合成生物学相关文章
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当前共找到 1564 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-05 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
|
综述 | 探讨肿瘤内微生物群（特别是胞内细菌）在肿瘤演进中的作用及其在癌症治疗中的应用前景 | 系统阐述胞内细菌在肿瘤进展中的新机制，并提出基于合成生物学和工程化药物递送系统的靶向治疗新策略 | NA | 解析肿瘤内微生物群在癌症发生发展中的作用机制并探索其治疗应用 | 肿瘤内微生物群（特别是胞内细菌）及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 癌症 | 二代测序、生物信息学分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 782 | 2025-10-05 |
Protein design of two-component tubular assemblies similar to cytoskeletons
2025-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62076-3
PMID:40695817
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研究论文 | 开发了一种受自然启发的蛋白质设计方法，利用两种不同蛋白质单元构建类似细胞骨架的动态管状结构 | 首次实现了两种不同蛋白质单元在精心设计条件下组装成具有动态柔性的管状结构，能够响应环境刺激可逆组装 | NA | 探索蛋白质高级结构组装的设计原理，模拟天然细胞骨架系统的动态行为 | 两种不同蛋白质单元及其组装形成的管状结构 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜 | NA | 结构图像数据 | NA | 蛋白质理性设计 | NA | 仿肌动蛋白丝和微管的管状组装结构 | 材料科学, 合成生物学 |
| 783 | 2025-10-05 |
Identification of cognate recombination directionality factors for large serine recombinases by virtual pulldown
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf691
PMID:40701553
|
研究论文 | 本研究利用AlphaFold2-multimer预测并实验验证了大丝氨酸重组酶的匹配重组方向性因子 | 首次使用AlphaFold2-multimer系统性地预测RDFs，成功识别了超过半数测试重组酶的潜在RDFs | RDFs缺乏序列保守性且与噬菌体整合酶基因缺乏同线性，增加了识别难度 | 开发识别大丝氨酸重组酶匹配重组方向性因子的计算方法 | 98个大丝氨酸重组酶及其重组方向性因子 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2-multimer预测、实验验证 | AlphaFold2-multimer | 蛋白质序列和结构数据 | 98个大丝氨酸重组酶测试集，其中9个作为测试案例 | 大丝氨酸重组酶系统 | NA | 整合型重组系统（噬菌体或移动元件插入模拟） | 合成生物学、基因组编辑 |
| 784 | 2025-10-05 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
|
研究论文 | 本研究开发了基因'保质期'电路来控制合成细菌的寿命，用于安全的环境修复应用 | 设计了可调节寿命的前馈激活网络电路，结合合成小调控RNA和基于asd的营养缺陷系统，实现了细菌程序化自毁 | NA | 开发合成细菌的生物安全控制策略，确保其在环境应用中的安全部署 | 工程化大肠杆菌及其基因调控电路 | 合成生物学 | NA | 基因电路设计、合成生物学工程 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 前馈激活网络、细胞裂解电路、营养缺陷系统 | 环境 |
| 785 | 2025-10-05 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
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研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现完整的合成生物学计算系统，采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译，支持权重更新为负值 | NA | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA | NA | NA | 包含计算训练组件、测试组件和学习算法的DNA杂交反应电路 | 生物计算 |
| 786 | 2025-10-05 |
Development of precise genome editing and multi-copy integration tools in Hansenula polymorpha DL-1
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.009
PMID:40735059
|
研究论文 | 开发了针对多形汉逊酵母DL-1菌株的精确基因组编辑和多拷贝整合工具包 | 建立了高效CRISPR-Cas9基因组编辑系统，部分抑制NHEJ通路增强同源重组效率，鉴定了36个中性位点用于单拷贝整合，开发了靶向rDNA和Ty元件的多拷贝整合工具 | NA | 解决多形汉逊酵母DL-1菌株因强NHEJ机制和有限遗传工具而受限的代谢工程问题 | 多形汉逊酵母DL-1菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑，同源重组，多拷贝整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Hansenula polymorpha DL-1 | 代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 787 | 2025-10-05 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-Jul-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 本研究开发了一种通过光响应DNA液滴动态调控酶级联途径的新方法 | 利用偶氮苯修饰的Y型DNA序列构建光响应液滴，首次实现了通过光控相分离动态调控酶级联反应 | 仅验证了两种酶级联系统，需要进一步测试更复杂的代谢途径 | 开发动态调控酶级联途径的新方法 | 酶级联反应系统（GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT） | 合成生物学 | NA | 液-液相分离，光控技术 | NA | 生化实验数据 | 两种酶级联系统 | DNA纳米技术 | NA | 光响应DNA液滴系统，酶隔离与释放机制 | 合成生物学, 生物工程, 微反应器设计 |
| 788 | 2025-10-05 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨计算生物学在癌症治疗中的应用，重点介绍从头设计蛋白质和多肽结合剂的方法与前景 | 整合计算设计、定向进化和人工智能技术，突破天然蛋白质支架限制，开发高特异性癌症靶向分子 | 计算工具（如Rosetta和AlphaFold）对无序区域和构象动力学的预测准确性仍存在局限 | 开发新型蛋白质和多肽结合剂以改善癌症精准治疗 | 从头设计的蛋白质和多肽结合剂（如DARPins、PD-1/PD-L1微型蛋白抑制剂） | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | 医学 |
| 789 | 2025-10-05 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜结构揭示了噬菌体蛋白gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的转录调控机制 | 首次解析了gp79通过N端侵入RNA通道取代σ4，并在遇到gp36时改变构象稳定RNAP-启动子开放复合物的分子机制 | NA | 阐明噬菌体phiEco32蛋白gp79同时抑制宿主转录和激活自身转录的双重调控机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79和gp36、同源启动子 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、结构分析、生化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 790 | 2025-10-05 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
|
研究论文 | 开发了一种基于机器学习的计算工具，用于从复制起点序列预测ColE1类质粒的拷贝数 | 首个能够从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件工具，强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 简化质粒拷贝数设计，重新定义质粒工程工作流程 | ColE1类质粒的复制起点序列 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | DNA序列数据 | NA | 质粒工程 | NA | 质粒复制起点设计 | 工业生物技术,医学 |
| 791 | 2025-10-05 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
|
综述 | 本文通过机器学习视角探讨细胞内的模式识别机制，分析人工神经网络与生物信号通路之间的相似性 | 将机器学习概念框架应用于生物学系统，提出信号通路和基因调控网络具有内在计算能力的新观点 | NA | 探索人工神经网络与生物信号通路在结构和功能上的相似性与差异 | 细胞信号通路、基因调控网络、人工神经网络 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 792 | 2025-10-05 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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研究论文 | 本研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器 | 首次将基因改造的巨大芽孢杆菌活细胞和孢子与CMOS芯片集成，创建可现场部署的砷检测传感器 | 作为概念验证研究，传感器在实际环境中的大规模应用仍需进一步验证 | 开发用于资源有限环境的实时砷检测技术 | 砷污染检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA | 合成生物学工具 | 巨大芽孢杆菌 | 砷生物传感器 | 环境 |
| 793 | 2025-10-05 |
High-Throughput 19F NMR Chiral Analysis for Screening and Directed Evolution of Imine Reductases
2025-Jul-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00498
PMID:40726787
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研究论文 | 开发了一种基于19F NMR的高通量手性分析方法，用于亚胺还原酶的筛选和定向进化 | 首次将19F NMR技术应用于高通量手性分析，能够同时评估对映选择性、立体偏好性和反应产率 | NA | 开发高效快速的手性分析方法以推动生物催化和合成生物学发展 | 亚胺还原酶及其在合成抗帕金森药物罗替戈汀中间体中的应用 | 合成生物学 | 帕金森病 | 19F NMR | NA | NMR光谱数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药 |
| 794 | 2025-10-05 |
Unraveling the Complexity of Plant Trichomes: Models, Mechanisms, and Bioengineering Strategies
2025-Jul-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26147008
PMID:40725255
|
综述 | 本文综述了植物表皮毛的发育、结构和功能研究进展，重点探讨腺毛在植物合成生物学中的应用潜力 | 整合分子机制与新兴技术，提出了利用表皮毛进行可持续农业和生物制造的前瞻性框架 | NA | 探讨植物表皮毛的发育机制及其在合成生物学中的应用策略 | 植物表皮毛，特别是关键物种的腺毛分泌毛(GSTs) | 植物合成生物学 | NA | 模块化基因工程、代谢通道策略 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 可持续农业,天然产物发现,生物制造 |
