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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-10-05 |
Mechanism and engineering of endoplasmic reticulum-localized membrane protein folding in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.03.006
PMID:40064436
|
综述 | 本文综述了酿酒酵母内质网膜蛋白折叠机制及代谢工程策略 | 系统总结膜蛋白折叠四步骤及其影响因素,并提出增强异源膜蛋白正确折叠的多维度工程策略 | 现有策略仍存在局限性,需进一步研究解决关键问题 | 研究内质网膜蛋白折叠机制及优化策略 | 酿酒酵母中的内质网定位膜蛋白(如细胞色素P450) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 膜蛋白工程、分子伴侣共表达、脂质工程 | 工业生物技术 |
| 1422 | 2025-10-05 |
Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70095
PMID:40116553
|
研究论文 | 开发了一种在莱茵衣藻中操纵倍性水平的合成生物学策略 | 使用非干扰性抗生素选择标记工程化倍性,可应用于野外分离株而不仅限于特定营养缺陷型实验室菌株 | 新形成的三倍体和四倍体显示出快速非整倍体化的迹象 | 研究倍性变化对植物进化的影响 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 基因组大小数据 | 北美野外分离株 | 抗生素选择标记 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 倍性操纵系统 | 基础研究,应用研究 |
| 1423 | 2025-10-05 |
Powering the Future: Unveiling the Secrets of Semiconductor Biointerfaces in Biohybrids for Semiartificial Photosynthesis
2025-Jan-23, Artificial photosynthesis (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/aps.4c00008
PMID:40200990
|
综述 | 本文综述了半人工光合作用中半导体-生物界面在生物混合系统中的作用机制与研究进展 | 系统揭示半导体与微生物之间电荷转移机制的研究空白,提出结合先进光谱学、显微镜学和合成生物学工具的研究路径 | 缺乏对光-半导体-微生物组合产化学品的明确机理理解,商业化应用仍面临基础挑战 | 通过研究半导体-微生物界面的电荷转移动力学,提高太阳能-化学能转换效率以实现工业应用 | 生物混合系统中的半导体-微生物界面 | 合成生物学 | NA | 先进光谱学、显微镜学、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 电活性微生物 | 半导体作为微生物的电子供体或受体的人工光合系统 | 能源, 环境 |
| 1424 | 2025-10-05 |
An innovative high-throughput genome releaser for rapid and efficient PCR screening
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1547909
PMID:40200958
|
研究论文 | 开发了一种用于快速高效PCR筛选的高通量基因组释放器 | 采用压片法实现快速、经济高效的DNA提取,无需提取缓冲液,与标准液体处理机器人平台兼容 | NA | 解决当前高通量PCR筛选方法中DNA提取效率低、成本高和可扩展性限制等问题 | 真菌孢子及其他微生物和细胞类型 | 合成生物学 | NA | PCR筛选、DNA提取 | NA | 基因组DNA | 96孔板规格 | NA | 真菌、多种微生物和细胞类型 | NA | 生物制造 |
| 1425 | 2025-10-05 |
Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy
2025-Jul, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128156
PMID:40158322
|
综述 | 探讨生物工程化微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力 | 系统阐述通过合成生物学技术改造微生物组以增强免疫检查点抑制剂疗效的创新策略 | 存在遗传稳定性、肿瘤定植效率和安全控制等挑战 | 研究微生物组在癌症免疫治疗中的作用机制及工程化改造策略 | 胃肠道微生物组和肿瘤内细菌群体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917, 乳酸乳球菌, 双歧杆菌, 拟杆菌 | 生物传感器, 靶向递送系统 | 医学 |
| 1426 | 2025-10-05 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Apr-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
|
研究论文 | 本文提出了一种控制膜化凝聚体去膜化的策略,实现凝聚体结构的动态重构和功能调控 | 通过静电竞争机制实现凝聚体的可控去膜化,并创建具有双层和Janus-like不对称膜结构的凝聚体原细胞 | NA | 开发具有动态可重构膜结构的合成原细胞系统 | 膜化凝聚体液滴和去膜化凝聚体液滴 | 合成生物学 | NA | 去膜化技术、静电竞争机制 | NA | NA | NA | NA | NA | 膜化/去膜化动态重构系统、双层膜结构、Janus-like不对称膜结构 | 合成生物学, 系统生物学, 生物技术 |
| 1427 | 2025-10-05 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
|
研究论文 | 本研究探索了不同来源PARP酶的调控域和催化域之间的交叉互补功能 | 首次证明不同PARP同源物的调控域和催化域可形成功能性嵌合组装体 | 仅进行体外实验,尚未在活细胞中验证 | 研究PARP酶调控域和催化域的交叉互补机制 | 来自哺乳动物、植物和细菌的PARP酶结构域 | 合成生物学 | NA | 定性和定量酶活性测定、结合研究 | NA | 酶活性数据、结合亲和力数据 | 四种PARP酶(hPARP1、hPARP2、atPARP2、haPARP)的结构域 | 结构域组装 | NA | 嵌合PARP组装体 | 医学, 工业生物技术 |
| 1428 | 2025-10-05 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
|
研究论文 | 本研究从云南地不容中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs,通过蛋白质工程成功调控了其区域选择性 | 通过定点突变操纵底物结合微环境,将SyOMT4转化为高特异性BIA 6OMT,将SyOMT5工程化为BIA NMTs | NA | 扩展BIA O-甲基转移酶的功能库,为药用重要BIAs的生产提供酶工具 | 云南地不容中的两个苯基异喹啉生物碱O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学 | COVID-19 | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点诱变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点诱变 | 植物 | 酶催化区域选择性调控 | 医药 |
| 1429 | 2025-10-05 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
|
研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子系统性地表征了Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子中的9个氨基酸反式激活结构域的功能 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面表征9aaTADs功能,发现其中10个具有活性并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制发挥作用 | 仅研究了Mxr1转录因子中的9aaTADs,其他类型转录因子的类似结构域功能尚未探索 | 阐明K. phaffii酵母Mxr1转录因子中多个9个氨基酸反式激活结构域的功能特性和作用机制 | Komagataella phaffii酵母Mxr1转录因子及其21个推测的9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除、功能互补实验 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 21个推测的9aaTADs和1个已知TAD A | 合成转录因子设计 | Komagataella phaffii | 由Mxr1ZF DNA结合结构域与多个9aaTADs组合构成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 1430 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1431 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1432 | 2025-10-05 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
|
研究论文 | 通过文献计量学和知识图谱方法分析亚胺还原酶(IREDs)研究的发展历程和研究格局 | 首次通过文献计量学方法对IREDs研究领域进行可视化分析,揭示该领域的发展轨迹和研究热点 | 仅基于Web of Science数据库的239篇文献进行分析,可能存在文献覆盖不全的局限 | 探索IREDs研究的整体格局和演进路径 | 2010-2024年间发表的239篇IREDs相关研究论文和综述 | 生物信息学 | NA | 文献计量分析、知识图谱构建 | NA | 文献数据 | 239篇研究论文和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
| 1433 | 2025-10-05 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
|
前言 | 本期特刊聚焦人工智能驱动的生物制造领域,综述其发展机遇、挑战与现状,并展望未来发展趋势 | 探讨系统生物学与合成生物学快速发展背景下,生物大数据和信息技术与生物技术的深度融合 | NA | 把握人工智能驱动生物制造的创新发展,为促进该领域技术创新和产业发展提供参考 | 生物制造领域的技术方法和发展趋势 | 生物制造 | NA | 系统生物学、合成生物学、人工智能技术 | NA | 生物大数据 | NA | NA | NA | 生物部件、电路和人工细胞的智能设计与构建 | 工业生物技术 |
| 1434 | 2025-10-05 |
Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency
2025-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81235-y
PMID:39779752
|
研究论文 | 本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率,探索提高植物遗传转化效率的新途径 | 首次系统比较杨树地上和地下器官外植体的再生能力与转化效率,发现根外植体具有显著再生潜力,并通过转录组分析揭示了相关基因表达机制 | 研究仅针对杨树这一木本多年生生物能源作物,结果可能不适用于其他植物物种 | 提高植物遗传转化效率,最大化植物材料利用率 | 杨树的不同外植体类型(叶、茎、叶柄和根) | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的植物转化、转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据、形态观察数据 | 杨树的四种不同外植体类型 | 农杆菌介导转化 | 杨树 | NA | 能源, 工业生物技术 |
| 1435 | 2025-10-05 |
Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly
2025-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58379-0
PMID:40148329
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研究论文 | 通过自组装将分子逻辑计算扩展到介观系统,展示膜结构可作为Reset-Set触发器并集成其他逻辑元件 | 首次实现人工分子基介观系统本征执行逻辑运算,将分子逻辑计算扩展到连续尺寸范围 | NA | 开发能够在介观尺度执行逻辑运算的分子自组装系统 | 环芳烃八羧酸盐和阳离子表面活性剂的自组装系统 | 合成生物学 | NA | 自组装技术 | Reset-Set触发器,逻辑元件 | NA | NA | NA | NA | Reset-Set触发器集成7个逻辑元件 | 生物学,合成生物学 |
| 1436 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms
2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12030324
PMID:40150788
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研究论文 | 本文探讨了Frederick Griffith转化实验的演变过程及其在创造新型微生物方面的潜力 | 分析了经典转化实验设计从考虑结构和控制信息到仅关注蛋白质合成指导信息的演变过程 | 未提供具体的实验数据验证转化在创造新型微生物中的实际应用潜力 | 研究转化实验方法在合成生物学中创造新型微生物的潜力 | 肺炎球菌转化实验及其演变 | 合成生物学 | NA | 基因组转化技术 | NA | 文献分析 | NA | NA | 肺炎球菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1437 | 2025-10-05 |
Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015
PMID:40151792
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研究论文 | 通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶,在大肠杆菌中提高germacrene A产量 | 结合分子对接和系统发育分析确定关键残基进行诱变,获得产量提高近10倍的Y376L突变体 | NA | 构建高产germacrene A的萜类化合物底盘细胞 | 加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶(ScGAS) | 合成生物学 | 癌症 | 分子对接、系统发育分析、定点诱变 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 异源MVA途径、germacrene A生物合成途径 | 医药 |
| 1438 | 2025-10-05 |
Anti-Cancer Strategies Using Anaerobic Spore-Forming Bacteria Clostridium: Advances and Synergistic Approaches
2025-Mar-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15030465
PMID:40141809
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综述 | 本文综述了利用厌氧孢子形成细菌梭菌的抗癌策略进展及其与现有疗法的协同作用 | 探讨了基于梭菌疗法在实体瘤缺氧微环境中的独特靶向优势,以及通过合成生物学手段进行基因改造增强其治疗潜力 | 尽管临床前和临床研究显示前景,但仍存在持续挑战需要解决 | 评估梭菌在癌症治疗中的潜力及与其他疗法的协同效应 | 厌氧孢子形成细菌梭菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因改造技术 | NA | NA | NA | NA | 梭菌 | 通过去除α毒素基因等遗传修饰增强治疗安全性 | 医学 |
| 1439 | 2025-10-05 |
Engineering Useful Microbial Species for Pharmaceutical Applications
2025-Mar-05, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030599
PMID:40142492
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综述 | 本文全面探讨微生物工程在制药生物技术领域的最新进展,包括关键技术突破、监管挑战和未来发展前景 | 整合CRISPR-Cas系统、合成生物学与人工智能技术,系统优化微生物菌株用于药物生产 | 代谢通路优化效率不足、工业规模生产可持续性挑战、国际监管要求达标困难 | 通过微生物工程技术创新推动制药生物技术发展 | 工程化微生物菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统, 合成生物学, 人工智能, 机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 代谢通路优化, 合成生物学通路 | 医药 |
| 1440 | 2025-10-05 |
Where Biology Meets Engineering: Scaling Up Microbial Nutraceuticals to Bridge Nutrition, Therapeutics, and Global Impact
2025-Mar-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030566
PMID:40142459
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综述 | 探讨微生物平台在营养保健品生产中的变革性作用及其对全球健康的影响 | 系统阐述微生物生物技术作为传统营养保健品可持续替代方案的创新潜力,整合CRISPR/Cas9基因组编辑与组学技术等前沿方法 | NA | 分析微生物营养保健品的规模化生产策略及其应对全球营养与慢性病挑战的潜力 | 微生物平台生产的营养保健品(如多不饱和脂肪酸、生物活性肽) | 合成生物学 | 肥胖, 糖尿病, 心血管疾病, 癌症 | 发酵技术, 合成生物学, 代谢工程, 基因组编辑, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 代谢通路工程 | 医药, 食品 |