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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
|
综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力,包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展,包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 62 | 2026-02-02 |
Intracellularly coupled oscillators for synthetic biology
2025-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67893-0
PMID:41423683
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研究论文 | 本文提出并建模了细胞内耦合振荡器作为合成生物学的高级构建模块,旨在指导未来细菌合成生物学实验 | 基于耦合强度对振荡器进行分类,并预测了包括混沌和同步在内的多种动态行为,为振荡器计算提供新方向 | NA | 工程化或重新设计生命系统以实现复杂功能 | 细胞内耦合振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基于振荡器的电路设计,包括独立、弱耦合、强耦合和深度耦合振荡器 | 工业生物技术 |
| 63 | 2026-02-02 |
Intratumoral microorganisms and artificial antitumor bacteria
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.06.002
PMID:41613448
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物在癌症进展和治疗中的作用,并探讨了基于合成生物学技术编程的人工抗肿瘤细菌在精准癌症诊断和治疗中的应用前景 | 强调了通过合成生物学技术编程细菌以增强时空可控性,结合免疫疗法或其他强效抗肿瘤剂,可能开启下一代精准癌症诊断和治疗 | NA | 探讨肿瘤内微生物在癌症发展和治疗中的角色,以及基于活菌的新型治疗和诊断方法 | 肿瘤内微生物和人工编程的抗肿瘤细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 64 | 2026-02-02 |
Gene circuit-based sensors
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.06.011
PMID:41613450
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综述 | 本文综述了基于合成生物学基因回路构建的生物传感器的设计原理、工程化方法及其在多个领域的应用,并重点探讨了基于无细胞系统的生物传感器的研究进展 | 整合合成生物学基本概念,全面描述了基因回路的设计与工程化,并重点聚焦于基于无细胞系统的生物传感器的设计理念、构建原则及其在生物检测领域的新前沿 | NA | 综述基于合成生物学基因回路的生物传感器的设计、构建与应用,并讨论该领域的新前沿与待解决的挑战 | 基于合成生物学基因回路的生物传感器,特别是基于无细胞系统的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物(泛指),无细胞系统 | 基因回路,包括具有不同响应机制、逻辑门和逻辑回路的传感器 | 生物制造过程监控, 环境监测, 食品安全, 医疗诊断与监测 |
| 65 | 2026-02-02 |
Nano-synthetic biology for disease diagnosis and treatment
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.07.002
PMID:41613477
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2026-02-02 |
Nanoscale synthetic biology with innovative medicinal applications
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.006
PMID:41613444
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综述 | 本文综述了纳米尺度合成生物学(NSB)在生物医学领域的应用,包括常见纳米载体、纳米生物组装系统及具体应用 | 整合合成生物学与纳米科学,通过纳米尺度操控实现更高效可控的生物工程,促进疾病治疗、生物成像、生物催化和生物传感的创新 | NA | 探讨NSB在生物医学中的应用,以推动科学技术进步并应对重大社会挑战 | 包括细胞、细菌和病毒在内的各种生物体 | 合成生物学 | NA | 基因调控系统(如CRISPR、mRNA、siRNA、质粒)、纳米酶、药物和特定纳米探针的递送 | NA | NA | NA | CRISPR, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细胞, 细菌, 病毒 | 生物传感器, 代谢途径 | 医学 |
| 67 | 2026-02-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 本文综述了肺癌组织内微生物群的存在及其通过炎症和免疫途径重塑肿瘤微环境的机制,并探讨了其在临床预测和治疗中的应用前景 | 推翻了‘无菌肿瘤’的传统观念,系统阐述了肿瘤内微生物群主动调控肺癌进展的机制,并前瞻性地讨论了合成生物学工具(如工程菌和靶向纳米抗生素)在重塑免疫微环境中的应用潜力 | 肺癌组织微生物生物量低,测序数据易受试剂污染和批次效应影响;真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明肿瘤内微生物群影响肺癌细胞及肿瘤微环境的机制,探索其在肺癌进展中的作用及临床转化潜力 | 肺癌组织内的微生物群(包括细菌、真菌、病毒等)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序、多组学技术 | NA | 测序数据、多组学数据 | NA | 合成生物学(涉及工程菌、靶向纳米抗生素设计) | NA | NA | 医学(癌症精准诊断与治疗) |
| 68 | 2026-01-30 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
|
研究论文 | 提出了一种名为DNABERT2-CAMP的混合深度学习模型,用于准确识别大肠杆菌的启动子序列 | 首次将预训练的DNABERT-2 Transformer与定制的CAMP模块(CNN-注意力-平均池化)相结合,以同时建模长距离基因组依赖性和细粒度局部基序 | NA | 开发一个强大的、可推广的基因组注释和合成生物学应用工具 | 大肠杆菌的启动子序列 | 自然语言处理 | NA | 深度学习 | Transformer, CNN | DNA序列 | 8720个经过实验验证的81-bp序列(正负样本) | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 69 | 2026-01-30 |
Systemic engineering and global regulation enabling high-level bilirubin biosynthesis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67804-3
PMID:41436472
|
研究论文 | 本研究通过系统工程和全局调控,开发了一种高效、可扩展的体外胆红素生物合成途径 | 揭示了Fe²⁺诱导中间体氧化降解的隐藏挑战,并通过竞争性铁螯合、质子化状态调控以及引入一氧化碳脱氢酶解决酶活性抑制问题,实现了胆红素合成效率的20倍提升 | 研究基于体外系统,其在体内应用的效果和稳定性仍需进一步验证 | 提高胆红素生物合成的产量和效率,解决合成生物学中血红素相关途径的稳定性问题 | 胆红素生物合成途径及其关键酶和中间体 | 合成生物学 | NA | DFT计算、酶筛选、机理分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 体外胆红素生物合成途径,包含血红素加氧酶、一氧化碳脱氢酶和甲酸脱氢酶(用于NADPH循环) | 工业生物技术 |
| 70 | 2026-01-30 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Nov-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能光合底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 系统总结了该藻类从模式生物向可扩展生物制造平台转型的整合策略,包括细胞器基因表达、DNA定点整合等新兴技术 | 当前仍存在产物产量不足、生物量限制和生产成本过高等工业化转化障碍 | 探讨三角褐指藻作为光合底盘在可持续生物生产中的潜力与优化路径 | 海洋硅藻三角褐指藻及其遗传改造菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 三角褐指藻 | 代谢途径工程(岩藻黄质、脂肪酸、三酰甘油增产)、异源产物合成途径(萜类、治疗性肽类、可持续材料) | 工业生物技术, 医药, 材料 |
| 71 | 2026-01-30 |
Microbial therapeutics for canine periodontal disease: current status and future perspectives
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1748968
PMID:41602620
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综述 | 本文综述了犬牙周病的微生物疗法现状,包括益生菌、后生元、噬菌体及合成生物学等策略,并讨论了其未来前景与挑战 | 从生态失调角度而非单一病原体视角分析犬牙周病,并系统评估了多种新兴微生物疗法(如噬菌体、合成生物学工具)在该领域的应用潜力 | 现有疗法存在微生物定植短暂、兽医临床证据有限、生物安全性担忧以及缺乏标准化监管路径等问题 | 探讨通过调节口腔微生物群落结构与功能来治疗犬牙周病的非抗生素策略 | 犬牙周病及其相关的口腔微生物群落 | NA | 牙周病 | 测序技术、定量分子分析 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 72 | 2026-01-29 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本研究开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制气囊蛋白的组装因子和外壳蛋白的表达,以解决异源表达气囊时引起的细胞生长抑制和裂解问题 | 首次观察到气囊诱导后8-16小时细胞密度下降的现象,并设计了时序诱导策略,在维持气囊产量的同时恢复了细菌正常生长 | 研究仅在大肠杆菌中进行验证,未在其他宿主中测试该调控系统的普适性 | 优化气囊在非天然宿主中的异源表达,减少其对细胞生长的负面影响 | 气囊蛋白的组装过程及其对宿主细胞的影响 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统、时序诱导策略 | NA | NA | NA | 双诱导转录调控系统 | 大肠杆菌 | 时序调控的基因回路,通过正交控制组装因子蛋白和外壳蛋白的表达时序与化学计量比 | 生物医学工程、合成生物学 |
| 73 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角,系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章,主要基于现有文献进行整合分析,未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用,探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子(如GLP-1)的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 74 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
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研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型,利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变,模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞,实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行,尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制,构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统,以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构,形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 75 | 2026-01-28 |
Antifungal Biocontrol in Sustainable Crop Protection: Microbial Lipopeptides, Polyketides, and Plant-Derived Agents
2025-Dec-27, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12010022
PMID:41590434
