合成生物学相关文章
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当前共找到 1216 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Molecular Paleontology Meets Drug Discovery: The Case for De-extinct Antimicrobials
2025-Sep-23, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05530
PMID:41018632
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综述 | 探讨从灭绝生物中重建抗菌分子的新兴领域及其在药物开发中的应用 | 将古基因组学、古蛋白质组学与合成生物学相结合，从灭绝生物中重建抗菌分子 | 面临技术挑战和伦理考量 | 开发新型抗菌剂以应对抗生素耐药性问题 | 从灭绝生物中重建的生物活性肽、抗生素和其他生物活性剂 | 合成生物学 | 抗生素耐药性感染 | 高通量DNA测序, 质谱分析, 计算生物学, 古基因组学, 古蛋白质组学 | NA | 遗传序列, 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 82 | 2025-10-05 |
Synthetic antimicrobial peptides: Combatting antimicrobial resistance for sustainable aquaculture
2025-Sep-16, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108029
PMID:40967516
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综述 | 本文综述了合成抗菌肽在水产养殖中作为抗生素替代品的设计策略、计算工具应用及环境意义 | 整合合成生物学与计算建模方法设计具有增强稳定性、靶向抗菌活性的合成抗菌肽 | NA | 开发可持续水产养殖疾病控制的抗生素替代方案 | 合成抗菌肽及其设计策略 | 计算生物学 | 水产养殖疾病 | 机器学习、计算建模 | 机器学习 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 水产养殖, 环境 |
| 83 | 2025-10-06 |
Streamline automated biomedical discoveries with agentic bioinformatics
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf505
PMID:41016012
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综述 | 探讨基于大语言模型的智能代理在计算生物学中形成的代理生物信息学新领域的核心原理、方法和应用 | 提出将自主、自适应和智能代理系统应用于解决复杂生物问题的新型研究范式 | NA | 探索代理生物信息学在推动生物医学发现和临床应用的潜力 | 代理生物信息学系统及其在生物医学领域的应用 | 计算生物学 | NA | 大语言模型 | 智能代理系统 | 生物数据集 | NA | NA | NA | NA | 个性化医疗, 药物发现, 合成生物学 |
| 84 | 2025-10-05 |
Targeting the gut-liver axis in cholangiocarcinoma: mechanisms, therapeutic advances, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1646897
PMID:41018102
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综述 | 探讨肠道-肝脏轴在胆管癌发病机制中的作用及靶向该轴线的治疗进展 | 系统阐述肠道微生物失调、胆汁酸代谢紊乱与免疫微环境重塑在胆管癌中的协同作用机制 | 微生物群异质性和受体信号双重性等挑战尚未解决，临床转化需更深入机制研究和标准化方案 | 研究肠道-肝脏轴在胆管癌发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 胆管癌患者肠道/胆道微生物组、胆汁酸代谢通路及肿瘤免疫微环境 | 医学肿瘤学 | 胆管癌 | 多组学分析、人工智能 | NA | 临床数据、微生物组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 工程化微生物群 | NA | 医学 |
| 85 | 2025-10-05 |
Therapeutic potential of the gut commensal bacterium Parabacteroides goldsteinii in human health and disease treatment
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1618892
PMID:41019532
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综述 | 系统探讨肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的潜在应用价值 | 首次系统综述该菌株通过短链脂肪酸分泌、胆汁酸转化和免疫调节等多重机制对抗多种疾病的治疗潜力 | 面临培养条件优化、剂量效应表征和遗传工具开发等转化挑战 | 评估Parabacteroides goldsteinii作为益生菌在疾病治疗和健康促进中的应用前景 | 肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii及其与宿主互作机制 | 微生物组研究 | 代谢紊乱、神经系统疾病、炎症性疾病、恶性肿瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 86 | 2025-10-05 |
