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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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721 | 2025-03-12 |
Comprehensive strategies for paclitaxel production: insights from plant cell culture, endophytic microorganisms, and synthetic biology
2025-Mar, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae346
PMID:40061810
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review | 本文综述了紫杉醇生产的综合策略,包括植物细胞培养、内生微生物和合成生物学的最新进展 | 整合了植物细胞培养、内生微生物和合成生物学在紫杉醇生产中的应用,并指出了未来的研究方向 | 内生微生物生产紫杉醇的产量和稳定性仍存在局限,植物细胞培养需要进一步的遗传和环境优化,合成生物学尚未实现完整的紫杉醇生物合成 | 优化紫杉醇的生产方法,以实现工业规模的生产 | 紫杉醇的生物合成途径及其生产方法 | 合成生物学 | 癌症 | 植物细胞培养、内生微生物培养、合成生物学 | NA | NA | NA |
722 | 2025-03-12 |
Anti photoaging mechanism of a novel recombinant human fibronectin peptide (rhFNP) derived from the extracellular matrix
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42730
PMID:40061928
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研究论文 | 本文研究了一种新型重组人纤维连接蛋白肽(rhFNP)在抗光老化中的作用机制 | 利用合成生物学构建了一种新型重组人纤维连接蛋白肽(rhFNP),并通过多种细胞模型、斑马鱼和小鼠光老化模型验证了其抗光老化功能 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行人体临床试验 | 探讨rhFNP在抗皮肤光老化中的作用机制 | HaCaT、P815、NHEK细胞、斑马鱼和KM小鼠光老化模型 | 生物医学 | 皮肤老化 | 合成生物学、转录组学分析 | 细胞模型、动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 多种细胞系、斑马鱼和KM小鼠 |
723 | 2025-03-11 |
Building Climate-Resilient Crops: Genetic, Environmental, and Technological Strategies for Heat and Drought Stress Tolerance
2025-Mar-10, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf111
PMID:40062368
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综述 | 本文探讨了气候变化导致的干旱和热胁迫对全球作物生产的威胁,并提出了通过遗传、环境和技术策略增强作物耐热和耐旱性的方法 | 强调了将基础研究与实际农业环境相结合的重要性,并讨论了合成生物学、先进育种技术和高通量表型分析等新兴技术 | 当前育种计划和模型在应对复杂耐性机制和农业环境变异性方面存在局限性 | 研究如何通过遗传、环境和技术策略增强作物对热和干旱胁迫的耐受性 | 主要粮食作物,如小麦、水稻、大豆和玉米 | 农业科学 | NA | 合成生物学、先进育种技术、高通量表型分析 | NA | NA | NA |
724 | 2025-03-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并展示了合成复制起点(SynORI)的模块化工程能力 | 提出了合成复制起点(SynORI)的概念,实现了质粒拷贝数的可定制化和模块化响应环境信号的能力 | 研究主要局限于大肠杆菌中,未在其他微生物中验证其通用性 | 开发具有可定制拷贝数和模块化响应能力的合成质粒,以增强其在合成生物学中的应用 | 质粒的复制起点 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控 | NA | NA | 6个正交SynORI质粒在大肠杆菌中共同维持一周 |
725 | 2025-03-08 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Mar-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
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综述 | 本文综述了大语言模型(LLMs)在合成生物学(SynBio)教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨了LLMs在从非结构化数据中提取SynBio信息、构建知识图谱、实现检索增强生成等方面的应用,并预测LLMs将革新代谢建模和工程中的设计-构建-测试-学习(DBTL)周期,并推动未来生物制造中的自动驾驶实验室 | 需要建立LLMs的基准,促进可信的知识合成,发展生物安全框架以防止滥用,并鼓励人工智能科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造中的应用和潜在影响 | 大语言模型(LLMs)及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | 大语言模型(LLMs) | 非结构化数据 | NA |
726 | 2025-03-08 |
Principles for introducing new genes and species for conservation
2025-Mar, Trends in ecology & evolution
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.tree.2024.11.011
PMID:39667987