| 795 | 2025-10-05 |
The V5-Epitope Tag for Cell Engineering and Its Use in Immunohistochemistry and Quantitative Flow Cytometry
2025-Jul-20, Biology
DOI:10.3390/biology14070890
PMID:40723447
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研究论文 | 系统评估V5表位标签及其抗体在细胞工程中的应用，包括免疫组织化学和定量流式细胞术 | 首次系统评估鼠源和人源化抗V5标签抗体在不同实验条件下的性能，并优化免疫组织化学方法以减少非特异性信号 | V5标签信号受特定固定剂和分离试剂影响，可能限制其在某些实验条件下的应用 | 开发用于合成生物学应用的V5标签检测工具箱 | V5标签融合蛋白、鼠源和人源化抗V5抗体、体外和体内实验样本 | 合成生物学 | NA | 免疫组织化学、流式细胞术、抗体人源化 | NA | 组织样本图像、流式细胞数据 | 46种人类正常或癌组织样本 | 表位标签技术 | 哺乳动物细胞 | 异源融合蛋白组装 | 医学 |
| 796 | 2025-10-05 |
Natural CCD2 Variants and RNA Interference for Boosting Crocin Biosynthesis in Tomato
2025-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology14070850
PMID:40723408
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研究论文 | 本研究通过引入不同来源的CCD2酶等位基因和RNA干扰技术，成功提高了番茄中藏花素的生物合成水平 | 首次在番茄中同时表达藏红花和雄黄兰来源的CCD2等位基因，并结合RNA干扰技术调控类胡萝卜素代谢通路 | 研究仅针对番茄模型，未在其他作物中验证；转基因作物的生物安全性需要进一步评估 | 通过合成生物学方法提高番茄中藏花素的生物合成效率 | 番茄果实及其类胡萝卜素代谢途径 | 合成生物学 | NA | RNA干扰，基因工程，转基因技术 | NA | 生物化学数据，基因表达数据 | 转基因番茄植株 | RNA干扰，基因导入 | 番茄 | 藏花素生物合成途径，包括CCD2酶催化的玉米黄质转化为藏红花酸，以及后续的醛脱氢酶和葡萄糖基转移酶修饰步骤 | 农业，食品，医药 |
| 797 | 2025-10-05 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 探讨将化学人工智能与认知计算相结合用于生物通路预测分析的方法，特别关注内在无序蛋白 | 提出将化学人工智能与认知计算整合的新方法，利用内在无序蛋白特性构建更精确的生物过程计算模型 | 生物数据的复杂性和规模仍然是整合过程中的主要挑战 | 弥合生物过程与其计算模拟之间的差距，开发更精确的预测模型 | 内在无序蛋白、蛋白质相互作用、基因调控、代谢通路 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型、神经形态芯片 | 生物分子相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、药物发现、合成生物学、非常规计算 |
| 798 | 2025-10-05 |
Enhancing ELISA Sensitivity: From Surface Engineering to Synthetic Biology
2025-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios15070434
PMID:40710084
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综述 | 本综述系统总结了提升ELISA检测灵敏度的策略，重点介绍了合成生物学在改进传统免疫检测方法中的应用 | 强调无细胞合成生物学技术在ELISA灵敏度提升中的新兴作用，包括表达免疫分析、CRISPR联用免疫分析(CLISA)和T7 RNA聚合酶联用免疫传感分析(TLISA)等创新方法 | NA | 提升酶联免疫吸附测定(ELISA)的检测灵敏度，缩小与核酸检测方法之间的灵敏度差距 | 蛋白质生物标志物检测技术 | 合成生物学 | NA | ELISA, 无细胞合成生物学, CRISPR, T7 RNA聚合酶系统 | NA | NA | NA | CRISPR, T7 RNA聚合酶系统 | 无细胞系统 | 可编程核酸和蛋白质合成系统 | 医学诊断 |
| 799 | 2025-10-05 |
Core biological principles and tools stemming from basic Arabidopsis research
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf141
PMID:40479512
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综述 | 本文探讨拟南芥基础研究在免疫机制、基因组学、合成生物学和工具开发等领域的核心贡献 | 系统阐述拟南芥研究在跨物种生物学原理探索和技术工具开发中的桥梁作用 | NA | 总结拟南芥基础研究对生物学各领域的原理性贡献和工具开发 | 拟南芥及其衍生研究工具 | 植物生物学 | 弗里德赖希共济失调 | 泛基因组学、重复序列扩展分析、生长素诱导降解技术 | NA | NA | NA | NA | 拟南芥 | NA | 医学、生物技术 |
| 800 | 2025-10-05 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-Jun, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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系统综述 | 本文系统评估食用药用真菌作为天然抗抑郁候选物的潜力，重点分析其生物活性成分和作用机制 | 首次系统整合食用药用真菌通过多种神经生物学途径（神经递质系统、色氨酸-犬尿氨酸通路、HPA轴、神经炎症和肠脑轴）发挥抗抑郁作用的机制，并探讨3D食品打印和合成生物学等创新技术在抗抑郁功能食品开发中的应用 | 缺乏临床验证和标准化问题 | 探索食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及其营养学意义 | 食用药用真菌及其生物活性成分 | 营养学与神经科学交叉领域 | 抑郁症 | 系统综述方法、人工智能建模 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药, 食品 |