本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-07-14 |
Ultrasensitive Multiplexed Detection of Protein Biomarkers via Aptamer-Driven T7 RNA Polymerase Amplification
2025-11-04, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04805
PMID:41123957
|
研究论文 | 报道了一种通过适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增系统,实现血清中蛋白生物标志物的超灵敏、双通道可视化检测 | 将蛋白响应核酸电路与等温RNA转录结合,利用荧光RNA-染料复合物产生红绿荧光信号,实现免仪器的超灵敏多靶标检测,并通过红绿荧光逻辑门直观解读结果 | 未明确提及局限性,但可能涉及适配体筛选的复杂度、临床样本中基质效应及长期稳定性等潜在挑战 | 开发一种简单、高灵敏、无干扰的蛋白生物标志物多重检测方法,用于早期诊断和精准医疗 | 以甲胎蛋白和人血清白蛋白为模型蛋白的生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌(甲胎蛋白相关) | 适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增 | NA | 荧光信号数据 | 加标和临床样本验证,回收率90%-110%,与ELISA结果高度一致 | NA | NA | 适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增电路,产生荧光RNA-染料复合物,实现逻辑门操作 | 医学 |
| 162 | 2026-07-14 |
Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing
2025-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003
PMID:40645879
|
综述 | 综述了CRISPR技术在基因组编辑之外的应用扩展,涵盖分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用图谱和单细胞分析等领域 | 系统总结了CRISPR技术从基因组编辑向多领域拓展的最新进展,特别是结合合成生物学、AI和空间组学的交叉应用 | 当前CRISPR技术在临床转化中仍存在脱靶效应、递送效率低和特异性不足等限制,需进一步研究克服 | 全面阐述CRISPR技术在基因组编辑之外的多样化应用及其未来发展方向 | CRISPR-Cas系统及其相关技术(如dCas蛋白、侧切活性等) | 分子生物学、合成生物学 | NA | CRISPR, Cas酶, 侧切活性, 催化失活Cas蛋白, CRISPR引导邻近标记, 单细胞CRISPR筛选 | NA | 核酸、离子、代谢物、蛋白质、空间组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13, dCas9, dCas13 | NA | NA | 分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用分析、单细胞分析 |
| 163 | 2026-07-14 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
|
综述 | 本文全面综述了甘草属植物的分类学、药理学、活性成分生物合成及合成生物学,旨在为甘草的分子育种和合成生物学研究提供基础 | 整合了甘草属植物的系统分类、多组学研究及生物合成途径,特别强调了代谢工程和微生物绿色生产在提高活性成分产量中的应用 | 未提及具体的研究数据或实验验证,依赖于现有文献的总结 | 提供甘草属植物的综合视角,促进分子育种和合成生物学领域的发展 | 甘草属物种、活性成分(三萜类、黄酮类、多糖)及其药理活性 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径 | 医药、资源保护 |
| 164 | 2026-07-14 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
|
研究论文 | 在毕赤酵母中设计和构建光调控基因转录与蛋白质翻译系统 | 首次在毕赤酵母中构建了光调控的基因转录和蛋白质翻译双系统,通过光敏传感器和稀有密码子刹车设计实现精确调控 | 光调控系统的性能优化可能依赖于特定配置(如LRE位置和拷贝数),且可能未在复杂蛋白表达场景中验证 | 开发具有优异表达能力和光敏感性的光调控基因转录与蛋白质翻译系统,以优化毕赤酵母在生物技术和合成生物学中的应用 | 光调控基因转录和蛋白质翻译系统 | 合成生物学 | NA | 光调控基因表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 光敏传感器(WC-1)、顺式元件(LRE)设计、稀有密码子刹车 | 毕赤酵母(P. pastoris) | 光诱导启动子、光抑制启动子、光抑制翻译系统(稀有密码子刹车) | 生物技术、合成生物学 |
| 165 | 2026-07-13 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-03-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
|
研究论文 | 本研究展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性引发原子转移自由基反应,实现丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸类单体在胞内聚合 | 首次证实细菌细胞可利用天然生物分子引发胞内自由基聚合,提供了一种新的细胞工程和合成生物学工具 | 仅使用了有限类型的单体(丙烯酰胺、丙烯酸、甲基丙烯酸类),未探索更广范围的单体和聚合条件 | 探究细菌细胞作为活催化剂进行胞内自由基聚合的可行性及细胞相容性 | 细菌细胞(具体菌种未在摘要中明确指定) | 合成生物学 | NA | NMR, GPC, 荧光标记, 荧光显微镜, 流式细胞术 | NA | 图像, 光谱, 色谱数据 | NA | NA | 细菌(未具体指定) | 胞内自由基聚合体系(基于原子转移自由基聚合引发剂) | 细胞工程, 合成生物学 |
| 166 | 2026-07-10 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-12, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
|
综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症免疫治疗中的应用 | 系统总结了脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶及智能纳米载体等纳米平台在细胞因子靶向、可控和持续递送中的创新设计,并探讨其与免疫检查点抑制剂、化疗、放疗及细胞治疗的协同作用 | 面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性和制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送能否克服传统细胞因子疗法的局限性并提升胃肠道癌症免疫治疗效果 | 胃肠道癌症(结直肠癌、胃癌、食管癌)中的细胞因子免疫治疗 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 纳米递送技术 | NA | 文献综述资料 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 167 | 2026-07-10 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中甲萘醌前体DHNA的合成受遗传、酶学和代谢的联合调控机制,平衡其生长益处与毒性 | 首次阐明微生物中醌类水平通过可逆通量与别构反馈抑制的相互作用实现两相调控模式,并发现MenF与MenD的相对表达比例决定调控酶的角色 | 研究仅限于乳酸菌中的DHNA合成途径,未探索其他醌类或微生物系统中的普适性 | 探究微生物调控醌类水平的机制,为代谢工程优化醌类生产提供理论基础 | 乳酸菌中甲萘醌前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的合成调控 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 甲萘醌前体DHNA的生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 168 | 2026-07-10 |
Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01976-25
PMID:40824035
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程和适应性实验室进化,使工业相关土壤细菌恶臭假单胞菌能够利用甲酸和甲醇作为唯一碳源和能源,实现严格的一碳代谢 | 首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸和甲醇营养型生长,通过线性还原性甘氨酸途径和进化工程拓展了该菌株的底物利用范围 | 初始菌株在混合营养条件下培养,进化后菌株的倍增时间较长,甲酸和甲醇的生长速率仍有优化空间 | 构建能高效利用甲酸和甲醇作为唯一碳源的恶臭假单胞菌菌株 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 代谢工程,适应性实验室进化 | NA | 基因组数据 | 多个工程菌株,包括rG·F和rG·M菌株,具体数量未提供 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 线性还原性甘氨酸途径 | 工业生物技术 |
| 169 | 2026-07-10 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
|
研究论文 | 利用合成生物学改造费氏弧菌,使其能够生物修复含盐废水和土壤中的复杂有机污染物 | 通过插入tfoX基因增强DNA吸收和整合能力,并结合酵母组装和迭代自然转化方法,成功向费氏弧菌中转移五个总长43kb的降解基因簇,实现对联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯等多种有机污染物的同时降解 | 未提及 | 开发能够高效降解复杂有机污染物且耐盐的工程菌株,用于含盐废水和土壤的生物修复 | 费氏弧菌菌株Vmax | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酵母组装、迭代自然转化 | NA | NA | 实验室废水样品(来自氯碱厂和石油炼厂) | CRISPR-Cas9 | 费氏弧菌(Vibrio natriegens) | 代谢途径(降解基因簇) | 环境 |
| 170 | 2026-07-10 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-01-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
|
research paper | 利用合成生物学研究种子植物中独脚金内酯物种间生物合成的进化 | 发现CYP722A酶将香豆酸转化为16-羟基香豆酸(非经典SL),并证明其在进化上是经典独脚金内酯生物合成的前体 | NA | 阐明种子植物中独脚金内酯生物合成的进化机制 | 独脚金内酯生物合成途径中的CYP722A和CYP722C酶 | 植物生物学, 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NB | NA | 合成生物学 | NA | 独脚金内酯生物合成途径 | 农业 |
| 171 | 2026-07-07 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-07-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
|
研究论文 | 开发CRISPR/dCas介导的反沉默方法,通过将dCas蛋白重新编程为异源沉默因子的拮抗剂,实现对放线菌中Lsr2样沉默蛋白靶基因的精确上调 | 首次利用核酸酶缺陷的dCas酶(dCas9和dCas12a)对抗Lsr2样异源沉默蛋白,无需启动子序列修饰即可实现反沉默,具有高特异性和低脱靶效应 | 不同靶位置和链上存在CRISPR干扰效应的强度差异,可能需要进一步优化gRNA设计以平衡沉默与干扰 | 开发一种不依赖启动子工程的反沉默策略,精确上调异源沉默蛋白靶向的基因表达 | 天蓝色链霉菌中的CgpS沉默蛋白和结核分枝杆菌中的Lsr2沉默蛋白及其靶基因簇 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas介导的反沉默(CRISPRcosi)、全基因组转录组分析 | NA | RNA-seq数据 | 多个天蓝色链霉菌和结核分枝杆菌菌株 | CRISPR-dCas9, CRISPR-dCas12a | 天蓝色链霉菌, 结核分枝杆菌 | CRISPR/dCas介导的反沉默系统(CRISPRcosi),通过gRNA/dCasDNA结合靶向沉默蛋白的成核位点 | 生物技术, 合成生物学 |
| 172 | 2026-07-06 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-06-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
|
研究论文 | 表征一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶,用于苯乙烯的生物合成 | 首次通过真菌阿魏酸脱羧酶的多重序列比对的共识蛋白设计,获得一种高效的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,并解析了其高分辨率的晶体结构(2.1 Å),揭示了关键催化残基 | 苯乙烯对微生物的毒性仍然是一个挑战,且该酶的工业应用还需进一步优化 | 实现从L-苯丙氨酸两步法生物合成苯乙烯,并表征关键酶PSC1的物理化学性质和三维结构 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,以及溶剂耐受菌株DOT-T1E | 合成生物学 | NA | NA | NA | 结构数据(蛋白质晶体结构) | NA | NA | DOT-T1E(溶剂耐受菌株) | 两步法苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→肉桂酸→苯乙烯 | 工业生物技术 |
| 173 | 2026-07-05 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-02-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
|
研究论文 | 提出一种利用肿瘤归巢聚合物实现CAR-T细胞空间激活控制的新框架IMPACT | 首次结合合成生物学与生物材料方法,通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR-T细胞的靶向激活 | 仅在小鼠肿瘤模型中进行了初步验证,未涉及人体临床试验 | 开发一种通过聚合物介导的肿瘤定位策略,以提高CAR-T细胞治疗的特异性并减少脱靶毒性 | CAR-T细胞及肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学, 生物材料 | 肿瘤 | 合成生物学, 生物材料工程 | NA | 动物实验数据 | 小鼠肿瘤模型中的实验样本 | NA | 小鼠 | IF-THEN门控CAR-T细胞电路,通过荧光素标记聚合物触发条件性蛋白表达 | 医学 |
| 174 | 2026-07-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
|
研究论文 | 开发了一种多模块组装先导编辑系统(mPE),显著提高双子叶植物中精确多碱基插入效率 | 首次在双子叶植物中通过拆分PE系统并利用pol II策略表达pegRNA,构建mPE系统,实现高达1288.5倍的效率提升,并能在原始PE2无法编辑的位点进行编辑 | 仅在拟南芥和本氏烟草两种模式植物中验证,尚未在作物或其他双子叶植物中测试,且多碱基插入的改善机制需进一步阐明 | 解决双子叶植物中先导编辑效率低下和不一致的问题 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 数字病理学 | NA | 先导编辑(PE)、农杆菌介导转化、深度扩增子测序 | NA | 序列数据 | 0.2-0.5百万条总清晰读长的深度扩增子测序数据 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装先导编辑系统(mPE) | 农业, 植物合成生物学 |
| 175 | 2026-07-04 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
|
综述 | 综述了酿酒酵母在医学应用中的工程化进展,包括药物生产、生物传感器和活体生物治疗产品 | 系统总结了酿酒酵母在医学领域的三类主要应用(药物与疫苗生产、诊断生物传感器、肠道疾病活体治疗)及其学术与商业发展 | 该领域仍面临挑战,但未具体说明主要障碍 | 综述酿酒酵母工程化在医学领域的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 医学 |
| 176 | 2026-07-03 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
|
研究论文 | 通过挖掘乌头转录组,发现多功能P450酶驱动二萜类化合物结构多样化和功能分化,实现生物活性化合物tripterifordin和隐存atiserenoids的合成 | 首次揭示多功能P450酶催化二萜骨架七个不同位点的氧化,并发现关键残基调控P450活性和产物谱,同时发现tripterifordin在乌头中的趋同进化合成 | 未进一步探索下游二萜途径的详细机制,且体内功能验证可能受限于异源表达系统 | 研究细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构多样化和功能分化 | 乌头(Aconitum carmichaelii 和 Aconitum coreanum)中的二萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 转录组测序,功能验证,蛋白质分析,定点诱变,组合生物合成 | NA | 序列数据 | 两个乌头物种的转录组样本 | NA | NA | 组合生物合成途径,用于生产tripterifordin、guan-fu二萜类化合物A和14种新atiserenoids | 医药 |
| 177 | 2026-07-03 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-06, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
|
综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计精确的微生物群落以执行特定功能,实现个性化精准治疗 | 需要严格的临床试验来评估工程化微生物群落在不同人群中的安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来根治代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落 | 合成生物学 | 代谢紊乱, 炎症性疾病, 胃肠道感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 人体肠道微生物组 | 人工微生物群落(包含治疗分子产生、免疫调节和抗病原菌等功能模块) | 医学 |
| 178 | 2026-07-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
|
综述 | 综述了瘤内微生物群通过炎症和免疫协同重塑肺癌微环境的机制 | 颠覆了传统“无菌肿瘤”观念,揭示了瘤内微生物群通过代谢物分泌、信号通路激活、免疫抑制细胞募集和免疫检查点分子表达上调主动促进肿瘤进展的机制 | 肺组织低生物量特性导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响,且真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明瘤内微生物群在肺癌进展中的作用机制并探索其临床应用潜力 | 肺癌组织和肿瘤微环境中的瘤内微生物群 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 179 | 2026-07-01 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-03-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
|
综述 | 本文概述了利用光遗传学手段调控合成酵母群落的最新进展 | 首次将光遗传学应用于合成微生物群落的时空调控,提出光生态学概念 | 主要基于现有研究总结,未涉及具体实验验证或新方法开发 | 探讨光遗传学在合成酵母群落中的应用潜力及其对复杂生态系统研究的启示 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 光控开关、逻辑门、代谢途径 | 工业生物技术, 环境, 医学 |
| 180 | 2026-06-30 |
Microorganism delivery of cancer vaccines
2025-12-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114288
PMID:41045964
|
综述 | 综述微生物介导的癌症疫苗,阐述其与宿主免疫系统的相互作用及抗肿瘤应用 | 综述微生物肿瘤靶向机制及合成生物学在精准表达肿瘤抗原或免疫检查点抑制剂中的应用 | 讨论了微生物癌症疫苗面临的潜在挑战 | 综合介绍微生物癌症疫苗的设计原理、优势及与其它疗法的联合应用 | 微生物(细菌和病毒)及病毒样颗粒在癌症疫苗中的应用 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 病毒 | 微生物癌症疫苗(用于表达肿瘤抗原或免疫检查点抑制剂) | 医学 |