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当前共找到 1531 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-20 |
Artificial polysaccharide-binding protein mediates co-assembly of nanodrug and probiotics against drug-resistant infectious enteritis
2025-Dec, Asian journal of pharmaceutical sciences
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.ajps.2025.101094
PMID:41809892
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研究论文 | 该研究通过将负载蜂毒肽的介孔二氧化硅纳米颗粒与人工多糖结合蛋白组装，再与益生菌共组装，形成纳米药物-益生菌复合体，用于治疗耐药性感染性肠炎 | 利用合成生物学技术构建人工多糖结合蛋白，实现无机纳米药物与益生菌的共组装，形成非生物/生物杂合体系，增强对耐药病原体的清除能力和益生菌的肠道定植效果 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未开展临床试验；共组装体系的长期安全性和稳定性有待进一步评估 | 开发一种基于纳米药物与益生菌共组装的新型治疗策略，用于高效治疗耐药病原体引起的感染性肠炎 | 耐药性肠道病原体（如鼠伤寒沙门氏菌、致病性大肠杆菌）、益生菌（乳酸菌、双歧杆菌）、感染性肠炎小鼠模型 | 合成生物学、纳米医学 | 感染性肠炎 | 纳米药物递送、益生菌共组装、合成生物学技术 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | 乳酸菌、双歧杆菌、小鼠 | 非生物/生物共组装体系（纳米药物-益生菌复合体） | 医学 |
| 62 | 2026-09-20 |
codonGPT: reinforcement learning on a generative language model enables scalable mRNA design
2025-11-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1345
PMID:41416521
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研究论文 | 该文章构建了首个基于生成式语言模型的mRNA设计工具codonGPT，并利用强化学习在多种生物约束下优化mRNA序列 | 首次将强化学习与生成式语言模型结合用于mRNA设计，提出了推理时掩码方法，并训练了首个仅基于mRNA序列的生成式语言模型 | 未明确说明模型泛化能力、计算资源需求以及实验验证的局限性 | 实现可扩展的mRNA设计，用于治疗、合成生物学和蛋白质工程 | mRNA序列，具体基因包括HLA-A、ACTB，以及GFP、β-内酰胺酶、促红细胞生成素等报告基因 | 机器学习 | NA | NA | 生成式语言模型，强化学习 | 文本（mRNA序列） | 338,417条来自模式生物的mRNA序列 | NA | NA | NA | 医学，合成生物学，工业生物技术 |
| 63 | 2026-09-20 |
Cellulase secretion by engineered Pseudomonas putida enables growth on cellulose oligomers
2025-Nov-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13617-9
PMID:41291027
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研究论文 | 该研究将纤维素酶分泌到工程化恶臭假单胞菌的培养上清液中，使其能够以纤维三糖或纤维四糖作为唯一碳源和能源生长 | 鉴定了适用于恶臭假单胞菌的优选双精氨酸转运分泌信号肽，并证明了大型多结构域酶能够功能性分泌到培养上清液中以支持纤维素寡糖的胞外降解和利用 | 目前仅验证了以纤维三糖或纤维四糖等纤维素寡糖为碳源的生长，尚未证明能够直接在聚合纤维素或复杂木质纤维素原料上生长，且适用于革兰氏阴性菌的分子工具仍然有限 | 工程化恶臭假单胞菌使其能够分泌非天然酶以降解胞外聚合物，从而实现从纤维素类原料进行化学合成 | 恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida），纤维素酶（外切纤维素酶和内切纤维素酶），纤维素寡糖（纤维三糖和纤维四糖） | 合成生物学 | NA | 蛋白质分泌工程，双精氨酸转运（Tat）途径信号肽筛选 | NA | NA | NA | NA | 恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida） | NA | 工业生物技术，能源，环境 |
| 64 | 2026-09-20 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.688514
PMID:41332601
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研究论文 | 开发了一种磁光基因电路，通过生物发光和磁刺激在哺乳动物细胞中微创控制基因表达 | 结合生物发光和磁敏感蛋白，构建了首个同时由光和磁刺激激活的完全遗传编码的光遗传学电路 | 仅使用50mT磁刺激，未进行体内实验，磁敏感蛋白的拆分重建效率可能有限 | 实现对哺乳动物细胞中基因表达的微创控制，解决光遗传学系统中光传递效率低的问题 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 光遗传学，生物发光，磁遗传学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 光遗传学基因电路，由光敏转录因子和磁敏感蛋白驱动的荧光素酶拆分重建组成 | 医学 |
| 65 | 2026-09-20 |
MULTIMODAL CELL CONTEXT INSTRUCTION TUNING FOR CONDITIONAL DNA REGULATORY SEQUENCE GENERATION WITH LARGE LANGUAGE MODELS
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084625
PMID:41426347
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研究论文 | 提出Leonine框架，将增强子序列设计重新定义为多模态问答任务，利用大语言模型整合DNA序列、启动子、基因表达谱和细胞类型信息，生成细胞类型特异性的调控序列 | 首次将增强子序列设计重新定义为细胞上下文中的多模态问答任务，整合多模态细胞数据（启动子序列、基因表达谱、细胞类型信息）来优化增强子序列，并构建了超过150万个细胞类型特异性启动子-增强子对的大规模数据集和评估基准 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 设计生物学上合理的调控序列（如增强子），实现细胞类型特异性的多转录因子招募以有效激活转录 | 增强子序列、启动子序列、基因表达谱、细胞类型信息 | 自然语言处理, 合成生物学, 基因调控 | NA | 大语言模型, 多模态学习 | 大语言模型（LLM） | DNA序列, 文本, 基因表达谱 | 超过150万个细胞类型特异性启动子-增强子对，涵盖7种细胞类型 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 66 | 2026-09-19 |
Synthetic bacterium-facilitated colonization of nitrogen-fixing bacteria for remodeling the rhizosphere microbiome and improving plant yield
2025-11-29, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02189-5
PMID:41318663
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研究论文 | 该研究通过基因工程改造合成细菌EcCMC表达表面展示的多糖识别蛋白Cmc，以增强固氮菌在豆科植物根部的定殖，从而重塑根际微生物组并提高植物产量 | 首次利用合成生物学方法，通过工程化细菌表达表面展示的多糖识别蛋白来增强固氮菌的根部定殖，进而调控根际微生物组以促进植物生长 | 研究仅在两种豆科植物中验证，未在其他作物或田间大规模试验中验证其广适性和长期生态安全性 | 探究合成细菌EcCMC是否能够提高固氮菌在豆科植物根部的定殖效率，并评估其对根际微生物组、生化指标和植物产量的影响 | 紫云英（Astragalus sinicus）和紫花苜蓿（Medicago sativa）及其根际微生物组 | 合成生物学 | NA | 16S rRNA基因扩增子测序、代谢组学分析、遗传工程 | NA | 序列数据、代谢物数据、生化指标数据 | 3个处理组，每组3个重复（n=3） | NA | 大肠杆菌（E. coli） | 表达表面展示的人工多糖识别蛋白Cmc的工程化细菌 | 农业 |
| 67 | 2026-09-19 |
A membrane-driven biochemical oscillator tunable by the volume to surface area ratio
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688573
PMID:41292784
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研究论文 | 本文提出并建模了一种基于膜磷脂浓度动态变化驱动蛋白质在膜上结合与解离的质量守恒生化振荡器，其振荡受体积与表面积比（V/A）调控 | 利用膜磷脂浓度变化和维度降低实现振荡，振荡可被体积与表面积比调控，且不依赖蛋白质翻译后修饰，可与自组装三聚体耦合影响三聚体产量 | 研究主要基于计算模拟，缺乏实验验证；振荡所需的酶动力学设计规则在低V/A时较为严格 | 设计并建模一种膜定位生化振荡器，探索其可调控性和潜在应用 | 膜驱动的生化振荡器系统，包含膜磷脂和受其调控的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 质量作用反应动力学建模、反应-扩散模拟、随机模拟 | 确定性模型、随机模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 膜定位生化振荡器、自组装三聚体耦合 | 医学、工业生物技术 |
| 68 | 2026-09-19 |
Engineered natural killer cells for cancer therapy
2025-Nov-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.09.013
PMID:41135520
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综述 | 该综述总结了早期临床试验中CAR-NK细胞疗法的安全性和疗效，并讨论了合成生物学和基因编辑方法以增强NK细胞功能，以及高通量发现平台识别可操作基因靶点，为设计多工程化CAR-NK细胞克服实体瘤挑战提供路径 | 整合了早期临床试验结果、合成生物学和基因编辑技术、高通量发现平台，提出多工程化CAR-NK细胞的设计路径以克服实体瘤挑战 | 未涉及具体实验数据或原始研究，主要基于现有文献的总结和展望 | 总结NK细胞免疫疗法的临床进展，探讨工程化改造策略以提升NK细胞效力并拓展至实体瘤治疗 | NK细胞、CAR-NK细胞、肿瘤患者 | 癌症免疫治疗 | 淋巴恶性肿瘤、实体瘤 | 嵌合抗原受体（CAR）、基因编辑、合成生物学、高通量发现平台 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类NK细胞 | 嵌合抗原受体（CAR） | 医学 |
| 69 | 2026-09-19 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
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研究论文 | 本文介绍了一个名为PIONEER的模块化平台，用于在酵母周质空间展示肽、蛋白质和纳米抗体，以实现对遗传编码的蛋白质调节剂的功能筛选 | PIONEER平台通过优化分泌信号和展示支架，实现了稳定的配体保留和稳健的自分泌信号传导，能够通过信号传导而非仅结合来评估配体活性，实现了功能优先的筛选 | 目前仅在人类G蛋白偶联受体上进行了验证，尚未在其他膜蛋白或可溶性蛋白靶点上广泛测试 | 开发一个基于合成生物学的周质展示平台，用于筛选和研究遗传编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体、人类G蛋白偶联受体 | 合成生物学 | NA | 周质展示 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学 |
| 70 | 2026-09-19 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
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研究论文 | 该文章介绍了一种合成多色抗原稳定化纳米抗体平台（VIS-Fbs），可在450 nm至660 nm可见光谱范围内实现无背景荧光成像，用于细胞内蛋白追踪、多抗原检测及功能成像 | 通过将二十多种荧光蛋白和生物传感器工程化到八种纳米抗体中，建立了通用型VIS-Fbs设计，仅在与同源抗原结合时才发出明亮荧光，并实现了组成型、光激活和光转换荧光蛋白及基于荧光蛋白的生物传感器的整合 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发一种合成多色抗原稳定化纳米抗体平台，用于交叉标记和功能成像，以实现对蛋白质动态、细胞过程及复杂生物系统的高特异性、低背景研究 | 纳米抗体、荧光蛋白、生物传感器、小鼠脑组织、斑马鱼胚胎、β-catenin蛋白、Wnt/β-catenin信号通路 | 合成生物学、荧光成像、细胞生物学 | NA | 荧光蛋白工程、纳米抗体工程、生物传感器构建、荧光成像、光激活、光转换 | NA | 图像 | NA | NA | 小鼠、斑马鱼 | 抗原稳定化荧光纳米抗体（VIS-Fbs），包含组成型、光激活和光转换荧光蛋白，以及基于荧光蛋白的生物传感器 | 医学、基础生物学研究 |
| 71 | 2026-09-19 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究方法论文 | 该方案描述了通过敲除minD基因并利用差异离心、过滤和药物处理从植物乳杆菌中生成和纯化无核小细胞的方法 | 首次在益生菌植物乳杆菌中建立小细胞生产平台，拓展了小细胞技术 beyond 传统模型细菌 | 仅通过显微镜和流式细胞术验证了小细胞的纯度，未进行体内递送实验验证其功能 | 建立从植物乳杆菌中生成和纯化小细胞的标准化方案，为治疗剂递送提供新平台 | 植物乳杆菌（Lactiplantibacillus plantarum）小细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心、过滤、DAPI染色、显微镜、流式细胞术 | NA | 图像、流式细胞数据 | NA | 质粒介导的同源重组 | 植物乳杆菌 | NA | 医学 |
| 72 | 2026-09-19 |
Recent advances in the Design-Build-Test-Learn (DBTL) cycle for systems metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501021
PMID:40195836
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综述 | 本文综述了谷氨酸棒杆菌在系统代谢工程中基于设计-构建-测试-学习（DBTL）循环的最新进展，重点关注L-赖氨酸衍生的C5平台化学品 | 系统总结了DBTL循环框架下谷氨酸棒杆菌从传统代谢工程到先进系统代谢工程的多种策略进展，并聚焦于C5平台化学品的生物合成 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，可能缺乏对具体技术细节的深入分析 | 总结谷氨酸棒杆菌系统代谢工程中DBTL循环的应用进展，特别是C5平台化学品的生物合成 | 谷氨酸棒杆菌及其代谢工程改造策略 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 谷氨酸棒杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 73 | 2026-09-19 |
Synthetic biology strategies for sustainable bioplastic production by yeasts
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501022
PMID:40195837
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略改造酵母细胞工厂（酿酒酵母和解脂耶氏酵母）以可持续生产生物塑料（如聚乳酸、聚羟基脂肪酸酯和聚己二酸/对苯二甲酸丁二酯）的研究进展 | 系统总结了在基因、通路和细胞系统水平上整合新遗传元件、代谢工程、蛋白质工程、适应性进化以及计算工具和机器学习到设计-构建-测试-学习循环中的最新策略，以提升酵母菌株效率和产量 | 在提高菌株鲁棒性和扩大工业规模生产过程方面仍存在挑战 | 探讨利用合成生物学方法开发酵母细胞工厂以生产关键可生物降解塑料，推动可持续和可扩展的生物塑料生产 | 酵母细胞工厂，特别是酿酒酵母和解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，蛋白质工程，适应性进化，机器学习 | NA | 文本 | NA | NA | 酿酒酵母，解脂耶氏酵母 | 代谢通路 | 材料，工业生物技术 |
| 74 | 2026-09-19 |
Untranslated region engineering strategies for gene overexpression, fine-tuning, and dynamic regulation
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501033
PMID:40195839
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综述 | 本文综述了利用mRNA非翻译区（UTR）工程策略优化细菌基因表达的研究进展，涵盖增强蛋白表达、精细调控和动态调控等方面 | 系统整合了UTR工程在基因过表达、精细调控和动态调控中的最新策略，提出了模块化调控框架 | 综述主要聚焦于细菌系统，对其他宿主如真核生物或哺乳动物细胞的UTR工程讨论有限 | 总结UTR工程策略用于细菌基因表达优化，包括蛋白过表达、代谢途径精细调控和动态基因调控 | 细菌基因表达中的mRNA非翻译区（UTR），包括AU富集元件、RG4结构、合成双UTR、ProQC系统、UTR文库、合成终止子、核糖开关和toehold开关 | 合成生物学 | NA | UTR工程，包括AU富集元件、RG4结构、合成双UTR、ProQC系统、UTR文库、合成终止子、核糖开关、toehold开关 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 核糖开关和toehold开关用于动态基因调控 | 医学，工业生物技术 |
| 75 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2026-09-18 |
A comprehensive review of genomic-scale genetic engineering as a strategy to improve bacterial productivity
2025-11, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001628
PMID:41182907
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综述 | 本文综述了细菌基因组工程工具从随机诱变到CRISPR/Cas等精准多重编辑策略的演进，及其在提升细菌生产力中的应用。 | 针对该领域缺乏统一概述的问题，整合历史里程碑与实际应用，提供基因组工程工具演进与前景的全面视角。 | 未提及具体实验验证或数据，属于文献综述，缺乏原始实验数据支持。 | 总结基因组规模遗传工程工具在细菌中的发展历程与应用，以提升细菌生产力。 | 细菌基因组工程工具及其在细菌生产中的应用。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术 |
| 77 | 2026-09-18 |
From Nano to Quantum: Ethics Through a Lens of Continuity
2025-10-13, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-025-00557-w
PMID:41082020
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研究论文 | 本文通过连续性视角，借鉴纳米技术伦理讨论的经验教训，分析和指导量子技术伦理话语的塑造 | 提出使用连续性视角，将纳米伦理讨论中的关键特征作为分析工具，用于评估和分析新兴的量子技术伦理话语，避免重复过去的错误 | 文章主要基于理论分析和文献回顾，缺乏实证数据支持，且未提供具体的量子技术伦理框架或操作指南 | 探讨如何借鉴纳米技术伦理讨论的经验，指导量子技术伦理和负责任创新的早期话语发展 | 纳米技术和量子技术的伦理讨论话语 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 78 | 2026-09-18 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 该文提出foldtuning方法，利用蛋白质语言模型生成远离天然序列的蛋白质变体，构建了覆盖700多个天然折叠的模型库，并通过实验验证了三个不同折叠靶标的稳定性与功能。 | 提出foldtuning方法，将蛋白质语言模型重新定义为探索蛋白质“深空”区域的探针，通过生成和自反馈机制，在强制核心结构约束下，探索与天然示例同源性极低或没有可检测同源性的序列空间，并构建了覆盖700多个天然折叠的模型库。 | 摘要中未明确提及研究局限性，可能包括实验验证仅针对三个折叠靶标，且对生成蛋白的功能验证范围有限。 | 探索蛋白质序列-结构映射中未被探索的区域，超越定向进化等金标准实验方法的限制，研究远离天然序列的蛋白质序列空间。 | 蛋白质序列-结构映射、蛋白质语言模型、SCOP数据库中的700多个天然折叠，包括GPCR、小GTP酶、细胞表面受体、DNA结合域、信号/调节域等。 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型、foldtuning、生成与自反馈 | 蛋白质语言模型 | 蛋白质序列与结构数据 | 覆盖SCOP数据库中超过700个天然折叠，实验验证了三个折叠靶标：SH3结构域、barnase抑制剂barstar和胰岛素 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 79 | 2026-09-18 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 本文介绍了STRAIGHT-IN Dual平台，能够在一周内以100%效率同时将两个DNA有效载荷单拷贝整合到人类诱导多能干细胞中 | 实现了双DNA有效载荷的同时、等位基因特异性、单拷贝整合，效率达到100%，且在一周内完成；利用STRAIGHT-IN平台实现近乎无疤痕的货物整合，便于组件回收利用；设计了grazoprevir诱导的synZiFTR系统，可与四环素诱导系统互补，在同一细胞内独立、可调、时序控制不同转录因子的表达 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种高效、快速的双DNA有效载荷和基因电路整合平台，用于人类诱导多能干细胞的精确基因工程 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 合成生物学 | NA | STRAIGHT-IN Dual平台、synZiFTR系统 | NA | NA | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人类诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导的synZiFTR系统 | 医学、工业生物技术 |
| 80 | 2026-09-18 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究在微藻中开发了一种利用GP1糖蛋白的PPSPX基序将蛋白质锚定在细胞壁上，并通过pH敏感内含肽实现可控释放的双系统 | 首次鉴定出GP1糖蛋白中的PPSPX基序是细胞壁锚定的关键信号，并创新性地结合pH敏感内含肽实现了蛋白质的时空可控释放 | 摘要中未明确说明该系统的局限性 | 开发一种在微藻中实现蛋白质细胞壁锚定和可控释放的双系统，以优化蛋白质定位和环境触发释放 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统，包括GP1糖蛋白、PHL7塑料降解酶、mCherry荧光蛋白和RecA来源的pH敏感内含肽 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学分析、Western blot分析 | NA | 蛋白质表达与释放数据、荧光数据、Western blot图像 | NA | 内含肽介导的蛋白质剪接 | 微藻 | GP1-PPSPX锚定系统与pH敏感内含肽切割释放系统组合 | 医学、环境、工业生物技术 |