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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2025-10-05 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
|
综述 | 本文综述了噬菌体工程技术在对抗多重耐药细菌方面的应用 | 系统总结了噬菌体工程技术,包括化学修饰和基因工程方法,并探讨了其在病原菌检测和清除中的跨学科应用 | 天然噬菌体存在宿主范围窄、特性未明、指数复制和进化带来的潜在风险 | 开发对抗多重耐药细菌的新型解决方案 | 噬菌体及其工程改造技术 | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学修饰, 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学, 纳米技术 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 1322 | 2025-10-05 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
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研究论文 | 开发了一种包裹工程化益生菌的粘液微球凝胶递送系统,用于炎症性肠病的诊断和治疗 | 设计了具有外部粘膜涂层和内部微球的双重保护结构,显著延长工程菌在肠道的定植时间达24小时 | NA | 开发能够有效递送工程菌至肠道病变部位并实现持续定植的治疗系统 | 炎症性肠病模型 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | 能够检测和治疗肠炎的基因工程菌 | 医学 |
| 1323 | 2025-10-05 |
An independent biosynthetic route to frame a xanthanolide-type sesquiterpene lactone in Asteraceae
2025-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17199
PMID:39642193
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研究论文 | 本研究阐明了菊科植物中黄烷内酯类化合物8-表黄烷素的完整生物合成途径 | 揭示了黄烷骨架直接来源于中心前体大牻牛儿烯A酸,通过一种不寻常的细胞色素P450催化的氧化重排反应形成 | NA | 解析黄烷内酯类化合物的生物合成途径 | 黄烷内酯类化合物(特别是8-表黄烷素) | 合成生物学 | NA | 生物合成途径解析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 黄烷内酯生物合成途径 | 医药 |
| 1324 | 2025-10-05 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
|
综述 | 本文综述了微生物适应性和基因工程方法在低渗透性土壤生物修复中的应用与进展 | 整合了微生物自然适应机制与合成生物学技术,提出了定制微生物群落协同修复低渗透性土壤污染的新策略 | NA | 提高低渗透性土壤中生物修复的有效性 | 低渗透性土壤中的微生物及其基因工程改造 | 环境生物技术 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 定制微生物群落 | 环境 |
| 1325 | 2025-10-05 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
|
综述 | 探讨利用启动子元件增强植物基因编辑效率的策略与进展 | 系统阐述组织特异性启动子、诱导型启动子和合成启动子在植物基因编辑中的创新应用 | NA | 提升植物基因编辑的精准性、效率和特异性 | 植物基因编辑系统中的启动子元件 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 组织特异性表达系统、诱导型表达系统、合成启动子设计 | 农业 |
| 1326 | 2025-10-05 |
Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate)
2025-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018
PMID:39581772
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研究论文 | 开发罗尔斯顿菌RPET菌株的基因工具,实现从废弃PET塑料生物升级回收生产多种化学品 | 开发了针对非模式微生物RPET的可诱导可滴定表达系统和基于丝氨酸整合酶的重组编辑工具,建立了从消费后PET废瓶生产番茄红素、脂质和琥珀酸的微生物供应链 | 非模式微生物合成生物学工具稀缺限制了生物产品范围的扩展 | 开发塑料生物升级回收技术,实现可持续化学生产 | 罗尔斯顿菌RPET菌株和消费后PET废弃塑料 | 合成生物学 | NA | 基因工程、微生物代谢工程 | NA | 实验数据 | NA | 丝氨酸整合酶重组工具 | Rhodococcus jostii RPET | 代谢通路工程、微生物供应链 | 环境,工业生物技术 |
| 1327 | 2025-10-05 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本微型综述重点介绍了合成共凝聚液滴在模拟生物分子凝聚物方面的最新设计进展及其在生物医学领域的应用潜力 | 通过动态相分离控制构建具有细胞样特征的合成凝聚物,为细胞仿生建模和功能材料工程提供创新解决方案 | NA | 探索合成生物分子凝聚物的相分离控制机制及其在生物医学中的应用 | 合成共凝聚液滴及其仿生结构 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生凝聚物结构、活性共凝聚物工程 | 生物医学, 材料科学 |
| 1328 | 2025-10-05 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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研究论文 | 本研究揭示了丹参根中ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮从周皮细胞向外转运的机制 | 首次发现丹参酮可从周皮细胞转运至土壤环境,并鉴定出负责丹参酮IIA和丹参酮I外排的ABC转运蛋白SmABCG1 | NA | 探究植物二萜类化合物的转运机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根中的丹参酮转运过程 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达、基因敲除和过表达 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据、细胞定位数据 | 丹参毛状根培养体系 | CRISPR-Cas9 | 非洲爪蟾卵母细胞, 丹参毛状根 | NA | 代谢工程, 合成生物学 |
| 1329 | 2025-10-05 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
|
综述 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控机制和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制,包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控,以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 阐明叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用前景 | 植物、藻类和光合细菌的叶绿素生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类, 光合细菌 | 叶绿素生物合成途径调控网络 | 农业, 合成生物学 |
| 1330 | 2025-10-05 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
|
综述 | 本文综述了基于细菌孢子特性的工程生物材料最新进展及其未来发展挑战 | 利用细菌孢子的休眠特性和环境抗性克服传统工程生物材料的寿命短和冷链运输限制 | NA | 开发高性能、时间效率和成本效益的孢子基材料 | 细菌孢子及其在材料科学中的应用 | 合成生物学与材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌孢子 | NA | 材料科学, 工业生物技术 |
| 1331 | 2025-10-05 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
|
综述 | 本文从多组学和技术视角全面探讨叶绿体在植物生长、防御和遗传创新中的多功能作用 | 独特整合叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学最新进展,提出通过组学数据与纳米技术、合成生物学结合优化植物生长和胁迫耐受性的新视角 | NA | 探索叶绿体在协调植物生长与防御平衡中的核心作用,推动可持续农业发展 | 叶绿体及其在植物生长、防御机制中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学)、合成生物学、纳米技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 1332 | 2025-10-05 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了利用'特洛伊木马'策略开发抗生素偶联物以克服细菌耐药性的研究现状 | 系统总结了三种抗生素偶联物(单克隆抗体、抗菌肽和铁载体)的作用机制及临床前/临床证据 | 抗生素偶联物的临床转化仍面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对多重耐药细菌感染 | 抗生素与生物活性成分(单克隆抗体、抗菌肽、铁载体)的偶联物 | NA | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1333 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-Apr-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
| 1334 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在玉米胚胎发育研究中的协同应用 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术相结合研究玉米胚胎发育,实现基因表达模式在单细胞分辨率和空间背景下的协同分析 | 单细胞技术缺乏已知细胞标记物难以识别特定细胞簇,空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 1335 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红与远红光组合能显著提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的产量 | 首次系统研究不同光质对本氏烟草瞬时表达效率的影响,发现红与远红光组合能显著提升异源蛋白和代谢物产量 | 研究仅针对本氏烟草和特定异源产物,未验证在其他植物或蛋白体系中的普适性 | 探究光质对植物瞬时表达系统效率的影响机制 | 本氏烟草植株及其表达的绿色荧光蛋白和紫杉二烯代谢物 | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 分子生物学数据、组学数据 | 五种不同光质处理下的本氏烟草植株 | 农杆菌浸润 | 本氏烟草 | 异源蛋白表达和代谢物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1336 | 2025-10-05 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型,开发了一种用于合成启动子设计和强度预测的深度学习平台 | 首次将扩散模型应用于启动子设计,并结合Transformer模型进行强度预测,相比传统方法能生成更接近天然启动子的合成序列 | NA | 开发高效的合成启动子设计和筛选方法,优化外源基因表达和代谢通路效率 | 合成启动子序列及其转录活性 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 扩散模型, Transformer, CNN, 变分自编码器 | 启动子序列数据 | NA | NA | 模型细菌, 蓝细菌 | 合成启动子设计 | 工业生物技术 |
| 1337 | 2025-10-05 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
|
研究论文 | 本研究从重楼中鉴定出4'-O-鼠李糖基转移酶UGT73DY2,阐明了甾体皂苷糖链生物合成机制,并通过合成生物学方法成功构建了地奥司宁生物合成系统 | 首次发现并表征了特异性催化甾体二糖苷4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶,通过半理性设计获得活性提升的突变体,并成功在烟草中重建了甾体三糖苷生物合成途径 | 未明确说明工程化系统的稳定性和规模化应用潜力 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发替代生产方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、亚细胞定位分析、代谢工程 | NA | 酶学数据、分子模拟数据、代谢产物数据 | NA | 代谢工程,合成生物学 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 甾体三糖苷生物合成途径,包含14个生物合成基因的共表达系统 | 医药 |
| 1338 | 2025-10-05 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
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研究论文 | 本研究开发了一种通过体内自组装siRNA治疗马查多-约瑟夫病神经病理和炎症的新方法 | 利用合成生物学策略将宿主肝脏重编程为组织底盘,实现siRNA的体内自组装和靶向递送 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对SCA3疾病的有效治疗方法 | YACMJD84.2转基因小鼠模型 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | siRNA技术、合成生物学 | NA | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学方法 | 小鼠 | 由巨细胞病毒启动子引导的合成构建体,编码神经元靶向的狂犬病毒糖蛋白标签和mATXN3-siRNA | 医学 |
| 1339 | 2025-10-05 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 本文聚焦CRISPR平台系统中非DSB编辑器BE和PE的发展与创新,探讨了改进策略及其在基因编辑技术中的应用前景 | 系统阐述了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等创新策略在BE和PE开发中的应用,并总结了CRISPR技术创新的思维突破 | NA | 推动CRISPR碱基编辑技术的发展,实现理想化编辑器的开发 | CRISPR平台系统中的非DSB编辑器(BE和PE) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 1340 | 2025-10-05 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发了一种在不改变内源基因编码序列的情况下整合遗传生物传感器的方法 | 通过将单导RNA插入基因终止子区域激活下游电路,避免了对内源基因编码序列的修改 | NA | 开发可定制的基因传感和响应系统 | CHO-K1细胞中的细胞应激传感器和效应器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | 数学模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 基因传感器和效应器平台,可条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞治疗 |