A fragment in the 5' untranslated region of alcohol oxidase 1 promoter significantly influencing gene expression of Komagataella phaffii
2025-Oct-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149745
PMID:40902693
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii的醇氧化酶1启动子5'非翻译区鉴定出一个13bp的负调控元件D3，敲除该片段可使异源蛋白表达提高3.5倍 | 首次在K. phaffii醇氧化酶1启动子5'UTR区鉴定出具有负调控功能的13bp顺式作用元件D3 | NA | 解析K. phaffii醇氧化酶1启动子调控机制并提高异源蛋白表达效率 | Komagataella phaffii醇氧化酶1启动子的5'非翻译区 | 合成生物学 | NA | 基因片段敲除、转录组分析、电泳迁移率变动分析、DNA pull-down、液相色谱-质谱联用 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | 基因敲除 | Komagataella phaffii | 启动子工程改造 | 工业生物技术 |
| 87 | 2025-10-05 |
A tool for modeling gene regulatory networks (GRN_modeler) and its applications to synthetic biology
2025-Sep-29, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00148-8
PMID:41023501
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研究论文 | 开发了一个用于基因调控网络建模和仿真的用户友好工具GRN_modeler，并展示了其在合成生物学中的应用 | 开发了具有图形用户界面的GRN_modeler工具，使无编程经验的用户能够创建现象学模型，同时支持命令行操作，并能分析动态行为和空间模式形成 | NA | 开发易用的基因调控网络建模工具以促进合成生物学研究 | 基因调控网络的建模与仿真 | 合成生物学 | NA | 基因调控网络建模与仿真 | 现象学模型 | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 新型振荡器家族、光检测生物传感器 | 合成生物学 |
| 88 | 2025-10-05 |
A Modular and Customizable CRISPR/Cas Toolkit for Epigenome Editing of Cis-regulatory Modules
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503917
PMID:41024337
|
研究论文 | 开发模块化CRISPR/Cas表观基因组编辑工具包用于顺式调控模块的表观遗传编辑 | 创建了基于dCas9的模块化表观基因组编辑平台(dCd和dCm)，可在植物和酵母中实现可编程的CRM活性解析与工程改造 | NA | 解析表观遗传标记对顺式调控模块功能的因果机制并开发表观基因组编辑工具 | 顺式调控元件(CREs)和顺式调控模块(CRMs) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas表观基因组编辑，DNA甲基化/去甲基化编辑 | NA | 表观遗传数据，基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物，酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 逻辑门控回路，光遗传学和温度敏感型抗CRISPR抑制器 | 合成生物学，农业 |
| 89 | 2025-10-05 |
Advances in Genetic Transformation of Lactic Acid Bacteria: Overcoming Barriers and Enhancing Plasmid Tools
2025-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189146
PMID:41009708
|
综述 | 综述乳酸菌遗传转化方法的最新进展及其在食品和益生菌生物技术中的应用 | 系统整合多种DNA导入方法，强调食品级策略和无标记工程技术的最新突破 | 存在菌株间变异性和宿主特异性障碍，仍需定制化解决方案 | 克服乳酸菌遗传转化障碍并增强质粒工具开发 | 乳酸菌(LAB) | 合成生物学 | NA | 自然感受态、电穿孔、接合、噬菌体介导转导、基因枪 | NA | NA | NA | 基因组编辑平台 | 乳酸菌 | 表达载体系统、染色体编辑、风味质地通路、食品级性状 | 食品, 工业生物技术 |
| 90 | 2025-10-05 |
Smart Phages: Leveraging Artificial Intelligence to Tackle Prosthetic Joint Infections
2025-Sep-19, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090949
PMID:41009927
|
综述 | 本文探讨如何利用人工智能和机器学习技术优化噬菌体疗法以应对假体关节感染 | 首次系统提出将人工智能与机器学习工具应用于噬菌体疗法开发，通过提升可扩展性、效率和精准度来克服传统疗法的局限性 | 未提供具体的实验验证数据，主要停留在概念探讨和应用前景分析层面 | 探索人工智能技术在噬菌体疗法研究和临床应用中的潜在价值 | 噬菌体疗法及其在假体关节感染治疗中的应用 | 机器学习 | 假体关节感染 | 基因组学、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 91 | 2025-10-05 |
Protein and Peptide in Cancer Research: From Biomarker to Biotherapeutics
2025-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17183031
PMID:41008874
|
综述 | 全面概述基于蛋白质和肽的癌症诊断与治疗策略的最新研究进展和技术发展 | 系统整合了蛋白质和肽在癌症诊疗中的多重应用，涵盖诊断标志物、治疗策略及新兴技术解决方案 | 肽类存在稳定性差、易被酶降解和递送效率低等局限性 | 探讨蛋白质和肽在精准癌症诊断与个性化治疗中的应用潜力 | 蛋白质、肽及其在癌症诊疗中的生物标志物和治疗剂 | 生物医学 | 癌症 | ELISA、质谱分析、CyTOF、合成生物学、计算设计、组学整合分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 92 | 2025-10-05 |
The Role of AI-Driven De Novo Protein Design in the Exploration of the Protein Functional Universe
2025-Sep-15, Biology
DOI:10.3390/biology14091268
PMID:41007412
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综述 | 本文系统综述了人工智能驱动的从头蛋白质设计在探索蛋白质功能宇宙中的作用、方法和应用 | 通过三种互补途径突破自然进化限制：探索新型折叠拓扑、从头设计功能位点、探索序列-结构-功能关系图谱 | 存在持续的技术挑战和限制 | 探索蛋白质功能宇宙并开发定制化生物分子 | 蛋白质序列、结构和功能 | 计算生物学 | NA | AI驱动的计算设计方法 | 先进计算框架 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗、催化、合成生物学 |
| 93 | 2025-10-05 |
Engineering Antioxidants with Pharmacological Applications: Biotechnological Perspectives
2025-Sep-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14091110
PMID:41009014
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综述 | 本文综述了通过生物技术方法生产抗氧化剂的最新进展及其在疾病治疗中的应用潜力 | 系统探讨了利用微生物细胞工厂、酶催化合成、植物细胞培养和代谢工程等生物技术方法生产抗氧化剂的创新策略 | NA | 探索生物技术在抗氧化剂生产中的潜力及其在疾病防治中的应用 | 生物技术生产的抗氧化剂，包括酶类和非酶类抗氧化分子 | 生物技术 | 恶性肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、衰老相关疾病 | 微生物发酵、酶催化合成、植物细胞培养、代谢工程、生物勘探、合成生物学 | NA | 临床前和临床研究数据 | NA | NA | 微生物细胞、植物细胞 | 代谢通路工程 | 医药 |
| 94 | 2025-10-05 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块通过调控抗氧化系统和冷信号通路增强植物耐寒性的分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐寒功能机制，并利用异源表达策略在拟南芥中验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证，尚未在小麦中直接验证该模块功能 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制，开发提高作物耐寒性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | 非疾病研究（植物胁迫生理） | 基因过表达、短串联靶标模拟技术(STTM)、异源表达 | NA | 基因表达数据、生理指标数据 | 转基因拟南芥株系（过表达和STTM植株）与野生型对照 | 基因编辑、合成生物学 | 拟南芥 | NA | 农业 |
| 95 | 2025-10-05 |
Synthetic Protein-Assisted Co-Assembly of Zeolitic Imidazolate Framework-8 and Novosphingobium capsulatum for Enhanced Saline-Alkali Resistance of Wheat
2025-Sep-09, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30183669
PMID:41011563
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研究论文 | 本研究构建了一种结合金属有机框架ZIF-8、合成多糖结合蛋白和甜菜碱的纳米载体，与益生菌共组装形成复合体系，显著增强小麦在盐碱胁迫下的抗性 | 首次通过合成蛋白介导的共组装策略将金属有机框架与益生菌结合，创建具有强根系结合能力的纳米-生物复合体系 | NA | 开发提高作物盐碱胁迫抗性的新型纳米-生物复合策略 | 小麦、Novosphingobium capsulatum益生菌、金属有机框架ZIF-8 | 合成生物学 | NA | 共组装技术、微生物组分析 | NA | 土壤理化数据、微生物组数据、植物生理指标 | NA | 合成蛋白设计 | Novosphingobium capsulatum | 多糖受体识别介导的蛋白质-ZIF-8-益生菌复合体系 | 农业 |
| 96 | 2025-10-05 |
Sustainable Production of Ginsenosides: Advances in Biosynthesis and Metabolic Engineering
2025-Sep-09, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182821
PMID:41011973
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综述 | 本文综述了人参皂苷生物合成与代谢工程的最新进展，重点介绍了可持续生产策略 | 系统整合了人参皂苷生物合成途径、合成生物学方法及工程化植物底盘的应用潜力 | NA | 探讨人参皂苷的可持续生产方法以克服传统种植的限制 | 人参皂苷及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 大肠杆菌 | 人参皂苷生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 97 | 2025-10-05 |
Review of the Arbitrium (ARM) System: Molecular Mechanisms, Ecological Impacts, and Applications in Phage-Host Communication
2025-Sep-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092058
PMID:41011390
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综述 | 本文系统综述了噬菌体仲裁系统(ARM)的分子机制、生态影响及其在噬菌体-宿主通讯中的应用潜力 | 首次系统整合了ARM系统在分子机制、生态影响和应用前景方面的最新研究进展 | ARM系统是相对较新的发现，相关研究仍处于早期阶段 | 解析噬菌体-宿主通讯机制及其在生物技术中的应用 | 噬菌体仲裁系统(ARM)及其分子机制 | 合成生物学 | NA | 群体感应样肽信号机制 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 仲裁通讯系统 | 医学,环境,工业生物技术 |
| 98 | 2025-10-05 |
Biofilms Exposed: Innovative Imaging and Therapeutic Platforms for Persistent Infections
2025-Aug-28, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090865
PMID:41009844
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综述 | 探讨生物膜持久性感染的分子机制、诊断治疗局限及新兴技术解决方案 | 整合超分辨率显微镜、微流控、AI建模与合成生物学技术，提出从反应性抗生素治疗转向精准生物膜管理的范式转变 | NA | 构建突破生物膜结构、重新定义感染治疗的综合性框架 | 临床和工业环境中的生物膜 | NA | 慢性感染 | 超分辨率显微镜, 微流控, AI建模, CRISPR-Cas, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | 工程化益生菌基因回路, 自我调节微生物群落 | 医学 |
| 99 | 2025-10-05 |
Untangling the Complexity of Two-Component Signal Transduction in Bacteria
2025-Aug-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092013
PMID:41011345
|
综述 | 本文探讨细菌双组分信号转导系统的非典型结构与调控机制 | 系统阐述非典型双组分系统的转录调控多样性、替代性反应调节蛋白活性及磷酸化控制机制 | 对非典型双组分系统的生理相关性及工程化潜力仍存在知识空白 | 解析细菌双组分信号转导系统的多样性及其在生物技术和医学中的应用潜力 | 细菌双组分信号转导系统（TCSs） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 细菌 | 双组分信号转导系统（包含组氨酸激酶和反应调节蛋白） | 生物技术, 医学 |
| 100 | 2025-10-05 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-06, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 探讨物理学与细胞生物化学的深度耦合如何揭示物质与生命界限的研究进展 | 整合过去十年实验与计算进展，聚焦空间组织和区室化对生命特征形成的作用 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建活细胞 | 探索物质与生命界限的本质特征 | 生物细胞及其物理化学特性 | 系统生物学与合成生物学 | NA | 全细胞建模与合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础科学研究 |