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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2025-10-05 |
A Review of DNA Restriction-Free Overlapping Sequence Cloning Techniques for Synthetic Biology
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70084
PMID:40713804
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综述 | 系统总结合成生物学中主要使用的无限制性酶重叠序列克隆技术及其发展与应用 | 首次系统比较各类RFOSC技术的效率、实用性和应用场景,提出方法选择应基于项目规模与需求的创新观点 | 未涉及传统限制性内切酶克隆方法的对比分析 | 评估合成生物学中DNA无酶克隆技术的发展现状与未来趋势 | 体外组装方法(Gibson Assembly、CPEC等)和体内重组方法(YHR、TAR等) | 合成生物学 | NA | DNA克隆技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, In-Fusion, LIC, SLIC, TEDA, YHR, IVA, TAR, PEDA | 酵母, 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 842 | 2025-10-05 |
Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review
2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04379-7
PMID:40555885
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综述 | 探讨色素产生链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成途径及生物技术应用 | 系统整合链霉菌色素研究的生态多样性、生物合成机制及CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默基因簇中的应用 | 存在毒理学评估不足、工业条件下色素稳定性问题、未探索菌株高通量筛选缺乏以及AI预测工具整合不充分等研究缺口 | 开发链霉菌天然色素作为合成色素的可持续替代品 | 色素产生链霉菌及其次级代谢产物 | 工业生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因编辑、发酵优化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 沉默生物合成基因簇激活 | 食品,制药,化妆品,纺织,环境 |
| 843 | 2025-10-05 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
|
研究论文 | 本研究鉴定并功能表征了苦楝中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶参与三萜类化合物生物合成 | 发现CYP88A108和CYP88A164具有双重功能,既能参与五环三萜合成也能参与柠檬苦素类合成,揭示了植物CYP88A P450s独特的催化多功能性 | NA | 阐明苦楝中五环三萜类化合物生物合成的酶学机制 | 苦楝(Melia azedarach L)中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征、系统发育重建、结构建模 | NA | 基因序列、蛋白质结构、酶活性数据 | NA | NA | 本氏烟(Nicotiana benthamiana)、酵母 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 844 | 2025-10-05 |
Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X2550051X
PMID:40626404
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综述 | 本文综述了2019-2024年间具有降压潜力的植物源天然产物及其通过信号通路改善高血压的作用机制 | 系统评估了70种具有降压活性的天然产物,并按黄酮类、萜类、生物碱和植物提取物进行分类,提出未来应优先研究兼具抗氧化/抗炎双重特性的天然产物 | 仅涵盖2019-2024年间的文献,未包括更早期的研究,且为综述性分析而非原始实验研究 | 评估植物源天然产物通过信号通路改善高血压的治疗潜力 | 70种植物源天然产物,包括20种黄酮类、24种萜类、17种生物碱和9种植物提取物 | 药理学 | 心血管疾病 | 文献检索分析 | NA | 文献数据 | 70种天然产物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 845 | 2025-10-05 |
Innovation in Swine Nutrition in China over the Past Decade
2025-Jun-24, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.06.009
PMID:40571101
|
综述 | 系统回顾中国过去十年在猪营养领域的研究进展与创新策略 | 首次系统总结中国现代化猪营养标准体系,提出低碳高效国际化生产模式及精准饲喂等针对性解决方案 | NA | 应对猪产业面临的饲料短缺、肉质下降、抗生素滥用等挑战,推动可持续畜牧业发展 | 猪营养标准、饲料质量控制、养殖环境管理 | NA | NA | 合成生物学、分子技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 846 | 2025-10-05 |
From consultors to collaborators - An SOP for advancing ethics engagement in science
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.006
PMID:40689230
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研究论文 | 提出一种结构化标准操作程序,用于系统地将伦理学融入科学研究过程 | 开发了分阶段的标准操作程序框架,将伦理学从外部咨询角色转变为科学探究核心的协作伙伴 | NA | 解决合成生物学等领域的伦理关切,促进伦理学在科学研究中的系统整合 | 早期职业研究人员和伦理学家 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 可持续性, 食品生产 |
| 847 | 2025-10-05 |
Construction and phenotypic classification of synthetic dual-pole Escherichia coli cells
2025-Jul-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08495-w
PMID:40684034
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研究论文 | 本研究构建了能够实现双极定位的合成大肠杆菌细胞,并开发了基于神经网络的表型分类方法 | 首次设计出能够在E. coli中实现两个不同支架蛋白在相对极定位的第二代合成遗传电路,并整合了PodJ片段和SpmX作为PopZ的直接嵌合体 | NA | 开发合成生物学工具包以实现可编程细胞分化 | 合成双极大肠杆菌细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、神经网络分类 | 神经网络 | 细胞图像 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | E. coli | 双极定位遗传电路,包含PodJ支架蛋白和PopZ-SpmX嵌合体 | 工业生物技术 |
| 848 | 2025-10-05 |
Quantum bioelectrochemical (QBIOL) software based on point stochastic processes
2025-Jul-19, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-025-01603-1
PMID:40683983
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研究论文 | 开发了基于点随机过程的量子生物电化学软件QBIOL,用于模拟生物电化学过程中的随机电子转移 | 首次整合分子动力学、应用数学、GPU编程和量子电荷传输,能够在皮秒到分钟时间尺度上模拟随机分子运动和电子转移 | NA | 解决当前模拟方法无法同时捕捉分子运动随机性和电子转移的问题 | 电极附着氧化还原标记DNA和纳米限制氧化还原物种产生的电流 | 计算生物学 | NA | 分子动力学、量子电荷传输、GPU编程 | 点随机过程模型 | 实验电流数据、电激励波形数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、医疗保健、催化、生物传感 |
| 849 | 2025-10-05 |
Engineering bi-directional chemically-modulated synthetic condensates for cellular control
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61877-w
PMID:40675979
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研究论文 | 开发了一种名为ARDrop的化学遗传平台,通过工程化雄激素受体及其药物实现生物分子凝聚物的可逆调控 | 首次利用雄激素受体和临床药物构建了能够双向化学调控合成凝聚物的平台,实现了凝聚物的形成与溶解的可逆控制 | 未明确说明该平台在所有蛋白质类型中的普适性及长期稳定性的具体数据 | 开发精确操控相分离凝聚物的工具,为合成生物学应用设计工程化凝聚物 | 雄激素受体(AR)及其配体药物,多种蛋白质的相分离行为 | 合成生物学 | NA | 理性工程方法,化学遗传平台 | NA | NA | NA | ARDrop平台 | 哺乳动物细胞 | 双向化学调控合成凝聚物系统,具有稳定液体样性质的相分离模块 | 医学, 合成生物学 |
| 850 | 2025-10-05 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计具有细胞类型特异性的人类合成增强子 | 采用迭代深度学习策略设计合成增强子,在两种人类细胞系中实现强差异活性,并通过单细胞水平验证增强子活性与转录因子表达的相关性 | NA | 解决合成生物学中如何实现细胞类型特异性基因表达靶向的重要问题 | 人类合成增强子序列 | 机器学习 | NA | 深度学习,染色质可及性分析,转录因子结合位点分析,扰动实验 | 深度学习模型 | 基因组序列数据,增强子活性测量数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 人类细胞系 | 合成增强子设计,具有细胞类型特异性调控功能 | 医学,合成生物学 |
| 851 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
|
综述 | 介绍合成生物学纳米医学的基本概念及其与传统和仿生纳米医学的区别,综述合成生物学在纳米医学中的应用进展 | 提出合成生物学纳米医学新概念,采用基因工程策略设计纳米药物,融合自上而下和自下而上两种策略 | NA | 探讨合成生物学与纳米医学的融合及其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 合成生物学纳米药物 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 852 | 2025-10-05 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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研究论文 | 开发了一种结合蓝细菌与纳米颗粒的活体生物治疗平台,用于增强癌症的光动力免疫治疗 | 首次将自供氧蓝细菌与多功能前药纳米颗粒结合,创建能够自供应纳米颗粒和氧气的活体纳米治疗剂 | NA | 开发新型癌症光动力免疫治疗平台 | 癌症治疗中的光动力免疫疗法 | 合成生物学与纳米医学 | 癌症 | 共价自组装策略、静电吸附、660nm激光照射 | NA | NA | NA | NA | 蓝细菌 | 自供氧系统与药物递送系统 | 医学 |
| 853 | 2025-10-05 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”概念在不同科学领域的含义、形式化及其在生命科学中的核心作用 | 跨学科视角整合数学、计算机科学到心理文化领域的代码研究,提出基于代码的统一生命理论框架 | 代码概念在不同学科中存在形式化程度差异,部分定义仍显模糊 | 构建跨学科代码研究的整体框架,探索生命系统中代码的通用理论 | 从细胞过程到文化实践的各类生物和社会系统中的代码现象 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 跨学科科学、合成生物学、人工智能 |
| 854 | 2025-10-05 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文系统评述了工程化蛋白质支架在癌症免疫治疗中的双重应用:治疗递送和肿瘤微环境分子成像 | 开发能够同时解决肿瘤穿透性不足和提供实时监测能力的多功能蛋白质支架平台 | 在将这些有前景的平台转化为临床应用方面仍面临持续挑战 | 开发用于癌症免疫治疗的多功能蛋白质支架平台 | 工程化蛋白质支架及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | 生成模型、强化学习 | 结构生物学数据、计算模型数据 | NA | 理性工程设计 | 重组表达系统 | 多功能蛋白质支架设计 | 医学 |
| 855 | 2025-10-05 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶的分子工程和生物技术进展及其工业应用 | 系统总结了多种酶工程策略(包括异源表达、CRISPR-Cas9、组学方法和纳米固定化)在提升β-葡萄糖苷酶性能方面的创新应用 | 未明确说明现有策略在工业放大过程中的具体实施障碍和成本效益分析 | 改善β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性以促进生物转化过程的工业应用 | β-葡萄糖苷酶及其工程化改造 | 工业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 使用里氏木霉Pcdna1启动子进行异源表达 | 能源, 食品, 医药 |
| 856 | 2025-10-05 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组水平鉴定了蛇根草中与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了三个Op10HGOs的酶活性 | 首次在蛇根草中全基因组鉴定15个10HGOs,并证实Op10HGO2和Op10HGO3在喜树碱生物合成中的关键作用 | 仅对三个Op10HGOs进行了酶活性验证,其他12个10HGOs的功能尚未明确 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为异源重建生物合成途径提供基因元件 | 蛇根草(Ophiorrhiza pumila)中的10-羟基香叶醇氧化还原酶 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行详细功能验证 | 转基因技术 | 蛇根草 | 喜树碱生物合成途径 | 医药 |
| 857 | 2025-10-05 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨利用非哺乳动物酶类作为延缓衰老和年龄相关疾病的潜在工具 | 提出利用异源物种酶类逆转年龄相关代谢变化的新策略,而非直接靶向自身基因 | NA | 探索通过代谢调控延缓衰老和年龄相关疾病的替代策略 | 来自低等生物的影响年龄相关代谢过程的酶类 | 合成生物学 | 老年疾病 | 酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 858 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 859 | 2025-10-05 |
Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential
2025-Jul, Archiv der Pharmazie
IF:4.3Q1
DOI:10.1002/ardp.70058
PMID:40685808
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综述 | 本文全面综述了香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的抗癌机制及临床潜力 | 系统阐述香豆雌酚衍生物通过调控多条信号通路抑制癌症的机制,并提出结合合成生物学、生物信息学和人工智能提升疗效的新方法 | 香豆雌酚类化合物存在生物利用度低、水溶性差、代谢快等临床应用挑战 | 探讨香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的机制及临床转化潜力 | 香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异秦皮啶和补骨脂定等香豆雌酚衍生物 | NA | 乳腺癌,卵巢癌,前列腺癌 | 合成生物学,生物信息学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 860 | 2025-10-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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研究论文 | 开发了一种无需淬灭剂的单染料标记方法用于监测G-四链体DNA的折叠与解折叠过程 | 首次实现了仅使用单染料标记(无需淬灭剂)的FRET类似格式来监测G-四链体结构转变 | NA | 开发低成本高通量监测G-四链体结构折叠转变的技术 | G-四链体形成DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | NA | NA | G-四链体结构 | 合成生物学 |