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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2025-Sep-19, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
|
研究论文 | 本研究开发了一种适用于热纤维梭菌的耐热L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围且泄漏可忽略的耐热L-阿拉伯糖诱导系统 | NA | 开发适用于非模式热微生物的诱导型遗传操作系统 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | NA | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | L-阿拉伯糖诱导系统,包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |
| 122 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Heterologous Protein Expression and Natural Product Synthesis by Aspergillus
2025-Jul-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11070534
PMID:40985424
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综述 | 综述曲霉属真菌在异源蛋白表达和天然产物合成领域的最新研究进展 | 系统总结了CRISPR-Cas9在曲霉遗传修饰中的应用现状,并重点探讨了其在萜类化合物异源生物合成中的具体应用 | NA | 总结曲霉作为异源表达平台在蛋白质和天然产物合成中的研究进展 | 曲霉属真菌(包括黑曲霉、米曲霉等) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 曲霉(包括黑曲霉、米曲霉等) | 异源蛋白表达系统、天然产物生物合成途径 | 工业生物技术,医药 |
| 123 | 2025-10-05 |
[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250116
PMID:40994325
|
综述 | 本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展,包括合成途径、产量提升策略及未来发展方向 | 系统比较甲羟戊酸和甲基赤藓糖醇磷酸两种合成途径在不同微生物宿主中的优劣,并提出酵母合成三萜类化合物的优化策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述进行分析 | 促进三萜类化合物在化妆品领域的应用开发 | 三萜类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径 | 化妆品 |
| 124 | 2025-10-05 |
[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240845
PMID:40994326
|
综述 | 本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展 | 系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学策略提高解脂耶氏酵母中倍半萜产量的方法 | 倍半萜类化合物及其在解脂耶氏酵母中的异源合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径工程,前体增强 | 香料,制药,生物燃料,工业生物技术 |
| 125 | 2025-10-05 |
A Deep Dive into Plant Metabolomics: Milestones, Technologies, and Translational Impact
2025-Sep-24, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
|
综述 | 本文全面回顾植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在农业和生物技术领域的转化应用 | 系统总结了500多种开源计算工具,涵盖代谢组学数据分析全流程,并展望了成像质谱、单细胞代谢组学等新兴技术 | 作为综述文章,不涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行整合分析 | 梳理植物代谢组学领域的发展里程碑、技术演进和转化应用前景 | 植物代谢组学研究方法、分析工具和应用案例 | 生物信息学 | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、代谢组全基因组关联分析(mGWAS)、代谢物QTL分析(mQTL) | AI辅助代谢物鉴定 | 代谢组学数据、转录组数据 | NA | NA | 药用植物、作物 | NA | 农业, 医药, 生物技术 |
| 126 | 2025-10-05 |
Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota
2025-Sep-23, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00367-25
PMID:40815469
|
研究论文 | 通过培养和测序牦牛肠道微生物群成员,揭示其功能潜力 | 建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库(YFR),包含548个高质量基因组,其中216株为新分类单元,将反刍动物肠道细菌培养物种比例提高19.39% | NA | 揭示牦牛肠道微生物群的功能潜力和生态适应性 | 牦牛肠道微生物群 | 微生物组学 | NA | 好氧和厌氧培养、基因组测序 | NA | 基因组数据 | 548个高质量基因组,216个新分类单元 | NA | 牦牛 | NA | 工业酶发现、合成生物学 |
| 127 | 2025-10-05 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges and perspectives
2025-Sep-23, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能生物生产底盘的研究进展、挑战与前景 | 系统总结了该硅藻在合成生物学领域的应用潜力,包括遗传工具开发、代谢工程和规模化生产策略 | 存在产物产量欠佳、生物量限制和生产成本过高等工业化障碍 | 探讨三角褐指藻从模式硅藻向规模化生物制造平台转型的路径 | 海洋硅藻三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、高效转化系统、DNA定点整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻 | 代谢途径工程(岩藻黄素、脂肪酸、三酰甘油、萜类、治疗性肽类) | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 128 | 2025-10-05 |
Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00368
PMID:40844977
|
研究论文 | 本研究在黑曲霉中开发了基于翻译延伸因子1-α基因启动子的高效报告系统 | 发现了迄今黑曲霉中最强的启动子,其活性比常用启动子高20倍以上,并开发了多功能共表达系统 | NA | 开发用于真菌合成生物学的高性能遗传工具 | 黑曲霉的翻译延伸因子1-α基因启动子 | 合成生物学 | NA | 甲基伞形酮报告基因检测、荧光蛋白标记、共聚焦显微镜 | NA | 荧光信号、染色信号、共定位数据 | NA | P2A肽、融合构建体 | 黑曲霉 | 启动子报告系统、双顺反子表达系统、核定位信号识别系统 | 工业生物技术 |
| 129 | 2025-10-05 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
|
研究论文 | 提出一种通过催化残基重编程增强酶在碱性pH下活性的工程策略 | 将保守的催化残基替换为更高pKa的可电离残基,实现从羧酸盐介导到酚盐介导的质子转移机制转变 | NA | 开发在极端pH条件下保持高效酶催化活性的方法 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化、分子动力学模拟 | NA | 动力学数据、模拟数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物催化, 环境生物催化 |
| 130 | 2025-10-05 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造NADH氧化酶,实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化 | 首次开发了能够高效氧化非天然辅因子NCDH的工程化酶,解决了氧化反应中NCD生成的技术瓶颈 | NA | 开发非天然辅因子NCD的再生工具,拓展合成生物学中氧化还原反应的应用能力 | NADH氧化酶及其突变体、非天然辅因子NCD/NCDH | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 酶活性数据、分子对接模拟数据 | NA | 酶定向进化 | 大肠杆菌Escherichia coli BW14329 | NCDH氧化再生系统,与磷酸脱氢酶偶联的代谢通路 | 工业生物技术, 化学生物学 |
| 131 | 2025-10-05 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
|
研究论文 | 通过宏基因组分析探讨金属(类)抗性基因及其在环境修复中的应用 | 采用宏基因组方法系统探索微生物金属抗性基因的功能多样性和作用机制 | NA | 研究微生物金属抗性基因的机制及其环境应用价值 | 微生物金属抗性基因及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 环境 |
| 132 | 2025-10-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
|
综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖在免疫调节中的关键作用及其治疗潜力 | 重点关注肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖,提出了通过合成生物学设计下一代免疫疗法的路线图 | 存在结构-功能知识空白,在连接特定结构基序与可预测免疫结果方面存在挑战,规模化生产方法仍需改进 | 探讨细菌胞外多糖的免疫调节功能及其在肠道微生物组时代的治疗应用 | 肠道共生菌和益生菌产生的微生物胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 肠道共生菌, 益生菌 | 定制化胞外多糖原位生产系统 | 医学 |
| 133 | 2025-10-05 |
Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries
2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269
PMID:40928961
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中构建并功能表达了III型分泌系统,显著增强了其杀虫效果 | 首次使用Red/ET重组工程技术克隆完整32-kb T3SS基因簇并在T3SS缺陷菌株中实现功能性表达,发现新型效应蛋白XopA | 研究主要基于实验室模型,尚未在真实田间环境中验证工程菌株的实际应用效果 | 通过合成生物学方法增强昆虫病原细菌的杀虫能力并扩展T3SS效应蛋白库 | 昆虫病原线虫共生细菌Xenorhabdus spp.及其III型分泌系统 | 合成生物学 | 昆虫病害控制 | Red/ET重组工程, 基因克隆, 异源表达 | NA | 分子生物学数据, 细胞实验数据, 生物测定数据 | CF-203细胞系和昆虫模型 | Red/ET recombineering | Xenorhabdus | 完整的32-kb III型分泌系统基因簇,包含新型效应蛋白XopA的递送机制 | 农业, 生物防治 |
| 134 | 2025-10-05 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-Sep-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
|
研究论文 | 开发了一种通过电激活微滴组装实现按需纳升级试剂输送的平台 | 将电传感、触发式液滴融合和被动分选集成在单一连续流中,实现基于阻抗检测的选择性液滴融合 | NA | 开发高精度纳升级试剂输送平台 | 微滴和细菌样品 | 微流控技术 | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学分选 | NA | 电信号数据 | 每分钟超过6000个事件 | NA | 细菌 | NA | 药物发现,合成生物学,单细胞分析 |
| 135 | 2025-10-05 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Sep-12, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
|
研究论文 | 本研究通过构建群体感应启动子库和新型混合启动子,扩展了合成生物学工具箱并实现了动态遗传电路的精确调控 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库,并设计了一种需要两种自诱导物激活的新型混合启动子 | NA | 扩展群体感应工具箱,实现遗传电路的动态调控和精确调谐 | 群体感应系统、遗传电路、启动子工程 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、遗传电路设计 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | E. coli | 多阶段遗传开关、混合启动子电路、需要3-氧代-己酰基和3-氧代-十二酰基-高丝氨酸内酯两种自诱导物激活的逻辑门 | 工业生物技术 |
| 136 | 2025-10-05 |
Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210
PMID:40821789
|
综述 | 探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用与优化 | 提出整合数学模型与计算技术的综合框架,以提升CAR-T疗法设计并预测临床效果 | 现有模型时空分辨率有限,影响疗法安全性及成本效益,尤其针对实体瘤 | 通过计算手段优化CAR-T疗法设计并预测治疗效果 | CAR-T细胞动力学及抗原结合机制 | 计算生物学 | 癌症 | 数学模型与计算模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | CAR(嵌合抗原受体)工程化改造 | 医学 |
| 137 | 2025-10-05 |
Integrative strategies against multidrug-resistant bacteria: Synthesizing novel antimicrobial frontiers for global health
2025-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108018
PMID:40914328
|
综述 | 本文综述了对抗多重耐药菌的综合策略,包括新型抗菌方法的研究进展和协同治疗潜力 | 提出了结合病原体靶向和宿主导向策略的多层次治疗范式,探讨了多种新型抗菌方法的协同应用 | 存在生产规模化、监管审批、安全性和临床疗效验证等方面的挑战 | 评估各种治疗方法对抗多重耐药菌的协同潜力,重新思考未来抗菌药物管理 | 多重耐药细菌及其感染治疗策略 | NA | 传染病 | CRISPR-Cas系统、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 138 | 2025-10-05 |
Recent advances in microbially derived chlorinated antiparasitic compounds
2025-Oct, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-11018-0
PMID:39476277
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综述 | 系统回顾微生物来源的氯化抗寄生虫化合物研究进展及其药物开发潜力 | 首次对1963年至今微生物来源的氯化抗寄生虫化合物进行全面梳理,发现28种具有明确抗寄生虫活性的氯化化合物 | 微生物来源的氯化抗寄生虫化合物相关文献资料有限 | 开发更安全、选择性更高、环境友好且疗效增强的抗寄生虫药物 | 微生物来源的氯化天然代谢产物 | 药物化学与合成生物学 | 寄生虫病 | PKS、NRPS、PKS-NRPS生物合成途径 | NA | 文献数据 | 28种氯化化合物 | 合成生物学、组合化学、有机合成 | 微生物 | NA | 医药 |
| 139 | 2025-10-05 |
Microbial mineralization for remediating heavy metal-contaminated groundwater: mechanisms, applications, advances, and perspectives
2025-Sep-23, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-025-02753-w
PMID:40986195
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综述 | 本文系统综述了微生物矿化修复重金属污染地下水的机制、应用、进展与前景 | 结合文献计量学分析与工程案例,阐明了碳酸盐、硫化物和磷酸盐矿物形成驱动重金属固定的机制,并识别了当前研究前沿 | 极端环境中微生物活性受抑制,复杂污染系统处理效率低,矿化产物长期稳定性监测不足 | 探讨微生物矿化修复重金属污染地下水的机制与应用 | 重金属污染地下水及参与矿化修复的微生物 | 环境生物技术 | NA | 微生物矿化,文献计量分析 | NA | 文献数据,工程案例 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 140 | 2025-10-05 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-Sep-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
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研究论文 | 提出一种基于DNA纳米笼的模块化策略,用于构建稳定且具有自适应反馈调控的人工细胞器网络 | 首次利用四面体DNA框架和回文杂交链式反应在细胞外囊泡表面构建机械强化的仿生DNA纳米笼,并集成逻辑门控DNA元件实现环境响应性空间重构 | 未明确说明该系统的长期稳定性及在复杂生物环境中的实际应用效果 | 开发具有自适应反馈调控能力的人工细胞器网络构建平台 | 细胞外囊泡和DNA纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、回文杂交链式反应 | NA | NA | NA | DNA纳米组装 | 细胞外囊泡 | 逻辑门控DNA元件、自适应信号传导网络 | 合成生物学, 生物医学应用, 智能材料设计 |