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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-05 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声响应哺乳动物细胞合成生物学的最新进展,重点介绍了声遗传学在非侵入性细胞控制中的应用 | 将超声波与基因工程效应器结合,克服了组织穿透性和侵入性的限制,实现了对细胞和分子过程的非侵入精确控制 | 参数标准化不足和对潜在机制理解不充分 | 开发超声响应合成生物学工具用于研究和治疗应用 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 声遗传学 | NA | NA | NA | 基因工程 | 哺乳动物细胞 | 超声响应遗传电路 | 医学 |
| 762 | 2025-10-05 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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研究论文 | 开发了一种基于基因组特征的DNA标记系统,用于创建自认证基因组 | 提出基于Golomb标尺的基因组梳状结构,能在有限密码子内高效映射大量核苷酸序列,显著提高错误校正和数据编码能力 | NA | 开发能够确保合成基因组材料真实性和完整性的DNA标记系统 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 450万核苷酸基因组 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因组签名系统,基于密码子顺序的数据编码 | 工业生物技术 |
| 763 | 2025-10-05 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
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研究论文 | 通过组合代谢工程改造解脂耶氏酵母实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 开发了蛋白质融合和多拷贝基因整合策略,并通过调控甲羟戊酸途径、脂质合成与降解来优化前体供应 | NA | 构建能够高效生产植物源二萜醇sclareol的微生物细胞工厂 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA | 基因整合、蛋白质融合 | Yarrowia lipolytica | sclareol合成途径,包含LPPS和SCS酶,优化甲羟戊酸途径和GGPP供应 | 工业生物技术 |
| 764 | 2025-10-05 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑料圈群落和浮游动物的影响,并探讨基于自然群落方法的新型修复策略 | 重点关注塑料圈群落的适应性响应和浮游动物对微塑料的摄食行为,提出基于自然群落水平的整合修复策略 | 需要更多研究来理解微塑料对珊瑚礁、海草床和红树林等重要海洋生态系统的毒性影响 | 总结微塑料污染现状及其环境影响,探讨基于微生物降解和生态功能的生物修复策略 | 水生环境中的微塑料、塑料圈微生物群落和浮游动物 | 环境科学 | NA | DNA元条形码、膜生物反应器、合成生物学、纳米材料技术 | NA | 文献数据、环境监测数据 | NA | 合成生物学 | 海洋微生物 | NA | 环境 |
| 765 | 2025-10-05 |
A CYP80B enzyme from Stephania tetrandra enables the 3'-hydroxylation of N-methylcoclaurine and coclaurine in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids
2025-May, Chinese journal of natural medicines
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/S1875-5364(25)60867-3
PMID:40383618
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研究论文 | 本研究从植物Stephania tetrandra中克隆了CYP80B基因并验证其能催化N-甲基乌药碱和乌药碱的3'-羟基化反应 | 发现StCYP80B具有比已知CYP80Bs更广的底物选择性,无需N-甲基基团即可发挥羟基化活性 | NA | 阐明苄基异喹啉生物碱生物合成途径中的关键酶功能 | Stephania tetrandra植物中的CYP80B酶及其催化机制 | 合成生物学 | NA | 酵母异源表达系统、定点突变、体外酶分析 | NA | 基因序列、酶活性数据 | NA | 定点突变 | 酵母 | CYP80B与细胞色素P450还原酶(CPR)的共表达系统 | 医药 |
| 766 | 2025-10-05 |
Comparative genomics of three medicinal Glycyrrhiza species unveiled novel candidates for the production of important bioactive compounds
2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70223
PMID:40384636
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研究论文 | 通过比较三种药用甘草属植物的基因组,揭示了其重要生物活性化合物合成的新候选基因 | 首次获得三种药用甘草的高质量基因组数据,鉴定出调控甘草苷合成的关键转录因子GibHLH9/GibHLH53/GibHLH174,并验证了GiOMT17在LCA生物合成中的功能 | NA | 解析三种药用甘草物种的生物活性化合物合成机制 | 甘草属三种药用植物:甘草(Glycyrrhiza uralensis)、胀果甘草(Glycyrrhiza inflata)和光果甘草(Glycyrrhiza glabra) | 植物基因组学 | NA | 基因组测序、基因组组装、转录组分析、共线性分析 | NA | 基因组序列数据、转录组数据 | 三种甘草物种的基因组数据(大小分别为425Mb、447Mb和423Mb) | NA | NA | NA | 医药、化妆品 |
