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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-03-28 |
Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials
2025-Mar-27, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502199
PMID:40143682
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研究论文 | 该研究首次利用外电细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶,为工程化活材料(ELMs)的开发奠定了基础 | 首次在活细菌环境中开发DNA水凝胶,并利用SpyCatcher/SpyTag技术实现外源聚合酶的细胞表面锚定 | 研究仅使用了Shewanella oneidensis一种细菌,未探索其他微生物系统的适用性 | 开发具有导电性和代谢活性的动态生物混合材料系统 | 外电细菌Shewanella oneidensis和DNA水凝胶 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag技术 | NA | NA | NA |
62 | 2025-03-28 |
Orthogonal Host-Guest Interactions Enable Programming of Protocell Membranes for Cellular High-Order Assembly and Enhanced Immunogenicity
2025-Mar-26, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c20476
PMID:40067075
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研究论文 | 本文提出了一种通过正交主客体相互作用编程原生细胞膜的方法,用于细胞高阶组装和增强免疫原性 | 利用β-环糊精(β-CD)作为宿主实体,通过主客体相互作用在微囊膜上对接功能分子,实现了细胞样膜表面的可编程性 | 未提及该方法在大规模生产中的可行性和成本效益 | 开发一种可编程的治疗性原生细胞平台,模拟真实的细胞间相互作用 | 多糖基微囊(P-somes)和巨噬细胞 | 合成生物学与生物工程 | NA | 主客体相互作用 | NA | NA | NA |
63 | 2025-03-28 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 该研究通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆调控 | 目前仅验证了丙酮酸代谢信号的特异性响应,未测试其他代谢物的广泛适用性 | 开发具有生命体感知和适应能力的合成生物材料 | 基于PdhR阻遏蛋白的合成细胞器系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | 生物分子相互作用数据 | NA |
64 | 2025-03-28 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究建立了一种适用于Cupriavidus necator H16的lambda Red重组系统,结合电穿孔技术,实现了高效快速的基因删除和稳定基因组整合 | 首次在线性PCR产物上应用lambda Red重组系统,并开发了高效的标记回收方法 | 研究仅验证了三个基因组位点的修改,未进行大规模应用测试 | 开发高效的基因组编辑方法以优化Cupriavidus necator H16的生产菌株 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组系统、电穿孔技术、Cre/loxP系统 | NA | 基因组数据 | 三个不同的基因组位点 |
65 | 2025-03-28 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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研究论文 | 本文探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来开发新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计,提高活性、特异性和降低免疫原性 | 未提及具体实验验证数据或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具以促进临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | 合成生物学 | NA | AI/ML模型预测、定向进化 | 机器学习模型(未指定具体架构) | 生物分子数据 | NA |
66 | 2025-03-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力,特别是在ALOX5基因中外显子跳跃和异构体转换的应用 | 提出了一种新型核糖开关控制剪接的概念,能够将5-LO野生型转换为缺乏外显子13的异构体(5-LOΔ13),并通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应提高了调控的动态范围 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型,且非适应性构建体的引入可能导致基因开关功能的意外结果 | 探索合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过选择性剪接调控基因表达的潜力及其优化策略 | ALOX5基因和HEK293细胞 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控 | NA | 基因表达数据 | NA |
67 | 2025-03-28 |
Outlook on Synthetic Biology-Driven Hydrogen Production: Lessons from Algal Photosynthesis Applied to Cyanobacteria
2025-Mar-20, Energy & fuels : an American Chemical Society journal
IF:5.2Q1
DOI:10.1021/acs.energyfuels.4c04772
PMID:40134520
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综述 | 本文探讨了合成生物学驱动的氢生产前景,借鉴了藻类光合作用的经验应用于蓝藻 | 利用合成生物学技术精确调控PSII活性,避免传统营养剥夺方法的副作用,优化氢生产效率 | NA | 开发可持续的清洁能源生产方法,推动碳中和未来 | 蓝藻(特别是PCC 6803菌株) | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
68 | 2025-03-28 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Mar-06, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 本文开发并验证了一种RT-qPCR方法,用于测量依赖于环境的核酶活性,通过引入寡核苷酸抑制核酶活性来提高测量的准确性 | 提出了一种新的RT-qPCR方法,通过抑制核酶活性来准确测量依赖于环境的核酶活性 | 该方法在RNA提取和反转录过程中可能诱导核酶切割,导致活性测量不准确 | 验证新的核酶序列和基于核酶的生物技术 | 自切割核酶 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR | NA | RNA | 一组已知在体外具有环境依赖性切割的自切割RNA |
69 | 2025-03-27 |
Introduction: Synthetic Biology
2025-Mar-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00158
PMID:40134283
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
70 | 2025-03-27 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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research paper | 该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 揭示了酒精依赖性半萜途径中第一个酶PhoN的广泛特异性,以及芳香族异戊二烯基转移酶的宽泛底物特异性,成功在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | NA | 拓展异戊二烯类化合物的化学空间,推动合成生物学发展 | 酒精依赖性半萜途径及其相关酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成 | NA | NA | NA |
71 | 2025-03-27 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Mar-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
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research paper | 该研究提出了一种控制去膜化膜化凝聚微滴的策略,以增强其功能性和动态重构能力 | 通过静电竞争触发去膜化过程,实现了凝聚微滴结构的可控重构,并开发了具有层次和非对称膜结构的凝聚微滴原细胞 | 研究未涉及该技术在复杂生物环境中的应用效果评估 | 开发具有动态和多样化结构的凝聚微滴原细胞,以扩展其在合成生物学和生物技术中的应用 | 膜化和去膜化凝聚微滴 | 合成生物学 | NA | 静电竞争触发去膜化 | NA | NA | NA |
72 | 2025-03-27 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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research paper | 该研究提出了一种高效的无疤痕体外组装方法,用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 开发了一种基于Gibson等温组装的迭代体外组装方法,能够无疤痕地组装复杂且高度重复的百kb级IGHV基因片段 | 未提及该方法在其他类型基因组片段组装中的适用性 | 开发大规模人类基因组片段的高效体外组装技术 | 人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | 百kb级的IGHV基因片段 |
73 | 2025-03-27 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Mar-24, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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综述 | 本文综述了聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)在废物管理中的作用及其研究进展 | 提供了关于PHBDs的全面更新,包括其胞外和胞内形式的结构、功能及其在生物降解PHB废物中的潜在应用 | 未涉及PHBDs在实际废物处理中的大规模应用案例研究 | 探讨PHBDs在生物可降解塑料废物管理中的应用潜力 | 聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)及其产生微生物 | 环境生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
74 | 2025-03-26 |
Synthetic biology approaches to improve Rubisco carboxylation efficiency in C3 Plants: Direct and Indirect Strategies
2025-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154470
PMID:40056853
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在提高C3植物中Rubisco羧化效率方面的直接和间接策略 | 介绍了最新的合成生物学和基因转化技术,以及通过工程化Rubisco亚基、修饰Rubisco相互作用蛋白和调整Rubisco环境等方法来优化Rubisco羧化效率 | NA | 提高C3植物中Rubisco的羧化效率,以改善光合作用性能 | C3植物中的Rubisco酶 | 合成生物学 | NA | 基因转化技术 | NA | NA | NA |
75 | 2025-03-26 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-Mar-25, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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research paper | 该研究通过基因组测序分析了极度濒危的橙腹鹦鹉在历史和当代样本中的遗传多样性丧失情况 | 首次使用长读长参考基因组和历史样本追踪该物种的长期基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降 | 样本量相对较小(历史样本16个,当代样本19个) | 评估橙腹鹦鹉的遗传多样性丧失情况及其对物种生存的影响 | 橙腹鹦鹉(Neophema chrysogaster) | 基因组学 | 病毒/细菌/真菌感染 | 长读长基因组测序、重测序 | NA | 基因组数据 | 历史样本16个(最早1829年),当代样本19个 |
76 | 2025-03-26 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-Mar-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 介绍了一款名为ProteoSeeker的命令行工具,用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释 | ProteoSeeker通过自动化关键步骤,降低了计算复杂性,使专业和非专业用户都能进行高效且全面的宏基因组分析 | 未提及具体的技术限制或性能瓶颈 | 加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新 | 微生物群落中的蛋白质 | 生物信息学 | NA | 宏基因组学 | NA | 宏基因组数据 | NA |
77 | 2025-03-26 |
Reprogramming Komagataella phaffii for a Robust Chassis toward Efficient De Novo Biosynthesis of (-)-α-Bisabolol
2025-Mar-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11904
PMID:40131269
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研究论文 | 本研究通过优化MVA途径和融合法尼基二磷酸合酶与比沙波醇合酶,成功在Komagataella phaffii中实现了高效生产(-)-α-比沙波醇 | 通过工程化辅因子NADPH、分子伴侣和转录因子,构建了强健的(-)-α-比沙波醇生产菌株KB-30,并在5 L补料分批发酵罐中实现了32.8 g/L的最高产量 | 未明确提及研究的局限性 | 开发一种高效、可持续的微生物细胞工厂生产(-)-α-比沙波醇 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、代谢工程 | NA | NA | 5 L补料分批发酵罐 |
78 | 2025-03-26 |
A novel MoClo-mediated intron insertion system facilitates enhanced transgene expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1544873
PMID:40123955
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研究论文 | 本文介绍了一种新型的MoClo介导的内含子插入系统,用于增强莱茵衣藻中转基因的表达 | 开发了一种与当前MoClo标准兼容的新型内含子插入策略,显著提高了转基因在莱茵衣藻中的表达效率 | NA | 提高莱茵衣藻中转基因的表达效率,推动藻类生物技术的发展 | 莱茵衣藻 | 合成生物学 | NA | Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA |
79 | 2025-03-25 |
Remediation of wastewater by using CdS-based biohybrids: Challenges and enhancement strategies
2025-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132379
PMID:40064454
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review | 本文综述了基于CdS的光催化剂-微生物生物杂化系统在废水修复中的应用、机制及优化策略 | 整合了全细胞生物催化剂和半导体纳米材料的优势,实现重金属离子回收、提高修复效率及同步去除复合污染物 | 未具体提及现有系统的实际应用限制或性能瓶颈 | 探讨CdS基生物杂化系统在废水污染物同步去除中的潜力与优化方向 | 含重金属和有机化合物的废水污染物 | 环境工程 | NA | CdS基光催化-微生物杂化技术 | NA | NA | NA |
80 | 2025-03-25 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
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research paper | 提出了一种名为KD-FRET的方法,用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的解离常数(K) | 开发了KD-FRET方法,首次实现了在活细菌细胞中直接定量测量PPIs的解离常数,并解决了传统方法中因光谱串扰导致的假阳性信号问题 | 未提及该方法在其他类型细胞(如真核细胞)中的适用性 | 开发一种在活细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用强度的新方法 | 活大肠杆菌细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET) | NA | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多种异源和同源蛋白质对 |