合成生物学相关文章
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当前共找到 1525 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-01-24 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 本文介绍了一种通过具有3'-突出端的引物对进行高效定点诱变的优化方法 | 利用部分互补且具有3'-突出端的引物对设计，显著提高了诱变效率并降低了错误率 | NA | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | NA | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 82 | 2026-01-24 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动力学和转运机制 | 首次通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证来确认预测的突变效果 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，为工程化改造提供原子层面的见解 | 蓝藻的碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学与计算生物学 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | BicA二聚体的模拟数据（超过1毫秒） | NA | 蓝藻 | NA | 能源、粮食生产、气候变化应对 |
| 83 | 2026-01-23 |
Editorial: Synthetic biology and metabolomics: novel insight in oncology research
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1768397
PMID:41568228
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2026-01-20 |
Editorial: Synthetic biology approaches for biocatalytic production of value-added chemicals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1755163
PMID:41550373
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2026-01-19 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
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研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的高效自复制DNA折纸二聚体系统，用于研究达尔文进化并应用于纳米技术 | 使用热稳定T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤，实现更快的循环时间和高达200万倍的扩增效率，并引入竞争机制以模拟达尔文式进化 | 未明确提及系统在复杂生物环境中的稳定性或长期演化潜力 | 研究人工自复制系统的竞争与灭绝机制，并探索其在生物相容性应用中的潜力 | DNA折纸二聚体自复制系统 | 合成生物学 | NA | 酶促连接（使用T4 DNA连接酶），DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 自复制DNA折纸二聚体系统，可结合其他酶如RNA聚合酶实现反馈调节 | 合成生物学，智能材料 |
| 86 | 2026-01-17 |
Rewiring central metabolism in Komagataella phaffii for efficient mannose synthesis
2025-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02886-8
PMID:41366679
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，优化其中心代谢途径，实现了高效甘露糖合成 | 采用双碳源系统（甘油用于生物质生成，葡萄糖用于甘露糖合成），通过敲除和下调关键基因（如pfk2、pfk1、zwf1）来重定向碳通量，并过表达大肠杆菌来源的磷酸酶基因yniC以促进甘露糖生物合成，最终在发酵中达到约121.1 g/L的甘露糖产量，创下微生物发酵的最高纪录 | NA | 通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，实现高效甘露糖生产 | Komagataella phaffii酵母及其甘露糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因敲除、基因下调、过表达、高细胞密度补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 甘露糖生物合成途径的重构，包括碳通量重定向至果糖-6-磷酸积累、抑制副产物生成 | 工业生物技术 |
| 87 | 2026-01-17 |
[A review of security, safety, and duality issues in the field of biology]
2025-Nov-18, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.188
PMID:41251134
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综述 | 本文综述了生物学领域中的安全、安保及双重用途问题，并评估了法国为限制这些风险所采取的措施 | 在当前生物研究繁荣和地缘政治不稳定的背景下，系统性地审视了生物风险，特别是结合合成生物学和测序技术发展带来的新挑战 | NA | 评估生物学研究中可接受的风险，平衡研究对健康、环境和生活质量的重要性与安全、安保及双重用途问题的考量 | 生物学研究中的安全、安保及双重用途问题，以及法国的风险管理措施 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2026-01-17 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 结合合成生物学和不确定性采样，通过多轮大规模平行报告基因检测迭代训练模型，解决了传统模型无法解释同一转录因子在不同背景下激活或抑制转录的问题 | NA | 开发能够区分具有相同序列但相反功能的CRX结合位点的调控DNA模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 大规模平行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 基因组中几乎所有结合的CRX位点 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 89 | 2026-01-16 |
Decoding necrosome assembly: harmonizing signal amplification and attenuation through optimal RIP3 stoichiometry
