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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2025-10-05 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
|
研究论文 | 介绍通过光遗传学调控细胞器功能的方法,重点关注线粒体-溶酶体接触的光学调控 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控,为细胞工程提供创新范式 | NA | 开发通过光遗传学动态调控细胞器功能的技术方法 | 真核细胞中的细胞器,特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 线粒体-溶酶体接触调控系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 1142 | 2025-10-05 |
Enhancing rufomycin production by CRISPR/Cas9-based genome editing and promoter engineering in Streptomyces sp. MJM3502
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.01.002
PMID:39925944
|
研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因组编辑和启动子工程增强链霉菌MJM3502中rufomycin的产量 | 首次建立该菌株的遗传操作平台,并利用CRISPR/Cas9技术在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子 | 对菌株基因组序列和生物合成途径的理解仍存在显著空白 | 提高rufomycin类抗结核先导化合物的产量 | 链霉菌MJM3502及其rufomycin生物合成基因簇 | 合成生物学 | 结核病 | CRISPR/Cas9基因组编辑,启动子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Streptomyces sp. MJM3502 | 在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子,在细胞色素P450酶编码基因上游插入启动子 | 医药 |
| 1143 | 2025-10-05 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
|
研究论文 | 开发了一种在氢凝胶颗粒中测量XNA聚合酶保真度的无纯化方法 | 通过在氢凝胶包被的磁性颗粒基质内完成XNA转录和逆转录步骤,无需传统凝胶电泳纯化过程 | NA | 开发更高效的XNA聚合酶保真度测量方法 | 人工遗传聚合物(XNAs)和XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 氢凝胶颗粒技术,DNA扩增,克隆测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1144 | 2025-10-05 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
|
综述 | 本章回顾了非编码RNA介导的细胞命运决策电路建模方法,从系统生物学延伸到合成生物学应用 | 整合数学建模与合成生物学方法揭示ncRNA介导的双稳态开关设计原理 | 主要基于理论框架和已有研究综述,缺乏原始实验数据验证 | 阐明ncRNA调控细胞命运决策的分子机制和设计原则 | 非编码RNA(miRNA、ceRNA)与转录因子构成的基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 数学建模、合成生物学 | NA | 理论模型 | NA | NA | NA | 双稳态开关、正反馈回路、miRNA-mRNA互作调控网络 | 医学 |
| 1145 | 2025-10-05 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
|
综述 | 本文探讨微生物组工程如何通过调控微生物群落来提升食品安全与质量 | 整合合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术来优化食品生产体系 | 需要进一步研究复杂食品系统中的微生物动力学并建立统一监管框架 | 探索微生物组工程在食品安全与质量提升中的应用潜力 | 食品生产系统中的微生物群落 | NA | NA | 合成生物学, 人工智能, 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业 |
| 1146 | 2025-10-05 |
Recent trends in the elucidation of complex triterpene biosynthetic pathways in horticultural trees
2025-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae254
PMID:39802733
|
综述 | 本文综述了园艺树木中三萜类化合物的化学多样性、生物合成酶及DBTL管道在生物合成途径研究中的应用 | 聚焦园艺树木三萜生物合成途径研究空白,提出集成DBTL管道用于途径发现与优化 | 园艺树木三萜类化合物的生物学功能和机制尚未完全阐明,缺乏可扩展的生产系统 | 阐明园艺树木中复杂三萜类化合物的生物合成途径 | 园艺树木中的三萜类化合物及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | DBTL(设计-构建-测试-学习)管道 | NA | NA | NA | NA | 园艺树木 | 三萜类化合物生物合成途径 | 食品, 医药, 工业生物技术 |
| 1147 | 2025-10-05 |
Metabolic engineering approaches for the biosynthesis of antibiotics
2025-Jan-31, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02628-2
PMID:39891166
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综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在抗生素发现与生产中的应用策略 | 系统整合了代谢工程与合成生物学工具用于开发新型抗生素及其衍生物 | NA | 应对多重耐药细菌的威胁,通过工程化方法开发新型抗生素 | 抗生素及其衍生物和类似物 | 合成生物学 | 细菌感染性疾病 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞工厂 | NA | 医药 |
| 1148 | 2025-10-05 |
Silk Protein Gene Engineering and Its Applications: Recent Advances in Biomedicine Driven by Molecular Biotechnology
2025, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S504783
PMID:39881670
|
综述 | 概述丝蛋白基因工程及其在生物医学领域应用的最新进展 | 系统阐述基因编辑技术(如CRISPR-Cas9)和合成生物学在丝蛋白遗传工程中的创新应用 | NA | 探讨分子生物技术驱动丝蛋白基因工程的发展及其生物医学应用 | 丝蛋白及其遗传修饰产物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑(CRISPR-Cas9), 转基因表达技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 家蚕, 蜘蛛 | NA | 医药 |
| 1149 | 2025-10-05 |
Unravelling the aromatic symphony: redirecting bifunctional mushroom synthases towards linalool monofunctionality
2025-Jan-13, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00056-2
PMID:39883255
|
研究论文 | 通过酶工程改造双功能蘑菇合酶,使其偏向单功能芳樟醇合成 | 通过修饰C和D螺旋间的氨基酸环,成功将双功能合酶的底物偏好从法尼基二磷酸转向香叶基二磷酸 | 未能实现完全的单功能性 | 提高酶特异性并创建单功能芳樟醇合酶 | 四种双功能蘑菇芳樟醇/橙花叔醇合酶(LNS) | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接模拟、分子动力学模拟 | NA | 酶活性数据、分子模拟数据 | 四种蘑菇LNS酶(包括来自Agrocybe pediades的ApLNS和来自Hypholoma sublateritium的HsLNS) | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1150 | 2025-10-05 |
Spontaneous Emergence of Lipid Vesicles in a Coacervate-Based Compartmentalized System
2025-Jan-27, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202414372
PMID:39656166
|
研究论文 | 本研究展示了凝聚微滴能够创建区室化环境,促进脂质分子自发组装成脂质囊泡 | 发现凝聚微滴可在无进化生物机制条件下促进脂质囊泡自发形成并持续释放,类似'原始酶'工厂装配线 | NA | 探索脂质囊泡在无生物机制条件下的自发形成机制及其对生命起源的意义 | 凝聚微滴与脂质分子的相互作用 | 合成生物学 | NA | 凝聚微滴系统 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | NA | 脂质囊泡自发组装系统 | 基础研究 |
| 1151 | 2025-10-05 |
Cell-to-Cell Natural Transformation Mediated Efficient Plasmid Transfer Between Bacillus Species
2025-Jan-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020621
PMID:39859334
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为细胞间天然转化质粒转移(CTCNT-P)的新方法,可在芽孢杆菌物种间高效转移质粒 | 首次报道了通过细胞间天然转化实现质粒在天然感受态芽孢杆菌菌株间高效转移的新方法 | NA | 开发一种高效的质粒转移方法,用于芽孢杆菌物种间的基因转移 | 芽孢杆菌物种,包括天然环境分离的野生菌株及其他芽孢杆菌物种 | 合成生物学 | NA | 细胞间天然转化质粒转移(CTCNT-P) | NA | NA | NA | NA | Bacillus species | NA | 工业生物技术, 合成生物学, 生物防治 |
| 1152 | 2025-01-31 |
Microbial biotechnology: from synthetic biology to synthetic ecology
2025-Jan-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00054-4
PMID:39883269
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1153 | 2025-10-05 |
Rapid Multi-Well Evaluation of Assorted Materials for Hydrogel-Assisted Giant Unilamellar Vesicle Production: Empowering Bottom-Up Synthetic Biology
2025-Jan-02, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels11010029
PMID:39852000
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研究论文 | 开发了一种快速评估多种水凝胶材料用于辅助生产巨型单层囊泡的高通量方法 | 用可控滴铸法替代手动涂布试剂,可在多孔板中同时筛选96种GUV生产配方,并开发了水凝胶回收利用方法和新型PLE-GUVs标记技术 | 未明确说明筛选的水凝胶材料数量上限及长期稳定性数据 | 开发改进巨型单层囊泡生产方法的高通量筛选平台 | 多种水凝胶材料(PEG-DA、交联透明质酸、基质胶、交联DNA等)和巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 水凝胶辅助GUV生产、可控滴铸法、酶封装技术 | NA | 实验数据 | 最多96种GUV生产配方同时筛选 | NA | NA | NA | 生物医学,环境 |
| 1154 | 2025-10-05 |
MoCloro: an extension of the Chlamydomonas reinhardtii modular cloning toolkit for microalgal chloroplast engineering
2025 Jan-Feb, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70088
PMID:39871102
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研究论文 | 本文开发了用于微藻叶绿体工程的模块化克隆工具包MoCloro,扩展了现有MoClo系统 | 创建了首个基于Golden Gate组装的叶绿体基因组工程标准化工具包,支持多基因组合构建 | 目前主要针对莱茵衣藻叶绿体工程,在其他微藻中的适用性有待验证 | 开发标准化叶绿体工程工具以促进微藻合成生物学应用 | 莱茵衣藻叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, BioBrick | Chlamydomonas reinhardtii | 多基因表达盒,叶绿体整合系统 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
| 1155 | 2025-10-06 |
Deciphering the biosynthetic pathway of triterpene saponins in Prunella vulgaris
2025-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17220
PMID:39868644
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研究论文 | 本研究通过综合筛选方法鉴定了夏枯草中三萜皂苷生物合成途径的关键基因 | 首次在夏枯草中精确鉴定出参与三萜皂苷生物合成的9个候选基因,并揭示了这些基因源于全基因组复制事件 | NA | 解析夏枯草中三萜皂苷的生物合成途径 | 夏枯草(Prunella vulgaris)及其三萜皂苷代谢物 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、基因表达评估、代谢组-转录组关联分析、共表达分析、异源表达、酶活性测定 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 异源表达 | NA | 三萜皂苷生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 1156 | 2025-10-06 |
Long oligos: direct chemical synthesis of genes with up to 1728 nucleotides
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06958g
PMID:39759933
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研究论文 | 开发了直接化学合成长达1728个核苷酸基因的新方法 | 在光滑表面进行合成而非传统多孔载体,结合捕获聚合纯化方法,突破200个核苷酸的合成限制 | NA | 实现长链寡核苷酸的高效化学合成 | 绿色荧光蛋白基因(800-mer)和29 DNA聚合酶基因(1728-mer) | 合成生物学 | NA | 化学合成、捕获聚合纯化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,基因编辑,蛋白质工程 |
| 1157 | 2025-10-06 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
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研究论文 | 本研究探索从头设计的卷曲螺旋肽组装体的动态特性,重点关注不同寡聚态之间的肽交换行为 | 开发了荧光报告检测方法研究肽交换动力学,发现设计肽存在同型交换忠实性和异型交换混杂性,并提出两种提高正交性的设计策略 | NA | 研究从头设计卷曲螺旋肽组装体的动态交换特性 | 系列卷曲螺旋肽组装体(从二聚体到七聚体) | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测、肽设计 | NA | 荧光数据、动力学数据 | NA | NA | NA | 卷曲螺旋肽组装体 | 化学生物学, 合成生物学 |
| 1158 | 2025-10-06 |
Environment signal dependent biocontainment systems for engineered organisms: Leveraging triggered responses and combinatorial systems
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.12.005
PMID:39830078
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综述 | 评估基于环境信号触发响应和组合系统的工程生物安全防护策略 | 系统分析多种环境触发因子(化学、光、温度、pH)与组合式生物防护系统的协同应用 | NA | 评估工程生物的环境信号依赖性生物防护系统 | 基因工程生物(GEOs)的生物防护系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境信号响应系统、组合式生物防护系统 | 环境, 工业生物技术 |
| 1159 | 2025-10-06 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在莱茵衣藻中实现了外源蛋白表达的快速、可逆调控 | 首次将哺乳动物来源的DD/Shield-1系统成功应用于微藻系统,实现了外源基因的快速可逆调控 | 未明确说明该系统在不同外源蛋白中的普适性及长期稳定性 | 开发莱茵衣藻中外源基因表达调控的新方法 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统、基因编辑 | NA | 分子生物学数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 分子开关系统,基于配体依赖的蛋白稳定性调控 | 工业生物技术 |
| 1160 | 2025-10-06 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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综述 | 本文讨论在合成细胞中构建从头开始的机械敏感信号通路的研究进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中创建全新的机械敏感信号通路 | NA | 通过合成生物学方法研究机械转导机制并开发新型生物技术 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成细胞 | 机械敏感信号通路 | 医学诊断, 微反应器, 治疗 |