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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-05 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 全面探讨T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的应用、挑战与未来发展方向 | 突破以往仅关注分子结构与功能的研究局限,提供T7RNAP变体的综合应用指南并强调工程化改造的最新进展 | NA | 优化微生物细胞工厂的转录系统并推动可持续生物生产 | T7RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 精细调控的电路设计 | 工业生物技术 |
| 702 | 2025-10-05 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
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研究论文 | 本研究开发了一种简化的定向进化系统,用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶的活性,以促进遗传密码扩展 | 开发了仅需基础实验室设备的简化定向进化系统,通过串联密码子随机化策略发现PylRS的叠加突变效应 | NA | 提高非经典氨基酸掺入效率,优化遗传密码扩展技术 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化,深度测序,串联密码子随机化 | NA | 测序数据,酶活性数据 | 针对三种不同底物进化的PylRS变体 | 定向进化 | NA | 正交tRNA和氨基酸酰-tRNA合成酶对 | 医学,工业生物技术 |
| 703 | 2025-10-05 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
|
研究论文 | 开发了基于Golden Gate组装技术的RT-EZ工具包,用于简化圆红冬孢酵母的基因工程操作 | 首次开发了专门针对圆红冬孢酵母的Golden Gate组装工具包,包含双向启动子、2A肽、RFP颜色筛选等新特性,可单次组装反应构建四基因表达盒 | NA | 解决圆红冬孢酵母因高GC含量和缺乏复制型质粒导致的基因操作困难 | 圆红冬孢酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Rhodotorula toruloides | 多基因表达盒,包含脂肪酸延伸酶和去饱和酶共表达系统 | 工业生物技术, 医药, 能源 |
| 704 | 2025-10-05 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
|
研究论文 | 本研究通过基因组缩减策略提高粘球菌中重组苯并噁唑类天然产物的产量 | 首次证明在粘球菌中连续移除生物合成基因簇可显著提高重组天然产物产量,并发现某些BGC组合删除会导致细胞不可存活 | 未明确说明具体删除了哪些BGC及其对细胞生理的全面影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响 | 粘球菌(Myxococcus xanthus) | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA | 基因组删除 | 粘球菌(Myxococcus xanthus) | 重组苯并噁唑生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 705 | 2025-10-05 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
|
综述 | 本文概述了光遗传学在糖尿病管理中的应用,重点探讨了通过光控技术实现胰岛素分泌的方法 | 将光遗传学作为合成生物学方法应用于糖尿病管理,实现用户通过光控远程调节激素分泌 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用 | 探索光遗传学在糖尿病治疗中的应用潜力 | 胰腺细胞、非胰腺细胞、小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 小鼠、高等动物细胞 | 光敏蛋白表达系统、胰岛素分泌通路调控 | 医学 |
| 706 | 2025-10-05 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
|
研究论文 | 本研究基于蓝藻远红光光适应系统开发了一种用于大肠杆菌的远红光传感器 | 首次在细菌中建立了动态范围超过230倍的正交远红光传感器系统 | NA | 开发用于合成生物学的远红光调控工具 | 蓝藻RfpABC信号系统和大肠杆菌基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌,蓝藻 | 远红光生物传感器,基因表达调控回路 | 工业生物技术 |
| 707 | 2025-10-05 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
|
研究论文 | 开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法,用于构建表达可调文库 | 利用体内同源重组实现自动化一步多基因组装,相比体外方法更高效 | NA | 开发高效的多基因组装方法以构建表达可调文库 | 酵母表达系统和多基因文库 | 合成生物学 | NA | 体内同源重组 | NA | NA | NA | 生物铸造厂工作流程 | 酵母 | 代谢途径,表达可调多基因文库 | 工业生物技术 |
| 708 | 2025-10-05 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
|
研究论文 | 调查常用合成生物学质粒中多聚体形成现象及其对电路可靠性的影响 | 首次系统评估四种常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异,并开发出能避免多聚体形成的大肠杆菌MG1655基因敲除株 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株和四种质粒骨架,未涵盖更广泛的宿主-质粒组合 | 优化质粒基础电路的完整性,防止多聚体形成对合成生物学电路的影响 | 四种常用合成生物学质粒骨架及其在大肠杆菌JM109和MG1655中的行为 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除、菌株转化 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株(JM109和MG1655)中的测试 | 基因敲除 | 大肠杆菌JM109, 大肠杆菌MG1655 | 质粒基础合成生物学电路 | 工业生物技术 |
| 709 | 2025-10-05 |
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58488-w
PMID:40195317
|
研究论文 | 开发了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器,用于活细胞报告和高通量筛选 | 开发了首个组蛋白整合的双荧光活细胞转录因子活性传感器系统,具有模块化设计和基因组整合特性 | NA | 开发用于活细胞转录因子活性检测和筛选的工具平台 | 缺氧诱导因子(HIF)、孕酮受体(PGR)和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告系统、高通量成像、CRISPRoff、全基因组CRISPR KO筛选 | NA | 荧光图像 | 1600种化合物的天然产物库 | CRISPRoff, CRISPR KO | 哺乳动物细胞 | 转录因子活性生物传感器 | 药物发现, 功能基因组学, 合成生物学 |
| 710 | 2025-10-05 |
Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S507322
PMID:40433121
|
综述 | 本文综述了基于合成生物学的超声控制系统在声遗传学和气囊泡技术中的最新进展与应用 | 系统总结了超声热效应和机械效应作为主要触发源,实现工程化细胞在靶向组织中进行声热或声机械遗传修饰的新策略 | NA | 深入理解超声效应与工程化细胞技术设计、组成和应用之间的关系 | 声遗传学技术和气囊泡技术 | 生物医学工程 | 癌症 | 超声控制技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程化细胞 | 声热启动子开关、声热瞬时受体电位通道、声机械激活 | 医学 |
| 711 | 2025-10-05 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering
2025-May-29, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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研究论文 | 本文开发了一种混沌3D生物打印技术,用于制造具有微观结构的细菌生态系统,模拟自然微生物群落的空间组织 | 首次将混沌3D打印技术应用于细菌共培养系统的构建,实现了微米级精度的空间控制 | 研究仅使用了简化的肠道微生物模型,尚未在更复杂的自然微生物群落中验证 | 开发能够模拟自然微生物生态系统空间结构的体外研究平台 | 细菌共培养系统,特别是人类肠道微生物模型 | 合成生物学 | NA | 混沌3D生物打印,荧光显微镜,菌落计数,定量PCR | NA | 图像数据,微生物生长数据 | NA | 3D生物打印,Kenics静态混合器打印喷嘴 | 多种细菌菌株(包括严格厌氧菌) | 多层微观结构共培养系统,模拟自然微生物生态系统的部分隔离 | 医学,环境,合成生物学 |
| 712 | 2025-10-05 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-29, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
|
研究论文 | 本研究评估了非天然核苷dTAT1在紫外光下的光物理特性和细胞毒性,发现其具有较低的光细胞毒性 | 首次系统研究dTAT1在紫外光激发下的三重态特性和活性氧产生机制,揭示其相比dTPT3具有更短的三重态寿命和更低的光细胞毒性 | 研究主要聚焦于光细胞毒性评估,对dTAT1在其他生理条件下的长期安全性研究不足 | 评估dTAT1非天然核苷的光细胞毒性特性,为安全遗传密码扩展提供依据 | dTAT1非天然核苷及其与dNaM形成的非天然碱基对 | 合成生物学 | NA | 紫外光激发、活性氧检测、光物理特性分析 | NA | 光谱数据、细胞毒性数据、量子产率数据 | NA | 遗传密码扩展技术 | 细胞培养系统 | 非天然碱基对dTAT1-dNaM,用于遗传信息存储和检索扩展 | 医学, 生物技术 |
| 713 | 2025-07-07 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-May-27, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
|
research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性 | 揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制 | 未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性 | 研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程 | 细菌和古菌中的镍铁氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 714 | 2025-10-05 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
|
研究论文 | 提出一种多层自催化反馈策略,解决资源竞争和上下文依赖耦合对积分反馈控制的限制 | 开发多层自催化控制器实现群体水平积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过多细胞群体间的协调相互作用涌现 | NA | 设计能够在资源竞争环境下实现鲁棒适应的合成生物控制系统 | 自催化积分反馈控制器、多细胞群体、工程微生物生态系统 | 合成生物学 | NA | 多层反馈策略、数学建模 | 积分反馈控制器 | NA | NA | NA | 微生物 | 自催化积分反馈控制器、多层反馈、群体水平控制电路 | 工业生物技术 |
| 715 | 2025-10-05 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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研究论文 | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于在茯苓中实现高效且适应性强的遗传修饰 | 创建了专门针对茯苓优化的转座子工程工具包,通过鸡尾酒式组装多基因转座子实现高效多重基因整合,无需复杂遗传电路组装 | NA | 开发适用于真菌系统的高效基因组工程工具 | 茯苓(Wolfiporia cocos)真菌 | 合成生物学 | NA | 转座子工程、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | 转座子 | 茯苓(Wolfiporia cocos) | 多重基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 716 | 2025-10-05 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本研究通过分析五种生物反馈电路,探讨生物系统中反馈调节的鲁棒性及其基本性能权衡 | 首次系统量化生物反馈回路的灵敏度,并提出多目标优化框架研究其性能权衡 | 仅分析了五种典型反馈电路,未覆盖所有可能的生物反馈机制 | 建立研究生物反馈调节的理论框架,提高对生物系统鲁棒性的理解 | 五种生物反馈电路:正自调节、负自调节、双正反馈、正负反馈和双负反馈(切换开关) | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | 正自调节、负自调节、双正反馈、正负反馈、双负反馈(切换开关) | 合成生物学, 系统生物学 |
| 717 | 2025-10-05 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 本研究利用CsrA蛋白与uxuB mRNA的浓度依赖性相互作用开发了一种合成生物学中的转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白对uxuB mRNA的异质性调控特性(浓度依赖性激活和抑制)设计生物带通滤波器,采用5' UTR + 100 nt CDS序列作为支架实现分级结合策略 | NA | 开发基于RNA-蛋白质相互作用的合成生物学电路 | uxuB mRNA转录本(5' UTR + 100 nt CDS)与CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录后带通滤波器,基于mRNA 5' UTR支架的分级结合策略,可根据CsrA浓度在ON/OFF状态间切换 | 合成生物学 |
| 718 | 2025-10-05 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于枯草芽孢杆菌的高产无细胞蛋白质合成系统 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因的工程菌株开发高产CFPS系统,无需额外添加T7 RNA聚合酶 | NA | 建立高产无细胞蛋白质合成系统用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统、核糖体结合位点元件、天然产物生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、基因组工程 | NA | 蛋白质产量数据、酶活性数据 | NA | 基因组整合 | 枯草芽孢杆菌 | T7启动子系统、核糖体结合位点原型设计、天然产物生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 719 | 2025-10-05 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 开发了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞尺寸脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现细胞尺寸脂质体的可靠重复生成 | NA | 开发按需生产细胞尺寸脂质体的新技术 | 细胞尺寸脂质体的生成过程 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像、数值分析 | NA | 视频数据、数值模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物化学研究 |
| 720 | 2025-10-05 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 开发了一种基于液液相分离的合成细胞器,能够将代谢信号转化为基因转录调控 | 首次将液液相分离原理应用于构建代谢物响应型合成细胞器,实现了代谢信号与转录调控的可逆连接 | NA | 构建具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液液相分离技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | 代谢物响应型转录调控回路,基于丙酮酸依赖性阻遏蛋白PdhR的相分离行为 | 传感器材料, 工业生物技术 |