合成生物学相关文章
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当前共找到 849 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-02-08 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-Feb-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的酵母文库转化方法HEEL，通过结合热休克和电穿孔技术，提高了单转化酵母细胞的比例，从而实现了近乎完美的表型到基因型的关联 | HEEL方法通过结合热休克和电穿孔技术，显著提高了单转化酵母细胞的比例，从20%提升至70%以上，解决了传统方法中多质粒摄取导致的异质基因型问题 | 尽管HEEL方法显著提高了转化效率和单转化细胞比例，但其在更大规模应用中的效果和稳定性仍需进一步验证 | 开发一种高效的酵母文库转化方法，以提高表型到基因型关联的准确性 | 酵母细胞 | 分子生物学 | NA | 热休克-电穿孔结合技术（HEEL） | NA | DNA文库 | 每个反应超过10个酵母细胞 |
| 762 | 2025-02-08 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 本文介绍了一种在凝胶颗粒格式中测量XNA聚合酶保真度的新方法 | 开发了一种无需纯化的方法，通过在凝胶包覆的磁性颗粒基质中进行XNA转录和逆转录步骤，显著减少了测量XNA聚合酶保真度所需的时间和反应规模 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种更高效的方法来测量能够合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶的保真度 | XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 凝胶包覆的磁性颗粒基质中的XNA转录和逆转录 | NA | NA | NA |
| 763 | 2025-02-08 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“foldtuning”的新方法，利用蛋白质语言模型（pLMs）探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域 | 通过foldtuning方法，利用pLMs生成和自反馈能力，探索与自然序列无同源性的蛋白质“深空”区域，并构建了一个包含700多种自然折叠的foldtuned pLMs库 | 尽管foldtuning方法展示了在蛋白质序列设计中的潜力，但其生成的蛋白质变体的功能和稳定性仍需进一步实验验证 | 探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域，推动合成生物学系统的重新设计和重构 | 蛋白质序列和结构 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质语言模型（pLMs） | pLMs | 蛋白质序列和结构数据 | 超过700种自然折叠的蛋白质 |
| 764 | 2025-02-08 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 本文回顾并总结了非编码RNA（ncRNA）在细胞命运决定中的数学模型框架及其在真实生物过程中的应用 | 探讨了ncRNA与转录因子之间的正反馈环以及miRNA-mRNA相互调控的新兴特性，这些特性使得双稳态开关能够指导细胞命运决定 | ncRNA介导的双稳态开关的分子机制仍然不明确且存在争议 | 阐明ncRNA介导的细胞命运决定过程的分子机制 | 非编码RNA（ncRNA）、mRNA、miRNA和竞争性内源mRNA（ceRNA） | 系统生物学与合成生物学 | NA | 数学模型与定量实验分析 | NA | NA | NA |
| 765 | 2025-02-08 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
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综述 | 本文探讨了微生物组工程在提高食品安全和质量方面的作用，并评估了相关的最新技术和社会伦理问题 | 本文综合评估了合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术在微生物组工程中的应用，并强调了跨学科合作的重要性 | 需要进一步研究以解决复杂食品系统中微生物动态的理解和统一监管框架的制定等关键挑战 | 探讨微生物组工程在提高食品安全和质量方面的潜力 | 微生物组及其在食品系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 766 | 2025-02-07 |
All Roads Lead to Rome: Pathways to Engineering Disease Resistance in Plants
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412223
PMID:39691979
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综述 | 本文综述了植物抗病性的基础机制及开发植物抗病性的不同策略，并总结了可用于关键作物抗病育种的潜在基因 | 结合基因工程、基因编辑和合成生物学的最新进展，全面解释了病原体与宿主之间的斗争机制，并提供了开发植物抗病性的详细策略 | 讨论了这些策略的局限性及其可能的解决方案 | 开发新的策略以控制植物病害，减少全球作物产量损失 | 植物及其与微生物病原体和有害害虫的相互作用 | 植物生物学 | 植物病害 | 基因工程、基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 767 | 2025-02-06 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 本文通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动态及其转运机制 | 通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 尽管进行了广泛的生化表征和晶体结构解析，但对碳酸氢盐转运机制的动态理解仍然不足 | 研究蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，以增强光合作用产量 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA | 分子动力学模拟 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | 超过1毫秒的模拟数据 |
| 768 | 2025-02-06 |
Recent trends in the elucidation of complex triterpene biosynthetic pathways in horticultural trees
2025-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae254
PMID:39802733
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综述 | 本文综述了园艺树木中三萜类化合物的化学多样性及其生物合成途径，并介绍了用于发现、表征和优化这些途径的集成设计-构建-测试-学习（DBTL）管道 | 本文强调了合成生物学在揭示三萜类化合物生物合成途径中的重要作用，并提出了跨学科合作的机会 | 园艺树木中三萜类化合物的生物功能和机制尚未完全明确，且缺乏可扩展的生产系统 | 探讨园艺树木中三萜类化合物的生物合成途径及其在可持续发展中的应用 | 园艺树木中的三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | DBTL（设计-构建-测试-学习）管道 | NA | NA | NA |
| 769 | 2025-02-06 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNAs（amiRNAs）和靶标模拟物在作物改良中的潜在应用，探讨了其在植物基因表达调控和作物抗逆性提升中的作用 | 提出了利用人工miRNAs和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的新方法，并探讨了其在合成生物学中的应用 | 文章主要基于现有研究进行综述，未涉及具体实验验证，且对amiRNAs和STTMs的实际应用挑战分析较为有限 | 探讨人工miRNAs和靶标模拟物在作物改良中的应用，特别是其在增强作物抗逆性和抗病性方面的潜力 | 植物miRNAs及其调控机制，以及人工miRNAs和靶标模拟物的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 人工miRNAs（amiRNAs）、靶标模拟物（eTMs、STTMs） | NA | NA | NA |
| 770 | 2025-02-05 |
Photoinduced electron transfer enables cytochrome P450 enzyme-catalyzed reaction cycling
2025-Feb, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.109412
PMID:39708699
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研究论文 | 本文报道了一种光诱导电子转移系统，用于启动和维持细胞色素P450酶（CYP）催化的反应循环 | 开发了一种光诱导电子转移系统，替代了传统的NADPH依赖的CYP还原酶（CPR），提高了CYP催化反应的效率 | 研究仅针对特定的CYP催化反应模型，尚未广泛验证于其他CYP催化反应 | 研究目的是开发一种新的电子转移系统，以提高CYP催化反应的效率并减少对NADPH和CPR的依赖 | 细胞色素P450酶（CYP）及其催化的反应 | 合成生物学 | NA | 光诱导电子转移 | NA | NA | NA |
| 771 | 2025-02-05 |
Metabolic engineering approaches for the biosynthesis of antibiotics
2025-Jan-31, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02628-2
PMID:39891166
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综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在抗生素发现及其有效生产中的应用 | 探讨了代谢工程和合成生物学在开发高效酶和细胞工厂以生产现有抗生素及其衍生物和类似物方面的创新策略 | 未具体提及研究的局限性 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略振兴新抗生素的发现和开发 | 抗生素及其衍生物和类似物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 772 | 2025-02-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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研究论文 | 本文介绍了一种无需淬灭剂的荧光监测方法，用于监测G-四链体结构的折叠 | 提出了一种仅使用单一染料标记、无需淬灭剂的FRET类似格式来监测G-四链体DNA序列的展开转变 | 未提及具体局限性 | 开发低成本、高通量的工具以监测G-四链体结构的折叠和展开转变，加速合成生物学系统的原型设计和设计-构建-测试周期 | G-四链体DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测 | NA | DNA序列数据 | 未提及具体样本数量 |
| 773 | 2025-02-05 |
Silk Protein Gene Engineering and Its Applications: Recent Advances in Biomedicine Driven by Molecular Biotechnology
2025, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S504783
PMID:39881670
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综述 | 本文综述了丝蛋白基因工程及其在生物医学领域的应用，重点介绍了分子生物技术在丝蛋白遗传工程中的应用 | 通过分子生物技术创新，如CRISPR-Cas9基因编辑技术、转基因表达技术和合成生物学技术，生产具有特定性能的新型丝蛋白 | NA | 探讨丝蛋白基因工程在生物医学领域的应用及其潜力 | 丝蛋白及其在药物递送系统、组织工程和再生医学中的应用 | 生物医学工程 | NA | CRISPR-Cas9, 转基因表达技术, 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 774 | 2025-02-02 |
Unravelling the aromatic symphony: redirecting bifunctional mushroom synthases towards linalool monofunctionality