| 767 | 2025-10-05 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
|
综述 | 本文概述了微生物组治疗领域的最新技术进展及其未来发展前景 | 系统性地比较了从粪便衍生产品到活体生物治疗剂、噬菌体疗法和合成生物学等多种微生物组治疗技术的优势与局限 | 作为叙述性综述,未进行定量荟萃分析,主要基于现有文献的定性总结 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向和技术路径 | 人类微生物组及其相关治疗技术 | 微生物组研究 | NA | 粪便微生物移植、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 人类微生物组 | NA | 医学 |
| 768 | 2025-10-05 |
Excavation of acoustic nanostructures biosynthesis gene clusters by combinatorial strategy
2025-May-15, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00069-5
PMID:40372536
|
研究论文 | 通过合成生物学策略构建杂交基因簇合成新型基因编码气囊泡,可在临床超声设备中成像 | 首次将Serratia sp.的结构基因簇与Bacillus megaterium的辅助基因簇在E. coli中杂交,合成尺寸约70×100 nm的新型气囊泡 | NA | 开发可在临床超声设备中成像的新型基因编码气囊泡 | 气囊泡(GVs)纳米结构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略、点饱和突变 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | Escherichia coli | 杂交基因簇(Serratia sp.结构基因簇与Bacillus megaterium辅助基因簇组合) | 医学 |
| 769 | 2025-10-05 |
Dynamic Analysis and Robust Strategy for the Delayed Paradoxical Cell Population Control Circuit
2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2025.3556585
PMID:40198292
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研究论文 | 通过分析延迟悖论细胞群体控制电路的双稳态切换和振荡行为,提出实现稳健群体控制的策略 | 揭示了两种双稳态切换机制(初始细胞密度驱动和博来霉素诱导细胞死亡时间延迟驱动),并提出通过调节初始细胞密度和博来霉素浓度的稳健控制策略 | NA | 实现合成悖论控制电路的稳健群体控制 | 延迟悖论细胞群体控制电路 | 合成生物学 | NA | 动态分析、双稳态分析、Hopf分岔分析 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 细胞群体 | 悖论控制电路、双稳态开关、群体控制电路 | 合成生物学, 细胞治疗 |
| 770 | 2025-10-05 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
|
研究论文 | 本研究通过生物催化聚合诱导自组装技术制备人工细胞囊泡,并系统优化其尺寸分布与后组装加载性能 | 首次系统研究生物催化PISA囊泡的尺寸均一化方法,并成功实现电穿孔技术对预成型囊泡的大分子加载 | NA | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡用于合成生物学应用 | 生物催化聚合诱导自组装形成的囊泡 | 合成生物学 | NA | 荧光相关光谱, 电穿孔, 蔗糖梯度离心 | NA | 光谱数据, 形态学数据 | NA | 生物催化聚合诱导自组装 | NA | 级联反应酶系统 | 合成生物学 |
| 771 | 2025-10-05 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
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研究论文 | 本研究开发了一种基于透明质酸微凝胶的双功能平台,用于研究无细胞蛋白质合成与蛋白质原位积累的相互作用 | 首次利用透明质酸微凝胶作为实验平台,实现了无细胞蛋白质合成与蛋白质原位积累的时空调控研究 | 仅展示了平台构建的初步步骤,尚未深入探索蛋白质释放动力学和实际应用场景 | 开发能够调控蛋白质合成和积累的细胞样平台 | 透明质酸微凝胶中的无细胞蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS),蛋白质固定化技术 | NA | 蛋白质积累动力学数据 | NA | NA | NA | 蛋白质合成与积累调控平台 | 合成生物学,生物技术 |
| 772 | 2025-10-05 |
Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400601
PMID:40071650
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研究论文 | 本研究展示了在巨型聚合物-脂质混合囊泡中原位聚合微管并观察不同网络形态的过程 | 首次在聚合物-脂质混合囊泡中实现微管原位聚合,并发现不同GTP浓度可产生不同的微管网络形态 | NA | 模拟活细胞动态细胞骨架,研究膜组成对微管形态的影响 | 巨型聚合物-脂质混合囊泡和微管 | 合成生物学 | NA | 原位聚合、微管组装 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 773 | 2025-10-05 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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研究论文 | 本研究开发了一种结合机器人技术和机器学习的自动化方法,用于大规模生产治疗用合成细胞 | 首次将机器人液体处理系统与自动化组织解离乳化技术结合,使合成细胞产量提升30倍,生产时间减少一半,并采用基于AI的图像分析进行自动化质量评估 | 研究主要针对临床前应用,尚未在人体进行验证 | 开发可扩展的合成细胞自动化生产方法用于治疗应用 | 蛋白质生产型合成细胞 | 合成生物学 | NA | 机器人液体处理系统、自动化组织解离乳化、AI图像分析 | 人工智能 | 图像数据 | 小鼠实验 | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 医学 |
| 774 | 2025-10-05 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 本研究开发了基于V-K型CRISPR相关转座酶(CAST)的系统,实现治疗性基因在人类细胞基因组中的可编程整合 | 首次将来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统重新用于人类细胞基因组编辑,相比传统Cascade系统仅需单个Cas12k效应蛋白 | 脱靶事件虽罕见但可在特定基因组区域重复出现 | 开发更简化的CRISPR基因编辑工具用于治疗应用 | 人类细胞基因组 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 基因组数据 | 多种人类细胞类型 | CRISPR-Cas | 人类细胞 | 基因整合系统 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 775 | 2025-10-05 |
Boosting microalgae-based carbon sequestration with the artificial CO2 concentration system
2025-May-15, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2498464
PMID:40374568
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综述 | 本文综述了利用微藻进行人工CO2封存技术的现状,重点探讨了CO2耐受物种筛选、培养优化、反应器设计及合成生物学应用 | 系统整合了微藻固碳技术的光反应与暗反应优化策略,并引入合成生物学手段提升CO2溶解与生物固定效率 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有文献分析 | 优化微藻基碳封存技术以应对全球变暖挑战 | 微藻及其碳封存系统 | NA | NA | 合成生物学,生命周期评估,技术经济分析 | NA | 文献资料 | NA | NA | 微藻 | NA | 环境,能源 |
| 776 | 2025-10-05 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M13噬菌体的工程细菌DNA递送系统,用于研究细菌间的协同响应机制 | 利用M13噬菌体构建动态噬菌粒补充系统,首次实现工程细菌间DNA介导的信息传递和协同响应 | 未提及具体应用场景下的效率验证和安全性评估 | 开发工程细菌间DNA递送系统并研究细菌协同响应机制 | 工程细菌和M13噬菌体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体递送系统、基因电路模块化 | NA | NA | NA | M13噬菌体 | 工程细菌 | 动态噬菌粒补充系统、模块化基因电路 | 医学 |
| 777 | 2025-10-05 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 开发了一种能够持续再生全部20种氨酰-tRNA合成酶的重构系统,推动自合成人工系统的实现 | 首次实现了在重构系统中持续再生全部20种AARS,通过五项关键改进突破了翻译系统的自我再生难题 | 未提及在更复杂系统或体内环境中的应用验证 | 构建可自我复制的人工系统,推动合成生物学发展 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)及其再生系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构系统、序列优化、翻译系统优化、密码子优化 | NA | 实验数据 | 20种AARS蛋白的再生系统 | 体外重构系统 | 无细胞系统 | AARS再生系统,包含20种酶的协同表达和功能维持 | 合成生物学、基础研究 |
| 778 | 2025-10-05 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过在酿酒酵母中引入人类m6Am甲基转移酶PCIF1,显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现人类m6Am甲基转移酶PCIF1在酵母中能促进萜类化合物生物合成,并揭示其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径基因以及激活细胞壁完整性MAPK通路发挥作用 | NA | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 779 | 2025-10-05 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造与人工智能、大模型等信息技术融合的发展方向和新兴技术方法 | NA | 为生物制造相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造相关的数据库、知识库和大语言模型 | 生物信息学 | NA | 系统生物学、合成生物学、人工智能、大语言模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 780 | 2025-10-05 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件智能设计方面的应用与进展 | 整合人工智能与合成生物学、高通量技术,开发更高效的核酸元件设计工具 | 生物系统复杂性高且缺乏高度量化的训练数据,限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨人工智能在生物制造中核酸元件设计优化的应用 | 生物制造中的核酸功能元件 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法、高通量技术 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 启动子、核糖体结合位点、终止子及其组合设计 | 工业生物技术 |