本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2025-10-05 |
Synthetic gene circuits in plants: recent advances and challenges
2025, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2025.3
PMID:40070723
|
综述 | 本文综述了植物合成生物学中合成基因回路的最新进展与挑战 | 系统总结了植物合成基因回路在基因表达可编程控制方面的最新进展,并提出了未来研究方向 | NA | 探讨植物合成生物学中合成基因回路的设计、构建与应用 | 植物合成基因回路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 合成基因回路,用于基因表达的可编程控制 | 农业 |
| 1462 | 2025-10-05 |
There and turn back again: the application of phage serine integrases in eukaryotic systems
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1478413
PMID:40066361
|
综述 | 概述丝氨酸整合酶在真核系统中的应用及其在合成生物学中的潜力 | 强调丝氨酸整合酶在真核细胞中的创新应用方式及新重组因子(RDFs)的持续发现 | NA | 更新丝氨酸整合酶在真核细胞中的研究进展并推动遗传工程应用 | 噬菌体丝氨酸整合酶及其在真核系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组技术 | NA | NA | NA | 丝氨酸整合酶 | 真核细胞 | DNA序列插入、切除或倒位 | 医学,农业,环境科学 |
| 1463 | 2025-10-05 |
Comprehensive strategies for paclitaxel production: insights from plant cell culture, endophytic microorganisms, and synthetic biology
2025-Mar, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae346
PMID:40061810
|
综述 | 本文系统总结了紫杉醇生产的综合策略,包括植物细胞培养、内生微生物利用和合成生物学方法 | 整合比较了三种主要紫杉醇生产策略的最新进展,并指出合成生物学在部分重建紫杉醇合成途径方面的突破 | 目前仍无法实现紫杉醇的完全生物合成,内生微生物产量和稳定性有限,植物细胞培养需要进一步优化 | 探讨紫杉醇工业化生产的优化策略和未来发展方向 | 紫杉醇生物合成途径、红豆杉植物细胞、内生真菌、微生物和植物底盘 | 合成生物学 | 癌症 | 植物细胞悬浮培养、微生物发酵、合成生物学技术 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 微生物、植物底盘 | 紫杉醇生物合成途径的部分重建 | 医药 |
| 1464 | 2025-10-05 |
Anti photoaging mechanism of a novel recombinant human fibronectin peptide (rhFNP) derived from the extracellular matrix
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42730
PMID:40061928
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学构建新型重组人纤连蛋白肽(rhFNP),并系统评估其在光老化模型中的抗炎和细胞外基质重塑作用 | 首次利用合成生物学技术构建重组人纤连蛋白肽,并采用多物种模型(细胞、斑马鱼、小鼠)系统验证其抗光老化机制 | 研究主要聚焦于体外和动物模型,尚未进行人体临床试验验证 | 开发新型抗光老化生物活性肽并阐明其作用机制 | HaCaT、P815、NHEK细胞、斑马鱼、KM小鼠光老化模型 | 合成生物学 | 皮肤光老化 | 合成生物学、转录组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织形态学数据 | 多种细胞系、斑马鱼和KM小鼠模型 | 合成生物学 | NA | 重组人纤连蛋白肽的生物合成 | 医药 |
| 1465 | 2025-10-05 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
|
研究论文 | 本研究通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数和正交兼容性的合成复制起点质粒系统 | 创建了可调节拷贝数的合成复制起点,开发了使用合成RNA调节器实现独立拷贝控制的兼容性起点,并构建了6种正交SynORI质粒库 | 目前仅在E. coli中进行了为期一周的验证,尚未在其他微生物宿主中进行测试 | 开发具有可调性和模块化特性的合成质粒复制系统 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、合成生物学方法 | NA | NA | 6种正交SynORI质粒在E. coli中共同维持一周 | 合成生物学方法 | E. coli | 合成复制起点、RNA调节器、可响应环境信号的多路拷贝报告系统 | 工业生物技术 |
| 1466 | 2025-10-05 |
From specialization to broad adoption: Key trends in droplet microfluidic innovations enhancing accessibility to non-experts
2025-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0242599
PMID:40046719
|
观点文章 | 概述提高液滴微流控系统稳健性和可访问性的最新进展 | 探讨商业化和自主研发设备如何共同推动液滴微流控技术向非专业用户的普及 | 商业解决方案的适应性通常受限于内部开发设备 | 促进液滴微流控技术在非专业实验室中的广泛应用 | 液滴微流控技术平台及其操作流程 | 微流控技术 | NA | 液滴生成、试剂添加、分裂、洗涤、孵育、分选和分配 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 分析应用、单细胞研究、合成生物学、定向进化、诊断 |
| 1467 | 2025-10-05 |
Nucleic Acid Framework-Enabled Spatial Organization for Biological Applications
2025-Feb-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00164
PMID:40041004
|
综述 | 本文总结了核酸框架在生物应用中的空间组织功能,重点介绍DNA折纸和四面体DNA纳米结构在生物传感、成像和纳米医学等领域的应用 | 系统阐述核酸框架在二维和三维空间组织中的独特优势,及其在仿生蛋白质/生物膜和无机纳米粒子可控合成中的创新应用 | NA | 探讨核酸框架在生物技术领域的空间组织功能和应用前景 | 核酸框架(DNA折纸和四面体DNA纳米结构)及其生物医学应用 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 纳米技术 |
| 1468 | 2025-10-05 |
Designer mammalian living materials through genetic engineering
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.007
PMID:40034809
|
综述 | 探讨通过基因工程策略构建具有定制化功能和空间排列的哺乳动物活体材料的最新进展 | 提出结合由内而外和由外而内细胞工程方法的协同作用,实现前所未有的细胞排列控制和可定制治疗功能 | NA | 开发具有定制化细胞功能和空间排列的哺乳动物活体材料 | 哺乳动物细胞密集材料和细胞组装体 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、合成生物学工具箱 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 定制化细胞功能电路、空间排列控制电路 | 医学、组织工程 |
| 1469 | 2025-10-05 |
Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases
2025-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258
PMID:39971105
|
研究论文 | 通过在酿酒酵母底盘细胞中删除内源性糖苷酶基因,提高药物样天然产物糖基化效率的研究 | 首次系统评估了删除EXG1和SPR1外切糖苷酶对天然产物糖基化效率和区域选择性的影响,并发现大环内酯糖缀合物对EXG1水解具有抗性 | 仅测试了18种糖苷配基中的13种显示出改善效果,未涵盖所有天然产物类型 | 提高天然产物及其类似物的糖基化效率和区域选择性 | 苯二酚内酯家族聚酮化合物和苯丙素类多酚 | 合成生物学 | NA | 糖基化工程、基因敲除、生物催化 | NA | 代谢产物分析数据 | 18种糖苷配基 | 基因敲除 | 酿酒酵母 | 糖基化途径工程 | 医药,营养保健品,作物保护 |
| 1470 | 2025-10-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
|
综述 | 本文综述了合成生物学方法在酿酒酵母进化工程中的应用及其在生物制造领域的潜力 | 系统总结了合成生物学工具在酵母进化工程中的最新进展,特别关注转录调控、模板依赖和非模板方法的综合应用 | NA | 探讨合成生物学方法在设计和工程化酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、进化工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母 | 转录调控电路、代谢途径工程、生物传感器 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 1471 | 2025-10-05 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
|
综述 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用及其与机理建模结合的潜力 | 提出机器学习与机理建模结合的混合方法,利用数据驱动模型的优势与基于机理模型的规范性能力 | 需要克服相关挑战才能充分发挥这些方法的潜力 | 提升合成基因电路工程从单个组件到电路层面的设计能力 | 合成基因电路及其与宿主细胞机器的相互作用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 能够执行操作、检测信号和调节细胞功能的工程生物电路 | 医学,能源,食品,环境 |
| 1472 | 2025-03-01 |
Next-generation biotechnology inspired by extremes : The potential of extremophile organisms for synthetic biology and for more efficient and sustainable biotechnology
2025-Feb-27, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00389-6
PMID:40016427
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1473 | 2025-10-05 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
|
研究论文 | 本研究通过基因组学、转录组学和合成生物学方法揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物dermolutein和physcion的生物合成途径 | 发现了与子囊菌非直系同源的nrPKS和OMT酶,表明担子菌中该途径的平行进化起源 | NA | 开发异源生产Cortinarius蒽醌类色素的方法 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇中的蒽醌生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学, 转录组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两种Cortinarius蘑菇物种 | NA | 酿酒酵母 | 蒽醌支架化合物emodin和endocrocin的生物合成及其甲基化途径 | 纺织, 涂料, 电子, 化妆品, 农业 |
| 1474 | 2025-10-05 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
|
综述 | 本文综述了水稻微生物组的多样性、功能作用及微生物组工程策略,旨在通过微生物组工程实现可持续水稻生产 | 系统探讨微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的发展,并提出通过微生物组塑造基因(M基因)培育抗病性状的新途径 | 微生物制剂的商业化成功受土壤特性、田间环境条件和植物基因型等多种因素限制,需要进一步探索 | 通过微生物组工程增强水稻的生物施肥、胁迫耐受性和气候适应性,实现可持续水稻生产 | 水稻微生物组(根际、叶际和内共生微生物)及其功能 | 农业生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 水稻 | NA | 农业 |
| 1475 | 2025-10-05 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
|
研究论文 | 本研究从金线吊乌龟中鉴定并表征了两个参与头花千金藤素生物合成途径的6-O-甲基转移酶Se6OMT1和Se6OMT3 | 首次发现Se6OMT3对(R)和(S)构型的1-苄基异喹啉生物碱均具有C6、C7和C4'位点的催化活性,揭示了酶在立体异构体底物上的底物混杂性 | 未在体内验证这些酶的生物学功能,且对(R)立体异构体底物的研究仍较初步 | 阐明头花千金藤素生物合成途径中负责(R)和(S)立体异构体生产的O-甲基转移酶 | 金线吊乌龟中的三个O-甲基转移酶及其对九种(R)和(S)构型1-苄基异喹啉生物碱的催化活性 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生化实验数据 | 三个OMT基因,九种1-BIA底物 | 代谢工程 | 金线吊乌龟 | 头花千金藤素生物合成途径 | 医药 |
| 1476 | 2025-10-05 |
Harnessing Gut Microbiota for Biomimetic Innovations in Health and Biotechnology
2025-Jan-24, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics10020073
PMID:39997096
|
综述 | 探讨肠道微生物群作为仿生创新灵感来源在医疗和生物技术领域的应用潜力 | 系统阐述微生物群仿生学的创新潜力,包括个性化益生菌、人工微生物组和仿生生物传感器等应用 | 人工环境中微生物复杂性复制的困难、基因工程微生物的伦理问题以及先进疗法的公平获取 | 探索基于微生物群的仿生创新在医疗和生物技术领域的应用前景 | 肠道微生物群及其仿生应用 | 生物技术 | NA | 人工智能、生物工程、多组学方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医疗, 环境 |
| 1477 | 2025-10-05 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
|
研究论文 | 介绍了一个基于网络的DNA突变设计工具DNAdesign,可同时考虑DNA序列和形状特征进行突变设计 | 首次实现了同时考虑DNA序列和形状特征的突变设计,提供交互式可视化比较突变候选与野生型DNA分子 | NA | 开发能够同时考虑DNA序列和形状特征的突变设计工具 | DNA序列和形状特征 | 合成生物学 | NA | Deep DNAshape预测,扩展k-mers,物理化学编码 | NA | DNA序列数据 | NA | DNAdesign | NA | 合成增强子和转录因子结合位点设计 | 合成生物学,基因调控研究 |
| 1478 | 2025-10-05 |
Cell-free systems: A synthetic biology tool for rapid prototyping in metabolic engineering
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108522
PMID:39863189
|
综述 | 本文综述了无细胞系统作为合成生物学工具在代谢工程快速原型设计中的应用 | 强调无细胞系统通过体外区室化策略实现超高通量筛选,显著提高原型设计效率 | NA | 评估无细胞系统作为多功能原型设计平台的潜力 | 基因调控、酶和多酶反应系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、体外区室化 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基因回路、代谢途径、酶功能原型设计 | 工业生物技术、医药 |
| 1479 | 2025-10-05 |
On Emergence of Spontaneous Oscillations in Kombucha and Proteinoids
2025, BioNanoScience
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s12668-024-01678-5
PMID:39980746
|
研究论文 | 本研究探讨康普茶和类蛋白体中的自发振荡现象及其与生命起源的潜在联系 | 首次系统比较康普茶和类蛋白体中的自发振荡现象,揭示其作为从无序到有序转变的关键机制 | 未明确说明实验样本数量和具体实验条件 | 探索生物系统中从混沌到有序的自发振荡机制及其在生命起源中的作用 | 康普茶(细菌和酵母群落)和类蛋白体(原始蛋白质形式) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | 自发振荡系统, 自组织网络 | 合成生物学, 生物技术 |
| 1480 | 2025-10-05 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
|
研究论文 | 介绍一种名为DAPE的新型DNA克隆方法,通过修饰引物在PCR产物中产生特定长度的3'单链末端 | 开发了能够精确控制3'突出端长度的DNA组装方法,克服传统SLIC技术无法克隆小片段DNA的限制 | NA | 开发更高效的DNA组装技术用于合成生物学 | DNA片段组装方法 | 合成生物学 | NA | PCR, 磷酸硫酯修饰, T5核酸外切酶 | NA | DNA序列数据 | NA | DAPE克隆 | NA | 多基因电路构建 | 工业生物技术 |