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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-10-05 |
Synthetic pathways for microbial biosynthesis of valuable pyrazine derivatives using genetically modified Pseudomonas putida KT2440
2025-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2025.e00258
PMID:40236303
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研究论文 | 本研究通过基因工程改造Pseudomonas putida KT2440,构建了合成吡嗪衍生物的新型代谢途径 | 结合微生物宿主与非血红素二铁单加氧酶的异源表达,首次实现了2,5-二甲基吡嗪及其羧酸和氧化物衍生物的微生物生物合成 | 研究仍处于早期阶段,产物滴度有待进一步提高 | 开发微生物合成高价值吡嗪衍生物的生物技术方法 | 基因工程改造的Pseudomonas putida KT2440菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因编辑、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas putida KT2440 | L-苏氨酸代谢途径改造、吡嗪合成途径、单加氧酶催化途径 | 工业生物技术 |
| 1402 | 2025-10-05 |
Towards electrospray-assisted production of lipid-based synthetic cell assemblies
2025-Apr-16, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01284d
PMID:40035737
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研究论文 | 开发了一种基于电喷雾的技术ATLAES,用于形成基于脂质的囊泡组装体 | 提出无有机溶剂的水相两相系统(ATPS)模板化电喷雾技术,可形成具有高度稳定脂质涂层的微观囊泡 | NA | 扩展合成生物学工具箱,探索替代性脂质组装体和新生产方法 | 脂质基囊泡和合成细胞组装体 | 合成生物学 | NA | 电喷雾技术、水相两相系统(ATPS) | NA | NA | NA | ATLAES | NA | 脂质囊泡组装体 | 合成生物学 |
| 1403 | 2025-10-05 |
Characterization of the Biosynthesis of Pimprinine-Type Indolyloxazoles Unravels an Unusual d-Configurational Substrate Metabolic Streamline
2025-Apr-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01705
PMID:40178231
|
研究论文 | 本研究揭示了皮姆普林型吲哚恶唑生物碱的生物合成机制,发现了一条以前未知的D-构型底物代谢流线 | 首次阐明了PIAs生物合成途径,发现了三个关键酶(PimA、PimB、PimC)参与的D-构型底物代谢流线,其中PimB作为门控酶从L-色氨酸池中提供D-色氨酸前体 | NA | 解析皮姆普林型吲哚恶唑生物碱的生物合成途径 | 链霉菌NZY3中的PIAs生物合成基因簇及其编码的酶 | 合成生物学 | NA | 氘标记实验、18O标记实验、比较基因组挖掘 | NA | 实验数据、基因组数据 | NA | NA | 链霉菌 | D-构型底物代谢流线,涉及色氨酸消旋、N-酰化和自由基重排介导的环化机制 | 医药, 农业 |
| 1404 | 2025-10-05 |
Engineering biology applications for environmental solutions: potential and challenges
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58492-0
PMID:40229265
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综述 | 本文概述了工程生物学在环境解决方案中的应用潜力与挑战 | 整合工程生物学与纳米技术、物联网和人工智能等其他技术,并提出加速环境解决方案应用的策略 | NA | 探讨工程生物学在解决全球环境挑战中的应用前景和障碍 | 工程生物学技术在环境领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1405 | 2025-10-05 |
Integrating microbial communities into algal biotechnology: a pathway to enhanced commercialization
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1555579
PMID:40236480
|
综述 | 本文系统阐述了藻类微生物组的分类多样性、生态功能及其在增强藻类生物技术商业化应用中的潜力 | 首次综合探讨微生物组工程通过调控藻类-微生物互作来突破藻类培养经济与环境壁垒的变革潜力 | NA | 探索藻类微生物组在促进微藻培养可持续性和经济可行性方面的生物技术潜力 | 微藻及其关联的微生物群落 | 生物技术 | NA | 合成生物学、生态学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | 通过营养交换、生长调控、病原防御和环境调节增强藻类-微生物互作的工程化设计 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 1406 | 2025-10-05 |
Deciphering the biosynthetic potential of microbial genomes using a BGC language processing neural network model
2025-Apr-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf305
PMID:40226917
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研究论文 | 开发基于Transformer的BGC-Prophet模型用于微生物基因组中生物合成基因簇的预测和分类 | 首创基于Transformer编码器的超高通量BGC预测工具,能够捕捉基因间位置依赖关系 | NA | 挖掘微生物基因组和宏基因组中隐藏的生物合成基因簇潜力 | 微生物基因组和宏基因组中的生物合成基因簇 | 自然语言处理 | NA | Transformer语言模型 | Transformer | 基因组序列数据 | 85203个基因组和9428个宏基因组 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1407 | 2025-10-05 |
Programmable DNA-Based Nanodevices for Next-Generation Clinical and Healthcare Applications
2025-Apr, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400593
PMID:39913110
|
综述 | 本文探讨DNA纳米技术在医疗保健领域的应用潜力与当前挑战 | 系统分析DNA纳米器件在临床转化中的关键问题与发展趋势 | 未提出具体解决方案,主要聚焦于问题梳理与前景展望 | 促进DNA纳米结构向医疗应用的转化 | DNA纳米结构与纳米器件 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 自组装纳米结构 | 医学 |
| 1408 | 2025-10-05 |
Antimicrobial Peptides and Their Mimetics: Promising Candidates of Next-Generation Therapeutic Agents Combating Multidrug-Resistant Bacteria
2025-Apr, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400461
PMID:39913150
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综述 | 全面讨论天然与合成抗菌肽及其化学模拟物在对抗多重耐药菌方面的研究进展 | 整合人工智能技术探索化学空间,结合化学与合成生物学进展开发抗菌肽化学模拟物 | NA | 开发对抗多重耐药菌的新一代治疗药物 | 抗菌肽及其化学模拟物 | NA | 细菌感染 | 人工智能、化学合成、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1409 | 2025-10-05 |
Analysis of the intrinsic value of life in the context of synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1536403
PMID:40230464
|
研究论文 | 基于Ronald Sandler内在价值理论分析合成生命的伦理价值 | 首次系统构建合成生命内在价值的分析框架,提出从合成微生物到合成人类的价值递增序列 | 理论分析缺乏实证支持,价值判断标准存在主观性 | 探讨合成生命的内在价值以指导其伦理建构与应用 | 合成生命体(微生物、植物、无脊椎动物、脊椎动物、人类) | 合成生物学伦理 | NA | NA | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 1410 | 2025-10-05 |
Beyond the blood: expanding CAR T cell therapy to solid tumors
2025-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02446-2
PMID:39533105
|
综述 | 探讨CAR-T细胞疗法从血液肿瘤扩展到实体瘤的最新进展及未来策略 | 分析近期实体瘤CAR-T疗法取得突破的原因,并提出通过CAR工程和合成生物学策略持续拓展疗效 | NA | 探索CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的扩展应用和持续改进策略 | CAR-T细胞疗法在胶质母细胞瘤等实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床试验数据 | NA | 合成生物学 | T细胞 | CAR工程改造 | 医学 |
| 1411 | 2025-10-05 |
New avenues in photosynthesis: from light harvesting to global modeling
2025 Mar-Apr, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70198
PMID:40231858
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综述 | 本文综述了第二届欧洲光合作用研究大会的最新进展,重点关注提高光合作用效率和跨尺度建模 | 整合了优化光捕获与碳固定的策略、利用自然变异性的方法、极端环境植物适应性研究以及叶肉导度参数化改进 | NA | 通过改进光合作用效率和建模来解决粮食安全和环境可持续性等全球挑战 | 光合作用过程、植物性状、极端环境适应植物 | 植物生理生态学 | NA | 合成生物学、动态代谢建模 | 跨尺度光合作用模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 1412 | 2025-10-05 |
Toward Sustainable Polyhydroxyalkanoates: A Next-Gen Biotechnology Approach
2025-Mar-22, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17070853
PMID:40219244
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研究论文 | 本文探讨利用极端微生物和下一代生物技术生产可持续生物聚合物聚羟基脂肪酸酯(PHA)的方法 | 整合极端微生物与AI驱动发酵技术,利用CRISPR基因组编辑和替代原料优化PHA生产 | 未提及具体技术实施的经济性定量分析或大规模生产的实际障碍 | 开发可持续的PHA生物聚合物生产技术以替代石油基塑料 | 极端微生物(特别是嗜盐菌)及其代谢工程改造 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、CRISPR基因组编辑、AI驱动发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌(Halophiles) | 代谢通路优化 | 材料, 环境 |
| 1413 | 2025-10-05 |
Current Approaches for Genetic Manipulation of Streptomyces spp.-Key Bacteria for Biotechnology and Environment
2025-Jan-02, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14010003
PMID:39846552
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综述 | 本文综述了链霉菌遗传操作的最新方法与挑战,重点介绍了合成生物学策略在开发这类重要生物技术细菌中的应用 | 总结了DNA测序、分析和编辑技术进步带来的新策略,能够克服菌株和构建体特异性工程难题 | 现有方法仍存在菌株和设计依赖性的限制 | 探索、理解和操纵链霉菌作为生物技术关键细菌的能力 | 链霉菌属细菌 | 合成生物学 | NA | DNA测序、基因组挖掘、遗传构建体组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境 |
| 1414 | 2025-10-05 |
Harnessing hyperaccumulator plants to recover technology-critical metals: where are we at?
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20449
PMID:40066815
|
综述 | 本文回顾了植物采矿技术三十多年来的发展历程,重点探讨了利用超富集植物回收镍及其他关键金属的现状与潜力 | 首次系统整合了超富集分子机制研究进展与商业化植物采矿实践,提出通过定向育种和合成生物学改进超富集植物的新路径 | 目前仅镍元素实现商业化规模应用,其他金属(钴、硒、铊)的植物采矿潜力尚未充分开发 | 推动利用超富集植物回收技术关键金属的植物采矿技术发展 | 超富集植物及其对镍、钴、硒、铊等金属的富集机制 | 环境生物技术 | NA | 定向育种、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超富集植物 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 1415 | 2025-10-05 |
High throughput construction of species characterized bacterial biobank for functional bacteria screening: demonstration with GABA-producing bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1545877
PMID:40212379
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研究论文 | 开发了一种高通量细菌生物库构建和功能筛选平台,并成功筛选出高产GABA的功能菌株 | 采用双末端条形码策略实现数千个细菌分离株的混合纳米孔测序,开发了模块化荧光生物传感器系统用于代谢物检测 | 仅针对GABA产生能力进行了概念验证筛选,平台在其他代谢物检测中的适用性需要进一步验证 | 建立高效的功能细菌发现平台,推动工业生物技术发展 | 来自中国各地发酵食品和婴儿粪便的细菌分离株 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 全长16S rDNA测序, 桑格测序, 荧光生物传感 | NA | 基因组测序数据, 荧光信号数据 | 15,337个细菌分离株(生物库), 1,740个分离株(GABA筛选) | 双质粒系统 | 细菌 | 模块化生物传感器, 代谢物传感与信号报告解耦系统 | 工业生物技术, 益生菌开发 |
| 1416 | 2025-10-05 |
Determination of the genome-scale metabolic network of Bartonella quintana str. Toulouse to optimize growth for its use as chassis for synthetic biology
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1527084
PMID:40213639
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研究论文 | 本研究重建了Bartonella quintana str. Toulouse的基因组尺度代谢网络模型,以优化其作为合成生物学底盘细胞的生长条件 | 首次构建了Bartonella quintana的基因组尺度代谢模型,并通过实验验证确定了2-酮戊二酸等关键代谢物对其生长的必要性 | 模型准确性仍需进一步提高,某些补充条件下观察到意外的生存率下降现象 | 优化Bartonella quintana的生长条件,开发其作为合成生物学底盘细胞的潜力 | Bartonella quintana str. Toulouse菌株及其代谢网络 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢网络重建、通量平衡分析、蛋白质组学分析 | 基因组尺度代谢模型 | 基因组数据、代谢数据、蛋白质组数据 | NA | NA | Bartonella quintana | NA | 工业生物技术 |
| 1417 | 2025-10-05 |
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform
2025-Apr-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt0402
PMID:40203090
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研究论文 | 开发基于大语言模型的基因挖掘平台SYMPLEX,用于发现高质量mRNA加帽酶 | 首次将大语言模型应用于基因挖掘领域,突破了传统基于序列同源性或专家知识的限制 | 未明确说明平台验证的规模限制和错误率 | 建立通用的基因挖掘平台以扩展合成生物学高质量遗传部件库 | mRNA加帽酶 | 合成生物学 | NA | 大语言模型,体外活性测试,体内交叉物种活性验证 | 大语言模型 | 生物医学文献和数据库文本数据 | 46个候选完整加帽酶进行实验测试 | NA | NA | NA | 生物技术,医药 |
| 1418 | 2025-10-05 |
Harnessing RNA base editing for diverse applications in RNA biology and RNA therapeutics
2025-Apr-08, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00063-x
PMID:40198443
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综述 | 本文综述了RNA碱基编辑技术在RNA生物学和RNA治疗领域的多样化应用 | 系统阐述了RNA碱基编辑作为突破性技术的优势,包括可逆性、剂量依赖性效应,以及在转录组范围内绘制RNA结合蛋白互作图谱的能力 | NA | 探讨RNA碱基编辑技术在基础研究和转化应用中的潜力 | RNA碱基编辑技术及其应用 | 合成生物学 | NA | RNA碱基编辑(ADAR和APOBEC介导的A-to-I和C-to-U转换) | NA | NA | NA | NA | NA | RNA编辑传感器(响应特定RNA物种表达效应蛋白) | 医学, 合成生物学 |
| 1419 | 2025-10-05 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Apr, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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综述 | 本文综述了PHB解聚酶在生物塑料废物管理中的作用机制和应用前景 | 首次系统总结了胞外和胞内PHB解聚酶的结构特征、微生物来源及在PHB生物降解中的功能 | 主要基于文献综述,缺乏原始实验数据支持 | 探讨PHB解聚酶在生物可降解塑料废物处理中的应用潜力 | PHB解聚酶及其产生微生物 | 环境生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | Rhodobacter, Rhodospirillum, Ralstonia, Zoogloea, Pseudomonas, Sinorhizobium, Bacillus | NA | 环境 |
| 1420 | 2025-10-05 |
An inhibitor-free, versatile, fast, and cheap precipitation-based DNA purification method
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317658
PMID:40198694
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研究论文 | 开发了一种无需抑制剂、快速廉价的新型DNA纯化方法 | 通过使用离液盐和醇/聚乙二醇实现蛋白质去除和DNA沉淀的单步操作,突破了传统方法需要多步骤的限制 | 未明确说明方法的适用范围和可能存在的其他限制因素 | 解决商业硅胶柱纯化方法中存在的酶反应抑制问题 | DNA纯化技术 | 合成生物学 | NA | DNA沉淀纯化技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | E. coli | NA | 分子生物学, 合成生物学 |