合成生物学相关文章
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当前共找到 1563 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-12-22 |
Yeast-secreted compounds with antifungal activity-screening, genetic parts, biosynthetic pathways, and regulation
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf068
PMID:41258858
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综述 | 本文综述了酵母分泌的具有抗真菌活性的化合物，包括筛选方法、遗传元件、生物合成途径和调控机制 | 整合了当前关于酵母抗真菌化合物的分子知识，并提出了筛选和工程化这些化合物以应用于生物防治、食品保存和人类健康的新方法 | NA | 探索酵母分泌的抗真菌化合物，以开发新型抗真菌剂，应对抗真菌耐药性问题 | 酵母分泌的化合物，如铁螯合剂、生物表面活性剂、挥发性有机化合物、霉菌素和水解酶 | 合成生物学 | 真菌感染 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酵母 | NA | 农业, 食品安全, 生物防治, 人类健康 |
| 162 | 2025-12-22 |
From bark to bench: innovations in QS-21 adjuvant characterization and manufacturing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1677995
PMID:41409277
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综述 | 本文以皂苷类佐剂QS-21为核心案例，综述了佐剂开发中的关键挑战及新兴技术解决方案，并提出了整合合成生物学、人工智能和系统免疫分析的佐剂开发新愿景 | 提出了“从树皮到实验室”的整合佐剂开发管线，结合合成生物学、人工智能和系统免疫分析，以加速新一代佐剂的发现与应用 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，主要基于现有文献进行分析和展望 | 探讨佐剂开发中的挑战与技术创新，特别是针对QS-21佐剂的特性改进与可持续生产 | 皂苷类佐剂QS-21及其类似物 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学、生物工程、纳米颗粒制剂技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物、植物平台 | NA | 医药 |
| 163 | 2025-12-22 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
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研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一种低成本、开源、基于喷墨技术的第二代DNA合成器，旨在实验室环境中实现灵活且低成本的寡核苷酸合成 | OpenIDS2通过3D打印机械部件、定制PCB集成控制电子设备以及蠕动泵批量溶液输送系统，显著降低了设备体积和成本，提高了操作稳定性和可重复性 | NA | 开发一种开源、低成本的DNA微阵列合成器平台，以促进实验室自动化和寡核苷酸合成的可及性 | DNA微阵列合成器（OpenIDS2）及其合成性能 | 合成生物学 | NA | 磷酸胺化学合成、尿素-PAGE、HPLC | NA | NA | 合成了15-mer poly(dT)序列 | 3D打印、定制PCB | NA | NA | 生物技术、分子诊断、合成生物学 |
| 164 | 2025-12-21 |
Synthetic bioengineered macrophages for immune cell functions in infectious disease cellular therapy
2025-Dec-20, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70254
PMID:41420534
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学方法改造巨噬细胞以治疗皮肤利什曼病的新策略 | 首次将AI设计的肽段与可诱导TET-ON基因回路结合，通过Tac-6纳米凝胶递送工程化巨噬细胞，实现靶向可控的免疫治疗 | 研究主要针对皮肤利什曼病，在其他感染或炎症疾病中的适用性需进一步验证，体内长期安全性和疗效评估尚不充分 | 开发针对皮肤利什曼病的精准免疫治疗方法 | 巨噬细胞及其在皮肤利什曼病感染中的免疫反应 | 合成生物学 | 皮肤利什曼病 | AI肽段设计、分子动力学模拟、基因回路工程 | NA | NA | NA | TET-ON基因回路 | 巨噬细胞 | 可诱导TET-ON基因回路，用于表达免疫调节肽PepA以增强IL-12产生和寄生虫清除 | 医学 |
| 165 | 2025-12-21 |
Reimagining colour with synthetic biology
2025-Dec-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.022
PMID:41419346
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2025-12-21 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2025-Dec-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核基因表达调控元件的设计策略，从基因组挖掘到人工智能驱动的生成方法 | 强调了深度学习生成模型在调控元件设计中的应用，并整合了从经验挖掘到理性设计的演变过程 | NA | 优化微生物细胞工厂的生物生产，通过精细调控基因表达 | 原核基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、生物物理模型、人工智能 | 深度学习生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件 | 工业生物技术 |
| 167 | 2025-12-21 |
Synergistic defense in cotton: Lignin-mediated barriers and JA/ET signaling pathways against Verticillium wilt
2025-Dec-15, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112943
PMID:41407016
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综述 | 本文综述了棉花通过木质素物理屏障与JA/ET信号通路协同防御黄萎病的机制 | 揭示了木质素介导的物理屏障与JA/ET信号通路的协同防御机制，并识别了关键调控因子（GhBLH7-D06、GhKWL1、GbTCP20） | 不同品种间通路贡献度存在争议，且环境调控机制尚不明确 | 阐明棉花抵御黄萎病的协同防御机制，为培育抗病品种提供理论依据 | 棉花（Gossypium spp.）及其与黄萎病菌（Verticillium dahliae）的互作 | 植物病理学/合成生物学 | 植物病害（黄萎病） | 多组学分析（multi-omics）、CRISPR基因编辑、合成生物学、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 棉花（植物） | JA/ET信号通路与苯丙烷类代谢途径的协同调控网络，涉及木质素生物合成增强的防御回路 | 农业 |