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研究论文 | 本文探讨了将新基因和新物种引入生态系统的机会和复杂决策,结合了生物、法律、社会、文化和伦理考虑,提出了一套全面的原则,以帮助保护管理者应对新兴技术 | 首次将生物、法律、社会、文化和伦理等多方面因素结合,提出了一套全面的原则,以指导保护管理者在面对高后果保护决策时进行综合考虑 | 未具体说明这些原则在实际应用中的具体效果和潜在问题 | 为保护管理者提供一套全面的原则,以应对新兴技术带来的高后果保护决策 | 新基因和新物种的引入 | 生态保护 | NA | NA | NA | NA | NA |
727 | 2025-03-08 |
From specialization to broad adoption: Key trends in droplet microfluidic innovations enhancing accessibility to non-experts
2025-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0242599
PMID:40046719
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综述 | 本文综述了液滴微流体技术的最新进展,旨在提高系统的稳健性和可访问性,使其更易于非专业实验室使用 | 讨论了液滴微流体技术从专业化到广泛采用的关键趋势,特别是商业化和自动化方面的创新 | 商业解决方案的适应性通常不如内部开发的设备 | 提高液滴微流体技术的稳健性和自动化,促进技术向非专业实验室的转移 | 液滴微流体技术及其在单细胞研究、合成生物学、定向进化和诊断等领域的应用 | 微流体技术 | NA | 液滴生成、试剂添加、分裂、洗涤、孵育、分选和分配 | NA | NA | NA |
728 | 2025-03-06 |
Designer mammalian living materials through genetic engineering
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.007
PMID:40034809
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研究论文 | 本文讨论了通过基因工程策略设计和组装下一代细胞密集或细胞基材料的最新进展和机会 | 通过基因工程策略实现对细胞行为和空间排列的完全控制,解锁具有定制细胞功能和空间排列的用户定义活体材料 | NA | 探索基因工程在设计和组装细胞密集或细胞基材料中的应用,以实现对细胞行为和空间排列的完全控制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 基因编辑和合成生物学工具箱 | NA | NA | NA |
729 | 2025-03-06 |
From Spores to Suffering: Understanding the Role of Anthrax in Bioterrorism
2025-Feb-27, Military medicine
IF:1.2Q2
DOI:10.1093/milmed/usae535
PMID:39656926
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review | 本文综述了炭疽病在生物恐怖主义中的作用,并探讨了未来应对策略 | 提出了利用合成生物学技术、纳米诊断和CRISPR技术等新兴技术来预防、检测和治疗炭疽病的新方法 | NA | 探讨炭疽病在生物恐怖主义中的威胁及应对策略 | 炭疽病及其病原体炭疽芽孢杆菌 | 生物恐怖主义与传染病防控 | 炭疽病 | 合成生物学技术、纳米诊断、CRISPR技术 | NA | 文献数据 | 53篇文献 |
730 | 2025-03-06 |
Nucleic Acid Framework-Enabled Spatial Organization for Biological Applications
2025-Feb-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00164
PMID:40041004
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研究论文 | 本文总结了利用DNA折纸和四面体DNA纳米结构(TDNs)进行分子空间组织的方法,并探讨了基于核酸框架(NAFs)的蛋白质和生物膜仿生应用 | 本文创新性地将NAFs应用于无机纳米颗粒的精确尺寸和结构形成,并展示了其在生物传感、生物成像和纳米医学治疗中的多功能性 | NA | 探讨核酸框架在分子空间组织和生物应用中的潜力 | DNA折纸和四面体DNA纳米结构(TDNs) | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
731 | 2025-03-05 |
Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases
2025-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258
PMID:39971105
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研究论文 | 本文探讨了通过删除内源性糖苷酶来提高酿酒酵母中药物样天然产物糖基化效率的方法 | 通过删除EXG1或SPR1糖苷酶,提高了糖苷化产物的产量和区域异构体分布的多样性 | 研究仅限于酿酒酵母系统,且仅测试了18种糖苷中的13种 | 提高天然产物或其非天然产物类似物的糖基化效率和区域特异性 | 苯二酚内酯家族的多酮类和苯丙烷类的多酚类化合物 | 合成生物学 | NA | 糖基化技术 | NA | NA | 18种糖苷 |
732 | 2025-03-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的方法和工具,并讨论了其在生物制造中的应用 | 本文详细讨论了转录调控、模板依赖和非模板依赖的方法,并全面总结了进化酿酒酵母在提高环境应激耐受性和细胞代谢性能方面的应用 | 未明确提及具体的研究局限性 | 探讨合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
733 | 2025-03-04 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Mar-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
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综述 | 本文介绍了合成生物学纳米医学的基本概念,并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与区别 | 提出了合成生物学纳米医学这一新概念,区别于传统或仿生纳米医学,采用基因工程策略进行设计 | 讨论了利用合成生物学开发纳米医学的潜在优势和挑战,但未具体说明具体挑战内容 | 探索合成生物学与纳米医学的融合,推动纳米医学在疾病诊断和治疗中的应用 | 合成生物学纳米医学 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
