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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-10-05 |
Determination of the genome-scale metabolic network of Bartonella quintana str. Toulouse to optimize growth for its use as chassis for synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1527084
PMID:40213639
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研究论文 | 本研究重建了Bartonella quintana str. Toulouse的基因组尺度代谢网络模型,以优化其作为合成生物学底盘细胞的生长条件 | 首次构建了Bartonella quintana的基因组尺度代谢模型,并通过实验验证确定了2-酮戊二酸等关键代谢物对其生长的必要性 | 模型准确性仍需进一步提高,某些补充条件下观察到意外的生存率下降现象 | 优化Bartonella quintana的生长条件,开发其作为合成生物学底盘细胞的潜力 | Bartonella quintana str. Toulouse菌株及其代谢网络 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢网络重建、通量平衡分析、蛋白质组学分析 | 基因组尺度代谢模型 | 基因组数据、代谢数据、蛋白质组数据 | NA | NA | Bartonella quintana | NA | 工业生物技术 |
| 1062 | 2025-10-05 |
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform
2025-Apr-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt0402
PMID:40203090
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研究论文 | 开发基于大语言模型的基因挖掘平台SYMPLEX,用于发现高质量mRNA加帽酶 | 首次将大语言模型应用于基因挖掘领域,突破了传统基于序列同源性或专家知识的限制 | 未明确说明平台验证的规模限制和错误率 | 建立通用的基因挖掘平台以扩展合成生物学高质量遗传部件库 | mRNA加帽酶 | 合成生物学 | NA | 大语言模型,体外活性测试,体内交叉物种活性验证 | 大语言模型 | 生物医学文献和数据库文本数据 | 46个候选完整加帽酶进行实验测试 | NA | NA | NA | 生物技术,医药 |
| 1063 | 2025-10-05 |
Harnessing RNA base editing for diverse applications in RNA biology and RNA therapeutics
2025-Apr-08, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00063-x
PMID:40198443
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综述 | 本文综述了RNA碱基编辑技术在RNA生物学和RNA治疗领域的多样化应用 | 系统阐述了RNA碱基编辑作为突破性技术的优势,包括可逆性、剂量依赖性效应,以及在转录组范围内绘制RNA结合蛋白互作图谱的能力 | NA | 探讨RNA碱基编辑技术在基础研究和转化应用中的潜力 | RNA碱基编辑技术及其应用 | 合成生物学 | NA | RNA碱基编辑(ADAR和APOBEC介导的A-to-I和C-to-U转换) | NA | NA | NA | NA | NA | RNA编辑传感器(响应特定RNA物种表达效应蛋白) | 医学, 合成生物学 |
| 1064 | 2025-10-05 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Apr, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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综述 | 本文综述了PHB解聚酶在生物塑料废物管理中的作用机制和应用前景 | 首次系统总结了胞外和胞内PHB解聚酶的结构特征、微生物来源及在PHB生物降解中的功能 | 主要基于文献综述,缺乏原始实验数据支持 | 探讨PHB解聚酶在生物可降解塑料废物处理中的应用潜力 | PHB解聚酶及其产生微生物 | 环境生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | Rhodobacter, Rhodospirillum, Ralstonia, Zoogloea, Pseudomonas, Sinorhizobium, Bacillus | NA | 环境 |
| 1065 | 2025-10-05 |
An inhibitor-free, versatile, fast, and cheap precipitation-based DNA purification method
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317658
PMID:40198694
|
研究论文 | 开发了一种无需抑制剂、快速廉价的新型DNA纯化方法 | 通过使用离液盐和醇/聚乙二醇实现蛋白质去除和DNA沉淀的单步操作,突破了传统方法需要多步骤的限制 | 未明确说明方法的适用范围和可能存在的其他限制因素 | 解决商业硅胶柱纯化方法中存在的酶反应抑制问题 | DNA纯化技术 | 合成生物学 | NA | DNA沉淀纯化技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | E. coli | NA | 分子生物学, 合成生物学 |
| 1066 | 2025-10-05 |
Potential applications of engineered bacteria in disease diagnosis and treatment
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.57
PMID:40207274
|
