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当前共找到 1531 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-09-02 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-07-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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综述 | 本文综述了通过单细胞纳米封装技术合成人工细胞-壳孢子的最新进展，重点介绍了有机、杂化及无机材料在保护细胞和增强功能方面的应用。 | 创新点在于系统分类和总结了单细胞纳米封装技术中不同材料类型（有机、杂化、无机）的应用，并强调了纳米壳在赋予细胞外源表型特性方面的多功能作用，为定制化人工孢子的设计提供了新方向。 | 本文未提及局限性，但可能因综述性质而缺乏对具体技术的深入实验验证。 | 旨在总结单细胞纳米封装技术的最新进展，并提出未来研究方向，以实现细胞内和周细胞水平的精细化学调控，构建定制化人工孢子。 | 人工细胞-壳结构，即通过化学合成方法制备的纳米封装细胞。 | 合成生物学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 |
| 122 | 2026-09-02 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-04-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文回顾了合成生物学在天然产物生物合成领域的最新进展，涵盖生物信息学工具、异源表达和途径工程三个方面。 | 综述了将生物信息学、实验和分析工具整合到天然产物发现流程中的新方法，并讨论了异源表达和组合生物合成等创新策略。 | 未提及具体局限性。 | 总结合成生物学在天然产物生物合成中的应用进展，包括工具开发、异源表达和途径工程。 | 天然产物及其生物合成基因簇（BGCs），涉及细菌、真菌和植物宿主。 | 合成生物学 | NA | 生物信息学工具、异源表达、组合生物合成 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | NA | NA | 细菌、真菌、植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 123 | 2026-09-02 |
Engineering highly active nuclease enzymes with machine learning and high-throughput screening
2025-03-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101236
PMID:40081373
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研究论文 | 该论文介绍了一种名为TeleProt的机器学习框架，该框架结合进化数据和实验数据来设计蛋白质库，并成功提高了降解慢性伤口生物膜的核酸酶催化活性，通过多轮高通量筛选获得了性能优于定向进化的酶变体 | 首次将进化与实验数据融合于机器学习框架中，设计了无需先验实验数据即可生成高性能初始库的方法，并发布了包含55,000个核酸酶变体的广泛基因型-表型活性数据集 | 未明确讨论在更新颖化学环境或不同酶类中的适用性，且依赖高通量实验成本，可能限制了在其他系统中的应用 | 优化酶在新型化学环境中的功能，特别是提高核酸酶降解慢性伤口生物膜的催化活性 | 核酸酶酶变体，以及慢性伤口生物膜 | 机器学习 | 慢性伤口感染（相关生物膜） | 高通量筛选 | 机器学习框架（TeleProt） | 基因型-表型数据（酶活性数据） | 55,000个核酸酶变体 | NA | NA | NA | 医学 |
| 124 | 2026-09-02 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-03, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本研究展示了来自Haliangium ochraceum的细菌微区室壳蛋白（BMC-H）在串联RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体表面组装成涂层，这些涂层受pH和蛋白质浓度影响，并能稳定存在，防止液滴融合，同时可选择性地富集折叠蛋白，为合成生物学提供了一种新的控制液-液相分离区室特性的方法 | 创新之处在于将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，通过设计RGG截短融合的BMC-H变体，在凝聚体表面形成稳定的涂层，从而控制液滴的融合行为，这是全新的一步 | 摘要未明确提及局限性，但可能包括涂层形成的条件依赖性（如pH和蛋白质浓度）以及对实际应用的环境敏感性 | 研究目的是利用基因编码的蛋白质涂层来调控液-液相分离凝聚体的表面特性，以应用于合成生物学中合成细胞或细胞器的构建 | 研究对象为Haliangium ochraceum的BMC-H壳蛋白、RGG-RGG结构域及其工程变体，以及TEV蛋白酶等折叠蛋白 | 合成生物学、蛋白质工程 | 不适用 | 蛋白质工程、液-液相分离、共聚焦显微镜 | 不适用 | 图像（显微镜图像） | 不适用（未提及样本数量） | 蛋白质融合 | 不适用（体外实验） | 设计了一种化学诱导二聚化系统，用于蛋白质凝聚体和涂层形成的调控 | 合成生物学、医学（潜在）、工业生物技术 |
| 125 | 2026-09-02 |
Synthetic Lipid Biology
2025-02-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一领域，整合了化学、生物学、物理学和工程学的研究方法，旨在通过构建、编辑、检测和分析脂质及生物膜来深入理解其性质和功能 | 首次将跨学科的脂质和膜研究统一为一个名为“合成脂质生物学”的新领域，强调理解与构建的紧密联系，并系统性地组织相关研究方法 | 作为综述，未提供具体的实验数据或验证结果，且该领域尚处于初期阶段，实际应用效果有待进一步验证 | 定义并推动合成脂质生物学领域的发展，通过构建和分析脂质及生物膜来增进对其生物学功能的理解 | 脂质分子及其形成的生物膜结构，包括其代谢、转运、相互作用和生物物理特性 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | 文献综述 | NA | 光遗传学、蛋白质工程 | NA | NA | 基础生物学、生物工程 |
| 126 | 2026-08-31 |
Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization
2025-09-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09366
PMID:40834351
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研究论文 | 本研究通过将金纳米颗粒包被的纳米马达锚定在凝聚液滴界面，并结合三元共聚物膜实现稳定，成功构建了具有运动能力的人工细胞模型，展示了光驱动的微马达平台。 | 首次将纳米马达与三元共聚物膜结合，稳定凝聚液滴并赋予其运动能力，实现光驱动的运动控制，填补了凝聚液滴人工细胞在运动功能上的空白。 | 运动性能依赖于激光刺激和纳米马达密度，且凝聚液滴的长期稳定性仍需进一步验证。 | 开发具有运动功能的凝聚液滴人工细胞，模拟自然细胞的运动特性。 | 凝聚液滴人工细胞系统，包含金纳米颗粒包被的纳米马达和三元共聚物膜。 | 合成生物学 | 不适用 | 纳米马达物理锚定、静电相互作用、表面等离激元热效应 | 不适用 | 图像、实验数据 | 不同浓度的纳米马达、不同尺寸的凝聚液滴 | 不适用 | 不适用 | 光驱动微马达平台（利用金纳米颗粒的等离激元热效应） | 生物医学、材料科学 |
| 127 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
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研究论文 | 本文描述了使用模块化克隆系统MoClo进行多基因构建体组装的实验方案 | 提供了一套标准化的MoClo系统组装多基因构建体的详细步骤，包括定义构建体结构、识别基本部件和载体，以及遵循标准规则进行单锅组装 | 未明确提及 | 介绍MoClo系统用于多基因构建体组装的方法，以促进合成生物学研究 | 多基因构建体及其组成部件和载体 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆，类型IIS酶DNA组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 多基因构建体 | 生物研究, 合成生物学 |
| 128 | 2026-08-29 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 本文介绍了一个软件工具，用于创建基于SBOL标准的构建计划表示，以模拟Type IIS介导的Golden Gate组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个将Golden Gate组装构建计划标准化为SBOL表示的软件工具，支持模拟Type IIS介导的组装反应，并实现机器可读的元数据存储 | 未在摘要中明确提及局限性 | 实现Golden Gate组装构建计划的标准化表示，以促进合成生物学中的信息交流和自动化 | Golden Gate组装标准（如MoClo、Phytobricks、Loop）和SBOL表示 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 文本和元数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | Golden Gate组装反应 | 工业生物技术 |
| 129 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文提供了克隆MoClo标准部件（level 0模块）的详细实验方案，包括引物设计、PCR扩增和Golden Gate克隆步骤 | 给出了用于MoClo系统的level 0模块克隆的标准化规程，特别涵盖了大片段部件的中间-1级克隆策略 | 未提及 | 为合成生物学研究者提供可复现的MoClo标准部件克隆方法 | MoClo标准部件（level 0模块）及其亚部件 | 合成生物学 | NA | PCR, Golden Gate克隆, DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 多基因构建体 | 工业生物技术 |
| 130 | 2026-08-29 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文介绍了一种利用声学分配器自动化和小型化Golden Gate DNA组装反应的方法，将反应体积从传统的10-25 μL减少到1 μL | 首次将声学液体处理技术应用于Golden Gate克隆反应的小型化，实现了无吸头、高通量、低成本的DNA组装自动化 | 摘要未提及具体局限性 | 开发并验证一种自动化、小型化的Golden Gate DNA组装反应协议，以减少试剂消耗和塑料废物 | Golden Gate克隆反应及其DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、声学液体处理 | NA | 实验数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | DNA组装反应（模块化克隆） | 工业生物技术 |
| 131 | 2026-08-29 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重纳米孔扩增子测序验证Golden Gate组装结果的方法，称为DuBA.flow工作流程。 | 提出了一种结合双条形码扩增子测序与纳米孔平台的DuBA.flow流程，实现了从单菌落到最终测序报告的全流程序列验证，适用于高组合复杂性的文库组装。 | 摘要未提及具体局限性。 | 提供一种详细、易操作的协议，用于对Golden Gate组装结果进行高效的序列验证，特别是在使用部分文库导致高组合复杂性的情况下。 | Golden Gate组装产物，包括转录单元和多基因构建体。 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | 测序数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元和多基因构建体的组装 | 工业生物技术 |
| 132 | 2026-08-29 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源Python包，用于在OpenTrons OT-2实验室机器人上自动化Golden Gate组装，并升级其功能以支持模块化克隆载体、突变文库和索引质粒文库的构建。 | 通过开源机器人自动化Golden Gate组装，提升了错误率、资源消耗和培训要求，适用于复杂DNA构建和组合文库，且成本低、易用。 | 未提及 | 提供低成本的自动化解决方案，以简化合成生物学中的Golden Gate克隆和文库构建。 | 自动化Golden Gate组装流程及升级能力 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 实验数据 | 未提及 | Golden Gate Assembly | NA | 模块化克隆载体、突变文库和索引质粒文库 | 工业生物技术 |
| 133 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装技术的高效构建大肠杆菌合成小RNA表达质粒的方法，并提供了相关协议和设计工具G-GArden | 提出了一种基于Golden Gate组装的质粒系列和快速构建合成小RNA表达质粒的协议，并开发了G-GArden工具用于辅助设计寡核苷酸和悬突以实现无痕组装 | 文中未提及具体局限性 | 开发快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，应用于合成生物学领域 | 大肠杆菌中的合成小RNA表达质粒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 质粒序列和寡核苷酸序列 | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 合成小RNA表达质粒 | 工业生物技术 |
| 134 | 2026-08-29 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种基于模块化Golden Gate组装的无克隆工作流程，用于快速生成线性DNA模板，以实现细胞-free转录和翻译系统的快速原型测试 | 提出了一种结合Golden Gate组装和PCR扩增的无克隆工作流程，能够在体外快速生成由多个基因部件组成的线性DNA模板，避免耗时的细胞转化和克隆步骤，实现一天内完成大量新组装构建体的测试 | 本文未明确提及局限性，但可能受限于线性DNA模板在细胞-free系统中的稳定性和组装效率 | 开发一种快速、模块化的方法，用于细胞-free原型测试遗传调控元件和电路，加速合成生物学的设计-构建-测试-学习循环 | 遗传调控元件和电路，包括启动子、核糖体结合位点、编码序列和终止子等基因部件 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、PCR扩增、细胞-free转录和翻译（TXTL） | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元由启动子、RBS、编码序列和终止子组成 | 工业生物技术 |
| 135 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 该文章描述了在莱茵衣藻中使用金门克隆和模块化克隆方法标准化组装基因元件，构建转基因表达盒的步骤 | 将模块化克隆（MoClo）工作流应用于莱茵衣藻，实现了基于金门组装的层级化、句法驱动的基因元件组装 | 标题和摘要中未提及研究的局限性 | 建立适用于莱茵衣藻的标准化转基因表达盒组装流程 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | 金门克隆、模块化克隆 | NA | DNA序列 | NA | 金门组装 | 莱茵衣藻 | 转基因表达盒 | 工业生物技术 |
| 136 | 2026-08-28 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-10-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
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研究论文 | 本文提出了一种名为STABLES的基因融合策略，通过将目标基因与必需内源基因连接并引入漏终止密码子，利用机器学习优化设计，以延长合成基因回路的进化半衰期，并在大肠杆菌中验证了其提高稳定性和产量的效果 | 创新性地采用机器学习框架预测最优基因融合对，并优化连接肽和DNA序列，以对抗进化不稳定性，且该策略具有物种无关性和可扩展性 | 实验验证仅限于特定宿主和部分目标基因，可能未涵盖所有生物体和复杂环境下的长期稳定性 | 提高合成基因回路的进化稳定性，减少异源基因表达随时间丢失的问题 | 合成基因回路中的目标基因（如荧光蛋白和人胰岛素原），以及其与必需内源基因的融合 | 合成生物学 | NA | 基因融合、机器学习、生物信息学分析、生物物理特征分析 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 生物序列数据、生物物理特征数据 | 实验涉及多种目标基因，包括荧光蛋白和人胰岛素原，具体样本数量未说明 | 基因融合技术 | 大肠杆菌 | 基因融合回路，包含目标基因、必需内源基因和漏终止密码子，旨在施加选择压力并维持表达 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 137 | 2026-08-28 |
An independent biosynthetic route to frame a xanthanolide-type sesquiterpene lactone in Asteraceae
2025-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17199
PMID:39642193
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研究论文 | 该研究揭示了菊科植物中黄酮内酯类倍半萜内酯（8-epi-xanthatin）的完整生物合成途径，包括通过细胞色素P450催化的氧化重排形成黄烷烃骨架，以及后续的12,8-内酯环形成 | 首次阐明12,8-黄酮内酯类倍半萜的完整生物合成途径，发现一条独立的生物合成路线，与已知的12,6-愈创木烷内酯途径形成对比，并鉴定了关键酶（一种不寻常的细胞色素P450） | 摘要中未提及具体局限性 | 阐明黄酮内酯类倍半萜内酯（特别是8-epi-xanthatin）的生物合成途径，为合成生物学应用提供基础 | 菊科植物中的黄酮内酯类倍半萜内酯生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物（用于合成生物学策略） | 黄酮内酯类倍半萜内酯的生物合成途径 | 合成生物学 |
| 138 | 2026-08-28 |
Deciphering the biosynthetic pathway of triterpene saponins in Prunella vulgaris
2025-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17220
PMID:39868644
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研究论文 | 本研究通过系统筛选方法，鉴定了夏枯草中三萜皂苷生物合成途径的关键基因，并进行了功能验证。 | 结合系统发育分析、基因表达评估、代谢组-转录组关联和共表达分析，从大型基因家族中精确鉴定出九个候选基因，并首次揭示了这些基因来源于全基因组复制事件。 | 未提及具体局限性。 | 阐明夏枯草中三萜皂苷的生物合成途径，为合成生物学工业生产和相关生物合成研究提供基础。 | 夏枯草中的三萜皂苷生物合成相关基因（两个OSCs、三个CYP716s和四个UGT73s）。 | 植物生物技术 | 不适用 | 系统发育分析、基因表达分析、代谢组-转录组关联分析、共表达分析、异源表达、酶活性测定 | 不适用 | 转录组数据、代谢组数据、序列数据 | 九个候选基因 | 不适用 | 异源表达宿主（具体未提及，可能为酵母或大肠杆菌） | 不适用 | 医药、工业生物技术 |
| 139 | 2026-08-27 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本研究通过数学模型分析配体-受体相互作用，发现受体二聚化（尤其是异源二聚化）能够通过群体水平的响应异质性编码配体身份，为配体判别提供新机制 | 首次提出配体判别可在群体层面通过响应异质性实现，引入局部缩放度量量化通路组分变异对细胞响应的影响，并揭示异源二聚体受体的功能优势 | 研究基于数学模型，缺乏实验验证；模型假设可能简化真实生物系统的复杂性 | 探究细胞如何通过受体架构在群体水平上区分不同配体信号 | 配体-受体相互作用系统，包括二聚化和异源二聚化受体，以及I型干扰素和Notch信号通路 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 数学模型（非特定机器学习模型） | 模拟数据 | 不适用（基于理论模型） | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 140 | 2026-08-27 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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研究论文 | 提出一种计算工具，通过机器学习模型预测ColE1样质粒拷贝数，强调启动子强度和RNA折叠动力学在复制起点中的作用 | 首次实现从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件解决方案，突破现有模型缺失的局限 | 未明确提及具体限制，但模型依赖于从复制起点提取的特征，可能对非ColE1样质粒适用性有限 | 简化质粒拷贝数设计，改进合成生物学和工业应用中的质粒工程流程 | ColE1样质粒的复制起点序列及其拷贝数 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | 序列数据 | 未提供具体样本数量 | NA | NA | 质粒复制起点 | 合成生物学、工业生物技术 |