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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-10-05 |
Reprogramming Hairy Root Cultures: A Synthetic Biology Framework for Precision Metabolite Biosynthesis
2025-Jun-23, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14131928
PMID:40647937
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综述 | 探讨发根培养物在可持续生产植物源高价值化合物中的合成生物学框架与应用潜力 | 提出整合发根系统与转录组学、CRISPR技术等先进基因组工具的合成生物学框架,用于加速途径特异性代谢工程 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于文献综述提出理论框架 | 优化发根培养物规模化生产高价值植物源化合物 | 发根培养物及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 转录组学, CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物发根组织 | 代谢途径工程, 生物合成通路优化 | 工业生物技术, 制药, 农业 |
| 982 | 2025-10-05 |
Reviving the Dire Wolf? A Case Study in Welfare Ethics, Legal Gaps, and Ontological Ambiguity
2025-Jun-21, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15131839
PMID:40646738
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研究论文 | 通过基因编辑和克隆技术复活灭绝物种的案例研究,分析其涉及的动物福利、伦理问题和法律监管空白 | 首次使用五领域模型框架评估工程动物福利风险,并从多种伦理角度分析功能性灭绝复活项目 | 基于单个案例研究,缺乏长期观察数据,法律分析主要针对欧盟框架 | 评估基因工程复活灭绝物种项目的伦理正当性、动物福利风险和监管需求 | 基因改造犬科动物(表型类似灭绝的恐狼)、代孕母狼和可能受影响的生态系统动物 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、克隆技术 | 五领域模型框架 | 案例研究数据、伦理分析框架 | 3只基因改造犬科动物及相关代孕母体 | CRISPR-Cas9 | 灰狼细胞 | 功能性灭绝复活工程 | 生物技术 |
| 983 | 2025-10-05 |
Unveiling the Diversity of Culturable Microbes from the Underexplored Mingyong Glacier Landscape: A Roadmap for Leveraging the Potential of Actinomycetota
2025-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-025-01449-0
PMID:40655354
|
研究论文 | 本研究从明永冰川景观分离并表征了73株土壤放线菌,揭示了该极端环境中放线菌的多样性和生物技术潜力 | 首次系统探索明永冰川景观的放线菌多样性,发现多个放线菌目下的不同属,为新型生物活性化合物发现提供新资源 | 仅基于培养方法分离微生物,可能低估真实多样性;样本数量有限(6个样本) | 探索极端环境微生物多样性以发现新型生物活性化合物 | 明永冰川景观土壤中的放线菌 | 微生物学 | NA | 16S rRNA基因测序,微生物分离培养 | NA | 基因序列数据,微生物培养数据 | 6个土壤样本,73株放线菌分离株 | NA | NA | NA | 医药,生物技术 |
| 984 | 2025-10-05 |
Glycosyltransferases in human milk oligosaccharide synthesis: structural mechanisms and rational design
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103315
PMID:40347686
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综述 | 系统分析糖基转移酶在母乳寡糖合成中的结构机制与理性设计策略 | 整合结构生物学与深度学习算法实现糖基转移酶的理性设计与从头设计 | NA | 阐明糖基转移酶的结构机制并建立碳水化合物活性酶的精准工程框架 | 糖基转移酶及其在母乳寡糖生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 晶体学研究、深度学习算法 | NA | 结构生物学数据 | NA | 结构引导理性设计 | 微生物平台 | 酶催化乳糖糖基化途径 | 医药, 食品 |
| 985 | 2025-10-05 |
An artificial intelligence-based approach for identifying the proteins regulating liquid-liquid phase separation
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf313
PMID:40632496
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的方法来识别调控液液相分离的蛋白质 | 使用ESM2预训练蛋白质语言模型提取蛋白质序列语义信息,结合多层感知机分类器,在识别LLPS调控蛋白方面优于传统序列分析方法 | 数据集规模相对有限(913个阳性样本和6584个阴性样本) | 开发准确识别液液相分离调控蛋白的计算方法 | 调控液液相分离的蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型,多层感知机分类器 | ESM2_t36, MLP | 蛋白质序列 | 913个阳性蛋白质序列和6584个阴性蛋白质序列 | NA | NA | NA | 生物技术, 材料科学, 医学, 合成生物学 |
| 986 | 2025-10-05 |
High-yield bioproduction of virus-free virus-like P4-EKORhE multi-lysin transducing particles as an antimicrobial gene therapeutic
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1561443
PMID:40636261
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研究论文 | 构建生物工程化P4-EKORhE病毒样颗粒并开发高产率生产方法,用于递送基因编码抗菌剂 | 开发了极高产率(每毫升高达10个颗粒)的无病毒污染病毒样颗粒生产方法,并利用P4和P2噬菌体病毒学建立生物生产过程 | 仅在纯细菌培养物和与A549永生化人类上皮细胞共培养的噬菌体感染模型中测试了抗菌活性 | 建立高产率无病毒污染的病毒样颗粒生物生产过程,用于抗菌基因治疗 | P4-EKORhE病毒样颗粒和多溶菌素盒抗菌剂 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学、上下游工艺优化 | NA | NA | NA | NA | A549人类上皮细胞 | 多溶菌素盒抗菌基因电路 | 医学 |
| 987 | 2025-10-05 |
Cell-Penetrating Peptide-Based Triple Nanocomplex Enables Efficient Nuclear Gene Delivery in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29019
PMID:40342143
|
研究论文 | 开发了一种基于细胞穿透肽的三重纳米复合物系统,用于实现莱茵衣藻细胞核内基因的高效递送 | 整合细胞穿透肽(CPPs)、核定位信号(NLS)肽和质粒DNA的新型三重纳米复合物系统,能够有效穿透微藻厚细胞壁并实现核内定位 | NA | 开发高效的基因递送系统以推进微藻合成生物学应用 | 莱茵衣藻野生型细胞 | 合成生物学 | NA | 基因递送技术 | NA | 实验数据 | NA | 细胞穿透肽,核定位信号肽 | 莱茵衣藻 | 基因递送系统 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 988 | 2025-10-05 |
Research progress in high-throughput DNA synthesis and its applications
2025-Jul-10, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb00869g
PMID:40530447
|
综述 | 本文系统回顾了高通量DNA合成技术的发展历程、技术分类及其在多个领域的应用前景 | 首次以微阵列芯片合成技术为分界点对高通量DNA合成技术进行代际划分,并系统比较了三代技术的优劣 | 作为综述文章,主要基于现有文献分析,缺乏原始实验数据验证 | 探讨高通量DNA合成技术的发展现状、技术瓶颈及未来发展方向 | 高通量DNA合成技术及其应用 | 合成生物学 | NA | 光刻法、喷墨法、电化学法、温控合成技术、酶法合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生命科学, 医学 |
| 989 | 2025-10-05 |
Magnetic metal-organic frameworks as an antisense delivery platform and their performance in a cell-free protein expression system
2025-Jul-10, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00788g
PMID:40552643
|
研究论文 | 本研究开发了一种磁性金属有机框架作为反义寡核苷酸递送平台,并在无细胞蛋白表达系统中评估其性能 | 开发了具有磁铁矿核心和MIL-100(Fe)外壳的磁性nMOFs,证明其在降解时不抑制蛋白质翻译,并能通过远程磁场控制实现基因表达的精细调控 | 仅使用无细胞蛋白表达系统进行评估,未在完整细胞系统中验证毒性和效果 | 评估磁性金属有机框架作为基因调控递送平台的性能 | 磁性纳米金属有机框架(nMOFs)及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白表达系统(CFPS) | NA | 蛋白质表达数据 | NA | NA | 无细胞系统 | 基因表达调控系统 | 生物医学,合成生物学 |
| 990 | 2025-10-05 |
Data-driven synthetic microbes for sustainable future
2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00556-4
PMID:40624030
|
观点文章 | 提出数据驱动合成微生物(DDSM)作为应对环境危机的生物技术解决方案 | 整合组学、机器学习和系统生物学设计工程微生物的创新方法 | NA | 开发可持续且可扩展的生物技术解决方案应对环境挑战 | 工程微生物 | 合成生物学 | NA | 组学技术, 机器学习, 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 991 | 2025-10-05 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
|
综述 | 系统综述微生物合成麦角硫因的研究进展与发展前景 | 系统整合麦角硫因应用、代谢途径和微生物合成策略,展望未来研究方向 | NA | 提升麦角硫因生物合成效率以满足市场需求 | 麦角硫因的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | 麦角硫因代谢途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 992 | 2025-10-05 |
Molecular mechanisms and applications of natural transformation in bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1578813
PMID:40630188
|
综述 | 本文系统概述了细菌自然转化的分子机制及其在基因编辑中的应用 | 全面比较了革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的自然转化机制,并深入探讨了其在合成生物学中的新兴应用 | NA | 阐明细菌自然转化的基本原理以增强其生物技术应用 | 细菌自然转化过程及其分子机制 | 合成生物学 | NA | 自然转化 | NA | NA | NA | 自然转化 | 革兰氏阳性菌, 革兰氏阴性菌 | NA | 工业生物技术 |
| 993 | 2025-10-05 |
Magnesium-Free Assembly of Cationic Peptide/DNA Nanostructures with Defined Geometries for Anticancer Drug Delivery
2025-Jul-09, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c07816
PMID:40560802
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研究论文 | 本研究开发了一种无镁离子条件下通过阳离子肽组装DNA纳米结构的新方法,用于抗癌药物递送 | 采用RGD-TAT阳离子肽替代传统镁离子促进DNA纳米结构自组装,提高了结构稳定性和靶向递送效率 | 仅在免疫缺陷小鼠肿瘤模型中验证,缺乏其他动物模型验证 | 开发新型DNA纳米结构药物递送系统以提高抗癌治疗效果 | DNA纳米结构、阳离子肽、抗癌药物(多柔比星和KRAS siRNA) | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术、肽自组装 | NA | 实验数据 | 免疫缺陷小鼠肿瘤模型 | NA | NA | DNA纳米管结构 | 医药 |
| 994 | 2025-10-05 |
Application of Sensor Based on Circularly Permuted Fluorescent Protein in Molecular Biology, Metabolism, and Cellular Imaging
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70071
PMID:40630016
|
综述 | 本文综述了基于环状置换荧光蛋白的传感器在分子生物学、代谢和细胞成像中的应用 | 系统总结了环状置换荧光蛋白通过改变末端相对位置来增强环境信号敏感度的创新传感机制 | NA | 总结环状置换荧光蛋白传感器的形成机制、结构优化及生物医学应用 | 环状置换荧光蛋白及其传感器 | 分子生物学 | NA | 环状置换技术、荧光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学、合成生物学 |
| 995 | 2025-10-05 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
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研究论文 | 提出一种名为FoldMark的蛋白质结构生成模型水印策略,用于保护AI驱动的蛋白质研究安全 | 首个利用分布和进化原理的蛋白质生成模型水印策略,平衡水印容量和结构质量 | NA | 开发蛋白质生成模型的安全保护方法,防止恶意使用 | 蛋白质结构生成模型 | 计算生物学 | NA | 分布和进化水印技术 | AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA | 蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | 生物安全, 药物发现, 合成生物学 |
| 996 | 2025-10-05 |
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-04-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622
PMID:40117974
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研究论文 | 本研究通过体外实验系统探究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应 | 首次系统比较人类癌细胞、小鼠巨噬细胞和天然含叶绿体海蛞蝓细胞与叶绿体的相互作用模式 | 仅使用特定细胞系进行研究,未涵盖更广泛的动物细胞类型 | 探究动物细胞与叶绿体相互作用的机制及光诱导反应 | 人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓分离细胞 | 合成生物学 | NA | 体外细胞培养、叶绿体共孵育、光照射实验 | NA | 细胞行为观察、细胞死亡率、活性氧检测 | 三种不同类型细胞系(HeLa、J774.1、E. marginata分离细胞) | NA | 人类细胞, 小鼠细胞, 海蛞蝓细胞 | NA | 医学, 基础研究 |
| 997 | 2025-10-05 |
Scaling Up Postbiotics Production: A Prospective Review of Processes and Health Benefits
2025-Jul-07, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10643-x
PMID:40622649
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综述 | 本文综述了后生元的生产工艺优化工具及其健康益处,重点关注工业化放大面临的挑战 | 系统总结了后生元工业化生产的关键优化工具和合成生物学技术,指出高细胞密度与产量关联性的研究空白 | 后生元作用机制尚未完全阐明,工业化生产在稳定性、质量、产量和一致性方面仍存在挑战 | 探索后生元生产工艺优化和工业化放大策略 | 后生元(包括消化酶、短链脂肪酸、细胞壁成分等生物活性化合物) | 工业生物技术 | 心血管疾病 | Plackett-Burman设计、响应面方法、田口方法、中心复合设计、基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医药,食品 |
| 998 | 2025-10-05 |
Regulation of the tagatose catabolic gene cluster and development of a tagatose-inducible expression system in the probiotic Escherichia coli Nissle 1917
2025-Jul-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02771-4
PMID:40615889
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研究论文 | 在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中开发了一种基于D-塔格糖的可诱导基因表达系统 | 首次在EcN中发现并利用塔格糖代谢基因簇的调控机制,开发了具有剂量依赖性响应和分解代谢物阻遏自诱导功能的新型表达系统 | NA | 开发可靠的可诱导基因表达系统以扩展益生菌大肠杆菌Nissle 1917的应用潜力 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917的塔格糖代谢基因簇及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 差异RNA测序、序列分析 | NA | 基因序列数据、表达数据 | NA | iGEM | 大肠杆菌Nissle 1917 | 塔格糖诱导型表达系统、分解代谢物阻遏自诱导策略 | 医药, 工业生物技术 |
| 999 | 2025-10-05 |
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996
PMID:40032480
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综述 | 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸(DHA)的当前生物技术,涵盖菌株改良、发酵优化、产品提取和安全应用等方面 | 系统总结了裂殖壶菌DHA生产的多方面技术挑战,并提出整合多种育种技术、人工智能优化发酵、纳米颗粒包装改善稳定性等创新解决方案 | NA | 探索提高裂殖壶菌DHA生产效率和产品质量的技术方法,推动其在食品和健康领域的应用发展 | 产油海洋原生生物裂殖壶菌及其生产的二十二碳六烯酸(DHA) | 工业生物技术 | NA | 发酵技术、合成生物学、纳米颗粒包装技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 裂殖壶菌 | DHA合成途径、结构化脂质构建 | 食品,医药 |
| 1000 | 2025-10-05 |
Integrating incompatible tandem photobiocatalysis in artificial cells enables metabolic modulation of natural cells
2025-Jul-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu4828
PMID:40614183
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研究论文 | 本研究开发了具有光生物催化功能的人工细胞,通过空间分离不相容的催化模块实现对肝细胞代谢的调控 | 设计了包含纳米细胞器的光生物催化人工细胞,通过空间隔离光催化辅因子再生和生物催化酒精代谢这两个不相容模块 | NA | 开发能够持续供应辅因子并调控天然细胞代谢的人工细胞系统 | 光生物催化人工细胞和肝细胞 | 合成生物学 | 酒精性氧化应激 | 光催化、生物催化 | NA | NA | NA | NA | 人工细胞、肝细胞 | 包含两个空间隔离模块的纳米细胞器:光催化辅因子再生模块和生物催化酒精代谢模块,其中酒精脱氢酶和醛脱氢酶共定位在同一纳米细胞器中 | 医学, 合成生物学, 生物医学 |