本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-16 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-02, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
|
研究论文 | 该文章构建了由信号响应型DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡组成的合成细胞模型,实现了纳米尺度DNA筏重塑与微尺度GUV重塑的耦合 | 首次将可重构DNA纳米筏与合成细胞界面结合,实现纳米尺度DNA筏在脂质膜上可逆的各向同性与短程局部有序转变,并编程化重塑GUV形态;利用生物孔辅助在GUV形状恢复过程中使局部有序DNA筏穿孔膜,形成可密封的合成通道用于大货物运输 | 未明确提及 | 构建合成细胞模型,探索可重构DNA纳米结构与合成细胞的界面交互平台 | 信号响应型DNA纳米筏、生物孔、巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 材料 |
| 2 | 2026-09-13 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
|
研究论文 | DNAdesign是一个基于Web的工具,用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | 同时考虑DNA序列和形状读取模式,利用Deep DNAshape进行超快速DNA形状预测,并提供多种核苷酸序列编码方法 | 未明确提及 | 研究基因调控以及合成生物学应用,如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | Deep DNAshape | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-09-02 |
Synthetic Lipid Biology
2025-02-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
|
综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一领域,整合了化学、生物学、物理学和工程学的研究方法,旨在通过构建、编辑、检测和分析脂质及生物膜来深入理解其性质和功能 | 首次将跨学科的脂质和膜研究统一为一个名为“合成脂质生物学”的新领域,强调理解与构建的紧密联系,并系统性地组织相关研究方法 | 作为综述,未提供具体的实验数据或验证结果,且该领域尚处于初期阶段,实际应用效果有待进一步验证 | 定义并推动合成脂质生物学领域的发展,通过构建和分析脂质及生物膜来增进对其生物学功能的理解 | 脂质分子及其形成的生物膜结构,包括其代谢、转运、相互作用和生物物理特性 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | 文献综述 | NA | 光遗传学、蛋白质工程 | NA | NA | 基础生物学、生物工程 |
| 4 | 2026-08-27 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-02, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
|
研究论文 | 本研究开发了一种可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了苔藓植物Physcomitrium patens中大DNA片段的插入效率 | 开发了体内可切割(IVC)供体系统,通过供体两端含有Cas9核酸酶识别位点,实现体内线性模板的释放,相比标准环状供体显著提高大片段(5.8-11.1 kb)的敲入效率 | 研究局限于特定苔藓物种和特定基因组位点,尚未在作物中验证其适用性 | 提高CRISPR/Cas9介导的大DNA片段精确插入效率 | 苔藓植物Physcomitrium patens | 基因组编辑 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因序列数据 | 涉及4种DNA插入片段(5.8, 7.5, 11.1和7.4 kb)及2个sgRNA靶位点 | CRISPR-Cas9 | Physcomitrium patens(小立碗藓) | 体内可切割供体系统,包含两个Cas9核酸酶识别位点侧翼的同源模板 | 基础研究, 合成生物学, 农业 |
| 5 | 2026-08-26 |
Expression of Viral DNA Polymerase in Synthetic Recombinant Adeno-Associated Virus Producer Cell Line Enhances Full Particle Productivity
2025-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28885
PMID:39578398
|
研究论文 | 本文开发了一种合成生物学策略,通过在HEK293细胞系中诱导表达HSV-1 DNA聚合酶复合物,提高重组腺相关病毒(rAAV)的全颗粒产量。 | 首次在合成rAAV生产细胞系中整合并诱导表达HSV-1 DNA聚合酶(UL30/UL42),显著提高病毒基因组滴度和全颗粒含量,而不影响衣壳产量。 | 未提及具体的局限性,如长期稳定性、规模化生产的潜在问题等。 | 提高rAAV生产细胞系的全颗粒产量,以满足基因治疗的临床需求。 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系(HEK293来源)及其产生的病毒颗粒。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因整合、诱导表达 | NA | 实验数据(病毒滴度、基因组拷贝数等) | 涉及多个克隆细胞系,具体数量未在摘要中提及。 | NA | HEK293细胞 | 诱导型启动子控制HSV-1 DNA聚合酶复合物(UL30/UL42)的表达回路 | 医学(基因治疗) |
| 6 | 2026-08-25 |
Model-guided gene circuit design for engineering genetically stable cell populations in diverse applications
2025-02, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0602
PMID:39933591
|
研究论文 | 本文开发并分析了一种生物分子控制器,旨在独立于突变合成基因的身份来抑制突变细胞生长,从而维持工程化细胞群的遗传稳定性 | 提出了一种与合成基因身份无关的通用控制器设计,无需针对特定基因回路进行重新工程,并通过资源感知细胞建模的新模拟方法直接关联电路设计参数与群体行为 | 未在实验中验证控制器性能,仅基于建模和模拟分析,可能受限于模型假设的准确性 | 开发一种通用生物分子控制器以抑制突变细胞生长,减少合成基因丢失,增强工程化细胞群的遗传稳定性 | 工程化细胞群及其突变体,涉及合成基因回路和宿主细胞 | 合成生物学 | NA | 资源感知细胞建模、仿真 | 生物分子控制器模型、群体行为模型 | 仿真数据 | NA | NA | NA | 生物分子控制器,广义上涉及抑制突变细胞生长的调控回路 | 生物技术、医学 |
| 7 | 2026-08-11 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
|
研究论文 | 本文探讨了利用天然产物、合成生物学和人工智能技术来工程化非核糖体肽合成酶和聚酮合酶,以创造新型生物活性化合物,应对抗生素耐药性和癌症等挑战。 | 提出了结合硫醇化结构域交换单元和人工智能驱动工具(如合成智能)的创新方法,用于扩展化学空间和优化生物合成途径,实现精确和可扩展的治疗解决方案。 | 未提及具体局限性。 | 推动下一代治疗药物的开发,革新药物发现和患者护理。 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶。 | 合成生物学 | 抗生素耐药性、癌症 | 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-08-07 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-02-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞系统和脚趾开关技术的生物传感器,结合核酸序列扩增技术,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒。 | 将脚趾开关技术与NASBA扩增技术相结合,显著提高了检测灵敏度,达到2.9 aM的检测限,解决了脚趾开关在低丰度目标检测中的固有局限性。 | 摘要中未提及明显的局限性,可能需要进一步评估其实际样本性能或稳定性。 | 开发一种快速、灵敏、低成本的寨卡病毒检测方法,应对全球健康需求。 | 寨卡病毒及其核酸序列。 | 合成生物学 | 寨卡病毒感染 | NASBA | NA | DNA/RNA序列 | NA | 脚趾开关技术 | 无细胞提取物 | 脚趾开关传感器 | 医学诊断 |
| 9 | 2026-07-24 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-02-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
|
综述 | 探讨合成生物学与人工智能在作物改良中的应用,综述了工程原理、遗传电路设计方法及未来发展方向 | 系统性地将人工智能驱动的合成生物学路径应用于植物工程,并提出开发SMART作物的概念 | 尚未有系统性综述整合AI与合成生物学的作物改良途径 | 探索作物合成生物学的工程原理及其在作物改良中的应用,并展望AI增强的合成生物技术 | 作物(包括光合效率、植株结构、代谢途径、环境适应性、养分吸收等性状) | 机器学习和数字农业 | NA | 基因编辑、合成核酸技术、合成蛋白技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 作物(植物) | 遗传电路(包括基因编辑、合成核酸和蛋白质回路、代谢通路设计) | 农业 |
| 10 | 2026-07-22 |
Harnessing the polysaccharide production potential to optimize and expand the application of probiotics
2025-02-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.122951
PMID:39643409
|
综述 | 这篇综述总结了用于多糖生产的益生菌底盘和遗传工具,介绍了通过代谢工程和合成生物学策略优化益生菌多糖合成的方法及其在食品、医药等领域的应用 | 系统性地归纳了合成生物学技术提高益生菌多糖产量、控制分子量及合成非天然多糖的策略,并探讨了外源和内源多糖对益生菌稳定性、生物活性和治疗效果的作用 | 未提及具体实验数据或定量比较不同策略的效果,缺乏对现有技术局限性的详细分析 | 优化和扩大益生菌多糖的生产潜力以促进其在生物技术中的应用 | 益生菌及其生产的多糖 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 食品, 医药, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-07-05 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-02-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
|
研究论文 | 提出一种利用肿瘤归巢聚合物实现CAR-T细胞空间激活控制的新框架IMPACT | 首次结合合成生物学与生物材料方法,通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR-T细胞的靶向激活 | 仅在小鼠肿瘤模型中进行了初步验证,未涉及人体临床试验 | 开发一种通过聚合物介导的肿瘤定位策略,以提高CAR-T细胞治疗的特异性并减少脱靶毒性 | CAR-T细胞及肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学, 生物材料 | 肿瘤 | 合成生物学, 生物材料工程 | NA | 动物实验数据 | 小鼠肿瘤模型中的实验样本 | NA | 小鼠 | IF-THEN门控CAR-T细胞电路,通过荧光素标记聚合物触发条件性蛋白表达 | 医学 |
| 12 | 2026-06-30 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-02-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
|
研究论文 | 提出一种名为HEEL的高效酵母文库转化方法,通过热激与电穿孔双重处理提高单转化细胞比例,实现精确的表型-基因型映射 | 首次将热激与电穿孔结合,将单转化细胞比例从20%提升至超过70%,并实现近100倍转化效率提升,结合双条形码及自动化基因分型流程,克服了文库大小与质量之间的长期权衡 | NA | 开发一种高转化效率且能保持高质量单基因型细胞的酵母文库转化方法,促进精确表型-基因型测量,用于改进计算机建模 | 高多样性酵母突变文库 | NA | NA | 热激电穿孔 (HEEL),Sanger测序 | NA | 基因型数据 | NA | NA | 酿酒酵母 (S. cerevisiae) | NA | 分子生物学, 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 13 | 2026-06-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
|
研究论文 | 利用合成生物学策略,通过基因电路在小细胞外囊泡内自组装siRNA,靶向LRRK2基因,减轻帕金森病模型中的神经退行性变 | 开发了一种基于合成生物学的基因电路,通过静脉注射后能在肝脏中自组装并递送LRRK2 siRNA进入黑质,实现非侵入性靶向治疗 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证;长期安全性和有效性尚需评估 | 开发一种通过小细胞外囊泡递送siRNA以治疗帕金森病的方法 | 帕金森病小鼠模型(LRRK2R1441G小鼠) | 合成生物学 | 帕金森病 | 基因电路设计、小细胞外囊泡、siRNA技术 | NA | NA | 多个小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 小鼠 | 包含神经元靶向RVG标签和LRRK2 siRNA的基因电路 | 医学 |
| 14 | 2026-05-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-02, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
|
研究论文 | 研究表明抑制琥珀终止密码子会减弱沙门氏菌的致病性 | 首次揭示终止密码子抑制对细菌致病性的影响具有选择性,仅琥珀密码子抑制影响沙门氏菌毒力 | 未详细阐明琥珀抑制如何调控HilD活性的具体分子机制 | 探究终止密码子抑制对细菌致病性的影响及其机制 | 沙门氏菌的毒力基因表达及巨噬细胞感染过程 | 微生物学 | 沙门氏菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 15 | 2026-05-12 |
Maize2035: A decadal vision for intelligent maize breeding
2025-02-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.012
PMID:39827366
|
综述论文 | 概述玉米育种的历史成功、当前挑战及未来十年智能育种的愿景与前沿解决方案 | 提出集成单细胞分析、全生物组、智能育种算法和合成生物的理性设计等跨学科方法,推动数据驱动的精准农业变革 | 未详细讨论各技术路线的实际验证数据或潜在实施障碍 | 提出面向2035年玉米智能育种的发展愿景和协同目标 | 玉米育种体系及其相关技术策略 | 农业科技 | NA | 多组学分析、单细胞分析、智能育种算法、合成生物学 | NA | 多组学数据、农业大数据 | NA | 合成生物学 | 玉米 | 理性设计合成生物回路 | 农业 |
| 16 | 2026-05-09 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2025-Feb-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
|
研究论文 | 本研究揭示了果蝇中调控区域间的染色体间接触如何触发稳定的跨代表观遗传,并鉴定了关键的蛋白因子及其作用机制 | 首次证明染色质接触本身足以建立跨代表观遗传,并阐明了Pleiohomeotic和GAGA因子在招募Polycomb抑制复合体2及介导染色体间接触中的具体作用 | 未在体内直接观察染色体间接触的动态过程,且研究仅限于果蝇模型,其跨代表观遗传机制在哺乳动物中的普适性尚待验证 | 阐明果蝇中Fab-7调控元件半合子状态如何通过染色体间接触触发稳定的跨代表观遗传 | 果蝇(Drosophila)Fab-7调控元件及其同源基因座 | 分子生物学 | NA | 突变分析, 体内合成生物学系统诱导 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 果蝇 | NA | NA |
| 17 | 2026-04-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为SNIPR的合成受体平台,能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能,用于增强工程化治疗细胞的特异性 | 首次将SNIPR受体架构改造为可被可溶性配体激活的平台,实现了低基线活性与高倍数激活,并通过内吞和pH依赖性切割机制工作 | 未明确说明受体平台在复杂生理环境中的长期稳定性及潜在免疫原性问题 | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体,用于精准调控工程化治疗细胞功能 | 合成受体平台(SNIPR)、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA | SNIPR平台 | 哺乳动物细胞 | 可溶性配体激活的合成受体、正交于天然信号通路的细胞间通信网络 | 医学 |
| 18 | 2026-04-08 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
|
研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针,用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域之间的相互作用,并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的交联,揭示了模块间识别事件和载体蛋白在催化步骤间的过程性移动机制 | 研究主要聚焦于酪氨酸素生物合成的前两个模块,可能未完全反映其他非核糖体肽合成酶系统的结构动态 | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪氨酸素生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 19 | 2026-03-04 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
|
meta-analysis | 通过荟萃分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇,鉴定出与克罗恩病相关的脂肪酸酰胺,并验证其破坏肠道通透性和加剧疾病的作用 | 首次通过合成生物学方法解析了克罗恩病相关基因簇产生的六种脂肪酸酰胺结构,并证实这些微生物来源小分子在疾病发生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型验证,人类样本中的直接致病机制仍需进一步探究 | 探究肠道微生物组小分子代谢物在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道宏基因组样本、克罗恩病相关基因簇产物、结肠炎小鼠模型 | 宏基因组学 | 炎症性肠病(克罗恩病) | 宏基因组测序、合成生物学、结构解析 | NA | 宏基因组数据、质谱数据 | IBD患者与健康对照的粪便样本(具体数量未明确说明) | 合成生物学 | 梭菌属(Clostridia) | 小分子生物合成基因簇(BGCs) | 医学 |
| 20 | 2026-02-22 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
|
综述 | 本文综述了通过相分离驱动的合成生物分子凝聚体(SBMCs)的最新进展,包括其构建原理、调控方法以及在基础与应用研究中的潜力 | 利用合成生物学方法从头合成生物分子凝聚体,并系统阐述其内在构建原理、调控方法及在染色体结构、疾病机制、生物制造等领域的应用 | 对生物分子凝聚体的内部组织和外部调控机制的理解仍处于早期阶段,未来在生物材料、生物技术和生物医学领域仍面临机遇与挑战 | 探讨合成生物分子凝聚体的构建方法、调控机制及其在基础科学与应用研究中的潜力 | 合成生物分子凝聚体(SBMCs) | 合成生物学 | 肿瘤发生、衰老 | 相分离、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物材料、生物技术、生物医学、药物递送、人工细胞设计、生物制造 |