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67098-5
PMID:41436733
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研究论文 | 本研究通过定量STORM和数学建模揭示了坏死小体组装中RIP3与RIP1的最优化学计量比约为3:1，以调控坏死性凋亡的信号放大与衰减 | 首次定义了坏死小体中RIP3与RIP1的最优化学计量比，并发现过度RIP3寡聚化可作为内在尺寸控制机制来衰减信号 | NA | 探究坏死小体组装的时空规则及其在坏死性凋亡中的作用机制 | 坏死小体、RIP3、RIP1、MLKL、Caspase-8、c-FLIP | 分子生物学 | 神经退行性疾病、缺血性损伤、炎症性疾病 | 定量STORM、数学建模 | NA | 成像数据、数学模型 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 90 | 2026-01-16 |
Reconstituting transcription-translation-coupled DNA replication within complex in vitro biological systems
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67411-2
PMID:41398169
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研究论文 | 本研究开发了一种名为LoopReX的无细胞系统，利用大肠杆菌粗提物重建了转录-翻译耦合的DNA复制过程，为合成生命构建提供了新平台 | 首次使用粗提物而非纯化组分重建TTcDR，引入机器学习优化系统效率，并利用CipB介导的区室化形成人工核样结构 | 系统仍依赖外源添加的phi29和T7聚合酶，且长期稳定性和遗传保真度有待进一步验证 | 在人工系统中重建转录-翻译耦合的DNA复制过程以推进合成生命构建 | 无细胞转录翻译系统与DNA复制机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统构建、机器学习优化 | NA | 实验性能数据 | NA | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 转录-翻译耦合的DNA复制系统、人工核样区室化结构 | 合成生物学、生物技术、生物混合系统 |
| 91 | 2026-01-15 |
Molecular life sciences in the era of the Fourth Industrial Revolution: sequencing, multi-omics and artificial intelligence
2025-Dec-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20253019
PMID:41385245
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综述 | 本文探讨了第四次工业革命背景下，人工智能与多组学技术在分子生命科学中的整合应用及其未来发展趋势 | 综述了人工智能与低成本高通量测序在多组学领域的结合，实现了前所未有的数据解析速度 | NA | 概述人工智能如何整合到多组学研究中，并预测该领域未来的研究方向 | 分子生命科学中的多组学数据 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2026-01-15 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
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研究论文 | 本研究开发了一种群体感应控制的I型CRISPRi工具包，用于动态调控代谢通量，并在枯草芽孢杆菌中成功应用于D-泛酸和核黄素的生物合成 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰技术整合，创建了可响应细胞密度的动态基因调控工具包，并通过优化关键组件显著提升了调控效率 | 未明确说明该工具包在其他宿主微生物中的普适性，且大规模发酵应用可能面临工程菌株稳定性挑战 | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、群体感应系统、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应控制的基因调控回路，包含PhrQ/RapQ信号系统与CRISPRi的整合设计 | 工业生物技术 |
| 93 | 2026-01-15 |
Engineered bacteria as living therapeutics: Next-generation precision tools for health, industry, environment, and agriculture
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025042
PMID:41522435
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌作为活体疗法方面的最新进展，探讨了其在医疗、工业、环境和农业领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统、合成基因电路和模块化质粒架构，结合计算建模与机器学习，实现了对微生物行为的精细调控 | 存在遗传稳定性、生物安全性、临床与工业环境可重复性等挑战，伦理与监管框架仍需完善 | 探讨工程化细菌作为下一代精准工具在健康、工业、环境和农业领域的应用潜力 | 工程化细菌（活体疗法） | NA | NA | CRISPR-Cas系统、合成基因电路、模块化质粒架构 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 合成基因电路（如生物传感器、逻辑门等） | 医学, 工业, 环境, 农业 |
| 94 | 2026-01-14 |
Host Factors Promoting the LTR Retrotransposon Life Cycle in Plant Cells: Current Knowledge and Future Directions
2025-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010374
PMID:41516247
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综述 | 本文综述了植物细胞中促进LTR反转座子生命周期的主机因素，探讨了其与宿主过程的整合及未来研究方向 | 提出整合植物移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学和互作组学来阐明植物特异性机制 | 精确机制在植物中仍不明确，尤其是针对富含LTR反转座子的植物 | 探讨促进植物中LTR反转座子转座的主机蛋白质 | LTR反转座子及其与植物宿主细胞的相互作用 | 植物生物学 | NA | 移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学、互作组学 | NA | 文献分析 | NA | 基因组编辑 | 植物细胞 | NA | 农业 |
