合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-03-26	ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration 2025-Mar-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414877 PMID:40130725	研究论文	介绍了一款名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释	ProteoSeeker通过自动化关键步骤，降低了计算复杂性，使专业和非专业用户都能进行高效且全面的宏基因组分析	未提及具体的技术限制或性能瓶颈	加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新	微生物群落中的蛋白质	生物信息学	NA	宏基因组学	NA	宏基因组数据	NA
82	2025-03-26	Reprogramming Komagataella phaffii for a Robust Chassis toward Efficient De Novo Biosynthesis of (-)-α-Bisabolol 2025-Mar-25, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c11904 PMID:40131269	研究论文	本研究通过优化MVA途径和融合法尼基二磷酸合酶与比沙波醇合酶，成功在Komagataella phaffii中实现了高效生产(-)-α-比沙波醇	通过工程化辅因子NADPH、分子伴侣和转录因子，构建了强健的(-)-α-比沙波醇生产菌株KB-30，并在5 L补料分批发酵罐中实现了32.8 g/L的最高产量	未明确提及研究的局限性	开发一种高效、可持续的微生物细胞工厂生产(-)-α-比沙波醇	Komagataella phaffii菌株	合成生物学	NA	微生物发酵、代谢工程	NA	NA	5 L补料分批发酵罐
83	2025-03-26	A novel MoClo-mediated intron insertion system facilitates enhanced transgene expression in Chlamydomonas reinhardtii 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1544873 PMID:40123955	研究论文	本文介绍了一种新型的MoClo介导的内含子插入系统，用于增强莱茵衣藻中转基因的表达	开发了一种与当前MoClo标准兼容的新型内含子插入策略，显著提高了转基因在莱茵衣藻中的表达效率	NA	提高莱茵衣藻中转基因的表达效率，推动藻类生物技术的发展	莱茵衣藻	合成生物学	NA	Modular Cloning (MoClo)	NA	NA	NA
84	2025-03-25	Remediation of wastewater by using CdS-based biohybrids: Challenges and enhancement strategies 2025-Jun, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132379 PMID:40064454	review	本文综述了基于CdS的光催化剂-微生物生物杂化系统在废水修复中的应用、机制及优化策略	整合了全细胞生物催化剂和半导体纳米材料的优势，实现重金属离子回收、提高修复效率及同步去除复合污染物	未具体提及现有系统的实际应用限制或性能瓶颈	探讨CdS基生物杂化系统在废水污染物同步去除中的潜力与优化方向	含重金属和有机化合物的废水污染物	环境工程	NA	CdS基光催化-微生物杂化技术	NA	NA	NA
85	2025-03-25	Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells 2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414777 PMID:40125621	research paper	提出了一种名为KD-FRET的方法，用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的解离常数（K）	开发了KD-FRET方法，首次实现了在活细菌细胞中直接定量测量PPIs的解离常数，并解决了传统方法中因光谱串扰导致的假阳性信号问题	未提及该方法在其他类型细胞（如真核细胞）中的适用性	开发一种在活细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用强度的新方法	活大肠杆菌细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用	合成生物学	NA	荧光共振能量转移（FRET）	NA	荧光信号数据	未明确说明具体样本数量，但涉及多种异源和同源蛋白质对
86	2025-03-25	A mediator-free sonogenetic switch for therapeutic protein expression in mammalian cells 2025-Mar-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf191 PMID:40114374	研究论文	介绍了一种名为SUPER的新型基因开关，通过超声波在哺乳动物细胞中介导无、非侵入性且直接的蛋白质表达调控	开发了无需介质的超声波响应基因开关SUPER，利用哺乳动物ROS感应系统实现蛋白质表达的精确控制	目前仅在体外和小鼠模型中验证，尚未进行人体试验	开发一种非侵入性、时空精确的基因表达调控工具用于细胞和基因治疗	哺乳动物细胞（包括人类间充质干细胞系）和1型糖尿病小鼠模型	合成生物学	糖尿病	超声波刺激技术	KEAP1/NRF2信号通路模型	基因表达数据	多种细胞类型（包括hMSC-TERT细胞系）和1型糖尿病小鼠模型
87	2025-03-24	Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations 2025-Mar-19, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c17257 PMID:40036043	研究论文	本文展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性触发原子转移自由基反应，从而启动多种丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸单体的聚合反应	揭示了细菌细胞作为活体催化剂用于聚合物生产的未开发潜力，并展示了基于原子转移自由基聚合引发剂的细胞内聚合作为一种生物正交工具在细胞工程和合成生物学中的应用	NA	研究细菌细胞内自由基聚合反应的机制及其在细胞工程和合成生物学中的应用	细菌细胞	合成生物学	NA	核磁共振光谱、凝胶渗透色谱、荧光显微镜、流式细胞术	NA	化学数据、荧光数据	NA
88	2025-03-24	Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers 2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c15442 PMID:39902740	研究论文	本文介绍了一种名为IMPACT的新框架，通过合成生物学和生物材料方法实现CAR T细胞的空间控制激活	提出了IMPACT框架，通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR T细胞的肿瘤局部激活	目前仅在鼠类肿瘤模型中进行了验证，尚未在人类临床试验中应用	提高CAR T细胞疗法的特异性，减少脱靶毒性	CAR T细胞和肿瘤微环境中的聚合物	合成生物学	肿瘤	合成生物学和生物材料方法	IF-THEN门控CAR T细胞	实验数据	鼠类肿瘤模型
89	2025-03-23	Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli 2025-May-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005 PMID:39827984	研究论文	本文利用机器学习模型和特征重要性分析，发现了一种新化合物，可显著提高大肠杆菌中壳寡糖的产量	通过机器学习模型和特征重要性分析，发现了铁这一新化合物，可将壳寡糖产量提高两倍，并揭示了未来工程步骤的重要线索	尽管发现了铁对壳寡糖产量的提升作用，但具体机制仍需进一步研究	提高大肠杆菌中壳寡糖的产量	大肠杆菌中的壳寡糖合成途径	合成生物学	NA	机器学习	NA	代谢数据	大肠杆菌工程转录调节因子库
90	2025-03-23	Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii 2025-Mar-21, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70095 PMID:40116553	研究论文	本文开发了一种在Chlamydomonas reinhardtii中操纵倍性的策略，使用非干扰性抗生素选择标记，并通过流式细胞术精确测量不同倍性菌株的基因组大小	开发了一种新的倍性操纵策略，适用于野外分离株，扩展了合成生物学在C. reinhardtii中的应用	新形成的三倍体和四倍体显示出快速非整倍体化的迹象	研究倍性变化对植物进化的影响	Chlamydomonas reinhardtii	合成生物学	NA	流式细胞术	NA	基因组数据	北美野外分离株
91	2025-03-23	Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis 2025-Mar-21, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567 PMID:40116601	综述	本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展，包括生物信息学、实验和分析工具的发展，天然产物在细菌、真菌和植物中的异源表达，以及生物合成途径的工程策略	本文综合了合成生物学在天然产物生物合成中的多方面应用，特别是异源表达和生物合成途径工程的最新进展	本文主要关注合成生物学的应用，可能未涵盖传统天然产物研究的所有方面	探讨合成生物学在天然产物生物合成中的应用和发展	天然产物及其生物合成途径	合成生物学	NA	生物信息学、异源表达、组合生物合成	NA	NA	NA
92	2025-03-23	Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua 2025-Mar-21, Plant cell reports IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s00299-025-03471-4 PMID:40116969	研究论文	本文通过补充缺失的酶和优化黄酮6羟化酶，成功在青蒿中实现了异源合成灯盏花素	首次在青蒿中通过合成生物学方法成功合成灯盏花素，并优化关键酶以提高产量	研究未涉及灯盏花素在青蒿中的长期稳定性和大规模生产的可行性	通过合成生物学方法在青蒿中生产稀缺药物	青蒿和灯盏花素	合成生物学	脑血管疾病, 心血管疾病	合成生物学, 基因工程	NA	NA	NA
93	2025-03-23	Engineering highly active nuclease enzymes with machine learning and high-throughput screening 2025-Mar-19, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101236 PMID:40081373	研究论文	本文介绍了一种名为TeleProt的机器学习框架，该框架结合进化和实验数据来设计多样化的蛋白质库，并用于提高降解慢性伤口生物膜的核酸酶的催化活性	TeleProt框架在无需先验实验数据的情况下，能够设计出高性能的初始库，并在多轮高通量实验后，找到了比定向进化（DE）显著更好的顶级酶	NA	优化酶在新型化学环境中的功能，以提高其催化活性	核酸酶	机器学习	慢性伤口	高通量筛选	机器学习框架	基因型-表型酶活性数据	55,000种核酸酶变体
94	2025-03-23	Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery 2025-Mar-19, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d4cs01198h PMID:40104998	综述	本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用	探讨了无细胞合成生物学在天然产物生物合成中的创新应用，包括快速原型设计和新型抗菌剂的发现	讨论了无细胞合成生物学与全细胞和化学生产路线相比的优缺点	研究无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用	天然产物，包括核糖体肽、非核糖体肽、聚酮化合物和萜类化合物	合成生物学	NA	无细胞合成生物学	NA	NA	NA
95	2025-03-23	AI-driven high-throughput droplet screening of cell-free gene expression 2025-Mar-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58139-0 PMID:40108186	研究论文	本文介绍了一种名为DropAI的基于液滴和AI驱动的高通量筛选策略，用于优化无细胞基因表达系统	DropAI结合微流控技术和荧光颜色编码系统，实现了高通量、经济高效的化学组合筛选，并通过机器学习模型进行优化预测	研究主要基于大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的无细胞系统，尚未验证在其他生物系统中的适用性	优化无细胞基因表达系统的组成，降低成本并提高产量	无细胞基因表达系统	合成生物学	NA	微流控技术、荧光颜色编码系统、机器学习	机器学习模型	化学组合数据、荧光信号数据	12种不同蛋白质
96	2025-03-23	Bioengineered therapeutic systems for improving antitumor immunity 2025-Jan, National science review IF:16.3Q1 DOI:10.1093/nsr/nwae404 PMID:40114728	综述	本文综述了通过基因编辑、合成生物学和表面工程技术创建生物工程系统以增强免疫治疗的策略	提出了通过生物工程技术增强免疫治疗的新策略，包括导航和识别系统的改进、可控组件的引入、免疫调节组件的添加以及毒性因子的去除	生物工程系统的临床转化仍面临挑战，具体效果和安全性需进一步验证	提高抗肿瘤免疫治疗的疗效和安全性	细胞、细菌和病毒来源的治疗系统	生物工程	肿瘤	基因编辑、合成生物学、表面工程	NA	NA	NA
97	2025-03-22	MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00860 PMID:39976310	研究论文	本文介绍了一种名为MultiCRISPR-EGA的图形用户界面工具，该工具使用精英遗传算法（EGA）来设计优化的单启动子驱动的多路CRISPR引导RNA（gRNA）阵列	MultiCRISPR-EGA工具通过使用精英遗传算法（EGA）优化多路gRNA阵列设计，显著提高了CRISPR干扰（CRISPRi）应用的效率和特异性	工具的性能仅在计算实验中进行了验证，尚未在实际生物实验中进行广泛测试	优化多路CRISPR引导RNA（gRNA）阵列设计，以提高基因组编辑的效率和成本效益	多路CRISPR引导RNA（gRNA）阵列	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统	精英遗传算法（EGA）	基因目标数据	NA
98	2025-03-22	Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00840 PMID:39991792	研究论文	本文开发了在麦胚提取物中起作用的蛋白质响应性上调核糖开关（ON-核糖开关），用于创建多步基因调控级联	首次在真核细胞无细胞系统中构建了复杂的基因调控级联，并成功开发了高效的蛋白质响应性ON-核糖开关	初始设计的两种ON-核糖开关效率较低，且多步级联的切换效率受限于其中最差的一步	构建真核细胞无细胞系统中的复杂基因调控级联	蛋白质响应性ON-核糖开关及其在基因调控级联中的应用	合成生物学	NA	核糖开关技术	NA	基因表达数据	NA
99	2025-03-22	Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00844 PMID:40040244	review	本文讨论了CRISPR基因工具包在提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能方面的应用	介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的最新进展，包括基因编辑、转录调控和酶调节	未具体提及研究的局限性	提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能	枯草芽孢杆菌	合成生物学	NA	CRISPR	NA	NA	NA
100	2025-03-22	Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00799 PMID:40066730	综述	本文综述了合成生物学策略在高效生产天然色素及其非天然衍生物方面的最新进展	讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量和多样化生产非天然衍生物的策略	天然色素在市场上的商业化仍面临稳定性差、颜色谱有限和产量低等挑战	探索利用合成生物学方法高效生产天然色素及其非天然衍生物	天然色素及其非天然衍生物	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA