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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-10-05 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-Mar, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文系统综述了玉米氮素吸收、同化和再利用的遗传与分子调控机制 | 整合了根系发育、微生物互作和氮信号转导等多维度机制,提出利用遗传多样性和合成生物学的综合研究策略 | NA | 提高玉米氮素利用效率以实现可持续农业 | 玉米 | 植物遗传学 | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 1002 | 2025-10-05 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本微型综述重点介绍了合成共凝聚液滴在模拟生物分子凝聚物方面的最新设计进展及其在生物医学领域的应用潜力 | 通过动态相分离控制构建具有细胞样特征的合成凝聚物,为细胞仿生建模和功能材料工程提供创新解决方案 | NA | 探索合成生物分子凝聚物的相分离控制机制及其在生物医学中的应用 | 合成共凝聚液滴及其仿生结构 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生凝聚物结构、活性共凝聚物工程 | 生物医学, 材料科学 |
| 1003 | 2025-10-05 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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研究论文 | 本研究揭示了丹参根中ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮从周皮细胞向外转运的机制 | 首次发现丹参酮可从周皮细胞转运至土壤环境,并鉴定出负责丹参酮IIA和丹参酮I外排的ABC转运蛋白SmABCG1 | NA | 探究植物二萜类化合物的转运机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根中的丹参酮转运过程 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达、基因敲除和过表达 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据、细胞定位数据 | 丹参毛状根培养体系 | CRISPR-Cas9 | 非洲爪蟾卵母细胞, 丹参毛状根 | NA | 代谢工程, 合成生物学 |
| 1004 | 2025-10-05 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
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综述 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控机制和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制,包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控,以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 阐明叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用前景 | 植物、藻类和光合细菌的叶绿素生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类, 光合细菌 | 叶绿素生物合成途径调控网络 | 农业, 合成生物学 |
| 1005 | 2025-10-05 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
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综述 | 本文综述了基于细菌孢子特性的工程生物材料最新进展及其未来发展挑战 | 利用细菌孢子的休眠特性和环境抗性克服传统工程生物材料的寿命短和冷链运输限制 | NA | 开发高性能、时间效率和成本效益的孢子基材料 | 细菌孢子及其在材料科学中的应用 | 合成生物学与材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌孢子 | NA | 材料科学, 工业生物技术 |
| 1006 | 2025-10-05 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文从多组学和技术视角全面探讨叶绿体在植物生长、防御和遗传创新中的多功能作用 | 独特整合叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学最新进展,提出通过组学数据与纳米技术、合成生物学结合优化植物生长和胁迫耐受性的新视角 | NA | 探索叶绿体在协调植物生长与防御平衡中的核心作用,推动可持续农业发展 | 叶绿体及其在植物生长、防御机制中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学)、合成生物学、纳米技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 1007 | 2025-10-05 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了利用'特洛伊木马'策略开发抗生素偶联物以克服细菌耐药性的研究现状 | 系统总结了三种抗生素偶联物(单克隆抗体、抗菌肽和铁载体)的作用机制及临床前/临床证据 | 抗生素偶联物的临床转化仍面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对多重耐药细菌感染 | 抗生素与生物活性成分(单克隆抗体、抗菌肽、铁载体)的偶联物 | NA | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1008 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-Apr-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
|
research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
| 1009 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在玉米胚胎发育研究中的协同应用 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术相结合研究玉米胚胎发育,实现基因表达模式在单细胞分辨率和空间背景下的协同分析 | 单细胞技术缺乏已知细胞标记物难以识别特定细胞簇,空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 1010 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红与远红光组合能显著提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的产量 | 首次系统研究不同光质对本氏烟草瞬时表达效率的影响,发现红与远红光组合能显著提升异源蛋白和代谢物产量 | 研究仅针对本氏烟草和特定异源产物,未验证在其他植物或蛋白体系中的普适性 | 探究光质对植物瞬时表达系统效率的影响机制 | 本氏烟草植株及其表达的绿色荧光蛋白和紫杉二烯代谢物 | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 分子生物学数据、组学数据 | 五种不同光质处理下的本氏烟草植株 | 农杆菌浸润 | 本氏烟草 | 异源蛋白表达和代谢物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1011 | 2025-10-05 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
|
研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型,开发了一种用于合成启动子设计和强度预测的深度学习平台 | 首次将扩散模型应用于启动子设计,并结合Transformer模型进行强度预测,相比传统方法能生成更接近天然启动子的合成序列 | NA | 开发高效的合成启动子设计和筛选方法,优化外源基因表达和代谢通路效率 | 合成启动子序列及其转录活性 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 扩散模型, Transformer, CNN, 变分自编码器 | 启动子序列数据 | NA | NA | 模型细菌, 蓝细菌 | 合成启动子设计 | 工业生物技术 |
| 1012 | 2025-10-05 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Apr-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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综述 | 本文介绍基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用及其免疫益处 | 提出微藻口服疫苗的合理化设计理念,结合合成生物学与鱼类免疫代谢研究推动疫苗创新 | NA | 探讨微藻疫苗在水产养殖中增强鱼类免疫力和控制疾病的作用 | 水产养殖鱼类 | 合成生物学 | 水产动物疾病 | 口服疫苗技术 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 疫苗抗原设计 | 农业 |
| 1013 | 2025-10-05 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
|
研究论文 | 通过阐明NADPH依赖酶的电子传递机制,系统改造酿酒酵母细胞工厂实现胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 首次系统阐明NADPH依赖酶的电子传递机制,并通过缩短和稳定电子传递链显著加速去质子化和质子耦合电子传递过程 | NA | 提高类固醇化合物的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 电子传递链工程、NADPH再生途径、碳流导向的电子传递组件 | 医药, 工业生物技术 |
| 1014 | 2025-10-05 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
|
研究论文 | 本研究从重楼中鉴定出4'-O-鼠李糖基转移酶UGT73DY2,阐明了甾体皂苷糖链生物合成机制,并通过合成生物学方法成功构建了地奥司宁生物合成系统 | 首次发现并表征了特异性催化甾体二糖苷4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶,通过半理性设计获得活性提升的突变体,并成功在烟草中重建了甾体三糖苷生物合成途径 | 未明确说明工程化系统的稳定性和规模化应用潜力 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发替代生产方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、亚细胞定位分析、代谢工程 | NA | 酶学数据、分子模拟数据、代谢产物数据 | NA | 代谢工程,合成生物学 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 甾体三糖苷生物合成途径,包含14个生物合成基因的共表达系统 | 医药 |
| 1015 | 2025-10-05 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过体内自组装siRNA治疗马查多-约瑟夫病神经病理和炎症的新方法 | 利用合成生物学策略将宿主肝脏重编程为组织底盘,实现siRNA的体内自组装和靶向递送 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对SCA3疾病的有效治疗方法 | YACMJD84.2转基因小鼠模型 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | siRNA技术、合成生物学 | NA | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学方法 | 小鼠 | 由巨细胞病毒启动子引导的合成构建体,编码神经元靶向的狂犬病毒糖蛋白标签和mATXN3-siRNA | 医学 |
| 1016 | 2025-10-05 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 本文聚焦CRISPR平台系统中非DSB编辑器BE和PE的发展与创新,探讨了改进策略及其在基因编辑技术中的应用前景 | 系统阐述了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等创新策略在BE和PE开发中的应用,并总结了CRISPR技术创新的思维突破 | NA | 推动CRISPR碱基编辑技术的发展,实现理想化编辑器的开发 | CRISPR平台系统中的非DSB编辑器(BE和PE) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 1017 | 2025-10-05 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发了一种在不改变内源基因编码序列的情况下整合遗传生物传感器的方法 | 通过将单导RNA插入基因终止子区域激活下游电路,避免了对内源基因编码序列的修改 | NA | 开发可定制的基因传感和响应系统 | CHO-K1细胞中的细胞应激传感器和效应器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | 数学模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 基因传感器和效应器平台,可条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞治疗 |
| 1018 | 2025-10-05 |
Bioengineering lipid-based synthetic cells for therapeutic protein delivery
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.08.004
PMID:39209601
|
综述 | 探讨基于脂质的合成细胞作为治疗性蛋白质递送平台的设计原理、功能特性及转化潜力 | 结合合成生物学与药物递送原理,利用脂质双层构建具有组织特异性靶向和免疫逃逸功能的刺激响应型合成细胞 | NA | 开发用于治疗性蛋白质递送的合成细胞平台 | 基于脂质的合成细胞 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 区室化蛋白质合成系统 | 医药 |
| 1019 | 2025-10-05 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-May, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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研究论文 | 本研究通过基因组分析追踪极度濒危的橙腹鹦鹉在长期演化过程中基因组多样性和免疫基因多样性的丧失 | 结合高质量长读长参考基因组与古今样本(最早可追溯至1829年)进行全基因组比较分析,首次量化了该物种基因组多样性的时间性衰退 | 样本量有限(当代样本N=19,历史样本N=16),且仅关注了Toll样受体基因的等位基因变化 | 评估橙腹鹦鹉的基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降状况,为保护该濒危物种提供科学依据 | 橙腹鹦鹉(Neophema chrysogaster)的古今基因组样本 | 保护基因组学 | 病毒、细菌和真菌感染性疾病 | 长读长测序、全基因组重测序 | NA | 基因组序列数据 | 35个样本(19个当代样本,16个历史样本) | 合成生物学 | NA | NA | 环境保护 |
| 1020 | 2025-10-05 |
Ultrasound-Energized OX40L-Expressing Biohybrid for Multidimensional Mobilization of Sustained T Cell-Mediated Antitumor Immunity and Potent Sono-Immunotherapy
2025-Apr-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02025
PMID:40200836
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研究论文 | 开发一种超声激活的生物混合系统,通过合成生物学工程化细菌表达OX40L并集成声敏剂,实现多维激活T细胞介导的抗肿瘤免疫治疗 | 首次将超声激活的纳米佐剂与共刺激免疫增强剂整合于活体生物治疗平台,实现级联放大的多维免疫激活 | NA | 开发新型癌症声免疫治疗策略,实现持久抗肿瘤免疫应答 | 工程化细菌生物混合系统及其抗肿瘤免疫效应 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学、超声技术 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学 | 细菌 | 表达OX40配体融合蛋白的生物传感器系统 | 医学 |