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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-10-05 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-06, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 探讨物理学与细胞生物化学的深度耦合如何揭示物质与生命界限的研究进展 | 整合过去十年实验与计算进展,聚焦空间组织和区室化对生命特征形成的作用 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建活细胞 | 探索物质与生命界限的本质特征 | 生物细胞及其物理化学特性 | 系统生物学与合成生物学 | NA | 全细胞建模与合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础科学研究 |
| 742 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-05, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
|
综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展,包括利用合成生物学和代谢模型开发微生物细胞工厂生产各类化合物的方法 | 整合合成生物学工具与数学模型加速代谢工程的设计-构建-测试-学习循环,开发具有复杂表型的酵母菌株 | NA | 通过代谢工程改造酵母菌株,实现可持续生产各类化合物 | 酵母菌株及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、数学建模 | 代谢模型 | NA | NA | NA | 酵母 | 代谢通量重定向、底物谱扩展、生理特性改良 | 工业生物技术,能源,化学品,医药 |
| 743 | 2025-10-05 |
Advances in the sustainable biosynthesis of valuable terpenoid flavor compounds and precursors in micro-organisms
2025-Sep-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02699-2
PMID:40999400
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综述 | 综述微生物可持续生物合成高价值萜类风味化合物及其前体的研究进展 | 整合合成生物学技术开发微生物细胞工厂,实现萜类风味化合物的绿色高效生产 | NA | 支持可持续生产技术的发展并促进风味香料行业的工业应用 | 萜类风味化合物及其前体 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、合成途径设计 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | 新型目标产物的合成途径设计 | 医药,食品,香料工业 |
| 744 | 2025-10-05 |
Phase Separation-Regulated Fungal Growth, Sexual Development, Adaptation and Synthetic Biology Applications
2025-Sep-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11090680
PMID:41003226
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综述 | 本文综述了液-液相分离(LLPS)在真菌生长、发育和适应中的调控作用及其在合成生物学中的应用 | 系统总结了环境信号通过LLPS调控真菌生物学过程的机制,并探讨了工程化合成生物分子凝聚体在微生物细胞工厂中的应用策略 | NA | 探讨液-液相分离在真菌生物学过程中的调控机制及其在合成生物学中的潜在应用 | 真菌蛋白质的液-液相分离现象及其形成的无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 合成生物分子凝聚体工程 | 生物技术, 生物合成, 代谢工程 |
| 745 | 2025-10-05 |
Automated and Programmable Cell-Free Systems for Scalable Synthetic Biology with a Focus on Biofoundry Integration
2025-Sep-16, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2507.07019
PMID:40967915
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白质合成技术与自动化生物铸造平台融合的技术创新、当前能力和未来发展方向 | 重点介绍了无细胞系统与自动化生物铸造平台集成如何加速设计-构建-测试-学习循环,并结合机器学习实现遗传构件和生物合成系统的预测性优化 | NA | 探讨无细胞系统与自动化生物铸造平台融合的技术发展和应用前景 | 无细胞蛋白质合成系统和自动化生物铸造平台 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、液体处理机器人技术、数字微流控 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | 生物传感器、代谢通路原型设计、逻辑门 | 工业生物技术、医药、环境、能源、材料 |
| 746 | 2025-10-05 |
Microalgae-Based 3D Bioprinting: Recent Advances, Applications and Perspectives
2025-Aug-27, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090342
PMID:41003311
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综述 | 本文综述了微藻基3D生物打印技术的最新进展、应用领域及未来展望 | 将微藻封装于生物活性基质并结合3D生物打印技术构建定制化结构,突破传统液体浸没培养的限制 | NA | 分析3D生物打印的基质与方法,总结微藻基3D生物打印在六大领域的发展 | 微藻及3D生物打印技术 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 生物材料, 能源, 生物制造, 环境修复, 组织工程, 食品工程 |
| 747 | 2025-10-05 |
Sophisticated Interfaces Between Biosensors and Organoids: Advancing Towards Intelligent Multimodal Monitoring Physiological Parameters
2025-Aug-22, Biosensors
DOI:10.3390/bios15090557
PMID:41002297
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综述 | 本文系统综述了类器官与生物传感器集成的多模态监测技术及其在生理参数智能监测中的应用 | 提出了类器官传感技术向增强仿生性和智能化发展的综合框架,系统比较了多种技术集成方法 | 未涉及传感器在血管化类器官中植入、长期培养信号稳定性及临床转化标准化等具体技术挑战的解决方案 | 为研究人员提供选择合适技术方法的框架,推动类器官传感技术发展 | 类器官与生物传感器的集成系统 | 生物医学工程 | NA | 微流控集成系统、微电极阵列电生理记录、光学传感、机械力传感、场效应晶体管传感、合成生物学工具、无标记技术 | NA | 电信号、光学信号、机械信号、化学信号 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 药物开发、毒性测试、个性化医疗 |
| 748 | 2025-10-05 |
Coacervate Vesicles as Adaptive Platforms for Synthetic Biology and Smart Materials
2025-Sep-24, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502268
PMID:40827771
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综述 | 本文介绍了凝聚层囊泡作为合成生物学和智能材料平台的基本特性、分类方法及应用前景 | 提出基于形成机制和能量景观的凝聚层囊泡分类体系,并系统阐述其结构特性与动态行为的关系 | 该领域仍处于发展初期,实际应用尚未成熟 | 探讨凝聚层囊泡在合成生物学和智能材料领域的应用潜力 | 凝聚层囊泡(一种结合凝聚层微滴动态特性与膜系统结构优势的原型细胞) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 材料科学 |
| 749 | 2025-10-05 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
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研究论文 | 本研究首次发现多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学反应形成P=S键,并成功应用于微生物P=Se键的形成 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究,并首次利用微生物代谢物实现化学合成中的P=Se键形成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的应用潜力 | 细菌的磷硫键和磷硒键形成机制 | 合成生物学 | NA | 生化和遗传研究方法 | NA | 实验数据 | 多种细菌 | NA | 细菌 | 中心硫代谢途径 | 工业生物技术 |
| 750 | 2025-10-05 |
Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production
2025-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-01914-3
PMID:40437134
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研究论文 | 本研究通过代谢工程在烟草叶片中重建了glyceollin的生物合成途径,实现了异黄酮类化合物的高效生产 | 成功鉴定了6种glyceollin合成酶,完成了15步生物合成途径的解析,并在植物底盘细胞中实现了glyceollin的从头全合成 | NA | 解析glyceollin生物合成途径并建立合成生物学生产平台 | 大豆glyceollin生物合成途径及相关酶 | 合成生物学 | 植物病害 | 代谢工程、酶筛选、体外抑菌实验 | NA | 代谢物分析、酶活性数据 | NA | 代谢工程 | 本氏烟草 | 15步glyceollin生物合成途径,包含异黄酮前体daidzein生产模块和glyceollin合成模块 | 农业,医药 |
| 751 | 2025-10-05 |
In Situ Plant Sensors: Toward Real-Time, High-Resolution Monitoring
2025-Sep-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01494
PMID:40830763
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综述 | 本文综述了柔性可穿戴设备和基因编码传感器在植物实时原位监测中的最新进展与应用潜力 | 首次系统比较了可穿戴传感器与基因编码传感器在植物监测中的互补优势,提出了多学科融合的未来发展方向 | 存在适应性、传感稳定性、空间分辨率、参数覆盖范围有限以及不同传感模式集成等实际问题 | 推动植物传感技术向实时、高分辨率监测方向发展 | 植物生理状态和应激反应 | 农业技术 | NA | 柔性可穿戴设备、基因编码传感器 | NA | 生理参数、分子信号、环境数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物传感器(用于检测钙、活性氧、植物激素等信号分子) | 农业 |
| 752 | 2025-10-05 |
Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules
2025-Sep-25, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc02423d
PMID:40905114
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研究论文 | 开发了一种动态多相凝聚系统,能够模拟细胞区室化实现选择性分子分配 | 通过动态膜化形成核壳结构凝聚物,实现基于极性的选择性分子分配和增强的胶体稳定性 | NA | 开发模拟细胞区室化的多相凝聚系统用于选择性分子分离 | 多相凝聚物系统及其分子分配特性 | 合成生物学 | NA | pH响应平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 催化, 合成生物学, 仿生化学系统 |
| 753 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Heterologous Protein Expression and Natural Product Synthesis by Aspergillus
2025-Jul-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11070534
PMID:40985424
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综述 | 综述曲霉属真菌在异源蛋白表达和天然产物合成领域的最新研究进展 | 系统总结了CRISPR-Cas9在曲霉遗传修饰中的应用现状,并重点探讨了其在萜类化合物异源生物合成中的具体应用 | NA | 总结曲霉作为异源表达平台在蛋白质和天然产物合成中的研究进展 | 曲霉属真菌(包括黑曲霉、米曲霉等) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 曲霉(包括黑曲霉、米曲霉等) | 异源蛋白表达系统、天然产物生物合成途径 | 工业生物技术,医药 |
| 754 | 2025-10-05 |
[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250116
PMID:40994325
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综述 | 本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展,包括合成途径、产量提升策略及未来发展方向 | 系统比较甲羟戊酸和甲基赤藓糖醇磷酸两种合成途径在不同微生物宿主中的优劣,并提出酵母合成三萜类化合物的优化策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述进行分析 | 促进三萜类化合物在化妆品领域的应用开发 | 三萜类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径 | 化妆品 |
| 755 | 2025-10-05 |
[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240845
PMID:40994326
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综述 | 本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展 | 系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学策略提高解脂耶氏酵母中倍半萜产量的方法 | 倍半萜类化合物及其在解脂耶氏酵母中的异源合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径工程,前体增强 | 香料,制药,生物燃料,工业生物技术 |
| 756 | 2025-10-05 |
Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota
2025-Sep-23, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00367-25
PMID:40815469
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研究论文 | 通过培养和测序牦牛肠道微生物群成员,揭示其功能潜力 | 建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库(YFR),包含548个高质量基因组,其中216株为新分类单元,将反刍动物肠道细菌培养物种比例提高19.39% | NA | 揭示牦牛肠道微生物群的功能潜力和生态适应性 | 牦牛肠道微生物群 | 微生物组学 | NA | 好氧和厌氧培养、基因组测序 | NA | 基因组数据 | 548个高质量基因组,216个新分类单元 | NA | 牦牛 | NA | 工业酶发现、合成生物学 |
| 757 | 2025-10-05 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
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研究论文 | 本研究通过工程化改造NADH氧化酶,实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化 | 首次开发了能够高效氧化非天然辅因子NCDH的工程化酶,解决了氧化反应中NCD生成的技术瓶颈 | NA | 开发非天然辅因子NCD的再生工具,拓展合成生物学中氧化还原反应的应用能力 | NADH氧化酶及其突变体、非天然辅因子NCD/NCDH | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 酶活性数据、分子对接模拟数据 | NA | 酶定向进化 | 大肠杆菌Escherichia coli BW14329 | NCDH氧化再生系统,与磷酸脱氢酶偶联的代谢通路 | 工业生物技术, 化学生物学 |
| 758 | 2025-10-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
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综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖在免疫调节中的关键作用及其治疗潜力 | 重点关注肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖,提出了通过合成生物学设计下一代免疫疗法的路线图 | 存在结构-功能知识空白,在连接特定结构基序与可预测免疫结果方面存在挑战,规模化生产方法仍需改进 | 探讨细菌胞外多糖的免疫调节功能及其在肠道微生物组时代的治疗应用 | 肠道共生菌和益生菌产生的微生物胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 肠道共生菌, 益生菌 | 定制化胞外多糖原位生产系统 | 医学 |
| 759 | 2025-10-05 |
Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries
2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269
PMID:40928961
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中构建并功能表达了III型分泌系统,显著增强了其杀虫效果 | 首次使用Red/ET重组工程技术克隆完整32-kb T3SS基因簇并在T3SS缺陷菌株中实现功能性表达,发现新型效应蛋白XopA | 研究主要基于实验室模型,尚未在真实田间环境中验证工程菌株的实际应用效果 | 通过合成生物学方法增强昆虫病原细菌的杀虫能力并扩展T3SS效应蛋白库 | 昆虫病原线虫共生细菌Xenorhabdus spp.及其III型分泌系统 | 合成生物学 | 昆虫病害控制 | Red/ET重组工程, 基因克隆, 异源表达 | NA | 分子生物学数据, 细胞实验数据, 生物测定数据 | CF-203细胞系和昆虫模型 | Red/ET recombineering | Xenorhabdus | 完整的32-kb III型分泌系统基因簇,包含新型效应蛋白XopA的递送机制 | 农业, 生物防治 |
| 760 | 2025-10-05 |
Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210
PMID:40821789
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综述 | 探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用与优化 | 提出整合数学模型与计算技术的综合框架,以提升CAR-T疗法设计并预测临床效果 | 现有模型时空分辨率有限,影响疗法安全性及成本效益,尤其针对实体瘤 | 通过计算手段优化CAR-T疗法设计并预测治疗效果 | CAR-T细胞动力学及抗原结合机制 | 计算生物学 | 癌症 | 数学模型与计算模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | CAR(嵌合抗原受体)工程化改造 | 医学 |