合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 92 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-04 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
|
meta-analysis | 通过荟萃分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇，鉴定出与克罗恩病相关的脂肪酸酰胺，并验证其破坏肠道通透性和加剧疾病的作用 | 首次通过合成生物学方法解析了克罗恩病相关基因簇产生的六种脂肪酸酰胺结构，并证实这些微生物来源小分子在疾病发生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型验证，人类样本中的直接致病机制仍需进一步探究 | 探究肠道微生物组小分子代谢物在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道宏基因组样本、克罗恩病相关基因簇产物、结肠炎小鼠模型 | 宏基因组学 | 炎症性肠病（克罗恩病） | 宏基因组测序、合成生物学、结构解析 | NA | 宏基因组数据、质谱数据 | IBD患者与健康对照的粪便样本（具体数量未明确说明） | 合成生物学 | 梭菌属（Clostridia） | 小分子生物合成基因簇（BGCs） | 医学 |
| 2 | 2026-02-28 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
|
综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一新兴领域，整合化学、生物学、物理学和工程学方法，以合成和操纵脂质及生物膜来理解其复杂性质与功能 | 首次将跨学科研究系统化为“合成脂质生物学”框架，强调通过构建与分析脂质及膜系统来深化理解，类比合成生物学的核心理念 | NA | 通过合成、编辑和检测脂质及生物膜，揭示其性质、行为和功能，以应对脂质生物学复杂性 | 脂质分子、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-02-22 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
|
综述 | 本文综述了通过相分离驱动的合成生物分子凝聚体（SBMCs）的最新进展，包括其构建原理、调控方法以及在基础与应用研究中的潜力 | 利用合成生物学方法从头合成生物分子凝聚体，并系统阐述其内在构建原理、调控方法及在染色体结构、疾病机制、生物制造等领域的应用 | 对生物分子凝聚体的内部组织和外部调控机制的理解仍处于早期阶段，未来在生物材料、生物技术和生物医学领域仍面临机遇与挑战 | 探讨合成生物分子凝聚体的构建方法、调控机制及其在基础科学与应用研究中的潜力 | 合成生物分子凝聚体（SBMCs） | 合成生物学 | 肿瘤发生、衰老 | 相分离、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物材料、生物技术、生物医学、药物递送、人工细胞设计、生物制造 |
| 4 | 2026-02-14 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
|
研究论文 | 开发了一种名为IMPACT的新框架，通过聚合物介导的空间控制方法，实现CAR-T细胞在肿瘤微环境中的特异性激活 | 首次将合成生物学与生物材料方法结合，创建了聚合物介导的IF-THEN门控CAR-T细胞系统，实现解剖学水平的空间控制 | 目前仅在小鼠肿瘤模型中进行了验证，尚未在人体临床试验中测试 | 提高CAR-T细胞疗法的特异性，减少脱靶毒性 | CAR-T细胞、肿瘤归巢聚合物、小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学方法、生物材料工程 | NA | 实验数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | T细胞 | IF-THEN门控电路：当工程化细胞与肿瘤定位聚合物结合（IF条件）后，驱动特定蛋白在肿瘤内选择性表达（THEN条件） | 医学 |
| 5 | 2026-02-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
|
研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，创建了具有可定制拷贝数的质粒，并利用合成RNA调控器实现独立拷贝控制，展示了合成复制起点（SynORI）的模块化工程应用 | 开发了合成复制起点（SynORI）技术，实现了质粒拷贝数的可定制化、兼容性和模块化调控，并创建了正交质粒库 | NA | 研究合成生物学中质粒复制起点的工程化改造，以提高其可调性、兼容性和模块化 | 质粒的复制起点和合成RNA调控器 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控器技术 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | 大肠杆菌 | 合成复制起点（SynORI）和正交质粒库，用于实现可调拷贝数控制和环境信号的多重报告 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-02-06 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
|
综述 | 本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶以开发整合生物加工（CBP）酵母菌株的当前策略与进展，并探讨了利用合成生物学工具优化菌株的工业应用前景 | 系统总结了通过理性菌株设计和现代合成生物学工具优化CBP酵母的策略，并指出组学策略对未来菌株开发的指导作用 | 目前报道的一步法纤维素底物转化乙醇的滴度和产率远低于工业要求，CBP尚未实现工业化规模应用 | 开发能够高效利用纤维素、实现整合生物加工的酵母菌株，用于将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其工程化菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具、组学策略（omics strategies）、理性菌株设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 纤维素酶表达系统、核心纤维素酶组合表达、分泌途径优化 | 能源、工业生物技术 |
| 7 | 2026-02-06 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
|
研究论文 | 本研究旨在开发一种用于大肠杆菌的快速、无标记、多位点、多拷贝基因组编辑系统，并探索构建AMP-ATP循环系统 | 鉴定出单个ppk基因（No.8）可完成AMP-ATP循环反应，并利用MUCICAT技术将其插入基因组不同位置和拷贝数，实现与质粒相当的表达水平 | 未明确说明实验规模或样本量，且研究主要聚焦于大肠杆菌，可能限制其直接应用于其他生物系统 | 开发高效的大肠杆菌基因组编辑系统，以降低ATP依赖反应的成本并推进合成生物学应用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）及其ATP合成途径相关基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | AMP-ATP循环系统 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-02-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
|
研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶，在人类细胞系和原代T细胞中实现了可编程的DNA甲基化和基因沉默 | 在DNMT3A催化核心引入突变，稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达，同时保持DNA甲基化和基因沉默功能，并首次在原代人T细胞中验证了工程化dCas-DNMTs的功能 | 研究主要限于体外细胞实验，尚未在体内模型或更复杂的生理环境中验证 | 开发更稳定、高效的CRISPR/Cas9基础的表观遗传编辑工具，用于哺乳动物细胞的可编程DNA甲基化调控 | 人类细胞系（包括Jurkat T细胞）和供体来源的原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9表观遗传编辑、DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白系统 | 表观遗传数据、基因表达数据 | 多种人类细胞系及供体来源的原代T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系、原代人T细胞 | dCas9与DNMT3A/3L甲基转移酶融合构建的表观遗传编辑系统 | 医学、基础研究 |
| 9 | 2026-02-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于植物生物工程的快速、自动化、高通量管道FAST-PB，通过整合自动化生物铸造、基因组编辑和单细胞质谱分析，以增强玉米和本氏烟草中的脂质生产 | 开发了FAST-PB管道，整合了自动化生物铸造、Golden Gate克隆、CRISPR编辑和单细胞MALDI-MS分析，实现了高通量植物基因组工程和表型分析，显著提高了脂质产量 | NA | 开发一种自动化高通量管道，以加速植物生物工程过程，特别是增强脂质生产 | 玉米（Zea mays）和本氏烟草（Nicotiana benthamiana）的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、Golden Gate克隆、单细胞MALDI-MS、自动化生物铸造 | NA | 质谱数据、脂质组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 玉米, 本氏烟草 | 通过CRISPR激活脂质控制基因来增强脂质生产，涉及多基因盒的引入 | 农业, 能源 |
| 10 | 2026-02-03 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
|
研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针，用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域间的相互作用，并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合结构域活性位点的交联，揭示了模块间识别事件和载体蛋白的进程性移动机制 | 研究聚焦于酪氨酸生物合成前两个模块的相互作用，可能未完全反映完整合成酶的动态特性 | 阐明非核糖体肽合成酶的分子作用机制，为合成生物学设计提供结构基础 | 酪氨酸生物合成途径中的载体蛋白与缩合结构域/差向异构化结构域复合物 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医药生物技术 |
| 11 | 2026-01-24 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过具有3'-突出端的引物对进行高效定点诱变的优化方法 | 利用部分互补且具有3'-突出端的引物对设计，显著提高了诱变效率并降低了错误率 | NA | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | NA | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2025-10-05 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
|
研究论文 | 开发了一种可被可溶性配体激活的合成膜内蛋白水解受体平台 | 首次将SNIPR受体架构适配用于可溶性配体激活，具有低基线活性和高倍数激活特性 | NA | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体并激活定制细胞功能 | 合成膜内蛋白水解受体和工程化治疗细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | 内吞pH依赖性切割机制 | NA | NA | NA | SNIPR, CAR-T | 哺乳动物细胞 | 合成信号网络，细胞间通讯系统 | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-02-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
|
综述 | 系统回顾2009-2023年间发现的409种天然二苯乙烯类化合物，重点分析寡聚二苯乙烯的结构分类、仿生合成及生物活性 | 首次系统梳理近15年新发现的二苯乙烯类化合物，特别关注具有独特骨架的寡聚二苯乙烯及其绝对立体化学研究 | 仅涵盖2009-2023年间报道的化合物，未涉及更早期的研究成果 | 总结天然二苯乙烯类化合物的化学结构与生物活性研究进展 | 天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯 | 天然产物化学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 文献数据 | 409种新二苯乙烯化合物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 14 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
|
综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
|
研究论文 | 开发了一个高效的基因组基础模型GenomeOcean，通过大规模宏基因组组装数据训练，提升对稀有微生物物种的表征能力 | 直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练，采用字节对编码(BPE)标记化策略，实现150倍更快的序列生成速度，同时保持高生物保真度 | NA | 开发高效的基因组基础模型，改进对稀有微生物物种的表征能力 | 宏基因组数据集中的微生物物种和蛋白质编码基因 | 机器学习 | NA | 宏基因组测序，字节对编码(BPE) | 生成式基础模型 | 基因组序列数据 | 220TB宏基因组数据集，包含超过600Gbp的高质量重叠群 | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 16 | 2025-10-05 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
|
研究论文 | 本文提出了一种旨在促进微生物学领域包容性和持久性的途径项目 | 设计了整合噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域的公平培训途径 | NA | 促进微生物学领域多元化人才培养和劳动力发展 | 微生物学领域的教育项目和人才培养途径 | 微生物学教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 17 | 2025-10-05 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
|
综述 | 本文探讨了合成生物学与人工智能技术在药物开发领域的融合应用 | 整合硫醇化结构域交换方法与人工智能工具改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶，开创药物研发新范式 | NA | 通过交叉学科技术开发应对抗生素耐药性和癌症的新一代治疗方法 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程化改造 | 机器学习 | 癌症 | 人工智能驱动的合成智能工具 | NA | NA | NA | eXchange Unit between Thiolation domains | NA | 生物活性化合物生物合成途径优化 | 医药 |
| 18 | 2025-10-05 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
|
研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了小立碗藓中大片段DNA插入的效率 | 设计了包含两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体，可在体内释放线性模板用于同源定向修复 | 主要在小立碗藓中验证，对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓(P. patens)原生质体 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 | CRISPR-Cas9 | 小立碗藓(Physcomitrium patens) | 同源定向修复(HDR)系统 | 农业,工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
|
研究论文 | 本研究基于Bacteroides thetaiotaomicron开发了一种抗终止子微生物全细胞生物传感器，用于通过检测硝酸盐/亚硝酸盐在小鼠体内诊断结肠炎 | 开发了基于抗终止子的新型生物传感元件，通过结合组成型启动子和诱导型终止子创建了硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子 | NA | 开发基于Bacteroides thetaiotaomicron的诊断性工程益生菌用于结肠炎诊断 | Bacteroides thetaiotaomicron微生物和溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学 | 溃疡性结肠炎 | 微生物全细胞生物传感器技术 | NA | 生物传感响应数据 | 化学诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学元件设计 | Bacteroides thetaiotaomicron | 抗终止子生物传感器，硝酸盐/亚硝酸盐响应型基因回路 | 医学诊断 |
| 20 | 2025-10-05 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
|
研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo系统兼容的低拷贝和中拷贝载体，扩展了模块化蛋白表达工具包 | 扩展了现有MoClo工具包，新增低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)目标载体，实现500倍荧光输出差异的蛋白表达范围 | NA | 开发模块化蛋白表达系统，优化生长耦合酶表达条件 | 大肠杆菌(E. coli)蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆(MoClo) | NA | 荧光输出数据，生长曲线数据 | 28个载体(Addgene目录号217582-217609) | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌(E. coli) | 模块化蛋白表达系统，包含不同拷贝数的表达载体 | 工业生物技术 |