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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-10-05 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究通过挖掘UDP-葡萄糖基转移酶开发大黄酚葡萄糖苷的高效生产策略 | 评估了10种高效的大黄酚UDP-葡萄糖基转移酶,开发了全细胞催化系统实现78.9%的高转化率,并揭示了OsUGT的双位点葡萄糖基化活性 | 丝状真菌中植物源蛋白表达存在挑战,阻碍了进一步优化 | 开发大黄酚葡萄糖苷的高效生物合成方法 | 大黄酚-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄酚-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 序列分析、结构分析、系统发育分析 | NA | NA | 10种UDP-葡萄糖基转移酶 | 合成生物学方法 | 丝状真菌 | 大黄酚葡萄糖苷生物合成途径 | 医药 |
| 742 | 2025-10-05 |
A framework for complex signal processing via synthetic biological operational amplifiers
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62464-9
PMID:40745425
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研究论文 | 本研究开发了一种通过合成生物学运算放大器处理复杂生物信号的框架 | 通过整合正交运算放大器到标准化生物过程中,实现了高效信号分解和放大,并设计了可扩展的运算放大器 | NA | 开发能够处理复杂生物信号的合成生物学框架 | 遗传电路和全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | σ/anti-σ对工程、核糖体结合位点强度调节、开环和闭环配置 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 运算放大器、全细胞生物传感器、生长状态响应诱导系统 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 743 | 2025-10-05 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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综述 | 本文综述了迷幻化合物在真核和原核宿主中的生物合成研究进展 | 系统总结了不同类型迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了具有异源活性的生物合成酶列表 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 吲哚胺类(裸盖菇素、N,N-二甲基色胺等)、麦角碱类(麦角酸)和苯乙胺类(麦司卡林)迷幻化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | NA | 真核生物, 原核生物 | 代谢途径工程 | 医药 |
| 744 | 2025-10-05 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
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综述 | 探讨微生物发酵作为食物废弃物增值的可持续解决方案,将有机质转化为能源、高价值化合物和生物材料 | 强调合成生物学和代谢工程在提升微生物效率、优化底物利用和扩展工业应用方面的作用,并分析生物精炼整合路径 | NA | 研究通过微生物发酵实现食物废弃物增值的技术路径和挑战 | 食物废弃物及其微生物转化过程 | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 745 | 2025-10-05 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
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研究论文 | 开发了一种结合工程微生物与可摄入光电胶囊的双向通信系统,用于可控的疾病治疗干预 | 首次建立了生物-光学-电子信号处理链,实现体内工程微生物的实时监测和远程控制 | 目前仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发数字健康监测和可控治疗干预的新方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 光遗传学, 生物发光检测 | NA | 生物发光信号, 无线电信号 | 猪模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 炎症检测生物传感器和抗炎纳米抗体表达系统 | 医学 |
| 746 | 2025-10-05 |
Cholesterol modulates membrane elasticity via unified biophysical laws
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62106-0
PMID:40745155
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研究论文 | 本研究通过核自旋技术和计算分析揭示了胆固醇如何通过统一生物物理定律调节膜弹性 | 发现脂质膜在介观尺度表现出统一的弹性行为,与胆固醇含量、脂质不饱和度或温度无关 | 研究主要关注介观尺度,未涉及分子和宏观尺度的完整验证 | 探索胆固醇调节膜弹性的生物物理机制 | 脂质膜的弹性特性 | 生物物理学 | NA | 核自旋技术、计算分析 | NA | 物理测量数据、计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、材料科学 |
| 747 | 2025-10-05 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 本研究通过实验评估了大肠杆菌中所有独特的Cas9引导RNA功能,揭示了gRNA设计的普遍功能性和设计规则 | 首次系统评估了近50万个独特gRNA在基因组中的活性,推翻了关于非功能性gRNA稀有的假设,并发现了间隔序列自相互作用是导致非功能性的主要原因 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未在其他细菌或真核系统中验证 | 评估Cas9引导RNA在细菌基因组中的实际功能效率并建立gRNA设计规则 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的近500,000个独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | 基因组数据、功能活性数据 | 约500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 748 | 2025-10-05 |
Genetically programmable wearable devices for precision physiological and molecular monitoring
2025-Aug-04, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/adf25a
PMID:40690926
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综述 | 本文综述了基因编程可穿戴设备在生理和分子监测领域的最新进展与应用前景 | 将基因工程和合成生物学整合到可穿戴平台,创建具有增强特异性、响应性和功能多样性的基因可编程生物界面 | 存在生物安全性问题、生物组件不稳定性以及临床转化障碍等挑战 | 开发用于精准医疗的基因编程可穿戴监测设备 | 可穿戴生物传感器和生物界面 | 生物医学工程 | NA | 基因工程, 合成生物学 | NA | 生物化学标记物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞, 微生物细胞 | 生物传感器, 自调节功能电路 | 医疗, 个性化医疗 |
| 749 | 2025-10-05 |
Revolutionizing Caffeic Acid Production: Advanced Microbial Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches
2025-Aug, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70091
PMID:40757780
|
综述 | 本文总结了通过微生物代谢工程和合成生物学方法优化咖啡酸生产的五种策略 | 系统整合了咖啡酸生物合成的五种优化策略:生物合成途径、代谢途径修饰、系统生物学与合成生物学、辅因子工程和模块化共培养 | 微生物底盘生产咖啡酸面临前体供应有限、代谢中间体毒性、辅因子利用效率低和宿主微生物种类单一等瓶颈 | 优化咖啡酸的微生物生产方法 | 咖啡酸及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 咖啡酸生物合成途径、代谢途径修饰 | 医药、食品 |
| 750 | 2025-10-05 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-06, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢产物的三大研究方向:吲哚咔唑和RiPPs的生物合成机制,以及通过微生物相互作用激活隐性次级代谢途径 | 开发了无细胞一锅合成平台用于RiPPs类似物生产,并通过放线菌与含分枝杆菌的共培养策略发现了42种新化合物 | NA | 探索放线菌次级代谢产物的生物合成机制及其在药物发现中的应用潜力 | 放线菌(特别是链霉菌)及其产生的次级代谢产物 | 合成生物学 | 癌症 | 共培养策略、无细胞一锅合成、基因修饰 | NA | NA | NA | NA | 放线菌、链霉菌、含分枝杆菌的细菌 | 隐性生物合成途径激活、肽类天然产物生物合成途径 | 医药 |
| 751 | 2025-10-05 |
Applications and prospects of synthetic receptors for therapeutic protein delivery
2025-Sep, European journal of pharmaceutics and biopharmaceutics : official journal of Arbeitsgemeinschaft fur Pharmazeutische Verfahrenstechnik e.V
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.ejpb.2025.114789
PMID:40553909
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综述 | 本文综述了合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用类型、特征及生物医学前景 | 系统归纳了GPCR受体系统、MESA、synNotch受体和SNIPRs等新型合成受体在蛋白质递送领域的创新应用 | 存在安全性问题、递送效率欠佳以及受体设计与优化复杂等挑战 | 探讨合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用现状与发展前景 | 合成受体及其递送的 therapeutic proteins | 合成生物学 | 肿瘤、炎症性免疫疾病、中枢神经系统疾病、关节病、病毒感染 | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | G蛋白偶联受体系统、模块化胞外传感架构、合成Notch受体、合成膜内蛋白水解受体 | 医学 |
| 752 | 2025-10-05 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 系统总结了合成生物学在植物生物强化中的五大核心策略,并重点介绍了中国研究团队的最新突破 | NA | 通过植物合成生物学方法解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物生物强化策略和技术 | 合成生物学 | 营养缺乏症 | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 内源生物合成基因过表达、异源生物合成途径引入、营养特异性转运蛋白表达、转录调控优化、蛋白质定向进化 | 农业, 食品 |
| 753 | 2025-10-05 |
Thermodynamically consistent, reduced models of gene regulatory networks
2025-Jul, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.241725
PMID:40746961
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于细胞群体建模的热力学一致基因表达简化模型 | 结合键合图方法确保热力学一致性,并开发了适用于大规模细胞群体模拟的简化基因表达模型 | NA | 为合理设计细胞群体行为开发数学建模方法 | 基因调控网络和细胞群体 | 合成生物学 | NA | 数学建模,键合图 | 动力学模型,基于代理的模型 | NA | NA | NA | NA | 切换开关,阻遏振荡器 | 工业生物技术 |
| 754 | 2025-10-05 |
Direct high-throughput deconvolution of non-canonical bases via nanopore sequencing and bootstrapped learning
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62347-z
PMID:40739090
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研究论文 | 本研究开发了一种通过纳米孔测序和自助学习方法高通量解卷积非经典碱基的技术 | 首次实现了非经典碱基的高通量纳米孔测序,并开发了基于自助学习和数据增强的通用性AI模型 | NA | 开发能够高通量识别和测序非经典碱基的技术方法 | 含有非经典碱基的合成异源核酸和寡核苷酸 | 生物信息学 | NA | 纳米孔测序,AI模型训练,数据增强 | 自助学习模型 | 纳米孔测序信号数据 | 1,024种含有非经典碱基的寡核苷酸,每个流动槽产生超过2.3×10^6条读长 | NA | NA | NA | 病毒基因组学,合成生物学,DNA存储 |
| 755 | 2025-10-05 |
Bioengineering Outer-Membrane Vesicles for Vaccine Development: Strategies, Advances, and Perspectives
2025-Jul-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13070767
PMID:40733744
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综述 | 本文综述了外膜囊泡在疫苗开发中的工程化策略、研究进展和未来前景 | 系统总结了包括表面抗原基因工程、表面偶联、糖工程、纳米颗粒工程、杂交OMV和原位生产在内的新兴工程策略,并提出了合成生物学技术的整合潜力 | NA | 探索外膜囊泡作为新一代疫苗开发平台的潜力 | 革兰氏阴性菌自然分泌的外膜囊泡 | 合成生物学 | 传染病和癌症 | 基因工程、生物技术、糖工程、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 革兰氏阴性菌 | 表面抗原展示系统、生物传感器、代谢通路 | 医学 |
| 756 | 2025-10-05 |
Soilless Cultivation: Precise Nutrient Provision and Growth Environment Regulation Under Different Substrates
2025-Jul-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14142203
PMID:40733440
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综述 | 系统回顾无土栽培技术体系及其在精准调控作物根际环境方面的创新潜力 | 系统整合无土栽培技术体系与根际微生物互作机制,提出通过合成生物学方法优化微生物群落结构 | 有机体系中根际微生物群落结构和功能稳定性易失衡,技术成本与基质可持续性亟待解决 | 揭示无土栽培技术优势并推动其向低碳化、精准化和空间化方向发展 | 无土栽培技术体系、营养液管理策略、根际微生物互作机制 | 现代农业技术 | NA | 合成生物学方法、智能环境控制系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 757 | 2025-10-05 |
Integrated Approach for Improving Lutein Production of Chlorella sp. via Adaptive Evolution and Casein Acid Hydrolysate
2025-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05279-0
PMID:40358910
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研究论文 | 本研究通过适应性进化和酪蛋白酸水解物调控开发了提高小球藻叶黄素产量的综合方法 | 结合适应性进化(苯酚胁迫)和代谢调控(NaCl与酪蛋白酸水解物)的集成策略显著提升微藻叶黄素产量 | 未探讨其他环境胁迫因子或代谢调控物质的协同效应 | 提高小球藻的叶黄素生产能力 | 小球藻(Chlorella sp.)及其进化菌株P30 | 合成生物学 | NA | 适应性进化、代谢调控 | NA | 生物化学分析数据 | 经过30代适应性进化的P30菌株及原始菌株 | 适应性进化 | 小球藻(Chlorella sp.) | NA | 工业生物技术 |
| 758 | 2025-10-05 |
How many plasmids can bacteria carry? A synthetic biology perspective
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240378
PMID:40730232
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综述 | 从合成生物学视角探讨细菌携带多重质粒的能力及其应用 | 首次系统探讨单个微生物携带独特质粒的最大数量问题 | NA | 研究细菌维持多重独特质粒的理论与实践可能性 | 细菌质粒系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 质粒载体 | 细菌 | 多质粒系统 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 759 | 2025-10-05 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-Jun-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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综述 | 探讨如何通过理解羧酶体特性将其移植到作物叶绿体中以提高光合作用效率 | 提出将羧酶体与功能性碳酸氢盐转运蛋白共同移植到植物叶绿体的合成生物学策略 | 对羧酶体壳层机制认识不足,缺乏合适的碳酸氢盐转运蛋白,表达水平需优化 | 利用羧酶体和蓝藻CO2浓缩机制提高作物光合作用效率 | 羧酶体、Rubisco酶、碳酸氢盐转运蛋白、植物叶绿体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物叶绿体 | 羧酶体移植系统 | 农业 |
| 760 | 2025-10-05 |
Armed Phages: A New Weapon in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2025-Jun-27, Viruses
DOI:10.3390/v17070911
PMID:40733529
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综述 | 本文探讨了细菌防御系统对噬菌体疗法的限制,并重点介绍了通过合成生物学技术改造的'武装噬菌体'在对抗耐药菌感染中的潜力 | 提出'武装噬菌体'概念,通过基因工程改造使其能够规避细菌免疫系统,并携带抗菌肽、CRISPR基因编辑工具等增强治疗功能 | NA | 探索替代性抗菌策略以应对多重耐药菌感染 | 噬菌体及其与细菌防御系统的相互作用 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学、基因工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | 涉及SNIPR001一期临床试验和LBP-EC01二期临床试验 | CRISPR-Cas, 合成生物学工具 | 噬菌体 | 受体结合蛋白工程、抗CRISPR基因整合、甲基化模式改变、酶降解细菌保护屏障 | 医学 |