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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2025-07-23 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶(BGL)的分子工程和生物技术进展及其工业应用 | 探讨了多种酶工程策略,包括异源表达、CRISPR-Cas9基因编辑和组学方法,以提高BGL的催化性能和工业适用性 | 尽管有多种改进策略,BGL的低催化效率、底物特异性窄和对操作条件的敏感性仍限制其大规模应用 | 提高β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性,以促进可持续和经济的生物转化过程 | β-葡萄糖苷酶(BGL) | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA |
142 | 2025-07-23 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组范围内鉴定了Ophiorrhiza pumila中的15种10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs),并对其中的Op10HGO1、Op10HGO2和Op10HGO3进行了酶活性测定,发现Op10HGO2和Op10HGO3在NADP存在下能将10-羟基香叶醇转化为10-氧代香叶醇、10-氧代香叶醛和10-羟基香叶醛,而Op10HGO1催化产生10-氧代香叶醇和10-羟基香叶醛 | 首次在全基因组范围内鉴定了Ophiorrhiza pumila中的10HGOs,并明确了Op10HGO2在喜树碱生物合成中的关键作用 | 仅对三种10HGOs进行了功能验证,未全面研究所有15种10HGOs的功能 | 通过鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为利用合成生物学工具在异源系统中重建喜树碱生物合成途径提供元件 | Ophiorrhiza pumila中的10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 15种10HGOs基因,其中3种进行了功能验证 |
143 | 2025-07-23 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台,用于高通量评估任意长度构建体的表达谱 | 结合长读长和短读长NGS技术,实现对多kb长度尺度上基因电路设计的定量评估 | 未提及具体的技术限制或实验条件限制 | 加速合成生物学研究,通过高通量筛选揭示基因部件的可组合性规则 | 人类细胞中的基因电路设计 | 合成生物学 | NA | NGS(长读长和短读长测序) | ML(机器学习模型) | 基因序列数据 | 超过10种基因电路设计(5-20 kb长度) |
144 | 2025-07-23 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨了利用其他物种的酶来逆转与年龄相关的代谢变化,以延缓衰老和老年相关疾病 | 提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和老年相关疾病的未开发资源 | NA | 探讨通过代谢调控延缓衰老和老年相关疾病的策略 | 来自低等生物的一组酶,这些酶影响与年龄相关过程的代谢参数 | 合成生物学 | 老年疾病 | NA | NA | NA | NA |
145 | 2025-07-23 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 该研究通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,测试了三种dCas9-DNMT3A/3L变体在不同人类细胞系和原代人类T细胞中的表现 | 研究发现DNMT3A催化核心的突变可以稳定dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时不牺牲DNA甲基化或基因沉默性能 | 研究主要局限于细胞系和原代T细胞,可能限制了在其他细胞类型或体内环境中的适用性 | 扩展表观遗传编辑的合成生物学工具包,并为工程化dCas基础的DNMTs在原代哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图 | 人类细胞系和原代供体来源的人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA甲基转移酶技术 | dCas9-DNMT3A/3L变体 | 基因表达和DNA甲基化数据 | 多种人类细胞系和原代供体来源的人类T细胞 |
146 | 2025-07-23 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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review | 本文综述了调节性T细胞(Treg细胞)在疾病治疗中的应用及其生物学机制 | 探讨了利用纳米医学和合成生物学技术精确调控Treg细胞功能的新一代临床试验 | 存在重要的未解决问题和局限性,如临床试验的结果尚不明确 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的潜力及其生物学机制 | 调节性T细胞(Treg细胞) | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA |
147 | 2025-07-22 |
Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction
2025-Jul-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00234
PMID:40689784
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研究论文 | 本研究展示了一种通过水凝胶固定多酶系统实现无细胞化学生物生产的方法 | 利用PEGDA-甘油水凝胶共固定多种无细胞表达酶,显著提高了酶的稳定性、可重用性和活性 | 研究仅测试了三种异源酶系统,未验证更复杂酶系统的适用性 | 开发可重复使用且稳定的无细胞多酶生物生产系统 | 聚乙二醇二丙烯酸酯(PEGDA)水凝胶固定化酶系统 | 合成生物学 | NA | 小角X射线散射(SAXS)、荧光测量 | NA | 生物化学数据 | 三种异源无细胞表达酶系统 |
148 | 2025-07-22 |
Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential
2025-Jul, Archiv der Pharmazie
IF:4.3Q1
DOI:10.1002/ardp.70058
PMID:40685808
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综述 | 本文全面概述了几种重要的香豆素衍生物的抗癌机制,并探讨了提高其疗效的方法 | 探讨了合成生物学、生物信息学和人工智能在提高香豆素疗效方面的应用 | 香豆素的临床应用面临生物利用度低、代谢快、水溶性差和制剂困难等挑战 | 评估香豆素衍生物在癌症治疗中的机制和临床潜力 | 香豆素衍生物(如香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异嗪皮啶和补骨脂素) | 癌症治疗 | 乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌 | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA |
149 | 2025-07-22 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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research paper | 本文介绍了一种无需淬灭剂的荧光监测方法,用于观察G-四链体结构的折叠过程 | 提出了一种仅需单一染料标记、无需淬灭剂的FRET类似格式监测G-四链体展开过渡的新方法 | 未明确提及方法在复杂生物环境中的适用性或与其他技术的比较 | 开发低成本、高通量的工具以监测G-四链体结构的折叠与展开过渡 | 富含鸟嘌呤的DNA序列及其形成的G-四链体结构 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)类似技术 | NA | 荧光信号数据 | 多种G-四链体形成DNA序列(具体数量未说明) |
150 | 2025-07-21 |
Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932
PMID:40609762
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综述 | 本文综述了中链长度α,ω-二醇(mcl-diols)的微生物生产现状与未来展望 | 提出了一种适用于不同链长的通用生物合成途径,并探讨了合成生物学、适应性实验室进化和AI驱动酶设计等未来研究方向 | 微生物底盘选择和优化速度较慢,限速酶活性不足,中间体和终产物毒性问题尚未完全解决 | 开发可持续的中链长度二醇生物生产方法以替代化石基工业过程 | 中链长度α,ω-二醇(mcl-diols) | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、高级蛋白质工程技术、过程优化 | NA | NA | NA |
151 | 2025-07-21 |
Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936
PMID:40614874
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综述 | 本文综述了酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展,重点介绍了代谢工程策略和发酵优化方法 | 强调了结构相关衍生物共有的生物合成逻辑,并将其分为两大类:叶黄素类(如角黄素、玉米黄质等)和类胡萝卜素衍生物(如藏红花酸、视黄醇等) | 未来工作可能需要扩大不同酵母宿主中的产物多样性并提高生物合成效率以实现更可持续的生产 | 探索酵母作为生产宿主在β-胡萝卜素及其衍生物可持续微生物生产中的潜力 | 酵母(特别是酿酒酵母和解脂耶氏酵母)中β-胡萝卜素及其衍生物的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略和发酵优化 | NA | NA | NA |
152 | 2025-07-21 |
Biohybrid technologies for CO2 conversion to fuels and chemicals: Advances in bio-electro-, bio-photoelectro-, and bio-photocatalysis
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132949
PMID:40639626
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综述 | 本文综述了生物杂交技术在二氧化碳转化为燃料和化学品中的最新进展,重点介绍了生物电催化、生物光电催化和生物光催化三种关键技术 | 总结了生物杂交技术在二氧化碳转化中的创新应用,包括界面电子转移、生物相容性优化以及系统耦合反应 | 讨论了经济可行性方面的关键挑战,未提及具体技术在实际应用中的大规模推广限制 | 探索高效、可持续的二氧化碳转化技术,以实现碳中和社会 | 二氧化碳转化技术及其在燃料和化学品生产中的应用 | 生物技术与化学工程 | NA | 生物电催化(BEC)、生物光电催化(BPEC)、生物光催化(BPC) | NA | NA | NA |
153 | 2025-07-21 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Aug-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
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研究论文 | 研究揭示了多极端环境微生物Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温的交叉与独特适应策略 | 首次全面分析了N. thermophilus的热适应机制,并阐明了之前未探索的碱性特异性调控过程 | 对碱性适应的分子机制仍不够充分,对热适应的理解仅限于基因组分析 | 研究N. thermophilus在多种极端环境下的生存机制及其潜在的生物技术应用 | 多极端环境微生物Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
154 | 2025-07-21 |
A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine
2025-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102613
PMID:40449069
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研究论文 | 探讨噬菌体作为精准医学手段在解决抗生素耐药性细菌感染中的潜力 | 结合基因工程、合成生物学和人工智能技术,定制化设计噬菌体以扩大宿主范围、克服细菌免疫系统并表达有利蛋白质 | NA | 解决抗生素耐药性细菌感染的全球健康挑战 | 噬菌体及其在精准医学中的应用 | 精准医学 | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
155 | 2025-07-21 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2025-Jul-20, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达技术在Nicotiana benthamiana中实现了复杂甾体生物碱和皂苷的多样化工程合成 | 发现了一种新的番茄糖基转移酶SlGAME2-NEW,并成功在异源宿主中重建了20种甾体终产物的生物合成途径 | 研究仅在模式植物N. benthamiana中进行验证,尚未在商业化作物中测试 | 开发合成生物学平台生产高价值甾体代谢产物 | 茄科植物甾体糖生物碱(SGAs)和甾体皂苷 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达技术 | NA | 代谢组数据 | 涉及9-15个基因组合表达 |
156 | 2025-07-21 |
De novo designed protein guiding targeted protein degradation
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62050-z
PMID:40676011
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研究论文 | 开发了一种名为GPlad的引导蛋白质标记和降解系统,用于精确降解多种蛋白质 | 使用从头设计的引导蛋白和精氨酸激酶(McsB)实现精确蛋白质降解,无需预先融合降解标签或化学降解剂 | 目前仅在Escherichia coli中验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发一种可调谐、即插即用的蛋白质降解策略,用于合成生物学和代谢工程 | 荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质等多种蛋白质 | 合成生物学 | NA | 从头蛋白质设计 | NA | 蛋白质数据 | 多种蛋白质(包括荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质) |
157 | 2025-07-21 |
Efficient, cell-type-specific production of flavonols by multiplexed CRISPR activation of a suite of metabolic enzymes
2025-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61742-w
PMID:40670339
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的CRISPR激活系统,能够在稳定细胞系中以细胞类型特异性方式驱动基因表达,并应用于植物代谢途径的重编程 | 开发了首个能够在稳定植物细胞系中实现细胞类型特异性基因激活的CRISPR系统,突破了现有技术只能实现瞬时或泛在表达的局限 | 需要依赖荧光报告基因系在细胞水平评估表达效果,可能增加实验复杂度 | 开发植物合成生物学工具以实现细胞类型特异性的多基因协同调控 | 植物根系组织(内皮层和表皮层) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因激活系统 | NA | 荧光成像数据 | 使用myb12突变体作为研究模型 |
158 | 2025-07-21 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文研究了一种酒精依赖的半萜途径在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的广泛特异性 | 揭示了ADH模块的第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,并展示了ADH模块和异戊二烯基转移酶的组合特异性足以在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | NA | 探索半萜途径在合成生物学中扩展化学空间的潜力 | 酒精依赖的半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | ADH途径 | NA | NA | NA |
159 | 2025-07-21 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Apr-18, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子和生化特征,重点讨论了内共生体和宿主在进化过程中的分子变化 | 讨论了自然存在的光合内共生系统与现代叶绿体的共同特征,并探讨了实验室工程化内共生的研究进展 | 未提及具体的研究数据或实验结果的局限性 | 探讨光合内共生系统的进化特征及其在合成生物学中的应用 | 线粒体和叶绿体等内共生细胞器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
160 | 2025-07-20 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 探讨RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义 | 揭示了RNA可以序列依赖性地选择性结合脂质膜,为工程化RNA传感器和调控元件提供了新思路 | NA | 探索RNA与脂质相互作用的基础化学原理及其在合成生物学和细胞调控中的应用 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |