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当前共找到 1530 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-25 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-01-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 该研究通过全原子分子动力学模拟，揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的电梯式转运机制。 | 首次通过超过1毫秒的分子动力学模拟数据，动态解析BicA二聚体的结构重排和底物转运过程，并识别出降低构象转变自由能垒的潜在突变。 | 研究主要基于计算模拟，缺乏实验验证；模拟结果可能受限于力场参数和采样时间。 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，并为工程化改造以提高光合作用产量提供原子级见解。 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA二聚体。 | 分子动力学模拟 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 模拟轨迹数据 | 超过1毫秒的模拟数据 | NA | 蓝藻 | NA | 生物技术、能源、环境 |
| 102 | 2026-08-24 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-12, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
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综述 | 本文综述了利什曼病中寄生虫与宿主之间的表观遗传调控机制，探讨了染色质重塑、组蛋白修饰和非编码RNA在病原体生存及宿主免疫反应中的作用，并展望了合成生物学在该疾病控制中的潜力 | 首次系统整合了利什曼原虫与宿主间的表观遗传交互，并提出了合成基因电路作为调控双方表观基因组的新策略 | 受限于现有文献，缺乏实验验证合成生物学方法的实际效果 | 阐明利什曼病中寄生虫与宿主的表观遗传调控机制，并探讨合成生物学在疾病防控中的应用前景 | 利什曼原虫及宿主（包括共感染和共病模型） | 表观遗传学、合成生物学 | 利什曼病 | NA | NA | 文献数据（基于Web of Science、PubMed、Scopus的结构化综述） | NA | 合成基因电路（属于合成生物学工具，但未具体列出如CRISPR等） | 宿主（未指明具体物种，可能包括人类或模型动物） | 合成基因电路（用于调控宿主和寄生虫表观基因组） | 医学 |
| 103 | 2026-08-23 |
Biosensor-driven strain engineering reveals key cellular processes for maximizing isoprenol production in Pseudomonas putida
2025-10-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady2677
PMID:41134890
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research paper | 本研究开发了一种基于生物传感器的生长偶联筛选策略，在恶臭假单胞菌中优化异戊烯醇的生产，通过迭代组合菌株工程实现了36倍的滴度提升，并揭示了关键的宿主代谢过程 | 发现并表征了一个非经典信号通路，涉及杂合组氨酸激酶与醇脱氢酶的功能和物理复合物，其活性受异源二聚化调节；利用该生物传感器在CRISPRi文库筛选中识别宿主限制因素，并通过整合组学分析揭示了氨基酸分解代谢的重塑对产量提升的关键作用 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发一种生物传感器驱动的菌株工程策略，以优化恶臭假单胞菌中异戊烯醇的生产，并揭示宿主细胞的关键限制因素 | 恶臭假单胞菌菌株及其代谢途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | CRISPRi筛选、组学分析 | NA | 组学数据、生物传感器信号 | 使用CRISPRi文库进行筛选，具体样本数量未提及 | CRISPRi | 恶臭假单胞菌 | 生物传感器驱动的生长偶联选择系统 | 工业生物技术 |
| 104 | 2026-08-23 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-07-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
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研究论文 | 本文介绍了基于非离子表面活性剂的巨型单层囊泡（GUNs）作为合成细胞模型的平台，利用液滴微流控生成单分散的Span 80基GUNs，展示其膜流动性和选择性通透性，并通过诱导相分离和代谢级联反应验证功能。 | 提出巨型单层囊泡（GUNs）作为合成细胞新平台，具有高膜流动性、固有选择性通透性及成本效益，无需嵌入转运蛋白即可实现小分子和质子通透，并成功重建糖酵解-线粒体级联驱动肌动蛋白聚合。 | 未在摘要中明确提及。 | 开发一种稳健且成本效益高的合成细胞模型，以克服现有囊泡（如脂质体、聚合物囊泡和脂肪酸囊泡）的局限性，并展示其功能性应用。 | 基于Span 80的非离子表面活性剂巨型单层囊泡（GUNs）。 | 合成生物学 | NA | 液滴微流控 | NA | NA | NA | 液滴微流控 | NA | pH响应性液-液相分离和糖酵解-线粒体级联反应 | 合成生物学、药物递送 |
| 105 | 2026-08-22 |
Minimal logic gates for probiotic Escherichia coli Nissle 1917 sensing and treatment of dual-bacteria intestinal infection
2025-12, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2530156
PMID:40619672
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研究论文 | 本研究设计了针对益生菌大肠杆菌Nissle 1917的最小逻辑门，用于感知并治疗由两种细菌引起的肠道双重感染 | 设计并实现了针对双重细菌感染的“AND”逻辑门，使益生菌能够同时检测并杀死两种病原体，并在小鼠模型中验证了预防和治疗效果 | 尚未提及具体的局限性 | 开发一种能够感知并治疗双重细菌感染的工程益生菌策略 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917以及两种病原菌 | 合成生物学 | 肠道感染 | 基因工程 | 逻辑门 | 实验数据 | 小鼠模型 | NA | 大肠杆菌 | AND逻辑门 | 医学 |
| 106 | 2026-08-22 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
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综述 | 系统综述肠道微生物及其代谢产物在结直肠癌免疫治疗中调节免疫检查点抑制剂疗效的关键进展 | 全面总结特定菌群及代谢产物调控ICIs疗效的机制，并探讨基于合成生物学的工程菌疗法等新干预策略 | 综述基于现有文献，未包含最新未发表数据，且机制结论可能受研究异质性影响 | 为通过调节肠道微生物组优化结直肠癌免疫治疗提供理论依据 | 结直肠癌患者及肠道微生物群 | 微生物组学、肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | NA | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 肠道微生物 | 基于菌群的免疫调节通路 | 医学 |
| 107 | 2026-08-21 |
AlphaDesign: a de novo protein design framework based on AlphaFold
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00119-z
PMID:40527958
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研究论文 | 介绍了一个基于AlphaFold的从头蛋白质设计框架AlphaDesign，结合自回归扩散模型，实现可控制交互、构象和寡聚状态的快速蛋白质生成与计算验证，并成功设计了针对细菌噬菌体防御系统retrons的活性抑制剂 | 提出一种无需类别特定模型重训练或微调的通用从头蛋白质设计框架，结合AlphaFold与自回归扩散模型，支持快速生成和计算验证具有可控特性的蛋白质 | 本文未明确讨论限制，但可能涉及计算验证的准确性依赖以及体内活性的系统性验证范围有限 | 开发一个通用且易用的从头蛋白质设计框架，以加速新型蛋白质药物的理性设计 | 从头设计的蛋白质，特别是针对细菌噬菌体防御系统retrons的抑制剂 | 蛋白质设计 | 不适用 | AlphaFold | 扩散模型 | 蛋白质序列 | 未提供具体样本数量 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学 |
| 108 | 2026-08-20 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
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研究论文 | 本文设计了用于哺乳动物基因组编辑和分子记录的启动子及gRNA支架的标准化部件库，并通过多重引导编辑定量其活性。 | 提供了大量现存的、祖先的、诱变的或小型化的pol III启动子和gRNA支架变体，并鉴定出数百个活性高于常用序列的部件，同时通过饱和诱变筛选增加序列多样性，并展示了在分子记录中的应用。 | 未明确提及限制，但可能涉及哺乳动物细胞中某些部件的活性差异或设计选择的局限性。 | 建立哺乳动物遗传工程的标准化部件库，以支持可预测的多重编辑和分子记录。 | 哺乳动物细胞（人类和小鼠细胞系）中的pol III启动子和gRNA支架。 | 合成生物学 | NA | 多重引导编辑 | NA | 序列数据 | 人类和小鼠细胞系中的数千个部件 | NA | 人类细胞、小鼠细胞 | 基因表达部件（启动子和gRNA支架） | 医学、工业生物技术 |
| 109 | 2026-08-20 |
A minimal SufB2C2 complex functions as a [4Fe-4S] cluster scaffold in methanogenic archaea
2025-11-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02134-25
PMID:41060016
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研究论文 | 本文表征了产甲烷古菌中由SufB和SufC组成的最小双蛋白SUF系统，证明其形成稳定异源四聚体并结合[4Fe-4S]簇。 | 首次揭示产甲烷古菌中仅由SufB和SufC组成的最小双蛋白SUF系统，SufC为主要簇结合成分，且该系统代表Fe-S簇生物合成的祖先形式，拓展了Fe-S簇生物合成机制的多样性。 | 摘要中未提及研究的局限性。 | 阐明产甲烷古菌中Fe-S簇生物合成机制及其进化意义。 | 产甲烷古菌的SUF系统蛋白SufB和SufC。 | 微生物学、生物化学 | NA | 突变分析、进化比较 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 未在摘要中明确说明样本数量。 | NA | 产甲烷古菌 | NA | 合成生物学 |
| 110 | 2026-08-20 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-10-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
|
观点文章 | 本文提出并澄清了用于描述具有非树状进化历史的生物体的术语，引入了epaktovars和xenotypes两个互补概念，并探讨了它们在合成生物学和去灭绝研究中的应用。 | 提出了两个新术语：epaktovars（通过独立获取相似功能而展现趋同表型的生物群）和xenotypes（通过水平基因转移共享同源基因的生物体），从而扩展了现有的epaktologs和xenologs概念到基因组水平。 | 未提供实证数据或详细案例研究，主要基于理论视角进行概念阐述。 | 旨在整合和澄清用于描述非树状进化历史的生物体的术语，并提供分类框架。 | 具有水平基因转移或趋同进化的生物体，以及合成生物学和去灭绝中的基因改造生物。 | 进化生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 保护生物学 |
| 111 | 2026-08-20 |
Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins
2025-10, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70284
PMID:40944421
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研究论文 | 开发了一个名为Mpipi-T的残基级模型，用于准确预测无序蛋白质的热响应相分离行为，特别是下临界溶解温度（LCST）型转变。 | 首次整合原子级溶剂化自由能数据和实验浊点测量，参数化短程非键相互作用，并解析缩放长程静电相互作用，从而定量预测蛋白质的LCST型相分离。 | 模型预测依赖于特定实验数据，可能不适用于所有蛋白质，且计算效率虽高，但尚未验证其在大规模蛋白质设计中的通用性。 | 解释热应激下蛋白质凝聚的机制，并提供一种从序列直接设计热响应蛋白质的工具。 | 无序蛋白质，包括hTau40、Pab1和ELF3。 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | NA | Mpipi-T（残基级模型，基于物理统计） | 蛋白质序列和相分离实验数据 | 三种蛋白质（hTau40、Pab1、ELF3） | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 112 | 2026-08-20 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-05-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母细胞中的转化相关重组（TAR）方法成功组装了来自昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段（>44.6 Kb），并通过测序验证了组装质量 | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的合成，实现了超过44.6 Kb的DNA片段高效组装 | 未明确提及局限性，但可能包括突变和缺失的检测以及组装过程对特定序列的依赖性 | 评估TAR方法在昆虫病毒基因组工程研究中的适用性，以实现长DNA片段的合成 | 斜纹夜蛾囊泡病毒3h（HvAV-3h）的dsDNA基因组 | 合成生物学 | NA | 转化相关重组（TAR）、PCR、下一代测序（NGS）、Sanger测序 | NA | DNA序列数据 | 15个PCR片段，3个中型片段，1个长DNA片段（约44.6 Kb） | TAR | 酵母细胞 | NA | 农业 |
| 113 | 2026-08-20 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-05-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了通过代谢工程微生物生产糖酸的不同方法，包括酶法转化、全细胞生物转化和发酵，并强调了代谢工程和合成生物学工具在优化菌株中的应用 | 系统总结了C5和C6糖酸的不同生物合成途径，并突出了CRISPR-Cas和动态调控电路等合成生物学工具在菌株开发中的最新进展 | 未提供具体实验数据或比较不同策略的效率，可能缺乏定量分析 | 回顾和总结微生物生产糖酸的代谢工程策略及其应用 | 微生物菌株（如细菌和酵母）以及C5和C6糖酸 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas、动态调控电路 | 微生物（如细菌和酵母） | 代谢途径工程，包括关键酶过表达、竞争途径删除、辅因子平衡和转运体工程 | 食品、建筑、医疗、纺织、聚合物工业 |
| 114 | 2026-08-20 |
Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials
2025-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502199
PMID:40143682
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研究论文 | 本研究首次利用外电活性细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶，开发出可复制、自修复和响应外部刺激的工程活材料。 | 首次在活细菌环境中原位生产DNA水凝胶，利用SpyCatcher/SpyTag技术开发诱导型细胞表面锚点，实现生物杂化材料的动态和导电特性。 | 研究尚未充分探讨材料的长期稳定性和规模化生产可行性。 | 建立基于DNA水凝胶的工程活材料的生产方法，并验证其在生物电化学系统中的电流生成能力。 | Shewanella oneidensis菌株和DNA水凝胶。 | 合成生物学 | NA | DNA水凝胶合成、SpyCatcher/SpyTag技术、生物电化学系统 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量。 | SpyCatcher/SpyTag系统 | Shewanella oneidensis | 诱导型细胞表面锚点、DNA水凝胶形成路径 | 生物技术、能源 |
| 115 | 2026-08-19 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本研究通过转录组分析表征了适应悬浮生长的重组腺相关病毒生产细胞系，并探讨了恢复贴壁培养条件对病毒产量的影响 | 首次对适应悬浮生长的rAAV生产细胞系进行转录组功能表征，揭示了悬浮生长条件下细胞对病毒生产响应的减弱现象，并展示了通过调整培养条件恢复产量的可行性 | 产量恢复仅达到贴壁培养的25%-50%，未能完全恢复生产水平，悬浮培养条件下的病毒产量仍显着低于贴壁培养 | 探索和优化合成生物学方法构建的rAAV生产细胞系的悬浮培养适应性，以实现可规模化的病毒生产 | 基于HEK293的rAAV生产细胞系GX6B及其悬浮适应亚系GX6Bs | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 细胞系GX6B和GX6Bs的多个培养条件下的转录组样本 | NA | HEK293细胞 | 编码AAV和腺病毒辅助元件的整合型基因元件 | 医学 |
| 116 | 2026-08-19 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-07-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究合成了由L-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂聚合物，通过将聚脯氨酸链锚定到膜上，实现了可逆的相分离和微域形成，从而调控膜通透性和分子释放。 | 首次将聚脯氨酸脂聚合物锚定在脂质膜上，实现温度调控的微域形成和分散，动态控制膜组成和通透性，并展示其在药物递送和合成生物学中的潜力。 | 摘要未提及具体局限性，如微域形成的效率、长期稳定性或体内应用可行性。 | 开发一种能够模拟蛋白质行为的膜锚定聚脯氨酸系统，动态调节脂质囊泡的膜微域形成和通透性，用于药物递送和合成生物学。 | 脂质囊泡及其膜上锚定的聚脯氨酸链。 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜、荧光恢复后光漂白（FRAP） | NA | 图像数据（显微镜图像） | 未指明样本数量，涉及不同膜组成和多种负载分子（合成聚合物和酶）的脂质囊泡。 | NA | NA | 温度响应性微域形成系统，通过聚脯氨酸链的相分离实现膜通透性调控。 | 药物递送、合成生物学 |
| 117 | 2026-08-19 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-06, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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研究论文 | 该文设计并构建了一种细胞靶向的生物催化杀伤性原始细胞，通过高阶组装引导癌细胞抑制 | 受细胞膜受体-配体系统启发，利用主体-客体化学自下而上构建基于多糖的原始细胞，并结合正交性和协同性肿瘤抑制机制，实现靶向癌细胞消除 | 未提及 | 开发用于靶向癌细胞消除的合成治疗性原始细胞，展示在癌症治疗中的潜力 | 多糖基原始细胞（P-somes）及癌细胞 | 合成生物学、生物工程 | 癌症 | 主体-客体化学、静电驱动自组装、催化反应级联 | NA | NA | 未提及 | NA | NA | 生物催化杀伤性原始细胞，包含GOx/Pt-AuNP催化级联，生成一氧化氮用于癌细胞抑制 | 医学 |
| 118 | 2026-08-19 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本文建立了一个基于合成生物学的平台，用于开发可诱导产生重组腺相关病毒血清型8（rAAV8）的稳定生产细胞系，并通过优化提高了产量。 | 该平台能够将生产细胞系的构建流程从rAAV2扩展到rAAV8，通过修改包装模块和增加VP123基因拷贝数，显著提高rAAV8的产量，达到与三质粒转染相当的水平。 | 初始细胞系的产量低于传统三质粒转染，且Cap蛋白生产和衣壳形成是限制因素。 | 开发一种稳健的合成生物学平台，用于构建不同血清型的rAAV生产细胞系，提高基因治疗用病毒载体的生产效率。 | 重组腺相关病毒血清型8（rAAV8）及其生产细胞系。 | 合成生物学 | NA | 基因组整合、质粒转染、诱导表达 | NA | 实验数据 | 4个细胞系 | 合成生物学方法（具体工具未提及） | HEK293细胞 | 包含基因组模块、复制模块和包装模块的遗传电路，用于诱导rAAV8生产。 | 医学 |
| 119 | 2026-08-19 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
|
研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自费氏弧菌的LuxRI群体感应系统，实现细胞密度依赖的蛋白质过表达，并通过启动子进化提高表达水平 | 首次在枯草芽孢杆菌中功能重构LuxRI群体感应系统，实现与细胞生长协调的蛋白质生产，无需化学诱导剂；通过两轮启动子进化获得活性增强的突变体，并结合强终止子进一步提升表达 | 摘要中未提及具体局限性 | 开发一种高效且无需诱导剂的枯草芽孢杆菌重组蛋白表达系统，实现细胞生长与生产协调 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）及源自费氏弧菌的LuxRI群体感应系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、启动子进化、群体感应系统重构 | NA | 基因序列 | 4个启动子突变体（P22, P47, P56, P58） | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | LuxRI群体感应基因电路，包含输出控制启动子P及强终止子TB5 | 工业生物技术 |
| 120 | 2026-08-18 |
Current status and future perspectives of multi-modal bacteria-based cancer therapies
2025-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70485
PMID:41121752
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综述 | 本文综述了基于细菌的多模式癌症治疗方法的当前状况和未来前景，重点探讨细菌的肿瘤靶向机制、免疫调节功能及其作为药物递送平台的潜力。 | 系统总结了基因工程和纳米生物技术在细菌介导的癌症治疗中的整合，提出了多模式协同治疗策略，并展望了人工智能在优化合成生物学设计和预测细菌-宿主相互作用中的应用。 | 未明确指出具体的临床前或临床研究局限性，可能包括细菌治疗的毒性、安全性和临床转化挑战。 | 探讨细菌在肿瘤治疗中的应用，特别是其肿瘤靶向性、免疫调节功能以及作为多效应协同治疗平台的潜力。 | 细菌作为癌症治疗载体，以及其与免疫治疗、光动力治疗、声动力治疗等方法的组合应用。 | 癌症治疗，合成生物学，纳米技术 | 癌症 | 基因工程，纳米技术 | NA | 临床前研究数据，临床进展 | NA | 基因工程 | 细菌 | 基因线路，用于增强肿瘤特异性和治疗效果的合成生物学设计 | 医学 |