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综述 | 本文综述了微生物和植物来源的抗真菌生物防治剂在可持续作物保护中的应用,重点介绍了环状脂肽和聚酮类等次级代谢产物的结构、生物合成途径及作用机制 | 整合了当前关于微生物次级代谢产物(特别是环状脂肽和聚酮类)和植物来源抗真菌剂的最新知识,并强调了基因组学、代谢工程和合成生物学在加速菌株改良和新化合物发现方面的进展 | NA | 探讨抗真菌生物防治剂作为合成杀菌剂替代品在可持续作物保护中的作用 | 微生物(如芽孢杆菌属、假单胞菌属、链霉菌属)和植物产生的抗真菌次级代谢产物 | NA | NA | 基因组学、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 76 | 2026-01-28 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Dec-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
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研究论文 | 本研究为致病真菌新型隐球菌开发了基因编码的氧化还原传感器,用于实时监测细胞内氧化还原状态 | 首次为新型隐球菌优化设计了基因编码的氧化还原传感器,并建立了多种基于荧光的实时监测技术 | 该研究主要针对新型隐球菌,在其它真菌中的应用仍需进一步验证 | 开发用于致病真菌的氧化还原生物传感器,研究真菌毒力相关的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原蛋白 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器技术、荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器 | 医学 |
| 77 | 2026-01-25 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
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综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用中的表观遗传调控机制及其在疾病发病中的作用 | 系统总结了不同物种利什曼原虫的表观遗传变化,并探讨了寄生虫如何通过表观遗传途径操纵宿主免疫信号,同时提出了合成基因回路调控宿主和寄生虫表观基因组的新策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据,主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨利什曼病中寄生虫与宿主相互作用的表观遗传调控机制,并评估基于表观遗传学和合成生物学的治疗策略潜力 | 利什曼原虫及其宿主(包括人类)的表观遗传修饰与相互作用 | NA | 利什曼病 | 文献综述(Web of Science、PubMed、Scopus数据库检索) | NA | 文本(文献数据) | NA | 合成基因回路 | 人类(宿主) | 用于调控宿主和寄生虫表观基因组的合成基因回路 | 医学 |
| 78 | 2025-12-19 |
Engineered Clostridium butyricum: a promising application of synthetic biology in comprehensive health
2025-Dec-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02901-y
PMID:41408287
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2026-01-24 |
Medium dependent factors govern the functionality of engineered type III secretion systems
2025-Dec-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00600-1
PMID:41402848
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研究论文 | 本研究探讨了细菌宿主培养条件对基于III型分泌系统(T3SS)的工程化电路功能的影响,并开发了可诱导的iT3SS系统 | 首次系统研究了培养介质对T3SS工程化系统性能的影响,揭示了介质依赖性因素如何通过宿主资源分配策略影响分泌效率 | 研究仅基于沙门氏菌模型,未在其他细菌宿主中验证;提出的翻译和翻译后负担假设需要进一步实验验证 | 优化工程化分泌系统在合成生物学应用中的性能,理解培养条件对T3SS功能的影响机制 | 沙门氏菌中的工程化III型分泌系统(iT3SS),包括PrgH-GFP融合蛋白和效应蛋白SptP | 合成生物学 | NA | RNA-seq分析,GFP荧光监测,IPTG诱导系统 | NA | 基因表达数据,蛋白质分泌效率数据,RNA-seq转录组数据 | 在丰富LB培养基和葡萄糖最小培养基中培养的沙门氏菌细胞,使用不同IPTG浓度处理 | 基因融合,IPTG诱导系统 | 沙门氏菌(Salmonella enterica) | IPTG诱导的工程化III型分泌系统(iT3SS),将prgH基因与GFP编码序列融合以监测表达 | 工业生物技术,合成生物学 |
| 80 | 2026-01-24 |
Insights into microalgal biotechnology: Current applications, key challenges, and future prospects
2025-Nov, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.127263
PMID:40961787
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综述 | 本文综述了微藻生物技术的当前应用、关键挑战及未来前景,探讨了其在碳捕集、可再生能源生产、环境修复和高价值生物产品合成等方面的多功能潜力 | 系统整合了微藻生物技术的最新进展,包括生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥等低能耗采收技术,以及CRISPR/Cas基因组编辑、光生物反应器设计创新和生命周期评估,并提出了模块化生物精炼系统、智能过程控制和支持性政策框架等未来发展方向 | 未提供具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述,缺乏对特定技术经济障碍的定量分析 | 评估微藻生物技术的现状、挑战和未来潜力,以推动其大规模应用和可持续发展 | 微藻生物技术及其在能源、环境和生物产品领域的应用 | 工业生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥、光生物反应器设计、生命周期评估 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |