合成生物学相关文章
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当前共找到 1524 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性，恢复RT-qPCR测量的准确性，首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证，未涉及体内复杂环境或多种核酶类型，潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性，以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶（自切割RNA） | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 122 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 123 | 2026-04-29 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
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研究论文 | 开发了一种全可见光谱抗原稳定荧光纳米抗体平台，实现多色标记和功能成像 | 通过将二十多种荧光蛋白和生物传感器工程化到八个纳米抗体中，建立了通用型抗原稳定荧光纳米抗体设计，实现仅在与同源抗原结合时才发出明亮荧光 | NA | 开发一种合成生物学驱动的抗原稳定荧光纳米抗体工具包，用于高特异性和低背景的细胞内蛋白动态研究和功能成像 | 荧光蛋白、生物传感器、纳米抗体、小鼠脑、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光纳米抗体工程化、荧光成像 | NA | 图像 | 二十多种荧光蛋白和生物传感器、八种纳米抗体 | NA | 小鼠、斑马鱼 | 抗原稳定荧光纳米抗体电路 | 医学、生物学 |
| 124 | 2026-04-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
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综述 | 综述了利用植物病毒载体在本氏烟中瞬时表达系统生产生物制药的关键作用与最新进展 | 阐述了病毒载体修饰、水培法和受控环境农业等创新技术如何提升可扩展性和法规合规性，并通过糖基化工程拓宽可生产的生物制药范围 | 未明确讨论瞬时表达系统在工业生产中的长期稳定性或大规模生产成本控制的具体挑战 | 强调瞬时表达系统在生物制药生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用潜力，并推动植物分子农业成为现代生物技术的关键组成部分 | 本氏烟中的瞬时表达系统及植物病毒载体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达 | NA | NA | NA | 病毒载体 | 本氏烟 | 植物病毒载体驱动的瞬时表达系统 | 医药, 生物技术 |
| 125 | 2026-04-28 |
Advances in the microbial biosynthesis of ʟ-tryptophan and its derivatives
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100046
PMID:42038707
|
综述 | 综述L-色氨酸及其衍生物的微生物合成进展 | 系统总结了提高微生物L-色氨酸产量的优化策略及工程菌株在合成高价值衍生物方面的应用，并探讨了合成生物学快速进化为衍生物生产带来的变革性机遇 | 仍存在若干关键瓶颈，但未具体阐述 | 优化微生物合成途径以高效生产L-色氨酸及其衍生物 | L-色氨酸及其衍生物的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 微生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 生物合成途径 | 医药, 食品 |
| 126 | 2026-04-28 |
Four enzymes from button bush enable de novo biosynthesis of spirooxindole alkaloids in yeast
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100049
PMID:42038706
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研究论文 | 本文从风箱树中发现了四种酶，并在酵母中实现了螺环氧化吲哚生物碱的从头生物合成 | 首次发现并表征了四条酶的级联反应途径，能够在酵母中完全从头合成异育亨宾型氧化吲哚生物碱，阐明了氧化吲哚形成的酶学逻辑 | 未明确提及局限性 | 揭示异育亨宾型氧化吲哚生物碱的生物合成途径并实现其在酵母中的异源重建 | 风箱树中的四种酶（CoAJS、CoHYC3O、CoHYC3R、CoOIS）及相应生物碱产物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、生化验证、酶动力学分析、酵母工程改造 | NA | NA | NA | 酵母菌株工程 | 酿酒酵母 | 四酶级联途径，将鹰爪豆碱苷元转化为异育亨宾型氧化吲哚生物碱（米曲菲林、异米曲菲林、uncarine F） | 医药、工业生物技术 |
| 127 | 2026-04-28 |
DeepCodon: A deep learning codon-optimization model to enhance protein expression
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100042
PMID:42038710
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研究论文 | 提出一种名为DeepCodon的深度学习密码子优化模型，用于增强蛋白质表达 | 首次在密码子优化中保留功能上重要的稀有密码子簇，采用条件概率策略保护保守稀有密码子 | 未详细说明模型的泛化能力或在不同宿主物种中的表现 | 开发一种多目标密码子优化工具，平衡宿主密码子偏好、GC含量和mRNA二级结构等因素以提高异源基因表达 | Enterobacteriaceae序列、P450和G3PDH基因 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN | 序列数据 | 150万个天然肠杆菌科序列，7种低产量P450和13种AI设计的G3PDH | NA | E. coli | NA | 合成生物学、基因工程 |
| 128 | 2026-04-28 |
Protein design drives synthetic biology research of plant natural products
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100048
PMID:42038708
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综述 | 本文综述了蛋白质设计技术在植物天然产物合成生物学研究中的前沿进展，探讨如何通过人工智能与合成生物学深度融合解决植物天然产物微生物生产中的关键瓶颈 | 系统阐述了蛋白质设计技术在解决植物天然产物生物合成中未知酶步骤和植物源酶功能表现不佳等难题方面的突破性进展，并强调了人工智能与合成生物学深度融合的潜力 | 未深入讨论蛋白质设计技术的具体实验验证细节及其在工业规模化生产中的实际应用挑战 | 总结蛋白质设计技术在植物天然产物生物合成中的应用，探索解决微生物生产瓶颈的方法 | 植物天然产物及其相关的植物源酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 植物天然产物的生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品 |
| 129 | 2026-04-28 |
The convergence of AI and synthetic biology: the looming deluge
2025-Jul-01, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00021-1
PMID:42032179
|
评论 | 探讨人工智能与合成生物学融合带来的机遇与风险，并提出监管策略 | 首次综合性地分析AI驱动合成生物学在医学、农业和可持续发展领域的创新潜力，同时系统性地评估双重用途风险、治理缺口和伦理困境 | 未提供具体实验数据或案例研究，分析较为宏观，缺乏实证支持 | 探讨AI与合成生物学融合如何加速生物工程流程，并识别相关风险与治理需求 | AI驱动合成生物学的应用场景及治理框架 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 可持续性 |
| 130 | 2026-04-28 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 利用合成生物学将Vibrio natriegens改造成能修复含复杂有机污染物的盐废水及土壤的菌株 | 通过插入tfoX基因增强DNA摄取和整合能力，并利用酵母组装五个降解基因簇（总长43 kb）转移至Vmax菌株，实现从单环到多环有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）的广谱修复 | NA | 解决有机污染物复杂性及盐胁迫耐受受限的问题，开发海洋微生物在生物修复中的应用 | 复杂有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）及盐废水/土壤样本 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 来自氯碱厂和炼油厂的工业废水样本 | 酵母组装 | Vibrio natriegens | 代谢途径（五个降解基因簇） | 环境 |
| 131 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 132 | 2026-04-28 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本文从云南金不换中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的苄基异喹啉生物碱7-O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5，并通过对底物结合微环境的操作改变其催化区域选择性 | 首次发现通过操纵底物结合微环境中的三个残基（R143/L156/H163和F154/F167/G174），可将SyOMT4转化为高度特异的BIA 6OMT（SyOMT4-WFE），并将SyOMT5工程化为BIA N-甲基转移酶（SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD），拓展了BIA OMT的功能谱 | 未评估工程化酶在合成生物学和代谢工程中的实际应用效果 | 研究云南金不换中苄基异喹啉生物碱O-甲基转移酶的功能并通过蛋白工程改变其区域选择性 | 来自云南金不换（Stephania yunnanensis）转录组数据的两种O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | NA | NA | 转录组测序、定点突变、结构建模 | NA | 转录组数据 | 从云南金不换转录组数据中鉴定两种酶 | 定点突变 | NA | NA | 医学、合成生物学、代谢工程 |
| 133 | 2026-04-25 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文综述了利用生物策略实现木质素增值以及将木质素转化为生物制造原料的最新进展 | 综合了木质素降解酶、代谢工程、合成生物学和人工智能驱动技术等多学科交叉方法，提出利用数字系统和人工智能技术促进木质素商业化的创新观点 | 主要基于现有文献分析，可能缺乏大规模实际应用验证数据，且未深入探讨技术经济可行性 | 探索木质素增值的有效生物转化途径，推动将其作为可持续原料用于生物基制造 | 木质素及其衍生物的降解与转化工艺、相关酶系统、代谢途径及工程菌株 | NA | NA | 木质素降解酶、代谢工程、遗传工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环代谢路径重定向 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 134 | 2026-04-25 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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研究论文 | 提出一种逆向工程方法，从线性模型分析推断非线性Hill函数模型的动力学参数，用于设计实现完美适应的生物控制器 | 首次提出将线性系统理论与非线性Hill函数建模相结合进行逆向工程，实现生物网络基序控制器的设计 | 研究仅通过仿真验证了方法的有效性，缺乏实验验证 | 设计能够实现完美适应的合成生物控制器 | 三种基于生物网络基序的控制器 | 系统生物学 | NA | NA | Hill函数模型、线性模型 | 仿真数据 | NA | NA | NA | 生物网络基序控制器 | 合成生物学 |
| 135 | 2026-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 重点介绍基于CRISPR平台的非DSB编辑器BE和PE的开发与创新，探讨改进策略及未来理想编辑器的发展前景 | 系统归纳了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路在BE和PE开发中的应用，并阐述了CRISPR技术创新中的巧妙思维反转与跳跃 | 未具体探讨CRISPR碱基编辑技术在实际应用中可能面临的脱靶效应或伦理问题 | 综述CRISPR碱基编辑技术通过创新策略和思路的进展，展望未来理想编辑器的开发 | 基于CRISPR平台的碱基编辑器（BE）和先导编辑器（PE） | 合成生物学 | NA | CRISPR碱基编辑, 先导编辑, AAV递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 碱基编辑器, 先导编辑器, 小型编辑器 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 136 | 2026-04-25 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
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研究论文 | 利用可重构DNA纳米筏构建合成细胞模型，实现形态重塑和膜通道形成 | 将DNA纳米筏在纳米尺度的重塑与巨型单层囊泡在微米尺度的重塑耦合，通过可编程方式改变囊泡形态，并利用生物孔辅助形成可密封的合成通道 | NA | 探索可重构DNA纳米结构与合成细胞之间的界面，扩展DNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | 信号响应型DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡组成的合成细胞模型 | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 可重构DNA纳米筏网络 | 合成生物学 |
| 137 | 2026-04-23 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 实现了紧密调控、可滴定且具有低重组率和最小基础活性的Cre重组酶系统，并成功应用于缺氧环境下的砷酸盐生物传感 | NA | 开发一种可调控的低速率基因组重组工具，以增强环境生物传感和合成生物学的应用能力 | Escherichia coli（大肠杆菌）中的Cre-lox重组系统 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的低速率基因组重组系统，用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 138 | 2026-04-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SNIPR的合成受体平台，能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能，用于增强工程化治疗细胞的特异性 | 首次将SNIPR受体架构改造为可被可溶性配体激活的平台，实现了低基线活性与高倍数激活，并通过内吞和pH依赖性切割机制工作 | 未明确说明受体平台在复杂生理环境中的长期稳定性及潜在免疫原性问题 | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体，用于精准调控工程化治疗细胞功能 | 合成受体平台（SNIPR）、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA | SNIPR平台 | 哺乳动物细胞 | 可溶性配体激活的合成受体、正交于天然信号通路的细胞间通信网络 | 医学 |
| 139 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺，涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径，并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展，特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺，这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2026-04-21 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然性质潜力及关键修饰策略，以增强其功能，并讨论了其在生物医学领域的多样化应用 | 通过化学修饰、基因工程和仿生矿化等策略，克服天然铁蛋白的局限性，扩展其功能范围，特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化方面的应用潜力 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化方面的挑战 | 优化铁蛋白纳米颗粒的修饰策略，提高纳米递送系统的稳定性和靶向效率，并整合人工智能和合成生物学等新技术，构建高效、低毒、多功能的纳米递送系统 | 铁蛋白纳米颗粒及其修饰后的衍生物 | NA | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |