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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-03-30 |
Alien Chromosome Serves as a Novel Platform for Multiple Gene Expression in Kluyveromyces marxianus
2025-Feb-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030509
PMID:40142402
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研究论文 | 本研究探索了利用外来染色体R1作为克鲁维酵母中多基因稳定整合和表达的新平台 | 首次利用外来染色体R1作为多基因表达的稳定平台,并展示了其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力 | 目前对克鲁维酵母中调控元件和插入位点的了解有限 | 开发克鲁维酵母中多基因稳定表达的新方法 | 克鲁维酵母KS-R1菌株及其外来染色体R1 | 合成生物学 | NA | 基因删除、基因替换、异源基因表达 | NA | 基因表达数据 | 多个克鲁维酵母菌株及其基因改造变体 |
2 | 2025-03-24 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IMPACT的新框架,通过合成生物学和生物材料方法实现CAR T细胞的空间控制激活 | 提出了IMPACT框架,通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR T细胞的肿瘤局部激活 | 目前仅在鼠类肿瘤模型中进行了验证,尚未在人类临床试验中应用 | 提高CAR T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR T细胞和肿瘤微环境中的聚合物 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学和生物材料方法 | IF-THEN门控CAR T细胞 | 实验数据 | 鼠类肿瘤模型 |
3 | 2025-03-20 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析,探讨了Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术,深入解析了Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制,并验证了tonb基因在该机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制,未涉及其他极端环境的耐受性 | 研究Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制,以促进其在工业污染控制和合成生物学底盘细胞中的应用 | Halomonas alkalicola CICC 11012s及其突变体 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 蛋白质组数据、代谢组数据 | 野生型和突变体Halomonas alkalicola CICC 11012s |
4 | 2025-03-19 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
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研究论文 | 本文介绍了一种快速、自动化、可扩展的高通量植物生物工程管道(FAST-PB),用于玉米和本氏烟草的基因组编辑和产物表征 | FAST-PB整合了自动化生物工厂工程与单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱(MALDI-MS),显著提高了合成生物学、基因组编辑和代谢工程的通量 | NA | 提高植物细胞中的脂质产量 | 玉米(Zea mays)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱(MALDI-MS) | NA | 单细胞脂质组学数据 | 96个载体并行构建 |
5 | 2025-03-18 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
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综述 | 本文综述了当前处于后期开发阶段的最新技术,探讨了它们在微生物组治疗中的优势和局限性 | 涵盖了从粪便衍生产品到活体生物治疗、噬菌体疗法和合成生物学的多种技术,为微生物组治疗的未来发展指明了方向 | 现有商业微生物组定向产品通常效果较低 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向 | 人类微生物组 | 微生物组治疗 | NA | 粪便衍生产品、活体生物治疗、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | NA | NA |
6 | 2025-03-16 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
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研究论文 | 本文对酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的冻融耐受基因集进行了系统表征和分析,以优化低温培养条件下的生物合成效率 | 首次在统一的遗传背景下(BY4741实验室菌株)对冻融耐受基因家族进行标准化表征,揭示了这些基因在冻融和热激应激下的生存能力增强 | 研究仅限于BY4741实验室菌株,未涵盖其他遗传背景的酵母菌株 | 研究冻融耐受基因在低温培养条件下对酵母生存能力的影响,以优化生物合成效率 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的冻融耐受基因 | 合成生物学 | NA | 基因突变技术(KanMX6抗性盒) | NA | 基因表达数据 | BY4741实验室菌株及其突变体 |
7 | 2025-03-16 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
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综述 | 本文综述了真核生物中5'非翻译区(5' UTR)在翻译控制中的结构特征及其功能影响 | 详细阐述了5' UTR的结构特征如何独立或通过反式作用因子调节翻译,并探讨了其在合成生物学和基于mRNA的靶向治疗中的潜在应用 | NA | 探讨5' UTR在真核生物翻译控制中的作用及其在生物医学中的潜在应用 | 真核生物的5'非翻译区(5' UTR) | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
8 | 2025-03-15 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Dsembler的基于网络的软件应用,旨在组装长DNA序列,以解决合成生物学中的基因组装挑战 | Dsembler通过提供具有最佳熔解温度和GC重叠的寡核苷酸集合,提高了寡核苷酸设计的准确性,解决了合成生物学中的关键挑战 | NA | 开发一种工具以促进寡核苷酸的组装,支持合成生物学、基因工程和分子生物学的进步 | 长DNA序列的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | NA |
9 | 2025-03-15 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-Feb-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在作物改良中的应用,包括基因电路设计、基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程和AI等策略 | 首次系统性地综述了AI驱动的合成生物学在植物工程中的应用,并提出了通过AI赋能的合成生物技术开发SMART作物的概念 | 尚未解决合成生物学发展中的挑战,如技术复杂性和伦理问题 | 探讨合成生物学和人工智能在作物改良中的应用,以提高作物产量、营养吸收、抗逆性和营养质量 | 作物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程 | AI | 基因数据、蛋白质数据、多组学数据 | NA |
10 | 2025-03-15 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNIPR的合成受体架构,用于响应可溶性配体并激活定制细胞功能,展示了其在调节工程治疗细胞活性方面的临床应用潜力 | 开发了一种新型的合成受体平台SNIPR,能够通过内吞和pH依赖的切割机制响应自然和合成的可溶性因子,具有低基线活性和高激活倍数 | 目前仅针对可溶性配体进行了验证,尚未广泛测试其在多种疾病模型中的应用 | 开发模块化的合成受体,以响应可溶性配体并激活定制细胞功能,用于调节工程治疗细胞的活性 | 合成受体SNIPR及其在工程治疗细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成受体工程 | SNIPR | NA | NA |
11 | 2025-03-14 |
Harnessing Synthetic Riboswitches for Tunable Gene Regulation in Mammalian Cells
2025-Feb-24, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202401015
PMID:39995098
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综述 | 本文探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中的设计和功能实现的最新进展,强调了基于多种RNA调控机制的研究和新兴技术 | 本文综述了合成核糖开关在哺乳动物细胞中的应用,展示了其在基因治疗、生物生产和细胞重编程等领域的潜力 | 讨论了合成核糖开关在复杂生物环境中的脱靶效应、系统稳定性和配体递送等挑战 | 探索合成核糖开关在哺乳动物细胞中的设计和功能实现,以推动其在生物医学领域的应用 | 哺乳动物细胞中的合成核糖开关 | 合成生物学 | NA | RNA调控机制 | NA | NA | NA |
12 | 2025-03-12 |
Anti photoaging mechanism of a novel recombinant human fibronectin peptide (rhFNP) derived from the extracellular matrix
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42730
PMID:40061928
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研究论文 | 本文研究了一种新型重组人纤维连接蛋白肽(rhFNP)在抗光老化中的作用机制 | 利用合成生物学构建了一种新型重组人纤维连接蛋白肽(rhFNP),并通过多种细胞模型、斑马鱼和小鼠光老化模型验证了其抗光老化功能 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行人体临床试验 | 探讨rhFNP在抗皮肤光老化中的作用机制 | HaCaT、P815、NHEK细胞、斑马鱼和KM小鼠光老化模型 | 生物医学 | 皮肤老化 | 合成生物学、转录组学分析 | 细胞模型、动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 多种细胞系、斑马鱼和KM小鼠 |
13 | 2025-03-12 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
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研究论文 | 本文研究了DNA复制过程中聚合酶错误对突变率的影响,并探讨了DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复(MMR)在突变率中的作用 | 通过构建条件性超突变体并使用数学模型分析,揭示了校对如何防止MMR的部分饱和,并放大了核苷酸选择性的内在偏差 | 研究中使用的计数方法可能聚合了异质性突变,且对野生型中突变途径的了解有限 | 解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复对突变率的贡献 | 革兰氏阳性模型细菌枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 分子生物学 | NA | 突变积累实验、数学模型分析 | NA | 突变数据 | 多个条件性超突变体 |
14 | 2025-03-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并展示了合成复制起点(SynORI)的模块化工程能力 | 提出了合成复制起点(SynORI)的概念,实现了质粒拷贝数的可定制化和模块化响应环境信号的能力 | 研究主要局限于大肠杆菌中,未在其他微生物中验证其通用性 | 开发具有可定制拷贝数和模块化响应能力的合成质粒,以增强其在合成生物学中的应用 | 质粒的复制起点 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控 | NA | NA | 6个正交SynORI质粒在大肠杆菌中共同维持一周 |
15 | 2025-03-08 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
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研究论文 | 本文通过挖掘噬菌体基因组中的启动子,揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则,并设计了正交性更强的T7 RNAP-启动子变体 | 首次全面挖掘了多种ssRNAPs的启动子,并通过序列共变分析揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间的关键位点相互作用网络,设计了正交性更强的变体 | 研究主要集中于T7样RNA聚合酶,其他类型的ssRNAPs的启动子特异性规则仍需进一步探索 | 揭示T7样RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则,并设计正交性更强的RNAP-启动子变体 | 噬菌体基因组中的启动子和T7样RNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、序列共变分析 | NA | 基因组序列 | 多种噬菌体基因组 |
16 | 2025-03-06 |
From Spores to Suffering: Understanding the Role of Anthrax in Bioterrorism
2025-Feb-27, Military medicine
IF:1.2Q2
DOI:10.1093/milmed/usae535
PMID:39656926
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review | 本文综述了炭疽病在生物恐怖主义中的作用,并探讨了未来应对策略 | 提出了利用合成生物学技术、纳米诊断和CRISPR技术等新兴技术来预防、检测和治疗炭疽病的新方法 | NA | 探讨炭疽病在生物恐怖主义中的威胁及应对策略 | 炭疽病及其病原体炭疽芽孢杆菌 | 生物恐怖主义与传染病防控 | 炭疽病 | 合成生物学技术、纳米诊断、CRISPR技术 | NA | 文献数据 | 53篇文献 |
17 | 2025-03-06 |
Nucleic Acid Framework-Enabled Spatial Organization for Biological Applications
2025-Feb-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00164
PMID:40041004
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研究论文 | 本文总结了利用DNA折纸和四面体DNA纳米结构(TDNs)进行分子空间组织的方法,并探讨了基于核酸框架(NAFs)的蛋白质和生物膜仿生应用 | 本文创新性地将NAFs应用于无机纳米颗粒的精确尺寸和结构形成,并展示了其在生物传感、生物成像和纳米医学治疗中的多功能性 | NA | 探讨核酸框架在分子空间组织和生物应用中的潜力 | DNA折纸和四面体DNA纳米结构(TDNs) | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
18 | 2025-03-05 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本文研究了一种新型的双靶向CAR-NK细胞(dtCAR-NK92),用于治疗肺癌 | 设计了一种新型的双靶向CAR(dtCAR),结合了PD-L1纳米抗体和NKG2D,增强了NK细胞的细胞毒性和细胞因子产生 | 研究中未提及长期疗效和潜在副作用 | 探索双靶向CAR-NK细胞在肺癌治疗中的效果 | 肺癌H1299细胞 | 免疫治疗 | 肺癌 | 合成生物学,CAR-NK细胞工程 | 双靶向CAR(dtCAR) | 体外和体内实验数据 | 未明确提及样本数量 |
19 | 2025-03-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的方法和工具,并讨论了其在生物制造中的应用 | 本文详细讨论了转录调控、模板依赖和非模板依赖的方法,并全面总结了进化酿酒酵母在提高环境应激耐受性和细胞代谢性能方面的应用 | 未明确提及具体的研究局限性 | 探讨合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
20 | 2025-03-04 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SHIP的算法,用于在真核生物中系统地识别基因组安全港(GSHs) | SHIP算法通过基因组一般特征注释,系统地识别基因组安全港,填补了现有方法主要依赖经验识别的空白 | 研究主要基于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)进行实验验证,尚未在其他真核生物中广泛验证 | 开发一种系统识别基因组安全港的工具,以支持合成生物学中多基因模块的研究 | 真核生物的基因组安全港 | 基因组工程 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | 算法(SHIP) | 基因组数据 | 基于酿酒酵母的实验验证 |