本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-02-21 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
|
研究论文 | 本文展示了如何将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚物界面结合,以控制液-液相分离隔室的性质 | 首次将细菌微区室壳蛋白与由内在无序域形成的蛋白质凝聚物界面结合,开发出可完全编码的涂层系统,用于控制凝聚物的表面性质和稳定性 | 涂层形成依赖于pH和蛋白质浓度,且一旦形成后不与稀相交换,可能限制了动态调控的灵活性 | 开发用于合成细胞和细胞器的可控液-液相分离隔室系统 | 细菌微区室壳蛋白(来自Haliangium ochraceum的BMC-H)与工程化RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、液-液相分离技术 | NA | NA | NA | 基因融合、蛋白质工程 | NA | 蛋白质涂层系统(BMC-H-T2变体在液滴表面形成稳定涂层,防止液滴合并) | 合成生物学、生物医学工程 |
| 82 | 2026-02-19 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
|
研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能,并首次在拟南芥中验证了该模块的调控机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制,并利用异源表达策略验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证,尚未在小麦本物种中完成完整功能验证 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制,开发增强作物耐冷性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)及转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | NA | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS和MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化指标数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥植株(具体数量未明确说明) | 转基因技术 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | tae-miR164-TaNAC6A基因调控模块 | 农业 |
| 83 | 2026-02-19 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
|
综述 | 本文综述了DNA纳米结构在刺激响应性药物递送和多模态生物传感方面的最新进展 | 系统分析了DNA纳米结构的模块化设计策略、稳定性改进(如PEG功能化)以及针对癌症特异性生物标志物的多配体靶向能力,并展望了与人工智能设计工具的未来整合 | 仍存在规模化制造瓶颈、免疫相容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等关键转化挑战 | 解决精准医学中靶向药物递送和生物医学成像的关键挑战 | DNA工程纳米结构(包括基于瓦片的组装体、折纸框架、球形核酸和刺激响应性水凝胶) | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术、FRET、电化学发光放大电路、SERS、细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应性药物递送系统、多模态生物传感器 | 医学 |
| 84 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
|
研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属(类)抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制,并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 85 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
|
研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合,用于生物通路预测分析,特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中,以模拟人类思维过程并增强决策,为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大,整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识,以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型,促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |
| 86 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
|
综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略,重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性,并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用,以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母(酿酒酵母) | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 87 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq,利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需,仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶,并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS)、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 88 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
|
综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展,重点探讨了其与宿主(细菌和真核细胞)的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证,且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主(包括哺乳动物组织)的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌(噬菌体天然宿主)、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 89 | 2026-02-14 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
|
研究论文 | 开发了一种名为IMPACT的新框架,通过聚合物介导的空间控制方法,实现CAR-T细胞在肿瘤微环境中的特异性激活 | 首次将合成生物学与生物材料方法结合,创建了聚合物介导的IF-THEN门控CAR-T细胞系统,实现解剖学水平的空间控制 | 目前仅在小鼠肿瘤模型中进行了验证,尚未在人体临床试验中测试 | 提高CAR-T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR-T细胞、肿瘤归巢聚合物、小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学方法、生物材料工程 | NA | 实验数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | T细胞 | IF-THEN门控电路:当工程化细胞与肿瘤定位聚合物结合(IF条件)后,驱动特定蛋白在肿瘤内选择性表达(THEN条件) | 医学 |
| 90 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
|
综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境,并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并推动临床转化 | 工程化微生物系统(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据(389篇同行评审研究) | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 91 | 2026-02-11 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
|
综述 | 本文综述了用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂的挑战、构建策略及最新技术,特别关注了理性与非理性策略的应用 | 聚焦于原核细胞工厂在芳香族氨基酸衍生化学品生产中的独特优势,系统总结了结合理性与非理性策略的构建方法,并探讨了该领域的未来潜在方向 | 本文是一篇综述,不包含原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 为生产芳香族氨基酸衍生化学品的专用细胞工厂的构建与优化提供有价值的见解和指导 | 用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核细胞 | NA | 工业生物技术 |
| 92 | 2026-02-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
|
研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并利用合成RNA调控器实现独立拷贝控制,展示了合成复制起点(SynORI)的模块化工程应用 | 开发了合成复制起点(SynORI)技术,实现了质粒拷贝数的可定制化、兼容性和模块化调控,并创建了正交质粒库 | NA | 研究合成生物学中质粒复制起点的工程化改造,以提高其可调性、兼容性和模块化 | 质粒的复制起点和合成RNA调控器 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控器技术 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | 大肠杆菌 | 合成复制起点(SynORI)和正交质粒库,用于实现可调拷贝数控制和环境信号的多重报告 | 工业生物技术 |
| 93 | 2026-02-10 |
Harnessing semiochemicals for parasitoid-based biological control: from laboratory identification to field applications
2025-Nov-30, Crop health
DOI:10.1007/s44297-025-00061-4
PMID:41649713
|
综述 | 本文综述了信息化学物质在调控寄生蜂行为中的作用,评估了行为操纵方法,并探讨了合成生物学与信息化学物质结合在可持续害虫管理中的潜力和局限性 | 通过合成生物学手段,利用植物和酵母的遗传与代谢工程释放关键信息化学物质,以操纵寄生蜂行为,这是生物防治领域的前沿创新点 | 合成生物学与信息化学物质结合的应用仍处于探索阶段,存在技术实施复杂性和生态安全性等潜在限制 | 研究信息化学物质在寄生蜂行为调控中的作用,并探索通过合成生物学手段增强生物防治效果的可持续害虫管理策略 | 寄生蜂(如Campoletis chlorideae)及其相关的信息化学物质(如性信息素、植物源协同素和寄主源利他素) | 农业生物技术 | NA | 气相色谱-触角电位检测(GC-EAD)、异位表达系统、遗传工程、代谢工程 | NA | 化学数据、行为数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 酵母 | 生物传感器、代谢途径 | 农业 |
| 94 | 2026-02-08 |
Cellulase secretion by engineered Pseudomonas putida enables growth on cellulose oligomers
2025-Nov-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13617-9
PMID:41291027
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造恶臭假单胞菌,使其分泌纤维素酶,从而能够利用纤维素寡聚物作为碳源生长 | 首次在恶臭假单胞菌中实现非天然纤维素酶的功能性分泌,并鉴定出高效的双精氨酸转运酶分泌信号肽 | 仅测试了纤维素寡聚物(纤维三糖和纤维四糖)作为碳源,未验证对完整纤维素聚合物的降解能力 | 开发恶臭假单胞菌作为合成生物学平台,用于从低品位原料进行化学合成 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 分子工程改造、酶分泌系统构建 | NA | NA | NA | 双精氨酸转运酶分泌系统 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 纤维素酶分泌通路 | 工业生物技术 |
| 95 | 2026-02-08 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
|
研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台,用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱,并训练机器学习模型预测基因回路行为 | 结合长读长和短读长NGS技术,首次实现对多kb长度基因回路设计(>10^5种)的并行定量评估,建立了“组成-功能”映射关系 | NA | 加速合成生物学中基因回路的设计与优化,建立数据驱动的复杂遗传系统设计方法 | 包含多种遗传元件组合的基因回路设计(5-20 kb长度) | 合成生物学 | NA | 长读长与短读长下一代测序(NGS) | 机器学习模型 | 测序数据 | 单次实验可测量超过10^5种基因回路设计 | NA | 人类细胞 | 基因回路(包含多种遗传元件组合) | 工业生物技术 |
| 96 | 2026-02-08 |
Advances in promoter engineering strategies for enhanced recombinant protein expression in plants
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1747353
PMID:41635682
|
综述 | 本文综述了针对植物系统、旨在增强重组蛋白表达的启动子工程策略的最新进展 | 重点介绍了利用CRISPR转录控制、高通量筛选和机器学习辅助启动子设计等新兴合成生物学工具,创建适用于复杂多基因表达的可调、正交启动子 | NA | 推进植物分子农业,扩展植物作为高价值重组蛋白多功能生物工厂的作用 | 用于植物系统的启动子(天然、合成、杂交、诱导型和组织特异性启动子) | 合成生物学 | NA | CRISPR转录控制,高通量筛选,机器学习辅助启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR | 植物,植物细胞培养物 | NA | 医药,工业生物技术,农业 |
| 97 | 2026-02-08 |
Engineered probiotics for inflammatory bowel disease therapy: mechanisms, delivery strategies, and precision medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1696524
PMID:41640410
|
综述 | 本文综述了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的应用,包括其作用机制、递送策略和精准医学前景 | 聚焦于工程化益生菌的设计,以克服传统益生菌在胃肠道环境中的存活、定植和靶向性不足等限制,并探讨了基于个体肠道微生物组谱的个性化干预 | 工程化益生菌在长期安全性、稳定性以及治疗反应准确预测方面仍面临关键挑战 | 探索工程化益生菌作为炎症性肠病治疗的新型替代方案 | 炎症性肠病,包括溃疡性结肠炎和克罗恩病 | NA | 炎症性肠病 | 基因工程、合成生物学、先进封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 98 | 2026-02-07 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
|
研究论文 | 本研究通过阐明NADPH依赖酶的电子转移机制,系统性地工程化酿酒酵母的电子转移过程,以高效生产胆固醇和孕烯醇酮 | 首次系统性地工程化电子转移链,包括DHCR7和P450酶的电子转移残基、电子转移组件以及NADPH再生途径,显著缩短并稳定电子转移链 | NA | 提高类固醇的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子转移工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 代谢途径工程,包括电子转移链和NADPH再生途径 | 医药,工业生物技术 |
| 99 | 2026-02-06 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
|
综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、作用机制及生物技术进展,重点讨论了其作为精神健康治疗候选药物的前景以及通过微生物平台实现规模化生产的生物技术策略 | 整合了裸盖菇素的临床研究、作用机制和生物技术生产进展,强调了利用工程化微生物(如酿酒酵母、构巢曲霉和大肠杆菌)进行异源表达以提高产量(达2000 mg/L)的创新方法 | NA | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力、作用机制及通过生物技术实现可持续规模化生产的途径 | 裸盖菇素(一种来自裸盖菇属蘑菇的色胺衍生生物碱)及其生物合成 | NA | 精神健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 100 | 2026-02-06 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
|
综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、靶向甲基化或去甲基化的主要技术,以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 系统总结了利用融合蛋白(如锌指蛋白、TALE或CRISPR/dCas9与甲基化酶结合)实现靶向甲基化的新兴技术,并展望了通过鉴定更多细菌甲基化酶特性来开发新工具的潜力 | NA | 探讨细菌DNA甲基化酶作为分子和合成生物学工具的最新发展与应用 | 细菌DNA甲基化酶及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 靶向甲基化技术、DNA组装技术 | NA | NA | NA | CRISPR/dCas9, TALEN, 锌指蛋白 | 细菌, 作物植物 | NA | 遗传工程, 细菌学, 生物技术, 农业 |