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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-05 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
|
综述 | 本文讨论工程化模型在研究生殖层形成前后阶段的应用进展 | 整合干细胞技术与工程工具研究人类早期发育,提供前所未有的发育机制见解 | NA | 研究哺乳动物生殖层形成前后阶段的发育过程 | 胚泡样结构、二维微图案系统、三维原肠胚样结构、体节样结构等工程化模型 | 发育生物学 | NA | 干细胞技术、微图案基底、微流体系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA | 微图案基底、微流体系统、合成生物学工具 | 人类干细胞 | NA | 医学 |
| 762 | 2025-10-05 |
The gut-bone axis in osteoporosis: a multifaceted interaction with implications for bone health
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1569152
PMID:40741168
|
综述 | 系统阐述肠道-骨骼轴在骨质疏松中的作用机制及干预策略 | 创新性提出肠道-骨骼轴+X概念框架,支持纳米生物材料、细菌合成生物学等新技术在抗骨质疏松中的应用 | NA | 探讨肠道微生态通过免疫和内分泌途径影响骨骼健康的机制 | 肠道微生态与骨骼组织的相互作用 | 骨科与微生物组学交叉研究 | 骨质疏松 | 粪便微生物移植、益生菌/益生元补充、饮食模式调整 | NA | 文献综述数据 | NA | 细菌合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 763 | 2025-10-05 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
|
综述 | 系统总结铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然优势及关键修饰策略,并讨论其在生物医学领域的多样化应用 | 全面梳理铁蛋白结构修饰策略及其在生物医学应用中的最新进展,提出结合人工智能和合成生物学等新技术的未来发展方向 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化等挑战 | 总结铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其生物医学应用进展 | 铁蛋白纳米颗粒 | 纳米医学 | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、环境修复、工业生物技术 |
| 764 | 2025-10-05 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-Jul-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于非离子表面活性剂的巨型单层尼奥体(GUNs)作为合成细胞模型 | 首次利用液滴微流控技术制备单分散Span 80基GUNs,具有优异膜流动性和对小分子及质子的固有选择性渗透性 | NA | 开发更稳定、经济且具有良好渗透性的合成细胞模型 | 巨型单层尼奥体(GUNs) | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 糖酵解-线粒体级联反应系统 | 仿生微系统,合成生物学,药物递送 |
| 765 | 2025-10-05 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-Jul-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
|
研究论文 | 本研究揭示了病原体毒力因子malleicyprol中反应性丁烯酸内酯核心结构的生物合成机制 | 首次阐明通过两个聚酮链头对头融合形成硫模板化丁烯酸内酯的生物合成途径 | NA | 解析malleicyprol毒力因子中丁烯酸内酯核心结构的生物合成机制 | Burkholderia pseudomallei病原体中的malleicyprol毒力因子 | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学合成、体外生物转化重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 766 | 2025-10-05 |
Advances and obstacles of T cell-based immunotherapy in gynecological malignancies
2025-Jul-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02411-w
PMID:40713697
|
综述 | 全面分析CAR-T细胞疗法在妇科肿瘤中的进展、挑战及未来策略 | 整合临床前见解与转化临床数据,建立妇科肿瘤过继性T细胞疗法的战略框架,强调CAR-T技术与个性化新抗原疫苗及微环境重编程剂的协同潜力 | 治疗持久性和制造一致性仍存在持续限制 | 推进妇科恶性肿瘤中基于T细胞的免疫治疗 | 妇科恶性肿瘤(卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌) | NA | 妇科肿瘤 | CAR-T细胞疗法、合成生物学方法、多组学引导的抗原选择 | NA | 临床数据、临床前数据 | NA | CAR-T | T淋巴细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 767 | 2025-10-05 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
|
综述 | 探讨肿瘤内微生物群(特别是胞内细菌)在肿瘤演进中的作用及其在癌症治疗中的应用前景 | 系统阐述胞内细菌在肿瘤进展中的新机制,并提出基于合成生物学和工程化药物递送系统的靶向治疗新策略 | NA | 解析肿瘤内微生物群在癌症发生发展中的作用机制并探索其治疗应用 | 肿瘤内微生物群(特别是胞内细菌)及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 癌症 | 二代测序、生物信息学分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 768 | 2025-10-05 |
Protein design of two-component tubular assemblies similar to cytoskeletons
2025-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62076-3
PMID:40695817
|
研究论文 | 开发了一种受自然启发的蛋白质设计方法,利用两种不同蛋白质单元构建类似细胞骨架的动态管状结构 | 首次实现了两种不同蛋白质单元在精心设计条件下组装成具有动态柔性的管状结构,能够响应环境刺激可逆组装 | NA | 探索蛋白质高级结构组装的设计原理,模拟天然细胞骨架系统的动态行为 | 两种不同蛋白质单元及其组装形成的管状结构 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜 | NA | 结构图像数据 | NA | 蛋白质理性设计 | NA | 仿肌动蛋白丝和微管的管状组装结构 | 材料科学, 合成生物学 |
| 769 | 2025-10-05 |
Identification of cognate recombination directionality factors for large serine recombinases by virtual pulldown
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf691
PMID:40701553
|
研究论文 | 本研究利用AlphaFold2-multimer预测并实验验证了大丝氨酸重组酶的匹配重组方向性因子 | 首次使用AlphaFold2-multimer系统性地预测RDFs,成功识别了超过半数测试重组酶的潜在RDFs | RDFs缺乏序列保守性且与噬菌体整合酶基因缺乏同线性,增加了识别难度 | 开发识别大丝氨酸重组酶匹配重组方向性因子的计算方法 | 98个大丝氨酸重组酶及其重组方向性因子 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2-multimer预测、实验验证 | AlphaFold2-multimer | 蛋白质序列和结构数据 | 98个大丝氨酸重组酶测试集,其中9个作为测试案例 | 大丝氨酸重组酶系统 | NA | 整合型重组系统(噬菌体或移动元件插入模拟) | 合成生物学、基因组编辑 |
| 770 | 2025-10-05 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
|
研究论文 | 本研究开发了基因'保质期'电路来控制合成细菌的寿命,用于安全的环境修复应用 | 设计了可调节寿命的前馈激活网络电路,结合合成小调控RNA和基于asd的营养缺陷系统,实现了细菌程序化自毁 | NA | 开发合成细菌的生物安全控制策略,确保其在环境应用中的安全部署 | 工程化大肠杆菌及其基因调控电路 | 合成生物学 | NA | 基因电路设计、合成生物学工程 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 前馈激活网络、细胞裂解电路、营养缺陷系统 | 环境 |
| 771 | 2025-10-05 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
|
研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现完整的合成生物学计算系统,采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译,支持权重更新为负值 | NA | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA | NA | NA | 包含计算训练组件、测试组件和学习算法的DNA杂交反应电路 | 生物计算 |
| 772 | 2025-10-05 |
Development of precise genome editing and multi-copy integration tools in Hansenula polymorpha DL-1
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.009
PMID:40735059
|
研究论文 | 开发了针对多形汉逊酵母DL-1菌株的精确基因组编辑和多拷贝整合工具包 | 建立了高效CRISPR-Cas9基因组编辑系统,部分抑制NHEJ通路增强同源重组效率,鉴定了36个中性位点用于单拷贝整合,开发了靶向rDNA和Ty元件的多拷贝整合工具 | NA | 解决多形汉逊酵母DL-1菌株因强NHEJ机制和有限遗传工具而受限的代谢工程问题 | 多形汉逊酵母DL-1菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑,同源重组,多拷贝整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Hansenula polymorpha DL-1 | 代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 773 | 2025-10-05 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-Jul-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过光响应DNA液滴动态调控酶级联途径的新方法 | 利用偶氮苯修饰的Y型DNA序列构建光响应液滴,首次实现了通过光控相分离动态调控酶级联反应 | 仅验证了两种酶级联系统,需要进一步测试更复杂的代谢途径 | 开发动态调控酶级联途径的新方法 | 酶级联反应系统(GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离,光控技术 | NA | 生化实验数据 | 两种酶级联系统 | DNA纳米技术 | NA | 光响应DNA液滴系统,酶隔离与释放机制 | 合成生物学, 生物工程, 微反应器设计 |
| 774 | 2025-10-05 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨计算生物学在癌症治疗中的应用,重点介绍从头设计蛋白质和多肽结合剂的方法与前景 | 整合计算设计、定向进化和人工智能技术,突破天然蛋白质支架限制,开发高特异性癌症靶向分子 | 计算工具(如Rosetta和AlphaFold)对无序区域和构象动力学的预测准确性仍存在局限 | 开发新型蛋白质和多肽结合剂以改善癌症精准治疗 | 从头设计的蛋白质和多肽结合剂(如DARPins、PD-1/PD-L1微型蛋白抑制剂) | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | 医学 |
| 775 | 2025-10-05 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜结构揭示了噬菌体蛋白gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的转录调控机制 | 首次解析了gp79通过N端侵入RNA通道取代σ4,并在遇到gp36时改变构象稳定RNAP-启动子开放复合物的分子机制 | NA | 阐明噬菌体phiEco32蛋白gp79同时抑制宿主转录和激活自身转录的双重调控机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79和gp36、同源启动子 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、结构分析、生化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 776 | 2025-10-05 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
|
研究论文 | 开发了一种基于机器学习的计算工具,用于从复制起点序列预测ColE1类质粒的拷贝数 | 首个能够从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件工具,强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 简化质粒拷贝数设计,重新定义质粒工程工作流程 | ColE1类质粒的复制起点序列 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | DNA序列数据 | NA | 质粒工程 | NA | 质粒复制起点设计 | 工业生物技术,医学 |
| 777 | 2025-10-05 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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综述 | 本文通过机器学习视角探讨细胞内的模式识别机制,分析人工神经网络与生物信号通路之间的相似性 | 将机器学习概念框架应用于生物学系统,提出信号通路和基因调控网络具有内在计算能力的新观点 | NA | 探索人工神经网络与生物信号通路在结构和功能上的相似性与差异 | 细胞信号通路、基因调控网络、人工神经网络 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 778 | 2025-10-05 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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研究论文 | 本研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器 | 首次将基因改造的巨大芽孢杆菌活细胞和孢子与CMOS芯片集成,创建可现场部署的砷检测传感器 | 作为概念验证研究,传感器在实际环境中的大规模应用仍需进一步验证 | 开发用于资源有限环境的实时砷检测技术 | 砷污染检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA | 合成生物学工具 | 巨大芽孢杆菌 | 砷生物传感器 | 环境 |
| 779 | 2025-10-05 |
High-Throughput 19F NMR Chiral Analysis for Screening and Directed Evolution of Imine Reductases
2025-Jul-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00498
PMID:40726787
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研究论文 | 开发了一种基于19F NMR的高通量手性分析方法,用于亚胺还原酶的筛选和定向进化 | 首次将19F NMR技术应用于高通量手性分析,能够同时评估对映选择性、立体偏好性和反应产率 | NA | 开发高效快速的手性分析方法以推动生物催化和合成生物学发展 | 亚胺还原酶及其在合成抗帕金森药物罗替戈汀中间体中的应用 | 合成生物学 | 帕金森病 | 19F NMR | NA | NMR光谱数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药 |
| 780 | 2025-10-05 |
Unraveling the Complexity of Plant Trichomes: Models, Mechanisms, and Bioengineering Strategies
2025-Jul-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26147008
PMID:40725255
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综述 | 本文综述了植物表皮毛的发育、结构和功能研究进展,重点探讨腺毛在植物合成生物学中的应用潜力 | 整合分子机制与新兴技术,提出了利用表皮毛进行可持续农业和生物制造的前瞻性框架 | NA | 探讨植物表皮毛的发育机制及其在合成生物学中的应用策略 | 植物表皮毛,特别是关键物种的腺毛分泌毛(GSTs) | 植物合成生物学 | NA | 模块化基因工程、代谢通道策略 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 可持续农业,天然产物发现,生物制造 |