2025-Jan-13, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00056-2
PMID:39883255
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研究论文 | 本文通过修改双功能蘑菇合成酶的氨基酸序列，成功提高了其底物选择性，使其更倾向于生成芳樟醇而非橙花叔醇 | 通过修改双功能蘑菇合成酶的氨基酸序列，显著提高了其底物选择性，减少了副产物的生成 | 虽然底物选择性有所提高，但未能完全实现单功能化 | 提高酶的底物选择性，设计单功能的芳樟醇合成酶 | 双功能芳樟醇/橙花叔醇合成酶（LNS） | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接模拟、分子动力学模拟 | NA | NA | 四种双功能蘑菇LNS |
| 775 | 2025-01-31 |
Microbial biotechnology: from synthetic biology to synthetic ecology
2025-Jan-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00054-4
PMID:39883269
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 776 | 2025-02-01 |
Extracellular electron transfer-dependent bioremediation of uranium-contaminated groundwater: Advancements and challenges
2025-Mar-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2024.122957
PMID:39708382
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综述 | 本文综述了利用微生物还原过程通过细胞外电子转移（EET）将可溶性铀（U(VI)）转化为不溶性铀（U(IV)）的潜力，以修复铀污染的地下水 | 探讨了通过优化电子转移、利用合成生物学方法和集成机器学习等先进策略来提高EET驱动过程的效率 | 需要在实际工程应用中进行优化和创新 | 探索铀污染地下水修复的高效和可持续方法 | 铀污染的地下水 | 环境科学 | NA | 细胞外电子转移（EET） | NA | NA | NA |
| 777 | 2025-01-31 |
Spontaneous Emergence of Lipid Vesicles in a Coacervate-Based Compartmentalized System
2025-Jan-27, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202414372
PMID:39656166
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研究论文 | 本文研究了在缺乏进化生物机制的情况下，脂质囊泡的自发形成，展示了凝聚微滴如何创造一个分隔环境，富集脂质分子并促进其自发组装成脂质囊泡 | 揭示了凝聚微滴与脂质分子之间复杂的相互作用，为细胞系统的出现提供了新的视角，并扩展了对地球上生命发展所需条件的理解 | NA | 探索脂质囊泡在无生物机制情况下的自发形成机制 | 脂质分子和凝聚微滴 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 778 | 2025-01-31 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体在对抗多重耐药细菌中的应用，包括噬菌体工程技术及其在细菌病原体检测和消除中的应用 | 通过化学修饰和基因工程技术增强噬菌体的宿主范围、提高效能，并赋予新功能，以应对多重耐药细菌的挑战 | 天然噬菌体的宿主范围狭窄、特性未明以及指数复制和进化带来的潜在风险限制了其应用 | 探索噬菌体工程技术在病原体控制中的应用，以应对全球抗生素耐药性危机 | 多重耐药细菌 | 合成生物学与纳米技术 | 细菌感染 | 化学修饰、基因工程 | NA | NA | NA |
| 779 | 2025-01-31 |
Cell-to-Cell Natural Transformation Mediated Efficient Plasmid Transfer Between Bacillus Species
2025-Jan-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020621
PMID:39859334
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研究论文 | 本研究描述了一种新的质粒转移方法，称为细胞间自然转化质粒转移（CTCNT-P），该方法在自然感受态菌株之间高效促进质粒转移 | 提出了一种新的质粒转移方法CTCNT-P，相比传统方法如Spizizen培养基或电穿孔介导的转化，效率显著提高 | NA | 研究细菌水平基因转移（HGT）的新方法，以提高质粒转移效率 | 芽孢杆菌属（Bacillus species）的菌株 | 微生物学 | NA | 细胞间自然转化质粒转移（CTCNT-P） | NA | NA | NA |
| 780 | 2025-01-31 |
Rapid Multi-Well Evaluation of Assorted Materials for Hydrogel-Assisted Giant Unilamellar Vesicle Production: Empowering Bottom-Up Synthetic Biology
2025-Jan-02, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels11010029
PMID:39852000
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研究论文 | 本文介绍了一种快速评估多种水凝胶材料用于辅助生产巨型单层囊泡（GUVs）的方法，旨在推动自下而上的合成生物学研究 | 开发了一种通过控制滴铸在玻璃培养皿和聚苯乙烯多孔板中快速筛选多达96种GUV生产配方的技术，并成功封装了猪肝酯酶（PLE-GUVs），提供了一种新的GUV标记和追踪方法 | 部分水凝胶材料可能会泄漏并污染GUVs，或需要处理有毒材料或特殊化学物质，限制了新手的使用 | 探索和评估替代水凝胶材料以解决现有GUV生产方法的局限性，并开发新的GUV标记和追踪方法 | 巨型单层囊泡（GUVs） | 合成生物学 | NA | 水凝胶辅助GUV生产 | NA | 实验数据 | 多达96种GUV生产配方 |