
| 684 | 2025-06-03 |
Correction to "Synthetic Biology-Based Bacterial Extracellular Vesicles Displaying BMP-2 and CXCR4 to Ameliorate Osteoporosis"
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70095
PMID:40452467
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 685 | 2025-10-05 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统 | 首次利用噬菌体展示技术筛选出可被FDA批准小分子药物破坏的纳米抗体,建立化学诱导蛋白相互作用的解离系统 | NA | 开发能够可诱导调控蛋白质功能的后翻译化学方法 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示技术 | NA | NA | NA | 噬菌体展示 | 人类细胞 | 化学诱导解离系统 | 医学 |
| 686 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了微生物合成倍半萜醇的多种创新策略,包括酶筛选、通路调控和区室化表达 | 未提及具体实验数据验证策略效果,主要基于文献综述 | 推动倍半萜醇生物合成研究发展 | 倍半萜醇化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇合成通路 | 医药,食品,化妆品 |
| 687 | 2025-10-05 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究通过多种代谢工程策略改造酿酒酵母以增强对羟基苯甲酸甲酯的生物合成 | 通过调控内源莽草酸途径限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达等多种策略组合,实现了酿酒酵母合成对羟基苯甲酸甲酯的最高产量 | 摇瓶产量为68.59 mg/L,尚未进行大规模发酵验证 | 开发环境友好的对羟基苯甲酸甲酯生物合成方法 | 工程化酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 对羟基苯甲酸甲酯生物合成途径,包括莽草酸途径调控、竞争途径敲除和前体合成促进 | 工业生物技术,材料 |
| 688 | 2025-10-05 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针来解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域的相互作用机制 | 首次利用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的相互作用,并通过冷冻电镜获得高分辨率结构 | NA | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪酪肽生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 689 | 2025-10-05 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了小立碗藓中大片段DNA插入的效率 | 设计了包含两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体,可在体内释放线性模板用于同源定向修复 | 主要在小立碗藓中验证,对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓(P. patens)原生质体 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 | CRISPR-Cas9 | 小立碗藓(Physcomitrium patens) | 同源定向修复(HDR)系统 | 农业,工业生物技术 |
| 690 | 2025-10-05 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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研究论文 | 本文揭示了动力学模块作为生化网络中浓度鲁棒性来源的机制 | 无需参数值即可基于稳态反应速率耦合识别大规模生化网络中的动力学模块,并发现有序结合酶机制比随机结合具有更高的浓度鲁棒性 | 研究基于34个代谢网络模型,可能未覆盖所有生物系统类型 | 探索生化网络中动力学模块与浓度鲁棒性的关系 | 26个生物的34个代谢网络模型 | 系统生物学 | NA | 质量作用动力学分析 | 代谢网络模型 | 生化网络数据 | 34个代谢网络模型(来自26个生物) | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 691 | 2025-10-05 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过多参数遗传工程优化毕赤酵母中scFv抗体的分泌效率,发现结构同源蛋白对优化策略存在不同响应 | 挑战了结构同源性可预测优化效果的假设,揭示了蛋白特异性阈值对遗传工程策略的影响 | 仅研究两种scFv变体,样本量有限 | 优化毕赤酵母系统中单链抗体片段的分泌效率 | 两种结构同源的scFv变体(PR961和PR953) | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌通路重编程 | NA | 蛋白分泌效率数据 | 两种scFv变体 | 基因敲除、过表达 | 毕赤酵母 | 分泌通路重编程(涉及21个基因的三个功能模块) | 工业生物技术 |
| 692 | 2025-10-05 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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研究论文 | 通过转录组学和代谢组学分析揭示胡黄连中三萜类化合物生物合成途径的关键基因与分子机制 | 首次鉴定出NsOSC2双功能酶能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇,并建立了高效的再生系统和稳定遗传转化体系 | NA | 阐明胡黄连三萜类化合物生物合成的分子机制 | 胡黄连(Neopicrorhiza scrophulariiflora)的不同组织部位 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 代谢组学, 遗传转化 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 胡黄连 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药 |
| 693 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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研究论文 | 提出基于格里菲斯转化实验的合成生物学新方法,用于创建具有显著表型差异的杂交微生物 | 提出格里菲斯转化实验2.0设计,能够同时交换DNA和非DNA结构与调控信息 | 目前仅限于密切相关的细菌物种,供体与受体细胞间代谢通量和周转的调控匹配仍具挑战 | 开发能够整合多种遗传信息的合成生物学方法以创建新型微生物 | 细菌细胞及其遗传物质交换机制 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验、水平基因转移、体细胞核移植 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | DNA、大分子、拓扑、控制论和细胞遗传信息的整合系统 | 工业生物技术 |
| 694 | 2025-10-05 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
|
综述 | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染治疗中的作用及其发展前景 | 系统探讨了抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成等创新技术在提升生物类似物效力和生产效率方面的潜力 | NA | 分析生物类似物在传染病治疗领域的应用价值和发展挑战 | 针对病原体的生物类似物(包括治疗性蛋白、单克隆抗体、抗菌肽等) | NA | 传染病 | 抗体工程、合成生物学、无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 695 | 2025-10-05 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-Sep-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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综述 | 本文综述了基于代谢工程和合成生物学策略促进鞘聚糖高效合成与定制的方法 | 结合基因组代谢网络模型和CRISPR等高效工具调控代谢途径,通过分子量调控和可控取代基修饰实现鞘聚糖定制 | 野生型菌株研究背景不清晰及复杂合成路径等限制因素尚未完全解决 | 解决鞘聚糖生产能力受限和设计难题,实现高性能鞘聚糖的高效合成与定制 | 鞘聚糖(外多糖)及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 经典诱变、高通量筛选、CRISPR | 基因组代谢网络模型(GSMM) | NA | NA | CRISPR | 底盘细胞 | 代谢途径调控、分子量调控、取代基修饰 | 工业生物技术 |
| 696 | 2025-10-05 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Jul, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
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综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系,重点关注它们的适应性和利用昆虫宿主的能力,并回顾了天然产物研究的历史 | 系统总结了昆虫病原线虫-细菌共生体-昆虫三方伙伴关系的研究进展,并强调了利用合成生物学方法改进天然产物生物活性的最新方法 | NA | 研究昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系和致病机制 | 昆虫病原线虫(Steinernema和Heterorhabditis属)及其细菌共生体(Xenorhabdus和Photorhabdus属) | 微生物学 | NA | 合成生物学方法、高通量技术 | NA | NA | NA | NA | 昆虫病原线虫、Xenorhabdus细菌、Photorhabdus细菌 | NA | 农业、生物防治 |
| 697 | 2025-10-05 |
Engineering nitrogen and carbon fixation for next-generation plants
2025-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102699
PMID:40056871
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综述 | 本文探讨利用合成生物学技术优化植物固氮和固碳机制以培育新一代作物 | 整合定向进化、人工智能引导的酶设计和代谢工程来优化植物固氮固碳途径,并探索在极端环境的应用潜力 | NA | 通过工程化改造提升植物氮碳获取同化能力,解决全球农业和生态可持续发展挑战 | 植物固氮固碳机制、根瘤菌等固氮微生物、作物光合作用效率 | 合成生物学 | NA | 定向进化, 人工智能引导的酶设计, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 豆科作物, 非豆科作物, 根瘤菌, 固氮细菌 | 固氮途径优化, 固碳循环增强, 源-库关系调控 | 农业, 环境, 太空探索 |
| 698 | 2025-10-05 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶在分子工程、固定化策略及生物传感器、生物催化和生物燃料电池等领域的最新研究进展 | 重点关注通过分子工程和新型固定化技术提升酶性能,并拓展其在生物传感、生物催化和生物能源等领域的应用 | NA | 总结葡萄糖脱氢酶的最新研究进展和应用前景 | 葡萄糖脱氢酶及其应用 | 合成生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术,能源 |
| 699 | 2025-10-05 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计在非豆科植物中重构固氮酶,并探索在酵母线粒体低氧环境下工程化固氮酶 | 固氮酶的氧敏感性、金属簇组装复杂性及高能量需求尚未完全解决 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在植物体系中的功能重建 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酵母 | 固氮酶重构, 线粒体低氧表达系统 | 农业 |
| 700 | 2025-10-05 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和CRISPR基因编辑技术在病毒基因组研究中的应用 | 整合深度突变扫描与CRISPR技术,实现对病毒基因组的精准操作和功能表征 | NA | 探讨病毒进化分子机制及疫苗和治疗策略开发 | 病毒基因组和病毒蛋白 | NA | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因编辑, 测序技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |