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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
|
研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶，在人类细胞系和原代T细胞中实现了差异化的甲基化和基因沉默活性 | 在DNMT3A催化核心引入突变，稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达，同时保持DNA甲基化和基因沉默功能 | 研究主要局限于人类细胞系和原代T细胞，尚未在其他哺乳动物细胞类型中验证 | 开发优化的表观遗传编辑工具，用于在哺乳动物细胞中实现可编程的DNA甲基化 | 人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 表观遗传编辑, DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白 | 表观遗传数据, 基因表达数据 | 多种人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系, 原代人类T细胞 | 表观遗传编辑系统, DNA甲基转移酶融合蛋白 | 医学, 生物技术 |
| 2 | 2025-10-05 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 开发了一种可被可溶性配体激活的合成膜内蛋白水解受体平台 | 首次将SNIPR受体架构适配用于可溶性配体激活，具有低基线活性和高倍数激活特性 | NA | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体并激活定制细胞功能 | 合成膜内蛋白水解受体和工程化治疗细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | 内吞pH依赖性切割机制 | NA | NA | NA | SNIPR, CAR-T | 哺乳动物细胞 | 合成信号网络，细胞间通讯系统 | 医学 |
| 3 | 2025-10-05 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-02-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
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综述 | 系统回顾2009-2023年间发现的409种天然二苯乙烯类化合物，重点分析寡聚二苯乙烯的结构分类、仿生合成及生物活性 | 首次系统梳理近15年新发现的二苯乙烯类化合物，特别关注具有独特骨架的寡聚二苯乙烯及其绝对立体化学研究 | 仅涵盖2009-2023年间报道的化合物，未涉及更早期的研究成果 | 总结天然二苯乙烯类化合物的化学结构与生物活性研究进展 | 天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯 | 天然产物化学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 文献数据 | 409种新二苯乙烯化合物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 4 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2025-10-05 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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荟萃分析 | 通过分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇，发现与疾病相关的脂肪酸酰胺类分子及其致病机制 | 首次通过合成生物学方法鉴定出克罗恩病相关的微生物源小分子，并揭示其通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的直接致病性需要进一步验证 | 探索肠道微生物组来源的小分子在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组样本和疾病相关小分子 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组学，合成生物学 | NA | 宏基因组数据，质谱数据 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道微生物组样本 | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2025-10-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
|
研究论文 | 开发了一种用于植物生物工程的快速自动化高通量管道FAST-PB，用于增强植物细胞中的脂质生产 | 整合自动化生物铸造厂与单细胞MALDI-MS技术，实现了基因组编辑和产品表征的高通量自动化流程 | NA | 提高植物生物工程的效率和通量，增强植物细胞脂质生产 | 玉米和本氏烟草的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、单细胞MALDI-MS、Golden Gate克隆 | NA | 质谱数据、代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | Zea mays, Nicotiana benthamiana | 脂质控制基因的CRISPR激活、多基因盒 | 能源, 工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
|
研究论文 | 开发了一个高效的基因组基础模型GenomeOcean，通过大规模宏基因组组装数据训练，提升对稀有微生物物种的表征能力 | 直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练，采用字节对编码(BPE)标记化策略，实现150倍更快的序列生成速度，同时保持高生物保真度 | NA | 开发高效的基因组基础模型，改进对稀有微生物物种的表征能力 | 宏基因组数据集中的微生物物种和蛋白质编码基因 | 机器学习 | NA | 宏基因组测序，字节对编码(BPE) | 生成式基础模型 | 基因组序列数据 | 220TB宏基因组数据集，包含超过600Gbp的高质量重叠群 | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 8 | 2025-10-05 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
|
研究论文 | 本文提出了一种旨在促进微生物学领域包容性和持久性的途径项目 | 设计了整合噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域的公平培训途径 | NA | 促进微生物学领域多元化人才培养和劳动力发展 | 微生物学领域的教育项目和人才培养途径 | 微生物学教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 9 | 2025-10-05 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
|
综述 | 本文探讨了合成生物学与人工智能技术在药物开发领域的融合应用 | 整合硫醇化结构域交换方法与人工智能工具改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶，开创药物研发新范式 | NA | 通过交叉学科技术开发应对抗生素耐药性和癌症的新一代治疗方法 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程化改造 | 机器学习 | 癌症 | 人工智能驱动的合成智能工具 | NA | NA | NA | eXchange Unit between Thiolation domains | NA | 生物活性化合物生物合成途径优化 | 医药 |
| 10 | 2025-10-05 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
|
研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针来解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域的相互作用机制 | 首次利用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的相互作用，并通过冷冻电镜获得高分辨率结构 | NA | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪酪肽生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 11 | 2025-10-05 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了小立碗藓中大片段DNA插入的效率 | 设计了包含两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体，可在体内释放线性模板用于同源定向修复 | 主要在小立碗藓中验证，对其他作物的适用性需要进一步验证 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓(P. patens)原生质体 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 | CRISPR-Cas9 | 小立碗藓(Physcomitrium patens) | 同源定向修复(HDR)系统 | 农业,工业生物技术 |
| 12 | 2025-10-05 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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研究论文 | 本研究基于Bacteroides thetaiotaomicron开发了一种抗终止子微生物全细胞生物传感器，用于通过检测硝酸盐/亚硝酸盐在小鼠体内诊断结肠炎 | 开发了基于抗终止子的新型生物传感元件，通过结合组成型启动子和诱导型终止子创建了硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子 | NA | 开发基于Bacteroides thetaiotaomicron的诊断性工程益生菌用于结肠炎诊断 | Bacteroides thetaiotaomicron微生物和溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学 | 溃疡性结肠炎 | 微生物全细胞生物传感器技术 | NA | 生物传感响应数据 | 化学诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学元件设计 | Bacteroides thetaiotaomicron | 抗终止子生物传感器，硝酸盐/亚硝酸盐响应型基因回路 | 医学诊断 |
| 13 | 2025-10-05 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo系统兼容的低拷贝和中拷贝载体，扩展了模块化蛋白表达工具包 | 扩展了现有MoClo工具包，新增低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)目标载体，实现500倍荧光输出差异的蛋白表达范围 | NA | 开发模块化蛋白表达系统，优化生长耦合酶表达条件 | 大肠杆菌(E. coli)蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆(MoClo) | NA | 荧光输出数据，生长曲线数据 | 28个载体(Addgene目录号217582-217609) | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌(E. coli) | 模块化蛋白表达系统，包含不同拷贝数的表达载体 | 工业生物技术 |
| 14 | 2025-10-05 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
|
综述 | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶的策略，包括野生菌株筛选、诱变育种和模式菌株代谢工程 | 系统总结了利用合成生物学和代谢工程技术替代传统嗜盐菌生产四氢嘧啶的最新进展 | NA | 阐明四氢嘧啶微生物生产的当前研究现状并为工业化生产提供见解 | 四氢嘧啶及其微生物生产菌株 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 嗜盐细菌、非嗜盐工程菌株 | 四氢嘧啶合成途径 | 生物医学、化妆品、食品工业 |
| 15 | 2025-10-05 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
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研究论文 | 本研究通过鉴定新型shufflon倒置酶并建立单分子测序检测方法，扩展了合成生物学工具包中的DNA重组系统 | 鉴定了14种先前未经测试的shufflon倒置酶基因及其识别位点，建立了基于单分子测序的定量检测方法，发现了具有显著改善重组效率的酶 | NA | 扩展合成生物学工具包中的shufflon样重组系统 | shufflon倒置酶及其识别位点 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | 基因组序列数据 | 14种shufflon倒置酶基因 | shufflon倒置酶 | 大肠杆菌 | 合成shufflon系统，用于产生数百万序列变体 | 工业生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
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综述 | 本文探讨无细胞合成生物学系统在代谢模拟与扩展中的应用 | 将无细胞系统从传统蛋白质合成扩展到代谢途径原型设计和非天然反应网络构建 | 目前仅探索了少量代谢可能性，且主要依赖模式生物提取物 | 通过无细胞系统理解和工程化生物基化学转化过程 | 无细胞合成生物学系统及其代谢组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、酶组合设计 | NA | NA | NA | NA | 模式生物提取物 | 代谢途径原型、非天然反应网络 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
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综述 | 本文探讨丝状真菌作为微生物细胞工厂的驯化挑战与应用前景 | 系统阐述利用合成生物学工具开发丝状真菌生物技术潜力的新视角 | NA | 探讨丝状真菌菌株驯化策略以促进其生物技术应用 | 丝状真菌及其遗传与代谢特性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌 | 代谢通路、信号转导通路 | 工业生物技术, 能源, 食品 |
| 18 | 2025-10-05 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
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研究论文 | 开发了一种基于PCR的合成生物学平台DRIMS，能够实现DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | 利用recA非依赖性重组途径，在单一扩增步骤中完成多种DNA操作，无需DNA模板即可合成DNA | 仅提供了概念验证，尚未在更广泛的应用场景中验证 | 开发高效、简单、低成本的DNA操作平台以加速合成生物学和疾病治疗研究 | DNA片段、DNA结合序列、嵌合抗原受体组件、人工microRNA、点突变 | 合成生物学 | 癌症 | PCR, DpnI消化, 转化 | NA | DNA序列 | 4个删除、64个替换、4个组件替换、51个插入、5种点突变、8个DNA合成 | PCR, DpnI | 感受态细胞 | DNA删除、替换、插入、突变和合成操作平台 | 医学, 工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
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综述 | 本文概述了微生物组治疗领域的最新技术进展及其未来发展前景 | 系统性地比较了从粪便衍生产品到活体生物治疗剂、噬菌体疗法和合成生物学等多种微生物组治疗技术的优势与局限 | 作为叙述性综述，未进行定量荟萃分析，主要基于现有文献的定性总结 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向和技术路径 | 人类微生物组及其相关治疗技术 | 微生物组研究 | NA | 粪便微生物移植、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 人类微生物组 | NA | 医学 |
| 20 | 2025-10-05 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
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研究论文 | 本研究通过构建枯草芽孢杆菌条件性超突变株，揭示了DNA聚合酶校对功能如何影响突变率 | 首次在革兰氏阳性模式细菌中系统解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复对突变率的各自贡献 | 分析中存在聚集潜在异质性突变的困难以及野生型突变途径未知的局限 | 阐明DNA聚合酶校对如何影响净聚合酶错误率 | 枯草芽孢杆菌条件性超突变株 | 合成生物学 | NA | 突变积累实验、数学模型分析 | NA | 基因组突变数据 | 多个条件性超突变株系 | 合成生物学工具箱 | 枯草芽孢杆菌 | NA | 工业生物技术 |