| 95 | 2026-01-14 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的通用策略，用于设计在小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子 | 首次将深度学习模型应用于哺乳动物活体组织的增强子设计，成功实现了在复杂调控环境下对组织特异性基因表达的程序化控制 | 研究仅在小鼠胚胎中验证了三种组织（心脏、肢体、中枢神经系统）的增强子功能，尚未扩展到更多组织类型或成年动物模型 | 开发能够预测和设计在哺乳动物活体组织中有效工作的组织特异性增强子的通用框架 | 小鼠胚胎的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 深度学习，全基因组染色质可及性分析，迁移学习 | 卷积神经网络（CNN） | 基因组序列数据，染色质可及性数据 | 使用了已验证的人类和小鼠增强子数据进行迁移学习，并设计了15个合成增强子在小鼠胚胎中进行测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性基因表达增强子 | 功能基因组学，合成生物学，基因治疗 |
| 96 | 2026-01-14 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66964-6
PMID:41422091
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的细胞游离基因表达工作流程，用于优化基于变构转录因子的生物传感器，以检测饮用水中的铅污染 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离工作流程，结合方向性标签训练模型，快速优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器，用于环境监测和人类健康中的铅污染检测 | 变构转录因子PbrR作为生物传感器，用于饮用水中的铅检测 | 合成生物学 | NA | 细胞游离基因表达、机器学习模型训练 | 机器学习模型（未指定具体类型） | 序列到功能数据 | NA | CRISPR-Cas9（隐含于定向进化中，但未明确指定），机器学习框架 | 细胞游离系统（无特定宿主生物） | 基于变构转录因子的生物传感器，用于铅检测 | 环境监测 |
| 97 | 2026-01-14 |
Cyanobacteria-Derived Extracellular Vesicles: A Novel Frontier in Drug Delivery and Therapeutics
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010004
PMID:41515885
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综述 | 本文综述了蓝藻来源的细胞外囊泡作为新型药物递送载体的潜力、优势、应用领域及面临的挑战 | 首次系统性地探讨蓝藻细胞外囊泡作为专用纳米载体平台的潜力，并与现有合成载体进行比较分析 | 蓝藻细胞外囊泡的大规模分离和表征仍存在挑战，其相对于现有系统的具体优势和局限性尚未被系统总结 | 探索蓝藻细胞外囊泡在药物递送和治疗应用中的潜力 | 蓝藻来源的细胞外囊泡 | NA | 癌症、神经退行性疾病、感染性疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 医药 |
| 98 | 2026-01-14 |
[Building on 40 Years, Now Pioneering the Future: Preface to the 40th Anniversary Issue of the Chinese Journal of Biotechnology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250804
PMID:41457585
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评论 | 本文是《中国生物技术杂志》创刊40周年特刊的序言，回顾了期刊的贡献并展望了未来 | 作为40周年特刊的序言，系统总结了期刊在推动中国生物技术创新与转化方面的历史作用 | NA | 纪念期刊创刊40周年，展示生物技术领域的最新进展并展望未来发展方向 | 《中国生物技术杂志》及其40周年特刊收录的40篇文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物制造、健康、能源、农业 |
| 99 | 2026-01-14 |
Artificial intelligence in biology and medicine
2025-Oct-17, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02029-4
PMID:41107683
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综述 | 本文探讨了人工智能在生物学和医学领域的角色、应用、未来趋势、挑战及伦理问题 | 系统性地综述了AI在生物学多个子领域（如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞与合成生物学）及医学领域（如诊断、疫苗开发、疾病治疗）的应用，并探讨了可解释AI、生物启发模型、以及AI与机器人学、纳米技术等先进技术的协同作用 | 分析了AI面临的局限与挑战，包括伦理与法律问题、数据质量问题以及标准化的需求 | 探讨人工智能在生物学和医学领域的应用潜力、未来发展方向及其带来的机遇与风险 | 人工智能技术及其在生物学（如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞生物学、合成生物学）和医学（如疾病诊断、疫苗开发、治疗，包括COVID-19）中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 100 | 2026-01-13 |
Overcoming the eIF2α Brake in Human Cell-Derived Translation Systems
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688697
PMID:41497621
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研究论文 | 本研究通过基因编辑和表达调控策略，克服了人源细胞无细胞翻译系统中由eIF2α磷酸化抑制的翻译瓶颈 | 系统探索了在可编辑和难编辑的人源细胞类型中，通过基因编辑eIF2α-S52A、敲除PKR激酶，以及利用piggyBac系统表达GADD34/K3L来绕过eIF2α磷酸化抑制的互补策略 | 基因编辑在某些细胞类型（如原代细胞）中不适用，表达策略可能引入额外的调控复杂性 | 提高人源细胞无细胞翻译系统的翻译效率和生产力 | 人源细胞无细胞翻译系统、eIF2α磷酸化调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、piggyBac转座子系统、Tet诱导表达系统 | NA | NA | Expi293F悬浮细胞、诱导多能干细胞（iPSCs）、原代人成纤维细胞、心肌细胞 | CRISPR-Cas9, piggyBac | 人源细胞（Expi293F, iPSCs, 原代成纤维细胞, 心肌细胞） | Tet诱导启动子控制的GADD34/K3L表达盒，用于调控eIF2α磷酸化状态 | 医学, 工业生物技术 |