合成生物学相关文章
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当前共找到 1524 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-04-20 |
Isolation, engineering and ecology of temperate phages from the human gut
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09614-7
PMID:41094135
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研究论文 | 本研究从人类肠道细菌中分离、表征了134个可诱导的前噬菌体，并构建了一个合成微生物组，以探索温和噬菌体在肠道环境中的多样性和功能 | 通过大规模培养和诱导实验，首次系统性地扩展了人类肠道温和噬菌体的实验验证对，揭示了前噬菌体诱导的复杂机制和遗传多样性 | 研究中仅18%的计算预测前噬菌体能在纯培养中被诱导，表明现有预测方法存在局限性，且实验条件可能未完全模拟体内环境 | 研究人类肠道温和噬菌体的多样性、遗传特征及其与宿主细菌的相互作用机制 | 人类肠道细菌分离株中的可诱导前噬菌体 | 微生物学 | NA | 宏基因组学、数据挖掘、培养诱导实验、合成微生物组共培养 | NA | 基因组序列、培养实验数据 | 252个人类肠道细菌分离株 | 合成微生物组构建 | 人类肠道细菌（具体未指定）、Caco2人结肠细胞 | NA | 合成生物学、生物技术、微生物组研究 |
| 142 | 2026-04-20 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文揭示了一种人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 通过结合ADH模块和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性，首次在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物，扩展了异戊二烯类化合物的化学空间 | 未明确提及具体实验规模或下游酶应用的限制 | 研究人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性及其在异戊二烯生物合成中的应用 | ADH模块中的酸磷酸酶PhoN、异戊烯基激酶IPK和下游芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成途径工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 酒精依赖性半萜途径，包括PhoN和IPK酶模块，用于生产烷基焦磷酸盐 | 工业生物技术 |
| 143 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法，通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案，开发了低成本工程培养基，并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 144 | 2026-04-17 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用，以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统，实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制，并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 包括递送、转基因稳定性和在生理相关模型中稳健的时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统 | 心脏、肺、血液和睡眠系统的细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据 | 系统级模型、AI引导的电路设计 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学 |
| 145 | 2026-04-16 |
Advances in synthetic microbial ecosystems approach for studying ecological interactions and their influencing factors
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100205
PMID:41982405
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综述 | 本文综述了合成微生物生态系统在生态相互作用及其影响因素研究方面的进展 | 系统整合了当前关于合成微生物生态系统的知识，并强调了其相较于自然生态系统的简化性和可控性优势 | NA | 增强对微生物群落相互作用的理解，特别是群落稳定性、关键物种识别和群落结构调控等生态学关键问题 | 合成微生物生态系统及其中的生态相互作用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 146 | 2026-04-16 |
The Kongming defense: Host-pathogen battles take a new face
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100209
PMID:41982408
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评论 | 本文评论了Kongming细菌防御系统的新机制，该系统利用噬菌体衍生的酶合成dITP，通过消耗NAD+触发宿主免疫，揭示了宿主与病原体间持续的进化军备竞赛 | 首次揭示了Kongming防御系统利用噬菌体酶合成dITP并触发NAD+消耗的独特免疫机制，以及噬菌体相应进化出对抗策略 | NA | 探讨细菌免疫系统与噬菌体之间的进化相互作用机制 | 细菌防御系统（特别是Kongming系统）与噬菌体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |
| 147 | 2026-04-16 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
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综述 | 本文综述了跨学科增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用，并展望了如何将打印响应性生物材料整合到日常物品和建筑中以改善环境和人类健康 | 提出了将打印响应性生物材料集成到日常产品和建筑环境中的新愿景，强调通过生物、化学或物理过程实现环境交互的多感官互动新时代 | NA | 探索增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用及其在环境和健康领域的整合潜力 | 响应性生物材料及其在增材制造中的应用 | NA | NA | 增材制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 医学, 建筑 |
| 148 | 2026-04-16 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
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综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物通过多种信号通路调节宿主免疫的机制，并探讨了基于这些代谢物的新兴治疗策略 | 整合了空间代谢组学、合成生物学和纳米医学的最新进展，提出了时空递送免疫调节代谢物的新治疗途径，并展望了结合多组学和AI预测模型的个性化调控方向 | NA | 阐明肠道微生物代谢物在免疫调节中的作用机制并探索其治疗应用前景 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生吲哚等）及其对宿主免疫系统的影响 | NA | 炎症性和自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、合成生物学、纳米医学、多组学、AI驱动预测建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 149 | 2026-04-16 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
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研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一种低成本、开源、基于喷墨技术的第二代DNA合成器，旨在实现实验室环境中灵活且低成本的寡核苷酸合成 | OpenIDS2通过3D打印机械组件、定制PCB集成控制电子和蠕动泵批量溶液输送系统，显著减小设备体积、提高操作稳定性和制造可及性，增强了开源硬件平台的再现性和全球可访问性 | NA | 开发一种低成本、开源的DNA合成平台，以降低实验室自动化的入门门槛 | DNA合成器（OpenIDS2）及其在寡核苷酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 喷墨技术、磷酸胺化学、尿素-PAGE、HPLC | NA | NA | 成功合成了15-mer poly(dT)序列在CPG基板上 | 3D打印、定制PCB | NA | NA | 合成生物学、分子诊断、生物技术 |
| 150 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增，旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力，并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别，这是一种新的策略 | 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增，但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作，且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增，表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 | 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌） | 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP，并测试过表达限速基因GcpE | 医学 |
| 151 | 2026-04-13 |
Using the Droplet Transfer Method to Reliably Prepare Giant Unilamellar Vesicles
2025-09-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68340
PMID:41052083
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠制备巨型单层囊泡（GUVs）的液滴转移方法，并提供了详细的实验协议和关键参数分析 | 提出了针对GUV制备中关键参数的系统性指南，包括成本有效的氧气和湿度控制措施，以及一次性去除油相的简便方法 | 方法可能因不同磷脂和油的选择而需要调整，且对初学者可能存在学习曲线 | 优化GUVs的制备方法，以促进其在合成生物学和微机器人等领域的应用 | 巨型单层囊泡（GUVs）的制备过程 | 合成生物学 | NA | 液滴转移方法（倒置乳液法） | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 微机器人 |
| 152 | 2026-04-12 |
Efficient Sampling of Genetically Encoded Biosensor Design Space Enabled with a Design of Experiments and Automation Workflow
2025-10-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68448
PMID:41182995
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研究论文 | 本文提出了一种结合高通量自动化和计算方法的流程，用于高效采样基于变构转录因子的生物传感器设计空间，以生成具有数字和模拟剂量响应曲线的不同配置 | 采用实验设计算法和高通量自动化平台，实现生物传感器组合设计空间的高效统计映射和分数采样，优化筛选策略 | NA | 开发和优化生物传感器系统及遗传电路，为合成生物学社区提供调控工具包 | 基于变构转录因子的生物传感器设计空间 | 合成生物学 | NA | 实验设计算法、高通量自动化平台、效应物滴定分析 | NA | 表达数据、组合设计空间映射 | NA | 自动化平台 | 微生物（如用于酶优化、菌株开发） | 基于变构转录因子的生物传感器，包括启动子和核糖体结合位点库，具有数字和模拟剂量响应曲线 | 工业生物技术、酶优化、菌株开发、微生物过程控制 |
| 153 | 2026-04-10 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体必需的tRNA修饰酶，揭示了其最小翻译系统的组成与功能 | 首次系统鉴定了顶质体定位的tRNA修饰酶，并证明其中6个催化反密码子环修饰的酶对寄生虫生存和细胞器维持至关重要 | 有两个基因无法被敲除，其中一个可能具有顶质体外的必需功能，另一个的作用机制尚未完全阐明 | 阐明恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其对细胞器维持的影响 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 154 | 2026-04-09 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Dec-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来方向，重点探讨了其作为新型治疗平台的潜力 | 利用工程化细菌选择性定植肿瘤微环境，作为局部递送治疗剂和激发抗肿瘤免疫反应的创新平台 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用，以克服传统疗法的局限性 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计和应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 可编程生产抗癌有效载荷的合成生物电路 | 医学 |
| 155 | 2026-04-08 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针，用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域之间的相互作用，并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的交联，揭示了模块间识别事件和载体蛋白在催化步骤间的过程性移动机制 | 研究主要聚焦于酪氨酸素生物合成的前两个模块，可能未完全反映其他非核糖体肽合成酶系统的结构动态 | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪氨酸素生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 156 | 2026-04-04 |
RNA triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
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研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列组成的RNA的最小自由能二级结构，并改进了计算最小自由能和配分函数的算法，同时设计了用于RNA-RNA相互作用的新算法 | 改进了计算RNA三核苷酸重复序列最小自由能和配分函数的算法，并将RNA-RNA相互作用的计算复杂度从阶乘时间优化至指数时间，提出了基于碱基集的相互作用多项式时间算法 | 在TR情况下存在计算复杂性，但通过参数化算法部分解决，未提及实验验证或实际应用限制 | 提高RNA三核苷酸重复序列结构预测和相互作用的计算效率与准确性 | 由三核苷酸重复序列组成的RNA及其相互作用 | 计算生物学 | NA | 最小自由能计算、配分函数计算、RNA-RNA相互作用算法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 157 | 2026-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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综述 | 本文介绍了利用高通量突变筛选方法来理解、抑制和改造膜转运蛋白的原理、方法及其应用潜力 | 系统阐述了高通量筛选方法在解析多特异性膜转运蛋白分子机制中的独特优势，并提出了其在药物研发和合成生物学中的创新应用方向 | NA | 探讨高通量遗传筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 158 | 2026-03-31 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-05-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
|
综述 | 本文综述了利用微生物系统异源合成倍半萜醇的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了包括适应性倍半萜醇合酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及应对萜类化合物毒性的耐受性策略在内的多种创新方法 | NA | 推进倍半萜醇生物合成研究，以克服其工业化应用面临的产量低、成本高等挑战 | 倍半萜醇化合物及其微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇生物合成途径 | 制药, 食品, 化妆品 |
| 159 | 2026-03-30 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-10-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
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研究论文 | 本文开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制突变库构建方法，用于大规模功能筛选 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现高通量、精确控制的突变库构建，突变覆盖率达93.75%，并评估了多种聚合酶以优化文库质量 | 未映射读数的分析揭示了寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素，需改进PCR条件和加强寡核苷酸合成质量控制 | 开发一种高效、可扩展、精确控制的突变库构建策略，以支持高通量功能研究 | 以模型系统构建全长度琥珀密码子扫描突变库 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成、PCR、突变库构建 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 160 | 2026-03-30 |
Protein Translocation Control in E. coli via Temperature-Dependent Aggregation: Application to a Conditionally Lethal Enzyme, Levansucrase
2025-08-20, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081199
PMID:40867643
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研究论文 | 本文提出了一种基于温度响应性弹性蛋白样多肽（ELP）的系统，用于调控大肠杆菌中条件致死酶（levansucrase）的转运，实现蛋白质定位和分泌的可逆控制 | 利用ELP标签的温度依赖性聚集特性，设计了一种可逆调控蛋白质分泌的策略，应用于条件致死酶系统，为合成生物学和生物安全提供新方法 | NA | 开发一种温度响应性蛋白质转运控制系统，用于合成生物学和蛋白质工程 | 大肠杆菌中的条件致死酶levansucrase及其ELP融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、ELP标签技术 | NA | NA | NA | ELP标签 | 大肠杆菌 | 温度响应性蛋白质分泌控制系统，基于ELP聚集机制 | 合成生物学、代谢工程、生物安全 |