| 168 | 2025-12-21 |
A Modular and Customizable CRISPR/Cas Toolkit for Epigenome Editing of Cis-regulatory Modules
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503917
PMID:41024337
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研究论文 | 本文开发了一种模块化CRISPR/Cas工具包，用于表观基因组编辑，以解析和工程化顺式调控模块的功能 | 开发了基于dead Cas9的DNA去甲基化（dCd）和DNA甲基化（dCm）平台，实现了对顺式调控模块的可编程编辑和跨物种移植性研究 | NA | 研究表观遗传标记如何因果影响顺式调控模块功能，并开发工具进行工程化调控 | 顺式调控元件和模块，包括植物和酵母中的表观遗传调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas表观基因组编辑，包括DNA甲基化和去甲基化技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物，酿酒酵母 | 逻辑门控基因调控，输入响应型合成表观基因组编辑器 | 合成生物学，性状设计 |
| 169 | 2025-12-21 |
Engineering the Link: From Genome Interaction Maps to Functional Insight
2025-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500525
PMID:41221676
|
综述 | 本文探讨了如何利用基因组工程方法（如锌指蛋白、TALEs和CRISPR-Cas9）来靶向操控3D染色质结构，以揭示基因组结构与功能之间的因果联系 | 通过合成策略重新布线增强子-启动子通信，利用可编程DNA结合平台进行3D基因组工程，作为合成生物学的新支柱 | 当前方法在效率、可扩展性和特异性方面存在限制 | 理解并最终重编程基因组功能，特别是通过操控染色质结构来建立因果联系 | 3D染色质架构，特别是DNA环，以及增强子-启动子相互作用 | 合成生物学 | NA | 染色体构象捕获测序，基因组工程 | NA | 基因组相互作用数据 | NA | 锌指蛋白, TALEs, CRISPR-Cas9 | NA | 增强子-启动子通信的重布线，工程化染色质环 | 医学, 工业生物技术 |
| 170 | 2025-12-21 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2025-Nov-28, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于酵母转化相关重组（TAR）技术的伪狂犬病病毒（PRV）基因组组装平台，用于功能拯救和表征合成病毒 | 利用TAR技术成功组装和拯救了高GC含量、重复序列复杂的PRV基因组，并引入CRISPR/Cas9编辑插入egfp基因 | 合成的PRV-GX-Syn1病毒滴度降低、噬斑变小，且在BALB/c小鼠中仍引起致死性感染，毒力未完全减弱 | 开发快速灵活的PRV基因组修饰平台，以促进基础研究和基于PRV的疫苗载体开发 | 伪狂犬病病毒（PRV），特别是基因型II变异株PRV-GX-2011 | 合成生物学 | 伪狂犬病（由伪狂犬病病毒引起） | 酵母转化相关重组（TAR）、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 使用PRV-GX-2011株进行基因组组装，并在Vero细胞和BALB/c小鼠中进行功能测试 | CRISPR-Cas9, TAR | 酿酒酵母（用于TAR组装）、Vero细胞（用于病毒拯救） | NA | 医学（疫苗开发） |
| 171 | 2025-12-20 |
Patchoulol: Bioactive Properties, Synthase Catalytic Mechanisms, and Biosynthetic Progress ── a Review
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00552
PMID:41311191
|
综述 | 本文综述了广藿香醇的生物活性、其合酶的催化机制以及生物合成研究进展 | 系统总结了广藿香醇合酶的环化机制假说，并讨论了利用合成生物学和代谢工程提高其生物合成产量的可行策略 | NA | 探讨广藿香醇的生物活性、生物合成机制及其大规模生产的潜在应用前景 | 广藿香醇（一种三环倍半萜醇） | 合成生物学 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 香水，化妆品，医药 |
| 172 | 2025-12-20 |
Environmental Census: Modeling Synthetic Biology Ecological Risk with Metagenomic Enzymatic Data and High-Performance Computing
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00618
PMID:41335476
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为Environmental Census的Python软件包，用于预测工程微生物的环境范围，通过功能注释相似性评估其生态风险 | 利用公开可用的复合宏基因组数据，结合高性能计算，开发了一种新的风险评估工具，能预测工程微生物在农业-水循环等环境中的潜在定殖风险 | 工具依赖于公开的宏基因组数据，可能无法覆盖所有环境；风险评估基于相似性，可能忽略其他生态因素 | 评估合成生物学中工程微生物的生态风险，辅助其安全设计和管理 | 工程微生物，特别是细菌生物农药，以及农业-水循环环境中的微生物群落 | 计算生物学 | NA | 宏基因组测序，高性能计算 | NA | 宏基因组数据 | 基于公开的复合宏基因组数据库，具体样本数量未指定 | NA | 工程微生物（如细菌生物农药） | NA | 环境，农业 |
| 173 | 2025-12-20 |
Construction and Functional Characterization of a Heterologous Quorum Sensing Circuit in Clostridium sporogenes
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00628
PMID:41359820
|
研究论文 | 本研究在严格厌氧的革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes中构建并功能表征了一个异源群体感应（QS）电路，利用agr-QS系统实现密度依赖性基因调控 | 首次在严格厌氧菌中成功工程化agr群体感应系统，扩展了合成生物学工具包，为细菌疗法和代谢工程提供了新机会 | NA | 工程化革兰氏阳性菌中的群体感应系统，以实现密度依赖性基因调控 | 严格厌氧的革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | NA | NA | agr-QS系统 | Clostridium sporogenes | 异源群体感应电路，基于agr-QS系统，包括自诱导肽（AIP）生产和QS调控的GFP报告基因 | 医学, 工业生物技术 |
| 174 | 2025-12-20 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2025-Dec-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
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研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能性无机纳米材料（如量子点）分子级空间精确合成的方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS并调控其细胞内代谢途径，实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同，生长出单个无机半导体纳米晶体（量子点），赋予蛋白质独特荧光功能 | NA | 开发一种可编程平台，用于在活体细胞内特定分子位点遗传可控地生长无机纳米材料，以精确操纵、监测和增强生物体功能 | 活体哺乳动物细胞、特定蛋白质（如病毒核蛋白） | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签与代谢途径协同，设计合成量子点的生物合成路径 | 医学、生物技术 |
| 175 | 2025-12-20 |
Unveiling the landscape of prokaryotic global regulators through deep protein language models
2025-Dec-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00950-25
PMID:41283681
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研究论文 | 本研究利用深度蛋白质语言模型，系统性地揭示了原核生物全局调节因子的多样性及其进化结构 | 开发了一个基于深度学习的大规模框架，能够识别远程同源物和新型全局调节因子，超越了传统基于相似性或结构域的方法 | NA | 系统性绘制原核生物全局调节因子的调控景观，以理解其多样性和进化动力学 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组中的全局调节因子样蛋白质 | 自然语言处理 | NA | 深度蛋白质语言模型 | 深度学习模型 | 蛋白质序列 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组，包含超过270,000个全局调节因子样蛋白质 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 176 | 2025-12-20 |
High-throughput chemical genomic screening: a step-by-step workflow from plate to phenotype
2025-Dec-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00885-25
PMID:41313179
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研究论文 | 本文提供了一个从开始到结束进行化学基因组筛选的逐步指南 | 引入了一个可扩展的端到端协议，将实验、成像和计算步骤整合到一个统一的框架中，用于高通量筛选多种微生物物种 | NA | 开发标准化、可重复的工作流程，以促进化学基因组筛选在微生物研究中的广泛应用 | 微生物物种，包括菌株库和基因-环境相互作用 | 系统生物学 | NA | 高通量化学基因组筛选 | NA | 表型数据 | NA | NA | 微生物物种 | NA | 微生物系统生物学，包括微生物组研究、合成生物学和微生物群落研究 |
| 177 | 2025-12-20 |
Cell-free protein synthesis in microcompartments towards cell-cell communication
2025-Dec-17, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103416
PMID:41411873
|
综述 | 本文综述了在微区室中利用无细胞蛋白质合成系统实现合成细胞间通讯的不同策略与进展 | 系统比较了不同微区室化实验装置在实现合成细胞间通讯方面的策略，并重点分析了通讯模式在渗透性、资源更新、稳定性与可扩展性之间的权衡关系 | NA | 探讨如何通过微流体技术与无细胞表达系统构建可编程的合成细胞并实现其间的通讯功能 | 基于微区室（微流体隔室、液滴、囊泡）的无细胞蛋白质表达系统与合成细胞 | 合成生物学 | NA | 微流体技术、无细胞蛋白质表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路（用于通讯的信号传递、处理与输出生成） | 合成生物学、生物技术 |
| 178 | 2025-12-20 |
Harnessing heterogeneity for the rational design of cell manufacturing
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101458
PMID:41412112
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研究论文 | 本文提出利用细胞异质性作为设计特征，通过系统与合成生物学工具优化细胞疗法生产的产量和质量 | 将细胞异质性视为设计优势而非挑战，提出一个从输入细胞状态映射到输出细胞命运的框架，以提升生物工艺稳健性 | NA | 优化干细胞衍生细胞疗法的生产产量和质量，提高生物工艺的稳健性 | 多细胞系统中的细胞异质性（包括宏观和微观层面） | 合成生物学 | NA | 系统与合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 179 | 2025-12-20 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的应用进展，并探讨了其未来发展方向 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统，整合基因组工程、动态基因电路和高维生物传感器，构建可扩展的多细胞生物学定量模型 | 仍面临递送、转基因稳定性和生理相关模型中稳健时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统 | 人类细胞与组织（心脏、肺、血液、睡眠系统） | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据、人工智能引导的电路设计 | 系统级模型、高分辨率细胞和组织尺度模型 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 可调转录调节因子、合成组织器、反馈电路、生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 180 | 2025-12-20 |
What do you most hope we will achieve with mammalian synthetic biology within the next decade?
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101485
PMID:41412111
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |