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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2025-03-22 |
Semiautomated Production of Cell-Free Biosensors
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00703
PMID:40073441
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研究论文 | 本文探讨了使用液体处理机器人技术制造无细胞生物传感器的反应,比较了手动和半自动反应组装方法 | 使用液体处理机器人技术进行无细胞生物传感器的半自动化生产,提高了生产效率和一致性 | 研究仅针对两种无细胞基因表达检测系统进行了测试,未涵盖所有可能的生物传感器类型 | 提高无细胞生物传感器的生产效率和质量控制 | 无细胞生物传感器的制造过程 | 合成生物学 | NA | 液体处理机器人技术 | NA | NA | 384孔板的氟化物感应无细胞生物传感器 |
102 | 2025-03-22 |
Biosynthesis and metabolic engineering of natural sweeteners
2025-Mar-18, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01864-y
PMID:40100508
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综述 | 本文综述了天然甜味剂的生物合成途径及相关酶,并重点介绍了利用合成生物学方法通过微生物细胞工厂生产这些甜味剂的研究 | 总结了多种天然甜味剂的生物合成途径,并探讨了利用合成生物学技术进行微生物生产的进展 | 未提及具体实验数据或生产规模,主要为基础性综述 | 探讨天然甜味剂的生物合成途径及其微生物生产方法 | 天然甜味剂,如罗汉果苷、甜菊糖苷、甘草酸等 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
103 | 2025-03-22 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-Mar-18, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
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研究论文 | 本文通过定向进化技术增强羟化酶XcP4H的活性,用于在工程化益生菌中高效生产5-HTP,以治疗抑郁症 | 使用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化,显著提高了5-HTP的产量,并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 解决5-HTP的药代动力学问题,开发一种基于益生菌的活体治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程化益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动力学模拟、基因编辑 | NA | NA | 小鼠模型 |
104 | 2025-03-22 |
Self-pigmenting textiles grown from cellulose-producing bacteria with engineered tyrosinase expression
2025-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02194-3
PMID:38565971
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研究论文 | 本文通过基因工程改造Komagataeibacter rhaeticus细菌,使其能够生长出自着色细菌纤维素(BC),从而开发出一种可持续的纺织品染色方法 | 通过重组酪氨酸酶表达实现细菌中的黑色素生物合成,使细菌纤维素具有自着色能力,并结合合成生物学工具进行光遗传学图案化基因表达 | NA | 开发可持续的纺织品染色方法,以替代传统的染色工艺 | Komagataeibacter rhaeticus细菌及其生产的细菌纤维素(BC) | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA |
105 | 2025-03-22 |
ON-OFF nanopores for optical control of transmembrane ionic communication
2025-Mar, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01823-x
PMID:39838209
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研究论文 | 本文介绍了一种通过共价修饰α-溶血素蛋白孔与芳基偶氮吡唑光开关,制造出能够在正交波长照射下在离子电阻和二极管模式之间转换的'光孔' | 创新点在于开发了能够通过特定波长光照射在离子电阻和二极管模式之间转换的光孔,这种光孔能够根据单色或双波长照射调节电流输出,而不依赖于光强度 | NA | 研究目的是开发一种能够精确控制跨膜离子通信的纳米级光开关蛋白,以支持合成生物学、神经科学和生物电子学的研究 | 研究对象是α-溶血素蛋白孔与芳基偶氮吡唑光开关的共价修饰产物 | 生物电子学 | NA | 共价修饰技术 | NA | 离子电流数据 | NA |
106 | 2025-03-21 |
Modulating ion channels with nanobodies
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.005
PMID:40103710
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综述 | 本文综述了纳米抗体在离子通道研究和调控中的应用进展 | 纳米抗体因其小尺寸、高特异性和识别难以接近的表位的能力,为离子通道的结构-功能关系研究提供了新的机会,并有望克服传统药物的脱靶效应和毒性问题 | NA | 探讨纳米抗体在离子通道研究和治疗中的潜力 | 离子通道 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体技术 | NA | NA | NA |
107 | 2025-03-21 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for Enhanced De Novo Biosynthesis of Icaritin
2025-Mar-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00754
PMID:40106718
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术构建了一种微生物细胞工厂,用于从头合成具有抗癌特性的天然黄酮类化合物icaritin(ICT) | 通过优化代谢途径,包括通过甲羟戊酸途径修饰增强DMAPP供应,以及通过截断策略微调EsPT的表达和催化效率,显著提高了ICT产量至247.02 mg/L,这是迄今为止报道的最高微生物ICT滴度 | NA | 提高icaritin(ICT)的产量,以支持其大规模工业生产 | Yarrowia lipolytica酵母 | 合成生物学 | 肝癌 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
108 | 2025-03-21 |
Recent advances in biological synthesis of food additive succinate
2025-Mar-19, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2472636
PMID:40107767
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综述 | 本文综述了生物合成食品添加剂琥珀酸的最新进展,重点介绍了代谢工程策略在增强琥珀酸生物合成中的应用 | 本文通过先进的合成生物学技术,强调了开发强大的微生物细胞工厂的潜力,并塑造了微生物在工业应用中整合的未来方向 | 尽管在优化发酵过程和下游操作方面做出了大量努力,但仍需提高成本效益和竞争力,同时考虑环境问题 | 提高琥珀酸生物合成的效率和经济效益,同时考虑环境问题 | 琥珀酸 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略,包括发酵调控、代谢调控、细胞调控和模型指导 | NA | NA | NA |
109 | 2025-03-21 |
Microalgae in health care and functional foods: β-glucan applications, innovations in drug delivery and synthetic biology
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1557298
PMID:40103595
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综述 | 本文综述了微藻在医疗保健和功能性食品中的应用,特别是β-葡聚糖的治疗潜力、药物递送创新和合成生物学应用 | 强调了微藻在免疫调节和抗癌治疗中的潜力,以及合成生物学和生物工艺工程在提高微藻治疗和营养价值方面的创新应用 | 需要进一步研究和开发以解决可扩展性、法规一致性和消费者接受度问题 | 探讨微藻在医疗保健和功能性食品中的应用潜力 | 微藻及其衍生的生物活性化合物,如β-葡聚糖 | 生物技术 | 癌症 | 合成生物学、生物工艺工程 | NA | NA | NA |
110 | 2025-03-20 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型,用于增强合成启动子的设计和强度预测 | 首次将扩散模型应用于合成启动子设计,并结合Transformer模型进行强度预测,展示了比传统方法更好的性能 | 研究主要针对模型细菌和蓝细菌,未涉及其他生物体 | 优化外源基因表达和代谢途径效率,设计性能优于天然启动子的合成启动子 | 合成启动子 | 合成生物学 | NA | 扩散模型, Transformer模型 | 扩散模型, Transformer模型, 卷积神经网络 | 启动子序列数据 | NA |
111 | 2025-03-20 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-Mar-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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研究论文 | 本文调查了四种常用质粒骨架在克隆和野生型大肠杆菌菌株中多聚体的形成情况,并提出了避免多聚体产生的单基因敲除方法 | 首次系统地调查了常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异,并提出了通过单基因敲除避免多聚体产生的方法 | 仅在大肠杆菌的两种菌株中进行了实验,未在其他宿主或质粒系统中验证 | 优化基于质粒的合成生物学电路的设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架及其在大肠杆菌菌株JM109和MG1655中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒克隆、单基因敲除 | NA | NA | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的实验 |
112 | 2025-03-20 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析,探讨了Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术,深入解析了Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制,并验证了tonb基因在该机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制,未涉及其他极端环境的耐受性 | 研究Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制,以促进其在工业污染控制和合成生物学底盘细胞中的应用 | Halomonas alkalicola CICC 11012s及其突变体 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 蛋白质组数据、代谢组数据 | 野生型和突变体Halomonas alkalicola CICC 11012s |
113 | 2025-03-20 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jan-13, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路,该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入 | 开发了一种新型的无细胞生物传感器信号放大电路PSR,通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收,显著提高了生物传感器的灵敏度 | 未提及具体的局限性 | 扩展无细胞生物传感器的功能,提高其检测小分子的灵敏度 | 无细胞系统中的基因表达和传感 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收(PSR) | NA | 核酸 | NA |
114 | 2025-03-19 |
Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006
PMID:40092160
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研究论文 | 本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具,用于非模式微生物Erwinia persicina的基因操作 | 成功应用CRISPR-Cas9系统于Erwinia persicina,通过优化gRNA设计和单质粒系统实现高效基因组编辑,并展示了其在合成生物学中的应用潜力 | 研究主要针对Erwinia persicina,未涉及其他非模式微生物的适用性验证 | 开发适用于非模式微生物Erwinia persicina的基因组编辑工具 | Erwinia persicina细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | NA |
115 | 2025-03-19 |
A dual light-controlled co-culture system enables the regulation of population composition
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.012
PMID:40092159
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研究论文 | 本研究开发了一种双光控共培养系统,能够动态调节种群比例,为代谢工程和合成生物学提供通用工具包 | 利用优化的色适应传感器/调节器(CcaS/R)系统和蓝光激活的YF1-FixJ-PhlF系统作为诱导模块,结合正交群体感应系统和毒素-抗毒素系统,实现了种群比例的动态调控 | NA | 开发一种能够动态调节种群比例的双光控共培养系统,以优化生物生产性能 | 微生物共培养系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学系统,群体感应系统,毒素-抗毒素系统 | NA | NA | NA |
116 | 2025-03-19 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提高了催化效率,且无需NAD(P)H或双功能小分子 | NA | 开发高效降解氯苯胺类污染物的生物催化剂 | 五种氯苯胺(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | UPLC-MS | NA | 化学数据 | 五种氯苯胺 |
117 | 2025-03-19 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本文揭示了丹参中NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控酚酸合成的分子机制 | 首次报道了SmTAT2在丹参中的生物学功能及其调控机制,并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型在酚酸合成中的作用 | NA | 研究丹参中酚酸合成的分子机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge) | 合成生物学 | NA | 转基因实验(过表达和CRISPR/Cas9)、分子相互作用实验(酵母单杂交、双荧光素酶报告基因实验和电泳迁移率实验) | NAC36-MYB18-TAT2模型 | 分子生物学数据 | NA |
118 | 2025-03-19 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
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review | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展,特别强调了在治疗应用、异源核酸(XNAs)开发以及核酸病因学探究方面的最新进展 | 强调了糖修饰在核酸中的重要性,特别是在治疗应用和异源核酸开发方面的创新 | 主要集中于糖修饰的综述,未涉及其他类型的核酸修饰 | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的糖修饰 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
119 | 2025-03-19 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-Mar-17, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
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研究论文 | 本文介绍了在合成细胞中直接表达RNA折纸细胞骨架模拟物的方法,以替代依赖化学合成和热退火的DNA纳米结构 | 使用RNA折纸技术直接在合成细胞中表达细胞骨架模拟物,实现了在等温条件下自组装成微米级三维RNA折纸纳米管 | NA | 探索基于RNA的活性、可进化的合成细胞 | 合成细胞中的RNA折纸细胞骨架模拟物 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | 分子动力学模拟数据 | NA |
120 | 2025-03-19 |
Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots
2025-Mar-17, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01133-5
PMID:40097832
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研究论文 | 本文开发了一种在活细胞中合成量子点(QDs)的方法,并验证了其在多种细胞中的可行性 | 通过耦合细胞内代谢途径,实现了在活细胞中精确时空序列下合成量子点,解决了传统有机溶剂中合成的量子点生物相容性差的问题 | 需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该过程 | 开发一种生物相容性更好的量子点合成方法,以扩展其在生物医学领域的应用 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、MCF-7细胞和MDCK细胞 | 材料科学 | NA | 活细胞合成、准生物合成 | NA | NA | 多种细胞类型(酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞和MDCK细胞) |