综述 | 探讨工程菌在疾病诊断与治疗中的潜在应用及其作用机制 | 系统阐述利用合成生物学技术改造益生菌作为药物递送系统、生物传感器和黏膜疫苗的创新方法 | 未提及具体临床转化障碍和监管挑战 | 评估工程菌在疾病管理中的应用潜力 | 经过基因编辑的工程菌 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 代谢疾病, 癌症, 神经退行性疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 益生菌 | 药物递送系统, 生物传感器, 黏膜疫苗 | 医学 |
| 1067 | 2025-10-05 |
Advances in engineered bacteria vaccines for enhancing anti-cancer immunity
2025, Microbiome research reports
DOI:10.20517/mrr.2024.75
PMID:40207284
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术改造大肠杆菌Nissle 1917,开发了一种能够递送肿瘤新抗原表位的活菌疫苗 | 利用活菌药物优势在最佳环境中递送肿瘤特异性新抗原表位阵列,为癌症免疫治疗提供新策略 | NA | 开发有效的持久性癌症免疫疗法 | 工程化细菌疫苗 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 肿瘤靶向递送系统 | 医学 |
| 1068 | 2025-10-05 |
Bioconversion of CO2 into valuable bioproducts via synthetic modular co-culture of engineered Chlamydomonas reinhardtii and Escherichia coli
2025-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.03.004
PMID:40057263
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研究论文 | 开发了一种由改造的莱茵衣藻和大肠杆菌组成的合成模块化共培养系统,用于将CO2转化为高价值生物产品 | 首次构建了GYD1缺陷型莱茵衣藻突变体与大肠杆菌的模块化共培养系统,通过光呼吸途径实现CO2到生物产品的转化 | NA | 开发可持续的生物转化系统,将CO2转化为有价值的生物产品 | 改造的莱茵衣藻GYD1突变体和大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Chlamydomonas reinhardtii, Escherichia coli | 模块化共培养系统,利用光呼吸途径分泌乙醇酸,通过乙醛酸循环代谢 | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 1069 | 2025-10-05 |
Mechanism and engineering of endoplasmic reticulum-localized membrane protein folding in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.03.006
PMID:40064436
|
综述 | 本文综述了酿酒酵母内质网膜蛋白折叠机制及代谢工程策略 | 系统总结膜蛋白折叠四步骤及其影响因素,并提出增强异源膜蛋白正确折叠的多维度工程策略 | 现有策略仍存在局限性,需进一步研究解决关键问题 | 研究内质网膜蛋白折叠机制及优化策略 | 酿酒酵母中的内质网定位膜蛋白(如细胞色素P450) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 膜蛋白工程、分子伴侣共表达、脂质工程 | 工业生物技术 |
| 1070 | 2025-10-05 |
Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70095
PMID:40116553
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研究论文 | 开发了一种在莱茵衣藻中操纵倍性水平的合成生物学策略 | 使用非干扰性抗生素选择标记工程化倍性,可应用于野外分离株而不仅限于特定营养缺陷型实验室菌株 | 新形成的三倍体和四倍体显示出快速非整倍体化的迹象 | 研究倍性变化对植物进化的影响 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 基因组大小数据 | 北美野外分离株 | 抗生素选择标记 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 倍性操纵系统 | 基础研究,应用研究 |
| 1071 | 2025-10-05 |
Powering the Future: Unveiling the Secrets of Semiconductor Biointerfaces in Biohybrids for Semiartificial Photosynthesis
2025-Jan-23, Artificial photosynthesis (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/aps.4c00008
PMID:40200990
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综述 | 本文综述了半人工光合作用中半导体-生物界面在生物混合系统中的作用机制与研究进展 | 系统揭示半导体与微生物之间电荷转移机制的研究空白,提出结合先进光谱学、显微镜学和合成生物学工具的研究路径 | 缺乏对光-半导体-微生物组合产化学品的明确机理理解,商业化应用仍面临基础挑战 | 通过研究半导体-微生物界面的电荷转移动力学,提高太阳能-化学能转换效率以实现工业应用 | 生物混合系统中的半导体-微生物界面 | 合成生物学 | NA | 先进光谱学、显微镜学、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 电活性微生物 | 半导体作为微生物的电子供体或受体的人工光合系统 | 能源, 环境 |
| 1072 | 2025-10-05 |
An innovative high-throughput genome releaser for rapid and efficient PCR screening
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1547909
PMID:40200958
|
研究论文 | 开发了一种用于快速高效PCR筛选的高通量基因组释放器 | 采用压片法实现快速、经济高效的DNA提取,无需提取缓冲液,与标准液体处理机器人平台兼容 | NA | 解决当前高通量PCR筛选方法中DNA提取效率低、成本高和可扩展性限制等问题 | 真菌孢子及其他微生物和细胞类型 | 合成生物学 | NA | PCR筛选、DNA提取 | NA | 基因组DNA | 96孔板规格 | NA | 真菌、多种微生物和细胞类型 | NA | 生物制造 |
| 1073 | 2025-10-05 |
Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy
2025-Jul, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128156
PMID:40158322
|
综述 | 探讨生物工程化微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力 | 系统阐述通过合成生物学技术改造微生物组以增强免疫检查点抑制剂疗效的创新策略 | 存在遗传稳定性、肿瘤定植效率和安全控制等挑战 | 研究微生物组在癌症免疫治疗中的作用机制及工程化改造策略 | 胃肠道微生物组和肿瘤内细菌群体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917, 乳酸乳球菌, 双歧杆菌, 拟杆菌 | 生物传感器, 靶向递送系统 | 医学 |
| 1074 | 2025-10-05 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Apr-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
|
研究论文 | 本文提出了一种控制膜化凝聚体去膜化的策略,实现凝聚体结构的动态重构和功能调控 | 通过静电竞争机制实现凝聚体的可控去膜化,并创建具有双层和Janus-like不对称膜结构的凝聚体原细胞 | NA | 开发具有动态可重构膜结构的合成原细胞系统 | 膜化凝聚体液滴和去膜化凝聚体液滴 | 合成生物学 | NA | 去膜化技术、静电竞争机制 | NA | NA | NA | NA | NA | 膜化/去膜化动态重构系统、双层膜结构、Janus-like不对称膜结构 | 合成生物学, 系统生物学, 生物技术 |
| 1075 | 2025-10-05 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
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研究论文 | 本研究探索了不同来源PARP酶的调控域和催化域之间的交叉互补功能 | 首次证明不同PARP同源物的调控域和催化域可形成功能性嵌合组装体 | 仅进行体外实验,尚未在活细胞中验证 | 研究PARP酶调控域和催化域的交叉互补机制 | 来自哺乳动物、植物和细菌的PARP酶结构域 | 合成生物学 | NA | 定性和定量酶活性测定、结合研究 | NA | 酶活性数据、结合亲和力数据 | 四种PARP酶(hPARP1、hPARP2、atPARP2、haPARP)的结构域 | 结构域组装 | NA | 嵌合PARP组装体 | 医学, 工业生物技术 |
| 1076 | 2025-10-05 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本研究从云南地不容中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs,通过蛋白质工程成功调控了其区域选择性 | 通过定点突变操纵底物结合微环境,将SyOMT4转化为高特异性BIA 6OMT,将SyOMT5工程化为BIA NMTs | NA | 扩展BIA O-甲基转移酶的功能库,为药用重要BIAs的生产提供酶工具 | 云南地不容中的两个苯基异喹啉生物碱O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学 | COVID-19 | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点诱变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点诱变 | 植物 | 酶催化区域选择性调控 | 医药 |
| 1077 | 2025-10-05 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子系统性地表征了Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子中的9个氨基酸反式激活结构域的功能 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面表征9aaTADs功能,发现其中10个具有活性并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制发挥作用 | 仅研究了Mxr1转录因子中的9aaTADs,其他类型转录因子的类似结构域功能尚未探索 | 阐明K. phaffii酵母Mxr1转录因子中多个9个氨基酸反式激活结构域的功能特性和作用机制 | Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子及其21个推测的9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除、功能互补实验 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 21个推测的9aaTADs和1个已知TAD A | 合成转录因子设计 | Komagataella phaffii | 由Mxr1ZF DNA结合结构域与多个9aaTADs组合构成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 1078 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1079 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1080 | 2025-10-05 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在模拟生物组织结构和功能方面的应用 | 系统总结了多种原始细胞模型的空间组织方法及其集体行为特征 | NA | 构建功能化原始组织系统以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层和乳液滴等原始细胞模型 | 合成生物学 | NA | 化学和物理空间组织方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 原始细胞网络 | 生物医学,再生医学 |