734 | 2025-03-03 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
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研究论文 | 本文讨论了机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用,以及如何通过机器学习增强从单个组件到电路层面的工程设计 | 提出了机器学习与机制建模相结合的混合方法,以利用数据驱动模型的优势与基于机制的模型的规范性能力 | 需要克服的挑战包括如何有效地整合机器学习与机制建模,以及如何在实际应用中实现这些方法的潜力 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的应用,以解决设计空间大、组件与宿主细胞机器之间复杂交互的挑战 | 合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型(机器学习与机制建模) | NA | NA |
735 | 2025-03-01 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本文通过基因组学、转录组学和合成生物学方法,揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物emodin和endocrocin的生物合成途径,以及它们甲基化为黄色色素physcion和dermolutein的过程 | 发现了Cortinarius蘑菇中非还原性聚酮合酶(nrPKSs)和特异性O-甲基转移酶(OMTs)的平行进化起源,并成功在酵母中异源合成了physcion和dermolutein | 化学合成复杂且不经济,从森林中大量采集野生蘑菇不可行 | 研究Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物的生物合成途径及其应用 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 |
736 | 2025-03-01 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
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综述 | 本文更新并批判性地讨论了水稻微生物组的多样性、功能角色以及增强生物施肥和抗逆性的微生物组工程策略 | 强调了微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的进展,以及利用微生物组塑造基因(M基因)提高作物抗逆性的创新方法 | 需要进一步探索M基因以培育抗病性状,且商业化成功的关键因素包括土壤特性、实际环境条件和植物基因型 | 增强水稻的生物施肥、抗逆性和气候适应能力,以实现可持续水稻生产 | 水稻及其微生物组 | 农业生物技术 | NA | 微生物组工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
737 | 2025-02-28 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从千金藤属植物Stephania epigaea中克隆并功能表征了三种O-甲基转移酶(OMTs),重点研究了其中两种Se6OMTs在头花千金藤碱生物合成途径中的作用 | 首次鉴定了参与头花千金藤碱生物合成途径的Se6OMTs,并阐明了这些酶在(R)-和(S)-立体异构体生物碱生成中的作用 | 未探讨Se6OMTs在其他生物碱生物合成途径中的潜在作用 | 阐明头花千金藤碱生物合成途径中关键酶的作用机制 | Stephania epigaea植物中的O-甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生物化学数据 | 三种OMTs,九种1-BIAs底物 |
738 | 2025-02-28 |
Harnessing Gut Microbiota for Biomimetic Innovations in Health and Biotechnology
2025-Jan-24, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics10020073
PMID:39997096
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群在健康和生物技术中的仿生创新潜力 | 利用肠道微生物群的生物机制,开发个性化益生菌、人工微生物群、仿生生物传感器和生物修复系统等创新应用 | 在人工环境中复制微生物复杂性、基因工程微生物的伦理问题以及公平获取先进疗法的挑战 | 探索基于微生物群的仿生创新在医疗和生物技术中的潜力 | 肠道微生物群及其生物机制 | 生物技术 | NA | 人工智能、生物工程、多组学方法 | NA | NA | NA |
739 | 2025-02-27 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于网络的工具,用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | DNAdesign能够同时考虑序列突变引起的不同读取模式的改变,提供基于DNA序列和形状特征的突变设计 | NA | 研究基因调控和合成生物学应用,如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 生物信息学 | NA | Deep DNAshape | NA | DNA序列 | NA |
740 | 2025-02-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-Feb, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 本文研究了UAG(琥珀)终止密码子的抑制如何影响沙门氏菌的致病性 | 揭示了UAG终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的选择性影响,特别是对SPI-1基因表达的减弱作用 | 未探讨UGA和UAA终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的影响 | 探讨终止密码子抑制对细菌致病性的影响 | 沙门氏菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 系统遗传和生化分析 | NA | NA | NA |