合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1563 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-12-24 |
MULTIMODAL CELL CONTEXT INSTRUCTION TUNING FOR CONDITIONAL DNA REGULATORY SEQUENCE GENERATION WITH LARGE LANGUAGE MODELS
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084625
PMID:41426347
|
研究论文 | 提出了一种名为Leonine的新型框架，通过多模态细胞上下文指令调优，利用大型语言模型生成条件性DNA调控序列 | 将增强子序列设计重新定义为细胞上下文中的多模态问答任务，整合DNA序列、启动子序列、基因表达谱和细胞类型信息 | NA | 设计具有细胞类型特异性的生物合理调控序列，特别是增强子 | DNA调控序列（增强子） | 合成生物学 | NA | 大型语言模型（LLMs） | LLM | DNA序列、启动子序列、基因表达谱、细胞类型信息 | 超过150万个细胞类型特异性启动子-增强子对 | NA | NA | 增强子设计 | 医学 |
| 142 | 2025-12-24 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
|
研究论文 | 本研究揭示了人工酒精依赖性半萜（ADH）途径中PhoN酶和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛底物特异性，并成功在体内合成了非天然烷基化色氨酸衍生物 | 首次将ADH模块与异戊二烯基转移酶的底物宽泛性相结合，实现了非天然烷基化色氨酸衍生物的体内生物合成 | 未明确说明该途径的产率、规模化生产可行性及对其他下游酶普适性的系统验证 | 拓展异戊二烯类天然产物的结构多样性，推动合成生物学在萜类化合物生物合成中的应用 | 人工酒精依赖性半萜（ADH）途径中的PhoN酶、IPK激酶及芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 酶促反应、体内生物合成 | NA | 酶学特性数据、代谢产物分析数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌（E. coli） | 人工酒精依赖性半萜（ADH）代谢途径，包含PhoN磷酸酶、IPK激酶和芳香族异戊二烯基转移酶模块 | 工业生物技术 |
| 143 | 2025-12-24 |
Derepression of transposable elements in mouse prefrontal cortex disrupts social behavior
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646358
PMID:40236017
|
研究论文 | 本研究采用合成生物学方法，通过改造TRIM28蛋白在小鼠前额叶皮层中的功能，探究其对社交行为的影响 | 首次通过合成生物学手段在活体小鼠中逆转TRIM28的转录调控功能，揭示其通过稳定转座元件调控免疫基因表达以维持社交行为的新机制 | 研究主要关注前额叶皮层，未全面评估其他脑区的影响；实验对象仅限于小鼠，人类相关性有待验证 | 探究TRIM28-KZFP相互作用在调控转座元件和免疫基因表达中对小鼠社交行为的影响 | 雄性和雌性小鼠的前额叶皮层及TRIM28蛋白功能 | 合成生物学 | NA | RNA测序、病毒介导的基因递送 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 雄性和雌性小鼠（具体数量未明确） | 病毒载体系统 | 小鼠 | 通过替换TRIM28的转录抑制域为激活域VP64-p65-Rta，或删除调控域，构建功能逆转的TRIM28变体 | 医学 |
| 144 | 2025-12-24 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
|
综述 | 本文回顾了转录因子生物传感器从1960年代至今的发展历程，包括基础研究和工程策略的关键里程碑，并探讨了未来前景、挑战和未开发机遇 | 系统分析了转录因子生物传感器在基础知识和工程策略上的历史演变，并整合了多学科方法如高通量工具和计算学习来扩展其应用 | NA | 回顾转录因子生物传感器的发展历史，分析其工程策略，并讨论未来研究方向 | 转录因子生物传感器，包括其DNA和蛋白质层面的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录因子生物传感器，基于原核生物转录调控机制 | 生物技术 |
| 145 | 2025-12-23 |
Microbial engineering for sustainable microplastic biodegradation: from enzyme redesign to synthetic consortia
2025-Dec-22, International microbiology : the official journal of the Spanish Society for Microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s10123-025-00760-6
PMID:41423577
|
综述 | 本文综述了利用微生物和酶工程进行可持续微塑料生物降解的最新进展，包括酶重新设计、合成菌群及CRISPR技术的应用 | 结合CRISPR系统、计算与机器学习驱动的酶设计以及合成菌群，以增强生物降解效率，并连接实验室研究与实际应用 | 聚乙烯和聚苯乙烯降解的可扩展性、转基因生物的生物安全标准以及降解副产物的环境风险仍存在挑战 | 通过微生物和酶工程促进微塑料的可持续生物降解，支持循环生物经济模型 | 微塑料、微生物（如细菌和真菌）、酶（如PET水解酶） | 合成生物学 | NA | CRISPR系统（包括碱基编辑和启动子修饰）、计算与机器学习驱动的酶设计、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌 | 合成菌群、生物膜反应器、酶-纳米颗粒偶联物 | 环境、工业生物技术 |
| 146 | 2025-12-23 |
Synthetic biology strategies for engineering probiotics and commensal bacteria for diagnostics and therapeutics
2025-Dec-18, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108782
PMID:41421426
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学工具和策略改造益生菌和共生菌，以用于人类疾病诊断和治疗的最新进展 | 重点介绍了合成基因回路如何显著提高疾病诊断和治疗的精确性与可靠性，实现实时监测、治疗甚至预防性干预 | NA | 开发用于人类疾病诊断和治疗的工程化益生菌和共生菌 | 益生菌和人体共生菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 益生菌， 共生菌 | 合成基因回路 | 医学 |
| 147 | 2025-12-23 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2025-Nov-26, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
|
综述 | 本文全面概述了基于色蛋白的研究进展，包括其理化特性、分类、工程策略和应用 | 强调色蛋白作为可见工具在合成生物学中的独特优势，如裸眼可见性、广泛表达和可调性 | NA | 推动合成生物学中可见色蛋白报告基因的发展，提供更易访问和模块化的平台 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 原核和真核系统 | NA | 合成生物学研究与应用 |
| 148 | 2025-12-23 |
codonGPT: reinforcement learning on a generative language model enables scalable mRNA design
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1345
PMID:41416521
|
研究论文 | 本文开发了首个专门针对mRNA序列的生成式语言模型codonGPT，并结合强化学习实现了可扩展的mRNA设计优化 | 首次将强化学习与生物语言模型结合用于mRNA设计，提出了创新的推理时掩码方法以约束同义序列，并构建了首个基于模型生物mRNA序列的生成式语言模型 | 模型训练数据仅包含338,417条模型生物mRNA序列，可能未覆盖所有生物多样性；方法在HLA-A和ACTB等示例基因中验证，需进一步扩展应用范围 | 开发可扩展的mRNA设计方法，用于治疗、合成生物学和蛋白质工程 | mRNA序列设计优化 | 自然语言处理 | NA | 强化学习、生成式语言模型 | GPT类生成模型 | mRNA序列数据 | 338,417条模型生物mRNA序列 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、蛋白质工程 |
| 149 | 2025-12-22 |
Challenges and opportunities for establishing biofoundries in Latin America
2025-Dec-19, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103419
PMID:41421018
|
perspective | 本文探讨了在拉丁美洲建立生物铸造厂（Biofoundries）所面临的挑战与机遇，并提出了一个整合多组学、合成生物学与可持续性评估的集成框架 | 提出了一个从生物勘探到生物工艺放大的集成生物铸造厂模型，强调将区域生物多样性、科学能力与创新网络相结合，作为连接生物多样性与工业创新的关键策略 | NA | 分析在拉丁美洲建立生物铸造厂以促进生物经济与生物技术创新的可行性路径 | 拉丁美洲地区的生物铸造厂基础设施与发展模式 | 合成生物学 | NA | 多组学（multi-omics），合成生物学，生物工艺放大 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术，环境 |
| 150 | 2025-12-22 |
CRISPR as a next-generation environmental biosurveillance tool for air, land, and water
2025-Dec-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.014
PMID:41421891
|
综述 | 本文综述了基于CRISPR的环境生物监测技术（CRISPR-eBx）作为下一代前沿生物监测解决方案的潜力，涵盖其在空气、土地和水体中的应用 | 将CRISPR技术与计算科学、合成生物学和生物监测交叉融合，提出了一个战略路线图，以推动CRISPR-eBx成为便携、特异、灵敏且成本效益高的下一代环境监测平台 | 在部署CRISPR-eBx用于新型生物/基因靶标和环境来源时，仍存在关键挑战需要解决 | 探讨CRISPR-eBx作为下一代环境生物监测工具的应用前景和战略发展 | 环境核酸中的生物体，包括病原体、入侵物种和濒危物种 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术 | NA | 环境核酸 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 生物传感器 | 环境 |
| 151 | 2025-12-22 |
Engineered Peptide Scrambling for Enhanced Drug Delivery to Resistant Breast Cancer Cells via Small Extracellular Vesicles
2025-Dec-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00582
PMID:41321158
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过工程化肽序列扰乱来增强小细胞外囊泡靶向药物递送至耐药乳腺癌细胞的方法 | 利用双报告平台定量评估肿瘤归巢肽功能化小细胞外囊泡的结合，并通过氨基酸序列扰乱设计增强结合能力的肽变体，结合机械刺激提高药物负载效率 | 方法主要基于体外细胞实验，尚未进行体内验证；技术对小细胞外囊泡表面靶向部分的表征仍有限制 | 优化肿瘤靶向药物递送，克服耐药性 | 乳腺癌细胞（MDA-MB-231）和HEK293FT细胞 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 生物发光测定、荧光显微镜、小细胞外囊泡工程 | NA | 体外细胞实验数据 | 24种扰乱变体肽在MDA-MB-231细胞中评估 | 细胞外囊泡表面功能化 | HEK293FT细胞 | 肿瘤归巢肽功能化的小细胞外囊泡作为靶向药物递送系统 | 医学 |
| 152 | 2025-12-22 |
DrEFO: A Fermented Oil Rich in Dihydroquercetin With High Antioxidant Activity
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70612
PMID:41413727
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造酿酒酵母生产二氢槲皮素，并利用其发酵制备富含二氢槲皮素的十一籽发酵油（DrEFO），评估其抗氧化及促进胶原合成的护肤功效 | 首次通过合成生物学改造酵母生产二氢槲皮素并用于植物油发酵，显著提升天然油的抗氧化活性与护肤价值，开创了利用发酵技术增强天然油护肤功效的新策略 | 研究主要基于体外化学实验和细胞模型，缺乏完整的动物实验或人体临床试验数据验证实际护肤效果 | 提升天然植物油的护肤功效，解决其因功效不足难以应对复杂皮肤问题 | 二氢槲皮素（DHQ）及其发酵制备的十一籽发酵油（DrEFO） | 合成生物学 | NA | 发酵工程、DPPH/ABTS/羟基/超氧阴离子/PTIO/ROS自由基清除实验、细胞模型 | NA | 化学实验数据、细胞实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 用于生产二氢槲皮素（DHQ）的代谢途径 | 化妆品、护肤品 |
| 153 | 2025-12-22 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
|
综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战、近期临床试验的突破，以及整合合成生物学和基因工程的新策略 | 重点介绍了整合合成生物学和基因工程的突破性策略，以增强CAR-T细胞的适应性、效力、持久性，激活宿主免疫，重编程肿瘤微环境，并实现多抗原靶向 | 讨论了当前临床前模型（如免疫缺陷小鼠的人源异种移植、人源化或同基因模型）在评估CAR-T细胞疗法疗效和安全性方面的优缺点 | 探讨如何克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性，并推动下一代CAR-T疗法的发展 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学，基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 154 | 2025-12-22 |
Microwave-Activated Bacterial Biorobot for Multimodal Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504603
PMID:40789052
|
研究论文 | 本文开发了一种微波激活的细菌生物机器人，用于实现多模态癌症治疗 | 利用微波对工程化大肠杆菌进行局部激活，结合葡萄糖氧化酶表达与表面CuO纳米颗粒的类芬顿反应，协同诱导多种肿瘤细胞死亡方式 | 未明确说明长期生物安全性、免疫原性及临床转化潜力 | 开发一种安全、可精确控制的多模态癌症治疗平台 | 工程化大肠杆菌(MG1655)及肿瘤细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、纳米材料修饰、转录组分析 | NA | 体外实验数据、体内实验数据、转录组数据 | NA | 合成生物学工程 | 大肠杆菌 | 微波激活的葡萄糖氧化酶表达系统 | 医学 |
| 155 | 2025-12-22 |
Computational tools for nonnatural pathway design: Algorithms, applications, and challenges
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100041
PMID:41415682
|
综述 | 本文综述了用于非天然代谢途径设计的计算工具，包括算法、应用及挑战 | 系统比较了基于模板和无模板两类主要计算方法，并汇编了55个实验验证的非天然途径数据集以评估方法优劣 | 计算预测与实验可行性之间存在差距，代谢负担增加和有毒中间体积累等挑战尚未完全解决 | 通过理性设计非天然代谢途径扩展生物转化的范围和效率 | 非天然代谢途径的计算设计方法 | 合成生物学 | NA | 计算建模与生物信息学分析 | NA | 代谢途径数据与文献数据集 | 55个实验验证的非天然途径 | NA | 微生物细胞工厂 | 非天然代谢途径 | 工业生物技术 |
| 156 | 2025-12-22 |
Recent advances of engineered probiotics for therapeutic applications
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100039
PMID:41415685
|
综述 | 本文综述了工程化益生菌在癌症、胃肠道疾病、传染病和代谢性疾病等人类疾病治疗中的最新应用进展 | 利用合成生物学技术开发工程化益生菌作为诊断工具和疾病治疗方法，强调其在多因素疾病治疗中的创新应用 | NA | 总结工程化益生菌在人类疾病治疗领域的最新研究进展，并探讨其发展挑战与机遇 | 工程化益生菌及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症、胃肠道疾病、传染病、代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 157 | 2025-12-22 |
Enzyme promiscuity in the field of synthetic biology applied to white biotechnology: Opportunities and weaknesses
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100026
PMID:41415683
|
综述 | 本文探讨了酶的多功能性在合成生物学应用于白色生物技术中的机遇与弱点 | 强调了酶多功能性作为地下代谢的来源，在构建高效生产路径中的优势，同时指出其可能导致产量损失和代谢干扰的挑战 | 未提供具体实验数据或案例研究，主要基于理论分析和展望 | 改善微生物细胞工厂在生物生产中的性能，通过理解酶多功能性来优化工程策略 | 微生物代谢网络和酶的多功能性 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学工具 | 机器学习 | 遗传、代谢、酶学和发酵过程数据 | NA | NA | 微生物 | 代谢网络工程 | 工业生物技术 |
| 158 | 2025-12-22 |
Innovative tools for customized yeast cell factory
2025-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100010
PMID:41416100
|
综述 | 本文简要综述了合成生物学创新工具在定制化酵母细胞工厂开发中的最新重要进展与前景 | 系统性地总结了推动酵母细胞工厂快速发展的多种创新工具，包括基因组编辑工具、计算工具、适应性实验室进化和生物DNA部件的标准化，并提供了实用指南 | NA | 为定制化酵母细胞工厂的新型、有效和高效开发提供实用指南 | 酵母细胞工厂及其相关的合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑，适应性实验室进化，DNA部件标准化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 基因、回路、通路和网络的重编程 | 食品，能源，医药，工业生物技术 |
| 159 | 2025-12-22 |
Utilizing plant synthetic biology to accelerate plant-microbe interactions research
2025-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100007
PMID:41416106
|
综述 | 本文综述了植物合成生物学在加速植物-微生物互作研究中的应用，包括分子机制解析、抗病性增强和合成共生工程 | 利用合成生物学工具进行多基因表征和工程化，以解决传统方法在解析复杂通路交叉对话方面的不足 | NA | 加速植物-微生物互作研究，以提升生态系统韧性和作物产量 | 植物与有益及病原微生物的互作机制 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、遗传学、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 合成共生工程 | 农业 |
| 160 | 2025-12-22 |
Towards sustainable freshwater systems through plant synthetic biology engineering plants for sustainability
2025-Mar, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100009
PMID:41415721
|
研究论文 | 本文探讨利用植物合成生物学工程化植物，以过滤海水和储存淡水，应对气候变化和淡水需求 | 提出结合自然设计原则和先进合成生物学工具（如计算蛋白质设计和定向进化），工程化植物平台以可持续方式提供淡水 | NA | 通过植物合成生物学开发可持续淡水系统，减少气候变化影响 | 植物作为合成生物学平台 | NA | NA | 计算蛋白质设计，定向进化 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 植物 | 工程化植物以过滤海水和储存淡水，结合自然组件和适应性特性 | 环境 |